La reazione di Jarish Herxheimer si osserva nei primi casi di:
Sifilide
Gonorrea
LGV
Granuloma inguinale
La reazione JH è prodotta da sifilide, borreliosi (malattia di Lyme, febbre ricorrente trasmessa dalle zecche), malattia da graffio di gatto, febbre Q, brucellosi, bartonellosi, febbre tifoide.