Rò hậu môn là do chấn thương ở hậu môn và ống hậu môn. Nguyên nhân của chấn thương thường là do chuyển động ruột, và nhiều người có thể nhớ chính xác chuyển động ruột khi cơn đau của họ bắt đầu. Vết nứt có thể do phân cứng hoặc các đợt tiêu chảy lặp đi lặp lại.