Flu burung, seperti jenis influenza lainnya, disebabkan oleh virus yang menginfeksi sistem pernapasan. Akibatnya, efek pada tubuh sering terfokus pada tenggorokan, hidung, dan paru-paru. Hidung bisa menjadi tersumbat, tenggorokan bisa menjadi sakit, dan batuk atau sakit tenggorokan bisa terjadi.