Xem thêm: Đường hô hấp. Hệ hô hấp (còn gọi là bộ máy hô hấp, hệ thống thông gió) là một hệ thống sinh học bao gồm các cơ quan và cấu trúc cụ thể được sử dụng cho quá trình hô hấp ở một sinh vật. Động vật khác, chẳng hạn như côn trùng, có hệ thống hô hấp với các đặc điểm giải phẫu rất đơn giản, động vật lưỡng cư thậm chí da cũng đóng vai trò quan trọng trong trao đổi khí. Thực vật cũng có hệ thống hô hấp nhưng hướng trao đổi khí có thể ngược lại với động vật.