Tempat zat yang cocok dengan enzim disebut situs aktif dan zat yang cocok dengan situs aktif disebut substrat. Kerja enzim terjadi ketika enzim dan substrat bertumbukan. Selama tumbukan, substrat masuk ke situs aktif enzim. Tabrakan terjadi karena pergerakan acak molekul yang cepat. Ketika substrat bergabung dengan enzim seluruh struktur disebut kompleks enzim-substrat. Substrat diubah oleh aksi enzim dan kemudian dilepaskan sebagai produk. Enzim kemudian bebas untuk bergabung dengan substrat lain. Enzim dapat berupa anabolik atau katabolik.