Khi nhìn vào cấu trúc, có thể dễ dàng nhận thấy DNA nhân nằm trong các phân tử mạch thẳng, trong khi mtDNA nằm trong các phân tử hình tròn khép kín. Ngoài ra, DNA hạt nhân chứa bộ gen nhân trong khi mtDNA chứa bộ gen ty thể. Bộ gen là tập hợp vật chất di truyền hoàn chỉnh của một sinh vật. Một điểm khác biệt cuối cùng trong cấu trúc là DNA hạt nhân chứa ba tỷ nucleotide và mtDNA chỉ chứa 16.569 nucleotide. một nhóm photphat. Khi nhìn vào cấu trúc, có thể dễ dàng nhận thấy DNA nhân nằm trong các phân tử mạch thẳng, trong khi mtDNA nằm trong các phân tử hình tròn khép kín. Ngoài ra, DNA hạt nhân chứa bộ gen nhân trong khi mtDNA chứa bộ gen ty thể. Bộ gen là toàn bộ vật chất di truyền của một sinh vật.