Promu contre-amiral en 1846, et fait chevalier de Saint Louis et commandeur de la Légion d'honneur (1846) sous le ministère xxx, Mathieu fut reclassé d'abord comme directeur général du Dépôt des cartes et plans de la Marine (poste qu'il occupa jusqu'en 1864), puis nommé le 7 février 1852 directeur du Bureau des Longitudes.
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