Enzimi di restrizione Tipo II –
Sequenze di DNA specifiche del metilato
Taglia specifiche sequenze palindromiche di DNA
Aiuta nella digestione delle proteine
Aiuta a mantenere spiegata la proteina nascente
Gli enzimi di restrizione di tipo II identificano le sequenze palindromiche sul DNA e tagliano il filamento di DNA in un determinato sito specifico. Tipi di enzimi di restrizione
Gli enzimi di restrizione sono tradizionalmente classificati in quattro tipi sulla base della composizione delle subunità, della posizione di scissione, della specificità della sequenza e dei requisiti dei cofattori. Tuttavia, il sequenziamento degli amminoacidi ha scoperto una straordinaria varietà tra gli enzimi di restrizione e ha rivelato che a livello molecolare esistono molti più di quattro tipi diversi.
Gli enzimi di tipo I sono enzimi complessi, multisubunità, combinati di restrizione e modificazione che tagliano il DNA in modo casuale lontano dalle sequenze di riconoscimento.
Gli enzimi di tipo II tagliano il DNA in posizioni definite vicino o all'interno delle loro sequenze di riconoscimento. Producono frammenti di restrizione discreti e modelli distinti di bande di gel e sono l'unica classe utilizzata in laboratorio per l'analisi del DNA e la clonazione genetica. Piuttosto che formare un’unica famiglia di proteine ​​correlate, gli enzimi di tipo II sono un insieme di proteine ​​non correlate di molti tipi diversi. Gli enzimi di tipo II spesso differiscono così profondamente tra loro, e in effetti da ogni altra proteina conosciuta, nella sequenza aminoacidica, da esemplificare la classe di proteine ​​in rapida evoluzione che sono spesso indicative del coinvolgimento nelle interazioni ospite-parassita. Gli enzimi di tipo II più comuni sono quelli come HhaI, HindIII e NotI che scindono il DNA all'interno delle loro sequenze di riconoscimento. Enzimi di questo tipo sono i principali disponibili in commercio. Gli enzimi di tipo III sono anche grandi enzimi di restrizione e modificazione combinati. Si scindono al di fuori delle loro sequenze di riconoscimento e richiedono due di tali sequenze con orientamenti opposti all'interno della stessa molecola di DNA per realizzare la scissione; raramente forniscono digest completi.
Gli enzimi di tipo IV riconoscono il DNA modificato, tipicamente metilato e sono esemplificati dai sistemi McrBC e Mrr di E. coli.