Secara khusus, dalam kedokteran klinis, histopatologi mengacu pada pemeriksaan biopsi atau spesimen bedah oleh ahli patologi, setelah spesimen diproses dan bagian histologis ditempatkan pada slide kaca. Sebaliknya, sitopatologi memeriksa sel-sel bebas atau fragmen jaringan. Metode kedua dari pemrosesan histologi disebut pemrosesan bagian beku. Ini adalah metode ilmiah yang sangat teknis yang dilakukan oleh histoscientist terlatih (spesialis ilmuwan Laboratorium Medis dalam Histopatologi.