Một số người sử dụng bạc hà Nhật Bản như một chất kích thích, một chất diệt vi trùng hoặc một chất giảm đau. Bạc hà Nhật Bản bôi trực tiếp lên da trị đau cơ, đau dây thần kinh, ngứa, nổi mề đay. Khi hít vào, bạc hà Nhật Bản được sử dụng để làm sưng niêm mạc của đường hô hấp trên. Tinh dầu bạc hà Nhật Bản chứa tới 95% tinh dầu bạc hà.