Apo B48 e Apo B100 sono sintetizzati dallo stesso mRNA; la differenza tra loro è dovuta a
Splicing dell’RNA
Esclusione allelica
Deaminazione della citidina a uridina
Repressione a monte
La proteina si presenta nel plasma in 2 isoforme principali, ApoB48 e ApoB100. Il primo viene sintetizzato esclusivamente dall'intestino tenue, il secondo dal fegato. ApoB-100 è la più grande del gruppo di proteine ​​apoB, costituito da 4563 aminoacidi. Entrambe le isoforme sono codificate da APOB e da un singolo trascritto di mRNA più grande di 16 kb. ApoB48 viene generato quando un codone di stop (UAA) sul residuo 2153 viene creato mediante l'editing dell'RNA. Sembra che ci sia un gene di splicing tessuto-specifico che agisce trans e che determina quale isoforma verrà infine prodotta. In alternativa, vi sono prove che un elemento ad azione cis, diverse migliaia di bp a monte, determina quale isoforma viene prodotta. Come risultato dell'editing dell'RNA, ApoB48 e ApoB100 condividono una sequenza N-terminale comune, ma ApoB48 è priva della regione di legame del recettore LDL C-terminale di ApoB100. Infatti ApoB48 è così chiamata perché costituisce il 48% della sequenza dell'ApoB100. ApoB 48 è una proteina unica per i chilomicroni dell'intestino tenue. Dopo che la maggior parte dei lipidi nei chilomicroni sono stati assorbiti, l'ApoB48 ritorna al fegato come pa del residuo dei chilomicroni, dove viene endocitato e degradato
Metabolism of nucleic acids