disi-unibo-nlp/bc4chemd · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 2 298	ner_tags listlengths 2 298
[ "A", "combinational", "intragastric", "administration", "of", "40mg", "/", "kg", "atRA", "can", "partially", "reverse", "NiCl", "(", "2", ")", "-", "induced", "arrhythmia", "in", "rats", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "results", "suggested", "that", "atRA", "might", "have", "therapeutic", "potential", "in", "alleviating", "the", "adverse", "effects", "of", "nickel", "on", "the", "cardiovascular", "system", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Pioglitazone", "protects", "against", "cisplatin", "induced", "nephrotoxicity", "in", "rats", "and", "potentiates", "its", "anticancer", "activity", "against", "human", "renal", "adenocarcinoma", "cell", "lines", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Cisplatin", "-", "induced", "nephrotoxicity", "is", "a", "serious", "problem", "that", "limits", "its", "use", "in", "cancer", "treatment", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "present", "study", "aimed", "to", "investigate", "the", "renal", "protective", "capacity", "of", "pioglitazone", "to", "reduce", "the", "cisplatin", "-", "induced", "nephrotoxicity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "underlying", "suggested", "mechanism", "(", "s", ")", "and", "whether", "this", "nephroprotective", "effect", "(", "if", "any", ")", "interferes", "with", "the", "cytotoxic", "effect", "of", "cisplatin", "on", "cancer", "cells", "were", "also", "investigated", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Pioglitazone", ",", "Bisphenol", "A", "diglycidyl", "ether", ",", "BADGE", ",", "IP", "injected", "(", "Peroxisome", "proliferator", "-", "activated", "receptor", "gamma", "(", "PPAR", "-", "gamma", ")", "antagonist", ")", ",", "or", "their", "combination", "were", "administered", "to", "rats", "one", "hour", "before", "cisplatin", "injection", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Moreover", ",", "their", "effects", "on", "the", "cell", "viability", "of", "human", "renal", "adenocarcinoma", "cell", "models", "(", "ACHN", ")", "were", "studied", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "obtained", "results", "showed", "that", "pioglitazone", "improved", "the", "renal", "function", ",", "structural", "changes", ",", "renal", "malondialdehyde", "(", "MDA", ")", ",", "tumor", "necrosis", "factor", "alpha", "(", "TNF", "-", "alpha", ")", ",", "nuclear", "factor", "kappa", "B", "(", "NF", "-", "kappa", "B", ")", "genes", "expression", "in", "cisplatin", "injected", "rats", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]
[ "It", "increased", "both", "renal", "reduced", "glutathione", "(", "GSH", ")", "content", "and", "PPAR", "-", "gamma", "gene", "expression", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "contrast", "to", "the", "data", "obtained", "by", "prior", "administration", "of", "BADGE", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "Pioglitazone", "also", "potentiated", "the", "cytotoxic", "effect", "of", "cisplatin", "on", "human", "renal", "adenocarcinoma", "cells", "and", "this", "effect", "was", "abolished", "by", "BADGE", "co", "administration", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]
[ "In", "conclusion", ",", "these", "results", "suggested", "that", "pioglitazone", "protected", "against", "cisplatin", "-", "induced", "nephrotoxicity", "through", "its", "interaction", "with", "PPAR", "-", "gamma", "receptors", "and", "antioxidant", "effects", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "pioglitazone", "did", "not", "interfere", "but", "rather", "potentiated", "the", "cytotoxic", "effects", "of", "cisplatin", "on", "human", "renal", "adenocarcinoma", "cells", "." ]	[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Human", "apolipoprotein", "E", "isoforms", "differentially", "affect", "bone", "mass", "and", "turnover", "in", "vivo", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "primary", "role", "of", "apolipoprotein", "E", "(", "apoE", ")", "is", "to", "mediate", "the", "cellular", "uptake", "of", "lipoproteins", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "a", "new", "role", "for", "apoE", "as", "a", "regulator", "of", "bone", "metabolism", "in", "mice", "has", "recently", "been", "established", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "contrast", "to", "mice", ",", "the", "human", "APOE", "gene", "is", "characterized", "by", "three", "common", "isoforms", "APOE", "epsilon", "2", ",", "epsilon", "3", ",", "and", "epsilon", "4", "that", "result", "in", "different", "metabolic", "properties", "of", "the", "apoE", "isoforms", ",", "but", "it", "remains", "controversial", "whether", "the", "APOE", "polymorphism", "influences", "bone", "traits", "in", "humans", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "clarify", "this", ",", "we", "investigated", "bone", "phenotypes", "of", "apoE", "knock", "-", "in", "(", "k", ".", "i", ".", ")", "mice", ",", "which", "express", "one", "human", "isoform", "each", "(", "apoE2", "k", ".", "i", ".", ",", "apoE3", "k", ".", "i", ".", ",", "apoE4", "k", ".", "i", ".", ")", "in", "place", "of", "the", "mouse", "apoE", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Analysis", "of", "12", "-", "week", "-", "old", "female", "k", ".", "i", ".", "mice", "revealed", "increased", "levels", "of", "biochemical", "bone", "formation", "and", "resorption", "markers", "in", "apoE2", "k", ".", "i", ".", "animals", "as", "compared", "to", "apoE3", "k", ".", "i", ".", "and", "apoE4", "k", ".", "i", ".", ",", "with", "a", "reduced", "osteoprotegerin", "(", "OPG", ")", "/", "receptor", "activator", "of", "NF", "-", "kappa", "B", "ligand", "(", "RANKL", ")", "ratio", "in", "apoE2", "k", ".", "i", ".", ",", "indicating", "increased", "turnover", "with", "prevailing", "resorption", "in", "apoE2", "k", ".", "i", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Accordingly", ",", "histomorphometric", "and", "micro", "-", "computed", "tomography", "(", "micro", "CT", ")", "analyses", "demonstrated", "significantly", "lower", "trabecular", "bone", "mass", "in", "apoE2", "than", "in", "apoE3", "and", "apoE4", "k", ".", "i", ".", "animals", ",", "which", "was", "reflected", "by", "a", "significant", "reduction", "of", "lumbar", "vertebrae", "maximum", "force", "resistance", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Unlike", "trabecular", "bone", ",", "femoral", "cortical", "thickness", ",", "and", "stability", "was", "not", "differentially", "affected", "by", "the", "apoE", "isoforms", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "extend", "these", "observations", "to", "the", "human", "situation", ",", "plasma", "from", "middle", "-", "aged", "healthy", "men", "homozygous", "for", "epsilon", "2", "/", "epsilon", "2", ",", "epsilon", "3", "/", "epsilon", "3", ",", "and", "epsilon", "4", "/", "epsilon", "4", "(", "n", "=", "21", ",", "n", "=", "80", ",", "n", "=", "55", ",", "respectively", ")", "was", "analyzed", "with", "regard", "to", "bone", "turnover", "markers", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "analogy", "to", "apoE2", "k", ".", "i", ".", "mice", ",", "a", "lower", "OPG", "/", "RANKL", "ratio", "was", "observed", "in", "the", "serum", "of", "epsilon", "2", "/", "epsilon", "2", "carriers", "as", "compared", "to", "epsilon", "3", "/", "epsilon", "3", "and", "epsilon", "4", "/", "epsilon", "4", "individuals", "(", "p", "=", "0", ".", "02", "for", "epsilon", "2", "/", "epsilon", "2", "versus", "epsilon", "4", "/", "epsilon", "4", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "conclusion", ",", "the", "current", "data", "strongly", "underline", "the", "general", "importance", "of", "apoE", "as", "a", "regulator", "of", "bone", "metabolism", "and", "identifies", "the", "APOE", "epsilon", "2", "allele", "as", "a", "potential", "genetic", "risk", "factor", "for", "low", "trabecular", "bone", "mass", "and", "vertebral", "fractures", "in", "humans", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Acute", "effect", "of", "calcium", "citrate", "on", "serum", "calcium", "and", "cardiovascular", "function", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Calcium", "supplements", "have", "been", "associated", "with", "an", "increased", "risk", "of", "cardiovascular", "events", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "the", "validity", "of", "these", "findings", "has", "been", "questioned", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "major", "concern", "is", "that", "the", "mechanism", "underlying", "an", "increase", "in", "cardiovascular", "events", "has", "not", "been", "demonstrated", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Calcium", "initiates", "cardiac", "and", "vascular", "contraction", "following", "influx", "of", "calcium", "into", "cardiac", "and", "smooth", "muscle", "from", "extracellular", "fluid", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "have", "investigated", "whether", "the", "acute", "rise", "in", "serum", "calcium", "following", "calcium", "supplement", "administration", "is", "associated", "with", "adverse", "changes", "in", "cardiovascular", "function", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "an", "open", "interventional", "study", ",", "we", "recruited", "25", "volunteers", "(", "16", "female", ",", "age", "60", ".", "3", "+/-", "6", ".", "5", "years", ",", "body", "mass", "index", "25", ".", "7", "+/-", "2", ".", "7", "kg", "/", "m2", ")", "from", "the", "community", "who", "were", "not", "taking", "calcium", "supplements", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Participants", "were", "studied", "before", "and", "3", "hours", "after", "a", "single", "oral", "dose", "of", "1000", "mg", "calcium", "citrate", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]
[ "We", "assessed", "well", "-", "validated", "markers", "of", "arterial", "stiffness", "(", "pulse", "wave", "velocity", "[", "PWV", "]", ")", ",", "arterial", "wave", "reflection", "(", "augmentation", "index", "[", "AIx", "]", ")", ",", "and", "myocardial", "perfusion", "(", "subendocardial", "viability", "ratio", "[", "SEVR", "]", ")", "by", "pulse", "wave", "analysis", "and", "endothelial", "function", "(", "reactive", "hyperemia", "index", "[", "RHI", "]", ")", "by", "peripheral", "arterial", "tonometry", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Total", "and", "ionized", "serum", "calcium", "were", "acutely", "increased", "by", "0", ".", "10", "+/-", "0", ".", "07", "and", "0", ".", "06", "+/-", "0", ".", "03", "mmol", "/", "L", ",", "respectively", ",", "3", "hours", "after", "calcium", "citrate", "administration", "(", "p", "<", "0", ".", "0001", "for", "both", "comparisons", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Following", "administration", "of", "calcium", "citrate", "there", "was", "a", "fall", "in", "AIx", "from", "a", "median", "of", "29", ".", "7", "%", "(", "23", ".", "8", "%", "to", "34", ".", "0", "%", ")", "to", "26", ".", "4", "%", "(", "22", ".", "7", "%", "to", "34", ".", "0", "%", ",", "p", "=", "0", ".", "03", ")", "and", "an", "increase", "in", "SEVR", "from", "163", "%", "(", "148", "%", "to", "174", "%", ")", "to", "170", "%", "(", "149", "%", "to", "185", "%", ",", "p", "=", "0", ".", "007", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "PWV", "and", "RHI", "were", "not", "significantly", "altered", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "change", "in", "total", "calcium", "was", "negatively", "correlated", "with", "the", "change", "in", "AIx", "(", "r", "=", "-", "0", ".", "48", ",", "p", "=", "0", ".", "02", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "summary", ",", "the", "acute", "increase", "in", "serum", "calcium", "following", "calcium", "supplement", "administration", "is", "associated", "with", "reduced", "arterial", "wave", "reflection", "and", "a", "marker", "of", "increased", "myocardial", "perfusion", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "If", "maintained", "long", "-", "term", ",", "these", "changes", "would", "be", "expected", "to", "reduce", "cardiovascular", "risk", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Acute", "serum", "calcium", "-", "mediated", "changes", "in", "these", "parameters", "of", "cardiovascular", "function", "are", "unlikely", "to", "underlie", "an", "association", "between", "calcium", "supplementation", "and", "cardiovascular", "events", "." ]	[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Can", "peripheral", "blood", "gamma", "delta", "T", "cells", "predict", "osteonecrosis", "of", "the", "jaw", "?" ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "An", "immunological", "perspective", "on", "the", "adverse", "drug", "effects", "of", "aminobisphosphonate", "therapy", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Nitrogen", "-", "bisphosphonates", "(", "n", "-", "BP", ")", ",", "often", "referred", "to", "as", "aminobisphosphonates", ",", "are", "the", "most", "commonly", "prescribed", "drugs", "for", "the", "treatment", "of", "disorders", "of", "bone", "fragility", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "long", "-", "term", "continuous", "treatment", "predisposes", "certain", "individuals", "to", "serious", "rare", "side", "effects", ",", "such", "as", "bisphosphonate", "-", "associated", "osteonecrosis", "of", "the", "jaw", "(", "BAONJ", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "n", "-", "BP", "use", "is", "known", "to", "unintentionally", "activate", "a", "subset", "of", "innate", "T", "cells", "called", "V", "gamma", "9V", "delta", "2", "T", "cells", ",", "but", "the", "consequence", "of", "this", "chronic", "immune", "stimulation", "has", "remained", "unexplored", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "primary", "objectives", "of", "this", "study", "were", "to", "1", ")", "determine", "the", "fate", "of", "V", "gamma", "9V", "delta", "2", "T", "cells", "in", "osteoporotic", "patients", "on", "n", "-", "BP", "therapy", "as", "a", "function", "of", "time", "and", "type", "of", "therapy", ";", "2", ")", "evaluate", "the", "proportion", "of", "V", "gamma", "9V", "delta", "2", "T", "cells", "in", "patients", "who", "had", "recently", "experienced", "n", "-", "BP", "-", "associated", "ONJ", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "found", "there", "is", "a", "notable", "loss", "of", "V", "gamma", "9V", "delta", "2", "T", "cells", "over", "time", "in", "osteoporotic", "patients", "on", "n", "-", "BP", "therapy", ",", "particularly", "those", "on", "intravenous", "(", "iv", ")", "therapy", "(", "Spearman", "r", "=", "-", "0", ".", "55", ",", "p", "<", "0", ".", "0001", "iv", ";", "r", "=", "-", "0", ".", "3", ",", "p", "<", "0", ".", "03", "oral", ")", "(", "n", "=", "68", ")", ";", "no", "difference", "was", "observed", "in", "total", "T", "cells", ",", "monocytes", ",", "or", "granulocytes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Importantly", ",", "the", "observed", "negative", "effect", "on", "V", "gamma", "9V", "delta", "2", "T", "cells", "coincides", "with", "the", "reported", "route", "of", "administration", "and", "timing", "of", "the", "rare", "occurrence", "of", "BAONJ", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Patients", "(", "n", "=", "6", ")", "who", "had", "experienced", "BAONJ", "were", "all", "found", "to", "be", "significantly", "deficient", "in", "V", "gamma", "9V", "delta", "2", "T", "cells", "(", "median", "=", "0", ".", "07", "%", ")", "in", "comparison", "to", "age", "-", "and", "sex", "-", "matched", "treatment", "-", "na", "i", "ve", "controls", "(", "N", "=", "11", ";", "median", "=", "2", ".", "40", "%", ")", ",", "U", "=", "0", ",", "p", "=", "0", ".", "001", ";", "this", "was", "the", "only", "consistent", "difference", "in", "the", "leukocytes", "assessed", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "All", "BAONJ", "cases", "had", "an", "underlying", "condition", "that", "further", "contributed", "to", "impaired", "immunity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "propose", "V", "gamma", "9V", "delta", "2", "T", "cells", "show", "a", "strong", "potential", "to", "serve", "as", "harbingers", "of", "possible", "adverse", "immune", "effects", "of", "n", "-", "BP", "therapy", ",", "particularly", "in", "those", "patients", "already", "having", "a", "compromised", "immune", "system", "as", "they", "may", "be", "most", "vulnerable", "to", "the", "development", "of", "conditions", "such", "as", "BAONJ", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "role", "of", "adipokines", "in", "beta", "-", "cell", "failure", "of", "type", "2", "diabetes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "beta", "-", "Cell", "failure", "coupled", "with", "insulin", "resistance", "is", "a", "key", "factor", "in", "the", "development", "of", "type", "2", "diabetes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Changes", "in", "circulating", "levels", "of", "adipokines", ",", "factors", "released", "from", "adipose", "tissue", ",", "form", "a", "significant", "link", "between", "excessive", "adiposity", "in", "obesity", "and", "both", "aforementioned", "factors", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "review", ",", "we", "consider", "the", "published", "evidence", "for", "the", "role", "of", "individual", "adipokines", "on", "the", "function", ",", "proliferation", ",", "death", "and", "failure", "of", "beta", "-", "cells", ",", "focusing", "on", "those", "reported", "to", "have", "the", "most", "significant", "effects", "(", "leptin", ",", "adiponectin", ",", "tumour", "necrosis", "factor", "alpha", ",", "resistin", ",", "visfatin", ",", "dipeptidyl", "peptidase", "IV", "and", "apelin", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "It", "is", "apparent", "that", "some", "adipokines", "have", "beneficial", "effects", "whereas", "others", "have", "detrimental", "properties", ";", "the", "overall", "contribution", "to", "beta", "-", "cell", "failure", "of", "changed", "concentrations", "of", "adipokines", "in", "the", "blood", "of", "obese", "pre", "-", "diabetic", "subjects", "will", "be", "highly", "dependent", "on", "the", "balance", "between", "these", "effects", "and", "the", "interactions", "between", "the", "adipokines", ",", "which", "act", "on", "the", "beta", "-", "cell", "via", "a", "number", "of", "intersecting", "intracellular", "signalling", "pathways", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "emphasise", "the", "importance", ",", "and", "comparative", "dearth", ",", "of", "studies", "into", "the", "combined", "effects", "of", "adipokines", "on", "beta", "-", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Genetic", "correlate", "of", "cognitive", "training", "response", "in", "schizophrenia", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Intensive", "computerized", "auditory", "training", "results", "in", "improved", "cognition", "for", "schizophrenia", "patients", ",", "but", "participants", "show", "variation", "in", "their", "cognitive", "gains", "and", "the", "biological", "factors", "that", "affect", "the", "response", "to", "training", "are", "unknown", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Single", "nucleotide", "polymorphisms", "(", "SNPs", ")", "in", "the", "catechol", "-", "O", "-", "methyltransferase", "(", "COMT", ")", "gene", "have", "been", "related", "to", "cognitive", "function", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", "we", "asked", "if", "functional", "variation", "in", "this", "gene", "has", "an", "impact", "on", "the", "response", "of", "schizophrenia", "patients", "to", "cognitive", "training", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "genotyped", "48", "schizophrenia", "patients", "who", "completed", "50", "h", "of", "computerized", "cognitive", "training", "and", "analyzed", "the", "association", "between", "DNA", "variants", "in", "the", "COMT", "gene", "and", "the", "improvement", "in", "global", "cognition", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Although", "conventional", "analyses", "did", "not", "reveal", "any", "significant", "associations", ",", "a", "set", "-", "based", "analysis", "examining", "the", "aggregate", "effect", "of", "common", "variation", "in", "the", "COMT", "gene", "(", "42", "SNPs", ")", "suggested", "association", "with", "improvement", "in", "global", "cognition", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Eight", "SNPs", ",", "mostly", "located", "in", "the", "3", "'", "end", "of", "the", "COMT", "gene", ",", "were", "nominally", "associated", "with", "improvement", "in", "cognition", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "data", "suggest", "that", "genotype", "influences", "the", "response", "to", "intensive", "cognitive", "training", "in", "schizophrenia", ",", "and", "may", "indicate", "that", "cognitive", "training", "regimens", "need", "to", "be", "personalized", "to", "the", "underlying", "biosignatures", "of", "each", "individual", "patient", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "article", "is", "part", "of", "a", "Special", "Issue", "entitled", "'", "Cognitive", "Enhancers", "'", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Hepatic", "ATGL", "knockdown", "uncouples", "glucose", "intolerance", "from", "liver", "TAG", "accumulation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Adipose", "triglyceride", "lipase", "(", "ATGL", ")", "is", "the", "predominant", "triacylglycerol", "(", "TAG", ")", "hydrolase", "in", "mammals", ";", "however", ",", "the", "tissue", "-", "specific", "effects", "of", "ATGL", "outside", "of", "adipose", "tissue", "have", "not", "been", "well", "characterized", "." ]	[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Hence", ",", "we", "tested", "the", "contribution", "of", "hepatic", "ATGL", "on", "mediating", "glucose", "tolerance", "and", "insulin", "action", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Glucose", "or", "insulin", "tolerance", "tests", "and", "insulin", "signaling", "were", "performed", "in", "C57BL", "/", "6", "mice", "administered", "control", "(", "nongene", "specific", "shRNA", ")", "or", "Atgl", "shRNA", "adenoviruses", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Glucose", "and", "lipid", "metabolism", "assays", "were", "conducted", "in", "primary", "hepatocytes", "isolated", "from", "mice", "transduced", "with", "control", "or", "Atgl", "shRNA", "adenoviruses", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Knocking", "down", "hepatic", "ATGL", "completely", "abrogated", "the", "increase", "in", "serum", "insulin", "following", "either", "1", "or", "12", "wk", "of", "feeding", "a", "high", "-", "fat", "(", "HF", ")", "diet", "despite", "higher", "hepatic", "TAG", "content", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Glucose", "tolerance", "tests", "demonstrated", "that", "ATGL", "knockdown", "normalized", "glucose", "tolerance", "in", "HF", "-", "diet", "-", "fed", "mice", "." ]	[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "observed", "improvements", "in", "glucose", "tolerance", "were", "present", "despite", "unaltered", "hepatic", "insulin", "signaling", "and", "increased", "liver", "TAG", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "Mice", "with", "suppressed", "hepatic", "ATGL", "had", "reduced", "hepatic", "glucose", "production", "in", "vivo", ",", "and", "hepatocytes", "isolated", "from", "Atgl", "shRNA", "-", "treated", "mice", "displayed", "a", "26", "%", "decrease", "in", "glucose", "production", "and", "a", "38", "%", "increase", "in", "glucose", "oxidation", "compared", "to", "control", "cells", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Taken", "together", ",", "these", "data", "suggest", "that", "hepatic", "ATGL", "knockdown", "enhances", "glucose", "tolerance", "by", "increasing", "hepatic", "glucose", "utilization", "and", "uncouples", "impairments", "in", "insulin", "action", "from", "hepatic", "TAG", "accumulation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Inference", "on", "population", "histories", "by", "approximating", "infinite", "alleles", "diffusion", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Reconstruction", "of", "the", "past", "is", "an", "important", "task", "of", "evolutionary", "biology", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "It", "takes", "place", "at", "different", "points", "in", "a", "hierarchy", "of", "molecular", "variation", ",", "including", "genes", ",", "individuals", ",", "populations", ",", "and", "species", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Statistical", "inference", "about", "population", "histories", "has", "recently", "received", "considerable", "attention", ",", "following", "the", "development", "of", "computational", "tools", "to", "provide", "tractable", "approaches", "to", "this", "very", "challenging", "problem", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", ",", "we", "introduce", "a", "likelihood", "-", "based", "approach", "which", "generalizes", "a", "recently", "developed", "model", "for", "random", "fluctuations", "in", "allele", "frequencies", "based", "on", "an", "approximation", "to", "the", "neutral", "Wright", "-", "Fisher", "diffusion", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "new", "framework", "approximates", "the", "infinite", "alleles", "Wright", "-", "Fisher", "model", "and", "uses", "an", "implementation", "with", "an", "adaptive", "Markov", "chain", "Monte", "Carlo", "algorithm", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "method", "is", "especially", "well", "suited", "to", "data", "sets", "harboring", "large", "population", "samples", "and", "relatively", "few", "loci", "for", "which", "other", "likelihood", "-", "based", "models", "are", "currently", "computationally", "intractable", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Using", "our", "model", ",", "we", "reconstruct", "the", "global", "population", "history", "of", "a", "major", "human", "pathogen", ",", "Streptococcus", "pneumoniae", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "results", "illustrate", "the", "potential", "to", "reach", "important", "biological", "insights", "to", "an", "evolutionary", "process", "by", "a", "population", "genetics", "approach", ",", "which", "can", "appropriately", "accommodate", "very", "large", "population", "samples", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Crosslinked", "linear", "polyethylenimine", "enhances", "delivery", "of", "DNA", "to", "the", "cytoplasm", "." ]	[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Crosslinked", "polyethylenimines", "(", "PEIs", ")", "have", "been", "frequently", "examined", "over", "the", "past", "decade", "since", "they", "can", "maintain", "the", "transfection", "efficiency", "of", "commercially", "available", ",", "25k", "branched", "PEI", ",", "but", "exhibit", "less", "cytotoxicity", "." ]	[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "argument", "is", "often", "made", "that", "the", "degradability", "of", "such", "polymers", ",", "generally", "synthesized", "with", "either", "disulfide", "or", "hydrolytically", "degradable", "crosslinkers", ",", "is", "critical", "to", "the", "high", "efficiency", "and", "low", "toxicity", "of", "the", "system", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "work", ",", "we", "present", "a", "crosslinked", "linear", "PEI", "(", "xLPEI", ")", "system", "in", "which", "either", "disulfide", "-", "responsive", "or", "non", "-", "degradable", "linkages", "are", "incorporated", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "As", "with", "previous", "systems", ",", "strong", "transfection", "efficiency", "in", "comparison", "with", "commercial", "standards", "was", "achieved", "with", "low", "cytotoxicity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "these", "properties", "were", "shown", "to", "be", "present", "when", "either", "the", "degradable", "or", "non", "-", "degradable", "crosslinker", "was", "used", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Uncomplexed", "polymer", "was", "demonstrated", "to", "be", "the", "critical", "factor", "determining", "transfection", "efficiency", "for", "these", "polymers", ",", "mediating", "efficient", "endosomal", "escape", "without", "signs", "of", "cell", "membrane", "damage", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "While", "several", "crosslinked", "PEI", "systems", "in", "the", "literature", "have", "demonstrated", "the", "effect", "of", "the", "disulfide", "moiety", ",", "this", "work", "demonstrates", "that", "disulfide", "-", "mediated", "unpackaging", "may", "not", "be", "as", "important", "as", "conventionally", "thought", "for", "some", "PEI", "systems", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Molecular", "phylogeny", "of", "North", "American", "Branchiobdellida", "(", "Annelida", ":", "Clitellata", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Branchiobdellidans", ",", "or", "crayfish", "worms", ",", "are", "ectosymbiotic", "clitellate", "annelids", "associated", "primarily", "with", "freshwater", "crayfishes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "main", "objectives", "of", "our", "study", "were", "to", "infer", "a", "molecular", "phylogeny", "for", "the", "North", "American", "Branchiobdellida", ",", "examine", "its", "congruence", "with", "morphology", "-", "based", "hypotheses", "of", "relationships", "at", "the", "subfamily", "and", "genus", "level", ",", "and", "use", "our", "dataset", "to", "assess", "consistency", "of", "GenBank", "-", "archived", "branchiobdellidan", "sequences", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "used", "nucleotide", "sequence", "data", "from", "two", "mtDNA", "genes", "(", "COI", "and", "16S", "rDNA", ")", "and", "three", "nuclear", "genes", "(", "28S", "rDNA", ",", "18S", "rDNA", ",", "and", "ITS1", ")", "to", "estimate", "phylogenetic", "relationships", "among", "47", "described", "and", "one", "undescribed", "species", "of", "Branchiobdellida", "." ]	[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "recovered", "a", "monophyletic", "branchiobdellidan", "clade", "with", "generally", "short", "branch", "lengths", ",", "suggesting", "that", "a", "large", "portion", "of", "the", "taxon", "has", "likely", "undergone", "a", "recent", "and", "rapid", "radiation", "in", "North", "America", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Results", "from", "our", "phylogenetic", "analyses", "indicate", "that", "current", "taxonomic", "groupings", "are", "largely", "unsupported", "by", "the", "molecular", "data", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "combinational", "intragastric", "administration", "of", "40mg", "/", "kg", "atRA", "can", "partially", "reverse", "NiCl", "(", "2", ")", "-", "induced", "arrhythmia", "in", "rats", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "results", "suggested", "that", "atRA", "might", "have", "therapeutic", "potential", "in", "alleviating", "the", "adverse", "effects", "of", "nickel", "on", "the", "cardiovascular", "system", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Pioglitazone", "protects", "against", "cisplatin", "induced", "nephrotoxicity", "in", "rats", "and", "potentiates", "its", "anticancer", "activity", "against", "human", "renal", "adenocarcinoma", "cell", "lines", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Cisplatin", "-", "induced", "nephrotoxicity", "is", "a", "serious", "problem", "that", "limits", "its", "use", "in", "cancer", "treatment", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "present", "study", "aimed", "to", "investigate", "the", "renal", "protective", "capacity", "of", "pioglitazone", "to", "reduce", "the", "cisplatin", "-", "induced", "nephrotoxicity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "underlying", "suggested", "mechanism", "(", "s", ")", "and", "whether", "this", "nephroprotective", "effect", "(", "if", "any", ")", "interferes", "with", "the", "cytotoxic", "effect", "of", "cisplatin", "on", "cancer", "cells", "were", "also", "investigated", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Pioglitazone", ",", "Bisphenol", "A", "diglycidyl", "ether", ",", "BADGE", ",", "IP", "injected", "(", "Peroxisome", "proliferator", "-", "activated", "receptor", "gamma", "(", "PPAR", "-", "gamma", ")", "antagonist", ")", ",", "or", "their", "combination", "were", "administered", "to", "rats", "one", "hour", "before", "cisplatin", "injection", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "Moreover", ",", "their", "effects", "on", "the", "cell", "viability", "of", "human", "renal", "adenocarcinoma", "cell", "models", "(", "ACHN", ")", "were", "studied", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "obtained", "results", "showed", "that", "pioglitazone", "improved", "the", "renal", "function", ",", "structural", "changes", ",", "renal", "malondialdehyde", "(", "MDA", ")", ",", "tumor", "necrosis", "factor", "alpha", "(", "TNF", "-", "alpha", ")", ",", "nuclear", "factor", "kappa", "B", "(", "NF", "-", "kappa", "B", ")", "genes", "expression", "in", "cisplatin", "injected", "rats", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]

[ "It", "increased", "both", "renal", "reduced", "glutathione", "(", "GSH", ")", "content", "and", "PPAR", "-", "gamma", "gene", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "contrast", "to", "the", "data", "obtained", "by", "prior", "administration", "of", "BADGE", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]

[ "Pioglitazone", "also", "potentiated", "the", "cytotoxic", "effect", "of", "cisplatin", "on", "human", "renal", "adenocarcinoma", "cells", "and", "this", "effect", "was", "abolished", "by", "BADGE", "co", "administration", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]

[ "In", "conclusion", ",", "these", "results", "suggested", "that", "pioglitazone", "protected", "against", "cisplatin", "-", "induced", "nephrotoxicity", "through", "its", "interaction", "with", "PPAR", "-", "gamma", "receptors", "and", "antioxidant", "effects", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "pioglitazone", "did", "not", "interfere", "but", "rather", "potentiated", "the", "cytotoxic", "effects", "of", "cisplatin", "on", "human", "renal", "adenocarcinoma", "cells", "." ]

[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Human", "apolipoprotein", "E", "isoforms", "differentially", "affect", "bone", "mass", "and", "turnover", "in", "vivo", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "primary", "role", "of", "apolipoprotein", "E", "(", "apoE", ")", "is", "to", "mediate", "the", "cellular", "uptake", "of", "lipoproteins", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "a", "new", "role", "for", "apoE", "as", "a", "regulator", "of", "bone", "metabolism", "in", "mice", "has", "recently", "been", "established", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "contrast", "to", "mice", ",", "the", "human", "APOE", "gene", "is", "characterized", "by", "three", "common", "isoforms", "APOE", "epsilon", "2", ",", "epsilon", "3", ",", "and", "epsilon", "4", "that", "result", "in", "different", "metabolic", "properties", "of", "the", "apoE", "isoforms", ",", "but", "it", "remains", "controversial", "whether", "the", "APOE", "polymorphism", "influences", "bone", "traits", "in", "humans", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "clarify", "this", ",", "we", "investigated", "bone", "phenotypes", "of", "apoE", "knock", "-", "in", "(", "k", ".", "i", ".", ")", "mice", ",", "which", "express", "one", "human", "isoform", "each", "(", "apoE2", "k", ".", "i", ".", ",", "apoE3", "k", ".", "i", ".", ",", "apoE4", "k", ".", "i", ".", ")", "in", "place", "of", "the", "mouse", "apoE", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Analysis", "of", "12", "-", "week", "-", "old", "female", "k", ".", "i", ".", "mice", "revealed", "increased", "levels", "of", "biochemical", "bone", "formation", "and", "resorption", "markers", "in", "apoE2", "k", ".", "i", ".", "animals", "as", "compared", "to", "apoE3", "k", ".", "i", ".", "and", "apoE4", "k", ".", "i", ".", ",", "with", "a", "reduced", "osteoprotegerin", "(", "OPG", ")", "/", "receptor", "activator", "of", "NF", "-", "kappa", "B", "ligand", "(", "RANKL", ")", "ratio", "in", "apoE2", "k", ".", "i", ".", ",", "indicating", "increased", "turnover", "with", "prevailing", "resorption", "in", "apoE2", "k", ".", "i", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Accordingly", ",", "histomorphometric", "and", "micro", "-", "computed", "tomography", "(", "micro", "CT", ")", "analyses", "demonstrated", "significantly", "lower", "trabecular", "bone", "mass", "in", "apoE2", "than", "in", "apoE3", "and", "apoE4", "k", ".", "i", ".", "animals", ",", "which", "was", "reflected", "by", "a", "significant", "reduction", "of", "lumbar", "vertebrae", "maximum", "force", "resistance", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Unlike", "trabecular", "bone", ",", "femoral", "cortical", "thickness", ",", "and", "stability", "was", "not", "differentially", "affected", "by", "the", "apoE", "isoforms", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "extend", "these", "observations", "to", "the", "human", "situation", ",", "plasma", "from", "middle", "-", "aged", "healthy", "men", "homozygous", "for", "epsilon", "2", "/", "epsilon", "2", ",", "epsilon", "3", "/", "epsilon", "3", ",", "and", "epsilon", "4", "/", "epsilon", "4", "(", "n", "=", "21", ",", "n", "=", "80", ",", "n", "=", "55", ",", "respectively", ")", "was", "analyzed", "with", "regard", "to", "bone", "turnover", "markers", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "analogy", "to", "apoE2", "k", ".", "i", ".", "mice", ",", "a", "lower", "OPG", "/", "RANKL", "ratio", "was", "observed", "in", "the", "serum", "of", "epsilon", "2", "/", "epsilon", "2", "carriers", "as", "compared", "to", "epsilon", "3", "/", "epsilon", "3", "and", "epsilon", "4", "/", "epsilon", "4", "individuals", "(", "p", "=", "0", ".", "02", "for", "epsilon", "2", "/", "epsilon", "2", "versus", "epsilon", "4", "/", "epsilon", "4", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "conclusion", ",", "the", "current", "data", "strongly", "underline", "the", "general", "importance", "of", "apoE", "as", "a", "regulator", "of", "bone", "metabolism", "and", "identifies", "the", "APOE", "epsilon", "2", "allele", "as", "a", "potential", "genetic", "risk", "factor", "for", "low", "trabecular", "bone", "mass", "and", "vertebral", "fractures", "in", "humans", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Acute", "effect", "of", "calcium", "citrate", "on", "serum", "calcium", "and", "cardiovascular", "function", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Calcium", "supplements", "have", "been", "associated", "with", "an", "increased", "risk", "of", "cardiovascular", "events", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "the", "validity", "of", "these", "findings", "has", "been", "questioned", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "major", "concern", "is", "that", "the", "mechanism", "underlying", "an", "increase", "in", "cardiovascular", "events", "has", "not", "been", "demonstrated", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Calcium", "initiates", "cardiac", "and", "vascular", "contraction", "following", "influx", "of", "calcium", "into", "cardiac", "and", "smooth", "muscle", "from", "extracellular", "fluid", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "have", "investigated", "whether", "the", "acute", "rise", "in", "serum", "calcium", "following", "calcium", "supplement", "administration", "is", "associated", "with", "adverse", "changes", "in", "cardiovascular", "function", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "an", "open", "interventional", "study", ",", "we", "recruited", "25", "volunteers", "(", "16", "female", ",", "age", "60", ".", "3", "+/-", "6", ".", "5", "years", ",", "body", "mass", "index", "25", ".", "7", "+/-", "2", ".", "7", "kg", "/", "m2", ")", "from", "the", "community", "who", "were", "not", "taking", "calcium", "supplements", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "Participants", "were", "studied", "before", "and", "3", "hours", "after", "a", "single", "oral", "dose", "of", "1000", "mg", "calcium", "citrate", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]

[ "We", "assessed", "well", "-", "validated", "markers", "of", "arterial", "stiffness", "(", "pulse", "wave", "velocity", "[", "PWV", "]", ")", ",", "arterial", "wave", "reflection", "(", "augmentation", "index", "[", "AIx", "]", ")", ",", "and", "myocardial", "perfusion", "(", "subendocardial", "viability", "ratio", "[", "SEVR", "]", ")", "by", "pulse", "wave", "analysis", "and", "endothelial", "function", "(", "reactive", "hyperemia", "index", "[", "RHI", "]", ")", "by", "peripheral", "arterial", "tonometry", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Total", "and", "ionized", "serum", "calcium", "were", "acutely", "increased", "by", "0", ".", "10", "+/-", "0", ".", "07", "and", "0", ".", "06", "+/-", "0", ".", "03", "mmol", "/", "L", ",", "respectively", ",", "3", "hours", "after", "calcium", "citrate", "administration", "(", "p", "<", "0", ".", "0001", "for", "both", "comparisons", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Following", "administration", "of", "calcium", "citrate", "there", "was", "a", "fall", "in", "AIx", "from", "a", "median", "of", "29", ".", "7", "%", "(", "23", ".", "8", "%", "to", "34", ".", "0", "%", ")", "to", "26", ".", "4", "%", "(", "22", ".", "7", "%", "to", "34", ".", "0", "%", ",", "p", "=", "0", ".", "03", ")", "and", "an", "increase", "in", "SEVR", "from", "163", "%", "(", "148", "%", "to", "174", "%", ")", "to", "170", "%", "(", "149", "%", "to", "185", "%", ",", "p", "=", "0", ".", "007", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "PWV", "and", "RHI", "were", "not", "significantly", "altered", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "change", "in", "total", "calcium", "was", "negatively", "correlated", "with", "the", "change", "in", "AIx", "(", "r", "=", "-", "0", ".", "48", ",", "p", "=", "0", ".", "02", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "summary", ",", "the", "acute", "increase", "in", "serum", "calcium", "following", "calcium", "supplement", "administration", "is", "associated", "with", "reduced", "arterial", "wave", "reflection", "and", "a", "marker", "of", "increased", "myocardial", "perfusion", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "If", "maintained", "long", "-", "term", ",", "these", "changes", "would", "be", "expected", "to", "reduce", "cardiovascular", "risk", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Acute", "serum", "calcium", "-", "mediated", "changes", "in", "these", "parameters", "of", "cardiovascular", "function", "are", "unlikely", "to", "underlie", "an", "association", "between", "calcium", "supplementation", "and", "cardiovascular", "events", "." ]

[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Can", "peripheral", "blood", "gamma", "delta", "T", "cells", "predict", "osteonecrosis", "of", "the", "jaw", "?" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "An", "immunological", "perspective", "on", "the", "adverse", "drug", "effects", "of", "aminobisphosphonate", "therapy", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "Nitrogen", "-", "bisphosphonates", "(", "n", "-", "BP", ")", ",", "often", "referred", "to", "as", "aminobisphosphonates", ",", "are", "the", "most", "commonly", "prescribed", "drugs", "for", "the", "treatment", "of", "disorders", "of", "bone", "fragility", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "long", "-", "term", "continuous", "treatment", "predisposes", "certain", "individuals", "to", "serious", "rare", "side", "effects", ",", "such", "as", "bisphosphonate", "-", "associated", "osteonecrosis", "of", "the", "jaw", "(", "BAONJ", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "n", "-", "BP", "use", "is", "known", "to", "unintentionally", "activate", "a", "subset", "of", "innate", "T", "cells", "called", "V", "gamma", "9V", "delta", "2", "T", "cells", ",", "but", "the", "consequence", "of", "this", "chronic", "immune", "stimulation", "has", "remained", "unexplored", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "primary", "objectives", "of", "this", "study", "were", "to", "1", ")", "determine", "the", "fate", "of", "V", "gamma", "9V", "delta", "2", "T", "cells", "in", "osteoporotic", "patients", "on", "n", "-", "BP", "therapy", "as", "a", "function", "of", "time", "and", "type", "of", "therapy", ";", "2", ")", "evaluate", "the", "proportion", "of", "V", "gamma", "9V", "delta", "2", "T", "cells", "in", "patients", "who", "had", "recently", "experienced", "n", "-", "BP", "-", "associated", "ONJ", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "found", "there", "is", "a", "notable", "loss", "of", "V", "gamma", "9V", "delta", "2", "T", "cells", "over", "time", "in", "osteoporotic", "patients", "on", "n", "-", "BP", "therapy", ",", "particularly", "those", "on", "intravenous", "(", "iv", ")", "therapy", "(", "Spearman", "r", "=", "-", "0", ".", "55", ",", "p", "<", "0", ".", "0001", "iv", ";", "r", "=", "-", "0", ".", "3", ",", "p", "<", "0", ".", "03", "oral", ")", "(", "n", "=", "68", ")", ";", "no", "difference", "was", "observed", "in", "total", "T", "cells", ",", "monocytes", ",", "or", "granulocytes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Importantly", ",", "the", "observed", "negative", "effect", "on", "V", "gamma", "9V", "delta", "2", "T", "cells", "coincides", "with", "the", "reported", "route", "of", "administration", "and", "timing", "of", "the", "rare", "occurrence", "of", "BAONJ", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Patients", "(", "n", "=", "6", ")", "who", "had", "experienced", "BAONJ", "were", "all", "found", "to", "be", "significantly", "deficient", "in", "V", "gamma", "9V", "delta", "2", "T", "cells", "(", "median", "=", "0", ".", "07", "%", ")", "in", "comparison", "to", "age", "-", "and", "sex", "-", "matched", "treatment", "-", "na", "i", "ve", "controls", "(", "N", "=", "11", ";", "median", "=", "2", ".", "40", "%", ")", ",", "U", "=", "0", ",", "p", "=", "0", ".", "001", ";", "this", "was", "the", "only", "consistent", "difference", "in", "the", "leukocytes", "assessed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "All", "BAONJ", "cases", "had", "an", "underlying", "condition", "that", "further", "contributed", "to", "impaired", "immunity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "propose", "V", "gamma", "9V", "delta", "2", "T", "cells", "show", "a", "strong", "potential", "to", "serve", "as", "harbingers", "of", "possible", "adverse", "immune", "effects", "of", "n", "-", "BP", "therapy", ",", "particularly", "in", "those", "patients", "already", "having", "a", "compromised", "immune", "system", "as", "they", "may", "be", "most", "vulnerable", "to", "the", "development", "of", "conditions", "such", "as", "BAONJ", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "role", "of", "adipokines", "in", "beta", "-", "cell", "failure", "of", "type", "2", "diabetes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "beta", "-", "Cell", "failure", "coupled", "with", "insulin", "resistance", "is", "a", "key", "factor", "in", "the", "development", "of", "type", "2", "diabetes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Changes", "in", "circulating", "levels", "of", "adipokines", ",", "factors", "released", "from", "adipose", "tissue", ",", "form", "a", "significant", "link", "between", "excessive", "adiposity", "in", "obesity", "and", "both", "aforementioned", "factors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "review", ",", "we", "consider", "the", "published", "evidence", "for", "the", "role", "of", "individual", "adipokines", "on", "the", "function", ",", "proliferation", ",", "death", "and", "failure", "of", "beta", "-", "cells", ",", "focusing", "on", "those", "reported", "to", "have", "the", "most", "significant", "effects", "(", "leptin", ",", "adiponectin", ",", "tumour", "necrosis", "factor", "alpha", ",", "resistin", ",", "visfatin", ",", "dipeptidyl", "peptidase", "IV", "and", "apelin", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "It", "is", "apparent", "that", "some", "adipokines", "have", "beneficial", "effects", "whereas", "others", "have", "detrimental", "properties", ";", "the", "overall", "contribution", "to", "beta", "-", "cell", "failure", "of", "changed", "concentrations", "of", "adipokines", "in", "the", "blood", "of", "obese", "pre", "-", "diabetic", "subjects", "will", "be", "highly", "dependent", "on", "the", "balance", "between", "these", "effects", "and", "the", "interactions", "between", "the", "adipokines", ",", "which", "act", "on", "the", "beta", "-", "cell", "via", "a", "number", "of", "intersecting", "intracellular", "signalling", "pathways", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "emphasise", "the", "importance", ",", "and", "comparative", "dearth", ",", "of", "studies", "into", "the", "combined", "effects", "of", "adipokines", "on", "beta", "-", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Genetic", "correlate", "of", "cognitive", "training", "response", "in", "schizophrenia", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Intensive", "computerized", "auditory", "training", "results", "in", "improved", "cognition", "for", "schizophrenia", "patients", ",", "but", "participants", "show", "variation", "in", "their", "cognitive", "gains", "and", "the", "biological", "factors", "that", "affect", "the", "response", "to", "training", "are", "unknown", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Single", "nucleotide", "polymorphisms", "(", "SNPs", ")", "in", "the", "catechol", "-", "O", "-", "methyltransferase", "(", "COMT", ")", "gene", "have", "been", "related", "to", "cognitive", "function", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", "we", "asked", "if", "functional", "variation", "in", "this", "gene", "has", "an", "impact", "on", "the", "response", "of", "schizophrenia", "patients", "to", "cognitive", "training", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "genotyped", "48", "schizophrenia", "patients", "who", "completed", "50", "h", "of", "computerized", "cognitive", "training", "and", "analyzed", "the", "association", "between", "DNA", "variants", "in", "the", "COMT", "gene", "and", "the", "improvement", "in", "global", "cognition", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Although", "conventional", "analyses", "did", "not", "reveal", "any", "significant", "associations", ",", "a", "set", "-", "based", "analysis", "examining", "the", "aggregate", "effect", "of", "common", "variation", "in", "the", "COMT", "gene", "(", "42", "SNPs", ")", "suggested", "association", "with", "improvement", "in", "global", "cognition", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Eight", "SNPs", ",", "mostly", "located", "in", "the", "3", "'", "end", "of", "the", "COMT", "gene", ",", "were", "nominally", "associated", "with", "improvement", "in", "cognition", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "data", "suggest", "that", "genotype", "influences", "the", "response", "to", "intensive", "cognitive", "training", "in", "schizophrenia", ",", "and", "may", "indicate", "that", "cognitive", "training", "regimens", "need", "to", "be", "personalized", "to", "the", "underlying", "biosignatures", "of", "each", "individual", "patient", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "article", "is", "part", "of", "a", "Special", "Issue", "entitled", "'", "Cognitive", "Enhancers", "'", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Hepatic", "ATGL", "knockdown", "uncouples", "glucose", "intolerance", "from", "liver", "TAG", "accumulation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Adipose", "triglyceride", "lipase", "(", "ATGL", ")", "is", "the", "predominant", "triacylglycerol", "(", "TAG", ")", "hydrolase", "in", "mammals", ";", "however", ",", "the", "tissue", "-", "specific", "effects", "of", "ATGL", "outside", "of", "adipose", "tissue", "have", "not", "been", "well", "characterized", "." ]

[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Hence", ",", "we", "tested", "the", "contribution", "of", "hepatic", "ATGL", "on", "mediating", "glucose", "tolerance", "and", "insulin", "action", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Glucose", "or", "insulin", "tolerance", "tests", "and", "insulin", "signaling", "were", "performed", "in", "C57BL", "/", "6", "mice", "administered", "control", "(", "nongene", "specific", "shRNA", ")", "or", "Atgl", "shRNA", "adenoviruses", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Glucose", "and", "lipid", "metabolism", "assays", "were", "conducted", "in", "primary", "hepatocytes", "isolated", "from", "mice", "transduced", "with", "control", "or", "Atgl", "shRNA", "adenoviruses", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Knocking", "down", "hepatic", "ATGL", "completely", "abrogated", "the", "increase", "in", "serum", "insulin", "following", "either", "1", "or", "12", "wk", "of", "feeding", "a", "high", "-", "fat", "(", "HF", ")", "diet", "despite", "higher", "hepatic", "TAG", "content", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "Glucose", "tolerance", "tests", "demonstrated", "that", "ATGL", "knockdown", "normalized", "glucose", "tolerance", "in", "HF", "-", "diet", "-", "fed", "mice", "." ]

[ "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "observed", "improvements", "in", "glucose", "tolerance", "were", "present", "despite", "unaltered", "hepatic", "insulin", "signaling", "and", "increased", "liver", "TAG", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]

[ "Mice", "with", "suppressed", "hepatic", "ATGL", "had", "reduced", "hepatic", "glucose", "production", "in", "vivo", ",", "and", "hepatocytes", "isolated", "from", "Atgl", "shRNA", "-", "treated", "mice", "displayed", "a", "26", "%", "decrease", "in", "glucose", "production", "and", "a", "38", "%", "increase", "in", "glucose", "oxidation", "compared", "to", "control", "cells", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Taken", "together", ",", "these", "data", "suggest", "that", "hepatic", "ATGL", "knockdown", "enhances", "glucose", "tolerance", "by", "increasing", "hepatic", "glucose", "utilization", "and", "uncouples", "impairments", "in", "insulin", "action", "from", "hepatic", "TAG", "accumulation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "Inference", "on", "population", "histories", "by", "approximating", "infinite", "alleles", "diffusion", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Reconstruction", "of", "the", "past", "is", "an", "important", "task", "of", "evolutionary", "biology", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "It", "takes", "place", "at", "different", "points", "in", "a", "hierarchy", "of", "molecular", "variation", ",", "including", "genes", ",", "individuals", ",", "populations", ",", "and", "species", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Statistical", "inference", "about", "population", "histories", "has", "recently", "received", "considerable", "attention", ",", "following", "the", "development", "of", "computational", "tools", "to", "provide", "tractable", "approaches", "to", "this", "very", "challenging", "problem", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", ",", "we", "introduce", "a", "likelihood", "-", "based", "approach", "which", "generalizes", "a", "recently", "developed", "model", "for", "random", "fluctuations", "in", "allele", "frequencies", "based", "on", "an", "approximation", "to", "the", "neutral", "Wright", "-", "Fisher", "diffusion", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "new", "framework", "approximates", "the", "infinite", "alleles", "Wright", "-", "Fisher", "model", "and", "uses", "an", "implementation", "with", "an", "adaptive", "Markov", "chain", "Monte", "Carlo", "algorithm", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "method", "is", "especially", "well", "suited", "to", "data", "sets", "harboring", "large", "population", "samples", "and", "relatively", "few", "loci", "for", "which", "other", "likelihood", "-", "based", "models", "are", "currently", "computationally", "intractable", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Using", "our", "model", ",", "we", "reconstruct", "the", "global", "population", "history", "of", "a", "major", "human", "pathogen", ",", "Streptococcus", "pneumoniae", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "results", "illustrate", "the", "potential", "to", "reach", "important", "biological", "insights", "to", "an", "evolutionary", "process", "by", "a", "population", "genetics", "approach", ",", "which", "can", "appropriately", "accommodate", "very", "large", "population", "samples", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Crosslinked", "linear", "polyethylenimine", "enhances", "delivery", "of", "DNA", "to", "the", "cytoplasm", "." ]

[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Crosslinked", "polyethylenimines", "(", "PEIs", ")", "have", "been", "frequently", "examined", "over", "the", "past", "decade", "since", "they", "can", "maintain", "the", "transfection", "efficiency", "of", "commercially", "available", ",", "25k", "branched", "PEI", ",", "but", "exhibit", "less", "cytotoxicity", "." ]

[ "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "argument", "is", "often", "made", "that", "the", "degradability", "of", "such", "polymers", ",", "generally", "synthesized", "with", "either", "disulfide", "or", "hydrolytically", "degradable", "crosslinkers", ",", "is", "critical", "to", "the", "high", "efficiency", "and", "low", "toxicity", "of", "the", "system", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "work", ",", "we", "present", "a", "crosslinked", "linear", "PEI", "(", "xLPEI", ")", "system", "in", "which", "either", "disulfide", "-", "responsive", "or", "non", "-", "degradable", "linkages", "are", "incorporated", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "As", "with", "previous", "systems", ",", "strong", "transfection", "efficiency", "in", "comparison", "with", "commercial", "standards", "was", "achieved", "with", "low", "cytotoxicity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "these", "properties", "were", "shown", "to", "be", "present", "when", "either", "the", "degradable", "or", "non", "-", "degradable", "crosslinker", "was", "used", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Uncomplexed", "polymer", "was", "demonstrated", "to", "be", "the", "critical", "factor", "determining", "transfection", "efficiency", "for", "these", "polymers", ",", "mediating", "efficient", "endosomal", "escape", "without", "signs", "of", "cell", "membrane", "damage", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "While", "several", "crosslinked", "PEI", "systems", "in", "the", "literature", "have", "demonstrated", "the", "effect", "of", "the", "disulfide", "moiety", ",", "this", "work", "demonstrates", "that", "disulfide", "-", "mediated", "unpackaging", "may", "not", "be", "as", "important", "as", "conventionally", "thought", "for", "some", "PEI", "systems", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "Molecular", "phylogeny", "of", "North", "American", "Branchiobdellida", "(", "Annelida", ":", "Clitellata", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Branchiobdellidans", ",", "or", "crayfish", "worms", ",", "are", "ectosymbiotic", "clitellate", "annelids", "associated", "primarily", "with", "freshwater", "crayfishes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "main", "objectives", "of", "our", "study", "were", "to", "infer", "a", "molecular", "phylogeny", "for", "the", "North", "American", "Branchiobdellida", ",", "examine", "its", "congruence", "with", "morphology", "-", "based", "hypotheses", "of", "relationships", "at", "the", "subfamily", "and", "genus", "level", ",", "and", "use", "our", "dataset", "to", "assess", "consistency", "of", "GenBank", "-", "archived", "branchiobdellidan", "sequences", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "used", "nucleotide", "sequence", "data", "from", "two", "mtDNA", "genes", "(", "COI", "and", "16S", "rDNA", ")", "and", "three", "nuclear", "genes", "(", "28S", "rDNA", ",", "18S", "rDNA", ",", "and", "ITS1", ")", "to", "estimate", "phylogenetic", "relationships", "among", "47", "described", "and", "one", "undescribed", "species", "of", "Branchiobdellida", "." ]

[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "recovered", "a", "monophyletic", "branchiobdellidan", "clade", "with", "generally", "short", "branch", "lengths", ",", "suggesting", "that", "a", "large", "portion", "of", "the", "taxon", "has", "likely", "undergone", "a", "recent", "and", "rapid", "radiation", "in", "North", "America", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Results", "from", "our", "phylogenetic", "analyses", "indicate", "that", "current", "taxonomic", "groupings", "are", "largely", "unsupported", "by", "the", "molecular", "data", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]