La scatola TATA è vista in -
Regione promotrice
Regione palindromica
Enhancerregion
Regione del silenziatore
Ris. è 'a' cioè regione promotrice Queste sono le sequenze consenso del DNA presenti sullo stesso cromosoma, che deve essere trascritto. Queste sono - Sequenze promotore-prossimale (o semplicemente promotori):- Queste sono sequenze consenso, che si trovano vicino al sito di inizio della trascrizione. Questi possono essere suddivisi in: -i) Promotori che definiscono dove deve iniziare la trascrizione. Questi sono -TATA Box (scatola di Hogness) È quasi identico a quello della scatola di Pribnow della regione del promotore procariotico. Si trova - 25 paia di basi cioè 25 bp a monte (verso l'estremità 5l) dal sito di inizio della trascrizione. La sequenza dell'iniziatore (Inr)Is si trova da -3 bp (a monte) a +5 bp (a valle) dal sito di inizio della trascrizione. Elemento promotore a valle (DPE) Si trova a -25 bp (a valle) dal sito di inizio. È l'unica eccezione delle sequenze promotrici, che fanno parte del gene strutturale stesso.# L'RNA polimerasi umana (eucariotica) non può legarsi direttamente a queste sequenze promotrici. Il fattore di trascrizione IID{TFIID) dirige il legame della RNA polimerasi alla sequenza del promotore. TF II D è costituito da due componenti: la proteina legante TATA (TBP) e i fattori associati al TBP (TAF). La scatola TATA è legata dalle subunità TBP del TF II D e dirige il legame della RNA polimerasi. Inr e DPE sono legati dalle subunità TAF di TF II D per dirigere il legame della RNA polimerasi,ii) Promotori che definiscono la frequenza con cui avverrà la trascrizione Questi sono: GCbox;- Si trova ovunque tra -75 e -25 bp dal sito di inizio . Si lega alla proteina SP-1.b) CAA T boxSi trova a -7,5 bp dal sito di inizio. Si lega al fattore di trascrizione legante CA AT (C T F). Potenziatori: - Queste sono sequenze di DNA che aumentano la velocità di inizio della trascrizione da parte della RNA polimerasi II. Questi si trovano molto lontano dal sito di iniziazione. La sequenza è chiamata "elemento di risposta" che si lega a specifici fattori di trascrizione (TF), cioè fattori di trascrizione che legano il potenziatore e funzionano come attivatori di trascrizione. Silenziatori (o repressori): - Queste sequenze diminuiscono la trascrizione. Fattori transattivi Sono varie proteine/fattori codificati da sequenze di DNA di geni presenti su cromosomi diversi, cioè su cromosomi diversi da quello da trascrivere. Sono - Fattori generali di trascrizione che facilitano il legame della RNA polimerasi II alla sequenza prossimale del promotore e contribuiscono a formare il complesso di pre-inizio (PIC). Esempi sono TFIIA, TF IIB, TFIID, TFIIE, TFIIF, TF IIH; Coattivatori Questi regolano la velocità di trascrizione legandosi a TF, ad es. Subunità TAF di TFII D, HAT, HD AC. Attivatori Si legano alla casella GC o alla casella CAAT, ad es. SP-1 e CTF che si legano rispettivamente al box GC e al box CAAT. Fattori che si legano al potenziatore o ai silenziatori, ad es. Proteina legante HRE.
Molecular Genetics