Như thường thấy trong các cuộc chiến tranh và bao vây, phần lớn số người chết trong Nội chiến là do bệnh tật. Các bệnh viện dã chiến thường trở thành trung tâm lây nhiễm và dịch bệnh vì số lượng lớn binh lính bị thương sẽ được tập trung trong điều kiện bẩn thỉu với ít hoặc không có vệ sinh.