Bacterial DNA binding protein
ಆಣ್ವಿಕ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರದಲ್ಲಿ, ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಡಿಎನ್ಎ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಸಣ್ಣ, ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಡಿಎನ್ಎ ಅನ್ನು ಬಂಧಿಸುವ ಸುಮಾರು 90 ಅವಶೇಷಗಳ ಮೂಲ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಕುಟುಂಬವಾಗಿದ್ದು ಅವುಗಳನ್ನು ಹಿಸ್ಟೋನ್ ತರಹದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಬಂಧಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಕಾರ್ಯಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವುದರಿಂದ, ಅವೆಲ್ಲಕ್ಕೂ ಸಾಮಾನ್ಯ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸುವುದು ಕಷ್ಟಕರವಾಗಿದೆ. ಅವುಗಳನ್ನು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಹಿಸ್ಟೋನ್-ರೀತಿಯ ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಅನೇಕ ರೀತಿಯ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ. ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಹಿಸ್ಟೋನ್ಗಳು ಡಿಎನ್ಎಯನ್ನು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್ನಲ್ಲಿ ಹೊಂದಿಕೊಳ್ಳಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಅವು ಪ್ರಕೃತಿಯಲ್ಲಿ ಅತ್ಯಂತ ಸಂರಕ್ಷಿತ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳೆಂದು ತಿಳಿದುಬಂದಿದೆ. ಉದಾಹರಣೆಗಳಲ್ಲಿ ಎಸ್ಚೆರಿಚಿಯಾ ಕೋಲಿಯಲ್ಲಿನ ಎಚ್ಯು ಪ್ರೋಟೀನ್, ನಿಕಟವಾಗಿ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಆಲ್ಫಾ ಮತ್ತು ಬೀಟಾ ಸರಪಳಿಗಳ ಡೈಮರ್ ಮತ್ತು ಇತರ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದೇ ರೀತಿಯ ಸರಪಳಿಗಳ ಡೈಮರ್ ಆಗಿರಬಹುದು. ವಿವಿಧ ರೀತಿಯ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳು (ಸಯನೋಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಸೇರಿದಂತೆ) ಮತ್ತು ಆರ್ಕಿಯಾದಲ್ಲಿ HU-ರೀತಿಯ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಕಂಡುಬಂದಿವೆ ಮತ್ತು ಕೆಲವು ಪಾಚಿಗಳ ಕ್ಲೋರೋಪ್ಲಾಸ್ಟ್ ಜೀನೋಮ್ನಲ್ಲಿಯೂ ಸಹ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ. ಇಂಟಿಗ್ರೇಷನ್ ಹೋಸ್ಟ್ ಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ (ಐಎಚ್ಎಫ್), ಆನುವಂಶಿಕ ಮರುಸಂಯೋಜನೆಯಲ್ಲಿ ಮತ್ತು ಅನುವಾದ ಮತ್ತು ಪ್ರತಿಲೇಖನ ನಿಯಂತ್ರಣದಲ್ಲಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸಲು ಸೂಚಿಸಲಾದ ನಿಕಟ ಸಂಬಂಧಿತ ಸರಪಳಿಗಳ ಡೈಮರ್, ಎಂಟರೋಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಮತ್ತು ಆಫ್ರಿಕನ್ ಹಂದಿ ಜ್ವರ ವೈರಸ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಎ104ಆರ್ (ಅಥವಾ ಎಲ್ಎಂಡಬ್ಲ್ಯೂ5-ಎಆರ್) ಸೇರಿದಂತೆ ವೈರಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ. ಈ ಕುಟುಂಬವು ಡೈನೋಫ್ಲಾಜೆಲ್ಲೆಟ್ಗಳು ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಯುಕಾರ್ಯೋಟ್ಗಳ ಗುಂಪಿನಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ. ಈ ಡೈನೋಫ್ಲಾಜೆಲ್ಲೆಟ್ ಹಿಸ್ಟೋನ್ ತರಹದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಕೆಲವು ಡಿನೋಫ್ಲಾಜೆಲ್ಲೆಟ್ಗಳಲ್ಲಿ ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಅನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಡಿಎನ್ಎಯನ್ನು ದ್ರವ-ಸ್ಫಟಿಕದ ಸ್ಥಿತಿಗೆ ಪ್ಯಾಕೇಜ್ ಮಾಡುತ್ತವೆ. ಹಿಸ್ಟೋನ್ ತರಹದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಅನೇಕ ಯೂಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ, ಸೈನೋಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಮತ್ತು ಆರ್ಕೀಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ. ಈ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಎಲ್ಲಾ ಡಿಎನ್ಎ-ಅವಲಂಬಿತ ಕಾರ್ಯಗಳಲ್ಲಿ ಭಾಗವಹಿಸುತ್ತವೆ; ಈ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳಲ್ಲಿ, ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಡಿಎನ್ಎ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ವಾಸ್ತುಶಿಲ್ಪದ ಪಾತ್ರವನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ, ಇದು ಪ್ರತಿಲೇಖನ, ಮರುಸಂಯೋಜನೆ, ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಅಥವಾ ಯಾವುದೇ ಇತರ ಡಿಎನ್ಎ-ಅವಲಂಬಿತ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಂತೆ ರಚನಾತ್ಮಕ ಸಮಗ್ರತೆಯನ್ನು ಕಾಪಾಡಿಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಹಿಸ್ಟೋನ್ಗಳನ್ನು ಮೊದಲ ಬಾರಿಗೆ 0,4 ಎಂ ಎನ್. ಎ. ಸಿ. ಎಲ್ನಲ್ಲಿ ಪ್ರಯೋಗಗಳ ಮೂಲಕ ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲಾಯಿತು. ಈ ಹೆಚ್ಚಿನ ಉಪ್ಪಿನ ಸಾಂದ್ರತೆಗಳಲ್ಲಿ, ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ಡಿಎನ್ಎ ದ್ರಾವಣದಿಂದ ಹೊರಹಾಕಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದರಲ್ಲಿ ಸಿಂಗಲ್ ಸ್ಟ್ರ್ಯಾಂಡೆಡ್ ಡಿಎನ್ಎ ಅನ್ನು ಸೆಲ್ಯುಲೋಸ್ಗೆ ಕೋವೆಲೆಂಟ್ ಆಗಿ ಬಂಧಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಎಲ್ಯುಷನ್ ನಂತರ, ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡಿಎನ್ಎಯನ್ನು ಸುಲಭವಾಗಿ ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಡಿಎನ್ಎಗೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಹೆಚ್ಚಿನ ಆಕರ್ಷಣೆಯನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಯೂಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಹಿಸ್ಟೋನ್ಗಳು ಮತ್ತು HU-ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ನಡುವಿನ ಹೋಲಿಕೆಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುವವರೆಗೂ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಲ್ಲಿ ಹಿಸ್ಟೋನ್ ತರಹದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಇರುವುದೇ ತಿಳಿದಿರಲಿಲ್ಲ, ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಎರಡೂ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಸಮೃದ್ಧತೆ, ಕ್ಷಾರತೆ ಮತ್ತು ಸಣ್ಣ ಗಾತ್ರದಿಂದಾಗಿ. ಹೆಚ್ಚಿನ ತನಿಖೆಯ ನಂತರ, ಎಚ್. ಯು. ಯ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಸಂಯೋಜನೆಯು ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಹಿಸ್ಟೋನ್ಗಳನ್ನು ಹೋಲುತ್ತದೆ ಎಂದು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲಾಯಿತು, ಹೀಗಾಗಿ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಡಿಎನ್ಎ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ನಿಖರವಾದ ಕಾರ್ಯ ಮತ್ತು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಲ್ಲಿನ ಇತರ ಸಂಬಂಧಿತ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಆವಿಷ್ಕಾರಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂಶೋಧನೆಯನ್ನು ಪ್ರೇರೇಪಿಸುತ್ತದೆ. ಡಿಎನ್ಎ ಪ್ರತಿಕೃತಿಯಲ್ಲಿ ಪಾತ್ರವು ಡಿಎನ್ಎ ಪ್ರತಿಕೃತಿಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಡಿಎನ್ಎ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪ್ರಮುಖ ಪಾತ್ರವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಎಂದು ಸಂಶೋಧನೆಯು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ; ಲ್ಯಾಗಿಂಗ್ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ಅನ್ನು ಸ್ಥಿರಗೊಳಿಸುವಲ್ಲಿ ಮತ್ತು ಡಿಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ III ನೊಂದಿಗೆ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುವಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ. ಎಸ್ಚೆರಿಚಿಯಾ ಕೊಲಿ ಜೀವಕೋಶಗಳಲ್ಲಿ ಡಿಎನ್ಎ ಪುನರಾವರ್ತನೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಏಕ-ಎಳೆ ಡಿಎನ್ಎ ಬೈಂಡಿಂಗ್ (ಎಸ್ಎಸ್ಬಿ) ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಪಾತ್ರವನ್ನು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ, ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ವಿವಿಧ ಉಪ್ಪಿನ ಸಾಂದ್ರತೆಯ ಪರಿಸರದಲ್ಲಿ ಎಸ್ಎಸ್ಬಿ ಮತ್ತು ಡಿಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ III ರ χ ಉಪಘಟಕದ ನಡುವಿನ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ. ಲ್ಯಾಗಿಂಗ್ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ಸೈಟ್ನಲ್ಲಿ ಡಿಎನ್ಎ ಪ್ರತಿಕೃತಿಯಲ್ಲಿ, ಡಿಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ III ಡಿಎನ್ಎ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ನಿಂದ ಪ್ರತ್ಯೇಕವಾಗಿ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಹಾಕುತ್ತದೆ. ಅಸ್ಥಿರವಾದ ಎಸ್ಎಸ್ಬಿ/ಡಿಎನ್ಎ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯು ಎಸ್ಎಸ್ಬಿಯ ತ್ವರಿತ ವಿಘಟನೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಡಿಎನ್ಎ ಪುನರಾವರ್ತನೆಯನ್ನು ತಡೆಯುತ್ತದೆ. ಇ. ಕೋಲಿಯಲ್ಲಿ ಎಸ್ಎಸ್ಬಿ ಮತ್ತು ಡಿಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ III ರ χ ಉಪಘಟಕದ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯಿಂದ ಎಸ್ಎಸ್ಡಿಎನ್ಎ ಸ್ಥಿರಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ ಎಂದು ಸಂಶೋಧನೆ ತೋರಿಸಿದೆ, ಹೀಗಾಗಿ ಎಸ್ಎಸ್ಡಿಎನ್ಎಗೆ ಕಿಣ್ವಗಳ ಬಂಧಿಸುವ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುವ ಸರಿಯಾದ ರಚನೆಯನ್ನು ಕಾಪಾಡಿಕೊಳ್ಳುವ ಮೂಲಕ ಪ್ರತಿಕೃತಿಗೆ ತಯಾರಿ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ಇದಲ್ಲದೆ, ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಫೋರ್ಕ್ನಲ್ಲಿ ಡಿಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ III ಗೆ ಎಸ್ಎಸ್ಬಿಯನ್ನು ಬಂಧಿಸುವುದು ಎಸ್ಎಸ್ಬಿಯ ವಿಭಜನೆಯನ್ನು ತಡೆಯುತ್ತದೆ, ಇದರ ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ ಹೊಸ ಡಿಎನ್ಎ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ ಅನ್ನು ಸಂಶ್ಲೇಷಿಸಲು ಡಿಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ III ನ ದಕ್ಷತೆಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ. ಎಚ್-ಎನ್ಎಸ್ನ ಉದಾಹರಣೆಗಳು ಆರಂಭದಲ್ಲಿ, ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಡಿಎನ್ಎ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಡಿಎನ್ಎಯನ್ನು ಸ್ಥಿರಗೊಳಿಸಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತವೆ ಎಂದು ಭಾವಿಸಲಾಗಿತ್ತು. ಪ್ರಸ್ತುತ, ಹಿಸ್ಟೋನ್ ತರಹದ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಯ್ಡ್-ರಚನೆಯ ಪ್ರೋಟೀನ್, ಎಚ್-ಎನ್ಎಸ್ನಿಂದ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯ ನಿಯಂತ್ರಣವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಡಿಎನ್ಎ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಇನ್ನೂ ಅನೇಕ ಕಾರ್ಯಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲಾಗಿದೆ. ಎಚ್-ಎನ್ಎಸ್ ಸುಮಾರು 15.6 ಕೆಡಿಎ ಆಗಿದೆ ಮತ್ತು ಕೆಲವು ವಂಶವಾಹಿಗಳನ್ನು ನಿಗ್ರಹಿಸುವ ಮತ್ತು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವ ಮೂಲಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಲ್ಲಿ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಪ್ರತಿಲೇಖನವನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಎಚ್-ಎನ್ಎಸ್ ಒಂದು ಆಂತರಿಕ ವಕ್ರತೆಯೊಂದಿಗೆ ಡಿಎನ್ಎಗೆ ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ. ಇ. ಕೋಲಿಯಲ್ಲಿ, ಎಚ್-ಎನ್ಎಸ್ ಸ್ಥಿರ ಮತ್ತು ನಿಧಾನಗತಿಯ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಅವಧಿಯಲ್ಲಿ ಆರ್ಆರ್ಎನ್ಎ ಉತ್ಪಾದನೆಯನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುವ ಪಿ1 ಪ್ರವರ್ತಕಕ್ಕೆ ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ. ಆರ್ಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ ಮತ್ತು ಎಚ್-ಎನ್ಎಸ್ ಡಿಎನ್ಎ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಅತಿಕ್ರಮಿಸುವ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ; ಎಚ್-ಎನ್ಎಸ್ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಪ್ರಾರಂಭದ ಸೈಟ್ನಲ್ಲಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುವ ಮೂಲಕ ಆರ್ಆರ್ಎನ್ಎ ಉತ್ಪಾದನೆಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಭಾವಿಸಲಾಗಿದೆ. ಎಚ್-ಎನ್ಎಸ್ ಮತ್ತು ಆರ್ಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ ಎರಡೂ ಪಿ1 ಪ್ರವರ್ತಕದೊಂದಿಗೆ ಬಂಧಿಸಿ ಸಂಕೀರ್ಣವನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. ಎಚ್-ಎನ್ಎಸ್ ಅನ್ನು ಆರ್ಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ನೊಂದಿಗೆ ಪ್ರವರ್ತಕ ಪ್ರದೇಶಕ್ಕೆ ಬಂಧಿಸಿದಾಗ, ಡಿಎನ್ಎಯಲ್ಲಿ ರಚನಾತ್ಮಕ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳು ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ. ಎಚ್-ಎನ್ಎಸ್ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎಗೆ ಬಂಧಿಸುವ ಮೂಲಕ ಮತ್ತು ಅದರ ಅವನತಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗುವ ಮೂಲಕ ಅನುವಾದದ ಮೇಲೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರಬಹುದು ಎಂದು ಸಹ ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. HU HU ಒಂದು ಸಣ್ಣ (10 kDa) ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಗಿದ್ದು, ಇದು ರಚನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಹಿಸ್ಟೋನ್ನಿಂದ ಭಿನ್ನವಾಗಿದೆ ಆದರೆ ಟೋಪೋಯಿಸೊಮೆರೇಸ್ನ ಸಹಾಯದಿಂದ ನಕಾರಾತ್ಮಕ ಸೂಪರ್ ಕಾಯಿಲಿಂಗ್ ಅನ್ನು ವೃತ್ತಾಕಾರದ ಡಿಎನ್ಎಗೆ ಪ್ರೇರೇಪಿಸುವ ಮೂಲಕ ಹಿಸ್ಟೋನ್ನಂತೆಯೇ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ. ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಪುನರಾವರ್ತನೆ, ಮರುಸಂಯೋಜನೆ ಮತ್ತು ದುರಸ್ತಿಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ಅಳವಡಿಸಲಾಗಿದೆ. α-ಹೀಲಿಕಲ್ ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಕೋರ್ ಮತ್ತು ಎರಡು ಧನಾತ್ಮಕ ಆವೇಶದ β-ರಿಬ್ಬನ್ ತೋಳುಗಳೊಂದಿಗೆ, HU ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ಡಿಎಸ್ಡಿಎನ್ಎಗೆ ಕಡಿಮೆ ಆಕರ್ಷಣೆಯೊಂದಿಗೆ ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ ಆದರೆ ಜಂಕ್ಷನ್ಗಳು, ನಿಕ್ಗಳು, ಅಂತರಗಳು, ಫೋರ್ಕ್ಗಳು ಮತ್ತು ಓವರ್ಹ್ಯಾಂಗ್ಗಳಂತಹ ಬದಲಾದ ಡಿಎನ್ಎಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಆಕರ್ಷಣೆಯೊಂದಿಗೆ ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ. ಕಡಿಮೆ ಆಕರ್ಷಣೆಯ ಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ತೋಳುಗಳು ಡಿಎನ್ಎಯ ಸಣ್ಣ ತೋಡುಗೆ ಬಂಧಿಸುತ್ತವೆ; ಹೆಚ್ಚಿನ ಆಕರ್ಷಣೆಯ ಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ, α-ಹೆಲಿಕಲ್ ಕೋರ್ನ ಒಂದು ಅಂಶವು ಡಿಎನ್ಎಯೊಂದಿಗೆ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುತ್ತದೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಈ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಕಾರ್ಯವು ಕೇವಲ ಡಿಎನ್ಎಗೆ ಸೀಮಿತವಾಗಿಲ್ಲ; ಎಚ್ಯು ಆರ್ಎನ್ಎ ಮತ್ತು ಡಿಎನ್ಎ-ಆರ್ಎನ್ಎ ಮಿಶ್ರತಳಿಗಳೊಂದಿಗೆ ಸೂಪರ್ ಕಾಯಿಲ್ಡ್ ಡಿಎನ್ಎಗೆ ಸಮಾನವಾದ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಆರ್ಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ನ ಒತ್ತಡ ಸಿಗ್ಮಾ ಅಂಶದ ಪ್ರತಿಲೇಖನವಾದ ಆರ್ಪಿಓಎಸ್ನ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆಯೊಂದಿಗೆ ಎಚ್ಯು ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಅನುವಾದವನ್ನು ಉತ್ತೇಜಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಇತ್ತೀಚಿನ ಸಂಶೋಧನೆಯು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿದೆ. ಈ ಆರ್ಎನ್ಎ ಕಾರ್ಯಕ್ಕೆ ಹೆಚ್ಚುವರಿಯಾಗಿ, ಎಚ್-ಎನ್ಎಸ್ ಅನ್ನು ನಿಗ್ರಹಿಸುವ ಮೂಲಕ ಪ್ರತಿಲೇಖನವನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುವ ಮತ್ತು ಆರ್ಪಿಓಎಸ್ನ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುವ ಮೂಲಕ ಅನುವಾದವನ್ನು ಉತ್ತೇಜಿಸುವ ಸಣ್ಣ ನಾನ್-ಕೋಡಿಂಗ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ಡಿಎಸ್ಆರ್ಎಯನ್ನು ಎಚ್ಯು ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಸಹ ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಈ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಜೀವಕೋಶಗಳಲ್ಲಿನ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಮತ್ತು ಅನುವಾದದ ಮೇಲೆ HU ಅನೇಕ ಪ್ರಭಾವಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಐ. ಎಚ್. ಎಫ್. ಇಂಟಿಗ್ರೇಷನ್ ಹೋಸ್ಟ್ ಫ್ಯಾಕ್ಟರ್, ಐ. ಎಚ್. ಎಫ್., ಕೇವಲ ಗ್ರಾಮ್ ನೆಗಟಿವ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಯ್ಡ್-ಸಂಬಂಧಿತ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಲ್ಲ. ಇದು 20 ಕೆಡಿಎ ಹೆಟೆರೊಡೈಮರ್ ಆಗಿದ್ದು, ಇದು α ಮತ್ತು β ಉಪಘಟಕಗಳಿಂದ ಕೂಡಿದೆ, ಇದು 5 '-ವಾಟ್ಕಾನ್ ಎನ್ಟಿಟಿಆರ್-3' ಅನುಕ್ರಮಕ್ಕೆ ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಡಿಎನ್ಎಯನ್ನು ಸುಮಾರು 160 ಡಿಗ್ರಿಗಳಷ್ಟು ಬಾಗಿಸುತ್ತದೆ. ಐಎಚ್ಎಫ್ನ β ತೋಳುಗಳು ಡಿಎನ್ಎ ಕಿನ್ಕ್ಗಳನ್ನು ಸ್ಥಿರಗೊಳಿಸಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುವ ಪ್ರೊಲೈನ್ ಅವಶೇಷಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ. ಈ ಕಿನ್ಕ್ಗಳು ಕಾಂಪ್ಯಾಕ್ಟ್ ಡಿಎನ್ಎಗೆ ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಸೂಪರ್ ಕಾಯಿಲಿಂಗ್ಗೆ ಅವಕಾಶ ನೀಡುತ್ತವೆ. ಡಿಎನ್ಎಗೆ ಬಂಧಿಸುವ ವಿಧಾನವು ಅಯಾನುಗಳ ಸಾಂದ್ರತೆಯಂತಹ ಪರಿಸರದ ಅಂಶಗಳನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿರುತ್ತದೆ. ಕೆಸಿಎಲ್ನ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಾಂದ್ರತೆಯೊಂದಿಗೆ, ದುರ್ಬಲ ಡಿಎನ್ಎ ಬಾಗುತ್ತದೆ. ಕೆಸಿಎಲ್ನ ಸಾಂದ್ರತೆಯು 100 ಎಂಎಂಗಿಂತ ಕಡಿಮೆಯಾದಾಗ ಮತ್ತು ಐಹೆಚ್ಎಫ್ ಕೇಂದ್ರೀಕೃತವಾಗಿರದಿದ್ದಾಗ ತೀಕ್ಷ್ಣವಾದ ಡಿಎನ್ಎ ಬಾಗುವಿಕೆಯು ಸಂಭವಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. λ ಫೇಜನ್ನು E.coli ಆಗಿ ಮರುಸಂಯೋಜನೆ ಮಾಡಲು ಅಗತ್ಯವಾದ ಸಹ-ಅಂಶವಾಗಿ ಐ. ಎಚ್. ಎಫ್ ಅನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲಾಯಿತು. ಸಿ. ಆರ್. ಐ. ಎಸ್. ಪಿ. ಆರ್ ಪ್ರಕಾರ I ಮತ್ತು ಪ್ರಕಾರ II ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳಲ್ಲಿ ಐ. ಎಚ್. ಎಫ್ ಸಹ ಪ್ರಮುಖ ಪಾತ್ರ ವಹಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು 2016ರಲ್ಲಿ ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲಾಯಿತು. ಹೊಸ ಸ್ಪೇಸರ್ಗಳನ್ನು ಸಿ. ಆರ್. ಐ. ಎಸ್. ಪಿ. ಆರ್ ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಸಂಯೋಜಿಸಲು ಕ್ಯಾಸ್ 1-ಕ್ಯಾಸ್ 2 ಸಂಕೀರ್ಣಕ್ಕೆ ಅವಕಾಶ ನೀಡುವಲ್ಲಿ ಇದು ಪ್ರಮುಖ ಪಾತ್ರವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಐ. ಎಚ್. ಎಫ್. ನಿಂದ ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಯ ಬಾಗುವಿಕೆಯು ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಪ್ರಮುಖ ಮತ್ತು ಸಣ್ಣ ಚಡಿಗಳಲ್ಲಿನ ಅಂತರವನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಭಾವಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಕ್ಯಾಸ್ 1-ಕ್ಯಾಸ್ 2 ಸಂಕೀರ್ಣವು ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ನೆಲೆಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಪರ್ಕ ಸಾಧಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಇದು ಸಿ. ಆರ್. ಐ. ಎಸ್. ಪಿ. ಆರ್. ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಲ್ಲಿ ಪ್ರಮುಖ ಕಾರ್ಯವಾಗಿದೆ, ಏಕೆಂದರೆ ಇದು ಹೊಸ ಸ್ಪೇಸರ್ಗಳ ಪ್ರದೇಶವನ್ನು ಯಾವಾಗಲೂ ಸಿ. ಆರ್. ಐ. ಎಸ್. ಪಿ. ಆರ್. ಅನುಕ್ರಮದ ಆರಂಭದಲ್ಲಿ ಲೀಡರ್ ಅನುಕ್ರಮದ ಪಕ್ಕದಲ್ಲಿ ಸೇರಿಸುವುದನ್ನು ಖಾತ್ರಿಪಡಿಸುತ್ತದೆ. ಐಎಚ್ಎಫ್ನ ಏಕೀಕರಣದ ಈ ನಿರ್ದೇಶನವು ಕಾಲಾನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಸ್ಪೇಸರ್ಗಳನ್ನು ಸೇರಿಸುವುದನ್ನು ಖಾತ್ರಿಪಡಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಇತ್ತೀಚಿನ ವೈರಲ್ ಸೋಂಕಿನ ವಿರುದ್ಧ ಉತ್ತಮ ರಕ್ಷಣೆಯನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ. ಹೋಲಿಕೆ {| ಕ್ಲಾಸ್ = "ವಿಕಿಟೇಬಲ್" | + ಕೋಷ್ಟಕ 1. ಕೆಲವು ಡಿಎನ್ಎ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಹೋಲಿಕೆ |-! ಡಿಎನ್ಎ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್! ಗಾತ್ರ! ರಚನೆ! ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್! ಪರಿಣಾಮ |-|H-ಎನ್ಎಸ್ |15.6 ಕೆಡಿಎ |exists ಡೈಮರ್ಗಳಲ್ಲಿ ಆರ್ಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ ಅನ್ನು ಪ್ರವರ್ತಕ |binds ಗೆ ಬಾಗಿದ ಡಿಎನ್ಎಗೆ ಬಂಧಿಸುವುದನ್ನು ದೈಹಿಕವಾಗಿ ತಡೆಯಲು, ಇ. ಕೋಲಿ |regulation ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯ ಪಿ1 ಪ್ರವರ್ತಕಕ್ಕೆ ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ.-|H ಯು |10 ಕೆಡಿಎ |α-ಹೆಲಿಕಲ್ ಕೋರ್ ಮತ್ತು ಎರಡು ಧನಾತ್ಮಕ ಆವೇಶದ β-ರಿಬ್ಬನ್ ತೋಳುಗಳು |binds ಡಿಎಸ್ಡಿಎನ್ಎಗೆ ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ಅಲ್ಲದ, ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಷನ್ ಅನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುವ ಸಣ್ಣ ಕೋಡಿಂಗ್ ಅಲ್ಲದ ಆರ್ಎನ್ಎ ಡಿಎಸ್ಆರ್ಎಗೆ ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುವ ಇತರ ಮಾರ್ಗಗಳನ್ನು ಸಂಶೋಧಕರು ಪರಿಶೀಲಿಸುತ್ತಿದ್ದಾರೆ. ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಎಚ್-ಎನ್ಎಸ್ ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ ಸಂಘಟನೆ ಮತ್ತು ಜೀನ್ ನಿಯಂತ್ರಣದಲ್ಲಿ ಪಾತ್ರವಹಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ತಿಳಿದುಬಂದಿದೆ; ಆದಾಗ್ಯೂ, ಇತ್ತೀಚಿನ ಅಧ್ಯಯನಗಳು ಫ್ಲಾಜೆಲ್ಲಾ ಕಾರ್ಯಗಳನ್ನು ಪರೋಕ್ಷವಾಗಿ ನಿಯಂತ್ರಿಸುವಲ್ಲಿ ಅವುಗಳ ಪಾತ್ರವನ್ನು ದೃಢಪಡಿಸಿವೆ. ಎಚ್-ಎನ್ಎಸ್ ಪ್ರಭಾವ ಬೀರುವ ಕೆಲವು ಚಲನಶೀಲ ನಿಯಂತ್ರಕ ಸಂಪರ್ಕಗಳಲ್ಲಿ ಮೆಸೆಂಜರ್ ಅಣು ಸೈಕ್ಲಿಕ್ ಡಿ-ಜಿಎಂಪಿ, ಬಯೋ-ಫಿಲ್ಮ್ ನಿಯಂತ್ರಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಿಎಸ್ಜಿಡಿ ಮತ್ತು ಸಿಗ್ಮಾ ಅಂಶಗಳು, σ (S) ಮತ್ತು σ (F) ಸೇರಿವೆ. ಮುಂದಿನ ಅಧ್ಯಯನಗಳು ಈ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಯ್ಡ್-ಸಂಘಟಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಇತರ ನಿಯಂತ್ರಕ ಮಾರ್ಗಗಳ ಮೂಲಕ ಜೀವಕೋಶದ ಚಲನಶೀಲತೆಯ ಮೇಲೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುವ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ನಿರೂಪಿಸುವ ಗುರಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ. ಇತರ ಸಂಶೋಧಕರು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಸಾಲ್ಮೊನೆಲ್ಲಾ ಎಂಟ್ರಿಕಾ ಸೆರೋವರ್ ಟೈಫಿಮುರಿಯಂ ಅನ್ನು ಸಂಶೋಧಿಸಲು ಬಳಸಿದ್ದಾರೆ, ಇದರಲ್ಲಿ ಟಿ6ಎಸ್ಎಸ್ ವಂಶವಾಹಿಗಳು ಮ್ಯಾಕ್ರೋಫೇಜ್ ಸೋಂಕಿನಿಂದ ಸಕ್ರಿಯಗೊಳ್ಳುತ್ತವೆ. ಎಸ್. ಟೈಫಿಮುರಿಯಂ ಸೋಂಕಿಗೆ ಒಳಗಾದಾಗ, ಟಿ6ಎಸ್ಎಸ್ ಎಚ್-ಎನ್ಎಸ್ ಸೈಲೆನ್ಸಿಂಗ್ನೊಂದಿಗೆ ಸೆನ್ಸ್-ಅಂಡ್-ಕಿಲ್ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನದ ಮೂಲಕ ಅವುಗಳ ದಕ್ಷತೆಯನ್ನು ಸುಧಾರಿಸಬಹುದು. ಹಿಸ್ಟೋನ್ ತರಹದ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಯ್ಡ್ ರಚನೆಯ ಎಚ್-ಎನ್ಎಸ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ನಿಂದ ಟಿ6ಎಸ್ಎಸ್ ಜೀನ್ ಕ್ಲಸ್ಟರ್ ಅನ್ನು ಮೌನಗೊಳಿಸಲು ವರದಿಗಾರರ ಸಮ್ಮಿಳನಗಳು, ಎಲೆಕ್ಟ್ರೋಫೋರೆಟಿಕ್ ಮೊಬಿಲಿಟಿ ಶಿಫ್ಟ್ ಅಸ್ಸೇಗಳು, ಡಿಎನ್ಏಸ್ ಫುಟ್ಪ್ರಿಂಟಿಂಗ್ ಮತ್ತು ಫ್ಲೋರೊಸೆನ್ಸ್ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಕೋಪಿಯನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸುವ ಅಸ್ಸೇಗಳನ್ನು ರಚಿಸಲಾಗಿದೆ. ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್ ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಹಸಿವಿನಿಂದ ಜೀವಕೋಶಗಳಿಂದ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಷನ್ ಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೊಮೇನ್ ಡಿಎನ್ಎ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಸಹ ನೋಡಿ.