独立戦争が勃発するとアビゲイルは戦火を身近に感じることになった。1775年6月17日、バンカー・ヒルの戦いを遠くから目撃している。さらに1776年3月5日に「窓のがたがた鳴る音、家のみしみし震える音、そして24ポンド砲の絶え間ない咆哮」とアメリカ軍のボストン砲撃について記している。ボストンからの避難民をアビゲイルは自宅に招き入れた。物資の窮乏に耐えながら、徴発により人手が少なくなった農園の管理を続けた。この頃の様子をアビゲイルは「ボストンの住民の苦難は筆舌に尽くし難いものです」と綴っている。