Il vantaggio della soluzione di fluoruro di fosfato acidulato è-
È buono da gustare e può essere conservato in un contenitore di vetro
Non è necessaria alcuna ripetuta evacuazione tramite aspirazione
Nessun effetto sul restauro in composito esistente
Ha la capacità di depositare il fluoro nello smalto a una profondità maggiore rispetto al fluoruro di sodio neutro o al fluoruro stannoso
Vantaggi del fluoruro fosfato acidulato 

Richiede solo 2 applicazioni in un anno ed è quindi adatto alla maggior parte delle routine degli studi dentistici. 
La preparazione del gel può essere applicata autonomamente e quindi anche il costo dell'applicazione viene ridotto. 
Ha la capacità di depositare il fluoro nello smalto a una profondità maggiore rispetto al fluoruro di sodio neutro o al fluoruro stannoso 
L'APF è stabile e non è necessario prepararlo al momento per ciascun paziente. 

Svantaggi del fluoruro fosfato acidulato 

Difficoltà pratiche come i denti dovrebbero essere mantenute bagnate per 4 minuti. Pertanto, applicazioni ripetute richiedono l'uso dell'aspirazione, riducendo così al minimo il suo utilizzo sul campo. Ciò aumenta anche il tempo alla poltrona, rendendo questo metodo più costoso. 
Ha un sapore acido, acido e amaro. 
Non può essere conservato in contenitori di vetro. 
L'esposizione ripetuta o prolungata di restauri in porcellana o composito all'APF può provocare perdita di materiali, irruvidimento della superficie e possibili modifiche estetiche.