disi-unibo-nlp/bc4chemd · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 2 298	ner_tags listlengths 2 298
[ "When", "AD", "-", "C", "was", "incubated", "with", "phosphatase", ",", "Rib", "-", "C1", "and", "Rib", "-", "C2", "formed", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "3", "." ]	[ "O", "O" ]
[ "To", "understand", "the", "in", "vivo", "relevance", "of", "this", "metabolic", "pathway", ",", "rats", "were", "dosed", "with", "PT", "and", "Rib", "-", "C2", "was", "found", "in", "the", "urine", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "4", "." ]	[ "O", "O" ]
[ "Structure", "-", "activity", "relationship", "shows", "that", "replacement", "of", "the", "distal", "thiazole", "group", "in", "the", "PT", "to", "a", "phenyl", "group", "abolishes", "this", "conjugation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Three", "amino", "acid", "residues", "in", "the", "active", "site", "preferentially", "interact", "with", "the", "sulfur", "atom", "in", "the", "thiazole", "of", "PT", "." ]	[ "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]
[ "5", "." ]	[ "O", "O" ]
[ "In", "summary", ",", "PT", "forms", "direct", "AD", "-", "C", "in", "hepatocytes", ",", "which", "is", "further", "hydrolyzed", "by", "phosphatase", "to", "give", "ribose", "conjugates", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "In", "silico", "drug", "repositioning", ":", "what", "we", "need", "to", "know", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Drug", "repositioning", ",", "exemplified", "by", "sildenafil", "and", "thalidomide", ",", "is", "a", "promising", "way", "to", "explore", "alternative", "indications", "for", "existing", "drugs", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Recent", "research", "has", "shown", "that", "bioinformatics", "-", "based", "approaches", "have", "the", "potential", "to", "offer", "systematic", "insights", "into", "the", "complex", "relationships", "among", "drugs", ",", "targets", "and", "diseases", "necessary", "for", "successful", "repositioning", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "article", ",", "we", "propose", "the", "key", "bioinformatics", "steps", "essential", "for", "discovering", "valuable", "repositioning", "methods", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "proposed", "steps", "(", "repurposing", "with", "a", "purpose", ",", "repurposing", "with", "a", "strategy", "and", "repurposing", "with", "confidence", ")", "are", "aimed", "at", "providing", "a", "repurposing", "pipeline", ",", "with", "particular", "focus", "on", "the", "proposed", "Drugs", "of", "New", "Indications", "(", "DNI", ")", "database", ",", "which", "can", "be", "used", "alongside", "currently", "available", "resources", "to", "improve", "in", "silico", "drug", "repositioning", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Human", "beta", "-", "cell", "killing", "by", "autoreactive", "preproinsulin", "-", "specific", "CD8", "T", "cells", "is", "predominantly", "granule", "-", "mediated", "with", "the", "potency", "dependent", "upon", "T", "-", "cell", "receptor", "avidity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "end", "-", "stage", "immunopathology", "of", "type", "1", "diabetes", "resulting", "in", "beta", "-", "cell", "destruction", "appears", "to", "be", "strongly", "dominated", "by", "cytotoxic", "CD8", "T", "lymphocytes", "(", "CD8", "T", "cells", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "the", "mechanism", "of", "cytotoxicity", "used", "by", "autoreactive", "CD8", "T", "cells", "in", "the", "human", "setting", "remains", "unknown", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Using", "type", "1", "diabetes", "patient", "-", "derived", "preproinsulin", "-", "specific", "CD8", "T", "-", "cell", "clones", "recognizing", "either", "an", "HLA", "-", "A2", "(", "A", "", "0201", ")", "or", "HLA", "-", "A24", "(", "A", "", "2402", ")", "-", "restricted", "epitope", "(", "peptide", "of", "preproinsulin", "[", "PPI", "]", "(", "15", "-", "24", ")", ",", "ALWGPDPAAA", ";", "or", "PPI", "(", "3", "-", "11", ")", ",", "LWMRLLPLL", ")", ",", "we", "assessed", "the", "use", "of", "conventional", "mediators", "of", "cytotoxicity", "in", "the", "destruction", "of", "human", "beta", "-", "cells", "in", "vitro", "compared", "with", "virus", "-", "specific", "cytotoxic", "CD8", "T", "-", "cell", "clones", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "show", "that", "PPI", "-", "specific", "CD8", "T", "-", "cell", "clones", "are", "mainly", "reliant", "upon", "cytotoxic", "degranulation", "for", "inducing", "beta", "-", "cell", "death", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "we", "find", "that", "in", "comparison", "with", "virus", "-", "specific", "CD8", "T", "cells", ",", "there", "are", "differences", "in", "the", "killing", "potency", "of", "PPI", "-", "specific", "CD8", "T", "cells", "that", "are", "not", "due", "to", "cell", "-", "intrinsic", "differences", ",", "but", "rather", "are", "mediated", "by", "differences", "in", "strength", "of", "signaling", "by", "peptide", "-", "HLA", "ligands", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "study", "highlights", "the", "regulation", "of", "beta", "-", "cell", "killing", "as", "a", "potential", "point", "for", "therapeutic", "control", ",", "including", "the", "possibility", "of", "blocking", "autoreactive", "CD8", "T", "-", "cell", "function", "without", "impacting", "upon", "general", "immune", "competence", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Osteocyte", "control", "of", "osteoclastogenesis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Multiple", "lines", "of", "evidence", "support", "the", "idea", "that", "osteocytes", "act", "as", "mechanosensors", "in", "bone", "and", "that", "they", "control", "bone", "formation", ",", "in", "part", ",", "by", "expressing", "the", "Wnt", "antagonist", "sclerostin", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "the", "role", "of", "osteocytes", "in", "the", "control", "of", "bone", "resorption", "has", "been", "less", "clear", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Recent", "studies", "have", "demonstrated", "that", "osteocytes", "are", "the", "major", "source", "of", "the", "cytokine", "RANKL", "involved", "in", "osteoclast", "formation", "in", "cancellous", "bone", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "goal", "of", "this", "review", "is", "to", "discuss", "these", "and", "other", "studies", "that", "reveal", "mechanisms", "whereby", "osteocytes", "control", "osteoclast", "formation", "and", "thus", "bone", "resorption", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "article", "is", "part", "of", "a", "Special", "Issue", "entitled", "\"", "The", "Osteocyte", "\"", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Relation", "between", "dynamics", ",", "activity", "and", "thermal", "stability", "within", "the", "cholinesterase", "family", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Incoherent", "neutron", "scattering", "is", "one", "of", "the", "most", "powerful", "tools", "for", "studying", "dynamics", "in", "biological", "matter", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Using", "the", "cold", "neutron", "backscattering", "spectrometer", "IN16", "at", "the", "Institut", "Laue", "Langevin", "(", "ILL", ",", "Grenoble", ",", "France", ")", ",", "temperature", "dependence", "of", "cholinesterases", "'", "dynamics", "(", "human", "butyrylcholinesterase", "from", "plasma", ":", "hBChE", ";", "recombinant", "human", "acetylcholinesterase", ":", "hAChE", "and", "recombinant", "mouse", "acetylcholinesterase", ":", "mAChE", ")", "was", "examined", "using", "elastic", "incoherent", "neutron", "scattering", "(", "EINS", ")", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "dynamics", "was", "characterized", "by", "the", "averaged", "atomic", "mean", "square", "displacement", "(", "MSD", ")", ",", "associated", "with", "the", "sample", "flexibility", "at", "a", "given", "temperature", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "found", "MSD", "values", "of", "hAChE", "above", "the", "dynamical", "transition", "temperature", "(", "around", "200K", ")", "larger", "than", "for", "mAChE", "and", "hBChE", ",", "implying", "that", "hAChE", "is", "more", "flexible", "than", "the", "other", "ChEs", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Activation", "energies", "for", "thermodynamical", "transition", "were", "extracted", "through", "the", "frequency", "window", "model", "(", "FWM", ")", "(", "Becker", "et", "al", ".", "2004", ")", "[", "1", "]", "and", "turned", "out", "to", "increase", "from", "hBChE", "to", "mAChE", "and", "finally", "to", "hAChE", ",", "inversely", "to", "the", "MSDs", "relations", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Between", "280", "and", "316K", ",", "catalytic", "studies", "of", "these", "enzymes", "were", "carried", "out", "using", "thiocholine", "esters", ":", "at", "the", "same", "temperature", ",", "the", "hAChE", "activity", "was", "systematically", "higher", "than", "the", "mAChE", "or", "hBChE", "ones", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Our", "results", "thus", "suggest", "a", "strong", "correlation", "between", "dynamics", "and", "activity", "within", "the", "ChE", "family", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "also", "studied", "and", "compared", "the", "ChEs", "thermal", "inactivation", "kinetics", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Here", ",", "no", "direct", "correlation", "with", "the", "dynamics", "was", "observed", ",", "thus", "suggesting", "that", "relations", "between", "enzyme", "dynamics", "and", "catalytic", "stability", "are", "more", "complex", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Finally", ",", "the", "possible", "relation", "between", "flexibility", "and", "protein", "ability", "to", "grow", "in", "crystals", "is", "discussed", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Quantum", "chemical", "investigation", "of", "the", "intra", "-", "and", "intermolecular", "proton", "transfer", "reactions", "and", "hydrogen", "bonding", "interactions", "in", "4", "-", "amino", "-", "5", "-", "(", "2", "-", "hydroxyphenyl", ")", "-", "2H", "-", "1", ",", "2", ",", "4", "-", "triazole", "-", "3", "(", "4H", ")", "-", "thione", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]
[ "The", "intramolecular", "thione", "-", "thiol", "tautomerism", "and", "intermolecular", "double", "proton", "transfer", "reaction", "of", "the", "hydrogen", "-", "bonded", "thione", "and", "thiol", "dimers", "in", "the", "title", "triazole", "compound", "were", "studied", "at", "the", "B3LYP", "level", "of", "theory", "using", "6", "-", "311", "+", "+", "G", "(", "d", ",", "p", ")", "basis", "function", "." ]	[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "influence", "of", "the", "solvent", "on", "the", "single", "and", "double", "proton", "transfer", "reactions", "was", "examined", "in", "three", "solvents", "(", "chloroform", ",", "methanol", "and", "water", ")", "using", "the", "polarizable", "continuum", "model", "(", "PCM", ")", "approximation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "computational", "results", "show", "that", "the", "thione", "tautomer", "is", "the", "most", "stable", "isomer", "with", "a", "very", "high", "tautomeric", "energy", "barrier", "both", "in", "the", "gas", "phase", "and", "in", "solution", "phase", ",", "indicating", "a", "quite", "disfavored", "process", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "solvent", "effect", "is", "found", "to", "be", "sizable", "with", "increasing", "polarity", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "the", "double", "proton", "transfer", "reaction", ",", "the", "thione", "dimer", "is", "found", "to", "be", "more", "stable", "than", "thiol", "dimer", "both", "in", "the", "gas", "phase", "and", "in", "solution", "phase", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "energetic", "and", "thermodynamic", "parameters", "of", "the", "double", "proton", "transfer", "process", "show", "that", "the", "double", "proton", "exchange", "from", "thione", "dimer", "to", "thiol", "dimer", "is", "thermodynamically", "unfavored", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "the", "exchange", "from", "thiol", "dimer", "to", "thione", "dimer", "for", "the", "gas", "phase", "and", "water", "phase", "seems", "to", "be", "feasible", "with", "a", "low", "barrier", "height", "and", "with", "a", "negative", "value", "in", "enthalpy", "and", "free", "energy", "changes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "addition", ",", "the", "hydrogen", "bonding", "interactions", "were", "analyzed", "in", "the", "gas", "phase", "regarding", "their", "geometries", "and", "energies", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "It", "is", "found", "that", "all", "complex", "formations", "are", "enthalpically", "favored", ",", "and", "the", "stability", "of", "the", "H", "-", "bonds", "comes", "in", "the", "order", "of", "S1", "-", "H2", ".", ".", ".", "N2", ">", "N2", "-", "H2", ".", ".", ".", "S1", ">", "N3", "-", "H3B", ".", ".", ".", "O1", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]
[ "Finally", ",", "non", "-", "linear", "optical", "properties", "were", "carried", "out", "at", "the", "same", "calculation", "level", "in", "the", "gas", "phase", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Type", "2", "diabetes", "and", "cardiovascular", "disease", "in", "women", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Cardiovascular", "disease", "is", "the", "leading", "cause", "of", "death", "in", "both", "men", "and", "women", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "is", "also", "true", "for", "patients", "with", "diabetes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "general", ",", "differences", "between", "the", "sexes", "are", "present", "in", "several", "areas", ",", "such", "as", "epidemiology", ",", "pathophysiology", ",", "diagnostics", ",", "treatment", "response", "and", "prognosis", ",", "as", "well", "as", "the", "way", "in", "which", "disease", "is", "experienced", "and", "expressed", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Cardiovascular", "disease", "presents", "later", "in", "life", "in", "women", ",", "who", "are", "therefore", "more", "likely", "to", "suffer", "from", "comorbidities", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "However", ",", "this", "age", "-", "related", "difference", "is", "attenuated", "in", "women", "with", "diabetes", ",", "who", "suffer", "their", "first", "myocardial", "infarction", "at", "about", "the", "same", "age", "as", "men", "with", "diabetes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Diabetes", "mellitus", "increases", "the", "risk", "of", "cardiovascular", "disease", "by", "three", "to", "four", "times", "in", "women", "and", "two", "to", "three", "times", "in", "men", ",", "after", "adjusting", "for", "other", "risk", "factors", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "This", "paper", "describes", "the", "differences", "in", "cardiovascular", "disease", "in", "men", "and", "women", "and", "the", "special", "situation", "of", "women", "with", "type", "2", "diabetes", "when", "it", "comes", "to", "risk", "factors", ",", "symptoms", "and", "the", "setting", "of", "acute", "coronary", "syndromes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Furthermore", ",", "it", "highlights", "the", "importance", "of", "sex", "-", "specific", "analyses", "in", "clinical", "research", "to", "improve", "our", "knowledge", "of", "cardiovascular", "disease", "in", "women", "in", "general", "and", "in", "women", "with", "diabetes", "in", "particular", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "importance", "of", "taking", "sex", "into", "account", "when", "treating", "women", "and", "men", "at", "risk", "of", "cardiovascular", "disease", "is", "discussed", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Methylation", "levels", "of", "sodium", "-", "iodide", "symporter", "(", "NIS", ")", "promoter", "in", "benign", "and", "malignant", "thyroid", "tumors", "with", "reduced", "NIS", "expression", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "DNA", "methylation", "regulates", "gene", "expression", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Aberrant", "methylation", "plays", "an", "important", "role", "in", "human", "tumorigenesis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "have", "previously", "detected", "reduced", "NIS", "mRNA", "expression", "in", "thyroid", "tumors", "as", "compared", "to", "non", "-", "tumor", "tissues", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Thus", ",", "in", "this", "study", "we", "investigated", "whether", "the", "methylation", "of", "the", "CpG", "-", "island", "located", "in", "the", "NIS", "gene", "promoter", "was", "associated", "with", "reduced", "mRNA", "expression", "in", "thyroid", "tumors", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Methylation", "levels", "of", "30", "pairs", "of", "samples", "from", "10", "benign", "and", "20", "malignant", "thyroid", "tumors", "(", "T", ")", "along", "with", "matched", "non", "-", "tumor", "(", "NT", ")", "areas", "were", "determined", "by", "semiquantitative", "methylation", "specific", "-", "PCR", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "NIS", "methylation", "was", "detected", "in", "all", "samples", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Methylation", "levels", "and", "frequencies", "did", "not", "differ", "between", "the", "groups", "and", "were", "not", "associated", "with", "BRAF", "mutational", "status", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Highest", "methylation", "levels", "and", "frequencies", "were", "detected", "in", "the", "5", "'", "region", "of", "the", "CpG", "-", "island", "decreasing", "toward", "the", "3", "'", "end", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Intraindividual", "analysis", "(", "T", "versus", "NT", ")", "showed", "high", "tumor", "methylation", "levels", "in", "40", "%", "of", "the", "samples", "in", "the", "benign", "group", "and", "30", "%", "in", "the", "malignant", "group", ",", "associated", "with", "low", "NIS", "mRNA", "expression", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "No", "quantitative", "correlation", "was", "detected", "between", "methylation", "levels", "and", "mRNA", "expression", "in", "any", "the", "groups", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "results", "of", "this", "study", "showed", "that", "methylation", "of", "NIS", "promoter", "is", "a", "very", "frequent", "event", "in", "both", "benign", "and", "malignant", "tumors", "as", "well", "as", "in", "their", "surrounding", "tissues", ",", "and", "characterized", "a", "non", "-", "homogeneous", "methylation", "pattern", "along", "the", "CpG", "island", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "Therefore", ",", "further", "investigations", "involving", "other", "sites", "that", "may", "be", "implicated", "in", "methylation", "regulation", "of", "NIS", "expression", "are", "warranted", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Oral", "intake", "of", "beet", "extract", "provides", "protection", "against", "skin", "barrier", "impairment", "in", "hairless", "mice", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "epidermis", "acts", "as", "a", "functional", "barrier", "against", "the", "external", "environment", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Disturbances", "in", "the", "function", "of", "this", "barrier", "cause", "water", "loss", "and", "increase", "the", "chances", "of", "penetration", "by", "various", "irritable", "stimuli", ",", "leading", "to", "skin", "diseases", "such", "as", "dry", "skin", ",", "atopic", "dermatitis", ",", "and", "psoriasis", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Ceramides", "are", "a", "critical", "natural", "element", "of", "the", "protective", "epidermal", "barrier", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "aim", "of", "this", "study", "was", "to", "evaluate", "whether", "the", "oral", "intake", "of", "beet", "(", "Beta", "vulgaris", ")", "extract", ",", "a", "natural", "product", "rich", "in", "glucosylceramide", "(", "GlcCer", ")", ",", "may", "prevent", "disturbance", "in", "skin", "barrier", "function", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "When", "HR", "-", "1", "hairless", "mice", "were", "fed", "a", "special", "diet", "(", "HR", "-", "AD", ")", ",", "transepidermal", "water", "loss", "(", "TEWL", ")", "from", "the", "dorsal", "skin", "increased", ",", "with", "a", "compensatory", "increase", "in", "water", "intake", "after", "5", "weeks", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mice", "fed", "with", "HR", "-", "AD", "had", "dry", "skin", "with", "erythema", "and", "showed", "increased", "scratching", "behaviour", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Histological", "examinations", "revealed", "a", "remarkable", "increase", "in", "the", "thickness", "of", "the", "skin", "at", "8", "weeks", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Supplemental", "addition", "of", "beet", "extract", ",", "which", "contained", "GlcCer", "at", "a", "final", "concentration", "of", "0", ".", "1", "%", ",", "significantly", "prevented", "an", "increase", "TEWL", ",", "water", "intake", ",", "cumulative", "scratching", "time", ",", "and", "epidermal", "thickness", "at", "8", "weeks", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "results", "indicate", "that", "oral", "intake", "of", "beet", "extract", "shows", "potential", "for", "preventing", "skin", "diseases", "associated", "with", "impaired", "skin", "barrier", "function", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Copyright", "(c)", "2012", "John", "Wiley", "&", "Sons", ",", "Ltd", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Mutations", "in", "FKBP10", ",", "which", "result", "in", "Bruck", "syndrome", "and", "recessive", "forms", "of", "osteogenesis", "imperfecta", ",", "inhibit", "the", "hydroxylation", "of", "telopeptide", "lysines", "in", "bone", "collagen", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Although", "biallelic", "mutations", "in", "non", "-", "collagen", "genes", "account", "for", "<", "10", "%", "of", "individuals", "with", "osteogenesis", "imperfecta", ",", "the", "characterization", "of", "these", "genes", "has", "identified", "new", "pathways", "and", "potential", "interventions", "that", "could", "benefit", "even", "those", "with", "mutations", "in", "type", "I", "collagen", "genes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "identified", "mutations", "in", "FKBP10", ",", "which", "encodes", "the", "65", "kDa", "prolyl", "cis", "-", "trans", "isomerase", ",", "FKBP65", ",", "in", "38", "members", "of", "21", "families", "with", "OI", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "These", "include", "10", "families", "from", "the", "Samoan", "Islands", "who", "share", "a", "founder", "mutation", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Of", "the", "mutations", ",", "three", "are", "missense", ";", "the", "remainder", "either", "introduce", "premature", "termination", "codons", "or", "create", "frameshifts", "both", "of", "which", "result", "in", "mRNA", "instability", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "four", "families", "missense", "mutations", "result", "in", "loss", "of", "most", "of", "the", "protein", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "clinical", "effects", "of", "these", "mutations", "are", "short", "stature", ",", "a", "high", "incidence", "of", "joint", "contractures", "at", "birth", "and", "progressive", "scoliosis", "and", "fractures", ",", "but", "there", "is", "remarkable", "variability", "in", "phenotype", "even", "within", "families", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "loss", "of", "the", "activity", "of", "FKBP65", "has", "several", "effects", ":", "type", "I", "procollagen", "secretion", "is", "slightly", "delayed", ",", "the", "stabilization", "of", "the", "intact", "trimer", "is", "incomplete", "and", "there", "is", "diminished", "hydroxylation", "of", "the", "telopeptide", "lysyl", "residues", "involved", "in", "intermolecular", "cross", "-", "link", "formation", "in", "bone", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "The", "phenotype", "overlaps", "with", "that", "seen", "with", "mutations", "in", "PLOD2", "(", "Bruck", "syndrome", "II", ")", ",", "which", "encodes", "LH2", ",", "the", "enzyme", "that", "hydroxylates", "the", "telopeptide", "lysyl", "residues", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]
[ "These", "findings", "define", "a", "set", "of", "genes", ",", "FKBP10", ",", "PLOD2", "and", "SERPINH1", ",", "that", "act", "during", "procollagen", "maturation", "to", "contribute", "to", "molecular", "stability", "and", "post", "-", "translational", "modification", "of", "type", "I", "procollagen", ",", "without", "which", "bone", "mass", "and", "quality", "are", "abnormal", "and", "fractures", "and", "contractures", "result", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "vitro", "models", "for", "assessing", "the", "potential", "cardiovascular", "disease", "risk", "associated", "with", "cigarette", "smoking", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Atherosclerotic", "cardiovascular", "disease", "is", "a", "prevalent", "human", "disorder", "and", "a", "significant", "cause", "of", "human", "morbidity", "and", "mortality", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "number", "of", "risk", "factors", "may", "predispose", "an", "individual", "to", "developing", "atherosclerosis", ",", "and", "of", "these", "factors", ",", "cigarette", "smoking", "is", "strongly", "associated", "with", "the", "development", "of", "cardiovascular", "disease", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Current", "thinking", "suggests", "that", "exposure", "to", "toxicants", "found", "in", "cigarette", "smoke", "may", "be", "responsible", "for", "this", "elevated", "disease", "likelihood", ",", "and", "this", "gives", "rise", "to", "the", "idea", "that", "reductions", "in", "the", "levels", "of", "some", "smoke", "toxicants", "may", "reduce", "the", "harm", "associated", "with", "cigarette", "smoking", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "To", "assess", "the", "disease", "risk", "of", "individuals", "who", "smoke", "cigarettes", "with", "altered", "toxicant", "levels", ",", "a", "weight", "-", "of", "-", "evidence", "approach", "is", "required", "examining", "both", "exposure", "and", "disease", "-", "related", "endpoints", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "A", "key", "element", "of", "such", "an", "assessment", "framework", "are", "data", "derived", "from", "the", "use", "of", "in", "vitro", "models", "of", "cardiovascular", "disease", ",", "which", "when", "considered", "alongside", "other", "forms", "of", "data", "(", "e", ".", "g", ".", "from", "clinical", "studies", ")", "may", "support", "evidence", "of", "potential", "reduced", "risk", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Importantly", ",", "such", "models", "may", "also", "be", "used", "to", "provide", "mechanistic", "insight", "into", "the", "effects", "of", "smoking", "and", "of", "smoke", "toxicant", "exposure", "in", "cardiovascular", "disease", "development", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "review", "the", "use", "of", "in", "vitro", "models", "of", "cardiovascular", "disease", "and", "one", "of", "the", "contributory", "factors", ",", "oxidative", "stress", ",", "is", "discussed", "in", "the", "context", "of", "assessing", "the", "risk", "potential", "of", "both", "conventional", "and", "modified", "cigarettes", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "When", "AD", "-", "C", "was", "incubated", "with", "phosphatase", ",", "Rib", "-", "C1", "and", "Rib", "-", "C2", "formed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "3", "." ]

[ "O", "O" ]

[ "To", "understand", "the", "in", "vivo", "relevance", "of", "this", "metabolic", "pathway", ",", "rats", "were", "dosed", "with", "PT", "and", "Rib", "-", "C2", "was", "found", "in", "the", "urine", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "4", "." ]

[ "O", "O" ]

[ "Structure", "-", "activity", "relationship", "shows", "that", "replacement", "of", "the", "distal", "thiazole", "group", "in", "the", "PT", "to", "a", "phenyl", "group", "abolishes", "this", "conjugation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Three", "amino", "acid", "residues", "in", "the", "active", "site", "preferentially", "interact", "with", "the", "sulfur", "atom", "in", "the", "thiazole", "of", "PT", "." ]

[ "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O" ]

[ "5", "." ]

[ "O", "O" ]

[ "In", "summary", ",", "PT", "forms", "direct", "AD", "-", "C", "in", "hepatocytes", ",", "which", "is", "further", "hydrolyzed", "by", "phosphatase", "to", "give", "ribose", "conjugates", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "In", "silico", "drug", "repositioning", ":", "what", "we", "need", "to", "know", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Drug", "repositioning", ",", "exemplified", "by", "sildenafil", "and", "thalidomide", ",", "is", "a", "promising", "way", "to", "explore", "alternative", "indications", "for", "existing", "drugs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Recent", "research", "has", "shown", "that", "bioinformatics", "-", "based", "approaches", "have", "the", "potential", "to", "offer", "systematic", "insights", "into", "the", "complex", "relationships", "among", "drugs", ",", "targets", "and", "diseases", "necessary", "for", "successful", "repositioning", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "article", ",", "we", "propose", "the", "key", "bioinformatics", "steps", "essential", "for", "discovering", "valuable", "repositioning", "methods", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "proposed", "steps", "(", "repurposing", "with", "a", "purpose", ",", "repurposing", "with", "a", "strategy", "and", "repurposing", "with", "confidence", ")", "are", "aimed", "at", "providing", "a", "repurposing", "pipeline", ",", "with", "particular", "focus", "on", "the", "proposed", "Drugs", "of", "New", "Indications", "(", "DNI", ")", "database", ",", "which", "can", "be", "used", "alongside", "currently", "available", "resources", "to", "improve", "in", "silico", "drug", "repositioning", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Human", "beta", "-", "cell", "killing", "by", "autoreactive", "preproinsulin", "-", "specific", "CD8", "T", "cells", "is", "predominantly", "granule", "-", "mediated", "with", "the", "potency", "dependent", "upon", "T", "-", "cell", "receptor", "avidity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "end", "-", "stage", "immunopathology", "of", "type", "1", "diabetes", "resulting", "in", "beta", "-", "cell", "destruction", "appears", "to", "be", "strongly", "dominated", "by", "cytotoxic", "CD8", "T", "lymphocytes", "(", "CD8", "T", "cells", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "the", "mechanism", "of", "cytotoxicity", "used", "by", "autoreactive", "CD8", "T", "cells", "in", "the", "human", "setting", "remains", "unknown", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Using", "type", "1", "diabetes", "patient", "-", "derived", "preproinsulin", "-", "specific", "CD8", "T", "-", "cell", "clones", "recognizing", "either", "an", "HLA", "-", "A2", "(", "A", "*", "0201", ")", "or", "HLA", "-", "A24", "(", "A", "*", "2402", ")", "-", "restricted", "epitope", "(", "peptide", "of", "preproinsulin", "[", "PPI", "]", "(", "15", "-", "24", ")", ",", "ALWGPDPAAA", ";", "or", "PPI", "(", "3", "-", "11", ")", ",", "LWMRLLPLL", ")", ",", "we", "assessed", "the", "use", "of", "conventional", "mediators", "of", "cytotoxicity", "in", "the", "destruction", "of", "human", "beta", "-", "cells", "in", "vitro", "compared", "with", "virus", "-", "specific", "cytotoxic", "CD8", "T", "-", "cell", "clones", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "show", "that", "PPI", "-", "specific", "CD8", "T", "-", "cell", "clones", "are", "mainly", "reliant", "upon", "cytotoxic", "degranulation", "for", "inducing", "beta", "-", "cell", "death", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "we", "find", "that", "in", "comparison", "with", "virus", "-", "specific", "CD8", "T", "cells", ",", "there", "are", "differences", "in", "the", "killing", "potency", "of", "PPI", "-", "specific", "CD8", "T", "cells", "that", "are", "not", "due", "to", "cell", "-", "intrinsic", "differences", ",", "but", "rather", "are", "mediated", "by", "differences", "in", "strength", "of", "signaling", "by", "peptide", "-", "HLA", "ligands", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "study", "highlights", "the", "regulation", "of", "beta", "-", "cell", "killing", "as", "a", "potential", "point", "for", "therapeutic", "control", ",", "including", "the", "possibility", "of", "blocking", "autoreactive", "CD8", "T", "-", "cell", "function", "without", "impacting", "upon", "general", "immune", "competence", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Osteocyte", "control", "of", "osteoclastogenesis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Multiple", "lines", "of", "evidence", "support", "the", "idea", "that", "osteocytes", "act", "as", "mechanosensors", "in", "bone", "and", "that", "they", "control", "bone", "formation", ",", "in", "part", ",", "by", "expressing", "the", "Wnt", "antagonist", "sclerostin", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "the", "role", "of", "osteocytes", "in", "the", "control", "of", "bone", "resorption", "has", "been", "less", "clear", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Recent", "studies", "have", "demonstrated", "that", "osteocytes", "are", "the", "major", "source", "of", "the", "cytokine", "RANKL", "involved", "in", "osteoclast", "formation", "in", "cancellous", "bone", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "goal", "of", "this", "review", "is", "to", "discuss", "these", "and", "other", "studies", "that", "reveal", "mechanisms", "whereby", "osteocytes", "control", "osteoclast", "formation", "and", "thus", "bone", "resorption", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "article", "is", "part", "of", "a", "Special", "Issue", "entitled", "\"", "The", "Osteocyte", "\"", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Relation", "between", "dynamics", ",", "activity", "and", "thermal", "stability", "within", "the", "cholinesterase", "family", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Incoherent", "neutron", "scattering", "is", "one", "of", "the", "most", "powerful", "tools", "for", "studying", "dynamics", "in", "biological", "matter", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Using", "the", "cold", "neutron", "backscattering", "spectrometer", "IN16", "at", "the", "Institut", "Laue", "Langevin", "(", "ILL", ",", "Grenoble", ",", "France", ")", ",", "temperature", "dependence", "of", "cholinesterases", "'", "dynamics", "(", "human", "butyrylcholinesterase", "from", "plasma", ":", "hBChE", ";", "recombinant", "human", "acetylcholinesterase", ":", "hAChE", "and", "recombinant", "mouse", "acetylcholinesterase", ":", "mAChE", ")", "was", "examined", "using", "elastic", "incoherent", "neutron", "scattering", "(", "EINS", ")", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "dynamics", "was", "characterized", "by", "the", "averaged", "atomic", "mean", "square", "displacement", "(", "MSD", ")", ",", "associated", "with", "the", "sample", "flexibility", "at", "a", "given", "temperature", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "found", "MSD", "values", "of", "hAChE", "above", "the", "dynamical", "transition", "temperature", "(", "around", "200K", ")", "larger", "than", "for", "mAChE", "and", "hBChE", ",", "implying", "that", "hAChE", "is", "more", "flexible", "than", "the", "other", "ChEs", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Activation", "energies", "for", "thermodynamical", "transition", "were", "extracted", "through", "the", "frequency", "window", "model", "(", "FWM", ")", "(", "Becker", "et", "al", ".", "2004", ")", "[", "1", "]", "and", "turned", "out", "to", "increase", "from", "hBChE", "to", "mAChE", "and", "finally", "to", "hAChE", ",", "inversely", "to", "the", "MSDs", "relations", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Between", "280", "and", "316K", ",", "catalytic", "studies", "of", "these", "enzymes", "were", "carried", "out", "using", "thiocholine", "esters", ":", "at", "the", "same", "temperature", ",", "the", "hAChE", "activity", "was", "systematically", "higher", "than", "the", "mAChE", "or", "hBChE", "ones", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Our", "results", "thus", "suggest", "a", "strong", "correlation", "between", "dynamics", "and", "activity", "within", "the", "ChE", "family", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "also", "studied", "and", "compared", "the", "ChEs", "thermal", "inactivation", "kinetics", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Here", ",", "no", "direct", "correlation", "with", "the", "dynamics", "was", "observed", ",", "thus", "suggesting", "that", "relations", "between", "enzyme", "dynamics", "and", "catalytic", "stability", "are", "more", "complex", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Finally", ",", "the", "possible", "relation", "between", "flexibility", "and", "protein", "ability", "to", "grow", "in", "crystals", "is", "discussed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Quantum", "chemical", "investigation", "of", "the", "intra", "-", "and", "intermolecular", "proton", "transfer", "reactions", "and", "hydrogen", "bonding", "interactions", "in", "4", "-", "amino", "-", "5", "-", "(", "2", "-", "hydroxyphenyl", ")", "-", "2H", "-", "1", ",", "2", ",", "4", "-", "triazole", "-", "3", "(", "4H", ")", "-", "thione", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O" ]

[ "The", "intramolecular", "thione", "-", "thiol", "tautomerism", "and", "intermolecular", "double", "proton", "transfer", "reaction", "of", "the", "hydrogen", "-", "bonded", "thione", "and", "thiol", "dimers", "in", "the", "title", "triazole", "compound", "were", "studied", "at", "the", "B3LYP", "level", "of", "theory", "using", "6", "-", "311", "+", "+", "G", "(", "d", ",", "p", ")", "basis", "function", "." ]

[ "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "influence", "of", "the", "solvent", "on", "the", "single", "and", "double", "proton", "transfer", "reactions", "was", "examined", "in", "three", "solvents", "(", "chloroform", ",", "methanol", "and", "water", ")", "using", "the", "polarizable", "continuum", "model", "(", "PCM", ")", "approximation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "computational", "results", "show", "that", "the", "thione", "tautomer", "is", "the", "most", "stable", "isomer", "with", "a", "very", "high", "tautomeric", "energy", "barrier", "both", "in", "the", "gas", "phase", "and", "in", "solution", "phase", ",", "indicating", "a", "quite", "disfavored", "process", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "solvent", "effect", "is", "found", "to", "be", "sizable", "with", "increasing", "polarity", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "the", "double", "proton", "transfer", "reaction", ",", "the", "thione", "dimer", "is", "found", "to", "be", "more", "stable", "than", "thiol", "dimer", "both", "in", "the", "gas", "phase", "and", "in", "solution", "phase", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "energetic", "and", "thermodynamic", "parameters", "of", "the", "double", "proton", "transfer", "process", "show", "that", "the", "double", "proton", "exchange", "from", "thione", "dimer", "to", "thiol", "dimer", "is", "thermodynamically", "unfavored", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "the", "exchange", "from", "thiol", "dimer", "to", "thione", "dimer", "for", "the", "gas", "phase", "and", "water", "phase", "seems", "to", "be", "feasible", "with", "a", "low", "barrier", "height", "and", "with", "a", "negative", "value", "in", "enthalpy", "and", "free", "energy", "changes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "addition", ",", "the", "hydrogen", "bonding", "interactions", "were", "analyzed", "in", "the", "gas", "phase", "regarding", "their", "geometries", "and", "energies", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "It", "is", "found", "that", "all", "complex", "formations", "are", "enthalpically", "favored", ",", "and", "the", "stability", "of", "the", "H", "-", "bonds", "comes", "in", "the", "order", "of", "S1", "-", "H2", ".", ".", ".", "N2", ">", "N2", "-", "H2", ".", ".", ".", "S1", ">", "N3", "-", "H3B", ".", ".", ".", "O1", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O" ]

[ "Finally", ",", "non", "-", "linear", "optical", "properties", "were", "carried", "out", "at", "the", "same", "calculation", "level", "in", "the", "gas", "phase", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Type", "2", "diabetes", "and", "cardiovascular", "disease", "in", "women", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Cardiovascular", "disease", "is", "the", "leading", "cause", "of", "death", "in", "both", "men", "and", "women", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "is", "also", "true", "for", "patients", "with", "diabetes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "general", ",", "differences", "between", "the", "sexes", "are", "present", "in", "several", "areas", ",", "such", "as", "epidemiology", ",", "pathophysiology", ",", "diagnostics", ",", "treatment", "response", "and", "prognosis", ",", "as", "well", "as", "the", "way", "in", "which", "disease", "is", "experienced", "and", "expressed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Cardiovascular", "disease", "presents", "later", "in", "life", "in", "women", ",", "who", "are", "therefore", "more", "likely", "to", "suffer", "from", "comorbidities", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "However", ",", "this", "age", "-", "related", "difference", "is", "attenuated", "in", "women", "with", "diabetes", ",", "who", "suffer", "their", "first", "myocardial", "infarction", "at", "about", "the", "same", "age", "as", "men", "with", "diabetes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Diabetes", "mellitus", "increases", "the", "risk", "of", "cardiovascular", "disease", "by", "three", "to", "four", "times", "in", "women", "and", "two", "to", "three", "times", "in", "men", ",", "after", "adjusting", "for", "other", "risk", "factors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "This", "paper", "describes", "the", "differences", "in", "cardiovascular", "disease", "in", "men", "and", "women", "and", "the", "special", "situation", "of", "women", "with", "type", "2", "diabetes", "when", "it", "comes", "to", "risk", "factors", ",", "symptoms", "and", "the", "setting", "of", "acute", "coronary", "syndromes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Furthermore", ",", "it", "highlights", "the", "importance", "of", "sex", "-", "specific", "analyses", "in", "clinical", "research", "to", "improve", "our", "knowledge", "of", "cardiovascular", "disease", "in", "women", "in", "general", "and", "in", "women", "with", "diabetes", "in", "particular", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "importance", "of", "taking", "sex", "into", "account", "when", "treating", "women", "and", "men", "at", "risk", "of", "cardiovascular", "disease", "is", "discussed", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Methylation", "levels", "of", "sodium", "-", "iodide", "symporter", "(", "NIS", ")", "promoter", "in", "benign", "and", "malignant", "thyroid", "tumors", "with", "reduced", "NIS", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "I-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "DNA", "methylation", "regulates", "gene", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Aberrant", "methylation", "plays", "an", "important", "role", "in", "human", "tumorigenesis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "have", "previously", "detected", "reduced", "NIS", "mRNA", "expression", "in", "thyroid", "tumors", "as", "compared", "to", "non", "-", "tumor", "tissues", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Thus", ",", "in", "this", "study", "we", "investigated", "whether", "the", "methylation", "of", "the", "CpG", "-", "island", "located", "in", "the", "NIS", "gene", "promoter", "was", "associated", "with", "reduced", "mRNA", "expression", "in", "thyroid", "tumors", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Methylation", "levels", "of", "30", "pairs", "of", "samples", "from", "10", "benign", "and", "20", "malignant", "thyroid", "tumors", "(", "T", ")", "along", "with", "matched", "non", "-", "tumor", "(", "NT", ")", "areas", "were", "determined", "by", "semiquantitative", "methylation", "specific", "-", "PCR", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "NIS", "methylation", "was", "detected", "in", "all", "samples", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Methylation", "levels", "and", "frequencies", "did", "not", "differ", "between", "the", "groups", "and", "were", "not", "associated", "with", "BRAF", "mutational", "status", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Highest", "methylation", "levels", "and", "frequencies", "were", "detected", "in", "the", "5", "'", "region", "of", "the", "CpG", "-", "island", "decreasing", "toward", "the", "3", "'", "end", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Intraindividual", "analysis", "(", "T", "versus", "NT", ")", "showed", "high", "tumor", "methylation", "levels", "in", "40", "%", "of", "the", "samples", "in", "the", "benign", "group", "and", "30", "%", "in", "the", "malignant", "group", ",", "associated", "with", "low", "NIS", "mRNA", "expression", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "No", "quantitative", "correlation", "was", "detected", "between", "methylation", "levels", "and", "mRNA", "expression", "in", "any", "the", "groups", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "results", "of", "this", "study", "showed", "that", "methylation", "of", "NIS", "promoter", "is", "a", "very", "frequent", "event", "in", "both", "benign", "and", "malignant", "tumors", "as", "well", "as", "in", "their", "surrounding", "tissues", ",", "and", "characterized", "a", "non", "-", "homogeneous", "methylation", "pattern", "along", "the", "CpG", "island", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "Therefore", ",", "further", "investigations", "involving", "other", "sites", "that", "may", "be", "implicated", "in", "methylation", "regulation", "of", "NIS", "expression", "are", "warranted", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Oral", "intake", "of", "beet", "extract", "provides", "protection", "against", "skin", "barrier", "impairment", "in", "hairless", "mice", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "epidermis", "acts", "as", "a", "functional", "barrier", "against", "the", "external", "environment", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Disturbances", "in", "the", "function", "of", "this", "barrier", "cause", "water", "loss", "and", "increase", "the", "chances", "of", "penetration", "by", "various", "irritable", "stimuli", ",", "leading", "to", "skin", "diseases", "such", "as", "dry", "skin", ",", "atopic", "dermatitis", ",", "and", "psoriasis", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Ceramides", "are", "a", "critical", "natural", "element", "of", "the", "protective", "epidermal", "barrier", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "aim", "of", "this", "study", "was", "to", "evaluate", "whether", "the", "oral", "intake", "of", "beet", "(", "Beta", "vulgaris", ")", "extract", ",", "a", "natural", "product", "rich", "in", "glucosylceramide", "(", "GlcCer", ")", ",", "may", "prevent", "disturbance", "in", "skin", "barrier", "function", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "When", "HR", "-", "1", "hairless", "mice", "were", "fed", "a", "special", "diet", "(", "HR", "-", "AD", ")", ",", "transepidermal", "water", "loss", "(", "TEWL", ")", "from", "the", "dorsal", "skin", "increased", ",", "with", "a", "compensatory", "increase", "in", "water", "intake", "after", "5", "weeks", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mice", "fed", "with", "HR", "-", "AD", "had", "dry", "skin", "with", "erythema", "and", "showed", "increased", "scratching", "behaviour", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Histological", "examinations", "revealed", "a", "remarkable", "increase", "in", "the", "thickness", "of", "the", "skin", "at", "8", "weeks", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Supplemental", "addition", "of", "beet", "extract", ",", "which", "contained", "GlcCer", "at", "a", "final", "concentration", "of", "0", ".", "1", "%", ",", "significantly", "prevented", "an", "increase", "TEWL", ",", "water", "intake", ",", "cumulative", "scratching", "time", ",", "and", "epidermal", "thickness", "at", "8", "weeks", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "results", "indicate", "that", "oral", "intake", "of", "beet", "extract", "shows", "potential", "for", "preventing", "skin", "diseases", "associated", "with", "impaired", "skin", "barrier", "function", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Mutations", "in", "FKBP10", ",", "which", "result", "in", "Bruck", "syndrome", "and", "recessive", "forms", "of", "osteogenesis", "imperfecta", ",", "inhibit", "the", "hydroxylation", "of", "telopeptide", "lysines", "in", "bone", "collagen", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Although", "biallelic", "mutations", "in", "non", "-", "collagen", "genes", "account", "for", "<", "10", "%", "of", "individuals", "with", "osteogenesis", "imperfecta", ",", "the", "characterization", "of", "these", "genes", "has", "identified", "new", "pathways", "and", "potential", "interventions", "that", "could", "benefit", "even", "those", "with", "mutations", "in", "type", "I", "collagen", "genes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "identified", "mutations", "in", "FKBP10", ",", "which", "encodes", "the", "65", "kDa", "prolyl", "cis", "-", "trans", "isomerase", ",", "FKBP65", ",", "in", "38", "members", "of", "21", "families", "with", "OI", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "These", "include", "10", "families", "from", "the", "Samoan", "Islands", "who", "share", "a", "founder", "mutation", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Of", "the", "mutations", ",", "three", "are", "missense", ";", "the", "remainder", "either", "introduce", "premature", "termination", "codons", "or", "create", "frameshifts", "both", "of", "which", "result", "in", "mRNA", "instability", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "four", "families", "missense", "mutations", "result", "in", "loss", "of", "most", "of", "the", "protein", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "clinical", "effects", "of", "these", "mutations", "are", "short", "stature", ",", "a", "high", "incidence", "of", "joint", "contractures", "at", "birth", "and", "progressive", "scoliosis", "and", "fractures", ",", "but", "there", "is", "remarkable", "variability", "in", "phenotype", "even", "within", "families", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "loss", "of", "the", "activity", "of", "FKBP65", "has", "several", "effects", ":", "type", "I", "procollagen", "secretion", "is", "slightly", "delayed", ",", "the", "stabilization", "of", "the", "intact", "trimer", "is", "incomplete", "and", "there", "is", "diminished", "hydroxylation", "of", "the", "telopeptide", "lysyl", "residues", "involved", "in", "intermolecular", "cross", "-", "link", "formation", "in", "bone", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "The", "phenotype", "overlaps", "with", "that", "seen", "with", "mutations", "in", "PLOD2", "(", "Bruck", "syndrome", "II", ")", ",", "which", "encodes", "LH2", ",", "the", "enzyme", "that", "hydroxylates", "the", "telopeptide", "lysyl", "residues", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O", "B-CHEMICAL", "O", "O" ]

[ "These", "findings", "define", "a", "set", "of", "genes", ",", "FKBP10", ",", "PLOD2", "and", "SERPINH1", ",", "that", "act", "during", "procollagen", "maturation", "to", "contribute", "to", "molecular", "stability", "and", "post", "-", "translational", "modification", "of", "type", "I", "procollagen", ",", "without", "which", "bone", "mass", "and", "quality", "are", "abnormal", "and", "fractures", "and", "contractures", "result", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "vitro", "models", "for", "assessing", "the", "potential", "cardiovascular", "disease", "risk", "associated", "with", "cigarette", "smoking", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Atherosclerotic", "cardiovascular", "disease", "is", "a", "prevalent", "human", "disorder", "and", "a", "significant", "cause", "of", "human", "morbidity", "and", "mortality", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "number", "of", "risk", "factors", "may", "predispose", "an", "individual", "to", "developing", "atherosclerosis", ",", "and", "of", "these", "factors", ",", "cigarette", "smoking", "is", "strongly", "associated", "with", "the", "development", "of", "cardiovascular", "disease", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Current", "thinking", "suggests", "that", "exposure", "to", "toxicants", "found", "in", "cigarette", "smoke", "may", "be", "responsible", "for", "this", "elevated", "disease", "likelihood", ",", "and", "this", "gives", "rise", "to", "the", "idea", "that", "reductions", "in", "the", "levels", "of", "some", "smoke", "toxicants", "may", "reduce", "the", "harm", "associated", "with", "cigarette", "smoking", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "To", "assess", "the", "disease", "risk", "of", "individuals", "who", "smoke", "cigarettes", "with", "altered", "toxicant", "levels", ",", "a", "weight", "-", "of", "-", "evidence", "approach", "is", "required", "examining", "both", "exposure", "and", "disease", "-", "related", "endpoints", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "A", "key", "element", "of", "such", "an", "assessment", "framework", "are", "data", "derived", "from", "the", "use", "of", "in", "vitro", "models", "of", "cardiovascular", "disease", ",", "which", "when", "considered", "alongside", "other", "forms", "of", "data", "(", "e", ".", "g", ".", "from", "clinical", "studies", ")", "may", "support", "evidence", "of", "potential", "reduced", "risk", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Importantly", ",", "such", "models", "may", "also", "be", "used", "to", "provide", "mechanistic", "insight", "into", "the", "effects", "of", "smoking", "and", "of", "smoke", "toxicant", "exposure", "in", "cardiovascular", "disease", "development", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "review", "the", "use", "of", "in", "vitro", "models", "of", "cardiovascular", "disease", "and", "one", "of", "the", "contributory", "factors", ",", "oxidative", "stress", ",", "is", "discussed", "in", "the", "context", "of", "assessing", "the", "risk", "potential", "of", "both", "conventional", "and", "modified", "cigarettes", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]