Sân bay quốc tế Kota Kinabalu là cửa ngõ chính dẫn đến Sabah với thế giới bên ngoài. Nó nằm cách trung tâm thị trấn 10 km. Nhờ vị trí trung tâm, K.K. Sân bay Quốc tế cách hầu hết các thủ đô ASEAN chưa đầy ba giờ bay. Có các chuyến bay trực tiếp đến Hồng Kông, Tokyo, Seoul, Đài Bắc, Cao Hùng, Singapore, Manila, Kuala Lumpur, Cebu, Davao, Brunei và Labuan nối Kota Kinabalu với thế giới bên ngoài, đặc biệt là BIMP-EAGA và vành đai Châu Á - Thái Bình Dương.