Menurut CDC, gejala pernapasan influenza Spanyol termasuk batuk, sakit tenggorokan, pilek, hidung tersumbat dan masalah pernapasan. Meskipun gejala serupa terlihat dengan semua virus influenza, mereka sangat parah dengan influenza Spanyol. Menurut studi tahun 2006 di Nature, analisis histopatologi modern dari sampel otopsi dari kasus flu Spanyol menunjukkan kerusakan luar biasa pada paru-paru dengan peradangan fokal akut pada saluran udara (bronkus) dan jaringan lunak (alveoli) paru-paru.