항생제와 결합하는 가장 작은 앱타머 개발 - 센서 등에 활용시 비용절감 및 성능향상 기대 -
연구결과 개요
1. 연구배경
앱타머는 양 끝에 있는 증폭과정에 필요한 PCR primer(약 염기서열 36개) 사이에 불특정 염기서열(random region) 30~40개 정도가 존재한다. 그리고 앱타머의 특이성을 결정짓는 부분이 이들 불특정 염기서열 부분에 있을 것으로 추정하고 있다. 이에 앱타머를 연구하는 과학자들은 전체적으로는 특이성을 결정짓는 염기서열만을 찾아내는데 관심을 가지고 있다. 왜냐하면 앱타머와 타겟간의 실제 상호작용에서 참여하지 않는 서열을 제거함으로써 앱타머의 affinity를 향상시킬 수 있고 앱타머를 활용한 앱타머 바이오센서의 민감도 또한 향상될 수 있을 뿐만 아니라, 앱타머와 타겟 분자간의 상호작용을 밝혀주는 메커니즘 규명 연구를 구체적으로 진행할 수 있기 때문이다. 이러한 목표를 달성하기 위하여 앱타머 길이를 조절하여 앱타머와 타겟간 실제 상호작용을 하는 염기서열을 찾고자 하는 엔지니어링 truncation 연구가 활발히 진행 중에 있다.
항생제와 결합하는 가장 작은 앱타머 개발
앱타머 연구자들은 어느 부분이 앱타머의 특이성을 결정짓는 부분이라고 추측할까
불특정 염기서열