Il confronto della sequenza aminoacidica del citocromo C di specie diverse mostra molte variazioni. La maggior parte di queste variazioni si trovano:
A caso
Solo nelle regioni elicoidali
Solo nelle regioni del filo
Principalmente nelle regioni del circuito
La maggior parte delle variazioni nella sequenza aminoacidica del citocromo c influenzano la struttura primaria in modo da non influenzare le strutture secondarie e teiera che sono più importanti per la funzione. Gli amminoacidi che non possono essere sostituiti senza una modifica importante delle proprietà enzimatiche del citocromo c non lo sono alterato. Pertanto gli amminoacidi nelle posizioni che determinano la struttura secondaria della proteina (anse, elica o filamenti) vengono preservati mentre gli amminoacidi che non contribuiscono alla determinazione della struttura secondaria e tearia vengono preferenzialmente alterati. È probabile che queste alterazioni siano distribuite in modo casuale poiché risultano da mutazioni puntiformi sul gene responsabile e questa è la migliore risposta all'esclusione qui.