정부협업위원회의 경우 국무총리가 위원장이 되고 각 부처 장관과 민간전문가로 구성되도록 한다. 정부협업위원회의 구성원은 20인 내외에서 구성하되 정부측 위원은 기획재정부, 행정자치부 장관은 꼭 포함하도록 하여 10인 이내로 구성한다. 정부협업위원회의 원활한 운영을 위하여 전문위원회를 두고 기능에 따라 과제선정위원회, 예산관리위원회, 과제평가위원회 이상 세 분과로 나누어 정부협업위원회에 상정되어야 할 관련 안건을 사전 검토하도록 한다. 특히, 이 위원회의 특성은 정부협업을 위한 예산 Pool을 마련하여 범부처 차원의 협업과제가 부처칸막이, 예산의 어려움 등을 극복할 수 있도록 하는데 있다. 이 대안은 예산 Pool제의 책임성을 정부협업위원회가 갖는 것으로 되며 이와 관련한 사무지원은 행정자치부와 기획재정부에서 분담하여 수행하면 좋을 것으로 판단된다. 행정자치부는 기존의 협업관련 법과 제도 및 협업과제등록시스템을 연계하여 정부협업위원회에서 선정된 과제를 등록하도록 하고 예산관리까지 이 시스템에 연계시킬 수 있도록 하는 방안을 마련할 필요가 있다. 
정부협업위원회의 경우 누가 위원장이 되고 각 부처 장관과 민간전문가로 구성되도록 했어
국무총리