Il gene che definisce la localizzazione dei germi dei denti è:
Fgf-8
Bmp-2
Dlx-5
Pax-9
Durante lo sviluppo dei denti, diverse molecole mesenchimali e i loro recettori agiscono come mediatori delle interazioni epiteliale-mesenchimali. Proteine ​​morfogenetiche ossee (BMP) 2,4,7 Gli mRNA si spostano tra l'epitelio e il mesenchima durante la regolazione della morfogenesi dei denti. Il fattore di crescita dei fibroblasti (FGF8 FGF9) è stato localizzato nel mesenchima dentale e agisce tramite i fattori a valle MSX1 e PAX9. I geni homeobox specifici del muscolo MSX-1 e MSX-2 sembrano essere coinvolti nelle interazioni epiteliali-mesenchimali e nello sviluppo craniofacciale, in particolare nell'inizio della posizione di sviluppo (MSX-1) e nell'ulteriore sviluppo (MSX-2) delle gemme dentali. Pax-9 è il fattore di trascrizione necessario per lo sviluppo di (MSX 2) delle gemme dei denti. Pax 9 è un fattore di trascrizione necessario per la morfologia dei denti.