Nel trattamento dell'ipotiroidismo, la tiroxina è preferita alla liotironina a causa della tiroxina:
Agisce più velocemente
Ha una maggiore affinità per i recettori degli ormoni tiroidei
Ha un'emivita più lunga
Può essere prodotto più facilmente mediante la tecnologia del DNA ricombinante
La liotironina (T3) rispetto alla tiroxina (T4) è:

Azione rapida
Più potente
Breve emivita

Un'indicazione della liotironina include il coma mixedema e per la maggior parte delle indicazioni viene utilizzata la tiroxina perché ha una lunga emivita, quindi può essere utilizzata meno frequentemente della T3.