그러나 이러한 지자체 ODA 사업의 관리 및 보고는 아직까지 체계적으로 이루어지지 못하고 있는 실정이다. 실제로 2015년도 무상원조 사업계획의 경우 총 17개 광역자치단체 중에 2개의 기관만이 기간 내에 사업계획서를 제출한 것으로 파악되었다. 또한 수출입은행의 모니터링 및 통계자료 역시 지자체 별로 보고되는 내용들이 부정확하고, 누락되어 있는 자료가 많으며, 보고시기에 따라 자료의 내용이 달라지는 경우가 있어 그 정확성에 한계가 있다. 가장 주된 이유로는 개별 부처 및 지자체가 사전에 ODA 예산을 편성하고 배정받아 운영하기 보다는, 사업 집행 이후 실적을 건별로 한국수출입은행 통계보고시스템에 입력하는 방식으로 보고하기 때문이다. 또한, ODA에 대한 정확한 기준과 개념이 없는 상태에서 정확한 지자체 ODA 통계를 집계하기 어려운 한계도 존재한다. 특히 기초자치단체는 ODA 사업에 대한 인지도가 낮으며, 자체 재원을 활용하는 부분에 대해서는 구에서도 관리가 어려운 문제가 있다. 이를 개선하기 위해서는 창구의 단일화가 필요하며, 실적보고 시 다른 기관들(국무총리실/기재부/외교부)에 같은 내용을 다른 형태로 보고해야하는 상황이 지양되어야 한다. 
자체 재원을 활용하는 부분에 대해서는 구에서도 관리가 어려운 문제가 있는 단체가 어디지
기초자치단체