I virus più comuni isolati dall’herpangina sono:
CVA
CVB
Echovirus
EV71
La parola herpangina deriva da herpes, che significa "eruzione vescicolare", e angina, che significa "infiammazione della gola". 
Il CVA (Coxsackievirus A) (sierotipi 1–10, 16 e 22) sono i virus più comuni isolati da questa malattia. 
Ma in questa condizione sono stati identificati anche CVB1-5, 91.102 echovirus ed EV71.