Predator hiu utama lumba-lumba hidung botol adalah hiu banteng, hiu macan, hiu kehitaman, dan hiu putih besar. Bekas gigitan hiu pada lumba-lumba menunjukkan bahwa hiu biasanya berusaha menyergap lumba-lumba dari belakang dan bawah. Beberapa peneliti berpikir bahwa serangan hiu bahkan mungkin bukan upaya untuk memakan lumba-lumba.