Viene utilizzato il polimorfismo della lunghezza del frammento di restrizione
Analisi delle strutture dei cromosomi
Stima del DNA
Sintesi dell'acido nucleico
Rilevamento delle proteine ​​in una cellula
RFLP può essere osservato tagliando il DNA in frammenti con enzimi di restrizione. La lunghezza dei frammenti di restrizione viene alterata se la variante genetica altera il DNA. Non stima il DNA ma rileva la variazione nella struttura del DNA. Il DNA è contenuto nei cromosomi. RFLP veniva utilizzato anche per tracciare i cromosomi dai genitori alla prole.