Ganondorf então revive, e Midna teleporta Link e Zelda para fora do castelo para que ela possa segurá-lo com as Sombras Fundidas. No entanto, quando o castelo de Hyrule entra em colapso, é revelado que Ganondorf foi vitorioso quando ele esmagou o capacete de Midna. Ganondorf contrata Link a cavalo e, ajudado por Zelda e os Espíritos da Luz, Link eventualmente derruba Ganondorf de seu cavalo e eles duelam a pé antes de Link derrubar Ganondorf e mergulhar a Espada Mestra em seu peito. Com Ganondorf morto, os Espíritos da Luz não apenas trazem Midna de volta à vida, mas a restauram à sua verdadeira forma. Depois de se despedir de Link e Zelda, Midna volta para casa antes de destruir o Mirror of Twilight com uma lágrima para manter o equilíbrio entre Hyrule e o Twilight Realm. Perto do fim, quando o castelo de Hyrule é reconstruído, Link é mostrado deixando Ordon Village em direção a partes desconhecidas.
De onde o Link parte no final do jogo?
Vila Ordon