Đun nhỏ lửa từ một đến ba giờ hoặc cho đến khi phần thịt ba chỉ mềm. Khi nước dùng sôi, giảm lửa nhỏ lại. Khi nấu ba chỉ trong nước dùng, ba chỉ sẽ mềm dần và hấp thụ hương vị của nước dùng. Khi nước dùng sôi, giảm lửa nhỏ lại. Khi ba ba nấu trong nước dùng, nó sẽ dần mềm và hấp thụ hương vị của nước dùng.