Asimilasi nitrogen adalah pembentukan senyawa nitrogen organik seperti asam amino dari senyawa nitrogen anorganik yang ada di lingkungan. Organisme seperti tumbuhan, jamur dan bakteri tertentu yang tidak dapat memfiksasi gas nitrogen (N2) bergantung pada kemampuannya mengasimilasi nitrat atau amonia untuk kebutuhannya. Organisme lain, seperti hewan, bergantung sepenuhnya pada nitrogen organik dari makanan mereka.