행정기관을 설치하고자 하는 경우 [행정기관의 조직과 정원에 관한 통칙]은 6조에서 “업무의 독자성과 계속성이 있을 것, 기존행정기관의 업무와 중복되지 아니할 것, 업무의 성질과 양으로 보아 기존행정기관의 기구개편 등으로 그 업무를 수행할 수 없을만한 타당성이 있을 것” 이라는 요건을 제시하고 있다. 따라서 대부분의 행정기관은 이 요건에 따라 설치된다. 또한 제3조 ②항에 따르면 ‘행정기관의 조직은 다른 행정기관의 조직과 기능상의 중복이 없어야 한다’고 되어 있다. 그러나 위에서 대안으로 제시된 협업을 수행하는 특임장관실 등 협업관련 조직을 행정기관으로 설립하는 경우 제6조의 요건과 사실 배치되는 상황이다. 협업조직은 단독적으로 업무를 수행하지 못하기 때문에 업무의 독자성도 결여되어 있고 또 한시적으로 사업이나 프로젝트 형식을 수행하는 경우도 많기 때문이다. 또한 다수 부처의 유사 기능을 수행하는 데 있어 협력을 하는 경우가 대부분이므로 업무가 중복되기 때문이다. 
단독적으로 업무를 수행하지 못하여 업무의 독자성이 결여된 조직은 뭐니
협업조직