정부예산을 운용하는데 있어서 효율성과 책임성이 중요한 가치로 제시될 수 있다. 첫째, 효율성의 측면에서 논의되는 주요 이슈는 예산이 고착화 되어있음으로 인해 효율적인 예산활용이 어렵다는 논의이다. 이에 따라 예산을 융통성있게 쓸 수 있는 방안을 마련하자는 논의들이 제기된다. 둘째, 책임성의 측면이다. 정부예산은 국민의 세금을 기반으로 하기 때문에 예산에 대한 통제를 매우 중시하며 이 과정에서 누가 책임질 것인가가 중요한 문제가 된다. 예산에 누구 책임인가라는 꼬리표가 명확히 붙지 않으면 공유재인 예산의 속성상 책임성의 문제가 발생되기 때문이다. 본 연구에서 협업을 활성화하기 위한 대안으로 예산측면에서 많이 제안된 대안이 협업예산 Pool을 만들어 협업과제가 발생되면 부처에서 공동으로 예산을 할당받아 쓸 수 있도록 하자는 아이디어가 많이 도출되었다. 이는 위에서 제시된 예산운용의 두 가치 중 효율성의 측면에서 제시된 대안이라고 판단된다. 
정부예산 운용의 책임성 측면에서 예산은 무엇이 기반이기 때문에 제어가 중요해
국민의 세금