Phân màu vàng kéo dài cũng có thể do các bệnh như nhiễm giardia hoặc bệnh trào ngược dạ dày thực quản (GERD). Phân màu vàng cũng có thể cho thấy túi mật và gan có vấn đề. Muối mật từ gan làm cho phân có màu nâu và khi lượng mật giảm đi, ban đầu có thể xuất hiện dưới dạng phân màu vàng.