Theo điều tra dân số năm 2010, Algonquin có tổng diện tích 12,41 dặm vuông (32,14 km 2), trong đó 12,23 dặm vuông (31,68 km 2) (hoặc 98,55%) là đất và 0,18 dặm vuông (0,47 km 2) (hoặc 1,45 %) là nước. Phần lớn Algonquin là khoảng 2/3 ở McHenry County, với khoảng 1/3 ở Kane County.