Khả năng tương thích với thiết bị Phổ hấp thụ của các liên hợp Alexa Fluor phù hợp với các bước sóng đầu ra chính của các nguồn kích thích thông thường. Lựa chọn màu sắc Liên hợp Alexa Fluor có sẵn trong một số màu huỳnh quang khác nhau, từ xanh lam đến đỏ đến cận hồng ngoại (Hình 1, Bảng 1).