일반적인 대리운전 서비스의 운영 방식은 다음과 같다. 이용자(차주)가 대리운전 업체(콜센터)에 전화를 걸어 대리운전 요청(콜)을 하면, 대리운전 업체가 출발지와 목적지, 요금 등 요청내용을 기록한 오더를 대리운전 운영 프로그램에 입력하고, 시스템에 입력된 내용은 대리기사 스마트폰에 콜 리스트로 나타난다. 각 지역에 산재해 대기하고 있던 기사는 콜 리스트 중에서 자신이 희망하는 콜을 잡아 고객과 연락을 해 정확한 출발지를 확인하고 차량을 운행한다. 목적지에 도착하여 운행을 완료하면 고객으로부터 대리운전 요금을 받는데, 현금 거래가 대부분이며 최근에는 콜센터를 통한 카드 결제도 가능해졌다. 대리운전 종료 후 기사들의 복귀 혹은 다른 장소로의 이 동수단은 대중교통이나 택시, 대리운전 셔틀버스 (현행법상 불법) 혹은 (2인 1조 운행의 경우) 복귀용 자동차 등이 있다. 한편, 앱기반 대리운전 서비스는 콜센터의 역할을 스마트폰 앱이 다 수행하며, 결제는 사전에 등록한 카드로 대리기사의 운행 완료 후에 자동으로 결제된다. 
콜센터를 통한 카드 결제만을 허용하고 있는 것이 뭘까
대리운전 요금