Verkhoyansk có khí hậu khô, ít mưa hoặc tuyết rơi: lượng mưa trung bình hàng năm là 180 mm (7,1 in). Mặc dù không có tháng nào có thể được mô tả là thực sự ẩm ướt, nhưng có sự khác biệt mạnh mẽ theo mùa về lượng mưa, với mùa hè ẩm ướt hơn nhiều so với mùa đông.