Individu dengan bentuk defisiensi CPT II hepatokardiomuskular infantil yang parah berisiko mengalami gagal hati, kerusakan sistem saraf, koma, dan kematian mendadak. Bentuk miopati adalah jenis defisiensi CPT II yang paling ringan. Bentuk ini ditandai dengan episode nyeri otot (mialgia) dan kelemahan yang berulang dan berhubungan dengan kerusakan jaringan otot (rhabdomyolisis). Individu dengan bentuk CPT hepatokardiomuskular infantil yang parah Kekurangan II berisiko gagal hati, kerusakan sistem saraf, koma, dan kematian mendadak. Bentuk miopati adalah tipe defisiensi CPT II yang paling ringan.