Hình dạng của phân tử xác định cách nó hoạt động trong tự nhiên và hình dạng phân tử được mô tả bằng cách sử dụng thuật ngữ hình học. Bản chất của phân tử phụ thuộc vào hình dạng cũng như sự chuyển dịch electron trong liên kết. Hình dạng của một phân tử ảnh hưởng đến các tính chất vật lý và hóa học của các nguyên tố liên quan.