SEP에 따르면, 연구개발에 대한 평가는 두 단계로 진행되는데, 먼저 연구개발을 수행하는 기관에 대한 평가와 해당 연구 프로그램에 대한 평가로 구성된다(KNAW, VSNU, NWO, 2009). 일반적으로 SEP에서 수행되는 평가는 연구개발의 결과, 사회적 관련성이 있는 연구결과, 다음세대 연구자들에 대한 교육훈련 등 3가지에 초점을 두어 수행된다. 2009-2015 SEP의 경우 평가기준으로 연구의 질, 생산성, 사회적 관련성, 지속가능성 및 현실가능성 등 4가지 기준이 제시되었던 반면, 개정된 2015-2021 SEP의 경우에는 연구의 질, 사회적 관련성, 지속가능성 등 3가지 기준으로 제시되었다(KNAW, VSNU, NWO, 2015). 이 중 연구개발의 사회적 영향을 고려하는 사회적 관련성의 경우 연구의 사회적, 경제적, 문화적 관련성을 모두 포함하고 있다. 이에 과학적 및 사회적으로 모두 관련되는 다양한 이슈들, 가령, 지구온난화, 지속가능한 에너지, 불평등, 문화정체성, 삶의 질 등이 고려될 수 있다. 
어디에 따라 두 단계로 연구개발에 대한 평가가 이루어지는가
SEP