Kate McKinnon berkencan dengan sesama aktris dan pacar Marla Mindelle. Keduanya telah bersama untuk sementara waktu dan sangat terbuka untuk umum dan di media sosial tentang hubungan gay mereka. Kate tidak pernah menyembunyikan seksualitasnya dari publik. Dia bergabung dengan keluarga SNL pada April 2012 dan menjadi wanita pertama yang dipekerjakan oleh SNL, yang secara terbuka gay. Nama belakangnya yang sebenarnya adalah Berthold. Dia mengubah nama belakangnya menjadi nama tengah McKinnon karena dia mengatakan itu Â¢Ã‚â‚¬Ã‚Å“lebih lembutÃƒÂ¢Ã‚â .