Giao thức FTP thường sử dụng cổng 21 làm phương tiện giao tiếp chính của nó. Một máy chủ FTP sẽ lắng nghe các kết nối của máy khách trên cổng 21. Sau đó, máy khách FTP sẽ kết nối với máy chủ FTP trên cổng 21 và bắt đầu một cuộc trò chuyện. Kết nối chính này được gọi là Kết nối Điều khiển hoặc Kết nối Lệnh. Máy khách FTP thường sẽ tự xác thực với máy chủ FTP bằng cách gửi qua tên người dùng và mật khẩu.