Matthew Henson meninggalkan seorang putra tunggal, Anauakaq, yang ibunya adalah seorang wanita Inuit bernama Akatingwah. Anauakaq pernah mengunjungi keluarga ayahnya dan tempat di mana Henson dimakamkan. Pada tahun 1988 jenazah Henson dipindahkan ke Pemakaman Nasional Arlington dimana ia dikebumikan di dekat tempat pemakaman Robert Peary.