Nối ghép thay thế là một cơ chế điều chỉnh trong đó các biến thể trong việc kết hợp các exon, hoặc vùng mã hóa, vào mRNA dẫn đến việc sản xuất nhiều hơn một protein liên quan, hoặc isoform. Một quá trình trong đó việc đưa RNA sợi kép vào tế bào sẽ ức chế sự biểu hiện của các gen.