cDNA diproduksi dari mRNA yang ditranskripsi sepenuhnya yang ditemukan di dalam nukleus dan karena itu hanya berisi gen yang diekspresikan dari suatu organisme. Demikian pula, perpustakaan cDNA spesifik jaringan dapat diproduksi. Perpustakaan DNA vs. Perpustakaan DNA Genomic [sunting]. Pustaka cDNA tidak memiliki elemen non-coding dan regulasi yang ditemukan dalam DNA genom. Perpustakaan DNA genom memberikan informasi yang lebih rinci tentang organisme, tetapi lebih intensif sumber daya untuk menghasilkan dan memelihara.