Nhiệt độ trung bình hàng tháng cao nhất ở San Marcos cho tháng Tám là 70 độ. Nhiệt độ trung bình hàng tháng thấp nhất ở San Marcos cho tháng Giêng là 55 độ. Lượng mưa hàng tháng nhiều nhất ở San Marcos xảy ra trong tháng Giêng với 2,3 inch. Chỉ số chất lượng không khí ở San Marcos kém hơn 22% so với mức trung bình trên toàn quốc. Chỉ số ô nhiễm ở San Marcos tồi tệ hơn 798% so với mức trung bình của cả nước.