Sự khác biệt về cấu trúc và chức năng của các loại ribosome khác nhau đang tiếp tục được nghiên cứu và sửa đổi, nhưng hiện có hai cách phân loại chúng. Cách đầu tiên là phân loại chúng dựa trên loại tế bào mà chúng sinh sống: vi khuẩn cổ, tế bào nhân chuẩn hay vi khuẩn.