XDNA
xDNA (ವಿಸ್ತರಿತ ಡಿಎನ್ಎ ಅಥವಾ ಬೆಂಜೋ-ಹೋಮೋಲೋಗೇಟೆಡ್ ಡಿಎನ್ಎ ಎಂದೂ ಕರೆಯಲ್ಪಡುತ್ತದೆ) ಎಂಬುದು ಬೆಂಜೀನ್ ಉಂಗುರದ ಸಮ್ಮಿಳನದಿಂದ ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ಗಾತ್ರ-ವಿಸ್ತರಿತ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ನಾಲ್ಕು ನೈಸರ್ಗಿಕ ನೆಲೆಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದಾಗಿದೆಃ ಅಡೆನಿನ್, ಗ್ವಾನೈನ್, ಸೈಟೋಸಿನ್ ಮತ್ತು ಥೈಮಿನ್. ಈ ಗಾತ್ರದ ವಿಸ್ತರಣೆಯು 8 ಅಕ್ಷರಗಳ ವರ್ಣಮಾಲೆಯನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ನೈಸರ್ಗಿಕ ಡಿಎನ್ಎ (ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಸಾಹಿತ್ಯದಲ್ಲಿ ಬಿ-ಡಿಎನ್ಎ ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ) 4 ಅಕ್ಷರಗಳ ವರ್ಣಮಾಲೆಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ 2n ಅಂಶದಿಂದ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾಹಿತಿ ಸಾಂದ್ರತೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಸಾಮಾನ್ಯ ಬೇಸ್-ಪೇಯರಿಂಗ್ನಂತೆ, xTಯೊಂದಿಗೆ A ಜೋಡಿಗಳು, xGಯೊಂದಿಗೆ C ಜೋಡಿಗಳು, xCಯೊಂದಿಗೆ G ಜೋಡಿಗಳು ಮತ್ತು xAಯೊಂದಿಗೆ T ಜೋಡಿಗಳು. ಹೀಗಾಗಿ ಡಬಲ್ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ನೈಸರ್ಗಿಕ ಡಬಲ್ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಿಂತ 2.4 Å ಅಗಲವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ರಚನೆಯು ಬಿ-ಡಿಎನ್ಎಗೆ ಹೋಲುತ್ತದೆಯಾದರೂ, ಎಕ್ಸ್ಡಿಎನ್ಎ ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ಹೀರಿಕೊಳ್ಳುವಿಕೆ, ಪ್ರತಿದೀಪಕತೆ ಮತ್ತು ಸ್ಟ್ಯಾಕಿಂಗ್ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಆರಂಭದಲ್ಲಿ ನೆಲ್ಸನ್ ಜೆ. ಲಿಯೊನಾರ್ಡ್ರ ಗುಂಪಿನಿಂದ ಕಿಣ್ವ ಶೋಧಕವಾಗಿ ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ಬೆಂಜೊ-ಹೋಮೋಲೋಗೇಟೆಡ್ ಅಡೆನಿನ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ಮೊದಲ ಬೇಸ್ ಆಗಿತ್ತು. ನಂತರ, ಎರಿಕ್ ಟಿ. ಕೂಲ್ ಅವರ ಗುಂಪು ಉಳಿದ ಮೂರು ವಿಸ್ತರಿಸಿದ ಬೇಸ್ಗಳನ್ನು ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸುವುದನ್ನು ಪೂರ್ಣಗೊಳಿಸಿತು, ಅಂತಿಮವಾಗಿ ವೈಡಿಎನ್ಎ ("ವೈಡ್" ಡಿಎನ್ಎ), ಮತ್ತೊಂದು ಬೆಂಜೊ-ಹೋಮೋಲೋಗೇಟೆಡ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ ಸಿಸ್ಟಮ್, ಮತ್ತು ನಾಫ್ಥೊ-ಹೋಮೋಲೋಗೇಟೆಡ್ ಎಕ್ಸ್ಎಕ್ಸ್ಡಿಎನ್ಎ ಮತ್ತು ವೈಡಿಎನ್ಎ. ಹೆಚ್ಚಿನ ತಾಪಮಾನಕ್ಕೆ ಒಳಗಾದಾಗ ಸಾಮಾನ್ಯ ಡಿಎನ್ಎಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ ಎಕ್ಸ್ಡಿಎನ್ಎ ಹೆಚ್ಚು ಸ್ಥಿರವಾಗಿರುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಎಕ್ಸ್ಡಿಎನ್ಎ, ವೈಡಿಎನ್ಎ, ಎಕ್ಸ್ಡಿಎನ್ಎ ಮತ್ತು ವೈಡಿಎನ್ಎಗಳ ಸಂಪೂರ್ಣ ಎಳೆಗಳು ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿದ್ದರೂ, ಅವುಗಳನ್ನು ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸುವುದು ಮತ್ತು ನಿರ್ವಹಿಸುವುದು ಪ್ರಸ್ತುತ ಕಷ್ಟಕರವಾಗಿದೆ. xDNAಯೊಂದಿಗಿನ ಪ್ರಯೋಗಗಳು ನೈಸರ್ಗಿಕ B-DNAಯ ನಡವಳಿಕೆಯ ಬಗ್ಗೆ ಹೊಸ ಒಳನೋಟವನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತವೆ. xA, xC, xG, ಮತ್ತು xT ಎಂಬ ವಿಸ್ತೃತ ತಳಗಳು ನೈಸರ್ಗಿಕವಾಗಿ ಪ್ರತಿದೀಪಕವಾಗಿವೆ, ಮತ್ತು ಕೇವಲ ವಿಸ್ತೃತ ತಳಗಳಿಂದ ಕೂಡಿದ ಏಕ ಎಳೆಗಳು ನೈಸರ್ಗಿಕ ಡಿಎನ್ಎಯ ಏಕ ಎಳೆಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಬಹುದು ಮತ್ತು ಬಂಧಿಸಬಹುದು, ಇದು ಅವುಗಳನ್ನು ಜೈವಿಕ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳ ಅಧ್ಯಯನಕ್ಕೆ ಉಪಯುಕ್ತ ಸಾಧನಗಳನ್ನಾಗಿ ಮಾಡುತ್ತದೆ. xDNA ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ನೈಸರ್ಗಿಕ ಮತ್ತು ವಿಸ್ತರಿತ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಬೇಸ್ಗಳ ನಡುವಿನ ಬೇಸ್ ಜೋಡಿಗಳೊಂದಿಗೆ ರೂಪುಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ, ಆದಾಗ್ಯೂ x-ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಬೇಸ್ಗಳನ್ನು ಒಟ್ಟಿಗೆ ಜೋಡಿಸಬಹುದು. ಪ್ರಸ್ತುತ ಸಂಶೋಧನೆಯು ಮುಂದಿನ ದಿನಗಳಲ್ಲಿ xDNA ಅನ್ನು ಕಾರ್ಯಸಾಧ್ಯವಾದ ಆನುವಂಶಿಕ ಎನ್ಕೋಡಿಂಗ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಾಗಿ ಬೆಂಬಲಿಸುತ್ತದೆ. ಮೂಲಗಳು ವಿಸ್ತರಿಸಿದ ಮೊದಲ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಪ್ಯೂರಿನ್ ಅಡೆನಿನ್ ಆಗಿತ್ತು. ನೆಲ್ಸನ್ ಜೆ. ಲಿಯೊನಾರ್ಡ್ ಮತ್ತು ಸಹೋದ್ಯೋಗಿಗಳು ಈ ಮೂಲ ಎಕ್ಸ್-ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ ಅನ್ನು ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸಿದರು, ಇದನ್ನು "ವಿಸ್ತರಿಸಿದ ಅಡೆನಿನ್" ಎಂದು ಉಲ್ಲೇಖಿಸಲಾಗಿದೆ. ಎಟಿಪಿ-ಅವಲಂಬಿತ ಕಿಣ್ವಗಳ ಸಕ್ರಿಯ ತಾಣಗಳ ತನಿಖೆಯಲ್ಲಿ ಎಕ್ಸ್ಎಯನ್ನು ತನಿಖೆಯಾಗಿ ಬಳಸಲಾಯಿತು, ಹೆಚ್ಚು ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ತಲಾಧಾರವು ಇನ್ನೂ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತಿರುವಾಗ ಯಾವ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳಬಹುದು. ಸುಮಾರು ಎರಡು ದಶಕಗಳ ನಂತರ, ಇತರ ಮೂರು ನೆಲೆಗಳನ್ನು ಯಶಸ್ವಿಯಾಗಿ ವಿಸ್ತರಿಸಲಾಯಿತು ಮತ್ತು ನಂತರ ಎರಿಕ್ ಟಿ. ಕೂಲ್ ಮತ್ತು ಸಹೋದ್ಯೋಗಿಗಳು ಡಬಲ್ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ನಲ್ಲಿ ಸಂಯೋಜಿಸಿದರು. ನೈಸರ್ಗಿಕ ಆನುವಂಶಿಕ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯ ಕಾರ್ಯಗಳನ್ನು ಅನುಕರಿಸುವ ಮತ್ತು ಮೀರಿಸುವ ಸಂಶ್ಲೇಷಿತ ಆನುವಂಶಿಕ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯನ್ನು ರಚಿಸುವುದು ಮತ್ತು ಜೀವಂತ ಕೋಶಗಳಲ್ಲಿ ಮತ್ತು ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಜೀವರಸಾಯನಶಾಸ್ತ್ರದಲ್ಲಿ ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಯ ಅನ್ವಯಗಳನ್ನು ವಿಸ್ತರಿಸುವುದು ಅವರ ಗುರಿಯಾಗಿತ್ತು. ವಿಸ್ತರಿಸಿದ ಬೇಸ್ ಸೆಟ್ ಅನ್ನು ರಚಿಸಿದ ನಂತರ, ವಿಶ್ವಾಸಾರ್ಹ ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಕಿಣ್ವಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಅಥವಾ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲು ಮತ್ತು ವಿಸ್ತರಿಸಿದ ಡಿಎನ್ಎ ವರ್ಣಮಾಲೆಯನ್ನು ಮತ್ತಷ್ಟು ಉತ್ತಮಗೊಳಿಸಲು ಗುರಿಯನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸಲಾಯಿತು. ಬೆಂಜೊ-ಹೋಮೋಲೋಗೇಟೆಡ್ ಪ್ಯೂರಿನ್ಗಳಲ್ಲಿ (xA ಮತ್ತು xG), ಬೆಂಜೀನ್ ಉಂಗುರವು ಸಾರಜನಕ-ಇಂಗಾಲದ (N-C) ಬಂಧಗಳ ಮೂಲಕ ಸಾರಜನಕದ ತಳಕ್ಕೆ ಬಂಧಿಸಲ್ಪಡುತ್ತದೆ. ಬೆಂಜೊ-ಹೋಮೋಲೋಗೇಟೆಡ್ ಪಿರಿಮಿಡಿನ್ಗಳು ಬೇಸ್ ಮತ್ತು ಬೆಂಜೀನ್ ನಡುವಿನ ಕಾರ್ಬನ್-ಕಾರ್ಬನ್ (ಸಿ-ಸಿ) ಬಂಧಗಳ ಮೂಲಕ ರೂಪುಗೊಳ್ಳುತ್ತವೆ. ಇಲ್ಲಿಯವರೆಗೆ, ಫಾಸ್ಫೊರಾಮಿಡೈಟ್ ಉತ್ಪನ್ನಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಡಿಎನ್ಎ ಎಳೆಗಳಿಗೆ ಎಕ್ಸ್-ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಬೇಸ್ಗಳನ್ನು ಸೇರಿಸಲಾಗಿದೆ, ಏಕೆಂದರೆ ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ಗಳು ಎಕ್ಸ್ಡಿಎನ್ಎ ಎಳೆಗಳನ್ನು ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸುವಲ್ಲಿ ವಿಫಲವಾಗಿವೆ. ಬಿ-ಡಿಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ಗಳಿಗೆ ತಲಾಧಾರಗಳಾಗಿ ಎಕ್ಸ್-ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳು ಕಳಪೆ ಅಭ್ಯರ್ಥಿಯಾಗಿದ್ದು, ಅವುಗಳ ಗಾತ್ರವು ವೇಗವರ್ಧಕ ಡೊಮೇನ್ನಲ್ಲಿ ಬಂಧಿಸುವಲ್ಲಿ ಮಧ್ಯಪ್ರವೇಶಿಸುತ್ತದೆ. ಟೆಂಪ್ಲೇಟ್-ಸ್ವತಂತ್ರ ಕಿಣ್ವಗಳನ್ನು ಬಳಸುವ ಪ್ರಯತ್ನಗಳು ಯಶಸ್ವಿಯಾಗಿವೆ ಏಕೆಂದರೆ ಅವು ತಲಾಧಾರಗಳಿಗೆ ಕಡಿಮೆ ಜ್ಯಾಮಿತೀಯ ನಿರ್ಬಂಧವನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ. ಟರ್ಮಿನಲ್ ಡಿಯೋಕ್ಸಿನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟಿಡಿಲ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಫರೇಸ್ (ಟಿಡಿಟಿ) ಅನ್ನು ಈ ಹಿಂದೆ ಫ್ಲೋರೋಫೋರ್ಗಳಿಗೆ ಬದ್ಧವಾಗಿರುವ ಬೇಸ್ಗಳ ಎಳೆಗಳನ್ನು ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸಲು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತಿತ್ತು. ಟಿಡಿಟಿಯನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು, 30 ಮೊನೊಮರ್ಗಳನ್ನು ಒಟ್ಟುಗೂಡಿಸಿ xDNAಯ ಡಬಲ್-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಅನ್ನು ರಚಿಸಬಹುದು, ಆದಾಗ್ಯೂ ಈ ಆಲಿಗೋಮೆರಿಕ್ xDNA ಅಗಾಧವಾದ ಹೈಡ್ರೋಜನ್ ಬಂಧದಿಂದಾಗಿ ಈ ಉದ್ದವನ್ನು ಮೀರಿ ತನ್ನದೇ ಆದ ವಿಸ್ತರಣೆಯನ್ನು ತಡೆಯುತ್ತದೆ. ಪ್ರತಿಬಂಧವನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡಲು, xDNAಯನ್ನು ಸಾಮಾನ್ಯ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಆಗಿ ಸಂಕರೀಕರಿಸಬಹುದು. xDNAಯನ್ನು ಮಾಹಿತಿ ಸಂಗ್ರಹಣೆಗೆ ಪರ್ಯಾಯ ರಚನೆಯಾಗಿ ಬಳಸಬೇಕಾದರೆ, ಇದಕ್ಕೆ ವಿಶ್ವಾಸಾರ್ಹ ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನದ ಅಗತ್ಯವಿದೆ. ಡಿಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ I ನಿಂದ ಕ್ಲೆನೋ ತುಣುಕನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು xDNA ಪ್ರತಿಕೃತಿಯ ಸಂಶೋಧನೆಯು ಏಕ-ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ ಅಳವಡಿಕೆಯ ನಿದರ್ಶನಗಳಲ್ಲಿ ನೈಸರ್ಗಿಕ ಬೇಸ್ ಪಾಲುದಾರನನ್ನು ಆಯ್ದುಕೊಳ್ಳಲಾಗುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಡಿಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ IV (ಡಿಪಿಒ4) ಈ ರೀತಿಯ ಅಳವಡಿಕೆಗಳಿಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ನಿಷ್ಠೆಯೊಂದಿಗೆ ಎಕ್ಸ್ಡಿಎನ್ಎಯನ್ನು ಯಶಸ್ವಿಯಾಗಿ ಬಳಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗಿದೆ, ಇದು ಎಕ್ಸ್ಡಿಎನ್ಎಯ ಪ್ರತಿಕೃತಿಗಳನ್ನು ವಿಸ್ತರಿಸುವಲ್ಲಿ ಭವಿಷ್ಯದ ಸಂಶೋಧನೆಗೆ ಭರವಸೆಯ ಅಭ್ಯರ್ಥಿಯಾಗಿದೆ. xDNAಯ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯಾಗದ ಸಂವೇದನೆಯು B-DNAಯಂತೆಯೇ ಇರುತ್ತದೆ. ರಚನೆಯು ನೈಸರ್ಗಿಕ ಬೇಸ್ಗಳಂತೆಯೇ, ಎಕ್ಸ್-ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳು ಆಯ್ದ ಬಿ-ಡಿಎನ್ಎಯನ್ನು ಹೋಲುವ ಡ್ಯುಪ್ಲೆಕ್ಸ್-ರಚನೆಯಾಗಿ ಜೋಡಿಸುತ್ತವೆ. ನೈಟ್ರೋಜನ್ ಬೇಸ್ನಲ್ಲಿ ಬೆಂಜೀನ್ ಉಂಗುರವನ್ನು ಸೇರಿಸುವ ಮೂಲಕ xDNA ಅನ್ನು ಮೂಲತಃ ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸಲಾಯಿತು. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಇತರ ವಿಸ್ತರಿಸಿದ ಬೇಸ್ಗಳು ಥಿಯೋಫೀನ್ ಮತ್ತು ಬೆಂಜೋ [ಬಿ] ಥಿಯೋಫೀನ್ ಅನ್ನು ಸಹ ಸಂಯೋಜಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗಿದೆ. xDNA ಮತ್ತು yDNAಗಳು ಬೇಸ್ಗಳನ್ನು ವಿಸ್ತರಿಸಲು ಬೆಂಜೀನ್ ಉಂಗುರಗಳನ್ನು ಬಳಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಆದ್ದರಿಂದ ಅವುಗಳನ್ನು "ಬೆಂಜೊ-ಹೋಮೋಲೋಗೇಟೆಡ್" ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ವೈ. ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ವಿಸ್ತರಿಸಿದ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಬೇಸ್ಗಳ ಮತ್ತೊಂದು ರೂಪವು ನಾಫ್ಥಲೀನ್ಅನ್ನು ತಳಕ್ಕೆ ಸೇರಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಅವು "ನಾಫ್ಥೊ-ಹೋಮೋಲೋಗೇಟೆಡ್" ಆಗಿರುತ್ತವೆ. xDNA ಯು 3.2 Å ನ ಏರಿಕೆ ಮತ್ತು 32° ನ ತಿರುವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಇದು B-DNA ಗಿಂತ ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ಚಿಕ್ಕದಾಗಿದೆ, ಇದು 3.3 Å ನ ಏರಿಕೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಮತ್ತು 34.2° xDNA ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳ ತಿರುವು ಎರಡೂ ಎಳೆಗಳ ಮೇಲೆ ಸಂಭವಿಸಬಹುದು-ಏಕಾಂಗಿಯಾಗಿ ("ದ್ವಿಗುಣವಾಗಿ ವಿಸ್ತರಿಸಿದ DNA" ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ) ಅಥವಾ ನೈಸರ್ಗಿಕ ನೆಲೆಗಳೊಂದಿಗೆ ಬೆರೆತು-ಅಥವಾ ಪ್ರತ್ಯೇಕವಾಗಿ ಒಂದು ಎಳೆ ಅಥವಾ ಇನ್ನೊಂದರ ಮೇಲೆ. ಬಿ-ಡಿಎನ್ಎಯಂತೆಯೇ, ಎಕ್ಸ್ಡಿಎನ್ಎ ಪೂರಕ ಏಕ-ಎಳೆ ಡಿಎನ್ಎ ಅಥವಾ ಆರ್ಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಬಹುದು ಮತ್ತು ಬಂಧಿಸಬಹುದು. xDNAಯಿಂದ ರೂಪುಗೊಂಡ ಡ್ಯುಪ್ಲೆಕ್ಸ್ಗಳು ಎರಡು ಸಕ್ಕರೆ-ಫಾಸ್ಫೇಟ್ ಬೆನ್ನೆಲುಬುಗಳ ನಡುವಿನ ಅಂತರವನ್ನು ಹೊರತುಪಡಿಸಿ ನೈಸರ್ಗಿಕ ಡ್ಯುಪ್ಲೆಕ್ಸ್ಗಳನ್ನು ಹೋಲುತ್ತವೆ. ನೆರೆಯ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳ ನಡುವಿನ ಕಡಿಮೆ ಅಂತರದ ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ xDNA ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳು ಹೆಲಿಕ್ಸ್ನ ಪ್ರತಿ ತಿರುವಿನಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂಖ್ಯೆಯ ಬೇಸ್ ಜೋಡಿಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. xDNA ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳು ಸಮಾನಾಂತರ-ವಿರೋಧಿ, ಬಲಗೈ ಮತ್ತು C2 '-ಎಂಡೋ ಸಕ್ಕರೆ ಪಕರ್ನೊಂದಿಗೆ ಗ್ಲೈಕೋಸಿಡಿಕ್ ಬಂಧದ ಸುತ್ತಲೂ ವಿರೋಧಿ ಸಂರಚನೆಯನ್ನು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ ಎಂದು ಎನ್ಎಂಆರ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರಾ ವರದಿ ಮಾಡಿದೆ. xDNAಯಿಂದ ರಚಿಸಲಾದ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳು ಎ-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ರಚನೆಯ ಮೇಲೆ ಬಿ-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಅನ್ನು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುವ ಸಾಧ್ಯತೆಯಿದೆ, ಮತ್ತು ಬಿ-ಡಿಎನ್ಎಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ ಪ್ರಮುಖ ತೋಡು ಅಗಲವನ್ನು 6.5 Å ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ (ಅಲ್ಲಿ ಬೆನ್ನೆಲುಬುಗಳು ಹೆಚ್ಚು ದೂರದಲ್ಲಿರುತ್ತವೆ) ಮತ್ತು ಸಣ್ಣ ತೋಡು ಅಗಲವನ್ನು 5.5 Å ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ (ಅಲ್ಲಿ ಬೆನ್ನೆಲುಬುಗಳು ಒಟ್ಟಿಗೆ ಹತ್ತಿರದಲ್ಲಿರುತ್ತವೆ). ತೋಡು ಅಗಲವನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸುವುದರಿಂದ ಡಿಎನ್ಎ-ಬಂಧಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದುವ xDNA ಸಾಮರ್ಥ್ಯದ ಮೇಲೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ವಿಸ್ತರಿಸಿದ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳು ಒಂದು ಎಳೆಗೆ ಪ್ರತ್ಯೇಕವಾಗಿರುವವರೆಗೆ, ಗುರುತಿಸುವ ತಾಣಗಳು ಬಿ-ಡಿಎನ್ಎಗೆ ಸಾಕಷ್ಟು ಹೋಲುತ್ತವೆ, ಇದು ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳು ಮತ್ತು ಸಣ್ಣ ಪಾಲಿಮೈಡ್ ಅಣುಗಳ ಬಂಧವನ್ನು ಅನುಮತಿಸುತ್ತದೆ. ಮಿಶ್ರ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳು ಇತರ ಡಿಎನ್ಎ-ಬಂಧಿಸುವ ಅಣುಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ನಾಲ್ಕು ವಿಸ್ತರಿಸಿದ ಬೇಸ್ಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುವ ಸಾಧ್ಯತೆಯನ್ನು ಪ್ರಸ್ತುತಪಡಿಸುತ್ತವೆ. ವಿಸ್ತರಿಸಿದ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳು ಮತ್ತು ಅವುಗಳ ಆಲಿಗೋಮೆರಿಕ್ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳು ತಮ್ಮ ನೈಸರ್ಗಿಕ ಬಿ-ಡಿಎನ್ಎ ಪ್ರತಿರೂಪಗಳೊಂದಿಗೆ ಅನೇಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ, ಅವುಗಳ ಜೋಡಣೆಯ ಆದ್ಯತೆ ಸೇರಿದಂತೆಃ ಎ ಮತ್ತು ಟಿ, ಸಿ ಮತ್ತು ಜಿ. xDNA ಮತ್ತು ಬಿ-ಡಿಎನ್ಎ ನಡುವಿನ ರಾಸಾಯನಿಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳಲ್ಲಿನ ವಿವಿಧ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳು x-ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಬೇಸ್ಗಳನ್ನು ವಿಸ್ತರಿಸುವ ಬೆಂಜೀನ್ ಉಂಗುರವು ವಾಸ್ತವವಾಗಿ ರಾಸಾಯನಿಕವಾಗಿ ನಿಷ್ಕ್ರಿಯವಾಗಿಲ್ಲ ಎಂಬ ಊಹೆಯನ್ನು ಬೆಂಬಲಿಸುತ್ತದೆ. xDNA ಯು B-DNA ಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಆಗಿದೆ, ಮತ್ತು ಮಾರ್ಪಡಿಸಿದ ಶುದ್ಧತ್ವದ ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ ಸಣ್ಣ HOMO-LUMO ಅಂತರವನ್ನು (ಅತಿ ಹೆಚ್ಚು ಆಕ್ರಮಿತ ಆಣ್ವಿಕ ಕಕ್ಷೀಯ ಮತ್ತು ಕಡಿಮೆ ಆಕ್ರಮಿತ ಆಣ್ವಿಕ ಕಕ್ಷೀಯ ನಡುವಿನ ಅಂತರ) ಹೊಂದಿದೆ. xDNA ಯು B-DNA ಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿನ ಕರಗುವ ತಾಪಮಾನವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ (xA ಮತ್ತು T ಯ ಮಿಶ್ರ ಡೀಕ್ಯಾಮರ್ 55.6 °C ಕರಗುವ ತಾಪಮಾನವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, A ಮತ್ತು T ಯ ಅದೇ ಡೀಕ್ಯಾಮರ್ಗಿಂತ 34.3 °C ಹೆಚ್ಚಾಗಿದೆ), ಮತ್ತು "ಎಲ್ಲಾ-ಅಥವಾ-ಏನೂ" ಕರಗುವ ನಡವಳಿಕೆಯನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುತ್ತದೆ. ಪ್ರಯೋಗಾಲಯದ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ, xDNA ಸ್ವತಃ ಸಿನ್ ಸಂರಚನೆಯಲ್ಲಿ ಓರಿಯಂಟ್ ಆಗುತ್ತದೆ. ಇದು ದುರದೃಷ್ಟವಶಾತ್ xDNA ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳ ಬಂಧಿಸುವ ಮುಖವನ್ನು ಬಂಧಿಸಲು ನೆರೆಯ ಎಳೆಗಳನ್ನು ಎದುರಿಸಲು ಒಡ್ಡುವುದಿಲ್ಲ, ಅಂದರೆ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳನ್ನು ರೂಪಿಸಲು ಪ್ರಯತ್ನಿಸುವ ಮೊದಲು xDNA ಯ ಸಂರಚನೆಯನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸಲು ಹೆಚ್ಚುವರಿ ಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಅನ್ವಯಿಸಬೇಕು. ಆದಾಗ್ಯೂ, ವಿರೋಧಿ ಮತ್ತು ಸಿನ್ ದೃಷ್ಟಿಕೋನಗಳು ವಿಸ್ತರಿತ ಬೇಸ್ಗಳಲ್ಲಿ ಶಕ್ತಿಯುತವಾಗಿ ಪ್ರಾಯೋಗಿಕವಾಗಿ ಒಂದೇ ಆಗಿರುತ್ತವೆ. ಈ ರಚನಾತ್ಮಕ ಆದ್ಯತೆಯು ಪ್ರಾಥಮಿಕವಾಗಿ ಪಿರಿಮಿಡಿನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ, ಮತ್ತು ಪ್ಯೂರಿನ್ಗಳು ದೃಷ್ಟಿಕೋನಕ್ಕೆ ಕನಿಷ್ಠ ಆದ್ಯತೆಯನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುತ್ತವೆ. ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳನ್ನು ಡಬಲ್ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ನಲ್ಲಿ ಜೋಡಿಸುವುದು ಹೆಲಿಕ್ಸ್ನ ಸ್ಥಿರತೆಯನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸುವ ಪ್ರಮುಖ ಅಂಶವಾಗಿದೆ. ಹೆಚ್ಚುವರಿ ಮೇಲ್ಮೈ ವಿಸ್ತೀರ್ಣ ಮತ್ತು ಬಂಧಕ್ಕೆ ಲಭ್ಯವಿರುವ ಹೈಡ್ರೋಜನ್ನೊಂದಿಗೆ, ಬೆಂಜೀನ್ ಸ್ಪೇಸರ್ನ ಸೇರ್ಪಡೆಯೊಂದಿಗೆ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಬೇಸ್ಗಳ ಸ್ಟ್ಯಾಕಿಂಗ್ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವು ಹೆಚ್ಚಾಗುತ್ತದೆ. ಸಾರಜನಕ ಬೇಸ್ಗಳು ಮತ್ತು ಸಕ್ಕರೆ-ಫಾಸ್ಫೇಟ್ ಬೆನ್ನೆಲುಬಿನ ನಡುವಿನ ಪ್ರತ್ಯೇಕತೆಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುವ ಮೂಲಕ, ಹೆಲಿಕ್ಸ್ನ ಸ್ಟ್ಯಾಕಿಂಗ್ ಶಕ್ತಿಯು ಕಡಿಮೆ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಆದ್ದರಿಂದ ಹೆಚ್ಚು ಸ್ಥಿರವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ನೈಸರ್ಗಿಕ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಬೇಸ್ ಜೋಡಿಗಳ ಶಕ್ತಿಗಳು 18 ರಿಂದ 52 kJ/mol ವರೆಗೆ ಬದಲಾಗುತ್ತವೆ. ಈ ವ್ಯತ್ಯಾಸವು xDNAಗೆ ಕೇವಲ 14-40 kJ/mol ಆಗಿದೆ. ಡಿಎನ್ಎ ಮತ್ತು ಅದರ ನೆರೆಯ ಎಳೆಗಳ ನಡುವಿನ ಮತ್ತು ವಿಸ್ತರಿಸಿದ ಎಳೆಗಳ ನಡುವಿನ ಹೆಚ್ಚಿದ ಅತಿಕ್ರಮಣದಿಂದಾಗಿ, ವಿಸ್ತರಿಸಿದ ಮತ್ತು ಮಿಶ್ರ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಇಂಟರ್ಸ್ಟ್ರ್ಯಾಂಡ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳಿವೆ, ಇದು ಹೆಲಿಕ್ಸ್ನ ಸ್ಥಿರತೆಯಲ್ಲಿ ಗಮನಾರ್ಹ ಹೆಚ್ಚಳಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ. ಬೆಂಜೀನ್ ಸ್ಪೇಸರ್ನ ಸೇರ್ಪಡೆಯಿಂದ ಉಂಟಾಗುವ ಅಂತರ ಮತ್ತು ಇಂಟ್ರಾಸ್ಟ್ರ್ಯಾಂಡ್ ಹೈಡ್ರೋಜನ್ ಬಂಧದಲ್ಲಿನ ಬದಲಾವಣೆಗಳಿಂದಾಗಿ xDNA ಸ್ಟ್ಯಾಕಿಂಗ್ ಸಾಮರ್ಥ್ಯಗಳನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸಿದೆ, ಆದರೆ ಬೇಸ್ಗಳನ್ನು ವಿಸ್ತರಿಸುವುದರಿಂದ ಡ್ಯುಪ್ಲೆಕ್ಸ್ನ ಸ್ಥಿರತೆಗೆ ಹೈಡ್ರೋಜನ್ನ ಕೊಡುಗೆಯನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸುವುದಿಲ್ಲ. ಹೆಲಿಕ್ಸ್ನ ಬಲವನ್ನು ಅತ್ಯುತ್ತಮವಾಗಿಸಲು xDNA ಮತ್ತು B-DNA ಎರಡನ್ನೂ ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳು ಈ ಸ್ಟ್ಯಾಕಿಂಗ್ ಸಾಮರ್ಥ್ಯಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ. ಎ ಮತ್ತು ಎಕ್ಸ್ಎ ಮತ್ತು ಟಿ ಮತ್ತು ಎಕ್ಸ್ಟಿಗಳನ್ನು ಮಾತ್ರ ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಎಳೆಗಳಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿದ ಸ್ಟ್ಯಾಕಿಂಗ್ ಪ್ರಮುಖವಾಗಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ, ಏಕೆಂದರೆ ಟಿ-ಎಕ್ಸ್ಎ ಟಿ-ಎ ಗಿಂತ ಬಲವಾದ ಸ್ಟ್ಯಾಕಿಂಗ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಪಿರಿಮಿಡಿನ್ಗಳಿಂದ ಉಂಟಾಗುವ ಶಕ್ತಿಯು 30 ರಿಂದ 49 kJ/mol ವರೆಗೆ ಇರುತ್ತದೆ. ಪ್ಯೂರಿನ್ಗಳ ವ್ಯಾಪ್ತಿಯು 40-58 kJ/mol ನಡುವೆ ಇರುತ್ತದೆ. ಡಬಲ್-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ನಲ್ಲಿ ಒಂದು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಅನ್ನು ವಿಸ್ತರಿತ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ನೊಂದಿಗೆ ಬದಲಾಯಿಸುವ ಮೂಲಕ, ಸ್ಟ್ಯಾಕಿಂಗ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳ ಬಲವು 50 ಪ್ರತಿಶತದಷ್ಟು ಹೆಚ್ಚಾಗುತ್ತದೆ. ಎರಡೂ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳನ್ನು ವಿಸ್ತರಿಸುವುದರಿಂದ ಶೇಖಡ 90ರಷ್ಟು ಸ್ಟ್ಯಾಕಿಂಗ್ ಶಕ್ತಿ ಹೆಚ್ಚಾಗುತ್ತದೆ. ಹೆಲಿಕ್ಸ್ನ ಬಂಧಿಸುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯದ ಮೇಲೆ ಎಕ್ಸ್ಜಿ ಒಟ್ಟಾರೆ ಋಣಾತ್ಮಕ ಪರಿಣಾಮವನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದರೂ, ಇತರ ಮೂರು ವಿಸ್ತರಿತ ಬೇಸ್ಗಳು ತಮ್ಮ ಧನಾತ್ಮಕ ಪರಿಣಾಮಗಳೊಂದಿಗೆ ಇದನ್ನು ಮೀರಿಸುತ್ತವೆ. ಬೇಸ್ಗಳನ್ನು ವಿಸ್ತರಿಸುವುದರಿಂದ ಉಂಟಾಗುವ ಶಕ್ತಿಯಲ್ಲಿನ ಬದಲಾವಣೆಯು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಬೇಸ್ಗಳ ದ್ರವ್ಯರಾಶಿಯ ಕೇಂದ್ರಗಳ ಸುತ್ತ ಬಂಧದ ತಿರುಗುವಿಕೆಯ ಮೇಲೆ ಅವಲಂಬಿತವಾಗಿರುತ್ತದೆ, ಮತ್ತು ಸಮೂಹ ಸ್ಟ್ಯಾಕಿಂಗ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳ ಕೇಂದ್ರವು ಹೆಲಿಕ್ಸ್ನ ಸ್ಟ್ಯಾಕಿಂಗ್ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಸುಧಾರಿಸುತ್ತದೆ. ಗಾತ್ರ-ವಿಸ್ತರಿಸಿದ ಬೇಸ್ಗಳು ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಅನ್ನು ವಿಸ್ತರಿಸುವುದರಿಂದ, ಇದು ಹೆಚ್ಚಿನ ಕರಗುವ ತಾಪಮಾನದೊಂದಿಗೆ ಹೆಚ್ಚು ಉಷ್ಣವಾಗಿ ಸ್ಥಿರವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಹೀರಿಕೊಳ್ಳುವಿಕೆ x-ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಬೇಸ್ಗಳಲ್ಲಿ ಬೆಂಜೀನ್ ಸ್ಪೇಸರ್ನ ಸೇರ್ಪಡೆಯು ಬೇಸ್ಗಳ ಆಪ್ಟಿಕಲ್ ಹೀರಿಕೊಳ್ಳುವ ವರ್ಣಪಟಲದ ಮೇಲೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುತ್ತದೆ. xDNAಗೆ ಅನ್ವಯಿಸಲಾದ ಸಮಯ-ಅವಲಂಬಿತ ಸಾಂದ್ರತೆಯ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಸಿದ್ಧಾಂತವು (TDDFT) X-ಬೇಸ್ಗಳಲ್ಲಿನ ಅತಿ ಹೆಚ್ಚು ಆಕ್ರಮಿತ ಆಣ್ವಿಕ ಕಕ್ಷೆಗಳ (HOMO) ಬೆಂಜೀನ್ ಘಟಕವು ನೈಸರ್ಗಿಕ ಬೇಸ್ಗಳಿಗಿಂತ ಮುಂಚಿನ ಹಂತದಲ್ಲಿ ಹೀರಿಕೊಳ್ಳುವಿಕೆಯನ್ನು ಪ್ರಾರಂಭಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿತು. xDNA ಹೀರಿಕೊಳ್ಳುವ ವರ್ಣಪಟಲದ ಮತ್ತೊಂದು ಅಸಾಮಾನ್ಯ ಲಕ್ಷಣವೆಂದರೆ ಕಡಿಮೆ ವ್ಯಾಪ್ತಿಯಲ್ಲಿ xA ಯ ಕೆಂಪು-ಸ್ಥಳಾಂತರಗೊಂಡ ಎಕ್ಸೈಮರ್ಗಳು. ಬೆರಳಚ್ಚುಗಳನ್ನು ಜೋಡಿಸುವ ವಿಷಯದಲ್ಲಿ, ಸತತ xA-T ಬೇಸ್ ಜೋಡಿಗಳಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚು ಸ್ಪಷ್ಟವಾದ ಹೈಪೋಕ್ರೊಮಿಸಿಟಿಯು ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ. xDNAಯ ಬದಲಾದ ಹೀರಿಕೊಳ್ಳುವಿಕೆಯ ಪರಿಣಾಮಗಳು ನ್ಯಾನೊಎಲೆಕ್ಟ್ರಾನಿಕ್ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನ ಮತ್ತು ನ್ಯಾನೊಬಯೋಟೆಕ್ನಾಲಜಿಗಳಲ್ಲಿನ ಅನ್ವಯಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿವೆ. ಎಕ್ಸ್-ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳ ನಡುವಿನ ಅಂತರವು ಕಡಿಮೆಯಾಗುವುದರಿಂದ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಗಟ್ಟಿಯಾಗುತ್ತದೆ, ಹೀಗಾಗಿ ಇದು ತಲಾಧಾರ, ವಿದ್ಯುದ್ವಾರ ಮತ್ತು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ನ್ಯಾನೊಪರ್ಟಿಕಲ್ ಶಕ್ತಿಗಳಿಂದ ಸುಲಭವಾಗಿ ಪ್ರಭಾವಿತವಾಗುವುದಿಲ್ಲ. ನೈಸರ್ಗಿಕ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳಿಗೆ ಇತರ ಬದಲಾವಣೆಗಳು ವಿಭಿನ್ನ ಹೀರಿಕೊಳ್ಳುವ ವರ್ಣಪಟಲಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗುವುದರಿಂದ ಭವಿಷ್ಯದಲ್ಲಿ ಈ ಅನ್ವಯಗಳನ್ನು ವಿಸ್ತರಿಸುತ್ತದೆ. ಪ್ರತಿದೀಪ್ತಿ xDNAಯ ಒಂದು ವಿಶಿಷ್ಟ ಲಕ್ಷಣವೆಂದರೆ ಅದರ ಅಂತರ್ಗತ ಪ್ರತಿದೀಪ್ತಿ. ಮೈಕ್ರೋಅರೇಗಳು, ಸಿಟು ಹೈಬ್ರಿಡೈಸೇಶನ್ ಮತ್ತು ಪಾಲಿಮಾರ್ಫಿಸಮ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಲ್ಲಿ ಬಳಸಲು ನೈಸರ್ಗಿಕ ಬೇಸ್ಗಳನ್ನು ನೇರವಾಗಿ ಫ್ಲೋರೋಫೋರ್ಗಳಿಗೆ ಬಂಧಿಸಬಹುದು. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಈ ಪ್ರತಿದೀಪಕ ನೈಸರ್ಗಿಕ ತಳಗಳು ಆಗಾಗ್ಗೆ ಸ್ವಯಂ-ಶಮನದ ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ ವಿಫಲವಾಗುತ್ತವೆ, ಇದು ಅವುಗಳ ಪ್ರತಿದೀಪಕ ತೀವ್ರತೆಯನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ದೃಶ್ಯ ಡಿಎನ್ಎ ಟ್ಯಾಗ್ಗಳಾಗಿ ಅವುಗಳ ಅನ್ವಯವನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಎಕ್ಸ್-ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಬೇಸ್ಗಳಲ್ಲಿನ ಉಂಗುರಗಳ ನಡುವಿನ ಪೈ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳು ನೇರಳೆ-ನೀಲಿ ವ್ಯಾಪ್ತಿಯಲ್ಲಿ ಅಂತರ್ಗತ ಪ್ರತಿದೀಪಕಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತವೆ, ಸ್ಟೋಕ್ಸ್ 50 ಮತ್ತು 80 ಎನ್ಎಂ ನಡುವೆ ಬದಲಾಗುತ್ತದೆ. ಅವು 0.3-0.6 ವ್ಯಾಪ್ತಿಯಲ್ಲಿ ಕ್ವಾಂಟಮ್ ಇಳುವರಿಯನ್ನು ಸಹ ಹೊಂದಿವೆ. xC ಅತಿ ಹೆಚ್ಚು ಪ್ರತಿದೀಪಕ ಹೊರಸೂಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಇತರ ವಿಸ್ತರಿತ ನೆಲೆಗಳು xDNAಯ ಸೃಷ್ಟಿ ಮತ್ತು ಸುತ್ತಮುತ್ತಲಿನ ಯಶಸ್ವಿ ಸಂಶೋಧನೆಯ ನಂತರ, ವಿಸ್ತರಿತ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳ ಹೆಚ್ಚಿನ ರೂಪಗಳನ್ನು ತನಿಖೆ ಮಾಡಲಾಯಿತು. ವೈ. ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಯು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳ ಎರಡನೆಯ, ಇದೇ ರೀತಿಯ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಾಗಿದ್ದು, ಇದು ನಾಲ್ಕು ನೈಸರ್ಗಿಕ ಬೇಸ್ಗಳನ್ನು ವಿಸ್ತರಿಸಲು ಬೆಂಜೀನ್ ರಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ. xxDNA ಮತ್ತು yyDNA ಎರಡು ಹೈಡ್ರೋಕಾರ್ಬನ್ ಉಂಗುರಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಪಾಲಿಸೈಕ್ಲಿಕ್ ಅಣುವಾದ ನಾಫ್ಥಲೀನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸುತ್ತವೆ. ಎರಡು ಉಂಗುರಗಳು ತಳವನ್ನು ಇನ್ನೂ ಅಗಲವಾಗಿ ವಿಸ್ತರಿಸಿ, ಅದರ ರಾಸಾಯನಿಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಮತ್ತಷ್ಟು ಬದಲಾಯಿಸುತ್ತವೆ. xDNAಯ ಯಶಸ್ಸು ಮತ್ತು ಪರಿಣಾಮಗಳು B-DNAಯ ರಾಸಾಯನಿಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸಬಹುದಾದ ಇತರ ಅಂಶಗಳನ್ನು ಪರೀಕ್ಷಿಸಲು ಮತ್ತು ವಿಶಾಲವಾದ ಅನ್ವಯಗಳೊಂದಿಗೆ ಮಾಹಿತಿ ಸಂಗ್ರಹಣೆಗಾಗಿ ಹೊಸ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯನ್ನು ರಚಿಸಲು ಸಂಶೋಧನೆಯನ್ನು ಪ್ರೇರೇಪಿಸಿದವು. ವೈ. ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಯು xDNAಯಂತೆಯೇ ಬೆಂಜೀನ್ ಉಂಗುರವನ್ನು ಸಹ ಬಳಸುತ್ತದೆ, ವ್ಯತ್ಯಾಸವೆಂದರೆ ಸುಗಂಧದ ಉಂಗುರವನ್ನು ಸೇರಿಸುವ ಸ್ಥಳ ಮಾತ್ರ. ಬೆಂಜೀನ್ ಉಂಗುರದ ಸ್ಥಳವು ವಿಸ್ತರಿತ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ನ ಆದ್ಯತೆಯ ರಚನೆಯನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸುತ್ತದೆ. ಬದಲಾದ ಸಂರಚನೆಯು ಇಂಟರ್ಸ್ಟ್ರ್ಯಾಂಡ್ ಹೈಡ್ರೋಜನ್ ಬಂಧಗಳನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸುವ ಮೂಲಕ ವೈಡಿಎನ್ಎ ಅನ್ನು ಅದರ ದೃಷ್ಟಿಕೋನದಲ್ಲಿ ಬಿ-ಡಿಎನ್ಎಗೆ ಹೆಚ್ಚು ಹೋಲುವಂತೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಸ್ಥಿರತೆಯು ಬೇಸ್ ಮತ್ತು ಬೆನ್ನೆಲುಬಿನ ಸಕ್ಕರೆಯ ನಡುವಿನ ಸಂಪರ್ಕದ ಬಗ್ಗೆ ಬೇಸ್ಗಳ ತಿರುಗುವಿಕೆಯ ಮೇಲೆ ಹೆಚ್ಚು ಅವಲಂಬಿತವಾಗಿದೆ. ಈ ದೃಷ್ಟಿಕೋನಕ್ಕೆ ವೈ. ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಯ ಬದಲಾದ ಆದ್ಯತೆಯು ಅದನ್ನು ಒಟ್ಟಾರೆಯಾಗಿ xDNA ಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ಸ್ಥಿರವಾಗಿಸುತ್ತದೆ. ಬೆಂಜೀನ್ ಸ್ಪೇಸರ್ನ ಸ್ಥಳವು ಬೇಸ್ಗಳ ತೋಡು ರೇಖಾಗಣಿತದ ಮೇಲೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುತ್ತದೆ, ಇದು ನೆರೆಯ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸುತ್ತದೆ. ವೈ-ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳು ಮತ್ತು ನೈಸರ್ಗಿಕ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳ ನಡುವಿನ ಬೇಸ್ ಜೋಡಿಗಳು xDNAಯಂತೆ ಸ್ವಲ್ಪ ತಿರುಚಿದ ಬದಲು ಸಮತಟ್ಟಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಇದು xDNA ಸಾಧಿಸಿದ್ದಕ್ಕಿಂತ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ನ ಏರಿಕೆಯನ್ನು ಮತ್ತಷ್ಟು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ. xDNA ಮತ್ತು yDNA ಹೆಚ್ಚಿನ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳಲ್ಲಿ ಹೋಲುತ್ತವೆಯಾದರೂ, ಅವುಗಳ ಹೆಚ್ಚಿದ ಸ್ಟ್ಯಾಕಿಂಗ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳು ಸೇರಿದಂತೆ, yDNA ಹೆಚ್ಚಿನ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯಾಗದ ಗುರುತಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ವೈ-ಪಿರಿಮಿಡಿನ್ಗಳು ಎರಡು ಅನೋಮೆರಿಕ್ ಕಾರ್ಬನ್ಗಳ ನಡುವಿನ ಅಂತರದ ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ ಎಕ್ಸ್-ಪಿರಿಮಿಡಿನ್ಗಳಿಗಿಂತ ಸ್ವಲ್ಪ ಬಲವಾದ ಸ್ಟ್ಯಾಕಿಂಗ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುತ್ತವೆ, ಇದು ವೈಡಿಎನ್ಎಯಲ್ಲಿ ಸ್ವಲ್ಪ ದೊಡ್ಡದಾಗಿದೆ. xDNA ಇನ್ನೂ ಮಾದರಿ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳಲ್ಲಿ ಬಲವಾದ ಸ್ಟ್ಯಾಕಿಂಗ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಆದರೆ ನೈಸರ್ಗಿಕ ಡಬಲ್ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗೆ x-ಅಥವಾ y-ಪಿರಿಮಿಡಿನ್ಗಳನ್ನು ಸೇರಿಸುವುದರಿಂದ ಇಂಟ್ರಾ-ಮತ್ತು ಇಂಟರ್ಸ್ಟ್ರ್ಯಾಂಡ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ಬಲಪಡಿಸುತ್ತದೆ, ಒಟ್ಟಾರೆ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಸ್ಥಿರತೆಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ. ಕೊನೆಯಲ್ಲಿ, ಇವೆರಡರಲ್ಲಿ ಯಾವುದು ಒಟ್ಟಾರೆ ಬಲವಾದ ಸ್ಟ್ಯಾಕಿಂಗ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಎಂಬುದು ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿರುತ್ತದೆ; xT ಮತ್ತು yT ಒಂದೇ ರೀತಿಯ ಬಲದೊಂದಿಗೆ A ಅನ್ನು ಬಂಧಿಸುತ್ತವೆ, ಆದರೆ G ಗೆ ಬದ್ಧವಾಗಿರುವ yC ಯ ಸ್ಟ್ಯಾಕಿಂಗ್ ಶಕ್ತಿಯು xC ಯಿಂದ 4kJ/mol ಗಿಂತ ಬಲವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ವೈ. ಡಿ. ಎನ್. ಎ ಮತ್ತು ಇತರ ವಿಸ್ತರಿತ ನೆಲೆಗಳು ಅತ್ಯಂತ ಕಡಿಮೆ ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲಾದ ಅತ್ಯಂತ ಚಿಕ್ಕ ಕ್ಷೇತ್ರದ ಭಾಗವಾಗಿದೆ. ಆದರ್ಶ ರಚನೆಯನ್ನು ಇನ್ನೂ ಕಂಡುಹಿಡಿಯಬೇಕಾಗಿದೆ ಎಂದು ಸಂಶೋಧನೆ ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಬೆಂಜೀನ್ ಸ್ಥಳವು ವಿಸ್ತರಿಸಿದ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಬೇಸ್ಗಳ ದೃಷ್ಟಿಕೋನ ಮತ್ತು ರಚನೆಯ ಮೇಲೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುತ್ತದೆ ಎಂದು ತಿಳಿದಿರುವುದು ಅವುಗಳ ಭವಿಷ್ಯದ ವಿನ್ಯಾಸಕ್ಕೆ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಸೇರಿಸುತ್ತದೆ. yyDNA ಮತ್ತು XXDNA ಡಬಲ್-ಎಕ್ಸ್ಪಾಂಡೆಡ್ (ಅಥವಾ ನಾಫ್ಥೊ-ಹೋಮೋಲೋಗೇಟೆಡ್) ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಬೇಸ್ಗಳು ಬೆಂಜೀನ್ ರಿಂಗ್ ಬದಲಿಗೆ ನಾಫ್ಥಲೀನ್ ಸ್ಪೇಸರ್ ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತವೆ, ಅದರ ಎರಡು-ರಿಂಗ್ ರಚನೆಯೊಂದಿಗೆ ಬೇಸ್ ಅನ್ನು ಎರಡು ಪಟ್ಟು ಹೆಚ್ಚು ವಿಸ್ತರಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ರಚನೆಗಳು (XXDNA ಮತ್ತು YYDNA ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುತ್ತವೆ) ನೈಸರ್ಗಿಕ ಬೇಸ್ಗಳಿಗಿಂತ 4.8 Å ಅಗಲವಾಗಿವೆ ಮತ್ತು 1984 ರಲ್ಲಿ ATP-ಅವಲಂಬಿತ ಕಿಣ್ವಗಳಲ್ಲಿ ವಿಸ್ತರಿಸಿದ ಅಡೆನಿನ್ ಕುರಿತು ಲಿಯೊನಾರ್ಡ್ನ ಸಂಶೋಧನೆಯ ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ ಮತ್ತೊಮ್ಮೆ ರಚಿಸಲ್ಪಟ್ಟವು. 2013 ರವರೆಗೆ ಸುಮಾರು ಮೂರು ದಶಕಗಳ ಕಾಲ ಈ ದ್ವಿಗುಣವಾಗಿ ವಿಸ್ತರಿಸಿದ ನೆಲೆಗಳ ಮೇಲೆ ಯಾವುದೇ ಸಾಹಿತ್ಯವನ್ನು ಪ್ರಕಟಿಸಲಾಗಲಿಲ್ಲ, ಆಗ ಮೊದಲ XXG ಅನ್ನು ಶರ್ಮಾ, ಲೈಟ್ ಮತ್ತು ವೆಟ್ಮೋರ್ ನಿರ್ಮಿಸಿದರು ಮತ್ತು XXA ಜೊತೆಗೆ ನೈಸರ್ಗಿಕ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ನಲ್ಲಿ ಸೇರಿಸಲಾಯಿತು. XXDNAಯ ಮೇಲೆ ಬಹಳ ಕಡಿಮೆ ಸಂಶೋಧನೆಗಳನ್ನು ನಡೆಸಲಾಗಿದ್ದರೂ, XX-ಪ್ಯೂರೈನ್ ನೆರೆಹೊರೆಯವರು ಈಗಾಗಲೇ ಇಂಟ್ರಾಸ್ಟ್ರ್ಯಾಂಡ್ ಸ್ಟ್ಯಾಕಿಂಗ್ ಶಕ್ತಿಯನ್ನು 119% ವರೆಗೆ ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತಾರೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ (x-ಪ್ಯೂರೈನ್ಗಳಲ್ಲಿ 62 ಪ್ರತಿಶತಕ್ಕೆ ವಿರುದ್ಧವಾಗಿ). XX-ಪ್ಯುರಿನ್ ಮತ್ತು ಪಿರಿಮಿಡಿನ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳು ಒಟ್ಟುಗೂಡಿದ ಶಕ್ತಿಗಳಲ್ಲಿ ಒಟ್ಟಾರೆ ಇಳಿಕೆಯನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತವೆ, ಆದರೆ ಪಿರಿಮಿಡಿನ್ಗಳು ಮತ್ತು XX-ಪ್ಯುರಿನ್ಗಳು ಸೇರಿದಂತೆ ಡ್ಯುಪ್ಲೆಕ್ಸ್ಗಳ ಒಟ್ಟಾರೆ ಸ್ಥಿರತೆಯು 22 ಪ್ರತಿಶತದಷ್ಟು ಹೆಚ್ಚಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಪಿರಿಮಿಡಿನ್ಗಳು ಮತ್ತು X-ಪ್ಯುರಿನ್ಗಳಿಗಿಂತ ಎರಡು ಪಟ್ಟು ಹೆಚ್ಚು. xDNA ರಾಸಾಯನಿಕ ಮತ್ತು ಜೈವಿಕ ಸಂಶೋಧನೆಯಲ್ಲಿ ಅನೇಕ ಅನ್ವಯಿಕೆಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಇದರಲ್ಲಿ ಸ್ಕ್ಯಾಫೋಲ್ಡಿಂಗ್ನಂತಹ ನೈಸರ್ಗಿಕ ಡಿಎನ್ಎ ಅನ್ವಯಗಳ ಮೇಲೆ ವಿಸ್ತರಿಸುವುದು ಸೇರಿದೆ. ಸ್ವಯಂ-ಜೋಡಣೆಯ ನ್ಯಾನೊ ರಚನೆಗಳನ್ನು ರಚಿಸಲು, ಬೆಳವಣಿಗೆಯನ್ನು ಬೆಂಬಲಿಸಲು ಒಂದು ರೀತಿಯ ಟ್ರೆಲ್ಲಿಯಾಗಿ ಸ್ಕ್ಯಾಫೋಲ್ಡ್ ಅಗತ್ಯವಿದೆ. ಈ ಹಿಂದೆ ಡಿಎನ್ಎಯನ್ನು ಈ ಉದ್ದೇಶಕ್ಕಾಗಿ ಒಂದು ಸಾಧನವಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತಿತ್ತು, ಆದರೆ ವಿಸ್ತರಿತ ಸ್ಕ್ಯಾಫೋಲ್ಡ್ಗಳು ಹೆಚ್ಚು ಸಂಕೀರ್ಣವಾದ ಸ್ವಯಂ-ಜೋಡಣೆಗೆ ದೊಡ್ಡ ಸ್ಕ್ಯಾಫೋಲ್ಡ್ಗಳನ್ನು ಒಂದು ಆಯ್ಕೆಯಾಗಿ ಮಾಡುತ್ತವೆ. xDNAಯ ವಿದ್ಯುತ್ ವಹನ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು ಇದನ್ನು ಆಣ್ವಿಕ ತಂತಿಯಾಗಿ ಪ್ರಧಾನ ಅಭ್ಯರ್ಥಿಯನ್ನಾಗಿ ಮಾಡುತ್ತವೆ, ಏಕೆಂದರೆ ಅದರ π-π ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳು ವಿದ್ಯುಚ್ಛಕ್ತಿಯನ್ನು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿಯಾಗಿ ನಿರ್ವಹಿಸಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತವೆ. ಇದರ 8-ಅಕ್ಷರದ ವರ್ಣಮಾಲೆಯು (ಎ, ಟಿ, ಸಿ, ಜಿ, ಎಕ್ಸ್ಎ, ಎಕ್ಸ್ಟಿ, ಎಕ್ಸ್ಸಿ, ಎಕ್ಸ್ಜಿ) ಶೇಖರಣಾ ಸಾಂದ್ರತೆಯಲ್ಲಿ 2n ಪಟ್ಟು ಹೆಚ್ಚಳವನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ, ಅಲ್ಲಿ ಎನ್ ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಅಕ್ಷರಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತದೆ. ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಬಿ-ಡಿಎನ್ಎಯೊಂದಿಗೆ 6 ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸುವುದರಿಂದ 4096 ಸಂಭವನೀಯ ಅನುಕ್ರಮಗಳು ದೊರೆಯುತ್ತವೆ, ಆದರೆ xDNAಯೊಂದಿಗೆ ರಚಿಸಲಾದ ಅದೇ ಸಂಖ್ಯೆಯ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳ ಸಂಯೋಜನೆಯು 262,144 ಸಂಭವನೀಯ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ. ಹೆಚ್ಚುವರಿಯಾಗಿ, ಲಿಯೋನಾರ್ಡ್ ಮತ್ತು ಇತರರು ಅದರ ಮೂಲ ಅನ್ವಯಿಸಿದಂತೆ, xDNAಯನ್ನು ಕಿಣ್ವದ ಸಕ್ರಿಯ ಸ್ಥಳಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿದೀಪಕ ಶೋಧಕವಾಗಿ ಬಳಸಬಹುದು. xDNAಯನ್ನು ಪ್ರೋಟೀನ್-DNA ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳ ಅಧ್ಯಯನಕ್ಕೂ ಅನ್ವಯಿಸಲಾಗಿದೆ. xDNAಯ ನೈಸರ್ಗಿಕ ಪ್ರತಿದೀಪಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳಿಂದಾಗಿ, ಇದನ್ನು ಪ್ರಯೋಗಾಲಯ ಮತ್ತು ಜೀವನ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳೆರಡರಲ್ಲೂ ಸುಲಭವಾಗಿ ಕಾಣಬಹುದಾಗಿದೆ. xDNA ಅನ್ನು ರಚಿಸುವುದು ಮತ್ತು ಆಲಿಗೋಮೆರೈಸ್ ಮಾಡುವುದು ಹೆಚ್ಚು ಸುಲಭವಾಗುತ್ತಿದೆ, ಮತ್ತು ಪೂರಕ ಡಿಎನ್ಎ ಮತ್ತು ಆರ್ಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮಗಳಿಗೆ ಅದರ ಹೆಚ್ಚಿನ-ಆಕರ್ಷಣೆಯ ಬಂಧಿಸುವಿಕೆಯು ಜೀವಕೋಶದಲ್ಲಿ ತೇಲುತ್ತಿರುವ ಈ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಅವು ಈಗಾಗಲೇ ಜೀವಕೋಶದೊಳಗಿನ ಇತರ ರಚನೆಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುತ್ತಿರುವಾಗ. xDNAಯು ವರದಿಗಾರರನ್ನು ಸುಧಾರಿಸಬಹುದಾದ್ದರಿಂದ TdTಯನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಳ್ಳುವ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳಲ್ಲಿ ಸಂಭಾವ್ಯ ಅನ್ವಯಿಕೆಗಳನ್ನು ಸಹ ಹೊಂದಿದೆ, ಮತ್ತು ಇಂಟರ್ಸ್ಟ್ರ್ಯಾಂಡ್ ಬಂಧಕ್ಕೆ ಅಫಿನಿಟಿ ಟ್ಯಾಗ್ ಆಗಿ ಬಳಸಬಹುದು. ಡಿಎನ್ಎ ಆರ್ಎನ್ಎ ಡಿಎನ್ಎ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ ಜೆನೆಟಿಕ್ ಎಂಜಿನಿಯರಿಂಗ್ ನ್ಯಾನೊಬಯೋಟೆಕ್ನಾಲಜಿ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಬೇಸ್ ಹಚಿಮೋಜಿ ಡಿಎನ್ಎ ಕೃತಕವಾಗಿ ವಿಸ್ತರಿಸಿದ ಜೆನೆಟಿಕ್ ಇನ್ಫರ್ಮೇಷನ್ ಸಿಸ್ಟಮ್ (ಎಇಜಿಐಎಸ್) ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಬಯೋಕೆಮಿಸ್ಟ್ರಿ ವಿಧಾನಗಳು ಡಿಎನ್ಎ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ ತಂತ್ರಗಳು ಆಣ್ವಿಕ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರವನ್ನು ಸಹ ನೋಡಿ.