Sel punca multipoten terdiferensiasi sebagian, sehingga membentuk sejumlah jenis jaringan yang terbatas. Sel multipoten hanya menghasilkan sel-sel dari keluarga sel yang terkait erat (misalnya sel punca hematopoietik berdiferensiasi menjadi sel darah merah, sel darah putih, trombosit, dll.). diferensiasi HSC menjadi sel progenitor primitif garis keturunan spesifik seperti sel punca Myeloid (IL-3 dan GMCSF) atau sel punca limfoid (IL-3), memungkinkan proliferasi sel progenitor yang berkomitmen ke dalam kategori lain dari sel sumsum utama. Berbagai sel progenitor diidentifikasi berdasarkan jenis koloni yang mereka bentuk.