Saat pengguna memasukkan CD-ROM berkemampuan AutoRun ke dalam drive CD-ROM mereka, AutoRun secara otomatis menjalankan aplikasi pada CD-ROM yang menginstal, mengkonfigurasi, atau menjalankan produk yang dipilih. AutoRun dapat digunakan untuk menginstal dan menjalankan aplikasi CD-ROM. Meskipun AutoRun paling sering digunakan untuk aplikasi Windows, itu juga dapat digunakan untuk menginstal, mengkonfigurasi, atau menjalankan aplikasi berbasis MS-DOS dalam sesi Windows Microsoft MS-DOS. Anda dapat mengkonfigurasi setiap aplikasi berbasis MS-DOS dengan ikon uniknya sendiri, file Config.sys, dan file Autoexec.bat.