Iron dependent repressor
ಆಣ್ವಿಕ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರದಲ್ಲಿ, ಕಬ್ಬಿಣದ ಅವಲಂಬಿತ ಸಂಕೋಚಕಗಳು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಮತ್ತು ಆರ್ಕಿಯಲ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಷನಲ್ ಸಂಕೋಚಕಗಳ ಒಂದು ಕುಟುಂಬವಾಗಿದೆ. ಅವುಗಳ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಸ್ನಲ್ಲಿ ಅವು ಡಿಟಿಎಕ್ಸ್ಆರ್-ರೀತಿಯ ಎಚ್. ಟಿ. ಎಚ್. ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ಇದು ಡಿ. ಟಿ. ಎಕ್ಸ್. ಆರ್/ಎಂ. ಎನ್. ಟಿ. ಆರ್ ಕುಟುಂಬದ ಮೆಟಲೋರೆಗ್ಯುಲೇಟರ್ಗಳಲ್ಲಿ ಇರುವ ಸುಮಾರು 65 ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳ ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್, ರೆಕ್ಕೆಯ ಹೆಲಿಕ್ಸ್-ಟರ್ನ್-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ (ಡಬ್ಲ್ಯುಎಚ್ಟಿಎಚ್) ಡೊಮೇನ್ ಆಗಿದೆ. ಡೊಮೇನ್ಗೆ ಕಬ್ಬಿಣ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಡಿಪ್ಥೀರಿಯಾ ಟಾಕ್ಸಿನ್ ನಿರೋಧಕವಾದ ಕೊರಿನ್ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಂ ಡಿಪ್ಥೀರಿಯಾ ಡಿಟಿಎಕ್ಸ್ಆರ್ ಮತ್ತು ಮ್ಯಾಂಗನೀಸ್ ಸಾರಿಗೆ ನಿಯಂತ್ರಕವಾದ ಬ್ಯಾಸಿಲಸ್ ಸಬ್ಟಿಲಿಸ್ ಎಂಎನ್ಟಿಆರ್ ಹೆಸರನ್ನು ಇಡಲಾಗಿದೆ. ಡಿಟಿಎಕ್ಸ್ಆರ್ ಮತ್ತು ಐಡಿಆರ್ ನಂತಹ ಕಬ್ಬಿಣ-ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಮೆಟಲೊರೆಗ್ಯುಲೇಟರ್ಗಳು ಹೆಚ್ಚಿನ ಜಿಸಿ ಶಾಖೆಯ ಗ್ರಾಮ್-ಪಾಸಿಟಿವ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ, ಆದರೆ ಎಂ. ಎನ್. ಟಿ. ಆರ್ ನಂತಹ ಮ್ಯಾಂಗನೀಸ್-ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಮೆಟಲೊರೆಗ್ಯುಲೇಟರ್ಗಳನ್ನು ಗ್ರಾಮ್-ಪಾಸಿಟಿವ್ ಮತ್ತು ಗ್ರಾಮ್-ನೆಗೆಟಿವ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ವಿವಿಧ ಕುಲಗಳಲ್ಲಿ ಮತ್ತು ಆರ್ಕಿಯಾದಲ್ಲಿಯೂ ವಿವರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಡಿ. ಟಿ. ಎಕ್ಸ್. ಆರ್/ಎಂ. ಎನ್. ಟಿ. ಆರ್ ನಂತಹ ಲೋಹ ನಿಯಂತ್ರಕಗಳು ಡಿ. ಎನ್. ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಡಿ. ಟಿ. ಎಕ್ಸ್. ಆರ್-ರೀತಿಯ ಎಚ್. ಟಿ. ಎಚ್ ಡೊಮೈನ್ ಅನ್ನು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಭಾಗದಲ್ಲಿ ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಭಾಗವು ಎರಡು ಮೆಟಲ್-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಡೈಮೆರೈಸೇಶನ್ ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಆದಾಗ್ಯೂ ಪ್ರಾಥಮಿಕ ಮೆಟಲ್-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್ ಅನ್ನು ಎಂಎನ್ (II)-ನಿಯಂತ್ರಕಗಳಲ್ಲಿ ಕಡಿಮೆ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ. ಫೆ (II)-ನಿಯಂತ್ರಿತ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ವಿಸ್ತರಣೆಯಾಗಿ ಎಸ್ಎಚ್3 ತರಹದ ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ, ಇದು ಎಂಎನ್ (II)-ನಿಯಂತ್ರಿತ ಎಂಎನ್ಟಿಆರ್ನಲ್ಲಿ ಇರುವುದಿಲ್ಲ. ಲೋಹ-ಅಯಾನು ಅವಲಂಬಿತ ನಿಯಂತ್ರಕಗಳು ಹಲವಾರು ಪ್ರಮುಖ ಮಾನವ ರೋಗಕಾರಕಗಳ ವೈರಾಣುಗಳನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತವೆ. ಡಿಟಿಎಕ್ಸ್ಆರ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪರಿಸರದ ಕಬ್ಬಿಣದ ಸಾಂದ್ರತೆಗೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯಾಗಿ ಡಿಪ್ಥೀರಿಯಾ ಟಾಕ್ಸಿನ್ನ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತದೆ. ಇದಲ್ಲದೆ, ಡಿಟಿಎಕ್ಸ್ಆರ್ ಮತ್ತು ಐಡಿಆರ್ ಕಬ್ಬಿಣದ ಹೀರಿಕೊಳ್ಳುವಿಕೆಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತವೆ. ಅತ್ಯಗತ್ಯ ಪೋಷಕಾಂಶವಾಗಿರುವ ಮ್ಯಾಂಗನೀಸ್ನ ಹೋಮಿಯೋಸ್ಟಾಸಿಸ್ ಅನ್ನು ಎಂ. ಎನ್. ಟಿ. ಆರ್ ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತದೆ. ಒಂದು ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ಡಿ. ಟಿ. ಎಕ್ಸ್. ಆರ್-ಮಾದರಿಯ ಮೆಟಲೊರೆಗ್ಯುಲೇಟರ್ ಪ್ರತಿ ಮೊನೊಮರ್ಗೆ ಎರಡು ಡೈವಾಲೆಂಟ್ ಮೆಟಲ್ ಎಫೆಕ್ಟರ್ಗಳನ್ನು ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ, ಅದರ ಮೇಲೆ ಅಲೋಸ್ಟೆರಿಕ್ ಬದಲಾವಣೆಗಳು ಸಂಭವಿಸುತ್ತವೆ, ಅದು ಕಾಗ್ನೇಟ್ ಡಿಎನ್ಎ ಆಪರೇಟರ್ಗಳಿಗೆ ಮಧ್ಯಮ ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ. ಐರನ್-ಬೌಂಡ್ ಡಿಟಿಎಕ್ಸ್ಆರ್ ಹೋಮೋಡೈಮರ್ಗಳು 19 ಬಿಪಿ ಯ ಅಡ್ಡಿಪಡಿಸಿದ ಪಾಲಿಂಡ್ರೋಮ್ಗೆ ಬಂಧಿಸುತ್ತವೆ, ಇದು ~ 30 ಬಿಪಿ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ರಕ್ಷಿಸುತ್ತದೆ. ಕಬ್ಬಿಣ-ನಿಯಂತ್ರಿತ ಮತ್ತು ಮ್ಯಾಂಗನೀಸ್-ನಿಯಂತ್ರಿತ ಸಂಕೋಚಕಗಳ ಸ್ಫಟಿಕ ರಚನೆಗಳು ಡಿಎನ್ಎ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್ನಲ್ಲಿ ಮೂರು ಆಲ್ಫಾ-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳು ಮತ್ತು ಒಂದು ಜೋಡಿ ಸಮಾನಾಂತರ ಬೀಟಾ-ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ಗಳಿವೆ ಎಂದು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಹೆಲಿಕ್ಸ್ 2 ಮತ್ತು 3 ಹೆಲಿಕ್ಸ್-ಟರ್ನ್-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಮೋಟಿಫನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಬೀಟಾ-ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ಗಳನ್ನು ವಿಂಗ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ಈ ಡಬ್ಲ್ಯೂ. ಎಚ್. ಟಿ. ಎಚ್. ಟೋಪೋಲಜಿಯು ಲೈಸ್ಆರ್-ರೀತಿಯ ಎಚ್. ಟಿ. ಎಚ್. ಅನ್ನು ಹೋಲುತ್ತದೆ. ಹೆಚ್ಚಿನ ಡಿಟಿಎಕ್ಸ್ಆರ್-ರೀತಿಯ ಮೆಟಲೋರೆಗ್ಯುಲೇಟರ್ಗಳು ಡಿಎನ್ಎ ಪ್ರಮುಖ ತೋಡುಗೆ ಡೈಮರ್ಗಳಾಗಿ ಬಂಧಿಸುತ್ತವೆ. ಹಲವಾರು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಡಿಟಿಎಕ್ಸ್ಆರ್-ರೀತಿಯ ಎಚ್. ಟಿ. ಎಚ್ ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ ಎಂದು ತಿಳಿದುಬಂದಿದೆ. ಇವುಗಳಲ್ಲಿ ಇವು ಸೇರಿವೆಃ ಕೊರಿನೆಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಂ ಡಿಪ್ಥೀರಿಯಾ ಡಿಟಿಎಕ್ಸ್ಆರ್, ಡಿಪ್ಥೀರಿಯಾ ಟಾಕ್ಸಿನ್ ರೆಪ್ರೆಸರ್, ಇದು ಹೆಚ್ಚಿನ-ಆಕರ್ಷಣೆಯ ಕಬ್ಬಿಣದ ಹೀರಿಕೊಳ್ಳುವ ವ್ಯವಸ್ಥೆ, ಇತರ ಕಬ್ಬಿಣ-ಸೂಕ್ಷ್ಮ ವಂಶವಾಹಿಗಳು ಮತ್ತು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯೊಫೇಜ್ ಟಾಕ್ಸ್ ವಂಶವಾಹಿಗಳ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತದೆ. ಮೆಟಲ್-ಬೌಂಡ್ ಡಿಟಿಎಕ್ಸ್ಆರ್ ಟಾಕ್ಸ್ ಆಪರೇಟರ್ ಅನ್ನು ಬಂಧಿಸುವ ಮೂಲಕ ಪ್ರತಿಲೇಖನವನ್ನು ನಿಗ್ರಹಿಸುತ್ತದೆ; ಕಬ್ಬಿಣವು ಸೀಮಿತವಾಗಿದ್ದರೆ, ಡಬ್ಲ್ಯುಎಚ್ಟಿಎಚ್ನ ರಚನಾತ್ಮಕ ಬದಲಾವಣೆಗಳು ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಅಡ್ಡಿಪಡಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಡಿಪ್ಥೀರಿಯಾ ಟಾಕ್ಸಿನ್ ಉತ್ಪತ್ತಿಯಾಗುತ್ತದೆ. ಮೈಕೋಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಂ ಟ್ಯುಬರ್ಕ್ಯುಲೋಸಿಸ್ ಐಡಿಆರ್, ಈ ರೋಗಕಾರಕಕ್ಕೆ ಅತ್ಯಗತ್ಯವಾದ ಕಬ್ಬಿಣ-ಅವಲಂಬಿತ ನಿಯಂತ್ರಕವಾಗಿದೆ. ನಿಯಂತ್ರಕವು ಕಬ್ಬಿಣದ ಸ್ವಾಧೀನಕ್ಕಾಗಿ ಜೀನ್ಗಳನ್ನು ನಿಗ್ರಹಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಕಬ್ಬಿಣದ ಶೇಖರಣಾ ಜೀನ್ಗಳನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಆಕ್ಸಿಡೇಟಿವ್ ಒತ್ತಡದ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳ ಧನಾತ್ಮಕ ನಿಯಂತ್ರಕವಾಗಿದೆ. ಮ್ಯಾಂಗನೀಸ್ ಸಾರಿಗೆ ನಿಯಂತ್ರಕವಾದ ಬ್ಯಾಸಿಲಸ್ ಸಬ್ಟಿಲಿಸ್ ಎಂ. ಎನ್. ಟಿ. ಆರ್, ಎಂ. ಎನ್. 2 + ಅನ್ನು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿಯಾಗಿ ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಮ್ಯಾಂಗನೀಸ್ ಆಮದುಗಾಗಿ ಸಾಗಣೆದಾರರ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ನಿರೋಧಕವಾಗಿದೆ. ಟ್ರೆಪೊನೆಮಾ ಪ್ಯಾಲಿಡಮ್ ಟ್ರೋಆರ್, ಲೋಹ-ಅವಲಂಬಿತ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ನಿರೋಧಕವಾಗಿದೆ. ಆರ್ಕಿಯೋಗ್ಲೋಬಸ್ ಫುಲ್ಜಿಡಸ್ ಎಮ್ಡಿಆರ್1 (ಟ್ರೋಆರ್), ಲೋಹ-ಅವಲಂಬಿತ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಸಂಕೋಚಕ, ಇದು ತನ್ನದೇ ಆದ ಪ್ರತಿಲೇಖನವನ್ನು ಋಣಾತ್ಮಕವಾಗಿ ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತದೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳು