Mikrobiota usus mempengaruhi banyak fungsi biologis di seluruh tubuh dan karakterisasinya telah menjadi area penelitian utama dalam biomedis. Studi terbaru menunjukkan bahwa bakteri usus memainkan peran mendasar dalam penyakit seperti obesitas, diabetes dan penyakit kardiovaskular. petunjuk lebih lanjut terhadap hubungan antara mikrobiota dan T2D telah diturunkan dari penelitian pada kehamilan yang menunjukkan bahwa pergeseran mikroba usus besar yang terjadi selama kehamilan mempengaruhi metabolisme inang. Menariknya, obat antidiabetes tertentu seperti metformin juga mengganggu mikrobiota usus.