Vịnh Glacier có khí hậu hàng hải, chịu ảnh hưởng lớn của các dòng hải lưu. Kết quả là nhiệt độ mùa đông ôn hòa và nhiệt độ mùa hè mát mẻ gần mực nước biển. Du khách mùa hè có thể mong đợi nhiệt độ cao nhất từ ​​50 đến 60 độ F (10 đến 15 độ C). Nhiệt độ mùa đông hiếm khi giảm xuống mức nhỏ nhất, với mức thấp nhất vào ban đêm trung bình là 25 đến 40 độ F (-2 đến 5 độ C).