Ở tế bào nhân thực, trong tế bào chất xảy ra các phản ứng đường phân và lên men. Các con đường còn lại, bắt đầu bằng quá trình oxy hóa pyruvate, xảy ra trong ty thể. Hầu hết các ti thể của sinh vật nhân thực chỉ có thể sử dụng oxy làm chất nhận điện tử cuối cùng cho quá trình hô hấp.