Một trong những mối quan tâm chính của mọi người với chế độ ăn thực phẩm thô là nguy cơ thiếu hụt dinh dưỡng, chẳng hạn như vitamin B12, vitamin D, sắt, kẽm và axit béo omega-3. Chế độ ăn uống thực phẩm thô cũng có liên quan đến khối lượng xương thấp.