Selama tahun 1950-an Du Bois ditarik ke dalam gerakan kiri, termasuk memimpin Pusat Informasi Perdamaian. Penolakan pusat untuk mematuhi Undang-Undang Pendaftaran Agen Asing menyebabkan dakwaannya dengan empat orang lainnya oleh dewan juri federal pada tahun 1951.