tokens
sequence | folded_tokens
sequence | labels
sequence |
---|---|---|
[
"Furthermore",
",",
"IL-2",
"and",
"IL-12",
"synergistically",
"induced",
"IRF-1",
",",
"whereas",
"IFN-alpha",
"and",
"IL-12",
"did",
"not",
"."
] | [
"furthermore",
",",
"il-2",
"and",
"il-12",
"synergistically",
"induced",
"irf-1",
",",
"whereas",
"ifn-alpha",
"and",
"il-12",
"did",
"not",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"participation",
"of",
"STAT4",
"in",
"the",
"regulation",
"of",
"IRF-1",
"was",
"demonstrated",
"in",
"two",
"ways",
"."
] | [
"the",
"participation",
"of",
"stat4",
"in",
"the",
"regulation",
"of",
"irf-1",
"was",
"demonstrated",
"in",
"two",
"ways",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"First",
",",
"STAT4",
"was",
"required",
"for",
"the",
"IL-12",
"-dependent",
"transactivation",
"of",
"an",
"IRF-1",
"reporter",
"construct",
",",
"and",
"second",
",",
"STAT4",
"binding",
"to",
"the",
"IRF-1",
"promoter",
"was",
"shown",
"using",
"EMSA",
"."
] | [
"first",
",",
"stat4",
"was",
"required",
"for",
"the",
"il-12",
"-dependent",
"transactivation",
"of",
"an",
"irf-1",
"reporter",
"construct",
",",
"and",
"second",
",",
"stat4",
"binding",
"to",
"the",
"irf-1",
"promoter",
"was",
"shown",
"using",
"emsa",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"In",
"contrast",
"to",
"IL-12",
",",
"no",
"up-regulation",
"of",
"IRF-1",
"was",
"found",
"in",
"IL-4",
"-stimulated",
"cells",
",",
"and",
"IL-4",
"did",
"not",
"block",
"IL-12",
"-dependent",
"up-regulation",
"of",
"IRF-1",
"."
] | [
"in",
"contrast",
"to",
"il-12",
",",
"no",
"up-regulation",
"of",
"irf-1",
"was",
"found",
"in",
"il-4",
"-stimulated",
"cells",
",",
"and",
"il-4",
"did",
"not",
"block",
"il-12",
"-dependent",
"up-regulation",
"of",
"irf-1",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Therefore",
",",
"IRF-1",
"may",
"be",
"an",
"important",
"contributor",
"to",
"IL-12",
"signaling",
",",
"and",
"we",
"speculate",
"that",
"the",
"defective",
"IL-12",
"responses",
"seen",
"in",
"IRF",
"-1-/-",
"mice",
"might",
"be",
"attributable",
",",
"in",
"part",
",",
"to",
"the",
"absence",
"of",
"this",
"transcription",
"factor",
"."
] | [
"therefore",
",",
"irf-1",
"may",
"be",
"an",
"important",
"contributor",
"to",
"il-12",
"signaling",
",",
"and",
"we",
"speculate",
"that",
"the",
"defective",
"il-12",
"responses",
"seen",
"in",
"irf",
"-1-/-",
"mice",
"might",
"be",
"attributable",
",",
"in",
"part",
",",
"to",
"the",
"absence",
"of",
"this",
"transcription",
"factor",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"Cytokine",
"modulation",
"of",
"HIV",
"expression",
"."
] | [
"cytokine",
"modulation",
"of",
"hiv",
"expression",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"O"
] |
[
"Cytokines",
",",
"the",
"peptide",
"hormones",
"which",
"control",
"the",
"homeostasis",
"of",
"the",
"immune",
"system",
"and",
"also",
"play",
"a",
"fundamental",
"role",
"in",
"inflammatory",
"and",
"immune",
"mediated",
"reactions",
",",
"have",
"been",
"involved",
"at",
"multiple",
"levels",
"in",
"the",
"pathogenesis",
"of",
"the",
"acquired",
"immune",
"deficiency",
"syndrome",
"(",
"AIDS",
")",
"."
] | [
"cytokines",
",",
"the",
"peptide",
"hormones",
"which",
"control",
"the",
"homeostasis",
"of",
"the",
"immune",
"system",
"and",
"also",
"play",
"a",
"fundamental",
"role",
"in",
"inflammatory",
"and",
"immune",
"mediated",
"reactions",
",",
"have",
"been",
"involved",
"at",
"multiple",
"levels",
"in",
"the",
"pathogenesis",
"of",
"the",
"acquired",
"immune",
"deficiency",
"syndrome",
"(",
"aids",
")",
"."
] | [
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-body_part",
"I-body_part",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O"
] |
[
"Infection",
"with",
"the",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"(",
"HIV",
")",
"has",
"been",
"shown",
"to",
"induce",
"production",
"of",
"several",
"cytokines",
"both",
"in",
"vitro",
"and",
"in",
"vivo",
"."
] | [
"infection",
"with",
"the",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"(",
"hiv",
")",
"has",
"been",
"shown",
"to",
"induce",
"production",
"of",
"several",
"cytokines",
"both",
"in",
"vitro",
"and",
"in",
"vivo",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Conversely",
",",
"several",
"cytokines",
"modulate",
"the",
"levels",
"of",
"HIV",
"expression",
"in",
"infected",
"cells",
"of",
"both",
"T",
"lymphocytic",
"and",
"mononuclear",
"phagocytic",
"lineage",
"."
] | [
"conversely",
",",
"several",
"cytokines",
"modulate",
"the",
"levels",
"of",
"hiv",
"expression",
"in",
"infected",
"cells",
"of",
"both",
"t",
"lymphocytic",
"and",
"mononuclear",
"phagocytic",
"lineage",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Activated",
"mononuclear",
"cells",
",",
"particularly",
"B",
"cells",
"which",
"are",
"in",
"a",
"state",
"of",
"chronic",
"activation",
"in",
"HIV",
"infected",
"individuals",
",",
"release",
"HIV",
"-inductive",
"cytokines",
"and",
"thus",
"play",
"a",
"potentially",
"important",
"role",
"in",
"the",
"pathogenesis",
"of",
"HIV",
"infection",
"."
] | [
"activated",
"mononuclear",
"cells",
",",
"particularly",
"b",
"cells",
"which",
"are",
"in",
"a",
"state",
"of",
"chronic",
"activation",
"in",
"hiv",
"infected",
"individuals",
",",
"release",
"hiv",
"-inductive",
"cytokines",
"and",
"thus",
"play",
"a",
"potentially",
"important",
"role",
"in",
"the",
"pathogenesis",
"of",
"hiv",
"infection",
"."
] | [
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"O",
"O"
] |
[
"N-acetyl-L-cysteine",
"inhibits",
"primary",
"human",
"T",
"cell",
"responses",
"at",
"the",
"dendritic",
"cell",
"level",
":",
"association",
"with",
"NF-kappaB",
"inhibition",
"."
] | [
"n-acetyl-l-cysteine",
"inhibits",
"primary",
"human",
"t",
"cell",
"responses",
"at",
"the",
"dendritic",
"cell",
"level",
":",
"association",
"with",
"nf-kappab",
"inhibition",
"."
] | [
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"O"
] |
[
"N-acetyl-L-cysteine",
"(",
"NAC",
")",
"is",
"an",
"antioxidant",
"molecule",
"endowed",
"with",
"immunomodulatory",
"properties",
"."
] | [
"n-acetyl-l-cysteine",
"(",
"nac",
")",
"is",
"an",
"antioxidant",
"molecule",
"endowed",
"with",
"immunomodulatory",
"properties",
"."
] | [
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"To",
"investigate",
"the",
"effect",
"of",
"NAC",
"on",
"the",
"induction",
"phase",
"of",
"T",
"cell",
"responses",
",",
"we",
"analyzed",
"its",
"action",
"on",
"human",
"dendritic",
"cells",
"(",
"DC",
")",
"derived",
"from",
"adherent",
"PBMC",
"cultured",
"with",
"IL-4",
"and",
"granulocyte-macrophage",
"CSF",
"."
] | [
"to",
"investigate",
"the",
"effect",
"of",
"nac",
"on",
"the",
"induction",
"phase",
"of",
"t",
"cell",
"responses",
",",
"we",
"analyzed",
"its",
"action",
"on",
"human",
"dendritic",
"cells",
"(",
"dc",
")",
"derived",
"from",
"adherent",
"pbmc",
"cultured",
"with",
"il-4",
"and",
"granulocyte-macrophage",
"csf",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"We",
"first",
"found",
"that",
"NAC",
"inhibited",
"the",
"constitutive",
"as",
"well",
"as",
"the",
"LPS",
"-induced",
"activity",
"of",
"the",
"transcription",
"factor",
"NF-kappaB",
"."
] | [
"we",
"first",
"found",
"that",
"nac",
"inhibited",
"the",
"constitutive",
"as",
"well",
"as",
"the",
"lps",
"-induced",
"activity",
"of",
"the",
"transcription",
"factor",
"nf-kappab",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_complex",
"O"
] |
[
"In",
"parallel",
",",
"NAC",
"was",
"shown",
"to",
"down-regulate",
"the",
"production",
"of",
"cytokines",
"by",
"DC",
"as",
"well",
"as",
"their",
"surface",
"expression",
"of",
"HLA-DR",
",",
"CD86",
"(",
"B7-2",
")",
",",
"and",
"CD40",
"molecules",
"both",
"at",
"the",
"basal",
"state",
"and",
"upon",
"LPS",
"activation",
"."
] | [
"in",
"parallel",
",",
"nac",
"was",
"shown",
"to",
"down-regulate",
"the",
"production",
"of",
"cytokines",
"by",
"dc",
"as",
"well",
"as",
"their",
"surface",
"expression",
"of",
"hla-dr",
",",
"cd86",
"(",
"b7-2",
")",
",",
"and",
"cd40",
"molecules",
"both",
"at",
"the",
"basal",
"state",
"and",
"upon",
"lps",
"activation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O"
] |
[
"NAC",
"also",
"inhibited",
"DC",
"responses",
"induced",
"by",
"CD40",
"engagement",
"."
] | [
"nac",
"also",
"inhibited",
"dc",
"responses",
"induced",
"by",
"cd40",
"engagement",
"."
] | [
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"inhibitory",
"effects",
"of",
"NAC",
"were",
"not",
"due",
"to",
"nonspecific",
"toxicity",
"as",
"neither",
"the",
"viability",
"of",
"DC",
"nor",
"their",
"mannose",
"receptor-mediated",
"endocytosis",
"were",
"modified",
"by",
"NAC",
"."
] | [
"the",
"inhibitory",
"effects",
"of",
"nac",
"were",
"not",
"due",
"to",
"nonspecific",
"toxicity",
"as",
"neither",
"the",
"viability",
"of",
"dc",
"nor",
"their",
"mannose",
"receptor-mediated",
"endocytosis",
"were",
"modified",
"by",
"nac",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O"
] |
[
"Finally",
",",
"we",
"found",
"that",
"the",
"addition",
"of",
"NAC",
"to",
"MLR",
"between",
"naive",
"T",
"cells",
"and",
"allogeneic",
"DC",
"resulted",
"in",
"a",
"profound",
"inhibition",
"of",
"alloreactive",
"responses",
",",
"which",
"could",
"be",
"attributed",
"to",
"a",
"defect",
"of",
"DC",
"as",
"APC-independent",
"T",
"cell",
"responses",
"were",
"not",
"inhibited",
"by",
"NAC",
"."
] | [
"finally",
",",
"we",
"found",
"that",
"the",
"addition",
"of",
"nac",
"to",
"mlr",
"between",
"naive",
"t",
"cells",
"and",
"allogeneic",
"dc",
"resulted",
"in",
"a",
"profound",
"inhibition",
"of",
"alloreactive",
"responses",
",",
"which",
"could",
"be",
"attributed",
"to",
"a",
"defect",
"of",
"dc",
"as",
"apc-independent",
"t",
"cell",
"responses",
"were",
"not",
"inhibited",
"by",
"nac",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O"
] |
[
"Altogether",
",",
"our",
"results",
"suggest",
"that",
"NAC",
"might",
"impair",
"the",
"generation",
"of",
"primary",
"immune",
"responses",
"in",
"humans",
"through",
"its",
"inhibitory",
"action",
"on",
"DC",
"."
] | [
"altogether",
",",
"our",
"results",
"suggest",
"that",
"nac",
"might",
"impair",
"the",
"generation",
"of",
"primary",
"immune",
"responses",
"in",
"humans",
"through",
"its",
"inhibitory",
"action",
"on",
"dc",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-amino_acid_monomer",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O"
] |
[
"The",
"spatial",
"distribution",
"of",
"human",
"immunoglobulin",
"genes",
"within",
"the",
"nucleus",
":",
"evidence",
"for",
"gene",
"topography",
"independent",
"of",
"cell",
"type",
"and",
"transcriptional",
"activity",
"."
] | [
"the",
"spatial",
"distribution",
"of",
"human",
"immunoglobulin",
"genes",
"within",
"the",
"nucleus",
":",
"evidence",
"for",
"gene",
"topography",
"independent",
"of",
"cell",
"type",
"and",
"transcriptional",
"activity",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"B-cell_component",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"three-dimensional",
"positioning",
"of",
"immunoglobulin",
"(",
"Ig",
")",
"genes",
"within",
"the",
"nucleus",
"of",
"human",
"cells",
"was",
"investigated",
"using",
"in",
"situ",
"hybridization",
"and",
"confocal",
"microscopy",
"."
] | [
"the",
"three-dimensional",
"positioning",
"of",
"immunoglobulin",
"(",
"ig",
")",
"genes",
"within",
"the",
"nucleus",
"of",
"human",
"cells",
"was",
"investigated",
"using",
"in",
"situ",
"hybridization",
"and",
"confocal",
"microscopy",
"."
] | [
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"B-cell_component",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"visualization",
"of",
"heavy",
"and",
"light",
"chain",
"genes",
"in",
"B-lymphoid",
"cells",
"showed",
"that",
"the",
"three",
"Ig",
"genes",
"are",
"differentially",
"and",
"nonrandomly",
"distributed",
"in",
"different",
"nuclear",
"subvolumes",
":",
"the",
"kappa",
"genes",
"were",
"found",
"to",
"be",
"preferentially",
"confined",
"to",
"an",
"outer",
"nuclear",
"volume",
",",
"whereas",
"the",
"gamma",
"and",
"lambda",
"genes",
"consistently",
"occupied",
"more",
"central",
"positions",
"within",
"the",
"nucleus",
",",
"the",
"lambda",
"genes",
"being",
"more",
"interior",
"when",
"compared",
"with",
"the",
"gamma",
"genes",
"."
] | [
"the",
"visualization",
"of",
"heavy",
"and",
"light",
"chain",
"genes",
"in",
"b-lymphoid",
"cells",
"showed",
"that",
"the",
"three",
"ig",
"genes",
"are",
"differentially",
"and",
"nonrandomly",
"distributed",
"in",
"different",
"nuclear",
"subvolumes",
":",
"the",
"kappa",
"genes",
"were",
"found",
"to",
"be",
"preferentially",
"confined",
"to",
"an",
"outer",
"nuclear",
"volume",
",",
"whereas",
"the",
"gamma",
"and",
"lambda",
"genes",
"consistently",
"occupied",
"more",
"central",
"positions",
"within",
"the",
"nucleus",
",",
"the",
"lambda",
"genes",
"being",
"more",
"interior",
"when",
"compared",
"with",
"the",
"gamma",
"genes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_component",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O"
] |
[
"The",
"data",
"further",
"show",
"that",
"these",
"overall",
"topographical",
"distributions",
"are",
"independent",
"of",
"gene",
"transcriptional",
"activity",
"and",
"are",
"conserved",
"in",
"different",
"cell",
"types",
"."
] | [
"the",
"data",
"further",
"show",
"that",
"these",
"overall",
"topographical",
"distributions",
"are",
"independent",
"of",
"gene",
"transcriptional",
"activity",
"and",
"are",
"conserved",
"in",
"different",
"cell",
"types",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Although",
"subtle",
"gene",
"movements",
"within",
"those",
"defined",
"topographical",
"regions",
"cannot",
"be",
"excluded",
"by",
"this",
"study",
",",
"the",
"results",
"indicate",
"that",
"tissue",
"specificity",
"of",
"gene",
"expression",
"is",
"not",
"accompanied",
"by",
"drastic",
"changes",
"in",
"gene",
"nuclear",
"topography",
",",
"rather",
"suggesting",
"that",
"gene",
"organization",
"within",
"the",
"nucleus",
"may",
"be",
"primarily",
"dependent",
"on",
"structural",
"constraints",
"imposed",
"on",
"the",
"respective",
"chromosomes",
"."
] | [
"although",
"subtle",
"gene",
"movements",
"within",
"those",
"defined",
"topographical",
"regions",
"cannot",
"be",
"excluded",
"by",
"this",
"study",
",",
"the",
"results",
"indicate",
"that",
"tissue",
"specificity",
"of",
"gene",
"expression",
"is",
"not",
"accompanied",
"by",
"drastic",
"changes",
"in",
"gene",
"nuclear",
"topography",
",",
"rather",
"suggesting",
"that",
"gene",
"organization",
"within",
"the",
"nucleus",
"may",
"be",
"primarily",
"dependent",
"on",
"structural",
"constraints",
"imposed",
"on",
"the",
"respective",
"chromosomes",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-cell_component",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_molecule",
"O"
] |
[
"V3",
"loop",
"of",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"type",
"1",
"suppresses",
"interleukin",
"2",
"-induced",
"T",
"cell",
"growth",
"[",
"published",
"erratum",
"appears",
"in",
"AIDS",
"Res",
"Hum",
"Retroviruses",
"1997",
"May",
"1",
";",
"13",
"(",
"7",
")",
":",
"633",
"]"
] | [
"v3",
"loop",
"of",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"type",
"1",
"suppresses",
"interleukin",
"2",
"-induced",
"t",
"cell",
"growth",
"[",
"published",
"erratum",
"appears",
"in",
"aids",
"res",
"hum",
"retroviruses",
"1997",
"may",
"1",
";",
"13",
"(",
"7",
")",
":",
"633",
"]"
] | [
"B-protein_substructure",
"I-protein_substructure",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"tested",
"the",
"effect",
"of",
"three",
"linear",
"or",
"two",
"loop",
"peptides",
"derived",
"from",
"the",
"V3",
"region",
"of",
"the",
"HTLV-III",
"BH10",
"clone",
"or",
"the",
"SF2",
"strain",
"of",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"type",
"1",
"on",
"IL-2",
"-driven",
"T",
"cell",
"proliferation",
"."
] | [
"we",
"tested",
"the",
"effect",
"of",
"three",
"linear",
"or",
"two",
"loop",
"peptides",
"derived",
"from",
"the",
"v3",
"region",
"of",
"the",
"htlv-iii",
"bh10",
"clone",
"or",
"the",
"sf2",
"strain",
"of",
"human",
"immunodeficiency",
"virus",
"type",
"1",
"on",
"il-2",
"-driven",
"t",
"cell",
"proliferation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-peptide",
"I-peptide",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_substructure",
"I-protein_substructure",
"O",
"O",
"B-other_artificial_source",
"I-other_artificial_source",
"I-other_artificial_source",
"O",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"V3-BH10",
",",
"which",
"consists",
"of",
"42",
"amino",
"acids",
"and",
"has",
"a",
"loop",
"structure",
",",
"suppressed",
"IL-2",
"-driven",
"proliferation",
"of",
"all",
"IL-2",
"-dependent",
"cells",
"[",
"Kit225",
",",
"ED-40515",
"(",
"+",
")",
",",
"KT-3",
",",
"7-day",
"PHA-blasts",
",",
"and",
"fresh",
"peripheral",
"blood",
"mononuclear",
"cells",
"]",
"tested",
",",
"whereas",
"it",
"did",
"not",
"suppress",
"the",
"cell",
"growth",
"of",
"IL-2",
"-independent",
"cell",
"lines",
"(",
"Hut102",
",",
"Molt-4",
",",
"and",
"Jurkat",
")",
"."
] | [
"v3-bh10",
",",
"which",
"consists",
"of",
"42",
"amino",
"acids",
"and",
"has",
"a",
"loop",
"structure",
",",
"suppressed",
"il-2",
"-driven",
"proliferation",
"of",
"all",
"il-2",
"-dependent",
"cells",
"[",
"kit225",
",",
"ed-40515",
"(",
"+",
")",
",",
"kt-3",
",",
"7-day",
"pha-blasts",
",",
"and",
"fresh",
"peripheral",
"blood",
"mononuclear",
"cells",
"]",
"tested",
",",
"whereas",
"it",
"did",
"not",
"suppress",
"the",
"cell",
"growth",
"of",
"il-2",
"-independent",
"cell",
"lines",
"(",
"hut102",
",",
"molt-4",
",",
"and",
"jurkat",
")",
"."
] | [
"B-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_substructure",
"I-protein_substructure",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"suppressive",
"effect",
"was",
"also",
"seen",
"in",
"IL-2",
"-driven",
"cell",
"growth",
"of",
"CD8-positive",
"lymphocytes",
"purified",
"from",
"7-day",
"PHA-blasts",
",",
"indicating",
"that",
"CD4",
"molecules",
"were",
"not",
"required",
"for",
"the",
"suppression",
"."
] | [
"this",
"suppressive",
"effect",
"was",
"also",
"seen",
"in",
"il-2",
"-driven",
"cell",
"growth",
"of",
"cd8-positive",
"lymphocytes",
"purified",
"from",
"7-day",
"pha-blasts",
",",
"indicating",
"that",
"cd4",
"molecules",
"were",
"not",
"required",
"for",
"the",
"suppression",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"treatment",
"with",
"anti-",
"V3",
"loop",
"monoclonal",
"antibody",
"(",
"902",
"antibody",
")",
"completely",
"abolished",
"the",
"suppressive",
"effect",
"of",
"V3-BH10",
"."
] | [
"the",
"treatment",
"with",
"anti-",
"v3",
"loop",
"monoclonal",
"antibody",
"(",
"902",
"antibody",
")",
"completely",
"abolished",
"the",
"suppressive",
"effect",
"of",
"v3-bh10",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"B-protein_substructure",
"I-protein_substructure",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"V3-BH10",
"generated",
"the",
"arrest",
"of",
"Kit225",
"cells",
"and",
"also",
"purified",
"CD8-positive",
"lymphocytes",
"in",
"G1",
"phase",
"in",
"the",
"presence",
"of",
"IL-2",
"."
] | [
"in",
"addition",
",",
"v3-bh10",
"generated",
"the",
"arrest",
"of",
"kit225",
"cells",
"and",
"also",
"purified",
"cd8-positive",
"lymphocytes",
"in",
"g1",
"phase",
"in",
"the",
"presence",
"of",
"il-2",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"Neither",
"chromatin",
"condensation",
"nor",
"DNA",
"fragmentation",
"was",
"detected",
"in",
"Kit225",
"cells",
"cultured",
"with",
"V3-BH10",
"and",
"IL-2",
"."
] | [
"neither",
"chromatin",
"condensation",
"nor",
"dna",
"fragmentation",
"was",
"detected",
"in",
"kit225",
"cells",
"cultured",
"with",
"v3-bh10",
"and",
"il-2",
"."
] | [
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"O",
"B-protein_molecule",
"O"
] |
[
"V3-BH10",
"neither",
"blocked",
"radiolabeled",
"IL-2",
"binding",
"to",
"IL-2",
"receptors",
"nor",
"affected",
"tyrosyl",
"phosphorylation",
"of",
"several",
"cellular",
"proteins",
"(",
"p120",
",",
"p98",
",",
"p96",
",",
"p54",
",",
"and",
"p38",
")",
",",
"which",
"is",
"immediately",
"induced",
"by",
"IL-2",
"stimulation",
"."
] | [
"v3-bh10",
"neither",
"blocked",
"radiolabeled",
"il-2",
"binding",
"to",
"il-2",
"receptors",
"nor",
"affected",
"tyrosyl",
"phosphorylation",
"of",
"several",
"cellular",
"proteins",
"(",
"p120",
",",
"p98",
",",
"p96",
",",
"p54",
",",
"and",
"p38",
")",
",",
"which",
"is",
"immediately",
"induced",
"by",
"il-2",
"stimulation",
"."
] | [
"B-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"However",
",",
"V3-BH10",
"enhanced",
"IL-2",
"-induced",
"mRNA",
"expression",
"of",
"c-fos",
"but",
"not",
"c-myc",
"or",
"junB",
"."
] | [
"however",
",",
"v3-bh10",
"enhanced",
"il-2",
"-induced",
"mrna",
"expression",
"of",
"c-fos",
"but",
"not",
"c-myc",
"or",
"junb",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"O",
"B-protein_molecule",
"B-RNA_family_or_group",
"I-RNA_family_or_group",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"Thus",
",",
"the",
"binding",
"of",
"V3",
"loop",
"of",
"gp120",
"to",
"the",
"cell",
"surface",
"molecule",
"(",
"s",
")",
"appears",
"to",
"affect",
"intracellular",
"IL-2",
"signaling",
",",
"which",
"leads",
"to",
"the",
"suppression",
"of",
"IL-2",
"-induced",
"T",
"cell",
"growth"
] | [
"thus",
",",
"the",
"binding",
"of",
"v3",
"loop",
"of",
"gp120",
"to",
"the",
"cell",
"surface",
"molecule",
"(",
"s",
")",
"appears",
"to",
"affect",
"intracellular",
"il-2",
"signaling",
",",
"which",
"leads",
"to",
"the",
"suppression",
"of",
"il-2",
"-induced",
"t",
"cell",
"growth"
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_substructure",
"I-protein_substructure",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Multiple",
"NF-ATc",
"isoforms",
"with",
"individual",
"transcriptional",
"properties",
"are",
"synthesized",
"in",
"T",
"lymphocytes",
"."
] | [
"multiple",
"nf-atc",
"isoforms",
"with",
"individual",
"transcriptional",
"properties",
"are",
"synthesized",
"in",
"t",
"lymphocytes",
"."
] | [
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"The",
"transcription",
"factor",
"NF-ATc",
"that",
"controls",
"gene",
"expression",
"in",
"T",
"lymphocytes",
"and",
"embryonic",
"cardiac",
"cells",
"is",
"expressed",
"in",
"three",
"prominent",
"isoforms",
"."
] | [
"the",
"transcription",
"factor",
"nf-atc",
"that",
"controls",
"gene",
"expression",
"in",
"t",
"lymphocytes",
"and",
"embryonic",
"cardiac",
"cells",
"is",
"expressed",
"in",
"three",
"prominent",
"isoforms",
"."
] | [
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"is",
"due",
"to",
"alternative",
"splice/polyadenylation",
"events",
"that",
"lead",
"to",
"the",
"predominant",
"synthesis",
"of",
"two",
"long",
"isoforms",
"in",
"naive",
"T",
"cells",
"and",
"a",
"shorter",
"NF-ATc",
"isoform",
"in",
"effector",
"T",
"cells",
"."
] | [
"this",
"is",
"due",
"to",
"alternative",
"splice/polyadenylation",
"events",
"that",
"lead",
"to",
"the",
"predominant",
"synthesis",
"of",
"two",
"long",
"isoforms",
"in",
"naive",
"t",
"cells",
"and",
"a",
"shorter",
"nf-atc",
"isoform",
"in",
"effector",
"t",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Whereas",
"the",
"previously",
"described",
"isoform",
"NF-ATc",
"/A",
"contains",
"a",
"relatively",
"short",
"C",
"terminus",
",",
"the",
"longer",
"isoforms",
",",
"B",
"and",
"C",
",",
"span",
"extra",
"C-terminal",
"peptides",
"of",
"128",
"and",
"246",
"aa",
",",
"respectively",
"."
] | [
"whereas",
"the",
"previously",
"described",
"isoform",
"nf-atc",
"/a",
"contains",
"a",
"relatively",
"short",
"c",
"terminus",
",",
"the",
"longer",
"isoforms",
",",
"b",
"and",
"c",
",",
"span",
"extra",
"c-terminal",
"peptides",
"of",
"128",
"and",
"246",
"aa",
",",
"respectively",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-peptide",
"I-peptide",
"I-peptide",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"show",
"here",
"that",
"in",
"addition",
"to",
"the",
"strong",
"N-terminal",
"trans-activation",
"domain",
",",
"TAD-A",
",",
"which",
"is",
"common",
"to",
"all",
"three",
"NF-ATc",
"isoforms",
",",
"NF-ATc",
"/C",
"contains",
"a",
"second",
"trans-activation",
"domain",
",",
"TAD-B",
",",
"in",
"its",
"C-terminal",
"peptide",
"."
] | [
"we",
"show",
"here",
"that",
"in",
"addition",
"to",
"the",
"strong",
"n-terminal",
"trans-activation",
"domain",
",",
"tad-a",
",",
"which",
"is",
"common",
"to",
"all",
"three",
"nf-atc",
"isoforms",
",",
"nf-atc",
"/c",
"contains",
"a",
"second",
"trans-activation",
"domain",
",",
"tad-b",
",",
"in",
"its",
"c-terminal",
"peptide",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"I-protein_domain_or_region",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"B-peptide",
"I-peptide",
"O"
] |
[
"Various",
"stimuli",
"of",
"T",
"cells",
"that",
"induce",
"the",
"activity",
"of",
"TAD-A",
"also",
"enhance",
"the",
"activity",
"of",
"TAD-B",
",",
"but",
",",
"unlike",
"TAD-A",
",",
"TAD-B",
"remains",
"unphosphorylated",
"by",
"protein",
"from",
"12-O-tetradecanoyl",
"12-phorbol",
"13-acetate",
"-stimulated",
"T",
"cells",
"."
] | [
"various",
"stimuli",
"of",
"t",
"cells",
"that",
"induce",
"the",
"activity",
"of",
"tad-a",
"also",
"enhance",
"the",
"activity",
"of",
"tad-b",
",",
"but",
",",
"unlike",
"tad-a",
",",
"tad-b",
"remains",
"unphosphorylated",
"by",
"protein",
"from",
"12-o-tetradecanoyl",
"12-phorbol",
"13-acetate",
"-stimulated",
"t",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"O",
"B-protein_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"The",
"shorter",
"C-terminal",
"peptide",
"of",
"isoform",
"NF-ATc",
"/B",
"exerts",
"a",
"suppressive",
"transcriptional",
"effect",
"."
] | [
"the",
"shorter",
"c-terminal",
"peptide",
"of",
"isoform",
"nf-atc",
"/b",
"exerts",
"a",
"suppressive",
"transcriptional",
"effect",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-peptide",
"I-peptide",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"These",
"properties",
"of",
"NF-ATc",
"/",
"B",
"and",
"-",
"C",
"might",
"be",
"of",
"importance",
"for",
"gene",
"regulation",
"in",
"naive",
"T",
"lymphocytes",
"in",
"which",
"NF-ATc",
"/",
"B",
"and",
"-C",
"are",
"predominantly",
"synthesized",
"."
] | [
"these",
"properties",
"of",
"nf-atc",
"/",
"b",
"and",
"-",
"c",
"might",
"be",
"of",
"importance",
"for",
"gene",
"regulation",
"in",
"naive",
"t",
"lymphocytes",
"in",
"which",
"nf-atc",
"/",
"b",
"and",
"-c",
"are",
"predominantly",
"synthesized",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-cell_type",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"Oct-2",
"transcription",
"factor",
"."
] | [
"the",
"oct-2",
"transcription",
"factor",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"The",
"Oct-2",
"transcription",
"factor",
"is",
"a",
"member",
"of",
"the",
"POU",
"(",
"Pit-Oct-Unc",
")",
"family",
"of",
"transcription",
"factors",
"and",
"is",
"expressed",
"only",
"in",
"B",
"lymphocytes",
"and",
"in",
"neuronal",
"cells",
"but",
"not",
"in",
"other",
"cell",
"types",
"."
] | [
"the",
"oct-2",
"transcription",
"factor",
"is",
"a",
"member",
"of",
"the",
"pou",
"(",
"pit-oct-unc",
")",
"family",
"of",
"transcription",
"factors",
"and",
"is",
"expressed",
"only",
"in",
"b",
"lymphocytes",
"and",
"in",
"neuronal",
"cells",
"but",
"not",
"in",
"other",
"cell",
"types",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"primary",
"RNA",
"transcript",
"of",
"the",
"gene",
"is",
"subject",
"to",
"alternative",
"splicing",
"to",
"yield",
"different",
"variants",
"which",
"can",
"either",
"activate",
"or",
"repress",
"gene",
"expression",
"."
] | [
"the",
"primary",
"rna",
"transcript",
"of",
"the",
"gene",
"is",
"subject",
"to",
"alternative",
"splicing",
"to",
"yield",
"different",
"variants",
"which",
"can",
"either",
"activate",
"or",
"repress",
"gene",
"expression",
"."
] | [
"O",
"B-RNA_family_or_group",
"I-RNA_family_or_group",
"I-RNA_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"forms",
"produced",
"in",
"B",
"lymphocytes",
"have",
"a",
"predominantly",
"activating",
"effect",
"on",
"gene",
"expression",
"whereas",
"those",
"produced",
"in",
"neuronal",
"cells",
"have",
"a",
"predominantly",
"inhibitory",
"effect",
"and",
"can",
"repress",
"the",
"expression",
"of",
"both",
"the",
"herpes",
"simplex",
"virus",
"immediate-early",
"genes",
"and",
"the",
"cellular",
"tyrosine",
"hydroxylase",
"gene",
"."
] | [
"the",
"forms",
"produced",
"in",
"b",
"lymphocytes",
"have",
"a",
"predominantly",
"activating",
"effect",
"on",
"gene",
"expression",
"whereas",
"those",
"produced",
"in",
"neuronal",
"cells",
"have",
"a",
"predominantly",
"inhibitory",
"effect",
"and",
"can",
"repress",
"the",
"expression",
"of",
"both",
"the",
"herpes",
"simplex",
"virus",
"immediate-early",
"genes",
"and",
"the",
"cellular",
"tyrosine",
"hydroxylase",
"gene",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-virus",
"I-virus",
"I-virus",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O"
] |
[
"Thus",
"Oct-2",
"plays",
"an",
"important",
"role",
"in",
"the",
"regulation",
"of",
"cellular",
"gene",
"expression",
"in",
"both",
"B",
"cells",
"and",
"neuronal",
"cells",
"as",
"well",
"as",
"in",
"the",
"control",
"of",
"viral",
"latency",
"."
] | [
"thus",
"oct-2",
"plays",
"an",
"important",
"role",
"in",
"the",
"regulation",
"of",
"cellular",
"gene",
"expression",
"in",
"both",
"b",
"cells",
"and",
"neuronal",
"cells",
"as",
"well",
"as",
"in",
"the",
"control",
"of",
"viral",
"latency",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Nuclear",
"NF-ATp",
"is",
"a",
"hallmark",
"of",
"unstimulated",
"B",
"cells",
"from",
"B-CLL",
"patients",
"."
] | [
"nuclear",
"nf-atp",
"is",
"a",
"hallmark",
"of",
"unstimulated",
"b",
"cells",
"from",
"b-cll",
"patients",
"."
] | [
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-multi_cell",
"B-multi_cell",
"O"
] |
[
"B",
"lymphocytes",
"from",
"the",
"peripheral",
"blood",
"of",
"patients",
"with",
"chronic",
"lymphocytic",
"leukaemia",
"(",
"CLL",
")",
"were",
"analysed",
"for",
"the",
"nuclear",
"presence",
"and",
"DNA",
"binding",
"of",
"a",
"panel",
"of",
"transcription",
"factors",
"which",
"are",
"involved",
"in",
"the",
"gene",
"control",
"of",
"lymphoid",
"cells",
"."
] | [
"b",
"lymphocytes",
"from",
"the",
"peripheral",
"blood",
"of",
"patients",
"with",
"chronic",
"lymphocytic",
"leukaemia",
"(",
"cll",
")",
"were",
"analysed",
"for",
"the",
"nuclear",
"presence",
"and",
"dna",
"binding",
"of",
"a",
"panel",
"of",
"transcription",
"factors",
"which",
"are",
"involved",
"in",
"the",
"gene",
"control",
"of",
"lymphoid",
"cells",
"."
] | [
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-tissue",
"I-tissue",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"The",
"following",
"transcription",
"factors",
"were",
"studied",
":",
"the",
"Octamer",
"factors",
"Oct-1",
"and",
"Oct-2",
",",
"members",
"of",
"the",
"AP-1",
"factor",
"family",
",",
"NF-AT",
"factors",
",",
"in",
"particular",
"NF-ATp",
",",
"and",
"members",
"of",
"the",
"Rel/NF-kB",
"family",
"."
] | [
"the",
"following",
"transcription",
"factors",
"were",
"studied",
":",
"the",
"octamer",
"factors",
"oct-1",
"and",
"oct-2",
",",
"members",
"of",
"the",
"ap-1",
"factor",
"family",
",",
"nf-at",
"factors",
",",
"in",
"particular",
"nf-atp",
",",
"and",
"members",
"of",
"the",
"rel/nf-kb",
"family",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"We",
"show",
"that",
"the",
"constitutive",
"nuclear",
"translocation",
"of",
"NF-ATp",
",",
"a",
"member",
"of",
"the",
"growing",
"family",
"of",
"NF-AT",
"factors",
",",
"is",
"a",
"hallmark",
"of",
"nonstimulated",
"B",
"cells",
"from",
"CLL",
"patients",
"that",
"distinguishes",
"B-CLL",
"cells",
"from",
"'normal'",
"B",
"lymphocytes",
"."
] | [
"we",
"show",
"that",
"the",
"constitutive",
"nuclear",
"translocation",
"of",
"nf-atp",
",",
"a",
"member",
"of",
"the",
"growing",
"family",
"of",
"nf-at",
"factors",
",",
"is",
"a",
"hallmark",
"of",
"nonstimulated",
"b",
"cells",
"from",
"cll",
"patients",
"that",
"distinguishes",
"b-cll",
"cells",
"from",
"'normal'",
"b",
"lymphocytes",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-other_name",
"B-multi_cell",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-cell_type",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Constitutive",
"nuclear",
"appearance",
"was",
"also",
"observed",
"for",
"NF-kB2/p52",
"."
] | [
"constitutive",
"nuclear",
"appearance",
"was",
"also",
"observed",
"for",
"nf-kb2/p52",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Constitutive",
"binding",
"of",
"further",
"factor",
"proteins",
"to",
"DNA",
",",
"such",
"as",
"JunD",
",",
"c-Fos",
"and",
"FosB",
",",
"was",
"detected",
"in",
"several",
"patients",
"whereas",
"the",
"localisation",
"and",
"DNA",
"binding",
"of",
"other",
"factors",
"such",
"as",
"c-Jun",
",",
"RelA/p65",
"and",
"c-Rel",
"was",
"unaltered",
"."
] | [
"constitutive",
"binding",
"of",
"further",
"factor",
"proteins",
"to",
"dna",
",",
"such",
"as",
"jund",
",",
"c-fos",
"and",
"fosb",
",",
"was",
"detected",
"in",
"several",
"patients",
"whereas",
"the",
"localisation",
"and",
"dna",
"binding",
"of",
"other",
"factors",
"such",
"as",
"c-jun",
",",
"rela/p65",
"and",
"c-rel",
"was",
"unaltered",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_complex",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"It",
"is",
"remarkable",
"that",
"in",
"B-CLL",
"cells",
"the",
"nuclear",
"appearance",
"and",
"DNA",
"binding",
"of",
"specific",
"transcription",
"factors",
"is",
"dramatically",
"affected",
"whereas",
"other",
"members",
"of",
"the",
"same",
"factor",
"family",
"remained",
"unaltered",
"in",
"these",
"leukemic",
"cells",
"."
] | [
"it",
"is",
"remarkable",
"that",
"in",
"b-cll",
"cells",
"the",
"nuclear",
"appearance",
"and",
"dna",
"binding",
"of",
"specific",
"transcription",
"factors",
"is",
"dramatically",
"affected",
"whereas",
"other",
"members",
"of",
"the",
"same",
"factor",
"family",
"remained",
"unaltered",
"in",
"these",
"leukemic",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"It",
"remains",
"to",
"be",
"shown",
"which",
"molecular",
"events",
"lead",
"to",
"the",
"specific",
"'pre-activation'",
",",
"i",
".",
"e",
"."
] | [
"it",
"remains",
"to",
"be",
"shown",
"which",
"molecular",
"events",
"lead",
"to",
"the",
"specific",
"'pre-activation'",
",",
"i",
".",
"e",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"constitutive",
"nuclear",
"translocation",
"and",
"DNA",
"binding",
",",
"of",
"these",
"members",
"of",
"NF-AT",
",",
"NF-kB",
"and",
"AP-1",
"factor",
"families",
"."
] | [
"constitutive",
"nuclear",
"translocation",
"and",
"dna",
"binding",
",",
"of",
"these",
"members",
"of",
"nf-at",
",",
"nf-kb",
"and",
"ap-1",
"factor",
"families",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"Tissue-specific",
"expression",
"of",
"the",
"platelet",
"GPIIb",
"gene",
"."
] | [
"tissue-specific",
"expression",
"of",
"the",
"platelet",
"gpiib",
"gene",
"."
] | [
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"One",
"of",
"the",
"major",
"objectives",
"in",
"the",
"study",
"of",
"thrombogenesis",
"is",
"to",
"determine",
"the",
"mechanisms",
"by",
"which",
"a",
"hematopoietic",
"progenitor",
"is",
"activated",
"and",
"committed",
"to",
"the",
"megakaryocytic",
"lineage",
"."
] | [
"one",
"of",
"the",
"major",
"objectives",
"in",
"the",
"study",
"of",
"thrombogenesis",
"is",
"to",
"determine",
"the",
"mechanisms",
"by",
"which",
"a",
"hematopoietic",
"progenitor",
"is",
"activated",
"and",
"committed",
"to",
"the",
"megakaryocytic",
"lineage",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"Recent",
"development",
"of",
"primary",
"cultures",
"of",
"human",
"megakaryocytes",
"and",
"the",
"molecular",
"cloning",
"of",
"genes",
"that",
"are",
"specific",
"to",
"this",
"lineage",
"offer",
"the",
"possibility",
"of",
"getting",
"some",
"insights",
"into",
"the",
"genetic",
"mechanisms",
"that",
"control",
"megakaryocytopoiesis",
"."
] | [
"recent",
"development",
"of",
"primary",
"cultures",
"of",
"human",
"megakaryocytes",
"and",
"the",
"molecular",
"cloning",
"of",
"genes",
"that",
"are",
"specific",
"to",
"this",
"lineage",
"offer",
"the",
"possibility",
"of",
"getting",
"some",
"insights",
"into",
"the",
"genetic",
"mechanisms",
"that",
"control",
"megakaryocytopoiesis",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"One",
"gene",
"of",
"interest",
"is",
"the",
"glycoprotein",
"IIb",
"(",
"GPIIb",
")",
"gene",
";",
"GPIIb",
",",
"the",
"alpha",
"subunit",
"of",
"the",
"platelet",
"cytoadhesin",
"GPIIb-IIIa",
",",
"is",
"produced",
"in",
"megakaryocytes",
"at",
"an",
"early",
"stage",
"of",
"the",
"differentiation",
",",
"whereas",
"the",
"other",
"subunit",
"of",
"this",
"complex",
",",
"GPIIIa",
",",
"is",
"expressed",
"in",
"other",
"cells",
"."
] | [
"one",
"gene",
"of",
"interest",
"is",
"the",
"glycoprotein",
"iib",
"(",
"gpiib",
")",
"gene",
";",
"gpiib",
",",
"the",
"alpha",
"subunit",
"of",
"the",
"platelet",
"cytoadhesin",
"gpiib-iiia",
",",
"is",
"produced",
"in",
"megakaryocytes",
"at",
"an",
"early",
"stage",
"of",
"the",
"differentiation",
",",
"whereas",
"the",
"other",
"subunit",
"of",
"this",
"complex",
",",
"gpiiia",
",",
"is",
"expressed",
"in",
"other",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-protein_subunit",
"I-protein_subunit",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"For",
"these",
"reasons",
",",
"the",
"5'-flanking",
"region",
"of",
"the",
"GPIIb",
"gene",
"was",
"used",
"to",
"identify",
"the",
"regions",
"that",
"interact",
"with",
"DNA-binding",
"nuclear",
"factors",
"."
] | [
"for",
"these",
"reasons",
",",
"the",
"5'-flanking",
"region",
"of",
"the",
"gpiib",
"gene",
"was",
"used",
"to",
"identify",
"the",
"regions",
"that",
"interact",
"with",
"dna-binding",
"nuclear",
"factors",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"A",
"fragment",
"extending",
"from",
"-643",
"to",
"+33",
"is",
"capable",
"of",
"controlling",
"the",
"tissue-specific",
"expression",
"of",
"the",
"CAT",
"gene",
"in",
"transfection",
"experiments",
"."
] | [
"a",
"fragment",
"extending",
"from",
"-643",
"to",
"+33",
"is",
"capable",
"of",
"controlling",
"the",
"tissue-specific",
"expression",
"of",
"the",
"cat",
"gene",
"in",
"transfection",
"experiments",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-DNA_family_or_group",
"I-DNA_family_or_group",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Within",
"this",
"region",
",",
"we",
"have",
"identified",
"several",
"sequences",
"that",
"are",
"implicated",
"in",
"DNA",
"protein",
"interactions",
"as",
"shown",
"in",
"DNAse",
"I",
"footprints",
"and",
"gel",
"mobility",
"shift",
"assays",
"."
] | [
"within",
"this",
"region",
",",
"we",
"have",
"identified",
"several",
"sequences",
"that",
"are",
"implicated",
"in",
"dna",
"protein",
"interactions",
"as",
"shown",
"in",
"dnase",
"i",
"footprints",
"and",
"gel",
"mobility",
"shift",
"assays",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"One",
"region",
",",
"centered",
"at",
"-54",
",",
"is",
"similar",
"to",
"a",
"nuclear",
"factor",
"E1-binding",
"site",
",",
"and",
"a",
"region",
"located",
"at",
"position",
"-233",
"contains",
"a",
"CCAAT",
"motif",
"."
] | [
"one",
"region",
",",
"centered",
"at",
"-54",
",",
"is",
"similar",
"to",
"a",
"nuclear",
"factor",
"e1-binding",
"site",
",",
"and",
"a",
"region",
"located",
"at",
"position",
"-233",
"contains",
"a",
"ccaat",
"motif",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O"
] |
[
"Two",
"domains",
"centered",
"at",
"positions",
"-345",
"and",
"-540",
",",
"respectively",
",",
"bind",
"proteins",
"that",
"are",
"present",
"in",
"megakaryocytic",
"cells",
"and",
"nonrelated",
"cells",
"as",
"well",
"."
] | [
"two",
"domains",
"centered",
"at",
"positions",
"-345",
"and",
"-540",
",",
"respectively",
",",
"bind",
"proteins",
"that",
"are",
"present",
"in",
"megakaryocytic",
"cells",
"and",
"nonrelated",
"cells",
"as",
"well",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Finally",
",",
"two",
"other",
"domains",
",",
"located",
"at",
"positions",
"-460",
"and",
"-510",
",",
"interact",
"with",
"proteins",
"that",
"are",
"only",
"present",
"in",
"megakaryocytic",
"cells",
"."
] | [
"finally",
",",
"two",
"other",
"domains",
",",
"located",
"at",
"positions",
"-460",
"and",
"-510",
",",
"interact",
"with",
"proteins",
"that",
"are",
"only",
"present",
"in",
"megakaryocytic",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"deletion",
"of",
"the",
"region",
"containing",
"these",
"two",
"domains",
"results",
"in",
"a",
"significant",
"decrease",
"of",
"the",
"promoter",
"activity",
"."
] | [
"in",
"addition",
",",
"deletion",
"of",
"the",
"region",
"containing",
"these",
"two",
"domains",
"results",
"in",
"a",
"significant",
"decrease",
"of",
"the",
"promoter",
"activity",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O"
] |
[
"It",
"is",
"very",
"likely",
"that",
"these",
"domains",
"bind",
"megakaryocyte-specific",
"nuclear",
"proteins",
"acting",
"as",
"positive",
"transcription",
"factors",
"."
] | [
"it",
"is",
"very",
"likely",
"that",
"these",
"domains",
"bind",
"megakaryocyte-specific",
"nuclear",
"proteins",
"acting",
"as",
"positive",
"transcription",
"factors",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"B-other_name",
"O",
"O"
] |
[
"Growth",
"regulation",
"and",
"cellular",
"changes",
"during",
"differentiation",
"of",
"human",
"prostatic",
"cancer",
"LNCaP",
"cells",
"as",
"induced",
"by",
"T",
"lymphocyte-conditioned",
"medium",
"."
] | [
"growth",
"regulation",
"and",
"cellular",
"changes",
"during",
"differentiation",
"of",
"human",
"prostatic",
"cancer",
"lncap",
"cells",
"as",
"induced",
"by",
"t",
"lymphocyte-conditioned",
"medium",
"."
] | [
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"B-other_name",
"I-other_name",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O"
] |
[
"Human",
"prostatic",
"epithelial",
"cells",
"from",
"an",
"androgen-dependent",
"LNCaP",
"cell",
"line",
"were",
"examined",
"in",
"response",
"to",
"conditioned",
"medium",
"(",
"CM",
")",
"derived",
"from",
"phytohemagglutinin",
"(",
"PHA",
")",
"-stimulated",
"lymphocytes",
"."
] | [
"human",
"prostatic",
"epithelial",
"cells",
"from",
"an",
"androgen-dependent",
"lncap",
"cell",
"line",
"were",
"examined",
"in",
"response",
"to",
"conditioned",
"medium",
"(",
"cm",
")",
"derived",
"from",
"phytohemagglutinin",
"(",
"pha",
")",
"-stimulated",
"lymphocytes",
"."
] | [
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"B-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"I-cell_line",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"O"
] |
[
"Addition",
"of",
"CM",
"caused",
"a",
"greater",
"than",
"70%",
"reduction",
"of",
"cell",
"proliferation",
"by",
"cell",
"counting",
"and",
"cell",
"cycle",
"."
] | [
"addition",
"of",
"cm",
"caused",
"a",
"greater",
"than",
"70%",
"reduction",
"of",
"cell",
"proliferation",
"by",
"cell",
"counting",
"and",
"cell",
"cycle",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"These",
"cells",
"showed",
"G1",
"phase",
"arrest",
"and",
"the",
"clonogenicity",
"was",
"reduced",
"."
] | [
"these",
"cells",
"showed",
"g1",
"phase",
"arrest",
"and",
"the",
"clonogenicity",
"was",
"reduced",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"growth-modulating",
"effect",
"was",
"dose-dependent",
"and",
"not",
"due",
"to",
"cell",
"lysis",
"or",
"apoptosis",
"."
] | [
"the",
"growth-modulating",
"effect",
"was",
"dose-dependent",
"and",
"not",
"due",
"to",
"cell",
"lysis",
"or",
"apoptosis",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"binding",
"of",
"androgen",
"to",
"androgen",
"receptor",
"on",
"these",
"cells",
"showed",
"approximately",
"50%",
"reduction",
",",
"underlining",
"a",
"proliferation",
"reduction",
"mechanism",
"."
] | [
"the",
"binding",
"of",
"androgen",
"to",
"androgen",
"receptor",
"on",
"these",
"cells",
"showed",
"approximately",
"50%",
"reduction",
",",
"underlining",
"a",
"proliferation",
"reduction",
"mechanism",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-lipid",
"O",
"B-lipid",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"The",
"prostate-specific",
"antigen",
"(",
"PSA",
")",
"was",
"downregulated",
"to",
"approximately",
"75%",
"during",
"the",
"process",
"."
] | [
"the",
"prostate-specific",
"antigen",
"(",
"psa",
")",
"was",
"downregulated",
"to",
"approximately",
"75%",
"during",
"the",
"process",
"."
] | [
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"Cell",
"morphology",
"showed",
"dendritic",
"processes",
"extending",
"from",
"cytoplasm",
"and",
"other",
"neuroendocrine",
"cell",
"characteristics",
"."
] | [
"cell",
"morphology",
"showed",
"dendritic",
"processes",
"extending",
"from",
"cytoplasm",
"and",
"other",
"neuroendocrine",
"cell",
"characteristics",
"."
] | [
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_component",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"expression",
"of",
"several",
"cytoskeleton",
"and",
"intracellular",
"proteins",
"increased",
"as",
"determined",
"by",
"immunostaining",
"on",
"slides",
"and",
"by",
"ELISA",
"procedures",
"."
] | [
"the",
"expression",
"of",
"several",
"cytoskeleton",
"and",
"intracellular",
"proteins",
"increased",
"as",
"determined",
"by",
"immunostaining",
"on",
"slides",
"and",
"by",
"elisa",
"procedures",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"These",
"included",
"vimentin",
",",
"correlating",
"to",
"cell",
"shape",
"changes",
",",
"cytokeratins",
"8",
"and",
"18",
",",
"associated",
"with",
"differentiated",
"cell",
"types",
"of",
"prostate",
"epithelia",
",",
"and",
"neuron-specific",
"enolase",
"and",
"serotonin",
",",
"associated",
"with",
"neuroendocrine",
"cells",
"."
] | [
"these",
"included",
"vimentin",
",",
"correlating",
"to",
"cell",
"shape",
"changes",
",",
"cytokeratins",
"8",
"and",
"18",
",",
"associated",
"with",
"differentiated",
"cell",
"types",
"of",
"prostate",
"epithelia",
",",
"and",
"neuron-specific",
"enolase",
"and",
"serotonin",
",",
"associated",
"with",
"neuroendocrine",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"B-tissue",
"I-tissue",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"From",
"these",
"cellular",
"changes",
",",
"we",
"can",
"infer",
"that",
"the",
"cell",
"growth",
"was",
"modulated",
"along",
"with",
"induction",
"of",
"terminal",
"differentiation",
"."
] | [
"from",
"these",
"cellular",
"changes",
",",
"we",
"can",
"infer",
"that",
"the",
"cell",
"growth",
"was",
"modulated",
"along",
"with",
"induction",
"of",
"terminal",
"differentiation",
"."
] | [
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"Activated",
"T",
"cells",
"were",
"demonstrated",
"to",
"be",
"important",
"in",
"providing",
"the",
"modulating",
"activity",
"."
] | [
"activated",
"t",
"cells",
"were",
"demonstrated",
"to",
"be",
"important",
"in",
"providing",
"the",
"modulating",
"activity",
"."
] | [
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"This",
"growth",
"modulator",
"was",
"semipurified",
"and",
"had",
"an",
"estimated",
"molecular",
"weight",
"13",
",",
"000",
"to",
"24",
",",
"000",
"Da",
"."
] | [
"this",
"growth",
"modulator",
"was",
"semipurified",
"and",
"had",
"an",
"estimated",
"molecular",
"weight",
"13",
",",
"000",
"to",
"24",
",",
"000",
"da",
"."
] | [
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"The",
"activity",
"was",
"determined",
"to",
"be",
"distinct",
"from",
"TGF",
",",
"TNF",
",",
"and",
"some",
"commonly",
"known",
"lymphokines",
"."
] | [
"the",
"activity",
"was",
"determined",
"to",
"be",
"distinct",
"from",
"tgf",
",",
"tnf",
",",
"and",
"some",
"commonly",
"known",
"lymphokines",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"The",
"interaction",
"between",
"lymphoid",
"and",
"prostatic",
"cells",
"in",
"growth",
"and",
"development",
"is",
"described",
"."
] | [
"the",
"interaction",
"between",
"lymphoid",
"and",
"prostatic",
"cells",
"in",
"growth",
"and",
"development",
"is",
"described",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"New",
"immunosuppressive",
"drug",
"PNU156804",
"blocks",
"IL-2",
"-dependent",
"proliferation",
"and",
"NF-kappa",
"B",
"and",
"AP-1",
"activation",
"."
] | [
"new",
"immunosuppressive",
"drug",
"pnu156804",
"blocks",
"il-2",
"-dependent",
"proliferation",
"and",
"nf-kappa",
"b",
"and",
"ap-1",
"activation",
"."
] | [
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"had",
"previously",
"shown",
"that",
"the",
"drug",
"undecylprodigiosin",
"(",
"UP",
")",
"blocks",
"human",
"lymphocyte",
"proliferation",
"in",
"vitro",
"."
] | [
"we",
"had",
"previously",
"shown",
"that",
"the",
"drug",
"undecylprodigiosin",
"(",
"up",
")",
"blocks",
"human",
"lymphocyte",
"proliferation",
"in",
"vitro",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"now",
"investigated",
"the",
"mechanism",
"of",
"action",
"of",
"a",
"new",
"analogue",
"of",
"UP",
",",
"PNU156804",
",",
"which",
"shows",
"a",
"more",
"favorable",
"activity",
"profile",
"than",
"UP",
"in",
"mice",
"."
] | [
"we",
"have",
"now",
"investigated",
"the",
"mechanism",
"of",
"action",
"of",
"a",
"new",
"analogue",
"of",
"up",
",",
"pnu156804",
",",
"which",
"shows",
"a",
"more",
"favorable",
"activity",
"profile",
"than",
"up",
"in",
"mice",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-multi_cell",
"O"
] |
[
"We",
"demonstrate",
"here",
"that",
"the",
"biological",
"effect",
"of",
"PNU156804",
"in",
"vitro",
"is",
"indistinguishable",
"from",
"UP",
":",
"PNU156804",
"blocks",
"human",
"T",
"cell",
"proliferation",
"in",
"mid-late",
"G1",
",",
"as",
"determined",
"by",
"cell",
"cycle",
"analysis",
",",
"expression",
"of",
"cyclins",
",",
"and",
"cyclin-dependent",
"kinases",
"and",
"retinoblastoma",
"phosphorylation",
"."
] | [
"we",
"demonstrate",
"here",
"that",
"the",
"biological",
"effect",
"of",
"pnu156804",
"in",
"vitro",
"is",
"indistinguishable",
"from",
"up",
":",
"pnu156804",
"blocks",
"human",
"t",
"cell",
"proliferation",
"in",
"mid-late",
"g1",
",",
"as",
"determined",
"by",
"cell",
"cycle",
"analysis",
",",
"expression",
"of",
"cyclins",
",",
"and",
"cyclin-dependent",
"kinases",
"and",
"retinoblastoma",
"phosphorylation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O"
] |
[
"In",
"addition",
",",
"we",
"show",
"that",
"PNU156804",
"does",
"not",
"block",
"significantly",
"the",
"induction",
"of",
"either",
"IL-2",
"or",
"IL-2R",
"alpha-",
"and",
"gamma-",
"chains",
"but",
"inhibits",
"IL-2",
"-dependent",
"T",
"cell",
"proliferation",
"."
] | [
"in",
"addition",
",",
"we",
"show",
"that",
"pnu156804",
"does",
"not",
"block",
"significantly",
"the",
"induction",
"of",
"either",
"il-2",
"or",
"il-2r",
"alpha-",
"and",
"gamma-",
"chains",
"but",
"inhibits",
"il-2",
"-dependent",
"t",
"cell",
"proliferation",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"We",
"have",
"investigated",
"several",
"molecular",
"pathways",
"that",
"are",
"known",
"to",
"be",
"activated",
"by",
"IL-2",
"in",
"T",
"cells",
"."
] | [
"we",
"have",
"investigated",
"several",
"molecular",
"pathways",
"that",
"are",
"known",
"to",
"be",
"activated",
"by",
"il-2",
"in",
"t",
"cells",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"We",
"show",
"that",
"PNU156804",
"does",
"not",
"inhibit",
"c-myc",
"and",
"bcl-2",
"mRNA",
"induction",
"."
] | [
"we",
"show",
"that",
"pnu156804",
"does",
"not",
"inhibit",
"c-myc",
"and",
"bcl-2",
"mrna",
"induction",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"On",
"the",
"other",
"hand",
",",
"PNU156804",
"efficiently",
"inhibits",
"the",
"activation",
"of",
"the",
"NF-kappa",
"B",
"and",
"AP-1",
"transcription",
"factors",
"."
] | [
"on",
"the",
"other",
"hand",
",",
"pnu156804",
"efficiently",
"inhibits",
"the",
"activation",
"of",
"the",
"nf-kappa",
"b",
"and",
"ap-1",
"transcription",
"factors",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O"
] |
[
"PNU156804",
"inhibition",
"of",
"NF-kappa",
"B",
"activation",
"is",
"due",
"to",
"the",
"inhibition",
"of",
"the",
"degradation",
"of",
"I",
"kappa",
"B-alpha",
"and",
"I",
"kappa",
"B-beta",
"."
] | [
"pnu156804",
"inhibition",
"of",
"nf-kappa",
"b",
"activation",
"is",
"due",
"to",
"the",
"inhibition",
"of",
"the",
"degradation",
"of",
"i",
"kappa",
"b-alpha",
"and",
"i",
"kappa",
"b-beta",
"."
] | [
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O"
] |
[
"PNU156804",
"action",
"is",
"restricted",
"to",
"some",
"signaling",
"pathways",
";",
"it",
"does",
"not",
"affect",
"NF-kappa",
"B",
"activation",
"by",
"PMA",
"in",
"T",
"cells",
"but",
"blocks",
"that",
"induced",
"by",
"CD40",
"cross-linking",
"in",
"B",
"lymphocytes",
"."
] | [
"pnu156804",
"action",
"is",
"restricted",
"to",
"some",
"signaling",
"pathways",
";",
"it",
"does",
"not",
"affect",
"nf-kappa",
"b",
"activation",
"by",
"pma",
"in",
"t",
"cells",
"but",
"blocks",
"that",
"induced",
"by",
"cd40",
"cross-linking",
"in",
"b",
"lymphocytes",
"."
] | [
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_complex",
"I-protein_complex",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O"
] |
[
"We",
"conclude",
"that",
"the",
"prodigiosin",
"family",
"of",
"immunosuppressants",
"is",
"a",
"new",
"family",
"of",
"molecules",
"that",
"show",
"a",
"novel",
"target",
"specificity",
"clearly",
"distinct",
"from",
"that",
"of",
"other",
"immunosuppressive",
"drugs",
"such",
"as",
"cyclosporin",
"A",
",",
"FK506",
",",
"and",
"rapamycin",
"."
] | [
"we",
"conclude",
"that",
"the",
"prodigiosin",
"family",
"of",
"immunosuppressants",
"is",
"a",
"new",
"family",
"of",
"molecules",
"that",
"show",
"a",
"novel",
"target",
"specificity",
"clearly",
"distinct",
"from",
"that",
"of",
"other",
"immunosuppressive",
"drugs",
"such",
"as",
"cyclosporin",
"a",
",",
"fk506",
",",
"and",
"rapamycin",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_name",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"I-other_organic_compound",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O",
"O",
"B-other_organic_compound",
"O"
] |
[
"musculin",
":",
"a",
"murine",
"basic",
"helix-loop-helix",
"transcription",
"factor",
"gene",
"expressed",
"in",
"embryonic",
"skeletal",
"muscle",
"."
] | [
"musculin",
":",
"a",
"murine",
"basic",
"helix-loop-helix",
"transcription",
"factor",
"gene",
"expressed",
"in",
"embryonic",
"skeletal",
"muscle",
"."
] | [
"B-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"I-DNA_domain_or_region",
"O",
"O",
"B-tissue",
"I-tissue",
"I-tissue",
"O"
] |
[
"We",
"describe",
"the",
"embryonic",
"expression",
"of",
"musculin",
",",
"a",
"new",
"murine",
"member",
"of",
"the",
"bHLH",
"family",
"of",
"transcription",
"factors",
"."
] | [
"we",
"describe",
"the",
"embryonic",
"expression",
"of",
"musculin",
",",
"a",
"new",
"murine",
"member",
"of",
"the",
"bhlh",
"family",
"of",
"transcription",
"factors",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O",
"B-protein_family_or_group",
"I-protein_family_or_group",
"O"
] |
[
"Musculin",
"protein",
"is",
"closely",
"related",
"to",
"human",
"ABF-1",
",",
"which",
"is",
"expressed",
"in",
"activated",
"B",
"cells",
",",
"and",
"to",
"epicardin/capsulin/Pod-1",
",",
"which",
"is",
"expressed",
"in",
"branchial",
"myoblasts",
",",
"visceral",
"and",
"urogenital",
"mesoderm",
"and",
"epicardium",
"."
] | [
"musculin",
"protein",
"is",
"closely",
"related",
"to",
"human",
"abf-1",
",",
"which",
"is",
"expressed",
"in",
"activated",
"b",
"cells",
",",
"and",
"to",
"epicardin/capsulin/pod-1",
",",
"which",
"is",
"expressed",
"in",
"branchial",
"myoblasts",
",",
"visceral",
"and",
"urogenital",
"mesoderm",
"and",
"epicardium",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"I-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-cell_type",
"I-cell_type",
"O",
"O",
"O",
"B-tissue",
"I-tissue",
"O",
"B-tissue",
"O"
] |
[
"In",
"situ",
"hybridisation",
"revealed",
"musculin",
"expression",
"in",
"embryos",
"was",
"largely",
"restricted",
"to",
"the",
"embryonic",
"skeletal",
"muscle",
"lineage",
"."
] | [
"in",
"situ",
"hybridisation",
"revealed",
"musculin",
"expression",
"in",
"embryos",
"was",
"largely",
"restricted",
"to",
"the",
"embryonic",
"skeletal",
"muscle",
"lineage",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-protein_molecule",
"O",
"O",
"B-multi_cell",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-tissue",
"I-tissue",
"I-tissue",
"O",
"O"
] |
[
"While",
"all",
"skeletal",
"muscles",
"expressed",
"the",
"gene",
",",
"only",
"a",
"subset",
"of",
"myocytes",
"within",
"each",
"muscle",
"were",
"positive",
",",
"indicating",
"molecular",
"heterogeneity",
"within",
"fetal",
"muscle",
"."
] | [
"while",
"all",
"skeletal",
"muscles",
"expressed",
"the",
"gene",
",",
"only",
"a",
"subset",
"of",
"myocytes",
"within",
"each",
"muscle",
"were",
"positive",
",",
"indicating",
"molecular",
"heterogeneity",
"within",
"fetal",
"muscle",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"B-other_name",
"I-other_name",
"O",
"B-tissue",
"I-tissue",
"O"
] |
[
"Copyright",
"1998",
"Elsevier",
"Science",
"Ireland",
"Ltd",
"."
] | [
"copyright",
"1998",
"elsevier",
"science",
"ireland",
"ltd",
"."
] | [
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O",
"O"
] |
Subsets and Splits