Các cơ quan chính của hệ thống miễn dịch là tủy xương, tuyến ức, lá lách và các hạch bạch huyết. Các cơ quan này sản xuất các tế bào bạch huyết cần thiết để tiêu diệt vi khuẩn, vi rút, tế bào khối u, v.v.