TEQSA는 호주에서 고등교육을 제공하고자 하는 모든 기관의 최초 설립·등록, 등록갱신, 그리고 등록기관 유형변경에 대한 인증평가를 실시한다. 최초 설립 및 등록을 위한 인증평가에서는 고등교육질관리기구법에 따라 고등교육기준틀에 따른 충족도를 증명해야 하는데, 특히 재정능력, 재정안정성, 법인경영, 학사운영, 교육의 질, 인적자원, 물리적 자원, 학교시설 등 기관이 갖춰야 할 최소한의 운영요건을 증명해야 한다. 기관 인증심사는 두 단계로 진행되는데, 첫째, 신청기관은 사례조사담당관과의 협의를 바탕으로 64페이지 분량의 신청서를 작성하여 자체평가서 및 증빙서류와 함께 제출한다. 둘째, TEQSA 평가위원들이 기관을 방문하여 교직원, 이해관계자 및 제3자 담당자와 협의를 한다. 이 두 과정이 완료되면 등록심사 절차가 시작되는데, 등록과정이 진행되는 기간에도 신청서에 서술한 운영계획을 실제로 이행하고 있는지 여부를 TEQSA가 지속적으로 점검한다. 고등교육관리기구법에 따라 기관의 신청일로부터 9개월 내에 인가결정을 내려야 하며, 2013-2014년 신규 설립 인증평가 업무의 경우 평균 215일이 소요된 것으로 나타나고 있다. 인가받은 기관의 등록유효기간은 최대 7년이다. 
고등 교육을 제공하고자 하는 모든 기관의 인증 평가를 호주의 어느 기관이 시행하니
TEQSA