Il metabolismo della prolina avviene in:
Mitocondri
Membrana cellulare
Ribosoma
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Il catabolismo della prolina avviene nei mitocodri. Poiché la prolina non partecipa alla transaminazione, l'azoto di questo imminoacido viene trattenuto durante tutta la sua ossidazione a 1-pirollina-5-carbossilato, l'apertura dell'anello a glutammato-semialdeide e l'ossidazione a glutammato, e viene rimosso solo durante la transaminazione del glutammato a a-chetoglutarato Rif: Harper 28a edizione, capitolo 29.