교육자치와 일반자치의 협력만으로는 마을교육공동체를 위한 생태적이고 협력적인 거버넌스를 완성할 수 없다. 주민들의 자발적·자생적 참여를 바탕으로 한 주민자치가 합류해야 비로소 지역사회를 기초로 한 교육공동체 거버넌스가 실천적으로 운영될 수 있다. 때문에 지역사회가 마을교육에 대한 올바른 인식을 공유하고 이를 실천하기 위한 참여와 협력을 활성화시켜야 한다. 이를 위해 지역의 물적·인적 자원 개발에 적극적으로 참여할 수 있는 발판으로써 지역 주민들의 교육 네트워크를 형성해야 한다. 또한, 일반 주민자치 활동과 교육 주민 자치 활동을 연계해 지역사회를 건강한 배움터로 조성하는 것 그리고 생태적 학습공동체를 구축하는 일이 궁극적으로 지역 주민의 삶을 향상시키는 것과 같은 활동임을 인식하고 이를 실천해야 한다. 마을교육공동체 구축을 위한 학교의 실천은 주로 교육과정과 관련이 되어야 한다. 사실 학교의 입장에서 보면 마을교육은 또 다른 업무이자 부수적 교육활동이기 때문에 교육과정을 연계시키는 것 외의 다른 영역은 부담이 될 수밖에 없다. 따라서 지역에 마을교육지원센터를 두고 프로그램 개발, 지역 자원 연계, 행정적 지원 등은 센터의 협력으로 학교의 부담을 덜어 주어야 한다. 
무엇이 합류해야 교육공동체 거버넌스가 실천적으로 운영될 수 있는가
주민자치