Người có tiền sử gia đình bị sỏi thận có thể dễ bị sỏi hơn. Nhiễm trùng đường tiết niệu, rối loạn thận như bệnh thận nang, và một số rối loạn chuyển hóa như cường cận giáp cũng có liên quan đến sự hình thành sỏi. Ngoài ra, hơn 70% những người mắc bệnh di truyền hiếm gặp được gọi là nhiễm toan ống thận phát triển thành sỏi thận. Cystin niệu và tăng oxy niệu là hai rối loạn chuyển hóa di truyền hiếm gặp khác thường gây ra sỏi thận.