Thalidomide được phát hiện có thể gây hại cho sự phát triển của thai nhi và gây ra dị tật bẩm sinh nghiêm trọng, đặc biệt nếu dùng trong bốn đến tám tuần đầu của thai kỳ. Thuốc dẫn đến tay hoặc chân của trẻ sơ sinh rất ngắn hoặc hình thành không hoàn chỉnh. Các tác dụng phụ khác cũng bao gồm mắt, tai và tim bị biến dạng.