Alcuni mRNA hanno attività di auto-giunzione. La rimozione degli introni viene eseguita da
Si verificano nell'introne quello del ribozima
Introni che si auto-giungono
Si formano gli intermedi lariati
Tutti questi
Nella biologia molecolare e nella genetica, lo splicing è una modifica di un RNA dopo la trascrizione, in cui gli introni vengono rimossi e gli esoni vengono uniti. Ciò è necessario per il tipico RNA messaggero eucariotico prima che possa essere utilizzato per produrre una proteina corretta attraverso la traduzione. Per molti introni eucariotici, lo splicing avviene in una serie di reazioni che sono catalizzate dallo spliceosoma, un complesso di piccole ribonucleoproteine ​​nucleari (snRNA), ma esistono anche introni che si auto-giungono.

Auto-giunzione

L'auto-giunzione avviene per introni rari che formano un ribozima, eseguendo le funzioni dello spliceosoma mediante il solo RNA.
Esistono tre tipi di introni auto-giuntivanti, Gruppo I, Gruppo II e Gruppo III. Gli introni dei gruppi I e II eseguono uno splicing simile allo spliceosoma senza richiedere alcuna proteina. Questa somiglianza suggerisce che gli introni dei gruppi I e II potrebbero essere evolutivamente correlati allo spliceosoma. L'auto-giunzione potrebbe anche essere molto antica e potrebbe essere esistita in un mondo di RNA presente prima delle proteine.
Sebbene i due meccanismi di splicing descritti di seguito non richiedano la presenza di alcuna proteina, vengono utilizzate 5 molecole di RNA aggiuntive e oltre 50 proteine ​​che idrolizzano molte molecole di ATP. I meccanismi di splicing utilizzano l'ATP per giuntare accuratamente gli mRNA. Se la cellula non utilizzasse alcun ATP, il processo sarebbe altamente impreciso e si verificherebbero molti errori.
Due transesterificazioni caratterizzano il meccanismo in cui gli introni del gruppo I vengono uniti:


3'OH di una guanina libera, un nucleoside (o uno situato nell'introne) o un cofattore nucleotidico (GMP, GDP, GTP) attacca il fosfato nel sito di giunzione 5'.
3' OH dell'esone 5' diventa un nucleofilo e la seconda transesterificazione porta all'unione dei due esoni.


Il meccanismo in cui gli introni del gruppo II vengono giuntati (due reazioni di transesterificazione come gli introni del gruppo I) è il seguente:


Il 2'OH di una specifica adenosina nell'introne attacca il sito di giunzione 5', formando così il lariato.
Il 3'OH dell'esone 5' innesca la seconda transesterificazione nel sito di giunzione 3' unendo così insieme gli esoni.


Le reazioni di transesterificazione spliceosomale e di auto-giunzione avvengono attraverso due reazioni di transesterificazione sequenziali. Innanzitutto, il 2'OH di uno specifico nucleotide del punto di ramificazione all'interno dell'introne definito durante l'assemblaggio dello spliceosoma esegue un attacco nucleofilo sul primo nucleotide dell'introne nel sito di giunzione 5' formando l'intermedio lariat. In secondo luogo, l'OH 3' dell'esone 5' rilasciato esegue quindi un attacco nucleofilo all'ultimo nucleotide dell'introne nel sito di giunzione 3' unendo così gli esoni e rilasciando l'introne lariat.'