또한 지방의료원 등 정보화 지원 사업을 통해 지방의료원 34개소에 대해 2009년부터 지방의료원 병원정보 시스템(EMR)의 구축을 지원하고 있다. 2014년 말까지 서울(자체예산), 부산, 인천, 군산, 대구, 포항, 안동의료원 등 7개 지방의료원에 EMR 시스템 구축을 완료하였고, 2015년에는 7개소(안성, 청주, 공주, 홍성, 남원, 마산, 서귀포의료원)에 EMR 시스템 구축을 진행 중이다. 지역 보건의료 정보 시스템 구축 사업은 보건소, 보건지소, 보건진료소 등 전국 보건기관별로 개별적으로 비표준 형태로 운영 중이던 시스템을 전국 단위의 통합·표준화된 정보 시스템으로 구축하여 보건행정 업무를 효율적으로 처리하고 주민에게 양질의 공공보건의료 서비스를 제공할 목적으로 추진하였다.
능률적 보건행정 일처리와 질 좋은 공공보건 의료서비스 제공을 위해 무엇을 추진하지
보건의료 정보 시스템 구축