L'apoproteina-A-1 è associata a:
LDL
VLDL
HDL
Chilomicroni
Apolipoproteina A-II È il principale componente proteico delle lipoproteine ​​ad alta densità (HDL) nel plasma. Anche i chilomicroni secreti dagli enterociti intestinali contengono ApoAl, ma viene rapidamente trasferito all'HDL nel flusso sanguigno. La proteina favorisce l'efflusso dei grassi, compreso il colesterolo, dai tessuti al fegato per l'escrezione. È un cofattore della lecitina colesteroloaciltransferasi (LCAT), responsabile della formazione della maggior parte degli esteri del colesterolo plasmatico. I difetti nel gene che la codifica sono associati a carenze di HDL, inclusa la malattia di Tangeri, e all'amiloidosi sistemica non neuropatica .