Nguyên nhân gây ra tật nứt đốt sống. Nứt đốt sống là một dị tật bẩm sinh không rõ nguyên nhân trong hầu hết các tình huống. Tuy nhiên, nghiên cứu cho thấy rằng sự thiếu hụt axit folic trong thời kỳ đầu mang thai có thể đóng một vai trò trong sự phát triển ống thần kinh. Ngoài ra, tiền sử gia đình bị nứt đốt sống làm tăng xác suất dị tật bẩm sinh.