CF disebabkan oleh mutasi pada gen cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR). Mutasi yang paling umum, Â´F508, adalah penghapusan (ÃƒÅ½Ã‚Â´ menandakan penghapusan) dari tiga nukleotida yang mengakibatkan hilangnya asam amino fenilalanin (F) pada posisi ke-508 pada protein. Orang yang berbeda mungkin memiliki derajat gejala yang berbeda. CF adalah gangguan resesif autosomal. Hal ini disebabkan oleh adanya mutasi pada kedua salinan gen untuk protein cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR). Mereka yang memiliki salinan kerja tunggal adalah pembawa dan sebagian besar normal.