Fungsi utama mitokondria adalah produksi energi selama produksi adenosin trifosfat (ATP) melalui Siklus TCA (yang juga sebagai Siklus Krebs dan Siklus Asam Sitrat). Proses itu merupakan jalur metabolisme yang penting (lihat juga apa metabolisme).menurut banyak buku teks: Produksi energi di dalam sel adalah fungsi utama mitokondria. Namun, beberapa siswa diberitahu untuk tidak menyatakan bahwa mitokondria menghasilkan atau menciptakan energi. Sebenarnya, energi dilepaskan dari penyimpanan (dalam ikatan kimia) melalui reaksi yang terjadi di mitokondria.