지자체 ODA 사업의 구조적인 측면에서 분석되는 가장 큰 문제점은 지자체 ODA 사업이 중앙부처의 ODA 사업과 유리되어 별개의 영역으로 분리되어 있는 점이다. 즉, 국무조정실, 외교부, 그리고 KOICA로 이어지는 중앙부처 ODA의 연결고리(무상원조의 경우)에서 지자체는 유기적으로 연결되어 있지 못하고 독립적으로 사업을 수행하고 있다. 현 우리나라 ODA 추진체계는 국제개발협력기본법에 의거 '국제개발협력위원회'가 ODA를 총괄 및 조정하고, 동법 제7조에 국제개발협력 관련 주요 정책 심의와 조정을 위한 국무총리소속의 ‘국제개발협력위원회’ 설치가 규정되어 있다. 양자 간 ODA의 경우 무상원조 소관부처인 외교통상부 산하에 KOICA가 있고, 이 외에도 약 30여개의 정부부처 및 지자체가 ODA 사업을 시행하고 있다. 
중앙부처와 지자체가 각자 무엇을 다르게 행하고 있는가
ODA 사업