Thalidomide ditemukan membahayakan perkembangan bayi yang belum lahir dan menyebabkan cacat lahir yang serius, terutama jika dikonsumsi dalam empat sampai delapan minggu pertama kehamilan. Obat tersebut menyebabkan lengan atau kaki bayi menjadi sangat pendek atau tidak terbentuk sempurna. Efek samping lainnya juga termasuk kelainan bentuk mata, telinga dan hati.