Le mutazioni di sostituzione delle basi possono avere le seguenti conseguenze molecolari tranne:
Cambia un codone di un amminoacido in un altro codone dello stesso amminoacido
Il codone di un amminoacido viene trasformato nel codone di un altro amminoacido
Il frame di lettura cambia a valle del sito mutante
Il codone di un amminoacido viene trasformato in un codone di terminazione della traduzione
C cioè il frame di lettura cambia a valle del sito mutante