Bệnh thối đầu hoa là do cây cà chua không thể cung cấp đủ canxi cho quả đang phát triển. Nó không phải do bệnh thực vật như nấm hoặc vi khuẩn gây ra. Bệnh thối đầu hoa cũng có thể xảy ra ở ớt, dưa, cà tím, bí và dưa chuột.