Kotoran kuning yang berkepanjangan juga dapat disebabkan oleh kondisi seperti giardiasis atau penyakit refluks gastroesofageal (GERD). Kotoran kuning juga dapat menunjukkan masalah dengan kantong empedu dan hati. Garam empedu dari hati membuat tinja berwarna kecoklatan dan ketika pengeluaran empedu berkurang, tinja pertama kali mungkin tampak berwarna kuning.