tokens
sequence | folded_tokens
sequence | labels
sequence |
---|---|---|
[
"Both",
"Drosophila",
"Toll",
"and",
"the",
"IL-1",
"receptor",
"are",
"known",
"to",
"signal",
"through",
"the",
"NF-kappaB",
"pathway",
"."
] | [
"both",
"drosophila",
"toll",
"and",
"the",
"il-1",
"receptor",
"are",
"known",
"to",
"signal",
"through",
"the",
"nf-kappab",
"pathway",
"."
] | [
"O",
"B-multi_cell",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"show",
"that",
"a",
"constitutively",
"active",
"mutant",
"of",
"human",
"Toll",
"transfected",
"into",
"human",
"cell",
"lines",
"can",
"induce",
"the",
"activation",
"of",
"NF-kappaB",
"and",
"the",
"expression",
"of",
"NF-kappaB",
"-controlled",
"genes",
"for",
"the",
"inflammatory",
"cytokines",
"IL-1",
",",
"IL-6",
"and",
"IL-8",
",",
"as",
"well",
"as",
"the",
"expression",
"of",
"the",
"co-stimulatory",
"molecule",
"B7",
".",
"1",
",",
"which",
"is",
"required",
"for",
"the",
"activation",
"of",
"naive",
"T",
"cells",
"."
] | [
"we",
"show",
"that",
"a",
"constitutively",
"active",
"mutant",
"of",
"human",
"toll",
"transfected",
"into",
"human",
"cell",
"lines",
"can",
"induce",
"the",
"activation",
"of",
"nf-kappab",
"and",
"the",
"expression",
"of",
"nf-kappab",
"-controlled",
"genes",
"for",
"the",
"inflammatory",
"cytokines",
"il-1",
",",
"il-6",
"and",
"il-8",
",",
"as",
"well",
"as",
"the",
"expression",
"of",
"the",
"co-stimulatory",
"molecule",
"b7",
".",
"1",
",",
"which",
"is",
"required",
"for",
"the",
"activation",
"of",
"naive",
"t",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"B-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"HIV-1",
"envelope",
"glycoproteins",
"induce",
"activation",
"of",
"activated",
"protein-1",
"in",
"CD4+",
"T",
"cells",
"[",
"published",
"erratum",
"appears",
"in",
"J",
"Biol",
"Chem",
"1995",
"Dec",
"1",
";",
"270",
"(",
"48",
")",
":",
"29038",
"]"
] | [
"hiv-1",
"envelope",
"glycoproteins",
"induce",
"activation",
"of",
"activated",
"protein-1",
"in",
"cd4+",
"t",
"cells",
"[",
"published",
"erratum",
"appears",
"in",
"j",
"biol",
"chem",
"1995",
"dec",
"1",
";",
"270",
"(",
"48",
")",
":",
"29038",
"]"
] | [
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-cell_type",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Activation",
"of",
"CD4",
"positive",
"T",
"cells",
"is",
"a",
"primary",
"requirement",
"for",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"(",
"HIV",
")",
"entry",
",",
"efficient",
"HIV",
"replication",
",",
"and",
"progression",
"to",
"AIDS",
",",
"Utilizing",
"CD4",
"positive",
"T",
"cell",
"lines",
"and",
"purified",
"T",
"cells",
"from",
"normal",
"individuals",
",",
"we",
"have",
"demonstrated",
"that",
"native",
"envelope",
"glycoproteins",
"of",
"HIV",
",",
"gp",
"160",
",",
"can",
"induce",
"activation",
"of",
"transcription",
"factor",
",",
"activated",
"protein-1",
"(",
"AP-1",
")",
"."
] | [
"activation",
"of",
"cd4",
"positive",
"t",
"cells",
"is",
"a",
"primary",
"requirement",
"for",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"(",
"hiv",
")",
"entry",
",",
"efficient",
"hiv",
"replication",
",",
"and",
"progression",
"to",
"aids",
",",
"utilizing",
"cd4",
"positive",
"t",
"cell",
"lines",
"and",
"purified",
"t",
"cells",
"from",
"normal",
"individuals",
",",
"we",
"have",
"demonstrated",
"that",
"native",
"envelope",
"glycoproteins",
"of",
"hiv",
",",
"gp",
"160",
",",
"can",
"induce",
"activation",
"of",
"transcription",
"factor",
",",
"activated",
"protein-1",
"(",
"ap-1",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-cell_type",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-multi_cell",
"I-multi_cell",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-virus",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"stimulatory",
"effects",
"of",
"gp160",
"are",
"mediated",
"through",
"the",
"CD4",
"molecule",
",",
"since",
"treatment",
"of",
"gp160",
"with",
"soluble",
"CD4-IgG",
"abrogates",
"its",
"activity",
",",
"and",
"CD4",
"negative",
"T",
"cell",
"lines",
"fail",
"to",
"be",
"stimulated",
"with",
"gp160",
"."
] | [
"the",
"stimulatory",
"effects",
"of",
"gp160",
"are",
"mediated",
"through",
"the",
"cd4",
"molecule",
",",
"since",
"treatment",
"of",
"gp160",
"with",
"soluble",
"cd4-igg",
"abrogates",
"its",
"activity",
",",
"and",
"cd4",
"negative",
"t",
"cell",
"lines",
"fail",
"to",
"be",
"stimulated",
"with",
"gp160",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Immunoprecipitation",
"of",
"the",
"gp",
"160",
"-induced",
"nuclear",
"extracts",
"with",
"polyclonal",
"antibodies",
"to",
"Fos",
"and",
"Jun",
"proteins",
"indicates",
"that",
"AP-1",
"complex",
"is",
"comprised",
"of",
"members",
"of",
"these",
"family",
"of",
"proteins",
"."
] | [
"immunoprecipitation",
"of",
"the",
"gp",
"160",
"-induced",
"nuclear",
"extracts",
"with",
"polyclonal",
"antibodies",
"to",
"fos",
"and",
"jun",
"proteins",
"indicates",
"that",
"ap-1",
"complex",
"is",
"comprised",
"of",
"members",
"of",
"these",
"family",
"of",
"proteins",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-cell_component",
"I-cell_component",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"gp160",
"-induced",
"AP-1",
"complex",
"is",
"dependent",
"upon",
"protein",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"and",
"is",
"protein",
"synthesis-independent",
"."
] | [
"the",
"gp160",
"-induced",
"ap-1",
"complex",
"is",
"dependent",
"upon",
"protein",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"and",
"is",
"protein",
"synthesis-independent",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"This",
"stimulation",
"can",
"also",
"be",
"abolished",
"by",
"inhibitors",
"of",
"protein",
"kinase",
"C",
",",
"but",
"it",
"is",
"unaffected",
"by",
"calcium",
"channel",
"blocker",
"or",
"cyclosporine",
"A",
"."
] | [
"this",
"stimulation",
"can",
"also",
"be",
"abolished",
"by",
"inhibitors",
"of",
"protein",
"kinase",
"c",
",",
"but",
"it",
"is",
"unaffected",
"by",
"calcium",
"channel",
"blocker",
"or",
"cyclosporine",
"a",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O"
] |
[
"This",
"gp160",
"treatment",
"adversely",
"affects",
"the",
"functional",
"capabilities",
"of",
"T",
"cells",
":",
"pre-treatment",
"of",
"CD4+",
"T",
"cells",
"with",
"gp160",
"for",
"4",
"h",
"at",
"37",
"degrees",
"C",
"inhibited",
"anti-CD3",
"-induced",
"interleukin-2",
"secretion",
"."
] | [
"this",
"gp160",
"treatment",
"adversely",
"affects",
"the",
"functional",
"capabilities",
"of",
"t",
"cells",
":",
"pre-treatment",
"of",
"cd4+",
"t",
"cells",
"with",
"gp160",
"for",
"4",
"h",
"at",
"37",
"degrees",
"c",
"inhibited",
"anti-cd3",
"-induced",
"interleukin-2",
"secretion",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"Effects",
"similar",
"to",
"gp160",
"were",
"seen",
"with",
"anti-CD4",
"mAb",
"."
] | [
"effects",
"similar",
"to",
"gp160",
"were",
"seen",
"with",
"anti-cd4",
"mab",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"The",
"aberrant",
"activation",
"of",
"AP-1",
"by",
"gp160",
"in",
"CD4",
"positive",
"T",
"cells",
"could",
"result",
"in",
"up-regulation",
"of",
"cytokines",
"containing",
"AP-1",
"sites",
",",
"e",
".",
"g",
".",
"interleukin-3",
"and",
"granulocyte",
"macrophage",
"colony-stimulating",
"factor",
",",
"and",
"concurrently",
"lead",
"to",
"T",
"cell",
"unresponsiveness",
"by",
"inhibiting",
"interleukin-2",
"secretion",
"."
] | [
"the",
"aberrant",
"activation",
"of",
"ap-1",
"by",
"gp160",
"in",
"cd4",
"positive",
"t",
"cells",
"could",
"result",
"in",
"up-regulation",
"of",
"cytokines",
"containing",
"ap-1",
"sites",
",",
"e",
".",
"g",
".",
"interleukin-3",
"and",
"granulocyte",
"macrophage",
"colony-stimulating",
"factor",
",",
"and",
"concurrently",
"lead",
"to",
"t",
"cell",
"unresponsiveness",
"by",
"inhibiting",
"interleukin-2",
"secretion",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"Superantigens",
"activate",
"HIV-1",
"gene",
"expression",
"in",
"monocytic",
"cells",
"."
] | [
"superantigens",
"activate",
"hiv-1",
"gene",
"expression",
"in",
"monocytic",
"cells",
"."
] | [
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Binding",
"of",
"superantigens",
"to",
"MHC",
"class",
"II",
"molecules",
"results",
"in",
"transduction",
"of",
"biochemical",
"signals",
"leading",
"to",
"cellular",
"activation",
"and",
"gene",
"expression",
"."
] | [
"binding",
"of",
"superantigens",
"to",
"mhc",
"class",
"ii",
"molecules",
"results",
"in",
"transduction",
"of",
"biochemical",
"signals",
"leading",
"to",
"cellular",
"activation",
"and",
"gene",
"expression",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"We",
"demonstrate",
"that",
"the",
"staphylococcal",
"superantigens",
"toxic",
"shock",
"syndrome",
"toxin-1",
"(",
"TSST-1",
")",
"and",
"staphylococcal",
"enterotoxin",
"A",
"(",
"SEA",
")",
"activate",
"HIV-1",
"-LTR",
"-driven",
"transcription",
"of",
"chloramphenicol",
"acetyl",
"transferase",
"in",
"the",
"human",
"monocytic",
"cell",
"line",
"THP-1",
"."
] | [
"we",
"demonstrate",
"that",
"the",
"staphylococcal",
"superantigens",
"toxic",
"shock",
"syndrome",
"toxin-1",
"(",
"tsst-1",
")",
"and",
"staphylococcal",
"enterotoxin",
"a",
"(",
"sea",
")",
"activate",
"hiv-1",
"-ltr",
"-driven",
"transcription",
"of",
"chloramphenicol",
"acetyl",
"transferase",
"in",
"the",
"human",
"monocytic",
"cell",
"line",
"thp-1",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"B-cell_line",
"O"
] |
[
"Induction",
"of",
"HIV-1",
"-",
"LTR",
"-driven",
"transcription",
"in",
"THP-1",
"cells",
"by",
"superantigens",
"was",
"associated",
"with",
"the",
"induction",
"of",
"nuclear",
"factor-kappa",
"B",
"DNA-binding",
"activity",
"."
] | [
"induction",
"of",
"hiv-1",
"-",
"ltr",
"-driven",
"transcription",
"in",
"thp-1",
"cells",
"by",
"superantigens",
"was",
"associated",
"with",
"the",
"induction",
"of",
"nuclear",
"factor-kappa",
"b",
"dna-binding",
"activity",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Superantigens",
"also",
"increased",
"viral",
"protein",
"secretion",
"from",
"the",
"granulocyte-macrophage",
"colony-stimulating",
"factor",
"-pretreated",
"chronically",
"infected",
"human",
"monocytic",
"cell",
"line",
"U1",
"."
] | [
"superantigens",
"also",
"increased",
"viral",
"protein",
"secretion",
"from",
"the",
"granulocyte-macrophage",
"colony-stimulating",
"factor",
"-pretreated",
"chronically",
"infected",
"human",
"monocytic",
"cell",
"line",
"u1",
"."
] | [
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Induction",
"of",
"HIV-1",
"gene",
"expression",
"in",
"monocytic",
"cells",
"by",
"superantigens",
"occurred",
"via",
"tumor",
"necrosis",
"factor-alpha",
"-dependent",
"and",
"-independent",
"mechanisms",
"."
] | [
"induction",
"of",
"hiv-1",
"gene",
"expression",
"in",
"monocytic",
"cells",
"by",
"superantigens",
"occurred",
"via",
"tumor",
"necrosis",
"factor-alpha",
"-dependent",
"and",
"-independent",
"mechanisms",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Our",
"results",
"suggest",
"that",
"superantigens",
"and",
"other",
"MHC",
"class",
"II",
"ligands",
"may",
"activate",
"HIV-1",
"gene",
"expression",
"in",
"monocytes/macrophages",
"."
] | [
"our",
"results",
"suggest",
"that",
"superantigens",
"and",
"other",
"mhc",
"class",
"ii",
"ligands",
"may",
"activate",
"hiv-1",
"gene",
"expression",
"in",
"monocytes/macrophages",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O"
] |
[
"Identification",
"of",
"transcription",
"factors",
"expressed",
"during",
"ATRA-induced",
"neutrophil",
"differentiation",
"of",
"HL60",
"cells",
"."
] | [
"identification",
"of",
"transcription",
"factors",
"expressed",
"during",
"atra-induced",
"neutrophil",
"differentiation",
"of",
"hl60",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O"
] |
[
"A",
"recent",
"clinical",
"therapeutic",
"initiative",
"has",
"been",
"the",
"use",
"of",
"chemical",
"agents",
"which",
"induce",
"the",
"leukaemic",
"cells",
"to",
"overcome",
"their",
"block",
"in",
"differentiation",
"."
] | [
"a",
"recent",
"clinical",
"therapeutic",
"initiative",
"has",
"been",
"the",
"use",
"of",
"chemical",
"agents",
"which",
"induce",
"the",
"leukaemic",
"cells",
"to",
"overcome",
"their",
"block",
"in",
"differentiation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"order",
"to",
"understand",
"this",
"block",
"the",
"cascade",
"of",
"molecular",
"events",
"needs",
"to",
"be",
"characterized",
"."
] | [
"in",
"order",
"to",
"understand",
"this",
"block",
"the",
"cascade",
"of",
"molecular",
"events",
"needs",
"to",
"be",
"characterized",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Haemopoietic",
"differentiation",
"is",
"ultimately",
"controlled",
"at",
"the",
"level",
"of",
"gene",
"transcription",
"which",
"is",
"mediated",
"by",
"an",
"array",
"of",
"transcription",
"factors",
"."
] | [
"haemopoietic",
"differentiation",
"is",
"ultimately",
"controlled",
"at",
"the",
"level",
"of",
"gene",
"transcription",
"which",
"is",
"mediated",
"by",
"an",
"array",
"of",
"transcription",
"factors",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"Many",
"transcription",
"factors",
"contain",
"similar",
"structural",
"protein",
"sequences",
",",
"and",
"we",
"have",
"used",
"an",
"RT-PCR",
"-based",
"approach",
"to",
"isolate",
"sequences",
",",
"from",
"transcription",
"factor",
"gene",
"families",
"which",
"share",
"similar",
"domains",
"."
] | [
"many",
"transcription",
"factors",
"contain",
"similar",
"structural",
"protein",
"sequences",
",",
"and",
"we",
"have",
"used",
"an",
"rt-pcr",
"-based",
"approach",
"to",
"isolate",
"sequences",
",",
"from",
"transcription",
"factor",
"gene",
"families",
"which",
"share",
"similar",
"domains",
"."
] | [
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Degenerate",
"primers",
"corresponding",
"to",
"the",
"TFIIIA",
"zinc-finger",
"consensus",
"amino",
"acid",
"sequences",
"and",
"to",
"the",
"POU-homeodomain",
"and",
"POU-specific",
"domain",
"were",
"used",
"to",
"amplify",
"genes",
"on",
"the",
"basis",
"that",
"they",
"contained",
"similarities",
"in",
"structural",
"motifs",
"shared",
"within",
"these",
"families",
"of",
"transcription",
"factors",
"."
] | [
"degenerate",
"primers",
"corresponding",
"to",
"the",
"tfiiia",
"zinc-finger",
"consensus",
"amino",
"acid",
"sequences",
"and",
"to",
"the",
"pou-homeodomain",
"and",
"pou-specific",
"domain",
"were",
"used",
"to",
"amplify",
"genes",
"on",
"the",
"basis",
"that",
"they",
"contained",
"similarities",
"in",
"structural",
"motifs",
"shared",
"within",
"these",
"families",
"of",
"transcription",
"factors",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_substructure",
"I-protein_substructure",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"A",
"serum-independent",
"HL60",
"cell",
"line",
"was",
"induced",
"towards",
"the",
"neutrophil",
"lineage",
"by",
"treatment",
"with",
"all-trans",
"retinoic",
"acid",
"(",
"ATRA",
")",
"for",
"24",
"h",
"."
] | [
"a",
"serum-independent",
"hl60",
"cell",
"line",
"was",
"induced",
"towards",
"the",
"neutrophil",
"lineage",
"by",
"treatment",
"with",
"all-trans",
"retinoic",
"acid",
"(",
"atra",
")",
"for",
"24",
"h",
"."
] | [
"O",
"B-cell_line",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"CD38+",
"cells",
"committed",
"towards",
"this",
"lineage",
"were",
"enriched",
"and",
"a",
"population",
"of",
"these",
"cells",
"treated",
"with",
"dihydroxyvitamin",
"D3",
"to",
"induce",
"neutrophil",
"maturation",
"."
] | [
"cd38+",
"cells",
"committed",
"towards",
"this",
"lineage",
"were",
"enriched",
"and",
"a",
"population",
"of",
"these",
"cells",
"treated",
"with",
"dihydroxyvitamin",
"d3",
"to",
"induce",
"neutrophil",
"maturation",
"."
] | [
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name"
] |
[
"RNA",
"extracted",
"from",
"uninduced",
",",
"ATRA",
"-induced",
"CD38+",
"cells",
",",
"and",
"vitamin",
"D3",
"treated",
"maturing",
"cell",
"cultures",
"were",
"amplified",
"using",
"the",
"degenerate",
"primers",
"."
] | [
"rna",
"extracted",
"from",
"uninduced",
",",
"atra",
"-induced",
"cd38+",
"cells",
",",
"and",
"vitamin",
"d3",
"treated",
"maturing",
"cell",
"cultures",
"were",
"amplified",
"using",
"the",
"degenerate",
"primers",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-polynucleotide",
"I-polynucleotide",
"O"
] |
[
"PCR",
"fragments",
"were",
"cloned",
",",
"sequenced",
",",
"clustered",
"into",
"homologous",
"groups",
",",
"and",
"the",
"group",
"sequences",
"searched",
"on",
"the",
"GenBank",
"database",
"."
] | [
"pcr",
"fragments",
"were",
"cloned",
",",
"sequenced",
",",
"clustered",
"into",
"homologous",
"groups",
",",
"and",
"the",
"group",
"sequences",
"searched",
"on",
"the",
"genbank",
"database",
"."
] | [
"B-DNA_molecule",
"I-DNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"Oct",
"1",
"transcription",
"factor",
",",
"and",
"a",
"very",
"close",
"homologue",
",",
"KIAA0144",
",",
"was",
"identified",
"using",
"the",
"POU",
"family",
"primers",
"."
] | [
"the",
"oct",
"1",
"transcription",
"factor",
",",
"and",
"a",
"very",
"close",
"homologue",
",",
"kiaa0144",
",",
"was",
"identified",
"using",
"the",
"pou",
"family",
"primers",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-polynucleotide",
"I-polynucleotide",
"I-polynucleotide",
"O"
] |
[
"The",
"zinc-finger",
"primers",
"identified",
"three",
"zinc-finger",
"genes",
"."
] | [
"the",
"zinc-finger",
"primers",
"identified",
"three",
"zinc-finger",
"genes",
"."
] | [
"O",
"B-polynucleotide",
"I-polynucleotide",
"O",
"O",
"B-polynucleotide",
"I-polynucleotide",
"O"
] |
[
"The",
"pattern",
"of",
"gene",
"expression",
"was",
"suggested",
"from",
"the",
"number",
"of",
"clones",
"in",
"each",
"group",
"at",
"neutrophil",
"commitment",
"and",
"maturation",
"."
] | [
"the",
"pattern",
"of",
"gene",
"expression",
"was",
"suggested",
"from",
"the",
"number",
"of",
"clones",
"in",
"each",
"group",
"at",
"neutrophil",
"commitment",
"and",
"maturation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"differential",
"expression",
"of",
"the",
"genes",
"in",
"the",
"zinc",
"finger",
"and",
"POU",
"families",
"will",
"lead",
"to",
"a",
"better",
"understanding",
"of",
"the",
"cascade",
"of",
"gene",
"expression",
"which",
"occurs",
"following",
"ATRA",
"-induced",
"differentiation",
"."
] | [
"the",
"differential",
"expression",
"of",
"the",
"genes",
"in",
"the",
"zinc",
"finger",
"and",
"pou",
"families",
"will",
"lead",
"to",
"a",
"better",
"understanding",
"of",
"the",
"cascade",
"of",
"gene",
"expression",
"which",
"occurs",
"following",
"atra",
"-induced",
"differentiation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Cellular",
"and",
"molecular",
"mechanisms",
"of",
"IFN-gamma",
"production",
"induced",
"by",
"IL-2",
"and",
"IL-12",
"in",
"a",
"human",
"NK",
"cell",
"line",
"."
] | [
"cellular",
"and",
"molecular",
"mechanisms",
"of",
"ifn-gamma",
"production",
"induced",
"by",
"il-2",
"and",
"il-12",
"in",
"a",
"human",
"nk",
"cell",
"line",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O"
] |
[
"Interferon-gamma",
"(",
"IFN-gamma",
")",
"is",
"an",
"important",
"immunoregulatory",
"protein",
"produced",
"predominantly",
"by",
"T",
"cells",
"and",
"large",
"granular",
"lymphocytes",
"(",
"LGL",
")",
"in",
"response",
"to",
"different",
"extracellular",
"signals",
"."
] | [
"interferon-gamma",
"(",
"ifn-gamma",
")",
"is",
"an",
"important",
"immunoregulatory",
"protein",
"produced",
"predominantly",
"by",
"t",
"cells",
"and",
"large",
"granular",
"lymphocytes",
"(",
"lgl",
")",
"in",
"response",
"to",
"different",
"extracellular",
"signals",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"In",
"particular",
",",
"two",
"interleukins",
"(",
"ILs",
")",
",",
"IL-2",
"and",
"IL-12",
",",
"have",
"been",
"shown",
"to",
"be",
"potent",
"inducers",
"of",
"IFN-gamma",
"gene",
"expression",
"in",
"both",
"T",
"cells",
"and",
"LGL",
"."
] | [
"in",
"particular",
",",
"two",
"interleukins",
"(",
"ils",
")",
",",
"il-2",
"and",
"il-12",
",",
"have",
"been",
"shown",
"to",
"be",
"potent",
"inducers",
"of",
"ifn-gamma",
"gene",
"expression",
"in",
"both",
"t",
"cells",
"and",
"lgl",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"O"
] |
[
"Although",
"it",
"has",
"been",
"reported",
"that",
"there",
"are",
"some",
"T",
"cell",
"lines",
"that",
"produce",
"IFN-gamma",
"in",
"response",
"to",
"IL-2",
"and",
"IL-12",
"stimulation",
",",
"there",
"has",
"as",
"yet",
"been",
"no",
"report",
"of",
"a",
"natural",
"killer",
"(",
"NK",
")",
"cell",
"line",
"that",
"responds",
"in",
"a",
"similar",
"manner",
"."
] | [
"although",
"it",
"has",
"been",
"reported",
"that",
"there",
"are",
"some",
"t",
"cell",
"lines",
"that",
"produce",
"ifn-gamma",
"in",
"response",
"to",
"il-2",
"and",
"il-12",
"stimulation",
",",
"there",
"has",
"as",
"yet",
"been",
"no",
"report",
"of",
"a",
"natural",
"killer",
"(",
"nk",
")",
"cell",
"line",
"that",
"responds",
"in",
"a",
"similar",
"manner",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"this",
"report",
"we",
"present",
"evidence",
"that",
"the",
"cell",
"line",
"NK3",
".",
"3",
"derived",
"from",
"human",
"NK",
"cells",
",",
"responds",
"to",
"both",
"IL-2",
"and",
"IL-12",
",",
"as",
"measured",
"by",
"increases",
"in",
"IFN-gamma",
"and",
"granulocyte-macrophage",
"colony-stimulating",
"factor",
"(",
"GM-CSF",
")",
"cytoplasmic",
"mRNA",
"and",
"protein",
"expression",
"."
] | [
"in",
"this",
"report",
"we",
"present",
"evidence",
"that",
"the",
"cell",
"line",
"nk3",
".",
"3",
"derived",
"from",
"human",
"nk",
"cells",
",",
"responds",
"to",
"both",
"il-2",
"and",
"il-12",
",",
"as",
"measured",
"by",
"increases",
"in",
"ifn-gamma",
"and",
"granulocyte-macrophage",
"colony-stimulating",
"factor",
"(",
"gm-csf",
")",
"cytoplasmic",
"mrna",
"and",
"protein",
"expression",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"when",
"used",
"together",
"IL-2",
"and",
"IL-12",
"synergized",
"in",
"the",
"induction",
"of",
"IFN-gamma",
"and",
"GM-CSF",
"and",
"this",
"synergy",
"was",
"attributed",
"to",
"an",
"increased",
"accumulation",
"and",
"stability",
"of",
"the",
"IFN-gamma",
"and",
"GM-CSF",
"mRNAs",
"."
] | [
"in",
"addition",
",",
"when",
"used",
"together",
"il-2",
"and",
"il-12",
"synergized",
"in",
"the",
"induction",
"of",
"ifn-gamma",
"and",
"gm-csf",
"and",
"this",
"synergy",
"was",
"attributed",
"to",
"an",
"increased",
"accumulation",
"and",
"stability",
"of",
"the",
"ifn-gamma",
"and",
"gm-csf",
"mrnas",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"To",
"investigate",
"the",
"signaling",
"pathways",
"involved",
"in",
"the",
"gene",
"induction",
",",
"five",
"inhibitors",
",",
"cyclosporin",
"A",
"(",
"CsA",
")",
",",
"transforming",
"growth",
"factor-beta",
",",
"cycloheximide",
",",
"genistein",
",",
"and",
"staurosporine",
"A",
",",
"were",
"used",
"in",
"analyzing",
"the",
"effects",
"of",
"IL-2",
"and",
"IL-12",
"on",
"NK3",
".",
"3",
"cells",
"."
] | [
"to",
"investigate",
"the",
"signaling",
"pathways",
"involved",
"in",
"the",
"gene",
"induction",
",",
"five",
"inhibitors",
",",
"cyclosporin",
"a",
"(",
"csa",
")",
",",
"transforming",
"growth",
"factor-beta",
",",
"cycloheximide",
",",
"genistein",
",",
"and",
"staurosporine",
"a",
",",
"were",
"used",
"in",
"analyzing",
"the",
"effects",
"of",
"il-2",
"and",
"il-12",
"on",
"nk3",
".",
"3",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O"
] |
[
"The",
"results",
"suggest",
"that",
"activation",
"of",
"protein",
"kinase",
"C",
",",
"but",
"not",
"new",
"protein",
"synthesis",
",",
"is",
"required",
"for",
"IL-2",
"induction",
"of",
"IFN-gamma",
"and",
"GM-CSF",
"cytoplasmic",
"mRNA",
"."
] | [
"the",
"results",
"suggest",
"that",
"activation",
"of",
"protein",
"kinase",
"c",
",",
"but",
"not",
"new",
"protein",
"synthesis",
",",
"is",
"required",
"for",
"il-2",
"induction",
"of",
"ifn-gamma",
"and",
"gm-csf",
"cytoplasmic",
"mrna",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"contrast",
",",
"IL-12",
"induction",
"of",
"IFN-gamma",
"cytoplasmic",
"mRNA",
"appears",
"to",
"only",
"partially",
"depend",
"on",
"activation",
"of",
"protein",
"kinase",
"C",
"."
] | [
"in",
"contrast",
",",
"il-12",
"induction",
"of",
"ifn-gamma",
"cytoplasmic",
"mrna",
"appears",
"to",
"only",
"partially",
"depend",
"on",
"activation",
"of",
"protein",
"kinase",
"c",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Furthermore",
",",
"both",
"transforming",
"growth",
"factor-beta",
"and",
"genistein",
",",
"a",
"tyrosine",
"kinase",
"inhibitor",
",",
"could",
"suppress",
"IL-2",
"and",
"IL-12",
"signaling",
"but",
"CsA",
"was",
"generally",
"inactive",
"."
] | [
"furthermore",
",",
"both",
"transforming",
"growth",
"factor-beta",
"and",
"genistein",
",",
"a",
"tyrosine",
"kinase",
"inhibitor",
",",
"could",
"suppress",
"il-2",
"and",
"il-12",
"signaling",
"but",
"csa",
"was",
"generally",
"inactive",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"It",
"also",
"was",
"observed",
"that",
"suppression",
"of",
"cytokine",
"gene",
"expression",
"by",
"these",
"agents",
"was",
"independent",
"of",
"the",
"inhibition",
"of",
"proliferation",
"."
] | [
"it",
"also",
"was",
"observed",
"that",
"suppression",
"of",
"cytokine",
"gene",
"expression",
"by",
"these",
"agents",
"was",
"independent",
"of",
"the",
"inhibition",
"of",
"proliferation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"IL-2",
"but",
"not",
"IL-12",
"induced",
"nuclear",
"factors",
"NF-kappa",
"B",
"and",
"AP1",
",",
"and",
"regulation",
"of",
"the",
"nuclear",
"levels",
"of",
"these",
"two",
"DNA",
"binding",
"protein",
"complexes",
"is",
"correlated",
"with",
"IFN-gamma",
"and",
"GM-CSF",
"gene",
"expression",
"."
] | [
"in",
"addition",
",",
"il-2",
"but",
"not",
"il-12",
"induced",
"nuclear",
"factors",
"nf-kappa",
"b",
"and",
"ap1",
",",
"and",
"regulation",
"of",
"the",
"nuclear",
"levels",
"of",
"these",
"two",
"dna",
"binding",
"protein",
"complexes",
"is",
"correlated",
"with",
"ifn-gamma",
"and",
"gm-csf",
"gene",
"expression",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"data",
"indicate",
"that",
"IL-2",
"and",
"IL-12",
"may",
"have",
"distinct",
"signaling",
"pathways",
"leading",
"to",
"the",
"induction",
"of",
"IFN-gamma",
"and",
"GM-CSF",
"gene",
"expression",
",",
"and",
"that",
"the",
"NK3",
".",
"3",
"cell",
"line",
"may",
"serve",
"as",
"a",
"novel",
"model",
"for",
"dissecting",
"the",
"biochemical",
"and",
"molecular",
"events",
"involved",
"in",
"these",
"pathways",
"."
] | [
"these",
"data",
"indicate",
"that",
"il-2",
"and",
"il-12",
"may",
"have",
"distinct",
"signaling",
"pathways",
"leading",
"to",
"the",
"induction",
"of",
"ifn-gamma",
"and",
"gm-csf",
"gene",
"expression",
",",
"and",
"that",
"the",
"nk3",
".",
"3",
"cell",
"line",
"may",
"serve",
"as",
"a",
"novel",
"model",
"for",
"dissecting",
"the",
"biochemical",
"and",
"molecular",
"events",
"involved",
"in",
"these",
"pathways",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Interferon-alpha",
"activates",
"multiple",
"STAT",
"proteins",
"and",
"upregulates",
"proliferation-associated",
"IL-2Ralpha",
",",
"c-myc",
",",
"and",
"pim-1",
"genes",
"in",
"human",
"T",
"cells",
"."
] | [
"interferon-alpha",
"activates",
"multiple",
"stat",
"proteins",
"and",
"upregulates",
"proliferation-associated",
"il-2ralpha",
",",
"c-myc",
",",
"and",
"pim-1",
"genes",
"in",
"human",
"t",
"cells",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Interferon-alpha",
"(",
"IFN-alpha",
")",
"is",
"a",
"pleiotropic",
"cytokine",
"that",
"has",
"antiviral",
",",
"antiproliferative",
",",
"and",
"immunoregulatory",
"functions",
"."
] | [
"interferon-alpha",
"(",
"ifn-alpha",
")",
"is",
"a",
"pleiotropic",
"cytokine",
"that",
"has",
"antiviral",
",",
"antiproliferative",
",",
"and",
"immunoregulatory",
"functions",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O"
] |
[
"There",
"is",
"increasing",
"evidence",
"that",
"IFN-alpha",
"has",
"an",
"important",
"role",
"in",
"T-cell",
"biology",
"."
] | [
"there",
"is",
"increasing",
"evidence",
"that",
"ifn-alpha",
"has",
"an",
"important",
"role",
"in",
"t-cell",
"biology",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"analyzed",
"the",
"expression",
"of",
"IL-2Ralpha",
",",
"c-myc",
",",
"and",
"pim-1",
"genes",
"in",
"anti-CD3-activated",
"human",
"T",
"lymphocytes",
"."
] | [
"we",
"have",
"analyzed",
"the",
"expression",
"of",
"il-2ralpha",
",",
"c-myc",
",",
"and",
"pim-1",
"genes",
"in",
"anti-cd3-activated",
"human",
"t",
"lymphocytes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"The",
"induction",
"of",
"these",
"genes",
"is",
"associated",
"with",
"interleukin-2",
"(",
"IL-2",
")",
"-induced",
"T-cell",
"proliferation",
"."
] | [
"the",
"induction",
"of",
"these",
"genes",
"is",
"associated",
"with",
"interleukin-2",
"(",
"il-2",
")",
"-induced",
"t-cell",
"proliferation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Treatment",
"of",
"T",
"lymphocytes",
"with",
"IFN-alpha",
",",
"IL-2",
",",
"IL-12",
",",
"and",
"IL-15",
"upregulated",
"IL-2Ralpha",
",",
"c-myc",
",",
"and",
"pim-1",
"gene",
"expression",
"."
] | [
"treatment",
"of",
"t",
"lymphocytes",
"with",
"ifn-alpha",
",",
"il-2",
",",
"il-12",
",",
"and",
"il-15",
"upregulated",
"il-2ralpha",
",",
"c-myc",
",",
"and",
"pim-1",
"gene",
"expression",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O"
] |
[
"IFN-alpha",
"also",
"sensitized",
"T",
"cells",
"to",
"IL-2",
"-induced",
"proliferation",
",",
"further",
"suggesting",
"that",
"IFN-alpha",
"may",
"be",
"involved",
"in",
"the",
"regulation",
"of",
"T-cell",
"mitogenesis",
"."
] | [
"ifn-alpha",
"also",
"sensitized",
"t",
"cells",
"to",
"il-2",
"-induced",
"proliferation",
",",
"further",
"suggesting",
"that",
"ifn-alpha",
"may",
"be",
"involved",
"in",
"the",
"regulation",
"of",
"t-cell",
"mitogenesis",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"When",
"we",
"analyzed",
"the",
"nature",
"of",
"STAT",
"proteins",
"capable",
"of",
"binding",
"to",
"IL-2Ralpha",
",",
"pim-1",
",",
"and",
"IRF-1",
"GAS",
"elements",
"after",
"cytokine",
"stimulation",
",",
"we",
"observed",
"IFN-alpha",
"-induced",
"binding",
"of",
"STAT1",
",",
"STAT3",
",",
"and",
"STAT4",
",",
"but",
"not",
"STAT5",
"to",
"all",
"of",
"these",
"elements",
"."
] | [
"when",
"we",
"analyzed",
"the",
"nature",
"of",
"stat",
"proteins",
"capable",
"of",
"binding",
"to",
"il-2ralpha",
",",
"pim-1",
",",
"and",
"irf-1",
"gas",
"elements",
"after",
"cytokine",
"stimulation",
",",
"we",
"observed",
"ifn-alpha",
"-induced",
"binding",
"of",
"stat1",
",",
"stat3",
",",
"and",
"stat4",
",",
"but",
"not",
"stat5",
"to",
"all",
"of",
"these",
"elements",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Yet",
",",
"IFN-alpha",
"was",
"able",
"to",
"activate",
"binding",
"of",
"STAT5",
"to",
"the",
"high-affinity",
"IFP53",
"GAS",
"site",
"."
] | [
"yet",
",",
"ifn-alpha",
"was",
"able",
"to",
"activate",
"binding",
"of",
"stat5",
"to",
"the",
"high-affinity",
"ifp53",
"gas",
"site",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"IFN-alpha",
"enhanced",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"of",
"STAT1",
",",
"STAT3",
",",
"STAT4",
",",
"STAT5a",
",",
"and",
"STAT5b",
"."
] | [
"ifn-alpha",
"enhanced",
"tyrosine",
"phosphorylation",
"of",
"stat1",
",",
"stat3",
",",
"stat4",
",",
"stat5a",
",",
"and",
"stat5b",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"IL-12",
"induced",
"STAT4",
"and",
"IL-2",
"and",
"IL-15",
"induced",
"STAT5",
"binding",
"to",
"the",
"GAS",
"elements",
"."
] | [
"il-12",
"induced",
"stat4",
"and",
"il-2",
"and",
"il-15",
"induced",
"stat5",
"binding",
"to",
"the",
"gas",
"elements",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"Taken",
"together",
",",
"our",
"results",
"suggest",
"that",
"IFN-alpha",
",",
"IL-2",
",",
"IL-12",
",",
"and",
"IL-15",
"have",
"overlapping",
"activities",
"on",
"human",
"T",
"cells",
"."
] | [
"taken",
"together",
",",
"our",
"results",
"suggest",
"that",
"ifn-alpha",
",",
"il-2",
",",
"il-12",
",",
"and",
"il-15",
"have",
"overlapping",
"activities",
"on",
"human",
"t",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"These",
"findings",
"thus",
"emphasize",
"the",
"importance",
"of",
"IFN-alpha",
"as",
"a",
"T-cell",
"regulatory",
"cytokine",
"."
] | [
"these",
"findings",
"thus",
"emphasize",
"the",
"importance",
"of",
"ifn-alpha",
"as",
"a",
"t-cell",
"regulatory",
"cytokine",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"Structural",
"and",
"functional",
"characterization",
"of",
"the",
"human",
"CD36",
"gene",
"promoter",
":",
"identification",
"of",
"a",
"proximal",
"PEBP2/CBF",
"site",
"."
] | [
"structural",
"and",
"functional",
"characterization",
"of",
"the",
"human",
"cd36",
"gene",
"promoter",
":",
"identification",
"of",
"a",
"proximal",
"pebp2/cbf",
"site",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"CD36",
"is",
"a",
"cell",
"surface",
"glycoprotein",
"composed",
"of",
"a",
"single",
"polypeptide",
"chain",
",",
"which",
"interacts",
"with",
"thrombospondin",
",",
"collagens",
"type",
"I",
"and",
"IV",
",",
"oxidized",
"low",
"density",
"lipoprotein",
",",
"fatty",
"acids",
",",
"anionic",
"phospholipids",
",",
"and",
"erythrocytes",
"parasitized",
"with",
"Plasmodium",
"falciparum",
"."
] | [
"cd36",
"is",
"a",
"cell",
"surface",
"glycoprotein",
"composed",
"of",
"a",
"single",
"polypeptide",
"chain",
",",
"which",
"interacts",
"with",
"thrombospondin",
",",
"collagens",
"type",
"i",
"and",
"iv",
",",
"oxidized",
"low",
"density",
"lipoprotein",
",",
"fatty",
"acids",
",",
"anionic",
"phospholipids",
",",
"and",
"erythrocytes",
"parasitized",
"with",
"plasmodium",
"falciparum",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-peptide",
"I-peptide",
"I-peptide",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"B-lipid",
"I-lipid",
"O",
"B-lipid",
"I-lipid",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"B-mono_cell",
"I-mono_cell",
"O"
] |
[
"Its",
"expression",
"is",
"restricted",
"to",
"a",
"few",
"cell",
"types",
",",
"including",
"monocyte/macrophages",
"."
] | [
"its",
"expression",
"is",
"restricted",
"to",
"a",
"few",
"cell",
"types",
",",
"including",
"monocyte/macrophages",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O"
] |
[
"In",
"these",
"cells",
",",
"CD36",
"is",
"involved",
"in",
"phagocytosis",
"of",
"apoptotic",
"cells",
",",
"and",
"foam",
"cell",
"formation",
"by",
"uptake",
"of",
"oxidized",
"low",
"density",
"lipoprotein",
"."
] | [
"in",
"these",
"cells",
",",
"cd36",
"is",
"involved",
"in",
"phagocytosis",
"of",
"apoptotic",
"cells",
",",
"and",
"foam",
"cell",
"formation",
"by",
"uptake",
"of",
"oxidized",
"low",
"density",
"lipoprotein",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O"
] |
[
"To",
"study",
"the",
"molecular",
"mechanisms",
"that",
"control",
"the",
"transcription",
"of",
"the",
"CD36",
"gene",
"in",
"monocytic",
"cells",
"we",
"have",
"isolated",
"and",
"analyzed",
"the",
"CD36",
"promoter",
"."
] | [
"to",
"study",
"the",
"molecular",
"mechanisms",
"that",
"control",
"the",
"transcription",
"of",
"the",
"cd36",
"gene",
"in",
"monocytic",
"cells",
"we",
"have",
"isolated",
"and",
"analyzed",
"the",
"cd36",
"promoter",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"Transient",
"expression",
"experiments",
"of",
"5'-deletion",
"fragments",
"of",
"the",
"CD36",
"promoter",
"coupled",
"to",
"luciferase",
"demonstrated",
"that",
"as",
"few",
"as",
"158",
"base",
"pairs",
"upstream",
"from",
"the",
"transcription",
"initiation",
"site",
"were",
"sufficient",
"to",
"direct",
"the",
"monocyte-specific",
"transcription",
"of",
"the",
"reporter",
"gene",
"."
] | [
"transient",
"expression",
"experiments",
"of",
"5'-deletion",
"fragments",
"of",
"the",
"cd36",
"promoter",
"coupled",
"to",
"luciferase",
"demonstrated",
"that",
"as",
"few",
"as",
"158",
"base",
"pairs",
"upstream",
"from",
"the",
"transcription",
"initiation",
"site",
"were",
"sufficient",
"to",
"direct",
"the",
"monocyte-specific",
"transcription",
"of",
"the",
"reporter",
"gene",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_molecule",
"I-DNA_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O"
] |
[
"Within",
"the",
"above",
"region",
",",
"the",
"fragment",
"spanning",
"nucleotides",
"-158",
"to",
"-90",
"was",
"required",
"for",
"optimal",
"transcription",
"in",
"monocytic",
"cells",
"."
] | [
"within",
"the",
"above",
"region",
",",
"the",
"fragment",
"spanning",
"nucleotides",
"-158",
"to",
"-90",
"was",
"required",
"for",
"optimal",
"transcription",
"in",
"monocytic",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Biochemical",
"analysis",
"of",
"the",
"region",
"-158/-90",
"revealed",
"a",
"binding",
"site",
"for",
"transcription",
"factors",
"of",
"the",
"polyomavirus",
"enhancer-binding",
"protein",
"2/core-binding",
"factor",
"(",
"PEBP2/CBF",
")",
"family",
"at",
"position",
"-103",
"."
] | [
"biochemical",
"analysis",
"of",
"the",
"region",
"-158/-90",
"revealed",
"a",
"binding",
"site",
"for",
"transcription",
"factors",
"of",
"the",
"polyomavirus",
"enhancer-binding",
"protein",
"2/core-binding",
"factor",
"(",
"pebp2/cbf",
")",
"family",
"at",
"position",
"-103",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"Disruption",
"of",
"the",
"PEBP2/CBF",
"site",
"markedly",
"diminished",
"the",
"role",
"of",
"the",
"PEBP2/CBF",
"factors",
"in",
"the",
"constitutive",
"transcription",
"of",
"the",
"CD36",
"gene",
"."
] | [
"disruption",
"of",
"the",
"pebp2/cbf",
"site",
"markedly",
"diminished",
"the",
"role",
"of",
"the",
"pebp2/cbf",
"factors",
"in",
"the",
"constitutive",
"transcription",
"of",
"the",
"cd36",
"gene",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"involvement",
"of",
"members",
"of",
"the",
"PEBP2/CBF",
"family",
"in",
"chromosome",
"translocations",
"associated",
"with",
"acute",
"myeloid",
"leukemia",
",",
"and",
"in",
"the",
"transcriptional",
"regulation",
"of",
"the",
"myeloid-specific",
"genes",
"encoding",
"for",
"myeloperoxidase",
",",
"elastase",
",",
"and",
"the",
"colony-stimulating",
"factor",
"receptor",
",",
"highlights",
"the",
"relevance",
"of",
"the",
"regulation",
"of",
"the",
"CD36",
"gene",
"promoter",
"in",
"monocytic",
"cells",
"by",
"members",
"of",
"the",
"PEBP2/CBF",
"family",
"."
] | [
"the",
"involvement",
"of",
"members",
"of",
"the",
"pebp2/cbf",
"family",
"in",
"chromosome",
"translocations",
"associated",
"with",
"acute",
"myeloid",
"leukemia",
",",
"and",
"in",
"the",
"transcriptional",
"regulation",
"of",
"the",
"myeloid-specific",
"genes",
"encoding",
"for",
"myeloperoxidase",
",",
"elastase",
",",
"and",
"the",
"colony-stimulating",
"factor",
"receptor",
",",
"highlights",
"the",
"relevance",
"of",
"the",
"regulation",
"of",
"the",
"cd36",
"gene",
"promoter",
"in",
"monocytic",
"cells",
"by",
"members",
"of",
"the",
"pebp2/cbf",
"family",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"Inhibition",
"of",
"HIV-1",
"replication",
"and",
"NF-kappa",
"B",
"activity",
"by",
"cysteine",
"and",
"cysteine",
"derivatives",
"."
] | [
"inhibition",
"of",
"hiv-1",
"replication",
"and",
"nf-kappa",
"b",
"activity",
"by",
"cysteine",
"and",
"cysteine",
"derivatives",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-virus",
"B-other_name",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O"
] |
[
"HIV-1",
"proviral",
"DNA",
"contains",
"two",
"binding",
"sites",
"for",
"the",
"transcription",
"factor",
"NF-kappa",
"B",
"."
] | [
"hiv-1",
"proviral",
"dna",
"contains",
"two",
"binding",
"sites",
"for",
"the",
"transcription",
"factor",
"nf-kappa",
"b",
"."
] | [
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"HIV-1",
"-infected",
"individuals",
"have",
",",
"on",
"average",
",",
"abnormally",
"high",
"levels",
"of",
"tumour",
"necrosis",
"factor",
"alpha",
"(",
"TNF",
"alpha",
")",
"and",
"abnormally",
"low",
"plasma",
"cysteine",
"levels",
"."
] | [
"hiv-1",
"-infected",
"individuals",
"have",
",",
"on",
"average",
",",
"abnormally",
"high",
"levels",
"of",
"tumour",
"necrosis",
"factor",
"alpha",
"(",
"tnf",
"alpha",
")",
"and",
"abnormally",
"low",
"plasma",
"cysteine",
"levels",
"."
] | [
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"therefore",
"investigated",
"the",
"effects",
"of",
"cysteine",
"and",
"related",
"thiols",
"on",
"HIV-1",
"replication",
"and",
"NF-kappa",
"B",
"expression",
"."
] | [
"we",
"therefore",
"investigated",
"the",
"effects",
"of",
"cysteine",
"and",
"related",
"thiols",
"on",
"hiv-1",
"replication",
"and",
"nf-kappa",
"b",
"expression",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"experiments",
"in",
"this",
"report",
"show",
"that",
"cysteine",
"or",
"N-acetylcysteine",
"(",
"NAC",
")",
"raise",
"the",
"intracellular",
"glutathione",
"(",
"GSH",
")",
"level",
"and",
"inhibit",
"HIV-1",
"replication",
"in",
"persistently",
"infected",
"Molt-4",
"and",
"U937",
"cells",
"."
] | [
"the",
"experiments",
"in",
"this",
"report",
"show",
"that",
"cysteine",
"or",
"n-acetylcysteine",
"(",
"nac",
")",
"raise",
"the",
"intracellular",
"glutathione",
"(",
"gsh",
")",
"level",
"and",
"inhibit",
"hiv-1",
"replication",
"in",
"persistently",
"infected",
"molt-4",
"and",
"u937",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-peptide",
"O",
"B-peptide",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O"
] |
[
"However",
",",
"inhibition",
"of",
"HIV-1",
"replication",
"appears",
"not",
"to",
"be",
"directly",
"correlated",
"with",
"GSH",
"levels",
"."
] | [
"however",
",",
"inhibition",
"of",
"hiv-1",
"replication",
"appears",
"not",
"to",
"be",
"directly",
"correlated",
"with",
"gsh",
"levels",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-peptide",
"O",
"O"
] |
[
"Cysteine",
"and",
"NAC",
"also",
"inhibit",
"NF-kappa",
"B",
"activity",
"as",
"determined",
"by",
"electrophoretic",
"mobility",
"shift",
"assays",
"and",
"chloramphenicol",
"acetyl-transferase",
"(",
"CAT",
")",
"gene",
"expression",
"under",
"control",
"of",
"NF-kappa",
"B",
"binding",
"sites",
"in",
"uninfected",
"cells",
"."
] | [
"cysteine",
"and",
"nac",
"also",
"inhibit",
"nf-kappa",
"b",
"activity",
"as",
"determined",
"by",
"electrophoretic",
"mobility",
"shift",
"assays",
"and",
"chloramphenicol",
"acetyl-transferase",
"(",
"cat",
")",
"gene",
"expression",
"under",
"control",
"of",
"nf-kappa",
"b",
"binding",
"sites",
"in",
"uninfected",
"cells",
"."
] | [
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"This",
"suggests",
"that",
"the",
"cysteine",
"deficiency",
"in",
"HIV-1",
"-infected",
"individuals",
"may",
"cause",
"an",
"over-expression",
"of",
"NF-kappa",
"B",
"-dependent",
"genes",
"and",
"enhance",
"HIV-1",
"replication",
"."
] | [
"this",
"suggests",
"that",
"the",
"cysteine",
"deficiency",
"in",
"hiv-1",
"-infected",
"individuals",
"may",
"cause",
"an",
"over-expression",
"of",
"nf-kappa",
"b",
"-dependent",
"genes",
"and",
"enhance",
"hiv-1",
"replication",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"O"
] |
[
"NAC",
"may",
"be",
"considered",
"for",
"the",
"treatment",
"of",
"HIV-1",
"-infected",
"individuals",
"."
] | [
"nac",
"may",
"be",
"considered",
"for",
"the",
"treatment",
"of",
"hiv-1",
"-infected",
"individuals",
"."
] | [
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"interleukin-8",
"AP-1",
"and",
"kappa",
"B-like",
"sites",
"are",
"genetic",
"end",
"targets",
"of",
"FK506-sensitive",
"pathway",
"accompanied",
"by",
"calcium",
"mobilization",
"."
] | [
"the",
"interleukin-8",
"ap-1",
"and",
"kappa",
"b-like",
"sites",
"are",
"genetic",
"end",
"targets",
"of",
"fk506-sensitive",
"pathway",
"accompanied",
"by",
"calcium",
"mobilization",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-atom",
"O",
"O"
] |
[
"FK506",
",",
"an",
"immunosuppressant",
",",
"inhibits",
"the",
"production",
"of",
"several",
"cytokines",
"in",
"T",
"lymphocytes",
"."
] | [
"fk506",
",",
"an",
"immunosuppressant",
",",
"inhibits",
"the",
"production",
"of",
"several",
"cytokines",
"in",
"t",
"lymphocytes",
"."
] | [
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"We",
"observed",
"that",
"FK506",
"suppressed",
"the",
"transcription",
"of",
"a",
"chemotactic",
"cytokine",
",",
"interleukin-8",
"(",
"IL-8",
")",
"in",
"a",
"human",
"T",
"cell",
"line",
",",
"Jurkat",
"cells",
",",
"activated",
"by",
"phorbol",
"12-myristate",
"13-acetate",
"(",
"PMA",
")",
"and",
"calcium",
"(",
"Ca2+",
")",
"ionophore",
"(",
"ionomycin",
")",
"."
] | [
"we",
"observed",
"that",
"fk506",
"suppressed",
"the",
"transcription",
"of",
"a",
"chemotactic",
"cytokine",
",",
"interleukin-8",
"(",
"il-8",
")",
"in",
"a",
"human",
"t",
"cell",
"line",
",",
"jurkat",
"cells",
",",
"activated",
"by",
"phorbol",
"12-myristate",
"13-acetate",
"(",
"pma",
")",
"and",
"calcium",
"(",
"ca2+",
")",
"ionophore",
"(",
"ionomycin",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-atom",
"O",
"B-atom",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O"
] |
[
"By",
"deleted",
"and",
"mutated",
"analysis",
"of",
"the",
"IL-8",
"promoters",
",",
"the",
"AP-1",
"and",
"kappa",
"B-like",
"sites",
"were",
"identified",
"as",
"the",
"responsive",
"elements",
"for",
"PMA",
"and",
"ionomycin",
"."
] | [
"by",
"deleted",
"and",
"mutated",
"analysis",
"of",
"the",
"il-8",
"promoters",
",",
"the",
"ap-1",
"and",
"kappa",
"b-like",
"sites",
"were",
"identified",
"as",
"the",
"responsive",
"elements",
"for",
"pma",
"and",
"ionomycin",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O"
] |
[
"FK506",
"suppressed",
"the",
"transcriptions",
"through",
"the",
"AP-1",
"or",
"kappa",
"B-like",
"sites",
"induced",
"by",
"PMA",
"plus",
"Ca",
"(",
"2+",
")",
"-mobilizing",
"agents",
",",
"but",
"not",
"those",
"induced",
"by",
"Ca",
"(",
"2+",
")",
"-independent",
"stimuli",
"."
] | [
"fk506",
"suppressed",
"the",
"transcriptions",
"through",
"the",
"ap-1",
"or",
"kappa",
"b-like",
"sites",
"induced",
"by",
"pma",
"plus",
"ca",
"(",
"2+",
")",
"-mobilizing",
"agents",
",",
"but",
"not",
"those",
"induced",
"by",
"ca",
"(",
"2+",
")",
"-independent",
"stimuli",
"."
] | [
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"gel",
"retardation",
"analysis",
",",
"FK506",
"had",
"little",
"effect",
"on",
"the",
"binding",
"to",
"the",
"AP-1",
"site",
"of",
"PMA",
"/",
"ionomycin",
"-induced",
"nuclear",
"factors",
",",
"which",
"were",
"recognized",
"with",
"anti-JunD",
"or",
"c-Fos",
"antibody",
"."
] | [
"in",
"gel",
"retardation",
"analysis",
",",
"fk506",
"had",
"little",
"effect",
"on",
"the",
"binding",
"to",
"the",
"ap-1",
"site",
"of",
"pma",
"/",
"ionomycin",
"-induced",
"nuclear",
"factors",
",",
"which",
"were",
"recognized",
"with",
"anti-jund",
"or",
"c-fos",
"antibody",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"In",
"contrast",
",",
"FK506",
"or",
"EGTA",
"(",
"Ca2+",
"chelator",
")",
"similarly",
"affected",
"the",
"formation",
"of",
"kappa",
"B-like",
"site",
"binding",
"complexes",
",",
"which",
"were",
"not",
"recognized",
"by",
"any",
"antibodies",
"against",
"the",
"human",
"Rel",
"family",
"proteins",
"(",
"c-Rel",
",",
"p65",
",",
"p50",
",",
"and",
"p49",
")",
"."
] | [
"in",
"contrast",
",",
"fk506",
"or",
"egta",
"(",
"ca2+",
"chelator",
")",
"similarly",
"affected",
"the",
"formation",
"of",
"kappa",
"b-like",
"site",
"binding",
"complexes",
",",
"which",
"were",
"not",
"recognized",
"by",
"any",
"antibodies",
"against",
"the",
"human",
"rel",
"family",
"proteins",
"(",
"c-rel",
",",
"p65",
",",
"p50",
",",
"and",
"p49",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-atom",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"Furthermore",
",",
"we",
"confirmed",
"the",
"previous",
"report",
"that",
"FK506",
"suppressed",
"the",
"PMA",
"/",
"ionomycin",
"-induced",
"activation",
"through",
"authentic",
"kappa",
"B",
"site",
"of",
"immunoglobulin",
"(",
"Ig",
")",
"gene",
",",
"to",
"which",
"NF-kappa",
"B",
"binding",
"was",
"also",
"decreased",
"by",
"FK506",
",",
"indicating",
"that",
"both",
"IL-8",
"kappa",
"B-like",
"site",
"and",
"Ig",
"kappa",
"B",
"site",
"are",
"FK506",
"-sensitive",
"in",
"spite",
"of",
"the",
"difference",
"of",
"binding",
"factors",
"."
] | [
"furthermore",
",",
"we",
"confirmed",
"the",
"previous",
"report",
"that",
"fk506",
"suppressed",
"the",
"pma",
"/",
"ionomycin",
"-induced",
"activation",
"through",
"authentic",
"kappa",
"b",
"site",
"of",
"immunoglobulin",
"(",
"ig",
")",
"gene",
",",
"to",
"which",
"nf-kappa",
"b",
"binding",
"was",
"also",
"decreased",
"by",
"fk506",
",",
"indicating",
"that",
"both",
"il-8",
"kappa",
"b-like",
"site",
"and",
"ig",
"kappa",
"b",
"site",
"are",
"fk506",
"-sensitive",
"in",
"spite",
"of",
"the",
"difference",
"of",
"binding",
"factors",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"Our",
"results",
"indicate",
"that",
"not",
"only",
"the",
"reported",
"IL-2",
"NF-AT",
"and",
"NFIL-2A",
"sites",
"and",
"Ig",
"kappa",
"B",
"site",
",",
"but",
"also",
"the",
"IL-8",
"AP-1",
"and",
"kappa",
"B-like",
"sites",
"are",
"terminals",
"of",
"FK506",
"-sensitive",
"pathway",
"involving",
"Ca2+",
"mobilization",
"."
] | [
"our",
"results",
"indicate",
"that",
"not",
"only",
"the",
"reported",
"il-2",
"nf-at",
"and",
"nfil-2a",
"sites",
"and",
"ig",
"kappa",
"b",
"site",
",",
"but",
"also",
"the",
"il-8",
"ap-1",
"and",
"kappa",
"b-like",
"sites",
"are",
"terminals",
"of",
"fk506",
"-sensitive",
"pathway",
"involving",
"ca2+",
"mobilization",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"B-atom",
"O",
"O"
] |
[
"Host",
"defense",
"mechanisms",
"triggered",
"by",
"microbial",
"lipoproteins",
"through",
"toll-like",
"receptors",
"."
] | [
"host",
"defense",
"mechanisms",
"triggered",
"by",
"microbial",
"lipoproteins",
"through",
"toll-like",
"receptors",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"The",
"generation",
"of",
"cell-mediated",
"immunity",
"against",
"many",
"infectious",
"pathogens",
"involves",
"the",
"production",
"of",
"interleukin-12",
"(",
"IL-12",
")",
",",
"a",
"key",
"signal",
"of",
"the",
"innate",
"immune",
"system",
"."
] | [
"the",
"generation",
"of",
"cell-mediated",
"immunity",
"against",
"many",
"infectious",
"pathogens",
"involves",
"the",
"production",
"of",
"interleukin-12",
"(",
"il-12",
")",
",",
"a",
"key",
"signal",
"of",
"the",
"innate",
"immune",
"system",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-mono_cell",
"I-mono_cell",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-body_part",
"I-body_part",
"I-body_part",
"O"
] |
[
"Yet",
",",
"for",
"many",
"pathogens",
",",
"the",
"molecules",
"that",
"induce",
"IL-12",
"production",
"by",
"macrophages",
"and",
"the",
"mechanisms",
"by",
"which",
"they",
"do",
"so",
"remain",
"undefined",
"."
] | [
"yet",
",",
"for",
"many",
"pathogens",
",",
"the",
"molecules",
"that",
"induce",
"il-12",
"production",
"by",
"macrophages",
"and",
"the",
"mechanisms",
"by",
"which",
"they",
"do",
"so",
"remain",
"undefined",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Here",
"it",
"is",
"shown",
"that",
"microbial",
"lipoproteins",
"are",
"potent",
"stimulators",
"of",
"IL-12",
"production",
"by",
"human",
"macrophages",
",",
"and",
"that",
"induction",
"is",
"mediated",
"by",
"Toll-like",
"receptors",
"(",
"TLRs",
")",
"."
] | [
"here",
"it",
"is",
"shown",
"that",
"microbial",
"lipoproteins",
"are",
"potent",
"stimulators",
"of",
"il-12",
"production",
"by",
"human",
"macrophages",
",",
"and",
"that",
"induction",
"is",
"mediated",
"by",
"toll-like",
"receptors",
"(",
"tlrs",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O"
] |
[
"Several",
"lipoproteins",
"stimulated",
"TLR-dependent",
"transcription",
"of",
"inducible",
"nitric",
"oxide",
"synthase",
"and",
"the",
"production",
"of",
"nitric",
"oxide",
",",
"a",
"powerful",
"microbicidal",
"pathway",
"."
] | [
"several",
"lipoproteins",
"stimulated",
"tlr-dependent",
"transcription",
"of",
"inducible",
"nitric",
"oxide",
"synthase",
"and",
"the",
"production",
"of",
"nitric",
"oxide",
",",
"a",
"powerful",
"microbicidal",
"pathway",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-inorganic",
"I-inorganic",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Activation",
"of",
"TLRs",
"by",
"microbial",
"lipoproteins",
"may",
"initiate",
"innate",
"defense",
"mechanisms",
"against",
"infectious",
"pathogens",
"."
] | [
"activation",
"of",
"tlrs",
"by",
"microbial",
"lipoproteins",
"may",
"initiate",
"innate",
"defense",
"mechanisms",
"against",
"infectious",
"pathogens",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-mono_cell",
"I-mono_cell",
"O"
] |
[
"An",
"in",
"vitro",
"globin",
"gene",
"switching",
"model",
"based",
"on",
"differentiated",
"embryonic",
"stem",
"cells",
"."
] | [
"an",
"in",
"vitro",
"globin",
"gene",
"switching",
"model",
"based",
"on",
"differentiated",
"embryonic",
"stem",
"cells",
"."
] | [
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"We",
"used",
"mouse",
"embryonic",
"stem",
"(",
"ES",
")",
"cells",
"to",
"study",
"globin",
"gene",
"expression",
"and",
"switching",
"in",
"vitro",
"."
] | [
"we",
"used",
"mouse",
"embryonic",
"stem",
"(",
"es",
")",
"cells",
"to",
"study",
"globin",
"gene",
"expression",
"and",
"switching",
"in",
"vitro",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"show",
"that",
"ES-derived",
"embryoid",
"bodies",
"express",
"the",
"full",
"complement",
"of",
"mouse",
"embryonic",
"globin",
"genes",
"in",
"the",
"correct",
"temporal",
"order",
"and",
"that",
"on",
"further",
"differentiation",
",",
"a",
"switch",
"occurs",
"to",
"the",
"fetal/adult",
"genes",
"."
] | [
"we",
"show",
"that",
"es-derived",
"embryoid",
"bodies",
"express",
"the",
"full",
"complement",
"of",
"mouse",
"embryonic",
"globin",
"genes",
"in",
"the",
"correct",
"temporal",
"order",
"and",
"that",
"on",
"further",
"differentiation",
",",
"a",
"switch",
"occurs",
"to",
"the",
"fetal/adult",
"genes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"the",
"erythroid-specific",
"transcription",
"factor",
"NF-E1",
"was",
"shown",
"to",
"be",
"expressed",
"coordinately",
"with",
"that",
"of",
"globin",
"in",
"embryoid",
"bodies",
"."
] | [
"in",
"addition",
",",
"the",
"erythroid-specific",
"transcription",
"factor",
"nf-e1",
"was",
"shown",
"to",
"be",
"expressed",
"coordinately",
"with",
"that",
"of",
"globin",
"in",
"embryoid",
"bodies",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"We",
"conclude",
"from",
"these",
"experiments",
"that",
"the",
"ES",
"cell",
"system",
"provides",
"a",
"good",
"model",
"to",
"study",
"hematopoietic",
"development",
"."
] | [
"we",
"conclude",
"from",
"these",
"experiments",
"that",
"the",
"es",
"cell",
"system",
"provides",
"a",
"good",
"model",
"to",
"study",
"hematopoietic",
"development",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"When",
"the",
"human",
"epsilon-",
"or",
"beta-",
"globin",
"genes",
"driven",
"by",
"the",
"dominant",
"control",
"region",
"(",
"DCR",
")",
"are",
"introduced",
"into",
"this",
"system",
",",
"the",
"human",
"epsilon-",
"globin",
"gene",
",",
"in",
"contrast",
"to",
"the",
"beta-",
"globin",
"gene",
",",
"is",
"not",
"deregulated",
"by",
"the",
"presence",
"of",
"the",
"DCR",
"and",
"is",
"expressed",
"strictly",
"as",
"an",
"embryonic",
"gene",
"."
] | [
"when",
"the",
"human",
"epsilon-",
"or",
"beta-",
"globin",
"genes",
"driven",
"by",
"the",
"dominant",
"control",
"region",
"(",
"dcr",
")",
"are",
"introduced",
"into",
"this",
"system",
",",
"the",
"human",
"epsilon-",
"globin",
"gene",
",",
"in",
"contrast",
"to",
"the",
"beta-",
"globin",
"gene",
",",
"is",
"not",
"deregulated",
"by",
"the",
"presence",
"of",
"the",
"dcr",
"and",
"is",
"expressed",
"strictly",
"as",
"an",
"embryonic",
"gene",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O"
] |
[
"We",
"conclude",
"from",
"this",
"that",
"the",
"epsilon-",
"globin",
"gene",
"is",
"not",
"regulated",
"by",
"competition",
"with",
"other",
"genes",
"in",
"the",
"human",
"beta-globin",
"locus",
"."
] | [
"we",
"conclude",
"from",
"this",
"that",
"the",
"epsilon-",
"globin",
"gene",
"is",
"not",
"regulated",
"by",
"competition",
"with",
"other",
"genes",
"in",
"the",
"human",
"beta-globin",
"locus",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"Anti-rheumatic",
"compound",
"aurothioglucose",
"inhibits",
"tumor",
"necrosis",
"factor-alpha",
"-induced",
"HIV-1",
"replication",
"in",
"latently",
"infected",
"OM10",
".",
"1",
"and",
"Ach2",
"cells",
"."
] | [
"anti-rheumatic",
"compound",
"aurothioglucose",
"inhibits",
"tumor",
"necrosis",
"factor-alpha",
"-induced",
"hiv-1",
"replication",
"in",
"latently",
"infected",
"om10",
".",
"1",
"and",
"ach2",
"cells",
"."
] | [
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
Subsets and Splits