Các dấu hiệu và triệu chứng của hội chứng cri-du-chat có thể liên quan đến việc mất nhiều gen trên nhánh ngắn của nhiễm sắc thể số 5. ​​Các nhà nghiên cứu tin rằng việc mất một gen cụ thể, CTNND2, có liên quan đến khuyết tật trí tuệ nghiêm trọng ở một số người tình trạng này. hầu hết các trường hợp hội chứng cri-du-chat không di truyền. Sự xóa bỏ xảy ra thường xuyên nhất là một sự kiện ngẫu nhiên trong quá trình hình thành các tế bào sinh sản (trứng hoặc tinh trùng) hoặc trong quá trình phát triển sớm của bào thai. Những người bị ảnh hưởng thường không có tiền sử về rối loạn trong gia đình của họ.