enoriega/GENIA-Term-Corpus · Datasets at Hugging Face

[ "Autocrine", "activation", "by", "interferon-gamma", "of", "STAT", "factors", "following", "T", "cell", "activation", "." ]

[ "autocrine", "activation", "by", "interferon-gamma", "of", "stat", "factors", "following", "t", "cell", "activation", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "The", "activation", "of", "T", "cells", "requires", "engagement", "of", "the", "T", "cell", "receptor/CD3", "complex", "and", "co-stimulatory", "molecules", ",", "and", "results", "in", "the", "triggering", "of", "several", "signaling", "pathways", "which", "lead", "rapidly", "to", "the", "nuclear", "translocation", "of", "several", "transcription", "factors", ",", "such", "as", "nuclear", "factor", "(", "NF", ")", "-kappa", "B", "and", "NF-AT", "." ]

[ "the", "activation", "of", "t", "cells", "requires", "engagement", "of", "the", "t", "cell", "receptor/cd3", "complex", "and", "co-stimulatory", "molecules", ",", "and", "results", "in", "the", "triggering", "of", "several", "signaling", "pathways", "which", "lead", "rapidly", "to", "the", "nuclear", "translocation", "of", "several", "transcription", "factors", ",", "such", "as", "nuclear", "factor", "(", "nf", ")", "-kappa", "b", "and", "nf-at", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "B-protein_family_or_group", "O" ]

[ "A", "result", "of", "this", "activation", "process", "is", "the", "induction", "of", "a", "number", "of", "genes", ",", "including", "those", "encoding", "cytokines", "such", "as", "interleukin-2", ",", "tumor", "necrosis", "factor-alpha", ",", "and", "interferon", "(", "IFN", ")", "-gamma", "which", "have", "important", "immunoregulatory", "effects", "." ]

[ "a", "result", "of", "this", "activation", "process", "is", "the", "induction", "of", "a", "number", "of", "genes", ",", "including", "those", "encoding", "cytokines", "such", "as", "interleukin-2", ",", "tumor", "necrosis", "factor-alpha", ",", "and", "interferon", "(", "ifn", ")", "-gamma", "which", "have", "important", "immunoregulatory", "effects", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O" ]

[ "We", "report", "here", "that", "a", "DNA-binding", "factor", "containing", "STAT1", "also", "becomes", "activated", "in", "human", "peripheral", "blood", "T", "lymphocytes", "or", "Jurkat", "cells", ",", "although", "not", "until", "1-2", "h", "after", "stimulation", "." ]

[ "we", "report", "here", "that", "a", "dna-binding", "factor", "containing", "stat1", "also", "becomes", "activated", "in", "human", "peripheral", "blood", "t", "lymphocytes", "or", "jurkat", "cells", ",", "although", "not", "until", "1-2", "h", "after", "stimulation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Activation", "is", "delayed", "a", "further", "1-2", "hr", "when", "mononuclear", "cell", "cultures", "are", "stimulated", "by", "an", "antigen", "which", "requires", "processing", "." ]

[ "activation", "is", "delayed", "a", "further", "1-2", "hr", "when", "mononuclear", "cell", "cultures", "are", "stimulated", "by", "an", "antigen", "which", "requires", "processing", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Appearance", "of", "the", "STAT1", "factor", "is", "significantly", "reduced", "in", "the", "presence", "of", "cyclosporin", "A", ",", "and", "blocked", "by", "cycloheximide", ",", "indicating", "that", "its", "activation", "is", "dependent", "upon", "a", "protein", "(", "s", ")", "synthesized", "in", "response", "to", "initial", "signaling", "events", "." ]

[ "appearance", "of", "the", "stat1", "factor", "is", "significantly", "reduced", "in", "the", "presence", "of", "cyclosporin", "a", ",", "and", "blocked", "by", "cycloheximide", ",", "indicating", "that", "its", "activation", "is", "dependent", "upon", "a", "protein", "(", "s", ")", "synthesized", "in", "response", "to", "initial", "signaling", "events", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Neutralizing", "antiserum", "against", "IFN-gamma", ",", "but", "not", "other", "cytokines", "tested", ",", "blocked", "activation", "of", "the", "factor", "almost", "completely", ",", "and", "IFN-gamma", "was", "found", "in", "the", "culture", "supernatants", "of", "stimulated", "cells", "at", "levels", "at", "which", "recombinant", "IFN-gamma", "could", "activate", "the", "factor", "in", "naive", "cells", "." ]

[ "neutralizing", "antiserum", "against", "ifn-gamma", ",", "but", "not", "other", "cytokines", "tested", ",", "blocked", "activation", "of", "the", "factor", "almost", "completely", ",", "and", "ifn-gamma", "was", "found", "in", "the", "culture", "supernatants", "of", "stimulated", "cells", "at", "levels", "at", "which", "recombinant", "ifn-gamma", "could", "activate", "the", "factor", "in", "naive", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "Therefore", ",", "a", "STAT1", "transcription", "factor", "is", "activated", "by", "IFN-gamma", "synthesized", "and", "released", "upon", "stimulation", "of", "T", "lymphocyte", "populations", "." ]

[ "therefore", ",", "a", "stat1", "transcription", "factor", "is", "activated", "by", "ifn-gamma", "synthesized", "and", "released", "upon", "stimulation", "of", "t", "lymphocyte", "populations", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "While", "Jurkat", "cells", "both", "secrete", "and", "respond", "to", "IFN-gamma", "in", "an", "autocrine", "loop", ",", "it", "seems", "likely", "that", "the", "responding", "cells", "may", "differ", "from", "those", "synthesizing", "this", "cytokine", "in", "the", "mononuclear", "cell", "cultures", "in", "the", "light", "of", "the", "recent", "report", "that", "Th1", "cells", "lack", "the", "IFN-gamma", "receptor", "chain", "necessary", "for", "activation", "of", "STAT1", "(", "Pernis", ",", "A", ".", ",", "Gupta", ",", "S", ".", ",", "Gollob", ",", "K", ".", "J", ".", ",", "Garfein", ",", "E", ".", ",", "Coffman", ",", "R", ".", "L", ".", ",", "Schindler", ",", "C", ".", ",", "and", "Rothman", ",", "P", ".", ",", "Science", "1995", ".", "269", ":", "245", ")", "." ]

[ "while", "jurkat", "cells", "both", "secrete", "and", "respond", "to", "ifn-gamma", "in", "an", "autocrine", "loop", ",", "it", "seems", "likely", "that", "the", "responding", "cells", "may", "differ", "from", "those", "synthesizing", "this", "cytokine", "in", "the", "mononuclear", "cell", "cultures", "in", "the", "light", "of", "the", "recent", "report", "that", "th1", "cells", "lack", "the", "ifn-gamma", "receptor", "chain", "necessary", "for", "activation", "of", "stat1", "(", "pernis", ",", "a", ".", ",", "gupta", ",", "s", ".", ",", "gollob", ",", "k", ".", "j", ".", ",", "garfein", ",", "e", ".", ",", "coffman", ",", "r", ".", "l", ".", ",", "schindler", ",", "c", ".", ",", "and", "rothman", ",", "p", ".", ",", "science", "1995", ".", "269", ":", "245", ")", "." ]

[ "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Monocytic", "cell", "type-specific", "transcriptional", "induction", "of", "collagenase", "." ]

[ "monocytic", "cell", "type-specific", "transcriptional", "induction", "of", "collagenase", "." ]

[ "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "Interstitial", "collagenase", "(", "MMP-1", ")", ",", "a", "metalloproteinase", "produced", "by", "resident", "and", "inflammatory", "cells", "during", "connective", "tissue", "turnover", ",", "cleaves", "type", "I", "collagen", "fibrils", "." ]

[ "interstitial", "collagenase", "(", "mmp-1", ")", ",", "a", "metalloproteinase", "produced", "by", "resident", "and", "inflammatory", "cells", "during", "connective", "tissue", "turnover", ",", "cleaves", "type", "i", "collagen", "fibrils", "." ]

[ "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "I-protein_complex", "O" ]

[ "This", "catalytic", "event", "is", "rate", "limiting", "in", "remodeling", "of", "tissues", "rich", "in", "fibrillar", "collagen", "such", "as", "the", "skin", "and", "lungs", "." ]

[ "this", "catalytic", "event", "is", "rate", "limiting", "in", "remodeling", "of", "tissues", "rich", "in", "fibrillar", "collagen", "such", "as", "the", "skin", "and", "lungs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-body_part", "O", "B-body_part", "O" ]

[ "The", "regulation", "of", "collagenase", "expression", "is", "cell-type", "specific", ";", "bacterial", "LPS", "and", "zymosan", ",", "a", "yeast", "cell", "wall", "derivative", ",", "are", "potent", "inducers", "of", "collagenase", "expression", "in", "macrophages", ",", "but", "do", "not", "alter", "fibroblast", "collagenase", "expression", "." ]

[ "the", "regulation", "of", "collagenase", "expression", "is", "cell-type", "specific", ";", "bacterial", "lps", "and", "zymosan", ",", "a", "yeast", "cell", "wall", "derivative", ",", "are", "potent", "inducers", "of", "collagenase", "expression", "in", "macrophages", ",", "but", "do", "not", "alter", "fibroblast", "collagenase", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "B-lipid", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "B-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "Since", "promoter", "elements", "controlling", "collagenase", "transcription", "in", "monocytic", "cells", "have", "not", "been", "previously", "defined", ",", "we", "sought", "to", "delineate", "responsive", "cis-acting", "elements", "of", "the", "collagenase", "promoter", "in", "transiently", "transfected", "human", "(", "U937", ")", "and", "murine", "(", "J774", ")", "monocytic", "cell", "lines", "." ]

[ "since", "promoter", "elements", "controlling", "collagenase", "transcription", "in", "monocytic", "cells", "have", "not", "been", "previously", "defined", ",", "we", "sought", "to", "delineate", "responsive", "cis-acting", "elements", "of", "the", "collagenase", "promoter", "in", "transiently", "transfected", "human", "(", "u937", ")", "and", "murine", "(", "j774", ")", "monocytic", "cell", "lines", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Deletion", "constructs", "containing", "as", "little", "as", "72", "bp", "of", "5'", "-flanking", "sequence", "of", "the", "collagenase", "promoter", "were", "sufficient", "for", "LPS-", "or", "zymosan-", "mediated", "transcriptional", "induction", ",", "whereas", "phorbol", "inducibility", "exhibited", "an", "absolute", "requirement", "for", "upstream", "elements", "including", "the", "polyoma", "enhancer", "A-binding", "protein-3", "site", "(", "-83", "to", "-91", ")", "and", "TTCA", "sequence", "(", "-102", "to", "-105", ")", "in", "both", "monocytic", "cells", "and", "fibroblasts", "." ]

[ "deletion", "constructs", "containing", "as", "little", "as", "72", "bp", "of", "5'", "-flanking", "sequence", "of", "the", "collagenase", "promoter", "were", "sufficient", "for", "lps-", "or", "zymosan-", "mediated", "transcriptional", "induction", ",", "whereas", "phorbol", "inducibility", "exhibited", "an", "absolute", "requirement", "for", "upstream", "elements", "including", "the", "polyoma", "enhancer", "a-binding", "protein-3", "site", "(", "-83", "to", "-91", ")", "and", "ttca", "sequence", "(", "-102", "to", "-105", ")", "in", "both", "monocytic", "cells", "and", "fibroblasts", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-polynucleotide", "I-polynucleotide", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-cell_type", "O" ]

[ "Mutagenesis", "of", "the", "activator", "protein-1", "[", "AP-1", "]", "site", "at", "-72", "abolished", "basal", "promoter", "activity", "and", "LPS", "/zymosan", "inducibility", ",", "while", "mutagenesis", "of", "an", "NF-kappaB-like", "site", "at", "-20", "to", "-10", "had", "no", "effect", "." ]

[ "mutagenesis", "of", "the", "activator", "protein-1", "[", "ap-1", "]", "site", "at", "-72", "abolished", "basal", "promoter", "activity", "and", "lps", "/zymosan", "inducibility", ",", "while", "mutagenesis", "of", "an", "nf-kappab-like", "site", "at", "-20", "to", "-10", "had", "no", "effect", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-lipid", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Nuclear", "extracts", "from", "LPS", "-and", "zymosan", "-treated", "cells", "showed", "strong", "AP-1", "activity", "by", "gel-shift", "analysis", ",", "and", "supershift", "analysis", "showed", "the", "AP-1", "complexes", "contained", "specific", "members", "of", "both", "the", "jun", "and", "fos", "gene", "families", "." ]

[ "nuclear", "extracts", "from", "lps", "-and", "zymosan", "-treated", "cells", "showed", "strong", "ap-1", "activity", "by", "gel-shift", "analysis", ",", "and", "supershift", "analysis", "showed", "the", "ap-1", "complexes", "contained", "specific", "members", "of", "both", "the", "jun", "and", "fos", "gene", "families", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "data", "indicate", "that", ",", "in", "contrast", "to", "most", "LPS", "effects", ",", "AP-1", ",", "but", "not", "nuclear", "factor-kappaB", ",", "mediates", "LPS", "induction", "of", "collagenase", "transcription", "in", "macrophagelike", "cells", "." ]

[ "these", "data", "indicate", "that", ",", "in", "contrast", "to", "most", "lps", "effects", ",", "ap-1", ",", "but", "not", "nuclear", "factor-kappab", ",", "mediates", "lps", "induction", "of", "collagenase", "transcription", "in", "macrophagelike", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_complex", "I-protein_complex", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "as", "compared", "to", "regulation", "by", "phorbol", "ester", ",", "collagenase", "induction", "in", "monocytic", "cells", "by", "cell", "wall", "derivatives", "of", "bacteria", "or", "yeast", "is", "largely", "independent", "of", "upstream", "promoter", "sequences", "." ]

[ "furthermore", ",", "as", "compared", "to", "regulation", "by", "phorbol", "ester", ",", "collagenase", "induction", "in", "monocytic", "cells", "by", "cell", "wall", "derivatives", "of", "bacteria", "or", "yeast", "is", "largely", "independent", "of", "upstream", "promoter", "sequences", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-mono_cell", "O", "B-mono_cell", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O" ]

[ "Signaling", "through", "the", "lymphotoxin-beta", "receptor", "stimulates", "HIV-1", "replication", "alone", "and", "in", "cooperation", "with", "soluble", "or", "membrane-bound", "TNF-alpha", "." ]

[ "signaling", "through", "the", "lymphotoxin-beta", "receptor", "stimulates", "hiv-1", "replication", "alone", "and", "in", "cooperation", "with", "soluble", "or", "membrane-bound", "tnf-alpha", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O" ]

[ "The", "level", "of", "ongoing", "HIV-1", "replication", "within", "an", "individual", "is", "critical", "to", "HIV-1", "pathogenesis", "." ]

[ "the", "level", "of", "ongoing", "hiv-1", "replication", "within", "an", "individual", "is", "critical", "to", "hiv-1", "pathogenesis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O" ]

[ "Among", "host", "immune", "factors", ",", "the", "cytokine", "TNF-alpha", "has", "previously", "been", "shown", "to", "increase", "HIV-1", "replication", "in", "various", "monocyte", "and", "T", "cell", "model", "systems", "." ]

[ "among", "host", "immune", "factors", ",", "the", "cytokine", "tnf-alpha", "has", "previously", "been", "shown", "to", "increase", "hiv-1", "replication", "in", "various", "monocyte", "and", "t", "cell", "model", "systems", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Here", ",", "we", "demonstrate", "that", "signaling", "through", "the", "TNF", "receptor", "family", "member", ",", "the", "lymphotoxin-beta", "(", "LT-beta", ")", "receptor", "(", "LT-betaR", ")", ",", "also", "regulates", "HIV-1", "replication", "." ]

[ "here", ",", "we", "demonstrate", "that", "signaling", "through", "the", "tnf", "receptor", "family", "member", ",", "the", "lymphotoxin-beta", "(", "lt-beta", ")", "receptor", "(", "lt-betar", ")", ",", "also", "regulates", "hiv-1", "replication", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "HIV-1", "replication", "is", "cooperatively", "stimulated", "when", "the", "distinct", "LT-betaR", "and", "TNF", "receptor", "systems", "are", "simultaneously", "engaged", "by", "their", "specific", "ligands", "." ]

[ "furthermore", ",", "hiv-1", "replication", "is", "cooperatively", "stimulated", "when", "the", "distinct", "lt-betar", "and", "tnf", "receptor", "systems", "are", "simultaneously", "engaged", "by", "their", "specific", "ligands", "." ]

[ "O", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Moreover", ",", "in", "a", "physiological", "coculture", "cellular", "assay", "system", ",", "we", "show", "that", "membrane-bound", "TNF-alpha", "and", "LT-alpha1beta2", "act", "virtually", "identically", "to", "their", "soluble", "forms", "in", "the", "regulation", "of", "HIV-1", "replication", "." ]

[ "moreover", ",", "in", "a", "physiological", "coculture", "cellular", "assay", "system", ",", "we", "show", "that", "membrane-bound", "tnf-alpha", "and", "lt-alpha1beta2", "act", "virtually", "identically", "to", "their", "soluble", "forms", "in", "the", "regulation", "of", "hiv-1", "replication", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "cosignaling", "via", "the", "LT-beta", "and", "TNF-alpha", "receptors", "is", "probably", "involved", "in", "the", "modulation", "of", "HIV-1", "replication", "and", "the", "subsequent", "determination", "of", "HIV-1", "viral", "burden", "in", "monocytes", "." ]

[ "thus", ",", "cosignaling", "via", "the", "lt-beta", "and", "tnf-alpha", "receptors", "is", "probably", "involved", "in", "the", "modulation", "of", "hiv-1", "replication", "and", "the", "subsequent", "determination", "of", "hiv-1", "viral", "burden", "in", "monocytes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O" ]

[ "Intriguingly", ",", "surface", "expression", "of", "LT-alpha1beta2", "is", "up-regulated", "on", "a", "T", "cell", "line", "acutely", "infected", "with", "HIV-1", ",", "suggesting", "a", "positive", "feedback", "loop", "between", "HIV-1", "infection", ",", "LT-alpha1beta2", "expression", ",", "and", "HIV-1", "replication", "." ]

[ "intriguingly", ",", "surface", "expression", "of", "lt-alpha1beta2", "is", "up-regulated", "on", "a", "t", "cell", "line", "acutely", "infected", "with", "hiv-1", ",", "suggesting", "a", "positive", "feedback", "loop", "between", "hiv-1", "infection", ",", "lt-alpha1beta2", "expression", ",", "and", "hiv-1", "replication", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Given", "the", "critical", "role", "that", "LT-alpha1beta2", "plays", "in", "lymphoid", "architecture", ",", "we", "speculate", "that", "LT-alpha1beta2", "may", "be", "involved", "in", "HIV", "-associated", "abnormalities", "of", "the", "lymphoid", "organs", "." ]

[ "given", "the", "critical", "role", "that", "lt-alpha1beta2", "plays", "in", "lymphoid", "architecture", ",", "we", "speculate", "that", "lt-alpha1beta2", "may", "be", "involved", "in", "hiv", "-associated", "abnormalities", "of", "the", "lymphoid", "organs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "B-body_part", "I-body_part", "O" ]

[ "Glucocorticoid", "resistance", "in", "chronic", "asthma", "." ]

[ "glucocorticoid", "resistance", "in", "chronic", "asthma", "." ]

[ "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Glucocorticoid", "pharmacokinetics", ",", "glucocorticoid", "receptor", "characteristics", ",", "and", "inhibition", "of", "peripheral", "blood", "T", "cell", "proliferation", "by", "glucocorticoids", "in", "vitro", "." ]

[ "glucocorticoid", "pharmacokinetics", ",", "glucocorticoid", "receptor", "characteristics", ",", "and", "inhibition", "of", "peripheral", "blood", "t", "cell", "proliferation", "by", "glucocorticoids", "in", "vitro", "." ]

[ "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O" ]

[ "A", "total", "of", "37", "chronic", ",", "severe", ",", "nonsmoking", "asthmatic", "patients", "with", "documented", "reversible", "airways", "obstruction", "were", "classified", "as", "glucocorticoid-sensitive", "or", "-resistant", "on", "the", "basis", "of", "changes", "in", "FEV1", ",", "FVC", ",", "and", "peak", "expiratory", "flow", "(", "PEF", ")", "after", "oral", "prednisolone", "." ]

[ "a", "total", "of", "37", "chronic", ",", "severe", ",", "nonsmoking", "asthmatic", "patients", "with", "documented", "reversible", "airways", "obstruction", "were", "classified", "as", "glucocorticoid-sensitive", "or", "-resistant", "on", "the", "basis", "of", "changes", "in", "fev1", ",", "fvc", ",", "and", "peak", "expiratory", "flow", "(", "pef", ")", "after", "oral", "prednisolone", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "B-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-other_name", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "O", "O", "B-lipid", "B-lipid", "O" ]

[ "The", "resistant", "patients", "showed", "no", "significant", "improvements", "in", "airflow", "limitation", "." ]

[ "the", "resistant", "patients", "showed", "no", "significant", "improvements", "in", "airflow", "limitation", "." ]

[ "O", "O", "B-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Phytohemagglutinin", "(", "PHA", ")", "-induced", "proliferation", "of", "peripheral", "blood", "T", "lymphocytes", "from", "the", "sensitive", "but", "not", "the", "resistant", "asthmatic", "patients", "was", "significantly", "(", "p", "less", "than", "0", ".", "01", ")", "inhibited", "by", "dexamethasone", "(", "10", "(", "-7", ")", "mol/L", ")", ",", "reflecting", "a", "shift", "of", "the", "dose-response", "curve", "." ]

[ "phytohemagglutinin", "(", "pha", ")", "-induced", "proliferation", "of", "peripheral", "blood", "t", "lymphocytes", "from", "the", "sensitive", "but", "not", "the", "resistant", "asthmatic", "patients", "was", "significantly", "(", "p", "less", "than", "0", ".", "01", ")", "inhibited", "by", "dexamethasone", "(", "10", "(", "-7", ")", "mol/l", ")", ",", "reflecting", "a", "shift", "of", "the", "dose-response", "curve", "." ]

[ "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "B-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "When", "all", "the", "asthmatic", "patients", "were", "analyzed", "together", ",", "there", "was", "a", "significant", "correlation", "between", "the", "degree", "of", "sensitivity", "of", "T", "cells", "to", "dexamethasone", "and", "the", "clinical", "responsiveness", "to", "prednisolone", "(", "p", "less", "than", "0", ".", "01", ")", "." ]

[ "when", "all", "the", "asthmatic", "patients", "were", "analyzed", "together", ",", "there", "was", "a", "significant", "correlation", "between", "the", "degree", "of", "sensitivity", "of", "t", "cells", "to", "dexamethasone", "and", "the", "clinical", "responsiveness", "to", "prednisolone", "(", "p", "less", "than", "0", ".", "01", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "No", "differences", "were", "observed", "between", "six", "of", "the", "sensitive", "and", "resistant", "patients", "in", "the", "clearance", "of", "plasma", "prednisolone", "derived", "from", "orally", "administered", "prednisone", "." ]

[ "no", "differences", "were", "observed", "between", "six", "of", "the", "sensitive", "and", "resistant", "patients", "in", "the", "clearance", "of", "plasma", "prednisolone", "derived", "from", "orally", "administered", "prednisone", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "B-lipid", "O", "O", "B-lipid", "I-lipid", "I-lipid", "O" ]

[ "Peripheral", "blood", "mononuclear", "cell", "glucocorticoid", "receptors", "were", "also", "characterized", "in", "five", "sensitive", "and", "seven", "resistant", "patients", "." ]

[ "peripheral", "blood", "mononuclear", "cell", "glucocorticoid", "receptors", "were", "also", "characterized", "in", "five", "sensitive", "and", "seven", "resistant", "patients", "." ]

[ "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O" ]

[ "The", "numbers", "and", "binding", "affinities", "of", "these", "receptors", "could", "not", "account", "for", "the", "observed", "difference", "in", "the", "susceptibility", "of", "these", "cells", "to", "functional", "inhibition", "by", "dexamethasone", "in", "vitro", "." ]

[ "the", "numbers", "and", "binding", "affinities", "of", "these", "receptors", "could", "not", "account", "for", "the", "observed", "difference", "in", "the", "susceptibility", "of", "these", "cells", "to", "functional", "inhibition", "by", "dexamethasone", "in", "vitro", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "suggest", "that", "clinical", "glucocorticoid", "resistance", "in", "chronic", "asthma", "does", "not", "reflect", "abnormal", "glucocorticoid", "clearance", "but", "may", "be", "due", "at", "least", "partly", "to", "a", "relative", "insensitivity", "of", "T", "lymphocytes", "to", "glucocorticoids", "." ]

[ "these", "results", "suggest", "that", "clinical", "glucocorticoid", "resistance", "in", "chronic", "asthma", "does", "not", "reflect", "abnormal", "glucocorticoid", "clearance", "but", "may", "be", "due", "at", "least", "partly", "to", "a", "relative", "insensitivity", "of", "t", "lymphocytes", "to", "glucocorticoids", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-lipid", "O" ]

[ "This", "lack", "of", "sensitivity", "is", "unexplained", "but", "is", "not", "attributable", "to", "abnormalities", "of", "cellular", "glucocorticoid", "receptors", "." ]

[ "this", "lack", "of", "sensitivity", "is", "unexplained", "but", "is", "not", "attributable", "to", "abnormalities", "of", "cellular", "glucocorticoid", "receptors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O" ]

[ "Evidence", "for", "normal", "vitamin", "D", "receptor", "messenger", "ribonucleic", "acid", "and", "genotype", "in", "absorptive", "hypercalciuria", "." ]

[ "evidence", "for", "normal", "vitamin", "d", "receptor", "messenger", "ribonucleic", "acid", "and", "genotype", "in", "absorptive", "hypercalciuria", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O" ]

[ "Absorptive", "hypercalciuria", "(", "a", "stone-forming", "condition", ")", "is", "characterized", "by", "gut", "hyperabsorption", "of", "calcium", ",", "hypercalciuria", ",", "and", "reduced", "bone", "density", "." ]

[ "absorptive", "hypercalciuria", "(", "a", "stone-forming", "condition", ")", "is", "characterized", "by", "gut", "hyperabsorption", "of", "calcium", ",", "hypercalciuria", ",", "and", "reduced", "bone", "density", "." ]

[ "B-other_name", "B-other_name", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-body_part", "O", "O", "B-atom", "O", "B-other_name", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Inasmuch", "as", "these", "features", "implicate", "enhanced", "calcitriol", "action", "in", "gut", "and", "bone", ",", "we", "analyzed", "the", "vitamin", "D", "receptor", "(", "VDR", ")", "gene", "to", "ascertain", "whether", "an", "abnormality", "of", "this", "gene", "marks", "patients", "with", "intestinal", "hyperabsorption", "of", "calcium", "." ]

[ "inasmuch", "as", "these", "features", "implicate", "enhanced", "calcitriol", "action", "in", "gut", "and", "bone", ",", "we", "analyzed", "the", "vitamin", "d", "receptor", "(", "vdr", ")", "gene", "to", "ascertain", "whether", "an", "abnormality", "of", "this", "gene", "marks", "patients", "with", "intestinal", "hyperabsorption", "of", "calcium", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-lipid", "O", "O", "B-body_part", "O", "B-body_part", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-atom", "O" ]

[ "We", "have", "compared", "the", "frequency", "of", "a", "restriction", "fragment", "length", "polymorphism", "(", "Bsm", "I", ")", "associated", "with", "different", "alleles", "of", "the", "VDR", "gene", "in", "a", "group", "of", "33", "well", "characterized", "absorptive", "hypercalciuric", "patients", "and", "a", "group", "of", "36", "normal", "race-", "and", "age-matched", "control", "subjects", "." ]

[ "we", "have", "compared", "the", "frequency", "of", "a", "restriction", "fragment", "length", "polymorphism", "(", "bsm", "i", ")", "associated", "with", "different", "alleles", "of", "the", "vdr", "gene", "in", "a", "group", "of", "33", "well", "characterized", "absorptive", "hypercalciuric", "patients", "and", "a", "group", "of", "36", "normal", "race-", "and", "age-matched", "control", "subjects", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_substructure", "I-DNA_substructure", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "B-multi_cell", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "O" ]

[ "There", "was", "no", "difference", "between", "the", "distribution", "of", "the", "VDR", "alleles", "in", "the", "patient", "population", "when", "compared", "with", "the", "normal", "population", "." ]

[ "there", "was", "no", "difference", "between", "the", "distribution", "of", "the", "vdr", "alleles", "in", "the", "patient", "population", "when", "compared", "with", "the", "normal", "population", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "The", "coding", "region", "of", "VDR", "messenger", "RNA", "was", "also", "normal", ",", "as", "determined", "by", "both", "DNA", "sequence", "analysis", "and", "chemical", "mismatch", "cleavage", "analysis", "of", "copy", "DNA", "from", "11", "index", "absorptive", "hypercalciuric", "patients", "." ]

[ "the", "coding", "region", "of", "vdr", "messenger", "rna", "was", "also", "normal", ",", "as", "determined", "by", "both", "dna", "sequence", "analysis", "and", "chemical", "mismatch", "cleavage", "analysis", "of", "copy", "dna", "from", "11", "index", "absorptive", "hypercalciuric", "patients", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "I-multi_cell", "I-multi_cell", "B-multi_cell", "O" ]

[ "On", "the", "basis", "of", "these", "results", ",", "we", "propose", "that", "the", "enhanced", "intestinal", "calcium", "absorption", "invariably", "seen", "in", "absorptive", "hypercalciuria", "and", "attendant", "symptoms", "of", "this", "disorder", "are", "not", "attributable", "to", "mutations", "of", "the", "VDR", "and", "are", "not", "linked", "to", "a", "common", "VDR", "genotype", "." ]

[ "on", "the", "basis", "of", "these", "results", ",", "we", "propose", "that", "the", "enhanced", "intestinal", "calcium", "absorption", "invariably", "seen", "in", "absorptive", "hypercalciuria", "and", "attendant", "symptoms", "of", "this", "disorder", "are", "not", "attributable", "to", "mutations", "of", "the", "vdr", "and", "are", "not", "linked", "to", "a", "common", "vdr", "genotype", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "B-atom", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "B-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O" ]

[ "Comparison", "of", "HTLV-I", "basal", "transcription", "and", "expression", "of", "CREB/ATF-1/CREM", "family", "members", "in", "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "and", "Jurkat", "T", "cells", "." ]

[ "comparison", "of", "htlv-i", "basal", "transcription", "and", "expression", "of", "creb/atf-1/crem", "family", "members", "in", "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "and", "jurkat", "t", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O" ]

[ "HTLV-I", "is", "the", "etiologic", "agent", "of", "adult", "T-cell", "leukemia", "/lymphoma", "and", "is", "associated", "with", "tropical", "spastic", "paraparesis/", "HTLV-I", "-associated", "myelopathy", "." ]

[ "htlv-i", "is", "the", "etiologic", "agent", "of", "adult", "t-cell", "leukemia", "/lymphoma", "and", "is", "associated", "with", "tropical", "spastic", "paraparesis/", "htlv-i", "-associated", "myelopathy", "." ]

[ "B-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "B-virus", "O", "O", "O" ]

[ "Following", "integration", "into", "the", "host", "cell", "genome", ",", "HTLV-I", "replication", "is", "regulated", "by", "both", "host", "and", "viral", "mechanisms", "that", "control", "transcription", "." ]

[ "following", "integration", "into", "the", "host", "cell", "genome", ",", "htlv-i", "replication", "is", "regulated", "by", "both", "host", "and", "viral", "mechanisms", "that", "control", "transcription", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Low", "levels", "of", "viral", "transcription", "(", "basal", "transcription", ")", "occur", "before", "expression", "of", "the", "virally", "encoded", "Tax", "protein", "(", "Tax", "-mediated", "transcription", ")", "." ]

[ "low", "levels", "of", "viral", "transcription", "(", "basal", "transcription", ")", "occur", "before", "expression", "of", "the", "virally", "encoded", "tax", "protein", "(", "tax", "-mediated", "transcription", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Members", "of", "the", "cyclic", "adenosine", "monophosphate", "(", "cAMP", ")", "response", "element", "binding", "(", "CREB", ")", "/activating", "transcription", "factor", "1", "(", "ATF-1", ")", "family", "of", "transcription", "factors", "bind", "three", "21-bp", "repeats", "(", "Tax-responsive", "element-1", ",", "or", "TRE-1", ")", "within", "the", "viral", "promoter", "and", "are", "important", "for", "basal", "and", "Tax-mediated", "transcription", "." ]

[ "members", "of", "the", "cyclic", "adenosine", "monophosphate", "(", "camp", ")", "response", "element", "binding", "(", "creb", ")", "/activating", "transcription", "factor", "1", "(", "atf-1", ")", "family", "of", "transcription", "factors", "bind", "three", "21-bp", "repeats", "(", "tax-responsive", "element-1", ",", "or", "tre-1", ")", "within", "the", "viral", "promoter", "and", "are", "important", "for", "basal", "and", "tax-mediated", "transcription", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-nucleotide", "I-nucleotide", "I-nucleotide", "O", "B-nucleotide", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Using", "mitogen", "stimulated", "and", "quiescent", "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "(", "PBMC", ")", "and", "Jurkat", "cells", ",", "we", "compared", "differences", "in", "basal", "transcription", "and", "amounts", "and", "binding", "of", "transcription", "factors", "with", "TRE-1", "." ]

[ "using", "mitogen", "stimulated", "and", "quiescent", "peripheral", "blood", "mononuclear", "cells", "(", "pbmc", ")", "and", "jurkat", "cells", ",", "we", "compared", "differences", "in", "basal", "transcription", "and", "amounts", "and", "binding", "of", "transcription", "factors", "with", "tre-1", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-cell_type", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "We", "demonstrate", "that", "amounts", "of", "transcriptionally", "active", "phosphorylated", "CREB", "protein", "(", "P-CREB", ")", "differ", "between", "activated", "PBMC", "and", "Jurkat", "cells", "." ]

[ "we", "demonstrate", "that", "amounts", "of", "transcriptionally", "active", "phosphorylated", "creb", "protein", "(", "p-creb", ")", "differ", "between", "activated", "pbmc", "and", "jurkat", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O" ]

[ "Following", "stimulation", ",", "P-CREB", "levels", "remain", "elevated", "in", "PBMC", "for", "up", "to", "24", "hours", "whereas", "CREB", "is", "dephosphorylated", "in", "Jurkat", "cells", "within", "4", "hours", "following", "stimulation", "." ]

[ "following", "stimulation", ",", "p-creb", "levels", "remain", "elevated", "in", "pbmc", "for", "up", "to", "24", "hours", "whereas", "creb", "is", "dephosphorylated", "in", "jurkat", "cells", "within", "4", "hours", "following", "stimulation", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "differences", "in", "P-CREB", "levels", "between", "PBMC", "and", "Jurkat", "cells", "were", "directly", "correlated", "with", "basal", "transcription", "of", "HTLV-I", "in", "the", "two", "cell", "types", "." ]

[ "the", "differences", "in", "p-creb", "levels", "between", "pbmc", "and", "jurkat", "cells", "were", "directly", "correlated", "with", "basal", "transcription", "of", "htlv-i", "in", "the", "two", "cell", "types", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Using", "electrophoretic", "mobility", "shift", "assays", ",", "we", "determined", "that", "the", "pattern", "of", "band", "migration", "differed", "between", "the", "two", "cell", "types", "." ]

[ "using", "electrophoretic", "mobility", "shift", "assays", ",", "we", "determined", "that", "the", "pattern", "of", "band", "migration", "differed", "between", "the", "two", "cell", "types", "." ]

[ "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "data", "demonstrate", "that", "PBMC", "differentially", "regulate", "basal", "HTLV-I", "transcription", "compared", "with", "Jurkat", "T", "cells", ",", "and", "this", "differential", "regulation", "is", "due", ",", "in", "part", "to", "differential", "phosphorylation", "and", "binding", "of", "CREB/ATF-1", "to", "TRE-1", "in", "the", "HTLV-I", "promoter", "." ]

[ "these", "data", "demonstrate", "that", "pbmc", "differentially", "regulate", "basal", "htlv-i", "transcription", "compared", "with", "jurkat", "t", "cells", ",", "and", "this", "differential", "regulation", "is", "due", ",", "in", "part", "to", "differential", "phosphorylation", "and", "binding", "of", "creb/atf-1", "to", "tre-1", "in", "the", "htlv-i", "promoter", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-virus", "O", "O" ]

[ "We", "demonstrate", "the", "utility", "of", "using", "primary", "lymphocyte", "models", "to", "study", "HTLV-I", "transcription", "in", "the", "context", "of", "cell", "signaling", "and", "suggest", "that", "activated", "PBMC", "maintain", "elevated", "levels", "of", "P-CREB", ",", "which", "promote", "basal", "HTLV-I", "transcription", "and", "enhance", "viral", "persistence", "in", "vivo", "." ]

[ "we", "demonstrate", "the", "utility", "of", "using", "primary", "lymphocyte", "models", "to", "study", "htlv-i", "transcription", "in", "the", "context", "of", "cell", "signaling", "and", "suggest", "that", "activated", "pbmc", "maintain", "elevated", "levels", "of", "p-creb", ",", "which", "promote", "basal", "htlv-i", "transcription", "and", "enhance", "viral", "persistence", "in", "vivo", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-virus", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O" ]

[ "Transcriptional", "regulation", "of", "lysosomal", "acid", "lipase", "in", "differentiating", "monocytes", "is", "mediated", "by", "transcription", "factors", "Sp1", "and", "AP-2", "." ]

[ "transcriptional", "regulation", "of", "lysosomal", "acid", "lipase", "in", "differentiating", "monocytes", "is", "mediated", "by", "transcription", "factors", "sp1", "and", "ap-2", "." ]

[ "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "Human", "lysosomal", "acid", "lipase", "(", "LAL", ")", "is", "a", "hydrolase", "required", "for", "the", "cleavage", "of", "cholesteryl", "esters", "and", "triglycerides", "derived", "from", "plasma", "lipoproteins", "." ]

[ "human", "lysosomal", "acid", "lipase", "(", "lal", ")", "is", "a", "hydrolase", "required", "for", "the", "cleavage", "of", "cholesteryl", "esters", "and", "triglycerides", "derived", "from", "plasma", "lipoproteins", "." ]

[ "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-lipid", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "It", "is", "shown", "here", "that", "during", "monocyte", "to", "macrophage", "differentiation", ",", "the", "expression", "of", "LAL", "-mRNA", "is", "induced", "." ]

[ "it", "is", "shown", "here", "that", "during", "monocyte", "to", "macrophage", "differentiation", ",", "the", "expression", "of", "lal", "-mrna", "is", "induced", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "induction", "is", "dependent", "on", "protein", "kinase", "C", "activity", "and", "protein", "synthesis", "." ]

[ "this", "induction", "is", "dependent", "on", "protein", "kinase", "c", "activity", "and", "protein", "synthesis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "cell", "type-specific", "increase", "in", "LAL", "expression", "is", "further", "investigated", "in", "the", "THP-1", "cell", "line", "with", "respect", "to", "transcriptional", "regulation", "." ]

[ "the", "cell", "type-specific", "increase", "in", "lal", "expression", "is", "further", "investigated", "in", "the", "thp-1", "cell", "line", "with", "respect", "to", "transcriptional", "regulation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "The", "human", "monocytic", "leukemia", "cell", "line", "THP-1", "differentiates", "into", "macrophage-like", "cells", "when", "treated", "with", "phorbol", "esters", "." ]

[ "the", "human", "monocytic", "leukemia", "cell", "line", "thp-1", "differentiates", "into", "macrophage-like", "cells", "when", "treated", "with", "phorbol", "esters", "." ]

[ "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "I-cell_line", "B-cell_line", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "order", "to", "determine", "the", "cis-acting", "elements", "necessary", "for", "both", "basal", "and", "phorbol", "12-myristate-13", "acetate", "(", "PMA", ")", "-enhanced", "promoter", "activity", ",", "we", "performed", "deletion", "analysis", "and", "reporter", "gene", "assays", "." ]

[ "in", "order", "to", "determine", "the", "cis-acting", "elements", "necessary", "for", "both", "basal", "and", "phorbol", "12-myristate-13", "acetate", "(", "pma", ")", "-enhanced", "promoter", "activity", ",", "we", "performed", "deletion", "analysis", "and", "reporter", "gene", "assays", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "I-other_organic_compound", "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "O" ]

[ "A", "PMA", "responsive", "element", "has", "been", "identified", "between", "-182", "bp", "and", "-107", "bp", "upstream", "of", "the", "major", "transcription", "start", "site", "." ]

[ "a", "pma", "responsive", "element", "has", "been", "identified", "between", "-182", "bp", "and", "-107", "bp", "upstream", "of", "the", "major", "transcription", "start", "site", "." ]

[ "O", "B-other_organic_compound", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O" ]

[ "Gel", "mobility", "shift", "assays", "demonstrated", "that", "binding", "of", "Sp1", "and", "AP-2", "to", "the", "LAL", "promoter", "is", "increased", "by", "PMA", "in", "THP-1", "cells", "." ]

[ "gel", "mobility", "shift", "assays", "demonstrated", "that", "binding", "of", "sp1", "and", "ap-2", "to", "the", "lal", "promoter", "is", "increased", "by", "pma", "in", "thp-1", "cells", "." ]

[ "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O" ]

[ "Co-transfections", "with", "expression", "plasmids", "for", "Sp1", "and", "AP-2", "further", "emphasized", "the", "important", "role", "of", "these", "transcription", "factors", "in", "both", "basal", "and", "PMA", "-enhanced", "LAL", "expression", "." ]

[ "co-transfections", "with", "expression", "plasmids", "for", "sp1", "and", "ap-2", "further", "emphasized", "the", "important", "role", "of", "these", "transcription", "factors", "in", "both", "basal", "and", "pma", "-enhanced", "lal", "expression", "." ]

[ "O", "O", "B-DNA_family_or_group", "I-DNA_family_or_group", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "B-other_organic_compound", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O" ]

[ "Our", "data", "suggest", "that", "differentiation", "dependent", "increase", "of", "lysosomal", "acid", "lipase", "(", "LAL", ")", "expression", "in", "THP-1", "cells", "is", "mediated", "by", "a", "concerted", "action", "of", "Sp1", "and", "AP-2", "." ]

[ "our", "data", "suggest", "that", "differentiation", "dependent", "increase", "of", "lysosomal", "acid", "lipase", "(", "lal", ")", "expression", "in", "thp-1", "cells", "is", "mediated", "by", "a", "concerted", "action", "of", "sp1", "and", "ap-2", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "B-cell_line", "I-cell_line", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "The", "role", "of", "the", "Ikaros", "gene", "in", "lymphocyte", "development", "and", "homeostasis", "." ]

[ "the", "role", "of", "the", "ikaros", "gene", "in", "lymphocyte", "development", "and", "homeostasis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "Ikaros", "gene", ",", "which", "encodes", "a", "family", "of", "hemopoietic-specific", "zinc", "finger", "proteins", ",", "is", "described", "as", "a", "central", "regulator", "of", "lymphocyte", "differentiation", "." ]

[ "the", "ikaros", "gene", ",", "which", "encodes", "a", "family", "of", "hemopoietic-specific", "zinc", "finger", "proteins", ",", "is", "described", "as", "a", "central", "regulator", "of", "lymphocyte", "differentiation", "." ]

[ "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "During", "fetal", "development", ",", "it", "is", "required", "at", "the", "earliest", "stage", "of", "T", "cell", "and", "B", "cell", "specification", "." ]

[ "during", "fetal", "development", ",", "it", "is", "required", "at", "the", "earliest", "stage", "of", "t", "cell", "and", "b", "cell", "specification", "." ]

[ "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "the", "adult", ",", "however", ",", "lymphoid", "lineages", "rely", "on", "Ikaros", "at", "distinct", "phases", "of", "their", "development", "." ]

[ "in", "the", "adult", ",", "however", ",", "lymphoid", "lineages", "rely", "on", "ikaros", "at", "distinct", "phases", "of", "their", "development", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Its", "activity", "is", "essential", "for", "the", "generation", "of", "B", "cell", "but", "not", "of", "T", "cell", "precursors", ",", "although", "the", "differentiation", "of", "the", "latter", "is", "not", "normal", "." ]

[ "its", "activity", "is", "essential", "for", "the", "generation", "of", "b", "cell", "but", "not", "of", "t", "cell", "precursors", ",", "although", "the", "differentiation", "of", "the", "latter", "is", "not", "normal", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "significant", "increase", "in", "CD4", "thymocytes", "and", "their", "immediate", "precursors", "is", "detected", ",", "and", "because", "these", "cells", "lack", "markers", "that", "correlate", "with", "positive", "selection", ",", "a", "deregulation", "in", "their", "maturation", "process", "is", "suggested", "." ]

[ "a", "significant", "increase", "in", "cd4", "thymocytes", "and", "their", "immediate", "precursors", "is", "detected", ",", "and", "because", "these", "cells", "lack", "markers", "that", "correlate", "with", "positive", "selection", ",", "a", "deregulation", "in", "their", "maturation", "process", "is", "suggested", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "Ikaros-null", "thymocytes", "hyperproliferate", "in", "response", "to", "T", "cell", "receptor", "(", "TCR", ")", "signaling", ";", "within", "days", "after", "their", "appearance", "in", "the", "thymus", ",", "clonally", "expanding", "populations", "are", "detected", "." ]

[ "furthermore", ",", "ikaros-null", "thymocytes", "hyperproliferate", "in", "response", "to", "t", "cell", "receptor", "(", "tcr", ")", "signaling", ";", "within", "days", "after", "their", "appearance", "in", "the", "thymus", ",", "clonally", "expanding", "populations", "are", "detected", "." ]

[ "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "B-other_name", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-body_part", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Deregulated", "TCR", "-mediated", "responses", "and", "the", "fast", "kinetics", "of", "tumor", "development", "in", "these", "mutant", "thymocytes", "implicate", "Ikaros", "as", "a", "central", "tumor", "suppressor", "gene", "for", "the", "T", "cell", "lineage", "." ]

[ "deregulated", "tcr", "-mediated", "responses", "and", "the", "fast", "kinetics", "of", "tumor", "development", "in", "these", "mutant", "thymocytes", "implicate", "ikaros", "as", "a", "central", "tumor", "suppressor", "gene", "for", "the", "t", "cell", "lineage", "." ]

[ "O", "B-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "I-DNA_domain_or_region", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "lack", "of", "natural", "killer", "cells", "and", "selective", "defects", "in", "gamma", "delta", "T", "cells", "and", "dendritic", "antigen-presenting", "cells", "point", "to", "Ikaros", "as", "an", "essential", "factor", "for", "the", "establishment", "of", "early", "branchpoints", "of", "the", "T", "cell", "pathway", "." ]

[ "in", "addition", ",", "lack", "of", "natural", "killer", "cells", "and", "selective", "defects", "in", "gamma", "delta", "t", "cells", "and", "dendritic", "antigen-presenting", "cells", "point", "to", "ikaros", "as", "an", "essential", "factor", "for", "the", "establishment", "of", "early", "branchpoints", "of", "the", "t", "cell", "pathway", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "The", "dominant", "interference", "activity", "of", "Ikaros", "isoforms", "unable", "to", "bind", "DNA", "and", "their", "effects", "in", "lymphocyte", "development", "suggest", "that", "Ikaros", "works", "in", "concert", "with", "other", "factors", "." ]

[ "the", "dominant", "interference", "activity", "of", "ikaros", "isoforms", "unable", "to", "bind", "dna", "and", "their", "effects", "in", "lymphocyte", "development", "suggest", "that", "ikaros", "works", "in", "concert", "with", "other", "factors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "role", "of", "Aiolos", ",", "a", "lymphoid-restricted", "and", "structurally", "related", "gene", ",", "in", "lymphoid", "differentiation", "is", "discussed", "." ]

[ "the", "role", "of", "aiolos", ",", "a", "lymphoid-restricted", "and", "structurally", "related", "gene", ",", "in", "lymphoid", "differentiation", "is", "discussed", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-DNA_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O" ]

[ "A", "model", "is", "proposed", "that", "defines", "Ikaros", "as", "the", "backbone", "of", "a", "complex", "regulatory", "protein", "network", "that", "controls", "cell", "fate", "decisions", "and", "regulates", "homeostasis", "in", "the", "hemo-lymphoid", "system", "." ]

[ "a", "model", "is", "proposed", "that", "defines", "ikaros", "as", "the", "backbone", "of", "a", "complex", "regulatory", "protein", "network", "that", "controls", "cell", "fate", "decisions", "and", "regulates", "homeostasis", "in", "the", "hemo-lymphoid", "system", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "O", "B-body_part", "I-body_part", "O" ]

[ "Changes", "in", "this", "regulatory", "network", "may", "reflect", "differentiation", "and", "proliferation", "adjustments", "made", "in", "hemo-lymphoid", "progenitors", "and", "precursors", "as", "they", "give", "rise", "to", "the", "cells", "of", "our", "immune", "system", "." ]

[ "changes", "in", "this", "regulatory", "network", "may", "reflect", "differentiation", "and", "proliferation", "adjustments", "made", "in", "hemo-lymphoid", "progenitors", "and", "precursors", "as", "they", "give", "rise", "to", "the", "cells", "of", "our", "immune", "system", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-body_part", "I-body_part", "O" ]

[ "Costimulation", "requirement", "for", "AP-1", "and", "NF-kappa", "B", "transcription", "factor", "activation", "in", "T", "cells", "." ]

[ "costimulation", "requirement", "for", "ap-1", "and", "nf-kappa", "b", "transcription", "factor", "activation", "in", "t", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "The", "transcriptional", "activity", "of", "the", "IL-2", "promoter", "requires", "T-cell", "costimulation", "delivered", "by", "the", "TCR", "and", "the", "auxiliary", "receptor", "CD28", "." ]

[ "the", "transcriptional", "activity", "of", "the", "il-2", "promoter", "requires", "t-cell", "costimulation", "delivered", "by", "the", "tcr", "and", "the", "auxiliary", "receptor", "cd28", "." ]

[ "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-cell_type", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O" ]

[ "Several", "transcription", "factors", "participate", "in", "IL-2", "promoter", "activation", ",", "among", "which", "are", "AP-1", "-like", "factors", "and", "NF-kappa", "B", "." ]

[ "several", "transcription", "factors", "participate", "in", "il-2", "promoter", "activation", ",", "among", "which", "are", "ap-1", "-like", "factors", "and", "nf-kappa", "b", "." ]

[ "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O" ]

[ "Protein", "phosphorylation", "has", "an", "important", "role", "in", "the", "regulation", "of", "these", "two", "factors", ":", "(", "1", ")", "it", "induces", "the", "transactivating", "capacity", "of", "the", "AP-1", "protein", "c-Jun", ";", "and", "(", "2", ")", "it", "is", "involved", "in", "the", "release", "of", "the", "cytoplasmic", "inhibitor", ",", "I", "kappa", "B", ",", "from", "NF-kappa", "B", ",", "allowing", "translocation", "of", "the", "latter", "into", "the", "nucleus", "." ]

[ "protein", "phosphorylation", "has", "an", "important", "role", "in", "the", "regulation", "of", "these", "two", "factors", ":", "(", "1", ")", "it", "induces", "the", "transactivating", "capacity", "of", "the", "ap-1", "protein", "c-jun", ";", "and", "(", "2", ")", "it", "is", "involved", "in", "the", "release", "of", "the", "cytoplasmic", "inhibitor", ",", "i", "kappa", "b", ",", "from", "nf-kappa", "b", ",", "allowing", "translocation", "of", "the", "latter", "into", "the", "nucleus", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-cell_component", "O" ]

[ "We", "have", "recently", "shown", "that", "both", "phosphorylation", "processes", "require", "T-cell", "costimulation", "." ]

[ "we", "have", "recently", "shown", "that", "both", "phosphorylation", "processes", "require", "t-cell", "costimulation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "in", "activated", "T", "cells", ",", "the", "kinetics", "of", "the", "two", "phosphorylation", "events", "are", "essentially", "similar", "." ]

[ "furthermore", ",", "in", "activated", "t", "cells", ",", "the", "kinetics", "of", "the", "two", "phosphorylation", "events", "are", "essentially", "similar", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "I-cell_type", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O" ]

[ "According", "to", "our", "results", ",", "however", ",", "the", "kinases", "responsible", "for", "the", "two", "processes", "are", "distinct", "entities", "." ]

[ "according", "to", "our", "results", ",", "however", ",", "the", "kinases", "responsible", "for", "the", "two", "processes", "are", "distinct", "entities", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Whereas", "TPCK", "inhibits", "phosphorylation", "of", "I", "kappa", "B", "and", ",", "consequently", ",", "activation", "of", "NF-kappa", "B", ",", "it", "markedly", "enhances", "the", "activity", "of", "JNK", ",", "the", "MAP", "kinase-related", "kinase", "that", "phosphorylates", "the", "transactivation", "domain", "of", "c-Jun", "." ]

[ "whereas", "tpck", "inhibits", "phosphorylation", "of", "i", "kappa", "b", "and", ",", "consequently", ",", "activation", "of", "nf-kappa", "b", ",", "it", "markedly", "enhances", "the", "activity", "of", "jnk", ",", "the", "map", "kinase-related", "kinase", "that", "phosphorylates", "the", "transactivation", "domain", "of", "c-jun", "." ]

[ "O", "B-protein_molecule", "O", "B-other_name", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "B-protein_molecule", "O" ]

[ "We", ",", "therefore", ",", "propose", "the", "activation", "scheme", "presented", "in", "FIGURE", "3", "for", "T-cell", "costimulation", "." ]

[ "we", ",", "therefore", ",", "propose", "the", "activation", "scheme", "presented", "in", "figure", "3", "for", "t-cell", "costimulation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "O" ]

[ "Costimulation", "results", "in", "the", "activation", "of", "a", "signaling", "pathway", "that", "leads", "to", "the", "simultaneous", "induction", "of", "the", "two", "transcription", "factors", ",", "AP-1", "and", "NF-kappa", "B", "." ]

[ "costimulation", "results", "in", "the", "activation", "of", "a", "signaling", "pathway", "that", "leads", "to", "the", "simultaneous", "induction", "of", "the", "two", "transcription", "factors", ",", "ap-1", "and", "nf-kappa", "b", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O" ]

[ "Integration", "of", "the", "signals", "generated", "by", "TCR", "and", "CD28", "engagement", "occurs", "along", "this", "pathway", ",", "which", "then", "bifurcates", "to", "induce", "I", "kappa", "B", "phosphorylation", "and", "NF-kappa", "B", "activation", "on", "the", "one", "hand", ",", "and", "JNK", "activation", "and", "c-Jun", "phosphorylation", "on", "the", "other", "." ]

[ "integration", "of", "the", "signals", "generated", "by", "tcr", "and", "cd28", "engagement", "occurs", "along", "this", "pathway", ",", "which", "then", "bifurcates", "to", "induce", "i", "kappa", "b", "phosphorylation", "and", "nf-kappa", "b", "activation", "on", "the", "one", "hand", ",", "and", "jnk", "activation", "and", "c-jun", "phosphorylation", "on", "the", "other", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "are", "currently", "engaged", "in", "defining", "where", "the", "two", "signals", "integrate", "along", "the", "AP-1", "/", "NF-kappa", "B", "pathway", "." ]

[ "we", "are", "currently", "engaged", "in", "defining", "where", "the", "two", "signals", "integrate", "along", "the", "ap-1", "/", "nf-kappa", "b", "pathway", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O" ]

[ "A", "human", "homologue", "of", "the", "Drosophila", "Toll", "protein", "signals", "activation", "of", "adaptive", "immunity", "[", "see", "comments", "]" ]

[ "a", "human", "homologue", "of", "the", "drosophila", "toll", "protein", "signals", "activation", "of", "adaptive", "immunity", "[", "see", "comments", "]" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Induction", "of", "the", "adaptive", "immune", "response", "depends", "on", "the", "expression", "of", "co-stimulatory", "molecules", "and", "cytokines", "by", "antigen-presenting", "cells", "." ]

[ "induction", "of", "the", "adaptive", "immune", "response", "depends", "on", "the", "expression", "of", "co-stimulatory", "molecules", "and", "cytokines", "by", "antigen-presenting", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-other_name", "I-other_name", "I-other_name", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "B-protein_family_or_group", "O", "B-cell_type", "I-cell_type", "O" ]

[ "The", "mechanisms", "that", "control", "the", "initial", "induction", "of", "these", "signals", "upon", "infection", "are", "poorly", "understood", "." ]

[ "the", "mechanisms", "that", "control", "the", "initial", "induction", "of", "these", "signals", "upon", "infection", "are", "poorly", "understood", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "It", "has", "been", "proposed", "that", "their", "expression", "is", "controlled", "by", "the", "non-clonal", ",", "or", "innate", ",", "component", "of", "immunity", "that", "preceded", "in", "evolution", "the", "development", "of", "an", "adaptive", "immune", "system", "in", "vertebrates", "." ]

[ "it", "has", "been", "proposed", "that", "their", "expression", "is", "controlled", "by", "the", "non-clonal", ",", "or", "innate", ",", "component", "of", "immunity", "that", "preceded", "in", "evolution", "the", "development", "of", "an", "adaptive", "immune", "system", "in", "vertebrates", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-body_part", "I-body_part", "I-body_part", "O", "B-multi_cell", "O" ]

[ "We", "report", "here", "the", "cloning", "and", "characterization", "of", "a", "human", "homologue", "of", "the", "Drosophila", "toll", "protein", "(", "Toll", ")", "which", "has", "been", "shown", "to", "induce", "the", "innate", "immune", "response", "in", "adult", "Drosophila", "." ]

[ "we", "report", "here", "the", "cloning", "and", "characterization", "of", "a", "human", "homologue", "of", "the", "drosophila", "toll", "protein", "(", "toll", ")", "which", "has", "been", "shown", "to", "induce", "the", "innate", "immune", "response", "in", "adult", "drosophila", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_family_or_group", "I-protein_family_or_group", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-multi_cell", "O" ]

[ "Like", "Drosophila", "Toll", ",", "human", "Toll", "is", "a", "type", "I", "transmembrane", "protein", "with", "an", "extracellular", "domain", "consisting", "of", "a", "leucine-rich", "repeat", "(", "LRR", ")", "domain", ",", "and", "a", "cytoplasmic", "domain", "homologous", "to", "the", "cytoplasmic", "domain", "of", "the", "human", "interleukin", "(", "IL", ")", "-1", "receptor", "." ]

[ "like", "drosophila", "toll", ",", "human", "toll", "is", "a", "type", "i", "transmembrane", "protein", "with", "an", "extracellular", "domain", "consisting", "of", "a", "leucine-rich", "repeat", "(", "lrr", ")", "domain", ",", "and", "a", "cytoplasmic", "domain", "homologous", "to", "the", "cytoplasmic", "domain", "of", "the", "human", "interleukin", "(", "il", ")", "-1", "receptor", "." ]

[ "O", "B-multi_cell", "B-protein_molecule", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "B-protein_domain_or_region", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-protein_domain_or_region", "I-protein_domain_or_region", "O", "O", "B-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "I-protein_molecule", "O" ]