Nhiễm Chlamydia trachomatis thường ảnh hưởng đến đường niệu sinh dục. Ở nam giới, nhiễm trùng thường có triệu chứng, với chứng khó tiểu và tiết dịch từ dương vật. Nhiễm chlamydia ở nam giới không được điều trị có thể lây lan đến mào tinh hoàn. Hầu hết phụ nữ bị nhiễm chlamydia có ít hoặc không có triệu chứng, nhưng một số lại phát triển thành bệnh viêm vùng chậu.