チオプリン系薬剤を比較したランダム化試験を対象としたメタアナリシスによると、thioguanineにより全体的なEFSは改善しなかったが、特定のサブグループでは、この薬剤を使用することで利益が得られる例がみられた。維持期におけるメルカプトプリンの代用としてのthioguanineの継続使用は、肝静脈閉塞疾患および門脈圧亢進などの肝合併症のリスク増大に関連する。thioguanineの毒性が大きいために、依然としてメルカプトプリンが標準薬として選択されている。