Setidaknya ada tiga subspesies yang berbeda: B. m. musculus Atlantik Utara dan Pasifik Utara, B. m. perantara Samudra Selatan dan B. m. brevicauda (juga dikenal sebagai paus biru kerdil) ditemukan di Samudra Hindia dan Samudra Pasifik Selatan.B. M. indica, ditemukan di Samudra Hindia, mungkin merupakan subspesies lain. Paus lue berlimpah di hampir semua samudra di Bumi hingga awal abad kedua puluh. Selama lebih dari satu abad, mereka diburu hampir punah oleh pemburu paus hingga dilindungi oleh komunitas internasional pada tahun 1966.