Polymerase Chain Reaction (PCR) biasanya digunakan untuk mengamplifikasi gen atau fragmen DNA yang diinginkan, dari sumber DNA mana pun, untuk dikloning. Untuk menghasilkan ujung yang kompatibel, biasanya ditambahkan situs restriksi ke ujung 5ÃƒÂ¢Ã‚ââ dari kedua primer PCR.