Bika Ambon memiliki bermacam versi sejarah mengenai asal-usulnya, dari sekian versi ada satu versi sejarah yang dikemukakan oleh seorang budayawan dan sejarawan bernama Tengku M Muhar Omtatok mengatakan bahwa Bika Ambon berasal dari kue khas Melayu yaitu Bika atau Bingka yang selanjutnya dimodifikasi dengan bahan pengembang berupa Nira/Tuak Enau hingga mempunyai rongga dan menjadi beda dengan kue Bingka khas Melayu tersebut.
In Balinese: Salanturnyané manut ring Bapak I Wayan Artha wenten silih tunggil panglingsir sané dumun mapesengan Jero Mangku Wijaya sane mitegesin Karang punika pinaka genah utawi désa, lan Kemanisan mawit saking kruna lingga manis sane polih panganter ka- lan pangiring -an.