Gejala klamidia tergantung pada tempat infeksi. Hal ini ditularkan melalui sekresi yang terinfeksi, dan terutama menginfeksi membran mukosa, terutama serviks, rektum, uretra, tenggorokan dan konjungtiva (mata). Trachoma, salah satu penyebab utama kebutaan adalah karena infeksi Chlamydia trachomatis.