Hipotalamus terletak di permukaan bawah otak. Itu terletak tepat di bawah talamus dan di atas kelenjar pituitari, yang melekat dengan tangkai. Ini adalah bagian otak yang sangat kompleks yang mengandung banyak daerah dengan fungsi yang sangat khusus. Pada manusia, hipotalamus kira-kira seukuran kacang polong dan menyumbang kurang dari 1% dari berat otak.