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1 |
+
import streamlit as st
|
2 |
+
from streamlit_option_menu import option_menu
|
3 |
+
import pandas as pd
|
4 |
+
import pickle
|
5 |
+
import lime
|
6 |
+
import lime.lime_tabular
|
7 |
+
import streamlit.components.v1 as components
|
8 |
+
from PIL import Image
|
9 |
+
import seaborn as sns
|
10 |
+
import matplotlib.pyplot as plt
|
11 |
+
|
12 |
+
# 1=sidebar menu, 2=horizontal menu, 3=horizontal menu w/ custom menu
|
13 |
+
EXAMPLE_NO = 3
|
14 |
+
st.set_page_config(layout='wide')
|
15 |
+
st.markdown("""
|
16 |
+
<style>
|
17 |
+
.block-container {
|
18 |
+
padding-top: 2rem;
|
19 |
+
padding-bottom: 0rem;
|
20 |
+
padding-left: 1rem;
|
21 |
+
padding-right: 1rem;
|
22 |
+
}
|
23 |
+
</style>
|
24 |
+
""", unsafe_allow_html=True)
|
25 |
+
|
26 |
+
def streamlit_menu(example=1):
|
27 |
+
if example == 1:
|
28 |
+
# 1. as sidebar menu
|
29 |
+
with st.sidebar:
|
30 |
+
selected = option_menu(
|
31 |
+
menu_title="Main Menu", # required
|
32 |
+
options=["Acceuil", "Statistique", "Prédiction"], # required
|
33 |
+
icons=["house", "book", "bow_and_arrow"], # optional
|
34 |
+
menu_icon="cast", # optional
|
35 |
+
default_index=0, # optional
|
36 |
+
)
|
37 |
+
return selected
|
38 |
+
|
39 |
+
if example == 2:
|
40 |
+
# 2. horizontal menu w/o custom style
|
41 |
+
selected = option_menu(
|
42 |
+
menu_title=None, # required
|
43 |
+
options=["Acceuil", "Statistique", "Prédiction"], # required
|
44 |
+
icons=["house", "book", "envelope"], # optional
|
45 |
+
menu_icon="cast", # optional
|
46 |
+
default_index=0, # optional
|
47 |
+
orientation="horizontal",
|
48 |
+
)
|
49 |
+
return selected
|
50 |
+
|
51 |
+
if example == 3:
|
52 |
+
# 2. horizontal menu with custom style
|
53 |
+
selected = option_menu(
|
54 |
+
menu_title=None, # required
|
55 |
+
options=["Acceuil", "Statistique", "Prédiction"], # required
|
56 |
+
icons=["house", "book", "envelope"], # optional
|
57 |
+
menu_icon="cast", # optional
|
58 |
+
default_index=0, # optional
|
59 |
+
orientation="horizontal",
|
60 |
+
styles={
|
61 |
+
"container": {"padding": "0!important", "background-color": "#fafafa"},
|
62 |
+
"icon": {"color": "orange", "font-size": "25px"},
|
63 |
+
"nav-link": {
|
64 |
+
"font-size": "25px",
|
65 |
+
"text-align": "left",
|
66 |
+
"margin": "0px",
|
67 |
+
"--hover-color": "#eee",
|
68 |
+
},
|
69 |
+
"nav-link-selected": {"background-color": "skyblue"},
|
70 |
+
},
|
71 |
+
)
|
72 |
+
return selected
|
73 |
+
|
74 |
+
|
75 |
+
selected = streamlit_menu(example=EXAMPLE_NO)
|
76 |
+
|
77 |
+
if selected == "Prédiction":
|
78 |
+
# st.title(f"You have selected {selected}")
|
79 |
+
# Load your trained model
|
80 |
+
with open('model.pkl', 'rb') as file:
|
81 |
+
model = pickle.load(file)
|
82 |
+
|
83 |
+
obesity_mapping = {
|
84 |
+
0: 'Normal',
|
85 |
+
1: 'Surpoid\Obése'
|
86 |
+
}
|
87 |
+
# Define the input features for the user to input
|
88 |
+
def user_input_features():
|
89 |
+
age = st.number_input('Age:',min_value=8, max_value=19, value=19, step=1, format="%d")
|
90 |
+
classe = st.radio('Classe_', ('Primaire','Secondaire'))
|
91 |
+
Zone = st.radio('zone', ('Rurale', 'Urbaine'))
|
92 |
+
Voler = st.radio('Voler', ('Oui', 'Non'))
|
93 |
+
Diversité = st.radio('Diversité', ('Mauvaise', 'Bonne'))
|
94 |
+
Region = st.selectbox(
|
95 |
+
'Region de ',
|
96 |
+
('Nord_ouest' ,'Sud_ouest', 'Ouest')
|
97 |
+
)
|
98 |
+
Source_eau=st.selectbox(
|
99 |
+
'Provenence ',
|
100 |
+
('Camwater','Eau_de_surface','forage','Puits','Eau_minérale')
|
101 |
+
)
|
102 |
+
Sexe = st.radio('Genre', ('F', 'M'))
|
103 |
+
|
104 |
+
|
105 |
+
Zone = 1 if Zone == 'Rurale' else 0
|
106 |
+
classe = 1 if classe == 'Primaire' else 0
|
107 |
+
Diversité = 1 if Diversité == 'Mauvaise' else 0
|
108 |
+
Region = ['Nord_ouest' ,'Sud_ouest', 'Ouest'].index(Region)
|
109 |
+
Source_eau=['Camwater','Eau_de_surface','forage','Puits','Eau_minérale'].index(Source_eau)
|
110 |
+
sex_f = 1 if Sexe == 'F' else 0
|
111 |
+
sex_m = 1 if Sexe == 'M' else 0
|
112 |
+
|
113 |
+
data = {
|
114 |
+
'Region': Region,
|
115 |
+
'Zone': Zone,
|
116 |
+
'Classe': classe,
|
117 |
+
'Age': age,
|
118 |
+
'Diversité': Diversité,
|
119 |
+
'Voler': Voler,
|
120 |
+
'Source_eau':Source_eau,
|
121 |
+
'Genre_F': sex_f,
|
122 |
+
'Genre_M': sex_m
|
123 |
+
}
|
124 |
+
features = pd.DataFrame(data, index=[0])
|
125 |
+
return features
|
126 |
+
|
127 |
+
# st.title('Obesity App')
|
128 |
+
|
129 |
+
# Display the input fields
|
130 |
+
input_df = user_input_features()
|
131 |
+
# Convertir toutes les colonnes non numériques en numérique si possible
|
132 |
+
input_df = input_df.apply(pd.to_numeric, errors='coerce')
|
133 |
+
|
134 |
+
# Remplacer les NaN par une valeur arbitraire (par exemple 0) si nécessaire
|
135 |
+
input_df = input_df.fillna(0)
|
136 |
+
|
137 |
+
# Initialiser LIME
|
138 |
+
explainer = lime.lime_tabular.LimeTabularExplainer(
|
139 |
+
training_data=input_df.values, # Entraînement sur la base des données d'entrée
|
140 |
+
feature_names=input_df.columns,
|
141 |
+
class_names=[obesity_mapping[0], obesity_mapping[1]],
|
142 |
+
mode='classification'
|
143 |
+
)
|
144 |
+
|
145 |
+
# Predict button
|
146 |
+
if st.button('Predict'):
|
147 |
+
# Make a prediction
|
148 |
+
prediction = model.predict(input_df)
|
149 |
+
prediction_proba = model.predict_proba(input_df)[0]
|
150 |
+
|
151 |
+
data = {
|
152 |
+
'Statut nutritionnel': [obesity_mapping[i] for i in range(len(prediction_proba))],
|
153 |
+
'Probabilité': prediction_proba
|
154 |
+
}
|
155 |
+
|
156 |
+
# Create a dataframe to display the results
|
157 |
+
result_df = pd.DataFrame(data)
|
158 |
+
|
159 |
+
# Transpose the dataframe to have obesity types as columns and add a row header
|
160 |
+
result_df = result_df.T
|
161 |
+
result_df.columns = result_df.iloc[0]
|
162 |
+
result_df = result_df.drop(result_df.index[0])
|
163 |
+
result_df.index = ['Probability']
|
164 |
+
|
165 |
+
# Display the results in a table with proper formatting
|
166 |
+
st.table(result_df.style.format("{:.4f}"))
|
167 |
+
# Générer l'explication LIME pour l'individu
|
168 |
+
# exp = explainer.explain_instance(input_df.values[0], model.predict_proba, num_features=5)
|
169 |
+
|
170 |
+
# # Afficher les explications dans Streamlit
|
171 |
+
# st.subheader('Explication LIME')
|
172 |
+
# exp.show_in_notebook(show_table=True, show_all=False)
|
173 |
+
# st.write(exp.as_list())
|
174 |
+
# Générer l'explication LIME pour l'individu
|
175 |
+
exp = explainer.explain_instance(input_df.values[0], model.predict_proba, num_features=4)
|
176 |
+
|
177 |
+
# Récupérer l'explication LIME sous forme HTML
|
178 |
+
explanation_html = exp.as_html()
|
179 |
+
|
180 |
+
# Afficher l'explication LIME dans Streamlit
|
181 |
+
st.subheader('Explication LIME')
|
182 |
+
|
183 |
+
# Utiliser Streamlit pour afficher du HTML
|
184 |
+
components.html(explanation_html, height=800) # Ajuster la hauteur selon le contenu
|
185 |
+
|
186 |
+
|
187 |
+
|
188 |
+
if selected == "Acceuil":
|
189 |
+
avant_propos = """
|
190 |
+
<div style="background-color: white; padding: 20px; border-radius: 10px;
|
191 |
+
display: flex; justify-content: center; align-items: center;
|
192 |
+
width: 800px; height: auto; margin: auto; flex-direction: column;
|
193 |
+
box-shadow: 0px 0px 10px rgba(0, 0, 0, 0.1);">
|
194 |
+
<h2 style="color: blue; text-align: center; font-size: 24px;">Avant-propos</h2>
|
195 |
+
<p style="color: blue; text-align: center; font-size: 16px;">
|
196 |
+
L'obésité est l'une des principales préoccupations de santé publique à travers le monde, avec des répercussions notables sur la qualité de vie et les coûts des soins de santé.
|
197 |
+
Dans un contexte où les maladies chroniques liées à l'obésité, telles que le diabète et les maladies cardiovasculaires, continuent de croître, il est impératif de développer des outils capables de prédire et de prévenir cette condition.
|
198 |
+
</p>
|
199 |
+
<p style="color: blue; text-align: center; font-size: 16px;">
|
200 |
+
L'application que nous présentons ici repose sur les technologies modernes de <strong>machine learning</strong> pour prédire le risque d'obésité à partir de divers facteurs liés au mode de vie,
|
201 |
+
aux habitudes alimentaires et aux caractéristiques individuelles. Cette solution, développée à l'aide de <strong>Streamlit</strong>, permet non seulement d'offrir une interface intuitive et accessible,
|
202 |
+
mais également d'analyser rapidement et précisément les données des utilisateurs afin d'anticiper les risques associés au surpoids.
|
203 |
+
</p>
|
204 |
+
<p style="color: blue; text-align: center; font-size: 16px;">
|
205 |
+
L'objectif principal de cette application est de fournir une aide à la décision pour les professionnels de santé, les chercheurs, et même les utilisateurs individuels
|
206 |
+
qui souhaitent comprendre et gérer leur risque personnel. En quelques clics, les utilisateurs peuvent explorer les facteurs influents et recevoir des prévisions basées sur des algorithmes avancés d'apprentissage automatique.
|
207 |
+
</p>
|
208 |
+
<p style="color: blue; text-align: center; font-size: 16px;">
|
209 |
+
Cette application est le fruit d'une volonté de concilier les avancées technologiques et l'impératif de santé publique qu'est la lutte contre l'obésité.
|
210 |
+
Nous espérons qu'elle contribuera à renforcer les actions de prévention et à offrir un support utile aux efforts de réduction des taux d'obésité.
|
211 |
+
</p>
|
212 |
+
</div>
|
213 |
+
"""
|
214 |
+
|
215 |
+
# Afficher le texte stylisé en bleu et centré sur un fond blanc
|
216 |
+
st.markdown(avant_propos, unsafe_allow_html=True)
|
217 |
+
# Ajouter un bouton qui redirige vers un site externe
|
218 |
+
url = "https://www.who.int/fr/news-room/fact-sheets/detail/obesity-and-overweight" # Remplacez par l'URL souhaitée
|
219 |
+
if st.button("pour plus d'informations"):
|
220 |
+
st.write(f"[Cliquez ici pour visiter le site]({url})")
|
221 |
+
if selected == "Statistique":
|
222 |
+
# Ouvrir l'image avec Pillow
|
223 |
+
#image = Image.open("az.JPEG")
|
224 |
+
|
225 |
+
# Redimensionner l'image (largeur, hauteur)
|
226 |
+
#image = image.resize((300, 200)) # Par exemple, 300x200 pixels
|
227 |
+
|
228 |
+
# Afficher l'image redimensionnée
|
229 |
+
#st.image(image, caption="Image redimensionnée", use_column_width=False)
|
230 |
+
# Titre de l'application
|
231 |
+
st.title("Visualisation des données avec Seaborn et Pandas")
|
232 |
+
|
233 |
+
# Charger le fichier CSV
|
234 |
+
uploaded_file = st.file_uploader("Choisissez un fichier", type=["csv", "xlsx", "json"])
|
235 |
+
|
236 |
+
if uploaded_file is not None:
|
237 |
+
# Lecture du fichier CSV
|
238 |
+
file_extension = uploaded_file.name.split('.')[-1]
|
239 |
+
if file_extension == 'csv':
|
240 |
+
# Lecture du fichier CSV
|
241 |
+
df = pd.read_csv(uploaded_file)
|
242 |
+
elif file_extension == 'xlsx':
|
243 |
+
# Lecture du fichier Excel
|
244 |
+
df = pd.read_excel(uploaded_file)
|
245 |
+
elif file_extension == 'json':
|
246 |
+
# Lecture du fichier JSON
|
247 |
+
df = pd.read_json(uploaded_file)
|
248 |
+
else:
|
249 |
+
st.error("Format de fichier non supporté!")
|
250 |
+
|
251 |
+
|
252 |
+
# Afficher le dataframe
|
253 |
+
st.write("Aperçu du dataset :")
|
254 |
+
st.write(df.head())
|
255 |
+
|
256 |
+
# Afficher les statistiques descriptives
|
257 |
+
st.write("Statistiques descriptives :")
|
258 |
+
st.write(df.describe())
|
259 |
+
|
260 |
+
# Sélection des variables pour les visualisations
|
261 |
+
numerical_columns = df.select_dtypes(include=['float64', 'int64']).columns.tolist()
|
262 |
+
categorical_columns = df.select_dtypes(include=['object', 'category']).columns.tolist()
|
263 |
+
|
264 |
+
# Distribution d'une variable
|
265 |
+
st.subheader("Distribution d'une variable numérique")
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266 |
+
selected_column = st.selectbox("Choisissez une variable numérique", numerical_columns)
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267 |
+
if st.button("Afficher la distribution"):
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268 |
+
fig, ax = plt.subplots(figsize=(5, 6))
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269 |
+
sns.histplot(df[selected_column], kde=True, ax=ax)
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270 |
+
st.pyplot(fig)
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271 |
+
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272 |
+
# Scatter plot
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273 |
+
st.subheader("Scatter Plot entre deux variables numériques")
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274 |
+
x_axis = st.selectbox("Choisissez la variable pour l'axe X", numerical_columns)
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275 |
+
y_axis = st.selectbox("Choisissez la variable pour l'axe Y", numerical_columns, key='scatter')
|
276 |
+
if st.button("Afficher le scatter plot"):
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277 |
+
fig, ax = plt.subplots(figsize=(8, 4))
|
278 |
+
sns.scatterplot(x=df[x_axis], y=df[y_axis], ax=ax)
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279 |
+
st.pyplot(fig)
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280 |
+
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281 |
+
# Boxplot
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282 |
+
st.subheader("Boxplot d'une variable numérique par rapport à une variable catégorielle")
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283 |
+
selected_categorical = st.selectbox("Choisissez une variable catégorielle", categorical_columns)
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284 |
+
selected_numerical = st.selectbox("Choisissez une variable numérique", numerical_columns, key='boxplot')
|
285 |
+
if st.button("Afficher le boxplot"):
|
286 |
+
fig, ax = plt.subplots(figsize=(8, 4))
|
287 |
+
sns.boxplot(x=df[selected_categorical], y=df[selected_numerical], ax=ax)
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288 |
+
st.pyplot(fig)
|