BioNER Datasets
Collection
A curated set of standard biomedical NER datasets in IOB format for training and evaluating BERT-like models and LLMs.
•
10 items
•
Updated
tokens
listlengths 1
334
| ner_tags
listlengths 1
334
|
|---|---|
[
"Immunostaining",
"and",
"confocal",
"analysis"
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"DNA",
"labelling",
"and",
"staining",
"with",
"5",
"-",
"bromo",
"-",
"2",
"'",
"-",
"deoxyuridine",
"(",
"BrdU",
"labelling",
"and",
"detection",
"kit",
"I",
";",
"Boehringer",
"Mannheim",
",",
"Germany",
")",
"was",
"performed",
"according",
"to",
"the",
"manufacturer",
"'",
"s",
"instructions",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"nucleoli",
"were",
"detected",
"with",
"an",
"anti",
"-",
"nucleolin",
"antibody",
"(",
"clone",
"3G4B2",
";",
"Upstate",
"biotechnology",
",",
"Lake",
"Placid",
",",
"NY",
")",
"on",
"cells",
"fixed",
"in",
"2",
"%",
"formalin",
"for",
"10",
"min",
"followed",
"by",
"permeabilization",
"with",
"ice",
"-",
"cold",
"methanol",
"for",
"30",
"min",
"."
] |
[
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"secondary",
"antibody",
"used",
"for",
"both",
"BrdU",
"and",
"nucleoli",
"staining",
"was",
"a",
"rhodamine",
"(",
"tetra",
"-",
"methyl",
")",
"-",
"conjugated",
"goat",
"anti",
"-",
"mouse",
"antibody",
"(",
"T",
"-",
"2762",
")",
"from",
"Molecular",
"Probe",
"(",
"Eugene",
",",
"OR",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"cells",
"were",
"examined",
"in",
"a",
"Zeiss",
"LSM",
"510",
"laser",
"scanning",
"microscope",
"equipped",
"with",
"a",
"Plan",
"-",
"Apochromate",
"63x",
"/",
"1",
".",
"4",
"oil",
"immersion",
"objective",
"."
] |
[
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"used",
"the",
"488",
"nm",
"laser",
"line",
"for",
"excitation",
"of",
"EGFP",
"(",
"detected",
"at",
"505",
"nm",
"<",
"lambdaEGFP",
"<",
"530",
"nm",
")",
"and",
"the",
"543",
"nm",
"laser",
"line",
"for",
"rhodamine",
"(",
"tetra",
"-",
"methyl",
")",
"(",
"detected",
"at",
"lambdaRhodamine",
">",
"560",
"nm",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"ECFP",
"fusion",
"protein",
"was",
"excited",
"with",
"a",
"458",
"nm",
"laser",
"line",
"(",
"detected",
"at",
"480",
"nm",
"<",
"lambdaECFP",
"<",
"520",
"nm",
")",
",",
"EYFP",
"fusion",
"protein",
"was",
"excited",
"with",
"a",
"514",
"nm",
"laser",
"line",
"(",
"lambdaEGFP",
">",
"560",
"nm",
")",
"and",
"HcRed",
"fusion",
"protein",
"was",
"excited",
"with",
"a",
"543",
"nm",
"laser",
"line",
"and",
"detected",
"at",
">",
"585",
"or",
"650",
"nm",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"images",
"were",
"from",
"1",
"mum",
"thick",
"slices",
"of",
"the",
"cells",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O"
] |
[
"The",
"images",
"were",
"exported",
"into",
"Adobe",
"Photoshop",
"(",
"Adobe",
"Systems",
"Inc",
".",
",",
"San",
"Jose",
",",
"CA",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Transcripts",
"Upregulated",
"in",
"ST",
"-",
"HSC",
"Compared",
"to",
"LT",
"-",
"HSC"
] |
[
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"(",
"181",
"KB",
"XLS",
")"
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Results"
] |
[
"O"
] |
[
"OFTT",
"was",
"given",
"to",
"33",
"men",
"with",
"MetS",
"(",
"defined",
"by",
"the",
"Adult",
"Treatment",
"Panel",
"III",
")",
",",
"17",
"HTN",
"and",
"14",
"healthy",
"men",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"MetS",
"group",
"was",
"further",
"divided",
"according",
"to",
"fasting",
"triglycerides",
"(",
"TG",
")",
"into",
"TG",
">",
"=",
"150",
"[",
"MetS",
"+",
"TG",
",",
"(",
"n",
"=",
"22",
")",
"]",
"or",
"<",
"150",
"mg",
"/",
"dl",
"[",
"MetS",
"-",
"TG",
"(",
"n",
"=",
"11",
")",
"]",
",",
"and",
"into",
"those",
"with",
"or",
"without",
"hypertension",
"[",
"MetS",
"+",
"HTN",
"(",
"n",
"=",
"24",
")",
",",
"MetS",
"-",
"HTN",
"(",
"n",
"=",
"9",
")",
",",
"respectively",
"]",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"TG",
"concentrations",
"were",
"measured",
"before",
"and",
"at",
"4",
",",
"6",
"and",
"8",
"h",
"after",
"OFTT",
"and",
"the",
"postprandial",
"response",
"was",
"quantified",
"using",
"the",
"area",
"under",
"the",
"curve",
"(",
"AUC",
")",
"for",
"TG",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"postprandial",
"response",
"was",
"significantly",
"higher",
"in",
"MetS",
"compared",
"to",
"HTN",
"and",
"healthy",
"men",
"[",
"AUC",
"(",
"SD",
")",
"in",
"mg",
"/",
"dl",
"/",
"h",
";",
"2534",
"+",
"/",
"-",
"1016",
"vs",
".",
"1620",
"+",
"/",
"-",
"494",
"and",
"1019",
"+",
"/",
"-",
"280",
",",
"respectively",
",",
"p",
"<",
"=",
"0",
".",
"001",
"]",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"TG",
"levels",
"were",
"increased",
"significantly",
"in",
"MetS",
"+",
"TG",
"compared",
"to",
"MetS",
"-",
"TG",
"subjects",
"at",
"4",
"(",
"p",
"=",
"0",
".",
"022",
")",
",",
"6",
"(",
"p",
"<",
"0",
".",
"001",
")",
"and",
"8",
"hours",
"(",
"p",
"<",
"0",
".",
"001",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"TG",
"were",
"increased",
"significantly",
"in",
"MetS",
"-",
"TG",
"compared",
"to",
"healthy",
"subjects",
"at",
"4",
"(",
"p",
"=",
"0",
".",
"011",
")",
",",
"6",
"(",
"p",
"=",
"0",
".",
"001",
")",
"and",
"8",
"hours",
"(",
"p",
"=",
"0",
".",
"015",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"linear",
"regression",
"analysis",
"only",
"fasting",
"TG",
"levels",
"were",
"a",
"significant",
"predictor",
"of",
"the",
"AUC",
"(",
"Coefficient",
"B",
"=",
"8",
".",
"462",
",",
"p",
"<",
"0",
".",
"001",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Conclusions"
] |
[
"O"
] |
[
"Only",
"after",
"careful",
"consideration",
"of",
"the",
"biological",
"underpinnings",
"of",
"a",
"truly",
"beneficial",
"response",
"can",
"an",
"exposure",
"be",
"considered",
"for",
"the",
"general",
"population",
",",
"such",
"as",
"the",
"addition",
"of",
"folic",
"acid",
"to",
"cereals",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"If",
"a",
"toxic",
"or",
"hazardous",
"pollutant",
"were",
"found",
"to",
"have",
"truly",
"beneficial",
"effects",
"at",
"low",
"dose",
",",
"then",
"that",
"agent",
"should",
"be",
"tested",
"clinically",
",",
"go",
"through",
"the",
"U",
".",
"S",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Food",
"and",
"Drug",
"Administration",
"(",
"FDA",
")",
"approval",
"process",
",",
"and",
"be",
"regulated",
"as",
"a",
"pharmaceutical",
"for",
"those",
"who",
"might",
"benefit",
"from",
"its",
"use",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Certainly",
",",
"the",
"general",
"population",
"should",
"not",
"be",
"exposed",
"to",
"chemotherapeutic",
"agents",
"that",
"benefit",
"cancer",
"patients",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O"
] |
[
"For",
"pharmaceuticals",
",",
"it",
"is",
"understood",
"that",
"there",
"are",
"trade",
"offs",
"between",
"benefits",
"and",
"risks",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"For",
"example",
",",
"although",
"aspirin",
"is",
"a",
"generally",
"well",
"-",
"tolerated",
"pain",
"reliever",
"and",
"is",
"increasingly",
"advocated",
"as",
"a",
"preventative",
"tool",
"for",
"heart",
"attacks",
"and",
"colorectal",
"cancer",
"(",
"Vainio",
"and",
"Miller",
"2003",
";",
"Werner",
"et",
"al",
".",
"2004",
")",
",",
"it",
"is",
"also",
"linked",
"to",
"increased",
"risk",
"of",
"gastrointestinal",
"bleeding",
",",
"cerebral",
"hemorrhage",
"(",
"Werner",
"et",
"al",
".",
"2004",
")",
",",
"and",
"asthma",
"attacks",
"(",
"Jenkins",
"et",
"al",
".",
"2004",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"aspirin",
"is",
"not",
"recommended",
"for",
"children",
"or",
"teenagers",
"who",
"have",
"or",
"are",
"recovering",
"from",
"chicken",
"pox",
"or",
"flulike",
"symptoms",
"because",
"it",
"can",
"cause",
"debilitating",
"and",
"sometimes",
"lethal",
"Reyes",
"syndrome",
"(",
"U",
".",
"S",
".",
"FDA",
"2003",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Individual",
"risks",
"to",
"pharmaceutical",
"agents",
"can",
"be",
"controlled",
"with",
"proper",
"usage",
";",
"however",
",",
"increased",
"exposure",
"to",
"environmental",
"toxins",
"presents",
"additional",
"involuntary",
"risks",
"for",
"the",
"general",
"population",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Under",
"the",
"latter",
"condition",
",",
"exposure",
"is",
"inadequately",
"controlled",
",",
"and",
"there",
"is",
"no",
"mechanism",
"to",
"correct",
"for",
"individual",
"circumstances",
"(",
"e",
".",
"g",
".",
",",
"medical",
"condition",
"or",
"age",
")",
"that",
"may",
"result",
"in",
"harm",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Although",
"hormetic",
"effects",
"may",
"occur",
"in",
"some",
"instances",
",",
"it",
"is",
"indeed",
"rare",
"that",
"exposures",
"to",
"toxic",
",",
"mutagenic",
",",
"teratogenic",
",",
"and",
"carcinogenic",
"chemicals",
",",
"even",
"at",
"low",
"exposure",
"levels",
",",
"would",
"be",
"risk",
"free",
"and",
"provide",
"health",
"benefits",
"for",
"the",
"general",
"public",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Portraying",
"chemicals",
"with",
"numerous",
"adverse",
"effects",
"as",
"having",
"benefits",
"while",
"ignoring",
"their",
"hazards",
"is",
"irresponsible",
"and",
"does",
"not",
"provide",
"full",
"and",
"objective",
"disclosure",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"the",
"1950s",
"doctors",
"prescribed",
"DES",
"to",
"pregnant",
"women",
"to",
"prevent",
"miscarriage",
"and",
"premature",
"births",
"and",
"to",
"produce",
"\"",
"bigger",
"and",
"stronger",
"babies",
"\"",
"even",
"though",
"DES",
"had",
"been",
"shown",
"to",
"cause",
"damage",
"to",
"reproductive",
"tissues",
"in",
"animals",
"(",
"Dinusson",
"et",
"al",
".",
"1948",
";",
"Dunn",
"and",
"Green",
"1963",
";",
"Takasugi",
"and",
"Bern",
"1964",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Human",
"use",
"of",
"DES",
"was",
"banned",
"in",
"the",
"United",
"States",
"in",
"1971",
"after",
"the",
"discovery",
"of",
"high",
"rates",
"of",
"rare",
",",
"clear",
"-",
"cell",
"adenocarcinomas",
"of",
"the",
"vagina",
"and",
"cervix",
"in",
"DES",
"-",
"exposed",
"daughters",
"(",
"Herbst",
"1981",
")",
",",
"and",
"later",
"studies",
"showed",
"elevated",
"breast",
"cancer",
"risk",
"in",
"women",
"who",
"took",
"DES",
"during",
"pregnancy",
"(",
"Titus",
"-",
"Ernstoff",
"et",
"al",
".",
"2001",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Certainly",
",",
"health",
"policy",
"decisions",
"should",
"be",
"based",
"on",
"scientific",
"evidence",
"and",
"not",
"on",
"speculation",
"of",
"health",
"benefits",
"in",
"order",
"for",
"the",
"general",
"population",
"to",
"avoid",
"repeating",
"the",
"mistakes",
"of",
"the",
"past",
"similar",
"to",
"that",
"of",
"the",
"DES",
"tragedy",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"claims",
"and",
"projections",
"of",
"health",
"benefits",
"from",
"exposures",
"to",
"environmental",
"toxicants",
"and",
"carcinogens",
"are",
"based",
"on",
"untested",
"assumptions",
"and",
"disregard",
"numerous",
"well",
"-",
"established",
"scientific",
"principles",
"that",
"underpin",
"a",
"public",
"health",
"-",
"protective",
"approach",
"to",
"regulating",
"exposure",
"to",
"toxic",
"substances",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"If",
"hormesis",
"were",
"used",
"in",
"the",
"decision",
"-",
"making",
"process",
"to",
"allow",
"higher",
"exposures",
"to",
"toxic",
"and",
"carcinogenic",
"agents",
",",
"this",
"would",
"substantially",
"increase",
"health",
"risks",
"for",
"many",
",",
"if",
"not",
"most",
",",
"segments",
"of",
"the",
"general",
"population",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Measured",
"analytes",
"in",
"five",
"biologic",
"sample",
"matrices",
".",
"a"
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Competing",
"interests"
] |
[
"O",
"O"
] |
[
"None",
"declared",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"article",
"is",
"the",
"third",
"in",
"an",
"ongoing",
",",
"educational",
"review",
"series",
"on",
"medical",
"statistics",
"in",
"critical",
"care",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Previous",
"articles",
"have",
"covered",
"'",
"presenting",
"and",
"summarising",
"data",
"'",
"[",
"3",
"]",
"and",
"'",
"samples",
"and",
"populations",
"'",
"[",
"4",
"]",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Future",
"topics",
"to",
"be",
"covered",
"include",
"power",
"calculations",
",",
"comparison",
"of",
"means",
",",
"comparison",
"of",
"proportions",
",",
"and",
"analysis",
"of",
"survival",
"data",
"to",
"name",
"but",
"a",
"few",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"If",
"there",
"is",
"a",
"medical",
"statistics",
"topic",
"you",
"would",
"like",
"explained",
"contact",
"us",
"on",
"editorial",
"@",
"ccforum",
".",
"com",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Results"
] |
[
"O"
] |
[
"The",
"set",
"of",
"E",
".",
"coli",
"expression",
"vectors",
",",
"encode",
"for",
"either",
"a",
"hexa",
"-",
"histidine",
"tag",
"or",
"the",
"three",
"most",
"commonly",
"used",
"solubility",
"tags",
"(",
"GST",
",",
"MBP",
",",
"NusA",
")",
"and",
"all",
"with",
"an",
"N",
"-",
"terminal",
"hexa",
"-",
"histidine",
"sequence",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"result",
"is",
"two",
"-",
"fold",
":",
"the",
"His",
"-",
"tag",
"facilitates",
"purification",
"by",
"immobilised",
"metal",
"affinity",
"chromatography",
",",
"whilst",
"the",
"fusion",
"domains",
"act",
"primarily",
"as",
"solubility",
"aids",
"during",
"expression",
",",
"in",
"addition",
"to",
"providing",
"an",
"optional",
"purification",
"step",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"also",
"incorporated",
"a",
"TEV",
"recognition",
"sequence",
"following",
"the",
"solubility",
"tag",
"domain",
",",
"which",
"allows",
"for",
"highly",
"specific",
"cleavage",
"(",
"using",
"TEV",
"protease",
")",
"of",
"the",
"fusion",
"protein",
"to",
"yield",
"native",
"protein",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"vectors",
"are",
"also",
"designed",
"for",
"ligation",
"-",
"independent",
"cloning",
"and",
"they",
"possess",
"a",
"high",
"-",
"level",
"expressing",
"T7",
"promoter",
",",
"which",
"is",
"suitable",
"for",
"auto",
"-",
"induction",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"To",
"validate",
"our",
"vector",
"system",
",",
"we",
"have",
"cloned",
"four",
"different",
"genes",
"and",
"also",
"one",
"gene",
"into",
"all",
"four",
"vectors",
"and",
"used",
"small",
"-",
"scale",
"expression",
"and",
"purification",
"techniques",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"demonstrate",
"that",
"the",
"vectors",
"are",
"capable",
"of",
"high",
"levels",
"of",
"expression",
"and",
"that",
"efficient",
"screening",
"of",
"new",
"proteins",
"can",
"be",
"readily",
"achieved",
"at",
"the",
"laboratory",
"level",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Inflammation",
"-",
"modulating",
"effect",
"of",
"antithrombin",
"on",
"the",
"endothelium",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O"
] |
[
"Ligation",
"of",
"heparan",
"sulfate",
"proteoglycans",
"(",
"HSPGs",
")",
"of",
"endothelium",
"with",
"antithrombin",
"(",
"AT",
")",
"induces",
"cellular",
"signalling",
"events",
"that",
"alter",
"the",
"cell",
"'",
"s",
"biochemical",
"and",
"functional",
"responses",
"to",
"inflammatory",
"stimuli",
"(",
"e",
".",
"g",
".",
"bacterial",
"lipopolysaccharide",
"[",
"LPS",
"]",
")",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Changes",
"include",
"reduced",
"release",
"of",
"inflammatory",
"and",
"procoagulatory",
"mediators",
"(",
"e",
".",
"g",
".",
"interleukin",
"[",
"IL",
"]",
"-",
"1",
",",
"IL",
"-",
"6",
",",
"tumour",
"necrosis",
"factor",
"-",
"alpha",
"[",
"TNF",
"]",
")",
",",
"tissue",
"factor",
"(",
"TF",
")",
",",
"adenosine",
"diphosphate",
"(",
"ADP",
")",
"and",
"cellular",
"adhesion",
"molecules",
"(",
"not",
"shown",
")",
",",
"as",
"well",
"as",
"increased",
"release",
"of",
"anticoagulatory",
"prostacyclin",
"(",
"prostaglandin",
"[",
"PG",
"]",
"I",
")",
"or",
"CD39",
"/",
"ATPDase",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"neuronal",
"tissue",
",",
"protective",
"mechanisms",
"may",
"by",
"mediated",
"via",
"the",
"release",
"of",
"calcitonin",
"gene",
"-",
"related",
"peptide",
"and",
"nitric",
"oxide",
"with",
"the",
"potential",
"to",
"affect",
"prostacyclin",
"release",
"[",
"55",
"]",
"."
] |
[
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Background"
] |
[
"O"
] |
[
"Hallucinations",
"may",
"occur",
"in",
"any",
"sensory",
"modalities",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Formed",
"musical",
"hallucinations",
"(",
"i",
".",
"e",
".",
"Perception",
"of",
"either",
"vocal",
"or",
"instrumental",
"melodies",
")",
"reported",
"in",
"English",
"literature",
"to",
"date",
"have",
"typically",
"been",
"associated",
"with",
"marked",
"hearing",
"loss",
",",
"advanced",
"age",
",",
"female",
"sex",
"(",
"71",
"%",
")",
",",
"lack",
"of",
"response",
"to",
"treatment",
"and",
"associated",
"psychopathology",
"[",
"1",
"]",
"but",
"has",
"been",
"concluded",
"that",
"hearing",
"loss",
"is",
"neither",
"a",
"necessary",
"nor",
"sufficient",
"condition",
"for",
"the",
"occurrence",
"of",
"musical",
"hallucinations",
"[",
"1",
"]",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Tumor",
"like",
"Astrocytoma",
",",
"Temporal",
"lobe",
"epilepsy",
",",
"raised",
"intra",
"cranial",
"tension",
",",
"drug",
"induced",
"(",
"tricyclics",
",",
"Propronolol",
"etc",
";",
")",
",",
"meningitis",
"and",
"psychotic",
"illness",
"were",
"shown",
"to",
"cause",
"palinacousis",
"and",
"musical",
"hallucinations",
"[",
"2",
",",
"3",
"]",
"."
] |
[
"B-ANATOMY",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Musical",
"hallucinations",
"are",
"pseudo",
"hallucinations",
"that",
"originate",
"in",
"memory",
"representations",
"and",
"they",
"may",
"undergo",
"a",
"transition",
"to",
"true",
"hallucination",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"musical",
"hallucination",
"spatial",
"projection",
"is",
"less",
"definite",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Sometimes",
"they",
"are",
"perceived",
"like",
"the",
"tinnitus",
"in",
"patient",
"'",
"s",
"own",
"head",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O"
] |
[
"The",
"quality",
"is",
"usually",
"very",
"intense",
"and",
"distinct",
"often",
"very",
"loud",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"They",
"vary",
"from",
"elementary",
"sounds",
"to",
"instrumental",
"music",
",",
"vocal",
"music",
",",
"bird",
"songs",
",",
"bells",
",",
"pieces",
"of",
"melodies",
"or",
"sentences",
",",
"religious",
"music",
"etc",
":",
"-",
"We",
"report",
"an",
"unusual",
"presentation",
"of",
"an",
"elderly",
"lady",
"who",
"had",
"experienced",
"musical",
"hallucinations",
"whilst",
"being",
"treated",
"with",
"Electro",
"Convulsive",
"Therapy",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Though",
"this",
"has",
"never",
"been",
"reported",
"earlier",
",",
"there",
"seemed",
"to",
"have",
"a",
"good",
"association",
"between",
"the",
"initiation",
"of",
"Electro",
"convulsive",
"therapy",
"and",
"musical",
"hallucination",
"in",
"our",
"patient",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Correlation",
"between",
"sperm",
"morphology",
"and",
"seminal",
"plasma",
"NO",
"(",
"a",
")",
"and",
"TBARS",
"(",
"b",
")",
"levels",
"in",
"both",
"groups",
"."
] |
[
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"I-ANATOMY",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Conclusion"
] |
[
"O"
] |
[
"The",
"survey",
"indicated",
"that",
",",
"the",
"study",
"area",
"has",
"plenty",
"of",
"medicinal",
"plants",
"to",
"treat",
"a",
"wide",
"spectrum",
"of",
"human",
"ailments",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Earlier",
"studies",
"on",
"traditional",
"medicinal",
"plants",
"also",
"revealed",
"that",
"the",
"economically",
"backward",
"local",
"and",
"tribal",
"people",
"of",
"Tamil",
"Nadu",
"prefer",
"folk",
"medicine",
"due",
"to",
"low",
"cost",
"and",
"sometimes",
"it",
"is",
"a",
"part",
"of",
"their",
"social",
"life",
"and",
"culture",
"[",
"40",
"-",
"45",
"]",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"It",
"is",
"evident",
"from",
"the",
"interviews",
"conducted",
"in",
"different",
"villages",
",",
"knowledge",
"of",
"medicinal",
"plants",
"is",
"limited",
"to",
"traditional",
"healers",
",",
"herbalists",
"and",
"elderly",
"persons",
"who",
"are",
"living",
"in",
"rural",
"areas",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"study",
"also",
"points",
"out",
"that",
"certain",
"species",
"of",
"medicinal",
"plants",
"are",
"being",
"exploited",
"by",
"the",
"local",
"residents",
"who",
"are",
"unaware",
"of",
"the",
"importance",
"of",
"medicinal",
"plants",
"in",
"the",
"ecosystem",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"study",
"concluded",
"that",
"even",
"though",
"the",
"accessibility",
"of",
"Western",
"medicine",
"for",
"simple",
"and",
"complicated",
"diseases",
"is",
"available",
",",
"many",
"people",
"in",
"the",
"studied",
"parts",
"of",
"Kancheepuram",
"district",
"is",
"still",
"continue",
"to",
"depend",
"on",
"medicinal",
"plants",
",",
"at",
"least",
"for",
"the",
"treatment",
"of",
"some",
"simple",
"diseases",
"such",
"as",
",",
"cold",
",",
"cough",
",",
"fever",
",",
"headache",
",",
"poison",
"bites",
",",
"skin",
"diseases",
"and",
"tooth",
"infections",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O",
"B-ANATOMY",
"O",
"O"
] |
[
"Well",
"-",
"knowledged",
"healers",
"have",
"good",
"interactions",
"with",
"patients",
"and",
"this",
"would",
"improve",
"the",
"quality",
"of",
"healthcare",
"delivery",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"present",
"-",
"day",
"traditional",
"healers",
"are",
"very",
"old",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Due",
"to",
"lack",
"of",
"interest",
"among",
"the",
"younger",
"generation",
"as",
"well",
"as",
"their",
"tendency",
"to",
"migrate",
"to",
"cities",
"for",
"lucrative",
"jobs",
",",
"there",
"is",
"a",
"possibility",
"of",
"losing",
"this",
"wealth",
"of",
"knowledge",
"in",
"the",
"near",
"future",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"It",
"thus",
"becomes",
"necessary",
"to",
"acquire",
"and",
"preserve",
"this",
"traditional",
"system",
"of",
"medicine",
"by",
"proper",
"documentation",
"and",
"identification",
"of",
"specimens",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Figures",
"and",
"Tables"
] |
[
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Figure",
"1"
] |
[
"O",
"O"
] |
[
"Modular",
"crosstalking",
"in",
"synthetic",
"gene",
"networks",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"A",
"promoter",
"with",
"binding",
"sites",
"for",
"lambda",
"cI",
"dimers",
"(",
"OR1",
"and",
"OR2",
")",
"and",
"for",
"the",
"lac",
"repressor",
"(",
"Olac",
")",
"controls",
"the",
"production",
"of",
"the",
"lac",
"repressor",
"(",
"encoded",
"by",
"lacI",
")",
"in",
"module",
"1",
"and",
"lambda",
"cI",
"(",
"encoded",
"by",
"cI",
")",
"in",
"module",
"2",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"lac",
"repressor",
"and",
"lambda",
"cI",
"dimers",
"are",
"represented",
"by",
"blue",
"ellipsoids",
"and",
"red",
"circles",
",",
"respectively",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"When",
"the",
"two",
"modules",
"are",
"put",
"together",
",",
"two",
"pairs",
"of",
"lambda",
"cI",
"dimers",
"bound",
"at",
"different",
"operators",
"can",
"loop",
"DNA",
"and",
"octamerize",
",",
"forming",
"a",
"tetramer",
"of",
"dimers",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Comparison",
"of",
"the",
"Predicted",
"Irr",
"Regulon",
"and",
"ICE",
"Motifs",
"with",
"the",
"Published",
"Expression",
"Microarray",
"Data",
"for",
"Iron",
"-",
"and",
"Irr",
"-",
"Affected",
"Genes",
"in",
"Bradyrhizobium",
"japonicum"
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Mass",
"casualty",
"estimation",
"on",
"a",
"geographic",
"basis"
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"Defense",
"Threat",
"Reduction",
"Agency",
"(",
"DTRA",
")",
"has",
"expended",
"considerable",
"effort",
"to",
"develop",
"models",
"for",
"calculating",
"mass",
"casualties",
"from",
"a",
"nuclear",
"detonation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"In",
"order",
"to",
"specifically",
"evaluate",
"urban",
"medical",
"systems",
"vulnerability",
"we",
"are",
"employing",
"the",
"PC",
"based",
"Consequence",
"Assessment",
"Tool",
"Set",
"(",
"CATS",
")",
"v6",
",",
"with",
"ESRI",
"'",
"s",
"ArcGIS9",
"[",
"14",
"]",
",",
"CATS",
"/",
"JACE",
"(",
"Joint",
"Assessment",
"of",
"Catastrophic",
"Events",
")",
"v5",
"with",
"ESRI",
"'",
"s",
"ArcView",
"3",
".",
"3",
",",
"Hazard",
"Prediction",
"and",
"Assessment",
"Capability",
"(",
"HPAC",
")",
"V4",
".",
"04SP3",
"[",
"15",
"]",
",",
"as",
"well",
"as",
"custom",
"GIS",
"and",
"database",
"software",
"applications",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"HPAC",
"does",
"excellent",
"Chemical",
"Biological",
"and",
"Nuclear",
"(",
"CBN",
")",
"modeling",
",",
"although",
"output",
"could",
"provide",
"more",
"flexibility",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Additionally",
",",
"results",
"can",
"be",
"exported",
"to",
"CATS",
"for",
"further",
"analysis",
"and",
"display",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"All",
"three",
"programs",
"can",
"access",
"the",
"current",
"weather",
"data",
"from",
"both",
"classified",
"and",
"unclassified",
"weather",
"servers",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Examples",
"of",
"uses",
"of",
"CATS",
"/",
"HPAC",
"are",
"hurricane",
",",
"tidal",
"surge",
"and",
"earthquake",
"damage",
",",
"prediction",
"of",
"the",
"results",
"from",
"nuclear",
",",
"biological",
"and",
"chemical",
"releases",
",",
"assessment",
"of",
"persons",
"and",
"infrastructure",
"affected",
"and",
"at",
"risk",
"(",
"e",
".",
"g",
".",
"which",
"hospitals",
"and",
"pharmacies",
"are",
"under",
"a",
"CBN",
"plume",
"and",
"are",
"thus",
"out",
"of",
"commission",
")",
",",
"and",
"mobilization",
"of",
"surviving",
"and",
"nearby",
"infrastructure",
"outside",
"the",
"plume",
"that",
"would",
"be",
"needed",
"to",
"address",
"healthcare",
"and",
"other",
"emergency",
"response",
"needs",
"of",
"the",
"community",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"These",
"models",
"have",
"been",
",",
"and",
"continue",
"to",
"be",
",",
"developed",
"with",
"a",
"view",
"to",
"better",
"estimating",
"the",
"impact",
"of",
"WMD",
"weapons",
"in",
"an",
"offensive",
"setting",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"However",
",",
"recent",
"DTRA",
"enhancements",
"and",
"our",
"modifications",
"have",
"facilitated",
"their",
"use",
"in",
"helping",
"estimate",
"potential",
"casualties",
"from",
"a",
"WMD",
"terrorist",
"incident",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"One",
"area",
"of",
"intense",
"interest",
",",
"and",
"somewhat",
"of",
"a",
"vacuum",
"in",
"public",
"health",
"planning",
",",
"has",
"been",
"the",
"utility",
"of",
"this",
"approach",
"in",
"estimating",
"medical",
"care",
"vulnerabilities",
"in",
"such",
"an",
"attack",
",",
"and",
"for",
"the",
"calculation",
"of",
"the",
"distribution",
"of",
"surviving",
"medical",
"care",
"resources",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"While",
"much",
"work",
"has",
"already",
"occurred",
"in",
"estimating",
"the",
"impact",
"of",
"chemical",
"weapons",
"(",
"due",
"to",
"the",
"dual",
"use",
"in",
"chemical",
"spill",
"management",
"from",
"transportation",
"and",
"industrial",
"accidents",
")",
",",
"or",
"in",
"nuclear",
"power",
"plant",
"accident",
"management",
",",
"much",
"less",
"research",
"and",
"development",
"has",
"gone",
"into",
"estimating",
"the",
"impact",
"on",
"our",
"civilian",
"population",
"of",
"a",
"nuclear",
"weapon",
"detonation",
"from",
"a",
"terrorist",
"incident",
"in",
"a",
"large",
"urban",
"area",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"models",
"already",
"calculate",
"such",
"factors",
"as",
"the",
"impact",
"of",
"blast",
",",
"thermal",
"effects",
"and",
"fallout",
",",
"but",
"results",
"are",
"often",
"not",
"available",
"at",
"the",
"detail",
"level",
"needed",
"for",
"civil",
"defense",
"purposes",
",",
"casualty",
"management",
",",
"and",
"planning",
"the",
"use",
"of",
"scarce",
"health",
"resources",
"in",
"response",
"to",
"a",
"nuclear",
"weapon",
"detonation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Furthermore",
",",
"the",
"models",
"do",
"not",
"readily",
"facilitate",
"the",
"calculation",
"of",
"injuries",
"from",
"multiple",
"effects",
"such",
"as",
"burns",
"and",
"blast",
"with",
"fallout",
"or",
"prompt",
"radiation",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"complexity",
"of",
"the",
"urban",
"three",
"-",
"dimensional",
"landscape",
"and",
"its",
"local",
"impact",
"on",
"thermal",
",",
"blast",
"and",
"radiation",
"is",
"also",
"poorly",
"understood",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Additionally",
",",
"given",
"their",
"traditional",
"world",
"-",
"wide",
"focus",
",",
"and",
"the",
"increased",
"sensitivity",
"to",
"providing",
"information",
"on",
"the",
"U",
".",
"S",
".",
"A",
".",
"of",
"use",
"to",
"terrorists",
",",
"the",
"models",
"do",
"not",
"provide",
"detailed",
"or",
"current",
"data",
"that",
"exists",
"for",
"the",
"United",
"States",
"that",
"would",
"help",
"provide",
"better",
"casualty",
"estimates",
"and",
"response",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"models",
"can",
"be",
"customized",
"locally",
"and",
"data",
"updated",
"if",
"the",
"user",
"has",
"sufficient",
"expertise",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"However",
",",
"there",
"is",
"often",
"a",
"significant",
"duplication",
"of",
"effort",
"due",
"to",
"overlapping",
"jurisdictions",
"and",
"the",
"lack",
"of",
"data",
"sharing",
"due",
"to",
"security",
"and",
"other",
"considerations",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"CATS",
"and",
"HPAC",
"are",
"also",
"useful",
"for",
"creating",
"realistic",
"scenarios",
"for",
"training",
"and",
"planning",
"before",
"a",
"disaster",
"strikes",
",",
"thus",
"enabling",
"responders",
"to",
"drill",
"and",
"exercise",
"so",
"they",
"know",
"roughly",
"what",
"to",
"expect",
"and",
"how",
"to",
"react",
"."
] |
[
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |