L'HLA importante nell'IDDM è -.
HLA-A3
HLA-B27
HLA-DR3/DR4
HLA-W1
Il 95% dei pazienti con IDDM (diabete mellito di tipo I) esprime HLA DR3 o HLA DR4 o la configurazione eterozigote DR3 / DR4. 
Non si osserva alcuna associazione HLA con il diabete mellito di tipo II o NIDDM.