Đau cơ xơ hóa KHÔNG PHẢI là một bệnh tự miễn dịch. Nguyên nhân của chứng đau cơ xơ hóa vẫn chưa được biết rõ. Những người mắc các bệnh khác có thể dễ bị đau cơ xơ hóa hơn. Những bệnh này bao gồm viêm khớp dạng thấp, lupus và viêm cột sống dính khớp. Các triệu chứng của đau cơ xơ hóa đôi khi giống như trong nhiều bệnh tự miễn dịch và việc chẩn đoán có thể khó khăn.