@transform( makeAnnotations,
            suffix('.annotations.gz'), 
            '_annotations.load' )
def loadAnnotations( infile, outfile ):

    tablename = P.toTable( outfile )

    statement = '''gunzip 
    < %(infile)s
    |python %(scriptsdir)s/csv2db.py %(csv2db_options)s 
              --quick
              --map=gene_id:str 
              --index=gene_id 
              --table=%(tablename)s
              --map=base_qualities:text 
    > %(outfile)s
    '''
    P.run()

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load annotations
dataset/ETHPy150Open CGATOxford/cgat/obsolete/pipeline_snps.py/loadAnnotations