Ví dụ, vi khuẩn Escherichia coli, gây ra phần lớn các bệnh nhiễm trùng đường tiết niệu, sẽ xuất hiện dưới dạng que màu hồng (gram âm) dưới kính hiển vi. Lactobacillus, một chất gây ô nhiễm âm đạo phổ biến trong mẫu nước tiểu của phụ nữ, sẽ xuất hiện dưới dạng các que mỏng màu tím (gram dương). Một số vi khuẩn, chẳng hạn như Lactobacillus, rất dễ dàng đối với một bác sĩ phòng thí nghiệm có kinh nghiệm để xác định, không gây bệnh và không cần phải điều tra thêm.