EPA do Tổng thống Richard Nixon đề xuất và bắt đầu hoạt động vào ngày 2 tháng 12 năm 1970, sau khi Nixon ký lệnh hành pháp. Lệnh thành lập EPA đã được phê chuẩn bởi các cuộc điều trần của ủy ban tại Hạ viện và Thượng viện. Cơ quan này được lãnh đạo bởi Quản trị viên, người được tổng thống bổ nhiệm và được Quốc hội phê chuẩn. Vào năm 1970, Tổng thống Richard Nixon đã đề xuất một tổ chức lại hành pháp sẽ hợp nhất nhiều trách nhiệm môi trường của chính phủ liên bang thành một cơ quan, Cơ quan Bảo vệ Môi trường mới. Đề xuất tổ chức lại đó đã được Hạ viện và Thượng viện xem xét và thông qua.