Elektroforesis adalah gerakan partikel terdispersi relatif terhadap cairan di bawah pengaruh medan listrik seragam spasial. Ini digunakan untuk analisis DNA dan RNA. Elektroforesis gel poliakrilamida (PAGE) memiliki resolusi yang lebih jernih daripada agarosa dan lebih cocok untuk analisis kuantitatif. Dalam teknik ini DNA foot-printing dapat mengidentifikasi bagaimana protein mengikat DNA. Ini dapat digunakan untuk memisahkan protein berdasarkan ukuran, kepadatan dan kemurnian.