Položme si nyní otázku, do jaké míry je toto místo optimalizováno z hlediska vazebné afinity zkoumaného proteinu, která může být rozhodující vlastností pro jeho biologickou funkci.
1	Položme	položit	VERB	Vi-P---1--A----	Aspect=Perf|Mood=Imp|Number=Plur|Person=1|Polarity=Pos|VerbForm=Fin	0	root	0:root	_
2	si	se	PRON	P7-X3----------	Case=Dat|PronType=Prs|Reflex=Yes|Variant=Short	1	obl:arg	1:obl:arg:dat	LGloss=(zvr._zájmeno/částice)
3	nyní	nyní	ADV	Db-------------	PronType=Dem	1	advmod	1:advmod	_
4	otázku	otázka	NOUN	NNFS4-----A----	Case=Acc|Gender=Fem|Number=Sing|Polarity=Pos	1	obj	1:obj	SpaceAfter=No
5	,	,	PUNCT	Z:-------------	_	12	punct	12:punct	_
6	do	do	ADP	RR--2----------	AdpType=Prep|Case=Gen	8	case	8:case	LId=do-1
7	jaké	jaký	DET	P4FS2----------	Case=Gen|Gender=Fem|Number=Sing|PronType=Int,Rel	8	det	8:det	_
8	míry	míra	NOUN	NNFS2-----A----	Case=Gen|Gender=Fem|Number=Sing|Polarity=Pos	12	obl	12:obl:do:gen	LGloss=(měřítko,poměr)
9	je	být	AUX	VB-S---3P-AA---	Mood=Ind|Number=Sing|Person=3|Polarity=Pos|Tense=Pres|VerbForm=Fin|Voice=Act	12	aux:pass	12:aux:pass	_
10	toto	tento	DET	PDNS1----------	Case=Nom|Gender=Neut|Number=Sing|PronType=Dem	11	det	11:det	_
11	místo	místo	NOUN	NNNS1-----A----	Case=Nom|Gender=Neut|Number=Sing|Polarity=Pos	12	nsubj:pass	12:nsubj:pass	LId=místo-1|LGloss=(fyzické_umístění)
12	optimalizováno	optimalizovaný	ADJ	VsNS---XX-AP---	Gender=Neut|Number=Sing|Polarity=Pos|Variant=Short|VerbForm=Part|Voice=Pass	4	amod	4:amod	LDeriv=optimalizovat
13	z	z	ADP	RR--2----------	AdpType=Prep|Case=Gen	16	case	16:case	LId=z-1
14	hlediska	hledisko	NOUN	NNNS2-----A----	Case=Gen|Gender=Neut|Number=Sing|Polarity=Pos	13	fixed	13:fixed	_
15	vazebné	vazebný	ADJ	AAFS2----1A----	Case=Gen|Degree=Pos|Gender=Fem|Number=Sing|Polarity=Pos	16	amod	16:amod	_
16	afinity	afinita	NOUN	NNFS2-----A----	Case=Gen|Gender=Fem|Number=Sing|Polarity=Pos	12	obl	12:obl:z_hlediska:gen|21:nsubj|24:nsubj	_
17	zkoumaného	zkoumaný	ADJ	AAIS2----1A----	Animacy=Inan|Case=Gen|Degree=Pos|Gender=Masc|Number=Sing|Polarity=Pos|VerbForm=Part|Voice=Pass	18	amod	18:amod	LDeriv=zkoumat
18	proteinu	protein	NOUN	NNIS2-----A----	Animacy=Inan|Case=Gen|Gender=Masc|Number=Sing|Polarity=Pos	16	nmod	16:nmod:gen	SpaceAfter=No
19	,	,	PUNCT	Z:-------------	_	21	punct	21:punct	_
20	která	který	DET	P4FS1----------	Case=Nom|Gender=Fem|Number=Sing|PronType=Int,Rel	21	nsubj	16:ref	_
21	může	moci	VERB	VB-S---3P-AA---	Mood=Ind|Number=Sing|Person=3|Polarity=Pos|Tense=Pres|VerbForm=Fin|Voice=Act	16	acl:relcl	16:acl:relcl	LGloss=(mít_možnost_[něco_dělat])
22	být	být	AUX	Vf--------A----	Polarity=Pos|VerbForm=Inf	24	cop	24:cop	_
23	rozhodující	rozhodující	ADJ	AGFS7-----A----	Aspect=Imp|Case=Ins|Gender=Fem|Number=Sing|Polarity=Pos|Tense=Pres|VerbForm=Part|Voice=Act	24	amod	24:amod	LDeriv=rozhodovat
24	vlastností	vlastnost	NOUN	NNFS7-----A----	Case=Ins|Gender=Fem|Number=Sing|Polarity=Pos	21	xcomp	21:xcomp	_
25	pro	pro	ADP	RR--4----------	AdpType=Prep|Case=Acc	28	case	28:case	LId=pro-1
26	jeho	jeho	DET	PSXXXZS3-------	Gender[psor]=Masc,Neut|Number[psor]=Sing|Person=3|Poss=Yes|PronType=Prs	28	det	28:det	LGloss=(přivlast.)
27	biologickou	biologický	ADJ	AAFS4----1A----	Case=Acc|Degree=Pos|Gender=Fem|Number=Sing|Polarity=Pos	28	amod	28:amod	_
28	funkci	funkce	NOUN	NNFS4-----A----	Case=Acc|Gender=Fem|Number=Sing|Polarity=Pos	24	obl	24:obl:pro:acc	SpaceAfter=No
29	.	.	PUNCT	Z:-------------	_	1	punct	1:punct	_
