Phần lớn sỏi thận được tạo thành từ canxi, và tăng canxi niệu (lượng canxi cao trong nước tiểu) là một trong những yếu tố nguy cơ. Khuynh hướng về nồng độ canxi cao trong nước tiểu có thể di truyền từ thế hệ này sang thế hệ khác. Một số bệnh di truyền hiếm gặp cũng khiến một số người hình thành sỏi thận.