Cấu trúc bậc hai liên quan đến liên kết hydro giữa các axit amin. Cấu trúc bậc ba liên quan đến liên kết giữa các nhóm R và cấu trúc bậc bốn thường liên quan đến nhiều tương tác protein. Biến tính ở nhiệt độ cao xảy ra do nhiệt độ cao phá vỡ một số liên kết xảy ra trong các cấu trúc protein bậc bốn / bậc ba / và bậc hai này.