@transform( runExternalDatasetGAT, suffix(".tsv"), ".tsv.load" )
def loadExternalDatasetGAT(infile, outfile):
    statement = """cat %(infile)s | grep -v "^#" | python %(scriptsdir)s/csv2db.py
                         --database=%(database)s
                         --table=external_dataset_gat_results gat/external_dataset_gat.tsv
                    > %(outfile)s"""
    P.run()

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## Section 4: Annotate predicted CGI Intervals
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Load genome association tester results into database
dataset/ETHPy150Open CGATOxford/cgat/obsolete/pipeline_proj007.py/loadExternalDatasetGAT