Magnesium citrate hoạt động bằng cách thu hút nước qua các mô bằng một quá trình được gọi là thẩm thấu. Khi ở trong ruột, nó có thể hút đủ nước vào ruột để gây đại tiện. Nước bổ sung sẽ kích thích nhu động ruột. Điều này có nghĩa là nó cũng có thể được sử dụng để điều trị các vấn đề về trực tràng và ruột kết.