S. pneumoniae là một trong những nguyên nhân phổ biến nhất gây viêm màng não do vi khuẩn ở người lớn và thanh niên, cùng với Neisseria meningitidis, và là nguyên nhân hàng đầu gây viêm màng não do vi khuẩn ở người lớn ở Hoa Kỳ. Nó cũng là một trong hai chủng phân lập hàng đầu được tìm thấy trong bệnh viêm tai, viêm tai giữa. vi khuẩn gây bệnh đáng kể cho người, S. pneumoniae được công nhận là nguyên nhân chính gây ra bệnh viêm phổi vào cuối thế kỷ 19, và là đối tượng của nhiều nghiên cứu về miễn dịch dịch thể. S. pneumoniae cư trú không triệu chứng trong vòm họng của người lành mang trùng.