FS MRI có thể hữu ích trong việc lập kế hoạch phẫu thuật cắt bỏ khối u nền sọ, khối u tủy sống hoặc khối u gây tràn dịch não (tích tụ chất lỏng trên não). MRI chức năng (fMRI): fMRI tạo ra hình ảnh MRI theo một trình tự nhanh hơn so với MRI truyền thống. Tốc độ tăng lên cho thấy cách oxy được sử dụng trong não.