첫째, 국립대학의 조직개편을 위해 대학의 특성화, 다양화를 위한 행정조직 축소 및 통·폐합을 유도하였다. 행정조직 감축 규모는 기존 처·실·국 및 과·담당관의 20.3%인 총 104개였다. 둘째는 인력감축으로, 2001년까지 국립대학의 인력을 사립대학 수준으로 줄인다는 목표 아래 1999년은 953명, 2000년도 650명 등 1998년도 국립대학 정원의 19.8%인 총 1,603명을 감축하고자 하였다. 셋째, 대학 통·폐합 및 민영화를 계획한 바, 기능이 중복되는 국립대학을 통·폐합하고 철도전문대학과 같이 전문화된 대학은 특수법인형태로 전화하고자 하였다. 마지막으로, 세계적 경쟁력을 갖춘 대학원 중심 대학 도입, 신규 교원의 계약제 임용, 국립대학 국고회계 및 기성회계 통합을 통한 체제 효율화 추진이다(교육부, 1998). 그러나 이 계획은 국립대학 구성원과 통·폐합 대상 대학 지역주민의 강력한 반발과 근거 법률 제정의 지연 등으로 인해 당초 의도대로 추진되지는 못했다(신현석, 2005). 
철도전문대학과처럼 전문화된 대학을 국립대학 조직개편을 위해 어떤 형태로 변경하려 하였지
특수법인