Tần số alen, hoặc tần số gen, là tần số tương đối của một alen (biến thể của gen) tại một vị trí cụ thể trong quần thể, được biểu thị bằng một phần hoặc phần trăm. Cụ thể, nó là một phần của tất cả các nhiễm sắc thể trong quần thể mang alen đó.