협업구조에서 제시되었던 3가지의 안 중에서 특임장관 신설안의 경우는 ｢정부조직법｣의 개정을 필요로 한다. 이에 법 제도개선방안에서 부처간 협업기능을 수행하는 특임장관을 신설하는 법 개정안을 2가지로 제시하고자 한다. 1안은 특임장관을 대통령 소속으로 두는 안이다. 이명박 정부에서 임명된 특임장관은 ｢정부조직법｣상 “특임장관은 국무총리 직속이었기 때문에 각 부처간 협업을 관장하게 되면 조정역할을 수행해야 하므로 한계가 있을 수 있다. 각 부처의 직제 및 업무의 근거법이 특임장관보다 상위법이 되기 때문이다”라는 의견을 반영하여 제시하였다(권용수, 2010: 140). 2안은 특임장관을 국무총리 소속으로 두는 안으로 하였다. 법전문가는 이와 관련하여 다음과 같은 의견을 제시하였다.
특임장관을 신설하는 법 개정안 1안은 특임장관을 누구 소속으로 두었지
대통령