Il cheratocono è associato a tutti tranne:
Sindrome di Down
Sindrome di Ehlers-Danlo
La sindrome di Marfan
La sindrome di Usher
Le condizioni sistemiche associate al cheratocono sono la sindrome di Marfan, l'osteogenesi imperfetta, l'EDS, la sindrome di Down, la MVP, l'atofia (asma, eczema, cheratocongiuntivite atopica, febbre da fieno).