Năm 1996, bộ gen của sinh vật nhân thực đầu tiên (Saccharomyces cerevisiae) đã được xác định trình tự. S. cerevisiae, một sinh vật kiểu mẫu trong sinh học có bộ gen chỉ khoảng 12 triệu cặp nucleotide, và là sinh vật nhân chuẩn đơn bào đầu tiên có trình tự toàn bộ bộ gen của nó. Động vật và eukaryote đa bào đầu tiên được giải trình tự toàn bộ bộ gen là giun tròn: Caenorhabditis elegans vào năm 1998.