Hormon pengganti tiroid digunakan untuk mengobati hipotiroidisme (produksi hormon tiroid yang rendah) dan miksedema, suatu kondisi yang disebabkan oleh hipotiroidisme yang berkepanjangan. Hormon pengganti tiroid mencegah pelepasan hormon tiroid dari nodul tiroid kanker dan karena itu digunakan untuk mengobati kanker tiroid.