Nơi mà chất phù hợp với enzim được gọi là vị trí hoạt động và chất phù hợp với vị trí hoạt động được gọi là cơ chất. Hoạt động của enzym xảy ra khi enzym và cơ chất va chạm. Trong quá trình va chạm, các khe cơ chất vào vị trí hoạt động của enzym. Sự va chạm xảy ra do sự chuyển động ngẫu nhiên nhanh chóng của các phân tử. Khi cơ chất tham gia với enzyme, toàn bộ cấu trúc được gọi là phức hợp enzyme-cơ chất. Chất nền trở nên thay đổi do hoạt động của enzym và sau đó được giải phóng dưới dạng sản phẩm. Sau đó, enzyme tự do tham gia vào cơ chất khác. Enzyme có thể là đồng hóa hoặc dị hóa.