Penyebab Bilirubin dalam Urine. Ada beberapa kemungkinan penyebab adanya bilirubin dalam urin. Berikut adalah penyebab paling umum: Â¢Ã‚â‚¬Ã‚Â¢ Saluran empedu yang tersumbat Â¢Ã‚ââ€œ Saluran empedu umum adalah tempat bilirubin melewati untuk penyaringan sebelum ditransfer ke usus besar.