Il termine base modificata si riferisce a
Purina o pirimidina attaccata al desossiribosio
Una purina o pirimidina che è stata alterata
Un anello contenente azoto diverso da una purina o una pirimidina che fa parte di un nucleotide
Una purina o pirimidina attaccata ad uno zucchero tramite legame O-glicoside
Una base modificata è una base che è stata modificata dopo la formazione della catena dell'acido nucleico. Queste basi vengono modificate mediante metilazione, riduzione, acetilazione o glicosilazione.
Nel t-RNA ci sono molte basi modificate, ad es. diidrouridina, ribotimidina, pseudouridina e 7-metilguanosina.
Nel DNA, la base modificata più comune è la 5-metilcitosina.
Altre importanti basi modificate sono l'acetilcitosina e la dimetiladenina.