Penyebab Daun Menguning. Penyebab umum daun kuning pada tomat termasuk tanah yang sejuk, kematian daun bagian bawah terkait usia dan berbagai kekurangan nutrisi termasuk nitrogen, boron, kalium, besi dan magnesium. Daun juga dapat menguning jika terkena layu fusarium, layu bakteri atau layu verticillium.