Khoảng 10% các trường hợp mắc hội chứng Angelman là do đột biến gen UBE3A và 3% khác là do khiếm khuyết trong vùng DNA kiểm soát sự hoạt hóa của gen UBE3A và các gen khác trên bản sao nhiễm sắc thể 15 của người mẹ.