Southern blotting kết hợp chuyển các đoạn DNA được phân tách bằng điện di vào màng lọc và phát hiện đoạn sau đó bằng cách lai đầu dò. , Southwestern blot) sử dụng các nguyên tắc tương tự, nhưng sử dụng RNA hoặc protein, sau đó được đặt tên theo tên của Edwin Southern. Các đoạn DNA sau đó được điện hóa trên gel agarose để phân tách chúng theo kích thước. 2 Nếu một số đoạn DNA lớn hơn 15 kb, thì trước khi thấm, gel có thể được xử lý bằng axit, chẳng hạn như HCl loãng.