I microrganismi possono sviluppare resistenza a vari farmaci attraverso:
Diminuzione dell'affinità del farmaco per il bersaglio.
Elaborazione degli enzimi che inattivano il farmaco.
Sviluppo di vie metaboliche alternative.
Tutti i precedenti.
Diminuzione dell'affinità per il target, ad es. pneumococchi e stafilococchi possono sviluppare proteine ​​leganti la penicillina alterate.
Sviluppo di percorsi metabolici alternativi, ad es. gli organismi resistenti ai sulfamidici iniziano a utilizzare l'acido folico preformato invece di sintetizzarlo dal PABA.
Elaborazione degli enzimi che inattivano il farmaco, ad es. β-lattamasi (penicilline e cefalosporine), cloramfenicolo acetil transferasi (cloramfenicolo) ed enzimi inattivanti gli aminoglicosidi (aminoglicosidi).
Diminuzione della permeabilità del farmaco a causa della perdita di canali specifici, ad es. gli aminoglicosidi e le tetracicline raggiungono concentrazioni di farmaco molto inferiori negli organismi resistenti rispetto agli organismi sensibili.
Lo sviluppo di pompe di efflusso (tetracicline, eritromicina e fluorochinoloni) si traduce nell'estrusione attiva del farmaco dai microrganismi resistenti.