Các cảnh bãi biển trong Mysterious Island được quay tại địa điểm tại Vịnh Sa Conca, Castell-Platja d'Aro ở Catalonia, Tây Ban Nha. Cuộc vượt ngục khỏi nhà tù của Liên minh miền Nam - bằng khinh khí cầu quan sát - được quay tại Quảng trường Nhà thờ, Shepperton, Anh. Nội thất được hoàn thành tại Shepperton Studios.