Il modo migliore per rilevare la presenza di virus nella coltura cellulare infetta è:
Cambiamenti citopatici nelle cellule di coltura
Presenza di proteina virale nel monostrato infetto
Test di emoagglutinazione
Test di inibizione dell'emoagglutinazione
I cambiamenti nella morfologia cellulare causati dall'infezione del virus sono chiamati effetti citopatici (CPE).
Per osservare questi cambiamenti cellulari al microscopio ottico, le colture cellulari sono state colorate con ematossilina, un colorante basico, ed eosina, un colorante acido. 
Esempi comuni sono l'arrotondamento della cellula infetta, la fusione con cellule adiacenti per formare un sincizio (policariociti) e la comparsa di corpi inclusi nucleari o citoplasmatici.