tokens
listlengths 1
334
| ner_tags
listlengths 1
334
|
|---|---|
[
"Contingency",
"plans",
"can",
"be",
"created",
"using",
"comprehensive",
"national",
"and",
"more",
"detailed",
"population",
"and",
"infrastructure",
"data",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Should",
"disaster",
"strike",
",",
"the",
"affected",
"population",
"and",
"the",
"impact",
"on",
"critical",
"facilities",
"can",
"be",
"quickly",
"assessed",
",",
"although",
"efforts",
"frequently",
"need",
"to",
"be",
"expended",
"to",
"ensure",
"regional",
"and",
"local",
"databases",
"are",
"current",
"and",
"useful",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Case",
"Presentation"
] |
[
"O",
"O"
] |
[
"The",
"patient",
"is",
"an",
"80",
"year",
"old",
"male",
"with",
"diabetes",
"mellitus",
"and",
"hypertension",
",",
"who",
"at",
"age",
"74",
"(",
"March",
"2001",
")",
"had",
"received",
"a",
"living",
"non",
"-",
"related",
"donor",
"kidney",
"transplant",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O"
] |
[
"At",
"that",
"time",
"he",
"was",
"discharged",
"with",
"a",
"double",
"immunosuppressive",
"therapy",
"consisting",
"of",
"prednisone",
"20",
"mg",
"/",
"day",
"and",
"mophetil",
"mycophenolate",
"1",
".",
"5",
"gr",
"/",
"day",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"No",
"calcineurin",
"inhibitor",
"was",
"administered",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"His",
"prednisone",
"dose",
"was",
"further",
"decreased",
"to",
"5",
"mg",
"/",
"day",
"and",
"mophetil",
"mycophenolate",
"doses",
"sustained",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"November",
"2001",
"he",
"developed",
"cutaneous",
"purple",
"elevated",
"lesions",
"in",
"his",
"lower",
"limbs",
"that",
"were",
"diagnosed",
"as",
"KS",
"by",
"skin",
"biopsy",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O"
] |
[
"He",
"received",
"19",
"administrations",
"of",
"vincristine",
"(",
"1",
"mg",
")",
"and",
"bleomycin",
"(",
"15",
"mg",
")",
"weekly",
"that",
"resulted",
"in",
"flattening",
"and",
"fading",
"of",
"the",
"lesions",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O"
] |
[
"Treatment",
"was",
"discontinued",
"for",
"two",
"months",
",",
"and",
"KS",
"recurred",
",",
"with",
"pain",
"and",
"edema",
"in",
"both",
"legs",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O"
] |
[
"On",
"July",
"2002",
",",
"with",
"an",
"almost",
"100",
"%",
"involvement",
"of",
"his",
"lower",
"limbs",
"skin",
"with",
"KS",
"but",
"no",
"visceral",
"involvement",
"he",
"received",
"50",
"mg",
"of",
"liposomal",
"-",
"adriamycin",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"he",
"was",
"then",
"prescribed",
"valganciclovir",
"450",
"mg",
"BID",
"(",
"corrected",
"for",
"creatinine",
"clearance",
")",
"[",
"7",
"]",
"and",
"three",
"additional",
"administrations",
"of",
"liposomal",
"-",
"adriamycin",
",",
"up",
"to",
"December",
"2002",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"He",
"showed",
"40",
"%",
"response",
"again",
"with",
"early",
"relapse",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"On",
"January",
"2003",
"the",
"patient",
"developed",
"disseminated",
"herpes",
"zoster",
",",
"which",
"was",
"treated",
"with",
"IV",
"acyclovir",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"May",
"2003",
"KS",
"progression",
"was",
"observed",
"and",
"received",
"radiotherapy",
"with",
"no",
"benefit",
"Figure",
"1",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"August",
"2003",
"he",
"started",
"oral",
"etoposide",
"at",
"50",
"mg",
"QD",
"for",
"two",
"weeks",
"followed",
"by",
"two",
"weeks",
"off",
"until",
"May",
"2004",
"achieving",
"a",
"very",
"slow",
"50",
"%",
"response",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Tolerance",
"was",
"good",
"and",
"serum",
"creatinine",
"remain",
"stable",
"at",
"around",
"1",
",",
"4",
"mg",
"/",
"dl",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Mophetil",
"mycophenolate",
"dose",
"was",
"reduced",
"to",
"1",
"g",
"/",
"day",
"and",
"prednisone",
"to",
"2",
".",
"5",
"mg",
"/",
"day",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Figure",
"1"
] |
[
"O",
"O"
] |
[
"Kaposi",
"'",
"s",
"sarcoma",
"progressions",
"after",
"chemotherapy",
"withdrawal",
",",
"both",
"lower",
"limbs",
"were",
"completely",
"covered",
"with",
"Kaposi",
"'",
"s",
"Sarcoma",
"(",
"June",
"2003",
")",
"."
] |
[
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"On",
"May",
"2004",
"the",
"patient",
"requested",
"a",
"second",
"opinion",
"and",
"was",
"prescribed",
"Imatinib",
"200",
"mg",
"qd",
"for",
"two",
"weeks",
"followed",
"by",
"400",
"mg",
"qd",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"After",
"four",
"weeks",
"of",
"Imatinib",
",",
"his",
"health",
"deteriorated",
"rapidly",
",",
"he",
"developed",
"anasarca",
",",
"worsening",
"of",
"KS",
",",
"his",
"serum",
"creatinine",
"increased",
"from",
"1",
".",
"4",
"mg",
"/",
"dl",
"to",
"2",
".",
"3",
"mg",
"/",
"dl",
"and",
"he",
"developed",
"grade",
"4",
"granulocytopenia",
"(",
"Figure",
"2",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"patient",
"was",
"hospitalized",
"with",
"fever",
"and",
"was",
"started",
"on",
"IV",
"antibiotics",
"and",
"daily",
"G",
"-",
"CSF",
"for",
"four",
"days",
"after",
"which",
"his",
"WBC",
"count",
"normalized",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Two",
"weeks",
"later",
"the",
"creatinine",
"level",
"returned",
"to",
"1",
".",
"5",
"mg",
"/",
"dl",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"On",
"February",
"2005",
"he",
"was",
"started",
"on",
"30",
"mg",
"of",
"paclitaxel",
"IV",
"every",
"three",
"weeks",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"After",
"three",
"courses",
"with",
"no",
"clinical",
"benefit",
"he",
"developed",
"a",
"skin",
"rash",
"that",
"prompted",
"discontinuation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Figure",
"2"
] |
[
"O",
"O"
] |
[
"Patient",
"developed",
"anasarca",
"with",
"rapid",
"progression",
"of",
"Kaposi",
"'",
"s",
"Sarcoma",
"after",
"four",
"weeks",
"of",
"taking",
"Imatinib",
"(",
"June",
"2004",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"On",
"April",
"2005",
",",
"he",
"was",
"started",
"on",
"Sirolimus",
"2",
"mg",
"a",
"day",
",",
"and",
"after",
"8",
"weeks",
"escalated",
"to",
"4",
"mg",
"a",
"day",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Three",
"weeks",
"later",
"mophetil",
"mycophenolate",
"and",
"prednisone",
"were",
"discontinued",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Sustained",
"and",
"significant",
"KS",
"regression",
"was",
"evident",
"after",
"16",
"weeks",
",",
"but",
"he",
"developed",
"a",
"basal",
"cell",
"carcinoma",
"and",
"pneumonia",
"that",
"required",
"hospital",
"admission",
";",
"Sirolimus",
"dose",
"was",
"lowered",
"to",
"2",
"mg",
"a",
"day",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Thereafter",
"his",
"clinical",
"course",
"has",
"been",
"satisfactory",
"with",
"continuous",
"and",
"progressive",
"regression",
"of",
"KS",
"lesions",
"(",
"Figure",
"3",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"His",
"serum",
"creatinine",
"has",
"remained",
"under",
"1",
".",
"6",
"mg",
"/",
"dl",
"and",
"he",
"has",
"not",
"developed",
"new",
"infectious",
"episodes",
"."
] |
[
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Figure",
"3"
] |
[
"O",
"O"
] |
[
"Extensive",
"regression",
"of",
"Kaposi",
"Sarcoma",
"after",
"immune",
"-",
"suppression",
"was",
"changed",
"to",
"Sirolimus",
",",
"(",
"14",
"months",
"later",
")",
",",
"he",
"only",
"has",
"hyperpigmented",
"areas",
"at",
"knee",
"levels",
",",
"skin",
"looks",
"thin",
"and",
"delicate",
"and",
"easily",
"bruised",
"(",
"July",
"2006",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Hypothetical",
"distribution",
"patterns",
"of",
"the",
"meadow",
"brown",
"Maniola",
"jurtina",
"in",
"Europe",
"during",
"the",
"last",
"glacial",
"maximum",
"(",
"dark",
"hatched",
"areas",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Postglacial",
"expansions",
"are",
"indicated",
"by",
"solid",
"arrows",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"postulated",
"actual",
"hybrid",
"zone",
"is",
"shown",
"by",
"the",
"hatched",
"area",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Question",
"marks",
"indicate",
"lack",
"of",
"information",
"concerning",
"ancient",
"distribution",
"patterns",
"in",
"the",
"South",
"and",
"present",
"distribution",
"of",
"hybrid",
"populations",
"in",
"the",
"North",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Redrawn",
"from",
"Schmitt",
"et",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"al",
"."
] |
[
"O",
"O"
] |
[
"[",
"36",
"]",
";",
"based",
"on",
"Thomson",
"[",
"37",
"]",
"and",
"Schmitt",
"et",
"al",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"[",
"36",
"]",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Supporting",
"Information"
] |
[
"O",
"O"
] |
[
"Alternate",
"Language",
"Article",
"S1"
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Translation",
"of",
"the",
"manuscript",
"into",
"French",
"by",
"EL"
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"(",
"201",
"KB",
"DOC",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Click",
"here",
"for",
"additional",
"data",
"file",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Extrapyramidal",
"symptoms",
"based",
"on",
"Extrapyramidal",
"Symptoms",
"Rating",
"Scale"
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Etiology"
] |
[
"O"
] |
[
"Anorectal",
"malformations",
"(",
"ARM",
")",
"represent",
"a",
"spectrum",
"of",
"abnormalities",
"ranging",
"from",
"mild",
"anal",
"anomalies",
"to",
"complex",
"cloacal",
"malformations",
"."
] |
[
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"etiology",
"of",
"such",
"malformations",
"remains",
"unclear",
"and",
"is",
"likely",
"multifactorial",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"There",
"are",
"however",
"reasons",
"to",
"believe",
"there",
"is",
"a",
"genetic",
"componenet",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"As",
"early",
"as",
"the",
"1950s",
",",
"it",
"was",
"recognized",
"that",
"there",
"was",
"an",
"increased",
"risk",
"for",
"a",
"sibling",
"of",
"a",
"patient",
"with",
"ARM",
"to",
"be",
"born",
"with",
"a",
"malformation",
",",
"as",
"much",
"as",
"1",
"in",
"100",
",",
"compared",
"with",
"the",
"incidence",
"of",
"about",
"1",
"in",
"5000",
"in",
"the",
"general",
"population",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Since",
"that",
"time",
"there",
"have",
"been",
"reports",
"of",
"families",
"with",
"2",
"or",
"more",
"affected",
"members",
"and",
"associations",
"of",
"ARMs",
"with",
"multisystem",
"syndromes",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"particular",
",",
"mutations",
"in",
"specific",
"genes",
"encoding",
"transcription",
"factors",
"have",
"been",
"described",
"in",
"patients",
"having",
"Townes",
"-",
"Broks",
"syndrome",
",",
"Currarino",
"'",
"s",
"syndrome",
",",
"and",
"Pallister",
"-",
"Hall",
"syndrome",
",",
"each",
"of",
"which",
"have",
"autosomal",
"dominant",
"modes",
"of",
"inheritance",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"it",
"has",
"been",
"found",
"that",
"there",
"is",
"not",
"only",
"an",
"increased",
"incidence",
"of",
"ARM",
"in",
"patient",
"with",
"trisomy",
"21",
"(",
"Down",
"'",
"s",
"syndrome",
")",
",",
"but",
"that",
"95",
"%",
"of",
"patients",
"with",
"trisomy",
"21",
"and",
"ARM",
"have",
"imperforate",
"anus",
"without",
"fistula",
",",
"compared",
"with",
"only",
"5",
"%",
"of",
"all",
"patients",
"with",
"ARM",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Based",
"on",
"this",
"evidence",
",",
"it",
"is",
"likely",
"that",
"the",
"mutation",
"of",
"a",
"variety",
"of",
"different",
"genes",
"can",
"result",
"in",
"ARM",
",",
"or",
"that",
"the",
"etiology",
"of",
"ARM",
"is",
"multigenic",
"[",
"13",
"]",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Images"
] |
[
"O"
] |
[
"Fig",
"."
] |
[
"O",
"O"
] |
[
"1"
] |
[
"O"
] |
[
"Fig",
"."
] |
[
"O",
"O"
] |
[
"2"
] |
[
"O"
] |
[
"Fig",
"."
] |
[
"O",
"O"
] |
[
"3"
] |
[
"O"
] |
[
"Results"
] |
[
"O"
] |
[
"Images"
] |
[
"O"
] |
[
"Figure",
"1"
] |
[
"O",
"O"
] |
[
"Results"
] |
[
"O"
] |
[
"The",
"observation",
"that",
"AP",
"-",
"3",
"is",
"found",
"in",
"both",
"cytosolic",
"and",
"membrane",
"subcellular",
"fractions",
",",
"and",
"that",
"membrane",
"-",
"associated",
"AP",
"-",
"3",
"can",
"be",
"extracted",
"with",
"salts",
"(",
"Dell",
"'",
"Angelica",
"et",
"al",
".",
",",
"1997a",
")",
"is",
"consistent",
"with",
"its",
"role",
"as",
"a",
"membrane",
"coat",
"that",
"can",
"be",
"recruited",
"from",
"a",
"cytosolic",
"pool",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"the",
"punctate",
"staining",
"of",
"AP",
"-",
"3",
"by",
"immunofluorescence",
"microscopy",
",",
"its",
"redistribution",
"to",
"the",
"cytosol",
"by",
"BFA",
",",
"and",
"the",
"reversibility",
"of",
"the",
"BFA",
"effect",
"(",
"Dell",
"'",
"Angelica",
"et",
"al",
".",
",",
"1997a",
";",
"Simpson",
"et",
"al",
".",
",",
"1997",
")",
"also",
"indicate",
"that",
"AP",
"-",
"3",
"can",
"cycle",
"between",
"the",
"cytosol",
"and",
"membranes",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"B-ANATOMY",
"O"
] |
[
"The",
"sensitivity",
"of",
"AP",
"-",
"3",
"to",
"BFA",
"in",
"cells",
"suggests",
"that",
"its",
"membrane",
"association",
"may",
"be",
"regulated",
"by",
"ARF1",
",",
"since",
"BFA",
"inhibits",
"ARF1",
"guanine",
"nucleotide",
"exchange",
",",
"and",
"has",
"been",
"shown",
"to",
"prevent",
"ARF1",
"membrane",
"binding",
"in",
"vitro",
"(",
"Donaldson",
"et",
"al",
".",
",",
"1992",
";",
"Helms",
"and",
"Rothman",
",",
"1992",
";",
"Randazzo",
"et",
"al",
".",
",",
"1993",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Immunocytochemistry"
] |
[
"O"
] |
[
"C2C12",
"cells",
"grown",
"in",
"8",
"-",
"chamber",
"slides",
"(",
"Nunc",
")",
"were",
"fixed",
"in",
"4",
"%",
"PFA",
"/",
"PBS",
"for",
"10",
"min",
"and",
"permeabilized",
"in",
"0",
".",
"1",
"%",
"Triton",
"X",
"-",
"100",
"for",
"20",
"min",
"."
] |
[
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"some",
"cases",
",",
"they",
"were",
"fixed",
"and",
"permeabilized",
"in",
"methanol",
"at",
"-",
"20degreesC",
"for",
"2",
"min",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"fixed",
"and",
"permeabilized",
"cells",
"were",
"blocked",
"in",
"PBS",
"containing",
"3",
"%",
"BSA",
"(",
"Jackson",
"ImmunoResearch",
"Laboratories",
")",
"and",
"incubated",
"overnight",
"at",
"4degreesC",
"with",
"primary",
"antibodies",
"in",
"blocking",
"solution",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Immunoreactivity",
"was",
"detected",
"with",
"either",
"Alexa",
"-",
"conjugated",
"secondary",
"antibody",
"(",
"Molecular",
"Probes",
")",
"or",
"a",
"combination",
"of",
"biotin",
"-",
"conjugated",
"secondary",
"antibody",
"(",
"Vector",
"Laboratories",
")",
"and",
"Alexa",
"-",
"conjugated",
"streptavidin",
"(",
"Molecular",
"Probes",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Cytology",
"and",
"Histology"
] |
[
"O",
"O",
"O"
] |
[
"For",
"semithin",
"sections",
",",
"embryoid",
"bodies",
"were",
"washed",
"twice",
"in",
"PBS",
",",
"fixed",
"in",
"4",
"%",
"paraformaldehyde",
"at",
"4degreesC",
"overnight",
",",
"and",
"after",
"dehydration",
"in",
"ethanol",
"were",
"embedded",
"in",
"JB",
"-",
"4",
"resin",
"(",
"Polysciences",
",",
"Inc",
".",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"1",
"-",
"4",
"-",
"mum",
"sections",
"were",
"cut",
"with",
"a",
"glass",
"knife",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"For",
"cytology",
",",
"the",
"sections",
"were",
"stained",
"with",
"toluidine",
"blue",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"cell",
"mixing",
"experiments",
",",
"the",
"embryoid",
"bodies",
"were",
"prefixed",
"and",
"stained",
"for",
"beta",
"-",
"galactosidase",
"and",
"the",
"sections",
"were",
"counterstained",
"with",
"neutral",
"red",
"."
] |
[
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Teratocarcinomas",
"were",
"fixed",
"in",
"Bouin",
"fixative",
",",
"embedded",
"in",
"Paraplast",
",",
"and",
"the",
"sections",
"were",
"stained",
"with",
"hematoxylin",
"and",
"eosin",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Microphotography",
"was",
"with",
"a",
"ZEISS",
"Axiomat",
"microscope",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Films",
"were",
"scanned",
"and",
"figures",
"were",
"prepared",
"with",
"Photoshop",
"5",
".",
"5",
"software",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Stimulation",
"/",
"Inhibition",
"of",
"iDC",
"Functions",
"by",
"Activated",
"NK",
"Cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O"
] |
[
"Two",
"previous",
"studies",
"have",
"shown",
"that",
"both",
"resting",
"and",
"activated",
"NK",
"cells",
"partially",
"kill",
"autologous",
"DCs",
",",
"as",
"measured",
"by",
"3",
"-",
"4",
"-",
"h",
"chromium",
"release",
"assays",
"using",
"high",
"NK",
"/",
"DC",
"ratios",
"(",
"11",
",",
"12",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"However",
",",
"in",
"our",
"long",
"-",
"term",
"cultures",
"(",
"24",
"-",
"48",
"h",
")",
"the",
"NK",
"cells",
"stimulated",
"the",
"iDCs",
"rather",
"than",
"lysing",
"them",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Based",
"on",
"these",
"conflicting",
"results",
",",
"we",
"examined",
"in",
"more",
"detail",
"the",
"apparent",
"stimulation",
"of",
"iDCs",
"after",
"contact",
"with",
"NK",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O"
] |
[
"We",
"reasoned",
"that",
"activated",
"NK",
"cells",
"would",
"be",
"more",
"useful",
"for",
"these",
"experiments",
"because",
"(",
"i",
")",
"an",
"encounter",
"in",
"vivo",
"between",
"NK",
"cells",
"that",
"normally",
"traffic",
"in",
"the",
"blood",
"(",
"4",
")",
"and",
"iDCs",
"which",
"reside",
"in",
"the",
"tissues",
"(",
"1",
",",
"3",
")",
",",
"should",
"only",
"occur",
"when",
"both",
"cells",
"are",
"activated",
";",
"(",
"ii",
")",
"activated",
"NK",
"cells",
"mediate",
"more",
"potent",
"lysis",
"of",
"iDCs",
"(",
"11",
"-",
"13",
")",
",",
"thereby",
"allowing",
"for",
"a",
"more",
"rigorous",
"examination",
"of",
"a",
"potential",
"cytotoxic",
"effect",
";",
"and",
"(",
"iii",
")",
"the",
"number",
"of",
"NK",
"cells",
"obtained",
"after",
"short",
"-",
"term",
"in",
"vitro",
"culture",
"would",
"be",
"far",
"greater",
"providing",
"more",
"cells",
"for",
"analysis",
"(",
"9",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"DC",
"maturation",
"induced",
"by",
"resting",
"NK",
"cells",
"we",
"observed",
"was",
"dependent",
"on",
"endogenous",
"TNF",
"-",
"alpha",
"production",
"."
] |
[
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Furthermore",
",",
"TNF",
"-",
"alpha",
"and",
"other",
"proinflammatory",
"cytokines",
"are",
"important",
"amplifiers",
"of",
"immune",
"responses",
"(",
"14",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Therefore",
",",
"we",
"used",
"TNF",
"-",
"alpha",
"production",
"as",
"a",
"readout",
"for",
"DC",
"stimulation",
"in",
"our",
"culture",
"system",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Culturing",
"activated",
"NK",
"cells",
"with",
"DCs",
"at",
"low",
"NK",
"/",
"DC",
"ratios",
"(",
"1",
":",
"5",
")",
"led",
"to",
"increases",
"in",
"TNF",
"-",
"alpha",
"production",
",",
"which",
"were",
"augmented",
"dramatically",
"by",
"the",
"addition",
"of",
"suboptimal",
"doses",
"(",
"10",
"ng",
"/",
"ml",
")",
"of",
"LPS",
"(",
"Fig",
".",
"2",
"A",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"increased",
"TNF",
"-",
"alpha",
"production",
"was",
"dependent",
"on",
"cell",
"-",
"to",
"-",
"cell",
"contact",
"because",
"when",
"the",
"two",
"cell",
"types",
"were",
"separated",
"in",
"trans",
"-",
"wells",
",",
"no",
"stimulation",
"was",
"observed",
"(",
"Fig",
".",
"2",
"B",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"separate",
"experiments",
"we",
"observed",
"this",
"NK",
"-",
"stimulatory",
"effect",
"on",
"TNF",
"-",
"alpha",
"production",
"at",
"NK",
"/",
"DC",
"ratios",
"as",
"low",
"as",
"1",
":",
"20",
"and",
"1",
":",
"40",
"(",
"data",
"not",
"shown",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Raising",
"the",
"NK",
"/",
"DC",
"ratio",
"to",
"5",
":",
"1",
"changes",
"the",
"interaction",
"from",
"one",
"of",
"potent",
"DC",
"stimulation",
"to",
"that",
"of",
"complete",
"inhibition",
"in",
"the",
"presence",
"or",
"absence",
"of",
"LPS",
"(",
"Fig",
".",
"2",
"C",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"An",
"identical",
"pattern",
"is",
"seen",
"for",
"IL",
"-",
"12",
"p40",
"production",
"(",
"Fig",
".",
"2",
"D",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"No",
"IL",
"-",
"10",
"production",
"in",
"the",
"cultures",
"was",
"detected",
"under",
"any",
"of",
"the",
"conditions",
"tested",
"(",
"data",
"not",
"shown",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"massive",
"production",
"of",
"TNF",
"-",
"alpha",
"in",
"the",
"cultures",
"at",
"the",
"lowest",
"ratios",
"was",
"mediated",
"primarily",
"by",
"DCs",
"in",
"the",
"culture",
"due",
"to",
"the",
"low",
"number",
"of",
"NK",
"cells",
"(",
"2",
"x",
"104",
"cells",
"per",
"well",
")",
"used",
"in",
"these",
"experiments",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
Subsets and Splits
No community queries yet
The top public SQL queries from the community will appear here once available.