Misalnya, bakteri Escherichia coli, yang menyebabkan sebagian besar infeksi saluran kemih, akan muncul sebagai batang berwarna merah muda (gram negatif) di bawah mikroskop. Lactobacillus, yang merupakan kontaminan vagina yang umum dalam sampel urin wanita, akan muncul sebagai batang tipis berwarna ungu (gram positif). Beberapa bakteri, seperti Lactobacillus, mudah diidentifikasi oleh ahli laboratorium yang berpengalaman, tidak patogen, dan tidak memerlukan penyelidikan lebih lanjut.