La cloaca endodermica dà origine a tutte le seguenti condizioni tranne:
Retto
Metà inferiore del canale anale
Metà superiore del canale anale
Mucosa della vescica
La parte inferiore del canale anale al di sotto della linea pettinata si sviluppa dall'invaginazione ectodermica, cioè dal proctodeo.