Các cây khác được hưởng lợi từ vi khuẩn cố định N khi vi khuẩn chết và giải phóng nitơ ra môi trường, hoặc khi vi khuẩn sống liên kết chặt chẽ với cây. Ở cây họ đậu và một số cây khác, vi khuẩn sống thành từng đám nhỏ trên rễ được gọi là nốt sần. Trong các nốt sần này, vi khuẩn cố định nitơ và NH 3 do chúng tạo ra sẽ được cây hấp thụ. Sự cố định nitơ của cây họ đậu là sự hợp tác giữa vi khuẩn và thực vật.