Il clitoride si sviluppa da quale dei seguenti:
Tubercolo genitale
Cresta genitale
Condotto Wolffiano
Condotto Mulleriano
Tubercolo fallico o tubercolo genitale Presente nello sviluppo degli organi urinari e riproduttivi. Si forma nella regione ventrale e caudale degli embrioni di mammiferi di entrambi i sessi e alla fine si sviluppa in un fallo. Nel feto umano il tubercolo genitale si sviluppa intorno alla quarta settimana di gestazione e entro la nona settimana diventa riconoscibilmente un clitoride o un pene. Questo non deve essere confuso con il tubercolo del seno che è una proliferazione dell'endoderma indotta dai dotti paramesonefici. Anche dopo che il fallo si è sviluppato, il termine tubercolo genitale rimane, ma solo come sua estremità terminale, che si sviluppa nel glande o nel glande del clitoride.