Satu-satunya perbedaan adalah bahwa XD-S 9mm memiliki magasin tumpuk tunggal dengan kapasitas 7 + 1 (dengan magasin opsional 9 +1 tersedia) dan 9mm sedikit lebih berat karena lubang yang lebih kecil (9mm) di laras (lebih banyak logam tertinggal).