Il glutammato che entra nel cervello insieme all'ammoniaca si trasforma nel seguente amminoacido:
Glutammina
Arginina
Gliceride
Glicina
L'assorbimento del glutammato da parte del cervello è approssimativamente bilanciato dalla produzione di glutammina. Il glutammato che entra nel cervello si associa all'ammoniaca e se ne va come glutammina. La conversione del glutammato, ovvero la conversione della glutammina nel cervello, l'opposto della reazione nei reni che produce parte dell'ammoniaca che entra nei tubuli, funge da meccanismo disintossicante per mantenere il cervello libero dall'ammoniaca. L'ammoniaca è molto tossica per le cellule nervose e si ritiene che l'intossicazione da ammoniaca sia una delle principali cause dei bizzarri sintomi neurologici del coma epatico. Rif: Barrett K.E., Barman SM, Boitano S., Brooks HL (2012). Capitolo 33. Circolazione nelle regioni speciali. In K.E. Barrett, S.M. Barman, S. Boitano, HL Brooks (a cura di), Recensione di fisiologia medica di Ganong, 24e.