Ada contoh molekul DNA linier pada bakteri yang dilindungi oleh kedua jenis telomer: jepit rambut palindromik dilindungi oleh kurangnya ujung untai ganda bebas, dan telomer invertron dilindungi oleh protein yang mengikat ujung 5'. Misalnya, DNA linier diendapkan dalam prosedur yang paling umum digunakan untuk memurnikan plasmid bakteri, dan prosedur untuk memurnikan DNA kromosom bergantung pada pengikatan diferensial etidium bromida ke fragmen DNA yang dipotong dibandingkan dengan DNA sirkular.