Le caratteristiche patologiche del cervello nell'AIDS sono tutte, tranne:
Invasione perivascolare di cellule giganti
Noduli microgliali
Vasculite
Infarto del lobo temporale
Altri aspetti patologici caratteristici del sistema nervoso centrale nell'AIDS sono:

Cambiamenti spongiformi diffusi e focali
Mielopatia vacuolare della colonna post-colonna del midollo spinale.
Le principali cellule colpite sono i macrofagi e i monociti.
Il reperto più caratteristico è la reazione infiammatoria cronica con infiltrati ampiamente distribuiti di noduli microgliali.
"A differenza della maggior parte delle altre encefaliti virali, l'HIV non sembra infettare i neuroni e la perivasculite è evidentemente assente"   - pagina 2728, 10 della patologia ANDERSON.
"Le caratteristiche cellule giganti multinucleari di origine macrofagica sono visibili nella sostanza bianca profonda dei lobi frontali e temporali, in particolare in posizione perivascolare" - pagina 10/e Anderson.