Ada sejumlah masalah lingkungan dan kesehatan yang terkait dengan antrakuinon. Untuk satu hal, penggunaannya sebagai pencahar telah dikaitkan dengan kondisi jinak tetapi tidak diinginkan yang dikenal sebagai melanosis coli, yang ditandai dengan perubahan warna pada dinding usus besar. ntrakuinon adalah senyawa organik aromatik yang terjadi secara alami pada tanaman, jamur, dan serangga tertentu. . Karena berkontribusi pada pigmen pewarna organisme tersebut, senyawa tersebut digunakan secara komersial untuk memproduksi pewarna.