Trong phương trình, p 2 biểu thị tần số kiểu gen đồng hợp tử AA, q 2 biểu thị tần số kiểu gen đồng hợp tử aa và 2pq biểu thị tần số kiểu gen dị hợp tử Aa. Ngoài ra, tổng tần số alen của tất cả các alen tại vị trí phải bằng 1, do đó p + q = 1.