Khi Lãnh thổ Missouri được tổ chức vào năm 1812, St. Louis là trụ sở chính phủ của Missouri. St. Charles sẽ đóng vai trò là thủ đô tiếp theo. Ở giữa bang, thành phố Jefferson được chọn làm thủ đô mới vào năm 1821 khi Thomas Jefferson vẫn còn sống.