Cosa è vero riguardo all’analisi di linkage nei disturbi genetici familiari?
Utile per creare l'albero genealogico per mostrare i membri della famiglia affetti e non affetti
Utilizzato per creare pedigree cha per mostrare la non paternità
Il polimorfismo caratteristico del DNA in una famiglia è associato a disturbi
Pedigree cha per identificare la frequenza della malattia
Un polimorfismo caratteristico del DNA in una famiglia è associato a disturbi [Ref: Harrison 17/e p4031 Non siamo in grado di dare un senso alle opzioni, ma vediamo in cosa consiste l'analisi di linkage. Almeno questo potrebbe aiutare un po'... Preparatevi alle opzioni corrette o ad altre opzioni negli esami. Il genoma umano è molto grande e contiene molte migliaia di geni. Pertanto, trovare il gene o i geni responsabili di una determinata malattia umana è molto difficile. Tradizionalmente, la ricerca di un gene responsabile di una malattia inizia con l'analisi del legame. In questo approccio, l'obiettivo è scoprire la posizione approssimativa del gene rispetto a un'altra sequenza di DNA, chiamata marcatore genetico, la cui posizione è già nota. Il principio dell'analisi di linkage: Due principi fondamentali sono essenziali per comprendere il concetto di linkage. 1) Quando due geni o alleli sono vicini su un cromosoma, di solito vengono trasmessi insieme. Si dice quindi che sono collegati. Ad esempio, nei moscerini della frutta i geni che influenzano il colore degli occhi e la lunghezza delle ali sono ereditati insieme perché compaiono sullo stesso cromosoma. Gli alleli dei geni che si trovano su cromosomi diversi di solito non sono collegati, a causa dell'associazione indipendente dei cromosomi durante la meiosi. 2) Poiché durante la segregazione dei cromosomi si verifica un incrocio di DNA, anche gli alleli legati sullo stesso cromosoma possono essere separati e andare a cellule figlie diverse. La probabilità che ciò accada è maggiore se gli alleli sono lontani tra loro sul cromosoma, poiché è più probabile che si verifichi un crossing-over tra di essi. Le probabilità di crossing over, o evento ricombinante, tra due geni collegati sono proporzionali alla distanza che li separa. Pertanto, i geni lontani hanno più probabilità di subire un evento di ricombinazione rispetto ai geni molto vicini. Elaborando il numero di ricombinanti è quindi possibile ottenere una misura della distanza tra i geni. Questa distanza è chiamata unità di mappa genetica (m.u.), o centimorgan e viene definita come la distanza tra i geni per i quali un prodotto della meiosi su 100 è ricombinante. Una mappa di linkage viene creata trovando le distanze di mappa tra i numeri di tratti presenti sullo stesso cromosoma, evitando idealmente di avere lacune significative tra i tratti per evitare le imprecisioni che si verificheranno a causa della possibilità di eventi di ricombinazione multipli. La mappatura del legame è fondamentale per identificare la posizione dei geni che causano le malattie genetiche. Una mappa di linkage è una mappa cromosomica di una specie o di una popolazione sperimentale che mostra la posizione dei geni e/o dei marcatori noti l'uno rispetto all'altro in termini di frequenza di ricombinazione, piuttosto che come distanza fisica specifica lungo ciascun cromosoma. Il polimorfismo è essenziale per gli studi di linkage perché fornisce un mezzo per distinguere i cromosomi materni e paterni in un individuo. Tutti i cromosomi sono accoppiati, uno ereditato dalla madre e uno dal padre. Ogni coppia di cromosomi contiene gli stessi geni nello stesso ordine, ma le sequenze non sono identiche. Ciò significa che dovrebbe essere facile scoprire se una sequenza paica proviene da nostra madre o da nostro padre. Queste varianti di sequenza sono chiamate alleli materni e paterni. I marcatori genetici sono sequenze di DNA che mostrano polimorfismo (variazioni di dimensione o sequenza) nella popolazione. Sono presenti in tutti e possono essere tipizzati (l'allele può essere identificato) utilizzando tecniche come la reazione a catena della polimerasi. I geni malattia vengono mappati misurando la ricombinazione rispetto a un pannello di marcatori diversi distribuiti sull'intero genoma. Nella maggior parte dei casi, la ricombinazione si verifica frequentemente, indicando che il gene della malattia e il marcatore sono lontani. Alcuni marcatori, tuttavia, a causa della loro vicinanza, tenderanno a non ricombinare con il gene della malattia e si dice che siano legati ad esso. Idealmente, vengono identificati marcatori vicini che affiancano il gene della malattia e definiscono una regione candidata del genoma di lunghezza compresa tra 1 e 5 milioni di bp. Il gene responsabile della malattia si trova da qualche parte in questa regione. Il legame è espresso come lod (logaritmo del punteggio di probabilità), ossia il rapporto tra la probabilità che i loci della malattia e i marcatori siano collegati piuttosto che non collegati. Per convenzione, un punteggio lod superiore a 3,0 è considerato un'evidenza di linkage. (Un punteggio di +3,0 significa che la probabilità di osservare il pedigree dato se i due loci non sono collegati è inferiore a 1 su 1000). D'altra parte, un punteggio lod inferiore a -2,0 è considerato una prova per escludere il linkage. I marcatori più vicini al gene della malattia hanno meno probabilità di subire eventi di ricombinazione e quindi ricevono un punteggio di linkage più alto. L'analisi di linkage è possibile solo per le malattie familiari, per le quali viene effettuata un'analisi del pedigree della malattia in quella famiglia. Tutta la famiglia viene esaminata per verificare la presenza di tutti i polimorfismi noti. In seguito, il polimorfismo presente in tutti i casi affetti viene identificato come l'allele legato e, in base alla posizione di questo polimorfismo, è possibile identificare la possibile posizione del gene della malattia.