Sistem file OpenZFS[sunting | sunting sumber] FreeNAS mendukung sistem file OpenZFS yang menyediakan pemeriksaan integritas data untuk mencegah korupsi data, mengaktifkan snapshot titik waktu, replikasi dan beberapa tingkat redundansi termasuk striping, mirroring, striped mirrors (RAID 1+0), dan tiga tingkat RAID-Z.