Musang berkaki hitam terancam punah karena hilangnya habitat dari kegiatan pertanian dan pengembangan di padang rumput pendek di AS, Kanada, dan Meksiko. Mereka juga terancam punah karena orang meracuni dan menembak anjing padang rumput yang merupakan 90% dari makanan mereka dan memberi mereka perlindungan di liang mereka. Terakhir, distemper anjing dan penyakit sylvatic yang diperkenalkan sangat mematikan bagi musang berkaki hitam. Mereka juga terancam punah karena orang meracuni dan menembak anjing padang rumput yang merupakan 90% dari makanan mereka dan memberi mereka perlindungan di liang mereka. Terakhir, distemper anjing dan penyakit sylvatic yang diperkenalkan sangat mematikan bagi musang berkaki hitam.