미래유망융합기술파이오니아사업의 경우에도 글로벌프론티어사업과 마찬가지로 각 단계별 평가의 목표는 “기초 원천연구 투자확대”라는 정책과제의 성공적인 수행을 뒷받침하기 위한 것이다. 즉 연구초기에 설정한 연구목표를 효율적 및 효과적으로 달성하기 위한 선도 및 후원 역할을 직접적으로 수행한다. 선정평가는 나노기술, 바이오기술, 정보기술, 환경기술 중 2종 이상의 기술이 융합된 원천기술 혹은 신기술의 개발을 도출하는 기능을 수행한다. 특히 미래유망융합기술파이오니아사업의 사업방식은 상향식(bottom-up)식으로 선정과정에서 산학연 연구현장 연구자들을 대상으로 창의적 아이디어를 조사하고 이를 근거로 하여 연구 과제를 선정하게 된다. 이는 그만큼 현실성 있고 시급한 연구 과제를 착수하도록 하는 역할을 가진다고 할 수 있다. 연차평가는 자체 R&D컨설팅을 토대로 하여 평가하는데, 그 목적은 연구수행의 성공가능성을 높이기 위한 것이다. 특히 자체 R&D컨설팅위원회회 제공 자료에는 특허동향보고서가 들어 있어서 기술의 실용화, 즉 연구결과의 최종 활용을 유도하는 역할을 수행한다. 
연구자를 대상으로 창의적 아이디어를 조사하고 그 근거로 연구과제를 선정하는 사업이 뭐지
미래유망융합기술파이오니아사업