La compromissione della competenza immunitaria è il fattore predisponente in circa la metà di tutte le persone che la sviluppano
Istoplasmosi
Coccidoidomicosi
Blastomicosi
Criptococcosi
Le infezioni fungine e da lieviti, soprattutto candidosi, aspergillosi e mucormicosi, si verificano frequentemente in pazienti gravemente immunodepressi, in particolare quelli che hanno ricevuto antibiotici ad ampio spettro per un periodo prolungato. In questi pazienti si verificano numerosi altri tipi di infezioni fungine. Circa il 75% di tutti i casi di infezione da Cryptococcus neoformans si verifica in persone affette da AIDS o linfoma, che assumono glucocorticoidi o che sono altrimenti immunocompromesse. L'associazione tra meningite criptococcica e malattia di Hodgkin è importante dal punto di vista clinico.