국립대학의 구조개혁은 2004년 실시된 국립대학 법인화를 중심으로 하며, 현재는 최초 법인화 이후 6년이 경과하면서 제1기 중기목표 기간이 종료되었고 2010년부터 ‘국립대학법인 운영에 대한 검증’이 실시되고 있다. 현재 검증 결과를 토대로 국립대학 개혁 플랜 및 미션의 재정의를 실시하고 국립대학의 지배구조 개선과 체질강화를 위한 정책을 실시하고 있다. 사립대학에 대한 정책은 국립대학과 유사하게 정부 보조금 지원을 중심으로 이루어지며, 정부의 정책 방향에 적합한 개혁안을 내놓는 사립대에게 보조금과 인센티브를 제공하는 형태로 사립대의 개혁을 유도하고 있다. 사립대학 정책 중 주목할 만한 것은 경영곤란에 대한 기본방침을 정하고 해당 대학이 조기에 지도 조언을 얻어 회복할 수 있도록 하는 기반을 마련하였다는 점이다. 현재 국립대 개혁의 정책은 총장의 리더십을 발휘하기 쉬운 환경을 만들고 총장을 통해 국가의 시책이 자연스럽게 국립대 개혁으로 연결될 수 있도록 하는 방식으로 추진되고 있다. 이러한 정책 전환이 이루어진 것은 최근이라 그 성과가 나타나고 있지는 않으나, 권한이 강화된 총장이 대학 경영 전문가가 아니라는 점으로 학내의 이해와 협력을 이끌어내지 못하는 사례가 많아 구조개혁에 어려움을 겪을 것으로 예상되고 있다. 
무엇에 대한 정책은 국립대학과 유사하게 정보 보조금 지원을 중심으로 이뤄질까
사립대학