Obat-obatan saja, bagaimanapun, tidak akan menutup VSD, dan dalam kasus ini, pembedahan mungkin diperlukan. Dalam kebanyakan kasus, operasi dilakukan dalam beberapa minggu pertama hingga bulan kehidupan seorang anak. Dokter bedah membuat sayatan di dinding dada dan mesin jantung-paru akan menjaga sirkulasi saat dokter bedah menutup lubang.