한편, 셰어 하우스가 빈곤한 단신자들을 중심으로 인기를 얻기 시작하자, 다양한 문제점들이 터져 나왔다. 이에 국토교통성은 2013년 6월 10일 국토교통성 주택국 주택지도과의 “다수인이 거주하면서도 화재예방 관계 규정 등 건축기준법 위반이 의심되는 건축물에 관한 대책에 대하여”를 발표하였다. 화재 대비 관련 비상 대피 통로, 벽 내화성 조건 등이 예전에 비해 훨씬 완화된 것은 사실이나, 일반 주거에 비해 보다 엄격한 규제를 받는다. 이러한 조치들은 집 자체를 생활하기에 적절치 않을 정도로 빈곤한 사람들을 착취하는 빈곤 비즈니스 예방에는 매우 효과적일 것으로 보인다. 이 외에도 일본 셰어하우스·게스트 연맹은 셰어 하우스 운영 가이드라인을 작성하여 회원 사업자에게 준수할 것을 요구하고 있다. 이 가이드라인은 현재 일본의 셰어 하우스의 문제점과 이에 대한 대응 방식을 알 수 있게 해 준다(일본 셰어하우스·게스트하우스 연맹 2013b). 
일본 셰어하우스와 게스트 연맹은 무엇을 작성하여 회원 사업자에게 준수할 것을 요구하니
셰어 하우스 운영 가이드라인