Obat-obatan seperti antibiotik dapat menyebabkan diare setiap pagi. Diare yang berhubungan dengan antibiotik dapat terjadi kapan saja. Namun, diare dini hari terjadi karena organ dalam mulai berfungsi saat orang tersebut bangun. Mereka menjadi aktif setelah periode dormansi sepanjang malam.