L’amminoacido che destabilizza l’alfa-elica è:
Prolina
Alanina
Glutammina
Triptofano
La prolina è priva di un protone ammidico, questo preclude il legame idrogeno tra essa e gli accettori di legami idrogeno, e quindi spesso limita il residuo alle prime quattro posizioni di un'elica a. Le eliche con prolina dopo la posizione quattro hanno una piega pronunciata. a -elica: È una struttura a spirale risultante dal legame idrogeno tra un legame peptidico e il quarto. Stabilità di un'elica a: La stabilità di un'elica a deriva principalmente dai legami idrogeno formati tra l'ossigeno del legame peptidico carbonilico e l'atomo di idrogeno dell'azoto del legame peptidico del residuo fouh lungo la catena polipeptidica. La capacità di formare il numero massimo di legami idrogeno, integrata dalle interazioni di van der Waals nel nucleo di questa struttura fitta, fornisce la forza motrice termodinamica per la formazione di un'elica. Prolina: l'azoto del legame peptidico della prolina è privo di un atomo di idrogeno per contribuire a un legame idrogeno, la prolina può essere alloggiata stabilmente solo all'interno del primo giro di un'elica. Quando è presente altrove, la prolina sconvolge la conformazione dell'elica, producendo una curvatura. La glicina tende anche a distruggere le eliche perché la sua elevata flessibilità conformazionale rende entropicamente costoso adottare la struttura a-elica relativamente vincolata. Rif: Biologia molecolare: dai geni alle proteine, di Buon E. Tropp, 4a edizione, pagina 53.