Nội dung của tệp MHTML được mã hóa như thể nó là một thông điệp e-mail HTML, sử dụng đa phần / liên quan kiểu MIME. Phần đầu tiên của tệp là tiêu đề e-mail. Phần thứ hai là HTML được mã hóa thông thường. Các phần tiếp theo là các tài nguyên bổ sung được xác định bằng URL gốc của chúng và được mã hóa trong base64.