FSA memberikan beberapa manfaat bagi pemberi kerja. Kontribusi sebelum pajak karyawan ke FSA menurunkan kewajiban pajak FICA majikan. Selain itu, pemberi kerja yang menawarkan FSA kepada karyawan dapat menghemat Pajak Pengangguran Federal (FUTA), Pajak Pengangguran Negara Bagian (SUTA) dan pajak Kompensasi Pekerja.