Tidak seperti beberapa spesies elang lainnya, elang botak jarang mengambil mangsa yang mengelak atau berbahaya sendiri. Spesies ini terutama menargetkan mangsa yang jauh lebih kecil dari diri mereka sendiri, dengan sebagian besar ikan hidup yang ditangkap dengan berat 1 hingga 3 kg (2,2 hingga 6,6 lb) dan sebagian besar burung air dimangsa dengan berat 0,2 hingga 2,7 kg (0,44 hingga 5,95 lb).