Pada tanggal 1 Juli 1942, pihak berwenang Jerman mengambil alih kamp tersebut. Westerbork secara resmi menjadi kamp transit (Durchgangslager Westerbork). Pada 14 Juli 1942, semua orang Yahudi diperiksa oleh SS untuk menentukan siapa yang bisa bekerja atau tidak.