L'indicazione per l'amnioinfusione è
Distress fetale
Sospette anomalie renali
Per facilitare il travaglio
Oligoidramnios
L'amnioinfusione con soluzione salina calda può essere eseguita in presenza di decelerazioni variabili dovute alla compressione del midollo nell'oligoidramnios. 
Il ruolo dell'amnioinfusione nei casi di liquido amniotico macchiato di meconio non è chiaro. Viene abitualmente utilizzato per diluire il meconio e ridurre il rischio di sindrome da aspirazione di meconio.