Một số người có thể gặp phản ứng ở đường tiêu hóa sau khi tiêm vitamin B12. Một số tác dụng phụ liên quan đến việc tiêm thuốc bao gồm buồn nôn, nôn mửa, khó tiêu và tiêu chảy nhẹ, theo Drugs.com. Mặc dù hiếm khi xảy ra, phản ứng dị ứng có thể xảy ra sau khi tiêm vitamin B12. Phản ứng được cho là xảy ra do các tạp chất trong thuốc tiêm B12, Drugs.com lưu ý.