Sau khi bị bắt, những người Frank được đưa đến các trại tập trung. Vào tháng 10 hoặc tháng 11 năm 1944, Anne và em gái của cô, Margot, được chuyển đến trại tập trung Bergen-Belsen từ trại tập trung Auschwitz, nơi họ chết (có thể là do sốt phát ban) vài tháng sau đó.