Perbedaan antara neuropeptida dan hormon peptida berkaitan dengan jenis sel yang melepaskan dan merespons molekul; neuropeptida disekresikan dari sel saraf (terutama neuron tetapi juga glia untuk beberapa peptida) dan memberi sinyal ke sel tetangga (terutama neuron). Neuropeptida dan hormon peptida lainnya disintesis oleh set enzim yang sama, yang meliputi prohormon convertase dan karboksipeptidase yang secara selektif membelah prekursor peptida di lokasi pemrosesan tertentu untuk menghasilkan peptida bioaktif.