L’energia di attivazione è la differenza tra l’energia libera di:
Substrato e prodotto
Substrato e stato di transizione
Stato di transizione e prodotto
Substrato e intermedio
Affinché un substrato diventi prodotto, passa ad uno stato di transizione (S++) che è una specie chimica fugace, momentanea e instabile. Non è né substrato né prodotto. Ha l'energia libera più alta in un diagramma di coordinate di reazione. Ciò crea una barriera energetica affinché il substrato diventi un prodotto. Questa energia è conosciuta come energia di attivazione. DGcat e DGuncat sono l'energia di attivazione (vedi fig). È la differenza di energia libera tra il substrato e quello dello stato di transizione. Anche se il substrato per la formazione del prodotto è endergonico, la formazione del substrato per lo stato di transizione è sempre endergonico.
Enzyme basics and serine proteases