Nel pemfigo volgare sono presenti anticorpi contro:
Membrana basale
Sostanza intercellulare
Nucleo cellulare
Cheratina
Il pemfigo è una malattia autoimmune, con formazione di anticorpi contro l'antigene del pemfigo presente nella sostanza intercellulare. Gli antigeni del pemfigo sono la desmogleina 3 e 1 in P. vulgaris e la desmogleina 1 in P. foliaceous.