Nel pemfigo volgare sono presenti anticorpi contro:
Membrana basale
Sostanza intercellulare
Nucleo cellulare
Cheratina
Nel pemfigo gli anticorpi sono diretti contro la desmogleina (una glicoproteina desmosomiale transmembrana appartenente alla caderina, una molecola di adesione calcio-dipendente) nella sostanza intercellulare causando perdita di coesione tra le cellule epidermiche (dello strato basale) I/t formazione di cellule acantolitiche che possono essere visto sullo striscio di Tzank. .