Mô tả cơ thể con người và vi khuẩn chiếm ưu thế. Hệ vi sinh vật là một cộng đồng sinh thái gồm các vi sinh vật sống chung, cộng sinh và gây bệnh chia sẻ không gian trong cơ thể chúng ta theo nghĩa đen. các thành viên của cộng đồng vi sinh vật bao gồm vi khuẩn, sinh vật nhân chuẩn và vi rút. Điều này được thực hiện chủ yếu bằng cách sử dụng các nghiên cứu dựa trên DNA, mặc dù các nghiên cứu dựa trên RNA, protein và chất chuyển hóa cũng được thực hiện.