Bayi dengan botulisme tampak lesu, sulit makan, sembelit, menangis lemah, dan tonus otot buruk. Gejala umumnya mulai 12-36 jam setelah makan makanan yang terkontaminasi, tetapi dapat terjadi sedini beberapa jam dan hingga 10 hari. Gejala botulisme pada bayi dapat terjadi hingga 14 hari kemudian.