Nella clonazione molecolare, lo screening blu-bianco viene utilizzato per:
Per lo screening dei vettori ricombinanti
Per rilevare mutazioni genetiche
Per identificare l'inserto di DNA cromosomico desiderato nei vettori plasmidici
Per rilevare il DNA ospite in situ
Lo screening per selezionare le cellule con DNA vettore contenente la sequenza di DNA inserzionale desiderata può essere effettuato mediante:


Marcatori di resistenza agli antibiotici: consentono la crescita solo delle cellule in cui il vettore è stato trasfettato.
Schermatura blu-bianco:- Si basa sull'operone lac. L'idrolisi di X-gal da parte della β-galattosidasi provoca il colore blu nelle colonie e indica che le colonie contengono il vettore non legato. Le colonie bianche invece indicano l'inserimento di DNA estraneo e la perdita della capacità delle cellule di idrolizzare il marcatore.
PCR, analisi di frammenti di restrizione e sequenziamento del DNA:- Metodi di conferma.