scmulan_model / config.json
skander-karkar's picture
Upload folder using huggingface_hub
2a4d343 verified
{
"_class_module": "dl_models.models.scmulan.model",
"_class_name": "ScMulanModelConfig",
"bias": false,
"block_size": 1550,
"cell_type_entities": [
"Ionocyte cell",
"Mature B cell",
"Oligodendrocyte",
"Effector T cell",
"CD4 Treg",
"Astrocyte",
"Monocyte-dendritic progenitor (MDP)",
"Haematopoietic stem and progenitor cell",
"Memory CD8 T cell",
"Conventional dendritic cell 1",
"Mast cell",
"Common myeloid progenitor (CMP)",
"Squamous cell",
"Erythrocyte",
"Unclassified",
"NK T cell",
"Megakaryocyte-erythrocyte progenitor (MEP)",
"Neural progenitor cell",
"Pro-B cell",
"Memory B cell",
"Cytotoxic T cell",
"Adventitial fibroblast",
"Cytotoxic CD8 T cell",
"Erythroid-like cell",
"Alveolar cell",
"Naive CD8 T cell",
"T cell",
"Lymphatic endothelial cell",
"Multipotent lymphoid progenitor (MLP)",
"Conventional dendritic cell 2",
"Vascular endothelial cell",
"Immature B cell",
"Monocyte",
"Megakaryocyte",
"Mesothelial cell",
"Capillary endothelial cell",
"Granulocyte",
"Goblet cell",
"Adipocyte",
"Microglia",
"Myofibroblast",
"Naive CD4 T cell",
"Type I alveolar cell",
"Type II alveolar cell",
"Neuron",
"Migratory dendriitic cell",
"Cycling T cell",
"Excitatory neuron",
"Myeloid cell",
"Fibroblast",
"Smooth muscle cell",
"Neutrophilic myelocyte",
"Secretory cell",
"Lymphoid cell",
"Sinusoidal endothelial cell",
"Multipotent progenitor (MPP)",
"Immune",
"Common lymphoid progenitor (CLP)",
"Macrophage",
"Conventional dendritic cell",
"Non-classical monocyte",
"Epithelial cell",
"CD4 T cell",
"Intermediate macrophage",
"Granule cell",
"Artery endothelial cell",
"Classical monocyte",
"Cardiomyocyte cell",
"Basophilic granulocyte",
"Erythroid progenitor cell",
"Hepatocyte",
"CD8 T cell",
"Vascular cell",
"Neutrophilic granulocyte",
"Early T-cell precursor",
"Plasmablast cell",
"Cell",
"Alveolar fibroblast",
"Haematopoietic stem cell",
"Ciliated cell",
"Memory CD4 T cell",
"Effector CD8 memory T cell",
"Basement membrane fibroblast",
"Tuft cell",
"Basal cell",
"FOXN4+ cell",
"Neuroglial cell",
"Proliferating cell",
"Pericyte",
"Kupffer cell",
"NK cell",
"Stromal cell",
"Epithelial progenitor cell",
"Dendritic cell",
"Plasmacytoid dendritic cell",
"Vascular smooth muscle cell",
"Oligodendrocyte precursor cell (OPC)",
"Erythroblast",
"Naive B cell",
"Migratory conventional dendritic cell",
"Ependymal cell",
"Neuroendocrine cell",
"Vein endothelial cell",
"Endothelial cell",
"Pre-B cell",
"MAIT cell",
"Bronchial smooth muscle cell",
"Inhibitory neuron",
"Plasma B cell",
"Granulocyte-monocyte progenitor (GMP)",
"Mature dendritic cell",
"B cell",
"Cholangiocyte",
"Hepatic stellate cell"
],
"dropout": 0.0,
"git_repo_info": {
"author": "skander-karkar",
"branch": "scmulan_train",
"commit_message": "Merge branch 'main' into scmulan_train",
"sha": "020b2ae0cfab43d38b8205b34ccdab43a4f1a886",
"timestamp": "2024-08-09T16:04:31+02:00"
},
"n_embd": 1120,
"n_express_level": 10,
"n_head": 20,
"n_layer": 24,
"token_set": [
"<E>",
"A2M",
"ABCA1",
"ABCA6",
"ABCA8",
"ABCA9",
"ABCB1",
"ABCC4",
"ABCC9",
"ABCG2",
"ABI3BP",
"ABTB2",
"ACAP1",
"ACKR1",
"ACKR3",
"ACP5",
"ACSL1",
"ACSM3",
"ACTA2",
"ACTC1",
"ACTG2",
"ACVRL1",
"ACY3",
"ADAM12",
"ADAM19",
"ADAM28",
"ADAMTS1",
"ADAMTS12",
"ADAMTS17",
"ADAMTS18",
"ADAMTS4",
"ADAMTS5",
"ADAMTS6",
"ADAMTS9",
"ADAMTS9-AS2",
"ADAMTSL1",
"ADAMTSL2",
"ADAMTSL3",
"ADAP2",
"ADARB2",
"ADCY4",
"ADCYAP1",
"ADGRE2",
"ADGRF5",
"ADGRG1",
"ADGRG3",
"ADGRG6",
"ADGRL2",
"ADGRL4",
"ADGRV1",
"ADH1B",
"ADIRF",
"ADM",
"ADRB2",
"AEBP1",
"AFF3",
"AGMO",
"AGR2",
"AGT",
"AHNAK",
"AHSP",
"AIF1",
"AIF1L",
"AKAP12",
"AKR1C1",
"ALAS2",
"ALDH1A1",
"ALDH1A2",
"ALDH1L1",
"ALDOB",
"ALOX5",
"ALOX5AP",
"ALPL",
"ANGPT1",
"ANGPT2",
"ANGPTL4",
"ANK3",
"ANKRD1",
"ANKRD22",
"ANKRD37",
"ANKRD44",
"ANKRD55",
"ANLN",
"ANO2",
"ANPEP",
"ANXA1",
"ANXA2",
"ANXA2R",
"ANXA3",
"ANXA4",
"AOAH",
"AOX1",
"APBA2",
"APBB1IP",
"APCDD1",
"APLN",
"APLNR",
"APOA1",
"APOA2",
"APOBEC3A",
"APOBR",
"APOC1",
"APOC2",
"APOD",
"APOE",
"APOLD1",
"APP",
"AQP1",
"AQP4",
"ARAP2",
"AREG",
"ARHGAP15",
"ARHGAP22",
"ARHGAP24",
"ARHGAP25",
"ARHGAP29",
"ARHGAP31",
"ARHGAP45",
"ARHGAP6",
"ARHGDIB",
"ARHGEF15",
"ARHGEF26",
"ARID5B",
"ARL15",
"ARL4C",
"ARPP21",
"ARRDC3",
"ARRDC5",
"ASIC4",
"ASPM",
"ASPN",
"ATF3",
"ATP10A",
"ATP10B",
"ATP13A4",
"ATP1A2",
"ATP1B2",
"ATP1B3",
"ATP2A3",
"ATP8A1",
"ATP8B4",
"AUTS2",
"AXL",
"AZGP1",
"AZU1",
"B2M",
"B3GALT2",
"B3GNT5",
"B3GNT7",
"BACE2",
"BACH2",
"BAG3",
"BANK1",
"BASP1",
"BATF",
"BCAN",
"BCAS1",
"BCL11A",
"BCL11B",
"BCL2",
"BCL2A1",
"BEST3",
"BEX1",
"BGN",
"BHLHE41",
"BICC1",
"BIN2",
"BIRC3",
"BIRC5",
"BLK",
"BLNK",
"BMP5",
"BMP6",
"BMPER",
"BMPR1B",
"BMX",
"BNC2",
"BPI",
"BPIFB1",
"BST2",
"BTBD11",
"BTG2",
"BTNL8",
"BTNL9",
"C11orf96",
"C12orf75",
"C15orf48",
"C16orf54",
"C19orf33",
"C1QA",
"C1QB",
"C1QC",
"C1QTNF1",
"C1R",
"C1S",
"C1orf162",
"C1orf54",
"C1orf56",
"C2CD4B",
"C2orf88",
"C3",
"C3AR1",
"C5AR1",
"C5AR2",
"C5orf17",
"C7",
"C8orf34",
"CA1",
"CA10",
"CA2",
"CA4",
"CA8",
"CABLES1",
"CACNA1C",
"CALB2",
"CALCR",
"CALCRL",
"CALD1",
"CALN1",
"CAMK4",
"CAPG",
"CARD11",
"CARMIL1",
"CARMN",
"CARNS1",
"CARTPT",
"CASC15",
"CASS4",
"CAV1",
"CAVIN1",
"CAVIN2",
"CBLN2",
"CCBE1",
"CCDC141",
"CCDC26",
"CCDC3",
"CCDC80",
"CCK",
"CCL14",
"CCL17",
"CCL18",
"CCL19",
"CCL2",
"CCL20",
"CCL21",
"CCL22",
"CCL23",
"CCL3",
"CCL3L1",
"CCL3L3",
"CCL4",
"CCL4L2",
"CCL5",
"CCL8",
"CCN1",
"CCN2",
"CCNB1",
"CCND1",
"CCND3",
"CCR1",
"CCR7",
"CCSER1",
"CD14",
"CD160",
"CD163",
"CD163L1",
"CD177",
"CD1C",
"CD1E",
"CD2",
"CD22",
"CD226",
"CD24",
"CD247",
"CD248",
"CD27",
"CD28",
"CD300A",
"CD300E",
"CD34",
"CD36",
"CD37",
"CD38",
"CD3D",
"CD3E",
"CD3G",
"CD4",
"CD40LG",
"CD44",
"CD48",
"CD52",
"CD53",
"CD55",
"CD5L",
"CD68",
"CD69",
"CD7",
"CD70",
"CD74",
"CD79A",
"CD79B",
"CD82",
"CD83",
"CD84",
"CD86",
"CD8A",
"CD8B",
"CD9",
"CD93",
"CD96",
"CDA",
"CDC14A",
"CDC20",
"CDH11",
"CDH13",
"CDH19",
"CDH5",
"CDH6",
"CDK1",
"CDKN1A",
"CDKN1C",
"CEACAM6",
"CEBPD",
"CEMIP",
"CEMIP2",
"CENPF",
"CETP",
"CFD",
"CFH",
"CFP",
"CFTR",
"CGA",
"CGNL1",
"CH25H",
"CHGB",
"CHI3L1",
"CHI3L2",
"CHIT1",
"CHODL",
"CHRM2",
"CHRM3",
"CHST11",
"CHST15",
"CHST9",
"CHSY3",
"CIITA",
"CILP",
"CLDN10",
"CLDN11",
"CLDN4",
"CLDN5",
"CLEC10A",
"CLEC14A",
"CLEC1A",
"CLEC1B",
"CLEC2B",
"CLEC2D",
"CLEC3B",
"CLEC4E",
"CLEC4G",
"CLEC4M",
"CLEC5A",
"CLEC7A",
"CLEC9A",
"CLECL1",
"CLIC3",
"CLIC4",
"CLMN",
"CLSTN2",
"CLU",
"CMKLR1",
"CMTM2",
"CMTM5",
"CMTM8",
"CNDP1",
"CNKSR3",
"CNN1",
"CNN3",
"CNR1",
"CNTN2",
"CNTN4",
"CNTN5",
"CNTNAP2",
"CNTNAP3B",
"COBLL1",
"COL11A1",
"COL12A1",
"COL14A1",
"COL15A1",
"COL18A1",
"COL1A1",
"COL1A2",
"COL21A1",
"COL23A1",
"COL25A1",
"COL3A1",
"COL4A1",
"COL4A2",
"COL4A4",
"COL5A1",
"COL5A2",
"COL5A3",
"COL6A1",
"COL6A2",
"COL6A3",
"COL8A1",
"COL9A1",
"COLEC10",
"COLEC11",
"COLEC12",
"COMP",
"CORO1A",
"COTL1",
"COX4I2",
"COX7A1",
"CP",
"CPA3",
"CPAMD8",
"CPE",
"CPED1",
"CPM",
"CPNE5",
"CPS1",
"CPVL",
"CR1",
"CREB5",
"CRH",
"CRHBP",
"CRIM1",
"CRIP2",
"CRISPLD2",
"CRTAM",
"CRYAB",
"CSF1",
"CSF1R",
"CSF2",
"CSF2RA",
"CSF3",
"CSF3R",
"CSGALNACT1",
"CSPG4",
"CSRP2",
"CST3",
"CST7",
"CSTA",
"CTLA4",
"CTNNA3",
"CTSB",
"CTSC",
"CTSD",
"CTSG",
"CTSL",
"CTSS",
"CTSW",
"CX3CR1",
"CXCL1",
"CXCL10",
"CXCL11",
"CXCL12",
"CXCL13",
"CXCL14",
"CXCL16",
"CXCL2",
"CXCL3",
"CXCL5",
"CXCL6",
"CXCL8",
"CXCL9",
"CXCR1",
"CXCR2",
"CXCR3",
"CXCR4",
"CXCR6",
"CYB5D2",
"CYBA",
"CYBB",
"CYP1B1",
"CYP26B1",
"CYP27A1",
"CYP3A4",
"CYP3A5",
"CYP4F3",
"CYSLTR1",
"CYSLTR2",
"CYTH4",
"CYTIP",
"CYTL1",
"CYTOR",
"CYYR1",
"DAAM2",
"DAB2",
"DACH1",
"DAPK2",
"DCC",
"DCN",
"DDIT4",
"DEFA4",
"DEFB1",
"DENND3",
"DEPP1",
"DERL3",
"DES",
"DGKG",
"DHRS9",
"DIO2",
"DIPK2B",
"DISC1",
"DKK2",
"DLC1",
"DLGAP1",
"DLK1",
"DLL4",
"DLX6-AS1",
"DNAAF1",
"DNAH12",
"DNAJA4",
"DNAJB1",
"DNASE1L3",
"DOCK10",
"DOCK2",
"DOCK4",
"DOCK5",
"DOCK8",
"DOCK9",
"DPEP1",
"DPP10",
"DPT",
"DPYSL3",
"DSCAM",
"DTHD1",
"DUSP1",
"DUSP2",
"DUSP4",
"DUSP5",
"DUSP6",
"DYSF",
"EBF1",
"EBI3",
"ECM1",
"EDA",
"EDN1",
"EDNRA",
"EDNRB",
"EFEMP1",
"EFNA5",
"EFNB2",
"EGFL7",
"EGFR",
"EGLN3",
"EGR1",
"EGR2",
"EGR3",
"EHD3",
"ELANE",
"ELF3",
"ELN",
"ELOVL7",
"EMB",
"EMCN",
"EMILIN1",
"EMP1",
"EMP2",
"ENC1",
"ENG",
"ENPP2",
"ENTPD1",
"EOMES",
"EPAS1",
"EPB41L2",
"EPB42",
"EPHA3",
"EPS8",
"EPSTI1",
"ERBB4",
"EREG",
"ERG",
"ERMN",
"ESAM",
"ESM1",
"ETNPPL",
"ETS1",
"EYA1",
"EYA2",
"EYA4",
"EYS",
"EZR",
"F13A1",
"F2R",
"F2RL3",
"F3",
"F8",
"FABP1",
"FABP4",
"FABP5",
"FAM107A",
"FAM155A",
"FAM167B",
"FAM177B",
"FAM183A",
"FAM189A2",
"FAM30A",
"FAM43A",
"FAT3",
"FAXDC2",
"FBLN1",
"FBLN2",
"FBLN5",
"FBN1",
"FBN2",
"FBXL7",
"FCER1A",
"FCER1G",
"FCER2",
"FCGBP",
"FCGR1A",
"FCGR1B",
"FCGR2A",
"FCGR2B",
"FCGR3A",
"FCGR3B",
"FCGRT",
"FCMR",
"FCN1",
"FCN2",
"FCN3",
"FCRL1",
"FCRL3",
"FCRL5",
"FCRL6",
"FCRLA",
"FENDRR",
"FERMT1",
"FFAR2",
"FFAR3",
"FGD2",
"FGD3",
"FGD4",
"FGF12",
"FGF13",
"FGF14",
"FGFBP2",
"FGFR1",
"FGFR2",
"FGFR3",
"FGG",
"FGL1",
"FGL2",
"FGR",
"FHL1",
"FHL5",
"FILIP1",
"FILIP1L",
"FLI1",
"FLNA",
"FLRT2",
"FLT1",
"FLT4",
"FMN1",
"FMO2",
"FMO3",
"FN1",
"FOLH1",
"FOLR2",
"FOLR3",
"FOS",
"FOSB",
"FOXF1",
"FOXO1",
"FOXP2",
"FOXP3",
"FOXS1",
"FPR1",
"FPR3",
"FRAS1",
"FREM1",
"FRMD3",
"FRMD4A",
"FRMD4B",
"FRZB",
"FSCN1",
"FST",
"FSTL1",
"FSTL3",
"FTH1",
"FTL",
"FXYD1",
"FXYD2",
"FXYD3",
"FYB1",
"G0S2",
"GAD1",
"GAD2",
"GADD45B",
"GADD45G",
"GALNT15",
"GALNT18",
"GALNTL6",
"GAPT",
"GAS7",
"GATA1",
"GATA2",
"GATA3",
"GATM",
"GBP1",
"GBP5",
"GEM",
"GFAP",
"GGT5",
"GIMAP4",
"GIMAP5",
"GIMAP6",
"GIMAP7",
"GIMAP8",
"GJA1",
"GJA4",
"GJA5",
"GJB6",
"GLDN",
"GLI3",
"GLIS3",
"GLUL",
"GNA14",
"GNG11",
"GNG2",
"GNG7",
"GNLY",
"GP9",
"GPC3",
"GPC5",
"GPC6",
"GPIHBP1",
"GPM6A",
"GPM6B",
"GPNMB",
"GPR17",
"GPR171",
"GPR174",
"GPR183",
"GPR34",
"GPR65",
"GPRC5A",
"GPRIN3",
"GPX2",
"GPX3",
"GRAP2",
"GRAPL",
"GREM1",
"GRID2",
"GRIK1",
"GRIP1",
"GRK5",
"GRM8",
"GSN",
"GSTA1",
"GSTA2",
"GUCY1A2",
"GULP1",
"GYPA",
"GYPB",
"GYPC",
"GZMA",
"GZMB",
"GZMH",
"GZMK",
"GZMM",
"H1-2",
"H1-3",
"H1-4",
"H1-5",
"H2AC6",
"H2BC11",
"H2BC4",
"H2BC8",
"H3C10",
"H4C3",
"HAMP",
"HAS2",
"HBA1",
"HBA2",
"HBB",
"HBD",
"HBG1",
"HBG2",
"HBM",
"HBQ1",
"HCK",
"HCLS1",
"HCST",
"HDAC9",
"HECW2",
"HEG1",
"HEMGN",
"HES1",
"HES4",
"HES5",
"HEY1",
"HEYL",
"HGF",
"HHIP",
"HIF3A",
"HIGD1B",
"HIP1",
"HLA-A",
"HLA-B",
"HLA-C",
"HLA-DMB",
"HLA-DPA1",
"HLA-DPB1",
"HLA-DQA1",
"HLA-DQA2",
"HLA-DQB1",
"HLA-DRA",
"HLA-DRB1",
"HLA-DRB5",
"HLA-E",
"HMCN1",
"HMGB2",
"HMGCS1",
"HMOX1",
"HOPX",
"HP",
"HPGD",
"HPGDS",
"HPSE2",
"HS3ST2",
"HS3ST4",
"HSD11B1",
"HSH2D",
"HSP90AA1",
"HSPA1A",
"HSPA1B",
"HSPA2",
"HSPA6",
"HSPB1",
"HSPB8",
"HSPG2",
"HSPH1",
"HTR2C",
"HTRA1",
"HYAL2",
"ICAM1",
"ICAM2",
"ICOS",
"ID1",
"ID2",
"ID3",
"ID4",
"IDO1",
"IER2",
"IER3",
"IFI16",
"IFI27",
"IFI30",
"IFI44L",
"IFI6",
"IFIT1",
"IFIT2",
"IFIT3",
"IFITM1",
"IFITM2",
"IFITM3",
"IFNG",
"IFNG-AS1",
"IGF1",
"IGF1R",
"IGF2",
"IGF2BP2",
"IGFBP1",
"IGFBP2",
"IGFBP3",
"IGFBP4",
"IGFBP5",
"IGFBP6",
"IGFBP7",
"IGHA1",
"IGHA2",
"IGHD",
"IGHG1",
"IGHG2",
"IGHG3",
"IGHG4",
"IGHGP",
"IGHM",
"IGHV1-18",
"IGHV3-15",
"IGHV3-23",
"IGHV3-30",
"IGHV3-7",
"IGHV3-74",
"IGHV5-51",
"IGKC",
"IGKV1-39",
"IGKV1-5",
"IGKV2-30",
"IGKV3-11",
"IGKV3-15",
"IGKV3-20",
"IGKV4-1",
"IGLC2",
"IGLC3",
"IGLC6",
"IGLC7",
"IGLL1",
"IGLL5",
"IGLV1-40",
"IGLV1-44",
"IGLV1-47",
"IGLV1-51",
"IGLV2-11",
"IGLV2-14",
"IGLV2-23",
"IGLV2-8",
"IGLV3-19",
"IGLV3-21",
"IGLV6-57",
"IGSF21",
"IGSF6",
"IKZF1",
"IKZF2",
"IKZF3",
"IL10",
"IL10RA",
"IL13RA1",
"IL17A",
"IL18",
"IL18R1",
"IL18RAP",
"IL1A",
"IL1B",
"IL1R1",
"IL1R2",
"IL1RAP",
"IL1RAPL1",
"IL1RAPL2",
"IL1RL1",
"IL1RN",
"IL2",
"IL22",
"IL2RA",
"IL2RB",
"IL2RG",
"IL32",
"IL33",
"IL4R",
"IL6",
"IL6ST",
"IL7R",
"INHBA",
"INMT",
"INPP4B",
"INPP5D",
"INSIG1",
"INSR",
"IPCEF1",
"IQGAP2",
"IRAG1",
"IRAK3",
"IRF4",
"IRF7",
"IRF8",
"ISG15",
"ISG20",
"ISLR",
"ITGA1",
"ITGA2",
"ITGA2B",
"ITGA4",
"ITGA5",
"ITGA6",
"ITGA8",
"ITGAL",
"ITGAM",
"ITGAX",
"ITGB2",
"ITGB2-AS1",
"ITGB4",
"ITGB8",
"ITGBL1",
"ITIH5",
"ITK",
"ITLN1",
"ITM2A",
"ITPKB",
"ITPR2",
"JAG1",
"JAG2",
"JAK3",
"JAM2",
"JAM3",
"JAML",
"JCHAIN",
"JUN",
"JUNB",
"KALRN",
"KANK1",
"KAZN",
"KCNAB1",
"KCND2",
"KCNE4",
"KCNH7",
"KCNH8",
"KCNIP1",
"KCNIP4",
"KCNJ15",
"KCNJ2",
"KCNK13",
"KCNMA1",
"KCNMB4",
"KCNN3",
"KCNQ1OT1",
"KCNQ5",
"KCTD12",
"KDR",
"KHDRBS2",
"KIAA1217",
"KIF26B",
"KIR2DL1",
"KIR2DL3",
"KIR2DL4",
"KIR3DL1",
"KIR3DL2",
"KIT",
"KLF2",
"KLF4",
"KLF6",
"KLHL4",
"KLHL6",
"KLK6",
"KLRB1",
"KLRC1",
"KLRC2",
"KLRC3",
"KLRD1",
"KLRF1",
"KRT1",
"KRT17",
"KRT18",
"KRT19",
"KRT5",
"KRT7",
"KRT8",
"KRT81",
"KRT86",
"KYNU",
"LAG3",
"LAIR2",
"LAMA2",
"LAMA4",
"LAMB1",
"LAMC3",
"LAMP3",
"LAPTM5",
"LCK",
"LCN2",
"LCNL1",
"LCP1",
"LCP2",
"LDB2",
"LDB3",
"LEF1",
"LEPR",
"LGALS1",
"LGALS2",
"LGALS4",
"LGALS9",
"LGMN",
"LGR5",
"LHFPL2",
"LHFPL3",
"LHFPL6",
"LIF",
"LIFR",
"LILRA4",
"LILRA5",
"LILRB1",
"LILRB2",
"LILRB3",
"LILRB5",
"LIMCH1",
"LIMS2",
"LINC00278",
"LINC00299",
"LINC00511",
"LINC00639",
"LINC00844",
"LINC00861",
"LINC00877",
"LINC00926",
"LINC00996",
"LINC01088",
"LINC01091",
"LINC01094",
"LINC01099",
"LINC01170",
"LINC02446",
"LINGO2",
"LMCD1",
"LMNA",
"LMOD1",
"LOX",
"LPAR1",
"LPAR5",
"LPAR6",
"LPCAT2",
"LPL",
"LRMDA",
"LRP1B",
"LRP2",
"LRRC32",
"LRRC3B",
"LRRC4C",
"LRRIQ1",
"LRRK1",
"LRRK2",
"LSAMP",
"LSP1",
"LST1",
"LTB",
"LTBP1",
"LTC4S",
"LTF",
"LUCAT1",
"LUM",
"LUZP2",
"LY86",
"LY9",
"LY96",
"LYN",
"LYPD2",
"LYVE1",
"LYZ",
"MACROD2",
"MAF",
"MAFB",
"MAG",
"MAL",
"MALAT1",
"MAMDC2",
"MAML2",
"MAML3",
"MAOB",
"MAP1B",
"MAP3K7CL",
"MAP3K8",
"MARCHF3",
"MARCKS",
"MARCKSL1",
"MARCO",
"MAST4",
"MBP",
"MCAM",
"MCEMP1",
"MCTP1",
"MCTP2",
"MDK",
"MECOM",
"MEF2C",
"MEG3",
"MEGF11",
"MEIS1",
"MEIS2",
"MERTK",
"MFAP4",
"MFAP5",
"MFSD2A",
"MGAT4C",
"MGP",
"MGST1",
"MIAT",
"MID1",
"MIR181A1HG",
"MIR4435-2HG",
"MIR503HG",
"MIR646HG",
"MIR9-1HG",
"MKI67",
"MLC1",
"MME",
"MMP16",
"MMP19",
"MMP2",
"MMP7",
"MMP8",
"MMP9",
"MMRN1",
"MNDA",
"MOBP",
"MOG",
"MPEG1",
"MPO",
"MRC1",
"MRC2",
"MRO",
"MROCKI",
"MS4A1",
"MS4A2",
"MS4A3",
"MS4A4A",
"MS4A6A",
"MS4A7",
"MSR1",
"MSRB3",
"MT-ATP6",
"MT-ATP8",
"MT-CO1",
"MT-CO2",
"MT-CO3",
"MT-CYB",
"MT-ND1",
"MT-ND2",
"MT-ND3",
"MT-ND4",
"MT-ND4L",
"MT-ND5",
"MT1A",
"MT1E",
"MT1F",
"MT1G",
"MT1H",
"MT1M",
"MT1X",
"MT2A",
"MT3",
"MTRNR2L1",
"MTRNR2L12",
"MTRNR2L8",
"MTSS1",
"MTUS1",
"MUC1",
"MUC5B",
"MUC6",
"MX1",
"MX2",
"MXD1",
"MYBL1",
"MYCT1",
"MYH11",
"MYL4",
"MYL9",
"MYLK",
"MYO10",
"MYO1B",
"MYO1F",
"MYOF",
"MYOM2",
"MYRF",
"MZB1",
"NAMPT",
"NAV3",
"NCALD",
"NCAM1",
"NCF1",
"NCF2",
"NCF4",
"NCKAP1L",
"NCKAP5",
"NCR1",
"NCR3",
"NDRG2",
"NDUFA4L2",
"NEAT1",
"NEDD9",
"NEFL",
"NEFM",
"NEGR1",
"NES",
"NEURL1B",
"NEXN",
"NFATC2",
"NFE2",
"NFIB",
"NFKBIA",
"NFKBID",
"NGFR",
"NHS",
"NHSL1",
"NIBAN1",
"NIBAN3",
"NID1",
"NKAIN2",
"NKG7",
"NLRC5",
"NLRP1",
"NLRP3",
"NNMT",
"NOSTRIN",
"NOTCH3",
"NOTCH4",
"NPAS3",
"NPDC1",
"NPL",
"NPY",
"NPY1R",
"NR2F1",
"NR2F2",
"NR2F2-AS1",
"NR4A1",
"NR4A2",
"NR4A3",
"NRG1",
"NRG3",
"NRGN",
"NRN1",
"NRP1",
"NRP2",
"NRXN1",
"NRXN3",
"NTM",
"NTNG1",
"NTRK2",
"NTRK3",
"NTS",
"NUAK1",
"NUPR1",
"NUSAP1",
"NXPH1",
"OBI1-AS1",
"OGN",
"OIT3",
"OLFM4",
"OLFML3",
"OLIG1",
"OLIG2",
"OLR1",
"OPALIN",
"OPCML",
"ORM1",
"OSBPL10",
"OSM",
"OSMR",
"P2RX1",
"P2RY12",
"P2RY13",
"P2RY14",
"P2RY8",
"P3H2",
"PADI2",
"PADI4",
"PAG1",
"PALD1",
"PALLD",
"PALMD",
"PAMR1",
"PAPSS2",
"PARD3B",
"PARP14",
"PARP8",
"PATL2",
"PAX5",
"PCAT1",
"PCAT19",
"PCBP3",
"PCDH11X",
"PCDH11Y",
"PCDH15",
"PCDH17",
"PCDH7",
"PCDH9",
"PCED1B",
"PCK1",
"PCLAF",
"PCP4",
"PCSK1N",
"PCSK5",
"PCSK6",
"PDCD1",
"PDE10A",
"PDE1C",
"PDE2A",
"PDE3A",
"PDE3B",
"PDE4B",
"PDE4D",
"PDE7B",
"PDGFB",
"PDGFD",
"PDGFRA",
"PDGFRB",
"PDK4",
"PDLIM1",
"PDLIM3",
"PDZD2",
"PDZK1IP1",
"PDZRN3",
"PDZRN4",
"PEAR1",
"PECAM1",
"PEG10",
"PELI1",
"PELI2",
"PENK",
"PF4",
"PF4V1",
"PGAP1",
"PGGHG",
"PGLYRP1",
"PGM5",
"PHACTR1",
"PHKG1",
"PHLDA1",
"PHLDA2",
"PHLDB1",
"PHLDB2",
"PI16",
"PI3",
"PID1",
"PIEZO2",
"PIGR",
"PIK3AP1",
"PIK3R3",
"PIK3R5",
"PIP4K2A",
"PITPNC1",
"PKHD1L1",
"PLA2G2A",
"PLA2G4A",
"PLA2G5",
"PLA2G7",
"PLAC8",
"PLAC9",
"PLAT",
"PLAU",
"PLAUR",
"PLCB1",
"PLCB4",
"PLCG2",
"PLCH1",
"PLCL1",
"PLCXD3",
"PLD4",
"PLD5",
"PLEK",
"PLEKHG1",
"PLEKHH2",
"PLIN2",
"PLK2",
"PLLP",
"PLN",
"PLP1",
"PLPP1",
"PLPP2",
"PLPP3",
"PLSCR4",
"PLTP",
"PLVAP",
"PLXDC1",
"PLXDC2",
"PLXNA4",
"PLXND1",
"PMAIP1",
"PMCH",
"PMP2",
"PODN",
"PODXL",
"PON2",
"POSTN",
"POU2AF1",
"POU2F2",
"PPBP",
"PPFIBP1",
"PPP1R14A",
"PPP1R16B",
"PPP1R3C",
"PPP2R2B",
"PRDM1",
"PRDM16",
"PRELID2",
"PRELP",
"PREX1",
"PREX2",
"PRF1",
"PRG4",
"PRICKLE2",
"PRKCB",
"PRKCH",
"PRKCQ",
"PRKG1",
"PRKX",
"PROK2",
"PROX1",
"PRR16",
"PRR5L",
"PRRX1",
"PRSS23",
"PRTN3",
"PRUNE2",
"PTAFR",
"PTCHD4",
"PTCRA",
"PTGDR",
"PTGDS",
"PTGIR",
"PTGIS",
"PTGS1",
"PTGS2",
"PTH1R",
"PTN",
"PTPN22",
"PTPN7",
"PTPRB",
"PTPRC",
"PTPRE",
"PTPRG",
"PTPRM",
"PTPRS",
"PTPRT",
"PTPRZ1",
"PTTG1",
"PTX3",
"PVALB",
"PXDN",
"PYHIN1",
"RAB27B",
"RAB31",
"RAB3C",
"RAD51B",
"RALYL",
"RAMP1",
"RAMP2",
"RAMP3",
"RAPGEF3",
"RAPGEF5",
"RARRES1",
"RARRES2",
"RASAL3",
"RASD1",
"RASGEF1B",
"RASGEF1C",
"RASGRP3",
"RASIP1",
"RASSF2",
"RBM47",
"RBMS3",
"RBP1",
"RBP4",
"RBP7",
"RBPMS",
"RCAN2",
"RCSD1",
"RELN",
"RERG",
"RERGL",
"RETN",
"RFTN2",
"RFX4",
"RGCC",
"RGL1",
"RGS1",
"RGS10",
"RGS16",
"RGS18",
"RGS2",
"RGS20",
"RGS5",
"RGS6",
"RHBDF2",
"RHEX",
"RHOB",
"RHOC",
"RHOH",
"RHOJ",
"RIMS1",
"RIN2",
"RIPOR2",
"RIPOR3",
"RNASE1",
"RNASE2",
"RNASE6",
"RND3",
"RNF125",
"RNF144B",
"RNF152",
"RNF220",
"ROBO1",
"ROBO2",
"ROBO4",
"ROR1",
"RORB",
"RRAD",
"RRM2",
"RSAD2",
"RSPO3",
"RTKN2",
"RUBCNL",
"RUNX1",
"RUNX1T1",
"RUNX2",
"RUNX3",
"RXFP1",
"RYR2",
"RYR3",
"S100A1",
"S100A10",
"S100A11",
"S100A12",
"S100A4",
"S100A6",
"S100A8",
"S100A9",
"S100B",
"S100P",
"S100Z",
"S1PR1",
"S1PR5",
"SAA1",
"SAA2",
"SAMD3",
"SAMD4A",
"SAMD5",
"SAMD9L",
"SAMSN1",
"SASH1",
"SAT1",
"SCD",
"SCG2",
"SCGB1A1",
"SCGB3A1",
"SCGB3A2",
"SCGN",
"SCIN",
"SCML4",
"SCN7A",
"SCT",
"SDC3",
"SDK1",
"SDS",
"SEC14L1",
"SELE",
"SELENBP1",
"SELENOP",
"SELL",
"SELPLG",
"SEMA3B",
"SEMA3C",
"SEMA3D",
"SEMA3E",
"SEMA3F",
"SEMA3G",
"SEMA4D",
"SEMA5A",
"SEMA6A",
"SERPINA1",
"SERPINB2",
"SERPINB9",
"SERPINE1",
"SERPINE2",
"SERPINF1",
"SERPINH1",
"SFMBT2",
"SFRP1",
"SFRP2",
"SFRP5",
"SFTA2",
"SFTPB",
"SFTPC",
"SGCD",
"SGCZ",
"SGIP1",
"SGK1",
"SH2D1A",
"SH2D1B",
"SH2D2A",
"SH2D3C",
"SH3RF3",
"SH3TC1",
"SH3TC2",
"SHANK3",
"SHROOM3",
"SHROOM4",
"SIGLEC1",
"SIGLEC10",
"SIGLEC8",
"SIRPB2",
"SKAP1",
"SLA",
"SLA2",
"SLAMF1",
"SLAMF6",
"SLAMF7",
"SLC11A1",
"SLC12A2",
"SLC14A1",
"SLC16A10",
"SLC18A2",
"SLC1A2",
"SLC1A3",
"SLC1A7",
"SLC24A3",
"SLC25A18",
"SLC25A37",
"SLC2A1",
"SLC2A3",
"SLC2A5",
"SLC38A11",
"SLC38A5",
"SLC40A1",
"SLC44A1",
"SLC4A1",
"SLC4A10",
"SLC4A4",
"SLC4A7",
"SLC5A11",
"SLC6A1",
"SLC6A12",
"SLC7A11",
"SLC7A5",
"SLC8A1",
"SLC9A3R2",
"SLC9A9",
"SLCO1A2",
"SLCO1C1",
"SLCO2A1",
"SLCO2B1",
"SLCO4A1",
"SLFN12L",
"SLIT2",
"SLIT3",
"SLPI",
"SMAD6",
"SMIM5",
"SMOC1",
"SMTN",
"SNCA",
"SNCG",
"SNTG1",
"SNTG2",
"SOCS3",
"SOD2",
"SOD3",
"SORBS2",
"SORL1",
"SOX17",
"SOX18",
"SOX4",
"SOX6",
"SOX9",
"SPARC",
"SPARCL1",
"SPI1",
"SPIB",
"SPINK1",
"SPINK2",
"SPOCK2",
"SPOCK3",
"SPON1",
"SPON2",
"SPP1",
"SPRY1",
"SPTA1",
"SRARP",
"SRGAP1",
"SRGAP2",
"SRGAP2B",
"SRGN",
"SRPX",
"SRPX2",
"SST",
"ST18",
"ST6GAL1",
"ST6GALNAC3",
"ST6GALNAC5",
"ST8SIA4",
"ST8SIA6",
"STAB1",
"STAB2",
"STAT4",
"STC1",
"STEAP4",
"STK17B",
"STK33",
"STMN1",
"STMN2",
"STOM",
"STON2",
"STXBP2",
"STXBP6",
"SUCNR1",
"SULF1",
"SULF2",
"SULT1E1",
"SVEP1",
"SYK",
"SYN3",
"SYNDIG1",
"SYNE1",
"SYNE2",
"SYNPO2",
"SYNPR",
"SYT1",
"SYTL2",
"SYTL3",
"TAC1",
"TAC3",
"TACSTD2",
"TAGAP",
"TAGLN",
"TAL1",
"TANC1",
"TBX18",
"TBX2",
"TBX21",
"TBX3",
"TBXAS1",
"TC2N",
"TCF4",
"TCIM",
"TCL1A",
"TCN1",
"TEK",
"TENM1",
"TENM3",
"TENT5C",
"TESC",
"TESPA1",
"TF",
"TFEC",
"TFF3",
"TFPI",
"TFPI2",
"TFRC",
"TGFB2",
"TGFBI",
"TGFBR2",
"TGFBR3",
"TGM2",
"THBD",
"THBS1",
"THBS2",
"THEMIS",
"THSD4",
"THSD7A",
"THSD7B",
"THY1",
"TIE1",
"TIGIT",
"TIMD4",
"TIMP1",
"TIMP3",
"TINAGL1",
"TKTL1",
"TLL1",
"TLR10",
"TLR2",
"TLR4",
"TM4SF1",
"TM4SF18",
"TMC8",
"TMCC2",
"TMCC3",
"TMEM100",
"TMEM119",
"TMEM132C",
"TMEM144",
"TMEM154",
"TMEM156",
"TMEM163",
"TMEM176A",
"TMEM176B",
"TMEM204",
"TMEM233",
"TMEM40",
"TMEM71",
"TMEM88",
"TMIGD2",
"TMIGD3",
"TMSB10",
"TMSB4X",
"TMTC1",
"TMTC2",
"TNC",
"TNF",
"TNFAIP2",
"TNFAIP3",
"TNFAIP6",
"TNFAIP8",
"TNFRSF10D",
"TNFRSF12A",
"TNFRSF13B",
"TNFRSF13C",
"TNFRSF18",
"TNFRSF1B",
"TNFRSF4",
"TNFRSF9",
"TNFSF10",
"TNFSF14",
"TNFSF8",
"TNIP3",
"TNR",
"TNXB",
"TOP2A",
"TOX",
"TOX2",
"TPD52L1",
"TPM1",
"TPM2",
"TPPP3",
"TPRG1",
"TPSAB1",
"TPSB2",
"TPSD1",
"TRAC",
"TRAF3IP3",
"TRAT1",
"TRAV6",
"TRBC1",
"TRBC2",
"TRDC",
"TREM1",
"TREM2",
"TREML1",
"TRG-AS1",
"TRGC1",
"TRGC2",
"TRGV10",
"TRGV9",
"TRHDE",
"TRIM59",
"TRPC3",
"TRPC6",
"TRPM3",
"TRPS1",
"TSC22D1",
"TSHZ2",
"TSPAN13",
"TSPAN7",
"TSPAN8",
"TTN",
"TTR",
"TUBA1A",
"TUBA1B",
"TUBA4A",
"TUBB1",
"TXK",
"TXNIP",
"TYMP",
"TYMS",
"TYROBP",
"UACA",
"UBE2C",
"UGT8",
"UNC13C",
"UNC5C",
"UNC5D",
"USP53",
"UST",
"VAMP5",
"VAV1",
"VAV3",
"VCAM1",
"VCAN",
"VEGFA",
"VEGFC",
"VIM",
"VIP",
"VIPR1",
"VMO1",
"VNN2",
"VNN3",
"VPREB3",
"VSIG4",
"VSIR",
"VSNL1",
"VWA1",
"VWC2",
"VWF",
"WDFY4",
"WDR49",
"WFDC1",
"WFDC2",
"WIF1",
"WIPF1",
"WNT2B",
"WWTR1",
"XAF1",
"XCL1",
"XCL2",
"XIST",
"XKR4",
"XYLT1",
"YBX3",
"ZAP70",
"ZBP1",
"ZC3HAV1",
"ZEB1",
"ZEB2",
"ZFP36",
"ZFP36L1",
"ZFP36L2",
"ZFPM2",
"ZIC1",
"ZNF331",
"ZNF366",
"ZNF385B",
"ZNF385D",
"ZNF521",
"ZNF536",
"ZNF683",
"ZNF80",
"ZNF804A",
"ZNF804B",
"ZNF831",
"Lung",
"Thymus",
"Bone marrow",
"Blood",
"Brain",
"Liver",
"Heart",
"Classical monocyte",
"Plasma B cell",
"Unclassified",
"Type II alveolar cell",
"Hepatic stellate cell",
"Plasmacytoid dendritic cell",
"Vascular cell",
"Conventional dendritic cell 2",
"Adipocyte",
"Intermediate macrophage",
"Haematopoietic stem and progenitor cell",
"Ionocyte cell",
"T cell",
"CD4 Treg",
"Common lymphoid progenitor (CLP)",
"Goblet cell",
"Neuron",
"Granulocyte-monocyte progenitor (GMP)",
"Tuft cell",
"Artery endothelial cell",
"Non-classical monocyte",
"Cholangiocyte",
"Basal cell",
"Oligodendrocyte",
"Excitatory neuron",
"Mast cell",
"Adventitial fibroblast",
"Secretory cell",
"Endothelial cell",
"Granulocyte",
"Pre-B cell",
"Lymphatic endothelial cell",
"Epithelial progenitor cell",
"Plasmablast cell",
"Haematopoietic stem cell",
"NK T cell",
"Erythrocyte",
"Stromal cell",
"Vascular endothelial cell",
"Proliferating cell",
"Naive CD8 T cell",
"Cytotoxic CD8 T cell",
"NK cell",
"Memory CD4 T cell",
"Alveolar fibroblast",
"Vein endothelial cell",
"Oligodendrocyte precursor cell (OPC)",
"Early T-cell precursor",
"Naive CD4 T cell",
"Megakaryocyte",
"Cytotoxic T cell",
"Myofibroblast",
"Neural progenitor cell",
"Microglia",
"FOXN4+ cell",
"Smooth muscle cell",
"Dendritic cell",
"Squamous cell",
"Fibroblast",
"Inhibitory neuron",
"Pro-B cell",
"Vascular smooth muscle cell",
"Mature dendritic cell",
"Megakaryocyte-erythrocyte progenitor (MEP)",
"Basement membrane fibroblast",
"Lymphoid cell",
"Immature B cell",
"B cell",
"Effector CD8 memory T cell",
"Neutrophilic granulocyte",
"Ciliated cell",
"Erythroid progenitor cell",
"Astrocyte",
"Type I alveolar cell",
"Erythroblast",
"Kupffer cell",
"Ependymal cell",
"Migratory conventional dendritic cell",
"Epithelial cell",
"Hepatocyte",
"Effector T cell",
"Immune",
"Naive B cell",
"MAIT cell",
"Multipotent progenitor (MPP)",
"Monocyte-dendritic progenitor (MDP)",
"Capillary endothelial cell",
"Erythroid-like cell",
"Pericyte",
"Conventional dendritic cell",
"Basophilic granulocyte",
"Conventional dendritic cell 1",
"Cardiomyocyte cell",
"Cycling T cell",
"Neuroendocrine cell",
"CD8 T cell",
"Mature B cell",
"Sinusoidal endothelial cell",
"Bronchial smooth muscle cell",
"CD4 T cell",
"Macrophage",
"Memory CD8 T cell",
"Monocyte",
"Granule cell",
"Memory B cell",
"Migratory dendriitic cell",
"Multipotent lymphoid progenitor (MLP)",
"Mesothelial cell",
"Neutrophilic myelocyte",
"Common myeloid progenitor (CMP)",
"Cell",
"Alveolar cell",
"Neuroglial cell",
"Myeloid cell",
"late E",
"75 year",
"15 year",
"110 year",
"60 year",
"5 year",
"30 year",
"early E",
"10 week",
"95 year",
"40 week",
"0 year",
"5 week",
"25 year",
"100 year",
"55 year",
"105 year",
"90 year",
"10 year",
"45 year",
"40 year",
"65 year",
"15 week",
"35 week",
"20 week",
"25 week",
"85 year",
"35 year",
"70 year",
"50 year",
"80 year",
"20 year",
"30 week",
"combined hepatocellular carcinoma and cholangiocarcinoma",
"hepatocellular carcinoma",
"COVID-19",
"intrahepatic cholangiocarcinoma",
"cirrhosis of liver",
"Healthy",
"Hippocampus",
"Alveoli",
"Cord blood",
"Cerebral cortex",
"Peripheral blood",
"Ventricle",
"Cerebellum",
"Pons",
"White matter",
"Basal ganglia",
"Spinal cord",
"Cingulate cortex",
"PBMC",
"Medulla oblongata",
"Ganglionic eminences",
"Grey matter",
"Medulla",
"Hindbrain",
"Atria",
"Forebrain",
"Midbrain",
"Hypothalamus",
"Epithalamus",
"Bronchi",
"Head",
"Choroid",
"Amygdala",
"Thalamus",
"Cortex",
"Lung parenchyma",
"Telencephalon",
"Diencephalon",
"Pituitary gland",
"mCEL-Seq2",
"Microwell-seq",
"Smart-seq",
"Fluidigm C1",
"Smartseq2",
"STRT-seq",
"SMART-seq",
"Split-seq",
"Drop-seq",
"10X",
"F",
"M",
"<PCT>",
"<SPToken1>",
"<SPToken2>",
"<SPToken3>",
"<SPToken4>",
"<SPToken5>",
"<SPToken6>",
"<SPToken7>",
"<SPToken8>",
"<SPToken9>",
"<SPToken10>",
"<SPToken11>",
"<SPToken12>",
"<SPToken13>",
"<SPToken14>",
"<SPToken15>"
],
"training": false
}