Hơn nữa, một số protein bổ sung được tìm thấy trong các tiểu đơn vị nhỏ và lớn của ribosome sinh vật nhân chuẩn, không có các chất tương đồng nhân sơ. Tiểu đơn vị 40S chứa RNA ribosome 18S (viết tắt là rRNA 18S), tương đồng với rRNA 16S của tế bào nhân sơ.