Nhiễm sắc thể, hoặc cấu trúc bậc cao chứa gen, cũng được phân tích để hỗ trợ thuyết tiến hóa. Các nhà khoa học so sánh nhiễm sắc thể giữa các loài hoặc các nhóm sinh vật sống lớn khác và ÃƒÂ ¢ Ã‚â‚¬Ã‚Å “kiểm đếm sự khác biệt.