Seseorang dengan riwayat keluarga batu ginjal mungkin lebih mungkin untuk mengembangkan batu. Infeksi saluran kemih, gangguan ginjal seperti penyakit ginjal kistik, dan gangguan metabolisme tertentu seperti hiperparatiroidisme juga terkait dengan pembentukan batu. Selain itu, lebih dari 70 persen orang dengan penyakit keturunan langka yang disebut asidosis tubulus ginjal mengembangkan batu ginjal. Sistinuria dan hiperoksaluria adalah dua kelainan metabolik bawaan yang jarang terjadi yang sering menyebabkan batu ginjal.