tokens
listlengths 2
298
| ner_tags
listlengths 2
298
|
---|---|
[
"A",
"myomectomy",
"respecting",
"the",
"pseudocapsule",
"neurofibers",
"should",
"facilitate",
"smooth",
"muscle",
"scarring",
"and",
"promote",
"restoration",
"of",
"normal",
"uterine",
"peristalsis",
"with",
"a",
"possible",
"positive",
"influence",
"on",
"fertility",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Increased",
"expression",
"of",
"transthyretin",
"in",
"leptin",
"-",
"deficient",
"ob",
"/",
"ob",
"mice",
"is",
"not",
"causative",
"for",
"their",
"major",
"phenotypic",
"abnormalities",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"hormone",
"leptin",
"is",
"a",
"critical",
"regulator",
"of",
"adipogenesis",
"and",
"energy",
"metabolism",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Similarly",
",",
"leptin",
"-",
"deficient",
"ob",
"/",
"ob",
"mice",
"display",
"various",
"metabolic",
"abnormalities",
",",
"including",
"not",
"only",
"obesity",
"and",
"insulin",
"resistance",
",",
"but",
"also",
"hypogonadism",
"and",
"high",
"bone",
"mass",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"By",
"genome",
"-",
"wide",
"expression",
"analysis",
"using",
"hypothalamus",
"RNA",
"from",
"wild",
"-",
"type",
"and",
"ob",
"/",
"ob",
"mice",
",",
"we",
"observed",
"the",
"increased",
"expression",
"of",
"the",
"gene",
"for",
"transthyretin",
"(",
"Ttr",
")",
"in",
"the",
"latter",
",",
"as",
"confirmed",
"by",
"quantitative",
"real",
"-",
"time",
"-",
"polymerase",
"chain",
"reaction",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Because",
"Ttr",
"encodes",
"a",
"carrier",
"protein",
"for",
"retinol",
"transport",
",",
"and",
"because",
"we",
"further",
"found",
"increased",
"retinol",
"levels",
"in",
"the",
"serum",
"of",
"ob",
"/",
"ob",
"mice",
",",
"we",
"investigated",
"whether",
"the",
"additional",
"absence",
"of",
"Ttr",
"would",
"influence",
"the",
"ob",
"/",
"ob",
"phenotype",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"It",
"was",
"found",
"that",
"Ttr",
"-",
"deficient",
"ob",
"/",
"ob",
"mice",
"were",
"indistinguishable",
"from",
"ob",
"/",
"ob",
"littermates",
"in",
"terms",
"of",
"body",
"weight",
",",
"as",
"well",
"as",
"serum",
"glucose",
",",
"insulin",
"and",
"cholesterol",
"levels",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O"
] |
[
"Although",
"all",
"of",
"these",
"parameters",
"were",
"identical",
"to",
"wild",
"-",
"type",
"controls",
"in",
"Ttr",
"-",
"deficient",
"mice",
",",
"we",
"found",
"that",
"the",
"sole",
"deletion",
"of",
"Ttr",
"caused",
"a",
"significant",
"increase",
"of",
"trabecular",
"bone",
"mass",
",",
"bone",
"marrow",
"adiposity",
"and",
"mean",
"adipocyte",
"area",
"in",
"white",
"adipose",
"tissue",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Interestingly",
",",
"all",
"these",
"latter",
"parameters",
"were",
"highest",
"in",
"Ttr",
"-",
"deficient",
"ob",
"/",
"ob",
"mice",
",",
"and",
"only",
"in",
"these",
"mice",
"did",
"we",
"observe",
"a",
"full",
"penetrance",
"of",
"liver",
"steatosis",
"at",
"24",
"weeks",
"of",
"age",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Taken",
"together",
",",
"our",
"data",
"demonstrate",
"that",
"the",
"increased",
"expression",
"of",
"Ttr",
"in",
"ob",
"/",
"ob",
"mice",
"does",
"not",
"cause",
"(",
"but",
"rather",
"attenuates",
")",
"their",
"phenotypic",
"abnormalities",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Effects",
"of",
"fenofibrate",
",",
"a",
"PPAR",
"-",
"alpha",
"ligand",
",",
"on",
"the",
"haemodynamics",
"of",
"glycerol",
"-",
"induced",
"renal",
"failure",
"in",
"rats",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"modulating",
"effect",
"of",
"peroxisome",
"proliferator",
"-",
"activated",
"receptor",
"alpha",
"ligand",
"on",
"haemodynamic",
"effects",
"of",
"phenylepherine",
"(",
"PE",
")",
",",
"angiotensin",
"II",
"(",
"AII",
")",
",",
"endothelin",
"1",
"(",
"ET1",
")",
",",
"acetylcholine",
"(",
"Ach",
")",
",",
"sodium",
"nitroprusside",
"(",
"SNP",
")",
"and",
"isoproterenol",
"(",
"ISO",
")",
"were",
"evaluated",
"in",
"glycerol",
"-",
"induced",
"acute",
"kidney",
"injury",
"in",
"rats",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"effect",
"of",
"PE",
"on",
"fenofibrate",
"-",
"treated",
"animals",
"was",
"a",
"dose",
"-",
"dependent",
"increase",
"in",
"mean",
"arterial",
"blood",
"pressure",
"(",
"MAP",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"For",
"AII",
"and",
"ET1",
",",
"MAP",
"was",
"also",
"increased",
"for",
"the",
"fenofibrate",
"group",
"but",
"not",
"in",
"a",
"dose",
"-",
"dependent",
"fashion",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"On",
"the",
"medullary",
"blood",
"flow",
"(",
"MBF",
")",
",",
"while",
"the",
"lower",
"doses",
"of",
"PE",
"and",
"AII",
"increased",
"the",
"perfusion",
"unit",
"on",
"the",
"fenofibrate",
"-",
"treated",
"group",
",",
"the",
"higher",
"doses",
"decreased",
"the",
"perfusion",
"unit",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"ET1",
"increased",
"the",
"perfusion",
"unit",
"on",
"this",
"group",
"but",
"not",
"in",
"dose",
"-",
"dependent",
"fashion",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"effects",
"of",
"PE",
"and",
"AII",
"on",
"the",
"cortical",
"blood",
"flow",
"(",
"CBF",
")",
"of",
"fenofibrate",
"-",
"treated",
"group",
"is",
"similar",
"to",
"that",
"of",
"MBF",
"for",
"the",
"same",
"group",
"but",
"not",
"for",
"ET1",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"effect",
"of",
"Ach",
",",
"SNP",
"and",
"ISO",
"in",
"all",
"the",
"groups",
"was",
"the",
"decrease",
"in",
"MAP",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"ISO",
"caused",
"dose",
"-",
"dependent",
"increase",
"in",
"MBF",
"of",
"fenofibrate",
"-",
"treated",
"group",
"."
] |
[
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"effect",
"of",
"Ach",
",",
"SNP",
"and",
"ISO",
"on",
"the",
"CBF",
"perfusion",
"unit",
"was",
"that",
"of",
"the",
"increase",
"for",
"the",
"fenofibrate",
"-",
"treated",
"group",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"study",
"showed",
"that",
"fenofibrate",
"did",
"not",
"attenuate",
"increased",
"blood",
"pressure",
"induced",
"by",
"PE",
",",
"AII",
"and",
"ET1",
"but",
"caused",
"enhanced",
"vasodilation",
"by",
"Ach",
",",
"SNP",
"and",
"ISO",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O"
] |
[
"Incretin",
"and",
"pancreatic",
"hormone",
"secretion",
"in",
"Caucasian",
"non",
"-",
"diabetic",
"carriers",
"of",
"the",
"TCF7L2",
"rs7903146",
"risk",
"T",
"allele",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"characterised",
"62",
"non",
"-",
"diabetic",
",",
"middle",
"-",
"aged",
",",
"Caucasians",
"with",
"and",
"without",
"the",
"T",
"risk",
"allele",
"of",
"rs7903146",
"in",
"transcription",
"factor",
"7",
"-",
"like",
"2",
"(",
"TCF7L2",
")",
"with",
"regard",
"to",
"secretion",
"of",
"insulin",
",",
"glucagon",
",",
"glucose",
"-",
"dependent",
"insulinotropic",
"polypeptide",
"(",
"GIP",
")",
",",
"glucagon",
"-",
"like",
"peptide",
"-",
"1",
"(",
"GLP",
"-",
"1",
")",
"as",
"well",
"as",
"insulin",
"sensitivity",
"and",
"endogenous",
"glucose",
"production",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O"
] |
[
"All",
"participants",
"had",
"a",
"3",
"-",
"h",
"oral",
"glucose",
"tolerance",
"test",
"(",
"OGTT",
")",
",",
"an",
"intravenous",
"glucose",
"tolerance",
"test",
"and",
"a",
"euglycaemic",
",",
"hyperinsulinaemic",
"clamp",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"After",
"adjustment",
"for",
"age",
"and",
"sex",
",",
"risk",
"T",
"allele",
"carriers",
"had",
"higher",
"haemoglobin",
"A1c",
"levels",
"(",
"p",
"=",
"0",
".",
"030",
")",
",",
"reduced",
"first",
"-",
"phase",
"insulin",
"response",
"(",
"p",
"=",
"0",
".",
"048",
")",
",",
"higher",
"peripheral",
"insulin",
"sensitivity",
"(",
"p",
"=",
"0",
".",
"050",
")",
"and",
"lower",
"fasting",
"GIP",
"concentrations",
"(",
"p",
"=",
"0",
".",
"003",
")",
"than",
"CC",
"allele",
"carriers",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"latter",
"was",
"also",
"reflected",
"by",
"lower",
"total",
"GIP",
"secretion",
"during",
"the",
"OGTT",
"(",
"p",
"=",
"0",
".",
"018",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"found",
"no",
"significant",
"differences",
"in",
"endogenous",
"glucose",
"production",
",",
"hepatic",
"insulin",
"sensitivity",
"or",
"fasting",
"concentrations",
"of",
"glucose",
",",
"insulin",
",",
"glucagon",
"and",
"GLP",
"-",
"1",
"between",
"the",
"groups",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"findings",
"suggest",
"that",
"the",
"effect",
"of",
"TCF7L2",
"on",
"diabetes",
"risk",
"may",
"include",
"reduced",
"secretion",
"of",
"GIP",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Aurora",
"A",
"kinase",
"(",
"AURKA",
")",
"in",
"normal",
"and",
"pathological",
"cell",
"division",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Temporally",
"and",
"spatially",
"controlled",
"activation",
"of",
"the",
"Aurora",
"A",
"kinase",
"(",
"AURKA",
")",
"regulates",
"centrosome",
"maturation",
",",
"entry",
"into",
"mitosis",
",",
"formation",
"and",
"function",
"of",
"the",
"bipolar",
"spindle",
",",
"and",
"cytokinesis",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Genetic",
"amplification",
"and",
"mRNA",
"and",
"protein",
"overexpression",
"of",
"Aurora",
"A",
"are",
"common",
"in",
"many",
"types",
"of",
"solid",
"tumor",
",",
"and",
"associated",
"with",
"aneuploidy",
",",
"supernumerary",
"centrosomes",
",",
"defective",
"mitotic",
"spindles",
",",
"and",
"resistance",
"to",
"apoptosis",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"properties",
"have",
"led",
"Aurora",
"A",
"to",
"be",
"considered",
"a",
"high",
"-",
"value",
"target",
"for",
"development",
"of",
"cancer",
"therapeutics",
",",
"with",
"multiple",
"agents",
"currently",
"in",
"early",
"-",
"phase",
"clinical",
"trials",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"More",
"recently",
",",
"identification",
"of",
"additional",
",",
"non",
"-",
"mitotic",
"functions",
"and",
"means",
"of",
"activation",
"of",
"Aurora",
"A",
"during",
"interphase",
"neurite",
"elongation",
"and",
"ciliary",
"resorption",
"have",
"significantly",
"expanded",
"our",
"understanding",
"of",
"its",
"function",
",",
"and",
"may",
"offer",
"insights",
"into",
"the",
"clinical",
"performance",
"of",
"Aurora",
"A",
"inhibitors",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Here",
"we",
"review",
"the",
"mitotic",
"and",
"non",
"-",
"mitotic",
"functions",
"of",
"Aurora",
"A",
",",
"discuss",
"Aurora",
"A",
"regulation",
"in",
"the",
"context",
"of",
"protein",
"structural",
"information",
",",
"and",
"evaluate",
"progress",
"in",
"understanding",
"and",
"inhibiting",
"Aurora",
"A",
"in",
"cancer",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"R740S",
"mutation",
"in",
"the",
"V",
"-",
"ATPase",
"a3",
"subunit",
"increases",
"lysosomal",
"pH",
",",
"impairs",
"NFATc1",
"translocation",
",",
"and",
"decreases",
"in",
"vitro",
"osteoclastogenesis",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Vacuolar",
"H",
"(",
"+",
")",
"-",
"ATPase",
"(",
"V",
"-",
"ATPase",
")",
",",
"a",
"multisubunit",
"enzyme",
"located",
"at",
"the",
"ruffled",
"border",
"and",
"in",
"lysosomes",
"of",
"osteoclasts",
",",
"is",
"necessary",
"for",
"bone",
"resorption",
"."
] |
[
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"previously",
"showed",
"that",
"heterozygous",
"mice",
"with",
"an",
"R740S",
"mutation",
"in",
"the",
"a3",
"subunit",
"of",
"V",
"-",
"ATPase",
"(",
"+",
"/",
"R740S",
")",
"have",
"mild",
"osteopetrosis",
"resulting",
"from",
"an",
"~",
"90",
"%",
"reduction",
"in",
"proton",
"translocation",
"across",
"osteoclast",
"membranes",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Here",
"we",
"show",
"that",
"lysosomal",
"pH",
"is",
"also",
"higher",
"in",
"+",
"/",
"R740S",
"compared",
"with",
"wild",
"-",
"type",
"(",
"+",
"/",
"+",
")",
"osteoclasts",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Both",
"osteoclast",
"number",
"and",
"size",
"were",
"decreased",
"in",
"cultures",
"of",
"+",
"/",
"R740S",
"compared",
"with",
"+",
"/",
"+",
"bone",
"marrow",
"cells",
",",
"with",
"concomitant",
"decreased",
"expression",
"of",
"key",
"osteoclast",
"markers",
"(",
"TRAP",
",",
"cathepsin",
"K",
",",
"OSCAR",
",",
"DC",
"-",
"STAMP",
",",
"and",
"NFATc1",
")",
",",
"suggesting",
"that",
"low",
"lysosomal",
"pH",
"plays",
"an",
"important",
"role",
"in",
"osteoclastogenesis",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"To",
"elucidate",
"the",
"molecular",
"mechanism",
"of",
"this",
"inhibition",
",",
"NFATc1",
"activation",
"was",
"assessed",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"NFATc1",
"nuclear",
"translocation",
"was",
"significantly",
"reduced",
"in",
"+",
"/",
"R740S",
"compared",
"with",
"+",
"/",
"+",
"cells",
";",
"however",
",",
"this",
"was",
"not",
"because",
"of",
"impaired",
"enzymatic",
"activity",
"of",
"calcineurin",
",",
"the",
"phosphatase",
"responsible",
"for",
"NFATc1",
"dephosphorylation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Protein",
"and",
"RNA",
"expression",
"levels",
"of",
"regulator",
"of",
"calcineurin",
"1",
"(",
"RCAN1",
")",
",",
"an",
"endogenous",
"inhibitor",
"of",
"NFATc1",
"activation",
"and",
"a",
"protein",
"degraded",
"in",
"lysosomes",
",",
"were",
"not",
"significantly",
"different",
"between",
"+",
"/",
"R740S",
"and",
"+",
"/",
"+",
"osteoclasts",
",",
"but",
"the",
"RCAN1",
"/",
"NFATc1",
"ratio",
"was",
"significantly",
"higher",
"in",
"+",
"/",
"R740S",
"versus",
"+",
"/",
"+",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"lysosomal",
"inhibitor",
"chloroquine",
"significantly",
"increased",
"RCAN1",
"accumulation",
"in",
"+",
"/",
"+",
"cells",
",",
"consistent",
"with",
"the",
"hypothesis",
"that",
"higher",
"lysosomal",
"pH",
"impairs",
"RCAN1",
"degradation",
",",
"leading",
"to",
"a",
"higher",
"RCAN1",
"/",
"NFATc1",
"ratio",
"and",
"consequently",
"NFATc1",
"inhibition",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Our",
"data",
"indicate",
"that",
"increased",
"lysosomal",
"pH",
"in",
"osteoclasts",
"leads",
"to",
"decreased",
"NFATc1",
"signaling",
"and",
"nuclear",
"translocation",
",",
"resulting",
"in",
"a",
"cell",
"autonomous",
"impairment",
"of",
"osteoclastogenesis",
"in",
"vitro",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Metabolic",
"profiling",
"of",
"TRPV1",
"antagonists",
"of",
"the",
"benzothiazole",
"amide",
"series",
":",
"implications",
"for",
"in",
"vitro",
"genotoxicity",
"assessment",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"vitro",
"metabolic",
"profiling",
"and",
"in",
"vitro",
"genotoxicity",
"assessment",
"are",
"important",
"aspects",
"of",
"the",
"drug",
"discovery",
"program",
"as",
"they",
"eliminate",
"harmful",
"compounds",
"from",
"further",
"development",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"standard",
"in",
"vitro",
"genotoxicity",
"testing",
",",
"induced",
"rat",
"liver",
"S9",
"is",
"used",
"as",
"an",
"exogenous",
"bio",
"-",
"activation",
"system",
"for",
"detecting",
"promutagens",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"this",
"study",
"we",
"show",
"that",
"rat",
"liver",
"S9",
"is",
"an",
"insufficient",
"system",
"regarding",
"the",
"conversion",
"of",
"TRPV1",
"antagonists",
"of",
"the",
"benzothiazole",
"amide",
"series",
"into",
"relevant",
"in",
"vivo",
"metabolites",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Human",
"and",
"rat",
"hepatocyte",
"experiments",
"demonstrated",
"generation",
"of",
"an",
"aryl",
"amine",
"metabolite",
"that",
"was",
"subsequently",
"N",
"-",
"acetylated",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"hydrolyzed",
"metabolites",
"as",
"well",
"as",
"the",
"parent",
"compound",
"were",
"also",
"metabolized",
"into",
"glutathione",
"(",
"GSH",
")",
"conjugates",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Rat",
"liver",
"S9",
"exhibited",
"a",
"very",
"low",
"amide",
"hydrolysis",
"capacity",
"and",
"no",
"formation",
"of",
"GSH",
"conjugates",
"when",
"supplemented",
"with",
"NADPH",
"and",
"GSH",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O"
] |
[
"The",
"discrepancy",
"in",
"metabolic",
"capability",
"between",
"hepatocytes",
"and",
"rat",
"liver",
"S9",
"led",
"to",
"confounding",
"results",
"in",
"in",
"vitro",
"genotoxicity",
"assessment",
"for",
"this",
"chemical",
"class",
"as",
"judged",
"by",
"the",
"results",
"of",
"Ames",
"test",
",",
"mouse",
"lymphoma",
"assay",
",",
"SOS",
"/",
"umu",
"test",
"and",
"Comet",
"assay",
"in",
"rat",
"hepatocytes",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"study",
"highlights",
"the",
"pivotal",
"role",
"that",
"understanding",
"the",
"mechanism",
"of",
"metabolite",
"formation",
"has",
"in",
"interpreting",
"as",
"well",
"as",
"designing",
"reliable",
"and",
"relevant",
"in",
"vitro",
"genotoxicity",
"experiments",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"CDKL5",
"disorder",
"is",
"an",
"independent",
"clinical",
"entity",
"associated",
"with",
"early",
"-",
"onset",
"encephalopathy",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"clinical",
"understanding",
"of",
"the",
"CDKL5",
"disorder",
"remains",
"limited",
",",
"with",
"most",
"information",
"being",
"derived",
"from",
"small",
"patient",
"groups",
"seen",
"at",
"individual",
"centres",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"study",
"uses",
"a",
"large",
"international",
"data",
"collection",
"to",
"describe",
"the",
"clinical",
"profile",
"of",
"the",
"CDKL5",
"disorder",
"and",
"compare",
"with",
"Rett",
"syndrome",
"(",
"RTT",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Information",
"on",
"individuals",
"with",
"cyclin",
"-",
"dependent",
"kinase",
"-",
"like",
"5",
"(",
"CDKL5",
")",
"mutations",
"(",
"n",
"=",
"86",
")",
"and",
"females",
"with",
"MECP2",
"mutations",
"(",
"n",
"=",
"920",
")",
"was",
"sourced",
"from",
"the",
"InterRett",
"database",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Available",
"photographs",
"of",
"CDKL5",
"patients",
"were",
"examined",
"for",
"dysmorphic",
"features",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"proportion",
"of",
"CDKL5",
"patients",
"meeting",
"the",
"recent",
"Neul",
"criteria",
"for",
"atypical",
"RTT",
"was",
"determined",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Logistic",
"regression",
"and",
"time",
"-",
"to",
"-",
"event",
"analyses",
"were",
"used",
"to",
"compare",
"the",
"occurrence",
"of",
"Rett",
"-",
"like",
"features",
"in",
"those",
"with",
"MECP2",
"and",
"CDKL5",
"mutations",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Most",
"individuals",
"with",
"CDKL5",
"mutations",
"had",
"severe",
"developmental",
"delay",
"from",
"birth",
",",
"seizure",
"onset",
"before",
"the",
"age",
"of",
"3",
"months",
"and",
"similar",
"non",
"-",
"dysmorphic",
"features",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Less",
"than",
"one",
"-",
"quarter",
"met",
"the",
"criteria",
"for",
"early",
"-",
"onset",
"seizure",
"variant",
"RTT",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Seizures",
"and",
"sleep",
"disturbances",
"were",
"more",
"common",
"than",
"in",
"those",
"with",
"MECP2",
"mutations",
"whereas",
"features",
"of",
"regression",
"and",
"spinal",
"curvature",
"were",
"less",
"common",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"CDKL5",
"disorder",
"presents",
"with",
"a",
"distinct",
"clinical",
"profile",
"and",
"a",
"subtle",
"facial",
",",
"limb",
"and",
"hand",
"phenotype",
"that",
"may",
"assist",
"in",
"differentiation",
"from",
"other",
"early",
"-",
"onset",
"encephalopathies",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Although",
"mutations",
"in",
"the",
"CDKL5",
"gene",
"have",
"been",
"described",
"in",
"association",
"with",
"the",
"early",
"-",
"onset",
"variant",
"of",
"RTT",
",",
"in",
"our",
"study",
"the",
"majority",
"did",
"not",
"meet",
"these",
"criteria",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Therefore",
",",
"the",
"CDKL5",
"disorder",
"should",
"be",
"considered",
"separate",
"to",
"RTT",
",",
"rather",
"than",
"another",
"variant",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"impact",
"of",
"FANCD2",
"deficiency",
"on",
"formaldehyde",
"-",
"induced",
"toxicity",
"in",
"human",
"lymphoblastoid",
"cell",
"lines",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Formaldehyde",
"(",
"FA",
")",
",",
"a",
"major",
"industrial",
"chemical",
"and",
"ubiquitous",
"environmental",
"pollutant",
",",
"has",
"recently",
"been",
"classified",
"by",
"the",
"International",
"Agency",
"for",
"Research",
"on",
"Cancer",
"as",
"a",
"human",
"leukemogen",
"."
] |
[
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"major",
"mode",
"of",
"action",
"of",
"FA",
"is",
"thought",
"to",
"be",
"the",
"formation",
"of",
"DNA",
"-",
"protein",
"cross",
"-",
"links",
"(",
"DPCs",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Repair",
"of",
"DPCs",
"may",
"be",
"mediated",
"by",
"the",
"Fanconi",
"anemia",
"pathway",
";",
"however",
",",
"data",
"supporting",
"the",
"involvement",
"of",
"this",
"pathway",
"are",
"limited",
",",
"particularly",
"in",
"human",
"hematopoietic",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Therefore",
",",
"we",
"assessed",
"the",
"role",
"of",
"FANCD2",
",",
"a",
"critical",
"component",
"of",
"the",
"Fanconi",
"anemia",
"pathway",
",",
"in",
"FA",
"-",
"induced",
"toxicity",
"in",
"human",
"lymphoblast",
"cell",
"models",
"of",
"FANCD2",
"deficiency",
"(",
"PD20",
"cells",
")",
"and",
"FANCD2",
"sufficiency",
"(",
"PD20",
"-",
"D2",
"cells",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"After",
"treatment",
"of",
"the",
"cells",
"with",
"0",
"-",
"150",
"mu",
"M",
"FA",
"for",
"24",
"h",
",",
"DPCs",
"were",
"increased",
"in",
"a",
"dose",
"-",
"dependent",
"manner",
"in",
"both",
"cell",
"lines",
",",
"with",
"greater",
"increases",
"in",
"FANCD2",
"-",
"deficient",
"PD20",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"FA",
"also",
"induced",
"cytotoxicity",
",",
"micronuclei",
",",
"chromosome",
"aberrations",
",",
"and",
"apoptosis",
"in",
"a",
"dose",
"-",
"dependent",
"manner",
"in",
"both",
"cell",
"lines",
",",
"with",
"greater",
"increases",
"in",
"cytotoxicity",
"and",
"apoptosis",
"in",
"PD20",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Increased",
"levels",
"of",
"gamma",
"-",
"ATR",
"and",
"gamma",
"-",
"H2AX",
"in",
"both",
"cell",
"lines",
"suggested",
"the",
"recognition",
"of",
"FA",
"-",
"induced",
"DNA",
"damage",
";",
"however",
",",
"the",
"induction",
"of",
"BRCA2",
"was",
"compromised",
"in",
"FANCD2",
"-",
"deficient",
"PD20",
"cells",
",",
"potentially",
"reducing",
"the",
"capacity",
"to",
"repair",
"DPCs",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Together",
",",
"these",
"findings",
"suggest",
"that",
"FANCD2",
"protein",
"and",
"the",
"Fanconi",
"anemia",
"pathway",
"are",
"essential",
"to",
"protect",
"human",
"lymphoblastoid",
"cells",
"against",
"FA",
"toxicity",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Future",
"studies",
"are",
"needed",
"to",
"delineate",
"the",
"role",
"of",
"this",
"pathway",
"in",
"mitigating",
"FA",
"-",
"induced",
"toxicity",
",",
"particularly",
"in",
"hematopoietic",
"stem",
"cells",
",",
"the",
"target",
"cells",
"in",
"leukemia",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"AKRs",
"expression",
"in",
"peripheral",
"blood",
"lymphocytes",
"from",
"smokers",
":",
"The",
"role",
"of",
"body",
"mass",
"index",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Aldo",
"-",
"keto",
"reductases",
"(",
"AKRs",
")",
"metabolize",
"a",
"wide",
"range",
"of",
"substrates",
",",
"including",
"polycyclic",
"aromatic",
"hydrocarbons",
"(",
"PAHs",
")",
",",
"generating",
"metabolites",
"(",
"o",
"-",
"quinones",
")",
"and",
"reactive",
"oxygen",
"species",
"(",
"ROS",
")",
",",
"which",
"are",
"capable",
"of",
"initiating",
"and",
"promoting",
"carcinogenesis",
"."
] |
[
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Exposure",
"to",
"PAHs",
",",
"their",
"metabolites",
",",
"and",
"ROS",
"further",
"increase",
"AKRs",
"isoform",
"expression",
"that",
"may",
"amplify",
"oxidative",
"damage",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Human",
"AKR",
"enzymes",
"are",
"highly",
"polymorphic",
",",
"and",
"allelic",
"variants",
"may",
"contribute",
"to",
"different",
"AKRs",
"expression",
"in",
"individuals",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Despite",
"the",
"importance",
"of",
"AKRs",
"in",
"PAHs",
"metabolism",
",",
"there",
"are",
"no",
"studies",
"that",
"evaluate",
",",
"in",
"general",
"human",
"populations",
",",
"the",
"effect",
"of",
"PAHs",
"on",
"AKRs",
"expression",
"in",
"peripheral",
"blood",
"lymphocytes",
"(",
"PBLs",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"aim",
"of",
"this",
"study",
"was",
"to",
"determine",
"the",
"effect",
"of",
"tobacco",
"smoke",
"exposure",
",",
"and",
"AKR1A1",
"*",
"2",
"and",
"AKR1C3",
"*",
"2",
"polymorphisms",
",",
"on",
"AKR1A1",
"and",
"AKR1C1",
"-",
"AKR1C3",
"messenger",
"RNA",
"(",
"mRNA",
")",
"levels",
"in",
"PBLs",
"from",
"smokers",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"the",
"smoker",
"group",
",",
"there",
"is",
"a",
"statistically",
"significant",
"positive",
"association",
"between",
"AKR1A1",
",",
"AKR1C1",
",",
"and",
"AKR1C3",
"mRNA",
"induction",
"and",
"urine",
"cotinine",
"levels",
"in",
"individuals",
"with",
"a",
"body",
"mass",
"index",
"(",
"BMI",
")",
"less",
"than",
"25",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"However",
",",
"AKR1A1",
"*",
"2",
"and",
"AKR1C3",
"*",
"2",
"alleles",
"did",
"not",
"influence",
"AKR1A1",
"and",
"AKR1C1",
"-",
"AKR1C3",
"mRNA",
"levels",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"results",
"suggest",
"that",
"AKRs",
"induction",
"by",
"PAHs",
"in",
"smokers",
"'",
"PBLs",
"is",
"associated",
"with",
"BMI",
";",
"therefore",
",",
"the",
"role",
"of",
"adipose",
"tissue",
"accumulation",
"in",
"PAHs",
"'",
"effects",
"needs",
"further",
"investigation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Novel",
"non",
"-",
"canonical",
"TGF",
"-",
"beta",
"signaling",
"networks",
":",
"emerging",
"roles",
"in",
"airway",
"smooth",
"muscle",
"phenotype",
"and",
"function",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"airway",
"smooth",
"muscle",
"(",
"ASM",
")",
"plays",
"an",
"important",
"role",
"in",
"the",
"pathophysiology",
"of",
"asthma",
"and",
"chronic",
"obstructive",
"pulmonary",
"disease",
"(",
"COPD",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"ASM",
"cells",
"express",
"a",
"wide",
"range",
"of",
"receptors",
"involved",
"in",
"contraction",
",",
"growth",
",",
"matrix",
"protein",
"production",
"and",
"the",
"secretion",
"of",
"cytokines",
"and",
"chemokines",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Transforming",
"growth",
"factor",
"beta",
"(",
"TGF",
"-",
"beta",
")",
"is",
"one",
"of",
"the",
"major",
"players",
"in",
"determining",
"the",
"structural",
"and",
"functional",
"abnormalities",
"of",
"the",
"ASM",
"in",
"asthma",
"and",
"COPD",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"It",
"is",
"increasingly",
"evident",
"that",
"TGF",
"-",
"beta",
"functions",
"as",
"a",
"master",
"switch",
",",
"controlling",
"a",
"network",
"of",
"intracellular",
"and",
"autocrine",
"signaling",
"loops",
"that",
"effect",
"ASM",
"phenotype",
"and",
"function",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"this",
"review",
",",
"the",
"various",
"elements",
"that",
"participate",
"in",
"non",
"-",
"canonical",
"TGF",
"-",
"beta",
"signaling",
",",
"including",
"MAPK",
",",
"PI3K",
",",
"WNT",
"/",
"beta",
"-",
"catenin",
",",
"and",
"Ca",
"(",
"2",
"+",
")",
",",
"are",
"discussed",
",",
"focusing",
"on",
"their",
"effect",
"on",
"ASM",
"phenotype",
"and",
"function",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"new",
"aspects",
"of",
"ASM",
"biology",
"and",
"their",
"possible",
"association",
"with",
"non",
"-",
"canonical",
"TGF",
"-",
"beta",
"signaling",
"will",
"be",
"discussed",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Nitrogen",
",",
"oxygen",
"or",
"sulfur",
"containing",
"heterocyclic",
"compounds",
"as",
"analgesic",
"drugs",
"used",
"as",
"modulators",
"of",
"the",
"nitroxidative",
"stress",
"."
] |
[
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Numerous",
"lines",
"of",
"evidence",
"suggest",
"that",
"heterocyclic",
"compounds",
"used",
"as",
"analgesic",
",",
"anti",
"-",
"inflammatory",
"and",
"anti",
"-",
"migraine",
"agents",
"can",
"be",
"potent",
"regulators",
"of",
"the",
"nitroxidative",
"stress",
"and",
"targeting",
"free",
"nitrogen",
"and",
"oxygen",
"radicals",
"is",
"a",
"very",
"promising",
"strategy",
"for",
"future",
"pain",
"management",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Both",
"classical",
"analgesics",
"(",
"nonsteroidal",
"anti",
"-",
"inflammatory",
"drugs",
",",
"opioid",
"drugs",
")",
"and",
"many",
"analgesic",
"adjuvants",
",",
"including",
"desipramine",
",",
"duloxetine",
",",
"fluoxetine",
",",
"paroxetine",
",",
"escitalopram",
",",
"phenytoin",
"or",
"carbamazepine",
"and",
"alpha",
"-",
"lipoic",
"acid",
"can",
"modulate",
"the",
"balance",
"between",
"pro",
"-",
"oxidant",
"and",
"antioxidant",
"processes",
"in",
"the",
"mammalian",
"tissues",
"and",
"these",
"properties",
"of",
"drugs",
"such",
"as",
"indomethacin",
",",
"meloxicam",
",",
"tenoxicam",
",",
"valdecoxib",
"or",
"some",
"metabolites",
"of",
"analgesic",
"drugs",
"formed",
"by",
"the",
"activity",
"of",
"tissue",
"peroxidases",
"may",
"contribute",
"to",
"their",
"clinical",
"efficacy",
"and",
"drug",
"-",
"related",
"toxic",
"effects",
",",
"including",
"gastrointestinal",
"ulcers",
",",
"hepatic",
"failure",
",",
"agranulocytosis",
",",
"aplastic",
"anemia",
",",
"neutropenia",
",",
"opiate",
"-",
"induced",
"hyperalgesia",
"and",
"tolerance",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"antioxidant",
"capacities",
"of",
"novel",
"heterocyclic",
"compounds",
",",
"including",
"the",
"compounds",
"acting",
"either",
"by",
"prevention",
"of",
"formation",
"or",
"catalyzed",
"decomposition",
"of",
"peroxynitrite",
"anion",
"(",
"ONOO",
"-",
")",
",",
"namely",
"the",
"peroxynitrite",
"decomposition",
"catalysts",
"or",
"as",
"superoxide",
"(",
"O2",
"*",
"-",
")",
"-",
"scavengers",
"which",
"are",
"the",
"functional",
"mimetics",
"of",
"superoxide",
"dismutase",
"(",
"SOD",
")",
"enzymes",
"(",
"SODm",
")",
",",
"as",
"well",
"as",
"the",
"derivatives",
"of",
"6",
"-",
"nitro",
"-",
"3",
",",
"4",
"-",
"methylenedioxyphenyl",
"-",
"Nacylhydrazone",
"(",
"LASSBio",
"-",
"881",
")",
"or",
"gamma",
"-",
"butyrolactone",
"(",
"LPP1",
",",
"BM113",
",",
"BM113A",
",",
"BM138",
"and",
"BM138A",
")",
"are",
"also",
"discussed",
"as",
"potent",
"and",
"promising",
"future",
"heterocyclic",
"analgesics",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"B-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"I-CHEMICAL",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Heat",
"shock",
"proteins",
"and",
"heat",
"shock",
"factor",
"1",
"in",
"carcinogenesis",
"and",
"tumor",
"development",
":",
"an",
"update",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Heat",
"shock",
"proteins",
"(",
"HSP",
")",
"are",
"a",
"subset",
"of",
"the",
"molecular",
"chaperones",
",",
"best",
"known",
"for",
"their",
"rapid",
"and",
"abundant",
"induction",
"by",
"stress",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"HSP",
"genes",
"are",
"activated",
"at",
"the",
"transcriptional",
"level",
"by",
"heat",
"shock",
"transcription",
"factor",
"1",
"(",
"HSF1",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"During",
"the",
"progression",
"of",
"many",
"types",
"of",
"cancer",
",",
"this",
"heat",
"shock",
"transcriptional",
"regulon",
"becomes",
"co",
"-",
"opted",
"by",
"mechanisms",
"that",
"are",
"currently",
"unclear",
",",
"although",
"evidently",
"triggered",
"in",
"the",
"emerging",
"tumor",
"cell",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.