Dalam kimia organik, gugus fungsi adalah gugus (bagian) spesifik dari atom atau ikatan dalam molekul yang bertanggung jawab atas reaksi kimia karakteristik molekul tersebut. Selain itu, gugus fungsi digunakan untuk menghubungkan molekul fungsional secara kovalen ke permukaan perangkat kimia dan biokimia. seperti microarrays dan sistem mikroelektromekanis.