E. coli thuộc về một nhóm vi khuẩn được gọi là coliforms được tìm thấy trong đường tiêu hóa của động vật máu nóng. E. coli thường cư trú trong đường tiêu hóa của trẻ sơ sinh trong vòng 40 giờ sau khi sinh, đến cùng với thức ăn hoặc nước uống hoặc từ những người tiếp xúc với trẻ.