Bạn sẽ không ngủ trong khi phẫu thuật, nhưng bạn sẽ không cảm thấy đau. Trong loại hình ghép giác mạc phổ biến nhất (tạo hình giác mạc xuyên thấu), bác sĩ phẫu thuật của bạn sẽ cắt toàn bộ độ dày của giác mạc bất thường hoặc bị bệnh để loại bỏ một đĩa mô giác mạc có kích thước bằng một nút nhỏ.