Omeprazole cũng được sử dụng để điều trị hội chứng Zollinger-Ellison, một tình trạng trong đó dạ dày tạo ra quá nhiều axit. Omeprazole cũng được sử dụng để điều trị chứng khó tiêu, một tình trạng gây chua dạ dày, ợ hơi, bỏng tim hoặc khó tiêu.