Beberapa orang mungkin mengalami reaksi di saluran pencernaan setelah mendapatkan suntikan vitamin B12. Beberapa efek samping yang terkait dengan suntikan termasuk mual, muntah, gangguan pencernaan dan diare ringan, menurut Drugs.com. Meskipun jarang terjadi, reaksi alergi dapat terjadi setelah injeksi vitamin B12. Reaksi diperkirakan terjadi karena kotoran dalam injeksi B12, catat Drugs.com.