I virus possono essere isolati da campioni clinici mediante coltivazione nei seguenti casi, tranne:
Coltura di tessuti
Uova embrionate
Animali
Mezzi chimicamente definiti
Coltivazione di virus 
"Poiché i virus sono parassiti intracellulari obbligati, non possono essere coltivati ​​su alcun terreno di coltura inanimato". Per la coltivazione dei virus vengono utilizzati tre metodi:
1. Inoculazione degli animali

Metodo più antico
I topi sono gli animali più ampiamente utilizzati
Altri animali utilizzati sono porcellini d'India, conigli e furetti.

2. Uova embrionate

I siti di inoculazione sono:


Membrana corioallantoica -----   vengono prodotte macchie visibili → HSV, vaccini, vaiolo
Sacco amniotico
Cavità allantoica 


Influenza
Alcuni paramixovirus


Sacco tuorlo


Alcuni virus
Clamidia
Rickettsia

3. Coltura dei tessuti

Il metodo più importante per l'isolamento del virus. 
Sono disponibili tre tipi di coltura tissutale


Cultura d'organo
Cultura dell'espianto
Coltura cellulare - (utilizzata abitualmente)