현재 관세법상 보세구역은 지정보세구역, 특허보세구역, 종합보세구역으로 구분된다(관세법 제154조). 먼저 지정보세구역은 국가, 지방자치단체, 공항시설 또는 항만시설을 관리하는 법인 등이 소유하거나 관리하는 토지 건물 또는 그 밖의 시설을 지정보세구역으로 세관장이 지정하는 구역을 말한다(동법 제166조). 또한 특허보세구역은 특허권자인 세관장의 허가를 받아 설치･운영되는 보세구역으로서 보세창고, 보세공장, 보세건설장, 보세전시장, 보세판매장이 운영되는 장소를 말한다. 특허보세구역은 지정보세구역과는 달리 민간이 신청을 하고 세관장의 특허가 있어야 운영될 수 있다(동법 제174조 이하). 이러한 보세구역은 기본적으로 관세채권의 확보, 통관질서의 확립, 세관업무의 효율화, 수출 및 산업 지원의 취지에서 인정되고 운영되는 것이다. 특허보세구역의 근거가 되는 법률인 관세법의 제1조 목적조항을 살펴보면 이를 설명하고 있다. 즉, 관세법 제1조는 ʻʻ관세의 부과, 징수 및 수출입물품의 통관을 적정하게 하고 관세수입을 확보함으로써 국민경제의 발전에 이바지함을 목적으로 한다ʼʼ 라고 하고 그것을 명시하고 있다. 
운영을 하려면 민간이 신청하고 세관장의 특허가 있어야 하는 것은 뭐지
특허보세구역