tokens
sequence | folded_tokens
sequence | labels
sequence |
---|---|---|
[
"The",
"human",
"IL-4",
"gene",
",",
"of",
"10",
"kilobases",
",",
"is",
"composed",
"of",
"four",
"exons",
"and",
"three",
"introns",
"."
] | [
"the",
"human",
"il-4",
"gene",
",",
"of",
"10",
"kilobases",
",",
"is",
"composed",
"of",
"four",
"exons",
"and",
"three",
"introns",
"."
] | [
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-polynucleotide",
"I-polynucleotide",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"A",
"cis-acting",
"element",
"(",
"P",
"sequence",
")",
"resides",
"in",
"the",
"5'",
"upstream",
"region",
";",
"no",
"additional",
"DNA",
"segments",
"with",
"enhancer",
"activity",
"were",
"identified",
"in",
"the",
"human",
"IL-4",
"gene",
"."
] | [
"a",
"cis-acting",
"element",
"(",
"p",
"sequence",
")",
"resides",
"in",
"the",
"5'",
"upstream",
"region",
";",
"no",
"additional",
"dna",
"segments",
"with",
"enhancer",
"activity",
"were",
"identified",
"in",
"the",
"human",
"il-4",
"gene",
"."
] | [
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"For",
"further",
"mapping",
"purposes",
",",
"a",
"fusion",
"promoter",
"was",
"constructed",
"with",
"the",
"granulocyte/macrophage",
"colony-stimulating",
"factor",
"basic",
"promoter",
"containing",
"60",
"base",
"pairs",
"of",
"sequence",
"upstream",
"from",
"the",
"cap",
"site",
"of",
"the",
"mouse",
"granulocyte/macrophage",
"colony-stimulating",
"factor",
"gene",
"and",
"various",
"lengths",
"of",
"the",
"5'",
"upstream",
"sequence",
"of",
"the",
"IL-4",
"gene",
"."
] | [
"for",
"further",
"mapping",
"purposes",
",",
"a",
"fusion",
"promoter",
"was",
"constructed",
"with",
"the",
"granulocyte/macrophage",
"colony-stimulating",
"factor",
"basic",
"promoter",
"containing",
"60",
"base",
"pairs",
"of",
"sequence",
"upstream",
"from",
"the",
"cap",
"site",
"of",
"the",
"mouse",
"granulocyte/macrophage",
"colony-stimulating",
"factor",
"gene",
"and",
"various",
"lengths",
"of",
"the",
"5'",
"upstream",
"sequence",
"of",
"the",
"il-4",
"gene",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"The",
"P",
"sequence",
"was",
"located",
"between",
"positions",
"-79",
"and",
"-69",
"relative",
"to",
"the",
"transcription",
"start",
"site",
"of",
"the",
"human",
"IL-4",
"gene",
",",
"and",
"this",
"location",
"was",
"confirmed",
"by",
"base-substitution",
"mutations",
"."
] | [
"the",
"p",
"sequence",
"was",
"located",
"between",
"positions",
"-79",
"and",
"-69",
"relative",
"to",
"the",
"transcription",
"start",
"site",
"of",
"the",
"human",
"il-4",
"gene",
",",
"and",
"this",
"location",
"was",
"confirmed",
"by",
"base-substitution",
"mutations",
"."
] | [
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"plasmids",
"carrying",
"multiple",
"copies",
"of",
"the",
"P",
"sequence",
"showed",
"higher",
"responsiveness",
"to",
"the",
"stimulation",
"."
] | [
"the",
"plasmids",
"carrying",
"multiple",
"copies",
"of",
"the",
"p",
"sequence",
"showed",
"higher",
"responsiveness",
"to",
"the",
"stimulation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"binding",
"protein",
"(",
"s",
")",
"that",
"recognize",
"the",
"P",
"sequence",
"of",
"the",
"IL-4",
"gene",
"were",
"identified",
"by",
"DNA-mobility-shift",
"assays",
"."
] | [
"the",
"binding",
"protein",
"(",
"s",
")",
"that",
"recognize",
"the",
"p",
"sequence",
"of",
"the",
"il-4",
"gene",
"were",
"identified",
"by",
"dna-mobility-shift",
"assays",
"."
] | [
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"binding",
"of",
"NF",
"(",
"P",
")",
"(",
"a",
"DNA",
"binding",
"protein",
"that",
"specifically",
"recognizes",
"the",
"P",
"sequence",
")",
"to",
"the",
"P",
"sequence",
"was",
"abolished",
"when",
"oligonucleotides",
"carrying",
"base",
"substitutions",
"were",
"used",
",",
"indicating",
"that",
"the",
"NF",
"(",
"P",
")",
"interaction",
"is",
"sequence-specific",
"and",
"that",
"binding",
"specificity",
"of",
"the",
"protein",
"paralleled",
"the",
"sequence",
"requirements",
"for",
"IL-4",
"expression",
"in",
"vivo",
"."
] | [
"the",
"binding",
"of",
"nf",
"(",
"p",
")",
"(",
"a",
"dna",
"binding",
"protein",
"that",
"specifically",
"recognizes",
"the",
"p",
"sequence",
")",
"to",
"the",
"p",
"sequence",
"was",
"abolished",
"when",
"oligonucleotides",
"carrying",
"base",
"substitutions",
"were",
"used",
",",
"indicating",
"that",
"the",
"nf",
"(",
"p",
")",
"interaction",
"is",
"sequence-specific",
"and",
"that",
"binding",
"specificity",
"of",
"the",
"protein",
"paralleled",
"the",
"sequence",
"requirements",
"for",
"il-4",
"expression",
"in",
"vivo",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-polynucleotide",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"P",
"sequence",
"does",
"not",
"share",
"homology",
"with",
"the",
"5'",
"upstream",
"sequence",
"of",
"the",
"IL-2",
"gene",
",",
"even",
"though",
"surrounding",
"sequences",
"of",
"the",
"IL-4",
"gene",
"share",
"high",
"homology",
"with",
"the",
"IL-2",
"gene",
"."
] | [
"the",
"p",
"sequence",
"does",
"not",
"share",
"homology",
"with",
"the",
"5'",
"upstream",
"sequence",
"of",
"the",
"il-2",
"gene",
",",
"even",
"though",
"surrounding",
"sequences",
"of",
"the",
"il-4",
"gene",
"share",
"high",
"homology",
"with",
"the",
"il-2",
"gene",
"."
] | [
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"We",
"conclude",
"that",
"a",
"different",
"set",
"of",
"proteins",
"recognize",
"IL-2",
"and",
"IL-4",
"genes",
"."
] | [
"we",
"conclude",
"that",
"a",
"different",
"set",
"of",
"proteins",
"recognize",
"il-2",
"and",
"il-4",
"genes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"GATA-3",
"-dependent",
"enhancer",
"activity",
"in",
"IL-4",
"gene",
"regulation",
"."
] | [
"gata-3",
"-dependent",
"enhancer",
"activity",
"in",
"il-4",
"gene",
"regulation",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O"
] |
[
"Previously",
",",
"we",
"analyzed",
"the",
"proximal",
"IL-4",
"promoter",
"in",
"directing",
"Th2-specific",
"activity",
"."
] | [
"previously",
",",
"we",
"analyzed",
"the",
"proximal",
"il-4",
"promoter",
"in",
"directing",
"th2-specific",
"activity",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"An",
"800-base",
"pair",
"proximal",
"promoter",
"conferred",
"some",
"Th2-selective",
"expression",
"in",
"transgenic",
"mice",
"."
] | [
"an",
"800-base",
"pair",
"proximal",
"promoter",
"conferred",
"some",
"th2-selective",
"expression",
"in",
"transgenic",
"mice",
"."
] | [
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_artificial_source",
"I-other_artificial_source",
"O"
] |
[
"However",
",",
"this",
"region",
"directed",
"extremely",
"low",
"reporter",
"mRNA",
"levels",
"relative",
"to",
"endogenous",
"IL-4",
"mRNA",
",",
"suggesting",
"that",
"full",
"gene",
"activity",
"requires",
"additional",
"enhancer",
"elements",
"."
] | [
"however",
",",
"this",
"region",
"directed",
"extremely",
"low",
"reporter",
"mrna",
"levels",
"relative",
"to",
"endogenous",
"il-4",
"mrna",
",",
"suggesting",
"that",
"full",
"gene",
"activity",
"requires",
"additional",
"enhancer",
"elements",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O"
] |
[
"Here",
",",
"we",
"analyzed",
"large",
"genomic",
"IL-4",
"regions",
"for",
"enhancer",
"activity",
"and",
"interaction",
"with",
"transcription",
"factors",
"."
] | [
"here",
",",
"we",
"analyzed",
"large",
"genomic",
"il-4",
"regions",
"for",
"enhancer",
"activity",
"and",
"interaction",
"with",
"transcription",
"factors",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"The",
"proximal",
"IL-4",
"promoter",
"is",
"only",
"moderately",
"augmented",
"by",
"GATA-3",
",",
"but",
"certain",
"genomic",
"regions",
"significantly",
"enhanced",
"GATA-3",
"promoter",
"transactivation",
"."
] | [
"the",
"proximal",
"il-4",
"promoter",
"is",
"only",
"moderately",
"augmented",
"by",
"gata-3",
",",
"but",
"certain",
"genomic",
"regions",
"significantly",
"enhanced",
"gata-3",
"promoter",
"transactivation",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Some",
"enhancing",
"regions",
"contained",
"consensus",
",",
"GATA",
"sites",
"that",
"bound",
"Th2-specific",
"complexes",
"."
] | [
"some",
"enhancing",
"regions",
"contained",
"consensus",
",",
"gata",
"sites",
"that",
"bound",
"th2-specific",
"complexes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O"
] |
[
"However",
",",
"retroviral",
"transduction",
"of",
"GATA-3",
"into",
"developing",
"T",
"cells",
"induced",
"IL-5",
"to",
"full",
"Th2",
"levels",
",",
"but",
"only",
"partially",
"restored",
"IL-4",
"production",
"."
] | [
"however",
",",
"retroviral",
"transduction",
"of",
"gata-3",
"into",
"developing",
"t",
"cells",
"induced",
"il-5",
"to",
"full",
"th2",
"levels",
",",
"but",
"only",
"partially",
"restored",
"il-4",
"production",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"Thus",
",",
"we",
"propose",
"that",
"GATA-3",
"is",
"permissive",
",",
"but",
"not",
"sufficient",
",",
"for",
"full",
"IL-4",
"enhancement",
"and",
"may",
"act",
"through",
"GATA",
"elements",
"surrounding",
"the",
"IL-13",
"/",
"IL-4",
"gene",
"locus",
"."
] | [
"thus",
",",
"we",
"propose",
"that",
"gata-3",
"is",
"permissive",
",",
"but",
"not",
"sufficient",
",",
"for",
"full",
"il-4",
"enhancement",
"and",
"may",
"act",
"through",
"gata",
"elements",
"surrounding",
"the",
"il-13",
"/",
"il-4",
"gene",
"locus",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"GATA-1",
"and",
"erythropoietin",
"cooperate",
"to",
"promote",
"erythroid",
"cell",
"survival",
"by",
"regulating",
"bcl-xL",
"expression",
"."
] | [
"gata-1",
"and",
"erythropoietin",
"cooperate",
"to",
"promote",
"erythroid",
"cell",
"survival",
"by",
"regulating",
"bcl-xl",
"expression",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"transcription",
"factor",
"GATA-1",
"is",
"essential",
"for",
"normal",
"erythropoiesis",
"."
] | [
"the",
"transcription",
"factor",
"gata-1",
"is",
"essential",
"for",
"normal",
"erythropoiesis",
"."
] | [
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"By",
"examining",
"in",
"vitro-differentiated",
"embryonic",
"stem",
"cells",
",",
"we",
"showed",
"previously",
"that",
"in",
"the",
"absence",
"of",
"GATA-1",
",",
"committed",
"erythroid",
"precursors",
"fail",
"to",
"complete",
"maturation",
"and",
"instead",
"undergo",
"apoptosis",
"."
] | [
"by",
"examining",
"in",
"vitro-differentiated",
"embryonic",
"stem",
"cells",
",",
"we",
"showed",
"previously",
"that",
"in",
"the",
"absence",
"of",
"gata-1",
",",
"committed",
"erythroid",
"precursors",
"fail",
"to",
"complete",
"maturation",
"and",
"instead",
"undergo",
"apoptosis",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"mechanisms",
"by",
"which",
"GATA-1",
"controls",
"cell",
"survival",
"are",
"unknown",
"."
] | [
"the",
"mechanisms",
"by",
"which",
"gata-1",
"controls",
"cell",
"survival",
"are",
"unknown",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Here",
"we",
"report",
"that",
"in",
"erythroid",
"cells",
",",
"GATA-1",
"strongly",
"induces",
"the",
"expression",
"of",
"the",
"anti-apoptotic",
"protein",
"bcl-xL",
",",
"but",
"not",
"the",
"related",
"proteins",
"bcl-2",
"and",
"mcl-1",
"."
] | [
"here",
"we",
"report",
"that",
"in",
"erythroid",
"cells",
",",
"gata-1",
"strongly",
"induces",
"the",
"expression",
"of",
"the",
"anti-apoptotic",
"protein",
"bcl-xl",
",",
"but",
"not",
"the",
"related",
"proteins",
"bcl-2",
"and",
"mcl-1",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Consistent",
"with",
"a",
"role",
"for",
"bcl-xL",
"in",
"mediating",
"GATA-1",
"-induced",
"erythroid",
"cell",
"survival",
",",
"in",
"vitro-differentiated",
"bcl-xL",
"-/-",
"embryonic",
"stem",
"cells",
"fail",
"to",
"generate",
"viable",
"mature",
"definitive",
"erythroid",
"cells",
",",
"a",
"phenotype",
"resembling",
"that",
"of",
"GATA-1",
"gene",
"disruption",
"."
] | [
"consistent",
"with",
"a",
"role",
"for",
"bcl-xl",
"in",
"mediating",
"gata-1",
"-induced",
"erythroid",
"cell",
"survival",
",",
"in",
"vitro-differentiated",
"bcl-xl",
"-/-",
"embryonic",
"stem",
"cells",
"fail",
"to",
"generate",
"viable",
"mature",
"definitive",
"erythroid",
"cells",
",",
"a",
"phenotype",
"resembling",
"that",
"of",
"gata-1",
"gene",
"disruption",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-other_name",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"we",
"show",
"that",
"erythropoietin",
",",
"which",
"is",
"also",
"required",
"for",
"erythroid",
"cell",
"survival",
",",
"cooperates",
"with",
"GATA-1",
"to",
"stimulate",
"bcl-xL",
"gene",
"expression",
"and",
"to",
"maintain",
"erythroid",
"cell",
"viability",
"during",
"terminal",
"maturation",
"."
] | [
"in",
"addition",
",",
"we",
"show",
"that",
"erythropoietin",
",",
"which",
"is",
"also",
"required",
"for",
"erythroid",
"cell",
"survival",
",",
"cooperates",
"with",
"gata-1",
"to",
"stimulate",
"bcl-xl",
"gene",
"expression",
"and",
"to",
"maintain",
"erythroid",
"cell",
"viability",
"during",
"terminal",
"maturation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Together",
",",
"our",
"data",
"show",
"that",
"bcl-xL",
"is",
"essential",
"for",
"normal",
"erythroid",
"development",
"and",
"suggest",
"a",
"regulatory",
"hierarchy",
"in",
"which",
"bcl-xL",
"is",
"a",
"critical",
"downstream",
"effector",
"of",
"GATA-1",
"and",
"erythropoietin",
"-mediated",
"signals",
"."
] | [
"together",
",",
"our",
"data",
"show",
"that",
"bcl-xl",
"is",
"essential",
"for",
"normal",
"erythroid",
"development",
"and",
"suggest",
"a",
"regulatory",
"hierarchy",
"in",
"which",
"bcl-xl",
"is",
"a",
"critical",
"downstream",
"effector",
"of",
"gata-1",
"and",
"erythropoietin",
"-mediated",
"signals",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Retinoic",
"acid",
"-induced",
"modulation",
"of",
"IL-2",
"mRNA",
"production",
"and",
"IL-2",
"receptor",
"expression",
"on",
"T",
"cells",
"."
] | [
"retinoic",
"acid",
"-induced",
"modulation",
"of",
"il-2",
"mrna",
"production",
"and",
"il-2",
"receptor",
"expression",
"on",
"t",
"cells",
"."
] | [
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"BACKGROUND",
":",
"Retinoic",
"acid",
"(",
"RA",
")",
"has",
"important",
"immune-modulating",
"effects",
"on",
"both",
"T",
"and",
"B",
"cell",
"function",
"."
] | [
"background",
":",
"retinoic",
"acid",
"(",
"ra",
")",
"has",
"important",
"immune-modulating",
"effects",
"on",
"both",
"t",
"and",
"b",
"cell",
"function",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Our",
"laboratory",
"has",
"shown",
"that",
"RA",
"can",
"enhance",
"in",
"vitro",
"polyclonal",
"B",
"cell",
"immunoglobulin",
"(",
"Ig",
")",
"response",
"."
] | [
"our",
"laboratory",
"has",
"shown",
"that",
"ra",
"can",
"enhance",
"in",
"vitro",
"polyclonal",
"b",
"cell",
"immunoglobulin",
"(",
"ig",
")",
"response",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Investigating",
"cytokines",
"known",
"to",
"affect",
"B",
"cell",
"differentiation",
",",
"we",
"have",
"recently",
"shown",
"that",
"IL-6",
"production",
"is",
"augmented",
"by",
"RA",
"."
] | [
"investigating",
"cytokines",
"known",
"to",
"affect",
"b",
"cell",
"differentiation",
",",
"we",
"have",
"recently",
"shown",
"that",
"il-6",
"production",
"is",
"augmented",
"by",
"ra",
"."
] | [
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O"
] |
[
"In",
"the",
"present",
"study",
"we",
"have",
"examined",
"the",
"immune",
"modulating",
"effects",
"of",
"RA",
"on",
"IL-2",
"mRNA",
",",
"another",
"important",
"cytokine",
"for",
"B",
"cell",
"immunoglobulin",
"production",
",",
"the",
"expression",
"of",
"IL-2",
"receptors",
"on",
"T",
"cells",
",",
"and",
"the",
"RA",
"nuclear",
"receptors",
"."
] | [
"in",
"the",
"present",
"study",
"we",
"have",
"examined",
"the",
"immune",
"modulating",
"effects",
"of",
"ra",
"on",
"il-2",
"mrna",
",",
"another",
"important",
"cytokine",
"for",
"b",
"cell",
"immunoglobulin",
"production",
",",
"the",
"expression",
"of",
"il-2",
"receptors",
"on",
"t",
"cells",
",",
"and",
"the",
"ra",
"nuclear",
"receptors",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"METHODS",
":",
"Purified",
"T",
"cells",
"were",
"obtained",
"from",
"adenoidal",
"tissues",
",",
"and",
"incubated",
"with",
"RA",
"(",
"10",
"(",
"-7",
")",
"M",
")",
"or",
"DMSO",
"solvent/media",
"control",
"for",
"0",
",",
"6-8",
",",
"and",
"24",
"h",
"."
] | [
"methods",
":",
"purified",
"t",
"cells",
"were",
"obtained",
"from",
"adenoidal",
"tissues",
",",
"and",
"incubated",
"with",
"ra",
"(",
"10",
"(",
"-7",
")",
"m",
")",
"or",
"dmso",
"solvent/media",
"control",
"for",
"0",
",",
"6-8",
",",
"and",
"24",
"h",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-tissue",
"I-tissue",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Total",
"mRNA",
"was",
"extracted",
"from",
"T",
"cells",
",",
"and",
"using",
"RT-PCR",
",",
"changes",
"in",
"the",
"production",
"of",
"IL-2",
"and",
"RA",
"receptors",
"(",
"RAR",
")",
"-",
"alpha",
",",
"beta",
",",
"gamma",
"mRNA",
"were",
"determined",
"."
] | [
"total",
"mrna",
"was",
"extracted",
"from",
"t",
"cells",
",",
"and",
"using",
"rt-pcr",
",",
"changes",
"in",
"the",
"production",
"of",
"il-2",
"and",
"ra",
"receptors",
"(",
"rar",
")",
"-",
"alpha",
",",
"beta",
",",
"gamma",
"mrna",
"were",
"determined",
"."
] | [
"O",
"B-RNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-RNA_molecule",
"O",
"B-RNA_molecule",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"effects",
"of",
"RA",
"on",
"IL-2-alpha",
"receptor",
"expression",
"was",
"determined",
"by",
"flow",
"cytometry",
"on",
"T",
"cells",
"."
] | [
"the",
"effects",
"of",
"ra",
"on",
"il-2-alpha",
"receptor",
"expression",
"was",
"determined",
"by",
"flow",
"cytometry",
"on",
"t",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"CONCLUSION",
":",
"These",
"studies",
"suggest",
"that",
"RA",
"can",
"augment",
"IL-2",
"mRNA",
"production",
"by",
"T",
"cells",
"with",
"a",
"possible",
"paracrine",
"effect",
"on",
"IL-2R-alpha",
"expression",
"."
] | [
"conclusion",
":",
"these",
"studies",
"suggest",
"that",
"ra",
"can",
"augment",
"il-2",
"mrna",
"production",
"by",
"t",
"cells",
"with",
"a",
"possible",
"paracrine",
"effect",
"on",
"il-2r-alpha",
"expression",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"changes",
"appear",
"to",
"be",
"mediated",
"by",
"RAR-alpha",
"."
] | [
"these",
"changes",
"appear",
"to",
"be",
"mediated",
"by",
"rar-alpha",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Thus",
",",
"IL-2",
"may",
"be",
"another",
"important",
"cytokine",
"modulated",
"by",
"RA",
"in",
"the",
"immune",
"response",
"."
] | [
"thus",
",",
"il-2",
"may",
"be",
"another",
"important",
"cytokine",
"modulated",
"by",
"ra",
"in",
"the",
"immune",
"response",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Mutations",
"in",
"the",
"TSC2",
"gene",
":",
"analysis",
"of",
"the",
"complete",
"coding",
"sequence",
"using",
"the",
"protein",
"truncation",
"test",
"(",
"PTT",
")",
"."
] | [
"mutations",
"in",
"the",
"tsc2",
"gene",
":",
"analysis",
"of",
"the",
"complete",
"coding",
"sequence",
"using",
"the",
"protein",
"truncation",
"test",
"(",
"ptt",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O"
] |
[
"Mutations",
"in",
"the",
"TSC2",
"gene",
"on",
"chromosome",
"16p13",
".",
"3",
"are",
"responsible",
"for",
"approximately",
"50%",
"of",
"familial",
"tuberous",
"sclerosis",
"(",
"TSC",
")",
"."
] | [
"mutations",
"in",
"the",
"tsc2",
"gene",
"on",
"chromosome",
"16p13",
".",
"3",
"are",
"responsible",
"for",
"approximately",
"50%",
"of",
"familial",
"tuberous",
"sclerosis",
"(",
"tsc",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_molecule",
"I-DNA_molecule",
"I-DNA_molecule",
"I-DNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"gene",
"has",
"41",
"small",
"exons",
"spanning",
"45",
"kb",
"of",
"genomic",
"DNA",
"and",
"encoding",
"a",
"5",
".",
"5",
"kb",
"mRNA",
"."
] | [
"the",
"gene",
"has",
"41",
"small",
"exons",
"spanning",
"45",
"kb",
"of",
"genomic",
"dna",
"and",
"encoding",
"a",
"5",
".",
"5",
"kb",
"mrna",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O"
] |
[
"Large",
"germline",
"deletions",
"of",
"TSC2",
"occur",
"in",
"<5%",
"of",
"cases",
",",
"and",
"a",
"number",
"of",
"small",
"intragenic",
"mutations",
"have",
"been",
"described",
"."
] | [
"large",
"germline",
"deletions",
"of",
"tsc2",
"occur",
"in",
"<5%",
"of",
"cases",
",",
"and",
"a",
"number",
"of",
"small",
"intragenic",
"mutations",
"have",
"been",
"described",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"analysed",
"mRNA",
"from",
"18",
"unrelated",
"cases",
"of",
"TSC",
"for",
"TSC2",
"mutations",
"using",
"the",
"protein",
"truncation",
"test",
"(",
"PTT",
")",
"."
] | [
"we",
"analysed",
"mrna",
"from",
"18",
"unrelated",
"cases",
"of",
"tsc",
"for",
"tsc2",
"mutations",
"using",
"the",
"protein",
"truncation",
"test",
"(",
"ptt",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O"
] |
[
"Three",
"cases",
"were",
"predicted",
"to",
"be",
"TSC2",
"mutations",
"on",
"the",
"basis",
"of",
"linkage",
"analysis",
"or",
"because",
"a",
"hamartoma",
"from",
"the",
"patient",
"showed",
"loss",
"of",
"heterozygosity",
"for",
"16p13",
".",
"3",
"markers",
"."
] | [
"three",
"cases",
"were",
"predicted",
"to",
"be",
"tsc2",
"mutations",
"on",
"the",
"basis",
"of",
"linkage",
"analysis",
"or",
"because",
"a",
"hamartoma",
"from",
"the",
"patient",
"showed",
"loss",
"of",
"heterozygosity",
"for",
"16p13",
".",
"3",
"markers",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"Three",
"overlapping",
"PCR",
"products",
",",
"covering",
"the",
"complete",
"coding",
"sequence",
"of",
"mRNA",
",",
"were",
"generated",
"from",
"lymphoblastoid",
"cell",
"lines",
",",
"translated",
"into",
"35S-methionine",
"labelled",
"protein",
",",
"and",
"analysed",
"by",
"SDS-PAGE",
"."
] | [
"three",
"overlapping",
"pcr",
"products",
",",
"covering",
"the",
"complete",
"coding",
"sequence",
"of",
"mrna",
",",
"were",
"generated",
"from",
"lymphoblastoid",
"cell",
"lines",
",",
"translated",
"into",
"35s-methionine",
"labelled",
"protein",
",",
"and",
"analysed",
"by",
"sds-page",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-DNA_molecule",
"I-DNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"PCR",
"products",
"showing",
"PTT",
"shifts",
"were",
"directly",
"sequenced",
",",
"and",
"mutations",
"confirmed",
"by",
"restriction",
"enzyme",
"digestion",
"where",
"possible",
"."
] | [
"pcr",
"products",
"showing",
"ptt",
"shifts",
"were",
"directly",
"sequenced",
",",
"and",
"mutations",
"confirmed",
"by",
"restriction",
"enzyme",
"digestion",
"where",
"possible",
"."
] | [
"B-DNA_molecule",
"I-DNA_molecule",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Six",
"PTT",
"shifts",
"were",
"identified",
"."
] | [
"six",
"ptt",
"shifts",
"were",
"identified",
"."
] | [
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Five",
"of",
"these",
"were",
"caused",
"by",
"mutations",
"predicted",
"to",
"produce",
"a",
"truncated",
"protein",
":",
"(",
"i",
")",
"a",
"sporadic",
"case",
"showed",
"a",
"32",
"bp",
"deletion",
"in",
"exon",
"11",
",",
"and",
"a",
"mutant",
"mRNA",
"without",
"exon",
"11",
"was",
"produced",
";",
"the",
"normal",
"exon",
"10",
"was",
"also",
"spliced",
"out",
";",
"(",
"ii",
")",
"a",
"sporadic",
"case",
"had",
"a",
"1",
"bp",
"deletion",
"in",
"exon",
"12",
"(",
"1634delT",
")",
";",
"(",
"iii",
")",
"a",
"TSC2",
"-linked",
"mother",
"and",
"daughter",
"pair",
"had",
"a",
"G-->T",
"transversion",
"in",
"exon",
"23",
"(",
"G2715T",
")",
"introducing",
"a",
"cryptic",
"splice",
"site",
"causing",
"a",
"29",
"bp",
"truncation",
"of",
"mRNA",
"from",
"exon",
"23",
";",
"(",
"iv",
")",
"a",
"sporadic",
"case",
"showed",
"a",
"2",
"bp",
"deletion",
"in",
"exon",
"36",
";",
"(",
"v",
")",
"a",
"sporadic",
"case",
"showed",
"a",
"1",
"bp",
"insertion",
"disrupting",
"the",
"donor",
"splice",
"site",
"of",
"exon",
"37",
"(",
"5007+2insA",
")",
",",
"resulting",
"in",
"the",
"use",
"of",
"an",
"upstream",
"exonic",
"cryptic",
"splice",
"site",
"to",
"cause",
"a",
"29",
"bp",
"truncation",
"of",
"mRNA",
"from",
"exon",
"37",
"."
] | [
"five",
"of",
"these",
"were",
"caused",
"by",
"mutations",
"predicted",
"to",
"produce",
"a",
"truncated",
"protein",
":",
"(",
"i",
")",
"a",
"sporadic",
"case",
"showed",
"a",
"32",
"bp",
"deletion",
"in",
"exon",
"11",
",",
"and",
"a",
"mutant",
"mrna",
"without",
"exon",
"11",
"was",
"produced",
";",
"the",
"normal",
"exon",
"10",
"was",
"also",
"spliced",
"out",
";",
"(",
"ii",
")",
"a",
"sporadic",
"case",
"had",
"a",
"1",
"bp",
"deletion",
"in",
"exon",
"12",
"(",
"1634delt",
")",
";",
"(",
"iii",
")",
"a",
"tsc2",
"-linked",
"mother",
"and",
"daughter",
"pair",
"had",
"a",
"g-->t",
"transversion",
"in",
"exon",
"23",
"(",
"g2715t",
")",
"introducing",
"a",
"cryptic",
"splice",
"site",
"causing",
"a",
"29",
"bp",
"truncation",
"of",
"mrna",
"from",
"exon",
"23",
";",
"(",
"iv",
")",
"a",
"sporadic",
"case",
"showed",
"a",
"2",
"bp",
"deletion",
"in",
"exon",
"36",
";",
"(",
"v",
")",
"a",
"sporadic",
"case",
"showed",
"a",
"1",
"bp",
"insertion",
"disrupting",
"the",
"donor",
"splice",
"site",
"of",
"exon",
"37",
"(",
"5007+2insa",
")",
",",
"resulting",
"in",
"the",
"use",
"of",
"an",
"upstream",
"exonic",
"cryptic",
"splice",
"site",
"to",
"cause",
"a",
"29",
"bp",
"truncation",
"of",
"mrna",
"from",
"exon",
"37",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-RNA_domain_or_region",
"I-RNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_molecule",
"I-RNA_molecule",
"O",
"B-RNA_domain_or_region",
"I-RNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-RNA_domain_or_region",
"I-RNA_domain_or_region",
"O",
"B-RNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-RNA_domain_or_region",
"I-RNA_domain_or_region",
"O",
"B-RNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_domain_or_region",
"I-RNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-RNA_domain_or_region",
"I-RNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_domain_or_region",
"I-RNA_domain_or_region",
"O",
"B-RNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_domain_or_region",
"I-RNA_domain_or_region",
"I-RNA_domain_or_region",
"I-RNA_domain_or_region",
"I-RNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_domain_or_region",
"I-RNA_domain_or_region",
"I-RNA_domain_or_region",
"O",
"B-RNA_family_or_group",
"O",
"B-RNA_domain_or_region",
"I-RNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"In",
"one",
"case",
",",
"the",
"PTT",
"shift",
"was",
"explained",
"by",
"in-frame",
"splicing",
"out",
"of",
"exon",
"10",
",",
"in",
"the",
"presence",
"of",
"a",
"normal",
"exon",
"10",
"genomic",
"sequence",
"."
] | [
"in",
"one",
"case",
",",
"the",
"ptt",
"shift",
"was",
"explained",
"by",
"in-frame",
"splicing",
"out",
"of",
"exon",
"10",
",",
"in",
"the",
"presence",
"of",
"a",
"normal",
"exon",
"10",
"genomic",
"sequence",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_domain_or_region",
"I-RNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"Alternative",
"splicing",
"of",
"exon",
"10",
"of",
"the",
"TSC2",
"gene",
"may",
"be",
"a",
"normal",
"variant",
"."
] | [
"alternative",
"splicing",
"of",
"exon",
"10",
"of",
"the",
"tsc2",
"gene",
"may",
"be",
"a",
"normal",
"variant",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-RNA_domain_or_region",
"I-RNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Three",
"3rd",
"base",
"substitution",
"polymorphisms",
"were",
"also",
"detected",
"during",
"direct",
"sequencing",
"of",
"PCR",
"products",
"."
] | [
"three",
"3rd",
"base",
"substitution",
"polymorphisms",
"were",
"also",
"detected",
"during",
"direct",
"sequencing",
"of",
"pcr",
"products",
"."
] | [
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_molecule",
"I-DNA_molecule",
"O"
] |
[
"Confirmed",
"mutations",
"were",
"identified",
"in",
"28%",
"of",
"the",
"families",
"studied",
"and",
"on",
"the",
"assumption",
"that",
"half",
"of",
"the",
"sporadic",
"cases",
"should",
"have",
"TSC2",
"mutations",
",",
"a",
"crude",
"estimate",
"of",
"the",
"detection",
"rate",
"would",
"be",
"60%",
"."
] | [
"confirmed",
"mutations",
"were",
"identified",
"in",
"28%",
"of",
"the",
"families",
"studied",
"and",
"on",
"the",
"assumption",
"that",
"half",
"of",
"the",
"sporadic",
"cases",
"should",
"have",
"tsc2",
"mutations",
",",
"a",
"crude",
"estimate",
"of",
"the",
"detection",
"rate",
"would",
"be",
"60%",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"compares",
"favourably",
"with",
"other",
"screening",
"methods",
"used",
"for",
"TSC2",
",",
"notably",
"SSCP",
",",
"and",
"since",
"PTT",
"involves",
"much",
"less",
"work",
"it",
"may",
"be",
"the",
"method",
"of",
"choice",
"."
] | [
"this",
"compares",
"favourably",
"with",
"other",
"screening",
"methods",
"used",
"for",
"tsc2",
",",
"notably",
"sscp",
",",
"and",
"since",
"ptt",
"involves",
"much",
"less",
"work",
"it",
"may",
"be",
"the",
"method",
"of",
"choice",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Distinct",
"signaling",
"properties",
"identify",
"functionally",
"different",
"CD4",
"epitopes",
"."
] | [
"distinct",
"signaling",
"properties",
"identify",
"functionally",
"different",
"cd4",
"epitopes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"The",
"CD4",
"coreceptor",
"interacts",
"with",
"non-polymorphic",
"regions",
"of",
"major",
"histocompatibility",
"complex",
"class",
"II",
"molecules",
"on",
"antigen-presenting",
"cells",
"and",
"contributes",
"to",
"T",
"cell",
"activation",
"."
] | [
"the",
"cd4",
"coreceptor",
"interacts",
"with",
"non-polymorphic",
"regions",
"of",
"major",
"histocompatibility",
"complex",
"class",
"ii",
"molecules",
"on",
"antigen-presenting",
"cells",
"and",
"contributes",
"to",
"t",
"cell",
"activation",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"investigated",
"the",
"effect",
"of",
"CD4",
"triggering",
"on",
"T",
"cell",
"activating",
"signals",
"in",
"a",
"lymphoma",
"model",
"using",
"monoclonal",
"antibodies",
"(",
"mAb",
")",
"which",
"recognize",
"different",
"CD4",
"epitopes",
"."
] | [
"we",
"have",
"investigated",
"the",
"effect",
"of",
"cd4",
"triggering",
"on",
"t",
"cell",
"activating",
"signals",
"in",
"a",
"lymphoma",
"model",
"using",
"monoclonal",
"antibodies",
"(",
"mab",
")",
"which",
"recognize",
"different",
"cd4",
"epitopes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"We",
"demonstrate",
"that",
"CD4",
"triggering",
"delivers",
"signals",
"capable",
"of",
"activating",
"the",
"NF-AT",
"transcription",
"factor",
"which",
"is",
"required",
"for",
"interleukin-2",
"gene",
"expression",
"."
] | [
"we",
"demonstrate",
"that",
"cd4",
"triggering",
"delivers",
"signals",
"capable",
"of",
"activating",
"the",
"nf-at",
"transcription",
"factor",
"which",
"is",
"required",
"for",
"interleukin-2",
"gene",
"expression",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Whereas",
"different",
"anti-CD4",
"mAb",
"or",
"HIV-1",
"gp120",
"could",
"all",
"trigger",
"activation",
"of",
"the",
"protein",
"tyrosine",
"kinases",
"p56lck",
"and",
"p59fyn",
"and",
"phosphorylation",
"of",
"the",
"Shc",
"adaptor",
"protein",
",",
"which",
"mediates",
"signals",
"to",
"Ras",
",",
"they",
"differed",
"significantly",
"in",
"their",
"ability",
"to",
"activate",
"NF-AT",
"."
] | [
"whereas",
"different",
"anti-cd4",
"mab",
"or",
"hiv-1",
"gp120",
"could",
"all",
"trigger",
"activation",
"of",
"the",
"protein",
"tyrosine",
"kinases",
"p56lck",
"and",
"p59fyn",
"and",
"phosphorylation",
"of",
"the",
"shc",
"adaptor",
"protein",
",",
"which",
"mediates",
"signals",
"to",
"ras",
",",
"they",
"differed",
"significantly",
"in",
"their",
"ability",
"to",
"activate",
"nf-at",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Lack",
"of",
"full",
"activation",
"of",
"NF-AT",
"could",
"be",
"correlated",
"to",
"a",
"dramatically",
"reduced",
"capacity",
"to",
"induce",
"calcium",
"flux",
"and",
"could",
"be",
"complemented",
"with",
"a",
"calcium",
"ionophore",
"."
] | [
"lack",
"of",
"full",
"activation",
"of",
"nf-at",
"could",
"be",
"correlated",
"to",
"a",
"dramatically",
"reduced",
"capacity",
"to",
"induce",
"calcium",
"flux",
"and",
"could",
"be",
"complemented",
"with",
"a",
"calcium",
"ionophore",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-atom",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O"
] |
[
"The",
"results",
"identify",
"functionally",
"distinct",
"epitopes",
"on",
"the",
"CD4",
"coreceptor",
"involved",
"in",
"activation",
"of",
"the",
"Ras",
"/protein",
"kinase",
"C",
"and",
"calcium",
"pathways",
"."
] | [
"the",
"results",
"identify",
"functionally",
"distinct",
"epitopes",
"on",
"the",
"cd4",
"coreceptor",
"involved",
"in",
"activation",
"of",
"the",
"ras",
"/protein",
"kinase",
"c",
"and",
"calcium",
"pathways",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Effects",
"of",
"Ara-C",
"on",
"neutral",
"sphingomyelinase",
"and",
"mitogen-",
"and",
"stress-",
"activated",
"protein",
"kinases",
"in",
"T-lymphocyte",
"cell",
"lines",
"."
] | [
"effects",
"of",
"ara-c",
"on",
"neutral",
"sphingomyelinase",
"and",
"mitogen-",
"and",
"stress-",
"activated",
"protein",
"kinases",
"in",
"t-lymphocyte",
"cell",
"lines",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O"
] |
[
"Neutral",
"sphingomyelinase",
"(",
"SMase",
")",
"can",
"be",
"activated",
"by",
"extracellular",
"signals",
"to",
"produce",
"ceramide",
",",
"which",
"may",
"affect",
"mitogen-activated",
"protein",
"kinase",
"(",
"MAPK",
")",
"activities",
"."
] | [
"neutral",
"sphingomyelinase",
"(",
"smase",
")",
"can",
"be",
"activated",
"by",
"extracellular",
"signals",
"to",
"produce",
"ceramide",
",",
"which",
"may",
"affect",
"mitogen-activated",
"protein",
"kinase",
"(",
"mapk",
")",
"activities",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Neutral",
"SMase",
"activity",
"was",
"assessed",
"in",
"membranes",
"from",
"Jurkat",
",",
"a",
"human",
"T-cell",
"line",
",",
"and",
"EL4",
",",
"a",
"murine",
"T-cell",
"line",
"."
] | [
"neutral",
"smase",
"activity",
"was",
"assessed",
"in",
"membranes",
"from",
"jurkat",
",",
"a",
"human",
"t-cell",
"line",
",",
"and",
"el4",
",",
"a",
"murine",
"t-cell",
"line",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_component",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O"
] |
[
"Ara-C",
"activated",
"SMase",
"with",
"10",
"minutes",
"in",
"both",
"Jurkat",
"and",
"EL4",
"cells",
",",
"while",
"phorbol",
"ester",
"(",
"PMA",
")",
"had",
"no",
"effect",
"."
] | [
"ara-c",
"activated",
"smase",
"with",
"10",
"minutes",
"in",
"both",
"jurkat",
"and",
"el4",
"cells",
",",
"while",
"phorbol",
"ester",
"(",
"pma",
")",
"had",
"no",
"effect",
"."
] | [
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"PMA",
",",
"but",
"not",
"Ara-C",
"or",
"ceramides",
",",
"activated",
"ERK",
"MAPKS",
",",
"in",
"Jurkat",
"and",
"EL4",
"."
] | [
"pma",
",",
"but",
"not",
"ara-c",
"or",
"ceramides",
",",
"activated",
"erk",
"mapks",
",",
"in",
"jurkat",
"and",
"el4",
"."
] | [
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"O"
] |
[
"PMA",
"acted",
"synergistically",
"with",
"ionomycin",
"to",
"activate",
"JNK",
"MAPKs",
"in",
"Jurkat",
"and",
"EL4",
"within",
"10",
"minutes",
"."
] | [
"pma",
"acted",
"synergistically",
"with",
"ionomycin",
"to",
"activate",
"jnk",
"mapks",
"in",
"jurkat",
"and",
"el4",
"within",
"10",
"minutes",
"."
] | [
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Ara-C",
"activated",
"JNKs",
"only",
"after",
"prolonged",
"incubation",
"(",
"90-120",
"minutes",
")",
"."
] | [
"ara-c",
"activated",
"jnks",
"only",
"after",
"prolonged",
"incubation",
"(",
"90-120",
"minutes",
")",
"."
] | [
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Thus",
",",
"ceramide",
"is",
"not",
"a",
"positive",
"signal",
"for",
"ERK",
"activation",
"in",
"T-cell",
"lines",
"."
] | [
"thus",
",",
"ceramide",
"is",
"not",
"a",
"positive",
"signal",
"for",
"erk",
"activation",
"in",
"t-cell",
"lines",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O"
] |
[
"The",
"effects",
"of",
"Ara-C",
"on",
"JNK",
"activity",
"may",
"be",
"mediated",
"through",
"secondary",
"response",
"pathways",
"."
] | [
"the",
"effects",
"of",
"ara-c",
"on",
"jnk",
"activity",
"may",
"be",
"mediated",
"through",
"secondary",
"response",
"pathways",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Transcriptional",
"regulation",
"of",
"the",
"pyruvate",
"kinase",
"erythroid-specific",
"promoter",
"."
] | [
"transcriptional",
"regulation",
"of",
"the",
"pyruvate",
"kinase",
"erythroid-specific",
"promoter",
"."
] | [
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"Mammal",
"pyruvate",
"kinases",
"are",
"encoded",
"by",
"two",
"genes",
"."
] | [
"mammal",
"pyruvate",
"kinases",
"are",
"encoded",
"by",
"two",
"genes",
"."
] | [
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"L",
"gene",
"produces",
"the",
"erythroid",
"(",
"R-PK",
")",
"or",
"the",
"hepatic",
"(",
"L-PK",
")",
"isozymes",
"by",
"the",
"alternative",
"use",
"of",
"two",
"promoters",
"."
] | [
"the",
"l",
"gene",
"produces",
"the",
"erythroid",
"(",
"r-pk",
")",
"or",
"the",
"hepatic",
"(",
"l-pk",
")",
"isozymes",
"by",
"the",
"alternative",
"use",
"of",
"two",
"promoters",
"."
] | [
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"We",
"report",
"the",
"characterization",
"of",
"the",
"cis-",
"and",
"trans-",
"acting",
"elements",
"involved",
"in",
"the",
"tissue-specific",
"activity",
"of",
"the",
"L",
"gene",
"erythroid",
"promoter",
"."
] | [
"we",
"report",
"the",
"characterization",
"of",
"the",
"cis-",
"and",
"trans-",
"acting",
"elements",
"involved",
"in",
"the",
"tissue-specific",
"activity",
"of",
"the",
"l",
"gene",
"erythroid",
"promoter",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"A",
"R-PK",
"DNA",
"fragment",
"extending",
"from",
"-870",
"to",
"+54",
"relative",
"to",
"the",
"cap",
"site",
"confers",
"erythroid",
"specificity",
"to",
"a",
"reporter",
"gene",
"."
] | [
"a",
"r-pk",
"dna",
"fragment",
"extending",
"from",
"-870",
"to",
"+54",
"relative",
"to",
"the",
"cap",
"site",
"confers",
"erythroid",
"specificity",
"to",
"a",
"reporter",
"gene",
"."
] | [
"O",
"B-DNA_molecule",
"I-DNA_molecule",
"I-DNA_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O"
] |
[
"Within",
"this",
"region",
",",
"we",
"define",
"a",
"minimal",
"promoter",
"(",
"-62",
"to",
"+54",
")",
"that",
"displays",
"erythroid-specific",
"activity",
"and",
"contains",
"two",
"DNA",
"binding",
"sites",
"."
] | [
"within",
"this",
"region",
",",
"we",
"define",
"a",
"minimal",
"promoter",
"(",
"-62",
"to",
"+54",
")",
"that",
"displays",
"erythroid-specific",
"activity",
"and",
"contains",
"two",
"dna",
"binding",
"sites",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"One",
",",
"located",
"at",
"-50",
",",
"binds",
"members",
"of",
"the",
"CCACC/Sp1",
"family",
"and",
"the",
"other",
",",
"located",
"at",
"-20",
",",
"binds",
"the",
"erythroid",
"factor",
"GATA-1",
"."
] | [
"one",
",",
"located",
"at",
"-50",
",",
"binds",
"members",
"of",
"the",
"ccacc/sp1",
"family",
"and",
"the",
"other",
",",
"located",
"at",
"-20",
",",
"binds",
"the",
"erythroid",
"factor",
"gata-1",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Although",
"the",
"-20",
"GATA",
"binding",
"site",
"(",
"AGATAA",
")",
"is",
"also",
"a",
"potential",
"TFIID",
"binding",
"site",
",",
"it",
"does",
"not",
"bind",
"TFIID",
"."
] | [
"although",
"the",
"-20",
"gata",
"binding",
"site",
"(",
"agataa",
")",
"is",
"also",
"a",
"potential",
"tfiid",
"binding",
"site",
",",
"it",
"does",
"not",
"bind",
"tfiid",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-polynucleotide",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Furthermore",
",",
"the",
"substitution",
"of",
"this",
"GATA",
"binding",
"site",
"by",
"a",
"canonical",
"TFIID",
"binding",
"site",
"suppresses",
"the",
"promoter",
"activity",
"."
] | [
"furthermore",
",",
"the",
"substitution",
"of",
"this",
"gata",
"binding",
"site",
"by",
"a",
"canonical",
"tfiid",
"binding",
"site",
"suppresses",
"the",
"promoter",
"activity",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Mutations",
"and",
"deletions",
"of",
"both",
"sites",
"indicate",
"that",
"only",
"the",
"association",
"of",
"CCACC/Sp1",
"and",
"GATA",
"binding",
"sites",
"can",
"drive",
"efficient",
"and",
"tissue-specific",
"expression",
"of",
"this",
"R-PK",
"minimal",
"promoter",
"."
] | [
"mutations",
"and",
"deletions",
"of",
"both",
"sites",
"indicate",
"that",
"only",
"the",
"association",
"of",
"ccacc/sp1",
"and",
"gata",
"binding",
"sites",
"can",
"drive",
"efficient",
"and",
"tissue-specific",
"expression",
"of",
"this",
"r-pk",
"minimal",
"promoter",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"Finally",
",",
"by",
"co-transfection",
"experiments",
",",
"we",
"study",
"the",
"elements",
"involved",
"in",
"the",
"hGATA-1",
"transactivation",
"of",
"the",
"R-PK",
"promoter",
"in",
"HeLa",
"cells",
"."
] | [
"finally",
",",
"by",
"co-transfection",
"experiments",
",",
"we",
"study",
"the",
"elements",
"involved",
"in",
"the",
"hgata-1",
"transactivation",
"of",
"the",
"r-pk",
"promoter",
"in",
"hela",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O"
] |
[
"In",
"vivo",
"anergized",
"CD4+",
"T",
"cells",
"express",
"perturbed",
"AP-1",
"and",
"NF-kappa",
"B",
"transcription",
"factors",
"."
] | [
"in",
"vivo",
"anergized",
"cd4+",
"t",
"cells",
"express",
"perturbed",
"ap-1",
"and",
"nf-kappa",
"b",
"transcription",
"factors",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"Anergy",
"is",
"a",
"major",
"mechanism",
"to",
"ensure",
"antigen-specific",
"tolerance",
"in",
"T",
"lymphocytes",
"in",
"the",
"adult",
"."
] | [
"anergy",
"is",
"a",
"major",
"mechanism",
"to",
"ensure",
"antigen-specific",
"tolerance",
"in",
"t",
"lymphocytes",
"in",
"the",
"adult",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"vivo",
",",
"anergy",
"has",
"mainly",
"been",
"studied",
"at",
"the",
"cellular",
"level",
"."
] | [
"in",
"vivo",
",",
"anergy",
"has",
"mainly",
"been",
"studied",
"at",
"the",
"cellular",
"level",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"this",
"study",
",",
"we",
"used",
"the",
"T-cell-activating",
"superantigen",
"staphylococcal",
"enterotoxin",
"A",
"(",
"SEA",
")",
"to",
"investigate",
"molecular",
"mechanisms",
"of",
"T-lymphocyte",
"anergy",
"in",
"vivo",
"."
] | [
"in",
"this",
"study",
",",
"we",
"used",
"the",
"t-cell-activating",
"superantigen",
"staphylococcal",
"enterotoxin",
"a",
"(",
"sea",
")",
"to",
"investigate",
"molecular",
"mechanisms",
"of",
"t-lymphocyte",
"anergy",
"in",
"vivo",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Injection",
"of",
"SEA",
"to",
"adult",
"mice",
"activates",
"CD4+",
"T",
"cells",
"expressing",
"certain",
"T-cell",
"receptor",
"(",
"TCR",
")",
"variable",
"region",
"beta-chain",
"families",
"and",
"induces",
"strong",
"and",
"rapid",
"production",
"of",
"interleukin",
"2",
"(",
"IL-2",
")",
"."
] | [
"injection",
"of",
"sea",
"to",
"adult",
"mice",
"activates",
"cd4+",
"t",
"cells",
"expressing",
"certain",
"t-cell",
"receptor",
"(",
"tcr",
")",
"variable",
"region",
"beta-chain",
"families",
"and",
"induces",
"strong",
"and",
"rapid",
"production",
"of",
"interleukin",
"2",
"(",
"il-2",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"contrast",
",",
"repeated",
"injections",
"of",
"SEA",
"cause",
"CD4+",
"T-cell",
"deletion",
"and",
"anergy",
"in",
"the",
"remaining",
"CD4+",
"T",
"cells",
",",
"characterized",
"by",
"reduced",
"expression",
"of",
"IL-2",
"at",
"mRNA",
"and",
"protein",
"levels",
"."
] | [
"in",
"contrast",
",",
"repeated",
"injections",
"of",
"sea",
"cause",
"cd4+",
"t-cell",
"deletion",
"and",
"anergy",
"in",
"the",
"remaining",
"cd4+",
"t",
"cells",
",",
"characterized",
"by",
"reduced",
"expression",
"of",
"il-2",
"at",
"mrna",
"and",
"protein",
"levels",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"analyzed",
"expression",
"of",
"AP-1",
",",
"NF-kappa",
"B",
",",
"NF-AT",
",",
"and",
"octamer",
"binding",
"transcription",
"factors",
",",
"which",
"are",
"known",
"to",
"be",
"involved",
"in",
"the",
"regulation",
"of",
"IL-2",
"gene",
"promoter",
"activity",
"."
] | [
"we",
"analyzed",
"expression",
"of",
"ap-1",
",",
"nf-kappa",
"b",
",",
"nf-at",
",",
"and",
"octamer",
"binding",
"transcription",
"factors",
",",
"which",
"are",
"known",
"to",
"be",
"involved",
"in",
"the",
"regulation",
"of",
"il-2",
"gene",
"promoter",
"activity",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Large",
"amounts",
"of",
"AP-1",
"and",
"NF-kappa",
"B",
"and",
"significant",
"quantities",
"of",
"NF-AT",
"were",
"induced",
"in",
"SEA",
"-activated",
"CD4+",
"spleen",
"T",
"cells",
",",
"whereas",
"Oct-1",
"and",
"Oct-2",
"DNA",
"binding",
"activity",
"was",
"similar",
"in",
"both",
"resting",
"and",
"activated",
"T",
"cells",
"."
] | [
"large",
"amounts",
"of",
"ap-1",
"and",
"nf-kappa",
"b",
"and",
"significant",
"quantities",
"of",
"nf-at",
"were",
"induced",
"in",
"sea",
"-activated",
"cd4+",
"spleen",
"t",
"cells",
",",
"whereas",
"oct-1",
"and",
"oct-2",
"dna",
"binding",
"activity",
"was",
"similar",
"in",
"both",
"resting",
"and",
"activated",
"t",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"In",
"contrast",
",",
"anergic",
"CD4+",
"T",
"cells",
"contained",
"severely",
"reduced",
"levels",
"of",
"AP-1",
"and",
"Fos/Jun-containing",
"NF-AT",
"complexes",
"but",
"expressed",
"significant",
"amounts",
"of",
"NF-kappa",
"B",
"and",
"Oct",
"binding",
"proteins",
"after",
"SEA",
"stimulation",
"."
] | [
"in",
"contrast",
",",
"anergic",
"cd4+",
"t",
"cells",
"contained",
"severely",
"reduced",
"levels",
"of",
"ap-1",
"and",
"fos/jun-containing",
"nf-at",
"complexes",
"but",
"expressed",
"significant",
"amounts",
"of",
"nf-kappa",
"b",
"and",
"oct",
"binding",
"proteins",
"after",
"sea",
"stimulation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_complex",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"Resolution",
"of",
"the",
"NF-kappa",
"B",
"complex",
"demonstrated",
"predominant",
"expression",
"of",
"p50-p65",
"heterodimers",
"in",
"activated",
"CD4+",
"T",
"cells",
",",
"while",
"anergic",
"cells",
"mainly",
"expressed",
"the",
"transcriptionally",
"inactive",
"p50",
"homodimer",
"."
] | [
"resolution",
"of",
"the",
"nf-kappa",
"b",
"complex",
"demonstrated",
"predominant",
"expression",
"of",
"p50-p65",
"heterodimers",
"in",
"activated",
"cd4+",
"t",
"cells",
",",
"while",
"anergic",
"cells",
"mainly",
"expressed",
"the",
"transcriptionally",
"inactive",
"p50",
"homodimer",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"These",
"alterations",
"of",
"transcription",
"factors",
"are",
"likely",
"to",
"be",
"responsible",
"for",
"repression",
"of",
"IL-2",
"in",
"anergic",
"T",
"cells",
"."
] | [
"these",
"alterations",
"of",
"transcription",
"factors",
"are",
"likely",
"to",
"be",
"responsible",
"for",
"repression",
"of",
"il-2",
"in",
"anergic",
"t",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Expression",
"of",
"IkappaBalpha",
"in",
"the",
"nucleus",
"of",
"human",
"peripheral",
"blood",
"T",
"lymphocytes",
"."
] | [
"expression",
"of",
"ikappabalpha",
"in",
"the",
"nucleus",
"of",
"human",
"peripheral",
"blood",
"t",
"lymphocytes",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_component",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"According",
"to",
"current",
"models",
"the",
"inhibitory",
"capacity",
"of",
"I",
"(",
"kappa",
")",
"B",
"(",
"alpha",
")",
"would",
"be",
"mediated",
"through",
"the",
"retention",
"of",
"Rel/NF-kappaB",
"proteins",
"in",
"the",
"cytosol",
"."
] | [
"according",
"to",
"current",
"models",
"the",
"inhibitory",
"capacity",
"of",
"i",
"(",
"kappa",
")",
"b",
"(",
"alpha",
")",
"would",
"be",
"mediated",
"through",
"the",
"retention",
"of",
"rel/nf-kappab",
"proteins",
"in",
"the",
"cytosol",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O"
] |
[
"However",
",",
"I",
"(",
"kappa",
")",
"B",
"(",
"alpha",
")",
"has",
"also",
"been",
"detected",
"in",
"the",
"nucleus",
"of",
"cell",
"lines",
"and",
"when",
"overexpressed",
"by",
"transient",
"transfection",
"."
] | [
"however",
",",
"i",
"(",
"kappa",
")",
"b",
"(",
"alpha",
")",
"has",
"also",
"been",
"detected",
"in",
"the",
"nucleus",
"of",
"cell",
"lines",
"and",
"when",
"overexpressed",
"by",
"transient",
"transfection",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_component",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"To",
"gain",
"better",
"insight",
"into",
"the",
"potential",
"role",
"of",
"nuclear",
"I",
"(",
"kappa",
")",
"B",
"(",
"alpha",
")",
"in",
"a",
"physiological",
"context",
"we",
"have",
"analysed",
"its",
"presence",
"in",
"the",
"nucleus",
"of",
"human",
"peripheral",
"blood",
"T",
"lymphocytes",
"(",
"PBL",
")",
"."
] | [
"to",
"gain",
"better",
"insight",
"into",
"the",
"potential",
"role",
"of",
"nuclear",
"i",
"(",
"kappa",
")",
"b",
"(",
"alpha",
")",
"in",
"a",
"physiological",
"context",
"we",
"have",
"analysed",
"its",
"presence",
"in",
"the",
"nucleus",
"of",
"human",
"peripheral",
"blood",
"t",
"lymphocytes",
"(",
"pbl",
")",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_component",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"demonstrate",
"the",
"nuclear",
"localization",
"of",
"I",
"(",
"kappa",
")",
"B",
"(",
"alpha",
")",
"in",
"PBL",
"by",
"different",
"techniques",
":",
"Western",
"blot",
",",
"indirect",
"immunofluorescence",
"and",
"electron",
"microscopy",
"."
] | [
"we",
"demonstrate",
"the",
"nuclear",
"localization",
"of",
"i",
"(",
"kappa",
")",
"b",
"(",
"alpha",
")",
"in",
"pbl",
"by",
"different",
"techniques",
":",
"western",
"blot",
",",
"indirect",
"immunofluorescence",
"and",
"electron",
"microscopy",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Low",
"levels",
"of",
"nuclear",
"I",
"(",
"kappa",
")",
"B",
"(",
"alpha",
")",
"were",
"detected",
"in",
"resting",
"cells",
"whereas",
"a",
"superinduction",
"was",
"obtained",
"after",
"PMA",
"activation",
"."
] | [
"low",
"levels",
"of",
"nuclear",
"i",
"(",
"kappa",
")",
"b",
"(",
"alpha",
")",
"were",
"detected",
"in",
"resting",
"cells",
"whereas",
"a",
"superinduction",
"was",
"obtained",
"after",
"pma",
"activation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"nuclear",
"pool",
"of",
"I",
"(",
"kappa",
")",
"B",
"(",
"alpha",
")",
"showed",
"a",
"higher",
"stability",
"than",
"cytosolic",
"I",
"(",
"kappa",
")",
"B",
"(",
"alpha",
")",
"and",
"was",
"partially",
"independent",
"of",
"the",
"resynthesis",
"of",
"the",
"protein",
"."
] | [
"the",
"nuclear",
"pool",
"of",
"i",
"(",
"kappa",
")",
"b",
"(",
"alpha",
")",
"showed",
"a",
"higher",
"stability",
"than",
"cytosolic",
"i",
"(",
"kappa",
")",
"b",
"(",
"alpha",
")",
"and",
"was",
"partially",
"independent",
"of",
"the",
"resynthesis",
"of",
"the",
"protein",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Unexpectedly",
",",
"the",
"presence",
"of",
"nuclear",
"I",
"(",
"kappa",
")",
"B",
"(",
"alpha",
")",
"did",
"not",
"inhibit",
"NF-kappaB",
"binding",
"to",
"DNA",
"and",
"this",
"phenomenon",
"was",
"not",
"due",
"to",
"the",
"presence",
"of",
"IkappaBbeta",
"at",
"the",
"nuclear",
"level",
"."
] | [
"unexpectedly",
",",
"the",
"presence",
"of",
"nuclear",
"i",
"(",
"kappa",
")",
"b",
"(",
"alpha",
")",
"did",
"not",
"inhibit",
"nf-kappab",
"binding",
"to",
"dna",
"and",
"this",
"phenomenon",
"was",
"not",
"due",
"to",
"the",
"presence",
"of",
"ikappabbeta",
"at",
"the",
"nuclear",
"level",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Immunoprecipitation",
"experiments",
"failed",
"to",
"demonstrate",
"an",
"association",
"between",
"nuclear",
"I",
"(",
"kappa",
")",
"B",
"(",
"alpha",
")",
"and",
"NF-kappaB",
"proteins",
"."
] | [
"immunoprecipitation",
"experiments",
"failed",
"to",
"demonstrate",
"an",
"association",
"between",
"nuclear",
"i",
"(",
"kappa",
")",
"b",
"(",
"alpha",
")",
"and",
"nf-kappab",
"proteins",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"O"
] |
[
"Our",
"results",
"demonstrate",
"that",
"in",
"resting",
"and",
"PMA-activated",
"human",
"PBL",
",",
"I",
"(",
"kappa",
")",
"B",
"(",
"alpha",
")",
"is",
"present",
"in",
"the",
"nucleus",
"in",
"an",
"apparently",
"inactive",
"form",
"unable",
"to",
"disrupt",
"NF-kappaB",
"binding",
"from",
"DNA",
"."
] | [
"our",
"results",
"demonstrate",
"that",
"in",
"resting",
"and",
"pma-activated",
"human",
"pbl",
",",
"i",
"(",
"kappa",
")",
"b",
"(",
"alpha",
")",
"is",
"present",
"in",
"the",
"nucleus",
"in",
"an",
"apparently",
"inactive",
"form",
"unable",
"to",
"disrupt",
"nf-kappab",
"binding",
"from",
"dna",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"B-cell_type",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_component",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"O",
"B-DNA_N/A",
"O"
] |
Subsets and Splits