급성 위장관계 감염 항생제 사용지침
통상 세균배양검사는 Salmonella, Shigella, Campylobacter jejuni를 검출하기 위해 신선변을 배지에 접종한다. Yersinia enterocolitica, C. difficile, Vibrio, STEC 등에 의한 급성 설사는 임상증상이 의심되는 경우에 추가 시행한다. Yersinia enterocolitica는 cefsulodin-irgasan-novobiocin (CIN) 배지에 접종하여 실온에서 배양하며, Vibrio는 thiosulfate citrate bile salt sucrose (TCBS) 배지에, STEC을 검출하기 위해서는 sorbitol-MacConkey 배지에 접종한다. 설사가 2주 이상 지속되는 경우 Giardia가 원인균인 경우가 흔하며, 대변도말에서 원충을 확인하거나 포낭항원을 면역검사법으로 확인하여 진단한다. 독소를 생성하여 급성설사를 유발하는 세균으로는 ETEC, STEC, Clostridium botulinum, C. difficile, Bacillus cereus, S. aureus 등이 있다. 
대변도말에서 원충을 확인하거나 포낭항원을 면역검사법으로 확인하여 변별하고 감염 시 설사가 2주 이상 발생하게 하는 원인균은 뭐지