Có một số khiếm khuyết di truyền dẫn đến hội chứng HIGM: 1 Dạng phổ biến nhất của hội chứng HIGM là kết quả của sự khiếm khuyết hoặc thiếu hụt protein trên bề mặt tế bào T khiến chúng không thể hướng dẫn tế bào B chuyển từ tạo IgM sang tạo ra các globulin miễn dịch khác.