Vakuola kontraktil adalah jenis khusus vakuola; vakuola ditemukan di sebagian besar sel tetapi tidak semua vakuola adalah vakuola kontraktil. Vakuola kontraktil, seperti namanya, mengeluarkan air dari sel dengan cara berkontraksi. Kontraksi vakuola kontraktil dan pengeluaran air keluar sel disebut sistol. Air selalu mengalir pertama kali dari luar sel ke dalam sitoplasma, dan baru kemudian dipindahkan dari sitoplasma ke dalam vakuola kontraktil untuk dikeluarkan.