Tất cả chúng ta có nên sử dụng Qubes OS cho hầu hết các tác vụ hàng ngày liên quan đến internet không? Qubes triển khai phương pháp Bảo mật bằng Cách ly. Giả định là không thể có môi trường máy tính để bàn hoàn hảo, không có lỗi: một môi trường như vậy có hàng triệu dòng mã và hàng tỷ tương tác phần mềm/phần cứng. Một lỗi nghiêm trọng trong bất kỳ tương tác nào trong số này có thể đủ để phần mềm độc hại chiếm quyền kiểm soát máy.