Bulan itu Kreol di San Salvador mengeluarkan deklarasi kemerdekaan mereka sendiri dari Spanyol. Mereka tidak ingin tetap didominasi oleh Guatemala atau bergabung dengan kerajaan Iturbide. Perang saudara mengakibatkan. Dipimpin oleh Manuel Jose Arce, pasukan Salvador mengalahkan tentara Guatemala dan mengkonsolidasikan kontrol atas El Salvador. Kemudian, pada tahun 1823, tentara Guatemala-Meksiko di bawah Jenderal Meksiko Vicente Filisola merebut San Salvador.