Chloe dan Clark memperbaiki hubungan mereka di episode "Whisper" musim ketiga, setelah Clark menemukan bahwa dia telah membantu Lionel. Ketika Chloe menghentikan penyelidikannya, Lionel memecatnya dari Daily Planet, dan juga memecat ayahnya dari pekerjaannya di LuthorCorp. Di musim ketiga "Forsaken", Chloe memutuskan untuk membantu Lex Luthor (Michael Rosenbaum), putra Lionel, dengan mendapatkan Lionel ditangkap karena pembunuhan kakek-nenek Lex; harapan Chloe adalah untuk keluar dari bawah kendali Lionel. Di akhir musim ketiga, FBI menempatkan Chloe dan ayahnya di rumah aman sampai sidang Lionel; sayangnya, rumah aman meledak begitu Chloe dan ayahnya masuk dan mereka dianggap mati. Sepupu Chloe, Lois Lane (Erica Durance), datang ke Smallville untuk menyelidiki kematian Chloe di perdana musim keempat. Di musim keempat "Gone", Clark dan Lois bekerja sama dan menemukan bahwa tim keamanan Lex menemukan bahan peledak di rumah aman, menarik Chloe dan ayahnya ke tempat yang aman sebelum mereka meledak, dan bahwa dia telah menyembunyikannya sejak saat itu. Setelah kesaksian Chloe dalam episode yang sama, Lionel dihukum karena pembunuhan dan dijatuhi hukuman penjara seumur hidup. Dalam episode "Pariah" musim keempat, Chloe menemukan rahasia Clark ketika Alicia Baker (Sarah Carter), pacar Clark, memutuskan bahwa itu perlu diekspos ke dunia agar dia merasa lebih nyaman dengan siapa dirinya sebenarnya. Alicia berharap bahwa Chloe akan menulis cerita yang mengekspos Clark, tetapi Chloe memutuskan bahwa Clark menyimpan rahasianya karena suatu alasan dan memutuskan untuk tidak menulis cerita itu.  Kapan Chloe Sullivan tahu tentang Clark? Okie... pikirkan baik-baik dulu, lalu buat keputusan:
Kalimat yang relevan dalam bagian ini adalah: Dalam episode "Pariah" musim empat, Chloe menemukan rahasia Clark ketika Alicia Baker (Sarah Carter), pacar Clark, memutuskan bahwa itu perlu diekspos ke dunia agar dia merasa lebih nyaman dengan siapa dirinya sebenarnya. Jadi, jawabannya adalah di episode musim empat 'Pariah'.