John Bell Hood chết ngày 30/8/1879 vì bệnh sốt vàng da, lúc 3 giờ 30A tại New Orleans, Louisiana. Vợ ông, Anna Marie Hennen Bell cũng chết 24/8/1879 vì bệnh sốt vàng da. Con gái của ông, Lydia, chết ngày 26/8/1879 vì bệnh sốt vàng da. Hài cốt của Hood sau đó được chuyển đến Hầm chứa Hennen ở Metairie Cemetary. Cha mẹ anh là Jasper Hood và Tryntje Andries.