Như với bất kỳ loại thuốc nào, có thể phát triển các tác dụng phụ khi dùng metformin. Các vấn đề thường được báo cáo nhất trong các nghiên cứu lâm sàng bao gồm tiêu chảy, buồn nôn hoặc nôn, đầy hơi và suy nhược. Bên cạnh những tác dụng phụ thông thường này, cũng có những vấn đề khác có thể xảy ra với metformin trong quá trình điều trị. Thuốc có thể gây ra tình trạng đe dọa tính mạng được gọi là nhiễm axit lactic.