Bột Nystatin được sử dụng để điều trị nấm men miệng và thực quản cũng như nấm men Candida phát triển quá mức trong ruột. Nystatin là một trong những chất ít độc hại nhất trong các loại thuốc kê đơn. Nó an toàn hơn để sử dụng hơn hầu hết các sản phẩm không kê đơn.