Chẩn đoán MRSA được thiết lập bằng cách nuôi cấy vi khuẩn từ một khu vực bị nhiễm bệnh. Bất kỳ vùng da nào có mủ, áp-xe hoặc mụn nước nên được nuôi cấy để tìm MRSA. Bệnh nhân bị nhiễm trùng huyết hoặc viêm phổi nên cấy máu. Mủ từ các vị trí phẫu thuật, tủy xương, dịch khớp hoặc hầu như bất kỳ vị trí nào trên cơ thể có thể bị nhiễm trùng nên được nuôi cấy để tìm MRSA.