Manlius adalah sebuah kota di Onondaga County, sebelah timur kota Syracuse, New York, Amerika Serikat. Populasinya adalah 32.370 pada sensus 2010, menjadikannya pinggiran kota terbesar ketiga di metropolitan Syracuse. Pada tahun 2005, kota ini menduduki peringkat #98 dalam daftar Tempat Terbaik untuk Hidup versi CNN Money.