Tra una visita e l'altra, la riacutizzazione endodontica è causata da:
candida albicans
Actinomyces viscoso
F. nucleatum
P. gengivale
In un caso di parodontite apicale asintomatica, esiste un equilibrio tra la microflora infettiva e i meccanismi difensivi del sistema immunitario umano nei tessuti parodontali. Questo fenomeno è chiamato “sindrome da adattamento locale”.
Nel caso della parodontite apicale sintomatica, quando il dente è sensibile alla percussione, i ceppi di microrganismi predominanti sono Parvimonas micro, Eubacterium, Porphyromonas (P. endodontalis, P. gingivalis) e Prevotella. Soprattutto i BPB (batteri pigmentati di nero) hanno guadagnato molta attenzione.