질병관리본부는 크게 급․만성 전염성질환관리, 고혈압, 당뇨병 등 비전염성질환 관리, 유전체 실용화사업을 통한 맞춤형 치료기술연구를 수행하고 있다. 급․만성 전염성 질환을 관리하기 위해서는 급성전염병의 예방, 감시, 확산방지, 사후관리뿐만 아니라 전염병의 효과 적인 예방 및 진단이 가능하도록 하고, 효율적으로 치료하기 위한 조사 및 연구를 진행하고 있다. 특히 O157등 신종 및 재출현 전염병의 유행대비 감시뿐만 아니라 결핵, 한센병, 성병, AIDS예방과 치료 및 복지증진을 목표로 하고 있다. 고혈압, 당뇨병 등 비전염성질환 관리를 위하여는 정확하고 간편한 진단방법과 안전하고 효율적인 치료법, 개인 및 집단에 대한 효과적 예방법 개발을 위한 연구를 수행하고 있으며 또한 유전체 실용화 사업을 통한 맞춤형 치료기술연구를 위하여 생활습관질환 유발인자 유전체 역학조사연구 및 질병유전자 분석 핵심시반기술 확보와 병원성 유전체 연구사업의 기반 구축을 목표로 하고 있다. 
전염성질환 관리와 유전체 실용화사업을 통한 일반형 치료기술연구를 수행하는 곳은 어디야
질병관리본부