L'indicazione di contaminazione fecale dell'acqua è dovuta alla presenza di tutto, TRANNE:
Enterococchi
Coliformi
E.coli
Clostridium difficile
L'indicatore batterico primario consigliato a questo scopo è il gruppo di organismi coliformi. Organismi indicatori supplementari sono: Gruppo fecale: E.coli, streptococchi fecali e batteri solfito riduttori Gruppo non fecale: Klebsiella aerogenes. Clostridium perfrigens: le spore sono in grado di sopravvivere nell'acqua per un tempo più lungo rispetto agli organismi del gruppo dei coliformi e solitamente resistenti alla clorazione. Rif: Park, 20a edizione, pagina 630