Cho đến những năm gần đây, phương pháp điều trị tiêu chuẩn cho nhiễm trùng tiểu là dùng amoxicillin, một loại kháng sinh penicillin trong 10 ngày, nhưng hiện nay nó không có hiệu quả đối với vi khuẩn E. coli trong 25% trường hợp. Một sự kết hợp của amoxicillin-clavulanate (Augmentin) đôi khi được dùng cho các trường hợp nhiễm trùng kháng thuốc.