Penyakit tangan, kaki, dan mulut disebabkan oleh virus yang termasuk dalam genus (kelompok) Enterovirus, antara lain poliovirus, coxsackievirus, echovirus, dan enterovirus. 1 Coxsackievirus A16 adalah penyebab paling umum dari penyakit tangan, kaki, dan mulut di Amerika Serikat, tetapi virus coxsackie lainnya juga dapat menyebabkan penyakit tersebut.