KIX domain
ಜೀವರಸಾಯನಶಾಸ್ತ್ರದಲ್ಲಿ, ಕೆಐಎಕ್ಸ್ ಡೊಮೇನ್ (ಕೈನೇಸ್-ಇಂಡ್ಯುಸಿಬಲ್ ಡೊಮೇನ್ (ಕೆಐಡಿ) ಇಂಟರಾಕ್ಟಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್) ಅಥವಾ ಸಿಆರ್ಇಬಿ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್ ಯುಕ್ಯಾರಿಯೋಟಿಕ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಷನಲ್ ಕೋಆಕ್ಟಿವೇಟರ್ಗಳಾದ ಸಿಬಿಪಿ ಮತ್ತು ಪಿ300ಗಳ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೊಮೇನ್ ಆಗಿದೆ. ಇದು ಕೋಆಕ್ಟಿವೇಟರ್ ಮತ್ತು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳ ನಡುವೆ ಹೆಟೆರೊಡೈಮರ್ಗಳ ರಚನೆಗೆ ಡಾಕಿಂಗ್ ತಾಣವಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ. ರಚನಾತ್ಮಕವಾಗಿ, KIX ಡೊಮೇನ್ ಮೂರು α-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳು ಮತ್ತು ಎರಡು ಸಣ್ಣ 310-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಗೋಳಾಕಾರದ ಡೊಮೇನ್ ಆಗಿದೆ. ಕೆಐಎಕ್ಸ್ ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ಮೂಲತಃ 1996 ರಲ್ಲಿ ಸಿಬಿಪಿಯಲ್ಲಿನ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಮತ್ತು ಕನಿಷ್ಠ ಪ್ರದೇಶವಾಗಿ ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲಾಯಿತು, ಇದು ಪ್ರತಿಲೇಖನವನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸಲು ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಟೆಡ್ ಸಿಆರ್ಇಬಿಯೊಂದಿಗೆ ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಸಂವಹನ ನಡೆಸುತ್ತದೆ. ಹೀಗಾಗಿ ಇದನ್ನು ಮೊದಲು ಸಿ. ಆರ್. ಇ. ಬಿ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಯಿತು. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಇದು ಇತರ ಅನೇಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಸಹ ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ನಂತರ ಕಂಡುಹಿಡಿದಾಗ, ಹೆಚ್ಚು ಸಾಮಾನ್ಯವಾದ ಹೆಸರು KIX ಡೊಮೇನ್ ಜನಪ್ರಿಯವಾಯಿತು. ಕೆಐಎಕ್ಸ್ ಡೊಮೇನ್ ಎರಡು ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆಃ ಆನ್ಕೋಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಿ-ಮೈಬ್ ಹೆಸರಿನ "ಸಿ-ಮೈಬ್ ಸೈಟ್" ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೋ-ಆಂಕೋಜೀನ್ ಎಂಎಲ್ಎಲ್ (ಮಿಶ್ರ ವಂಶಾವಳಿಯ ಲ್ಯುಕೇಮಿಯಾ, ಕೆಎಂಟಿ2ಎ) ಹೆಸರಿನ "ಎಂಎಲ್ಎಲ್ ಸೈಟ್". ಪ್ಯಾರಾಲೋಗಸ್ ಕೋಆಕ್ಟಿವೇಟರ್ಗಳಾದ ಸಿ. ಬಿ. ಪಿ. (ಸಿ. ಆರ್. ಇ. ಬಿ. ಬಿ. ಪಿ.) ಮತ್ತು ಪಿ300 (ಇ. ಪಿ. 300) ಗಳನ್ನು ಪ್ರತಿಲೇಖನವನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸಲು ಡಿ. ಎನ್. ಎ-ಬದ್ಧ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳಿಗೆ ನೇಮಿಸಿಕೊಳ್ಳಲಾಗುತ್ತದೆ. ಕೋಆಕ್ಟಿವೇಟರ್ಗಳು ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳೊಂದಿಗೆ ಪ್ರೋಟೀನ್-ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಂಪರ್ಕಗಳ ಮೂಲಕ ಮಾತ್ರ ಪರೋಕ್ಷವಾಗಿ ಡಿಎನ್ಎಯಲ್ಲಿ ಪ್ರವರ್ತಕರು ಮತ್ತು ವರ್ಧಕಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಯೋಜಿಸಬಹುದು. ಸಿಬಿಪಿ ಮತ್ತು ಪಿ300 ಎರಡು ರೀತಿಯಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿಲೇಖನವನ್ನು ಸಮನ್ವಯವಾಗಿ ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತವೆಃ ಮೊದಲನೆಯದಾಗಿ, ತಮ್ಮ ಆಂತರಿಕ ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಅಸಿಟೈಲ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಫರೇಸ್ ಚಟುವಟಿಕೆಯ ಮೂಲಕ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಅನ್ನು ಮರುರೂಪಿಸುವ ಮೂಲಕ ಮತ್ತು ವಿಶ್ರಾಂತಿ ನೀಡುವ ಮೂಲಕ, ಮತ್ತು ಎರಡನೆಯದಾಗಿ, ಆರ್ಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ II ನಂತಹ ತಳದ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಯಂತ್ರೋಪಕರಣಗಳನ್ನು ನೇಮಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ಮೂಲಕ. KIX ಡೊಮೇನ್ ಪ್ರಸ್ತಾವಿತ GACKIX ಡೊಮೇನ್ ಸೂಪರ್ ಫ್ಯಾಮಿಲಿಗೆ ಸೇರಿದೆ. GACKIX ಸಂಬಂಧಿತ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿ ರಚನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಮತ್ತು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಹೆಚ್ಚು ಏಕರೂಪದ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಇದಕ್ಕೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ GAL11/ARC105 (MED15), ಸಸ್ಯ ಪ್ರೋಟೀನ್ CBP-ರೀತಿಯ, ಮತ್ತು CBP ಮತ್ತು P300 ನಿಂದ KIX ಡೊಮೇನ್ನ ಹೆಸರನ್ನು ಇಡಲಾಗಿದೆ. ಹೆಚ್ಚುವರಿ ನಿದರ್ಶನಗಳಲ್ಲಿ ಆರ್ಇಸಿಕ್ಯುಎಲ್5 ಮತ್ತು ಸಂಬಂಧಿತ ಸಸ್ಯ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಸೇರಿವೆ. ಇವೆಲ್ಲವೂ ವಿವಿಧ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಆಕ್ಟಿವೇಶನ್ ಡೊಮೇನ್ನೊಂದಿಗೆ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುವ KIX ಡೊಮೇನ್ ಅಥವಾ KIX-ಸಂಬಂಧಿತ ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. KIX ಡೊಮೇನ್, KIX-ಸಂಬಂಧಿತ ಡೊಮೇನ್ ಮತ್ತು GACKIX ಡೊಮೇನ್ ನಡುವಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸವು ನಡೆಯುತ್ತಿರುವ ಚರ್ಚೆಗೆ ಒಳಪಟ್ಟಿರುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿ ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸಲಾಗಿಲ್ಲ. ಸಂಪೂರ್ಣ ಸಿಬಿಪಿ/ಪಿ300 ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕೆಐಎಕ್ಸ್ ಡೊಮೇನ್ನ ಹೊರತಾಗಿ, ಸಿಬಿಪಿ ಮತ್ತು ಪಿ300 ಗೊಂದಲಕ್ಕೀಡಾಗದ ಅನೇಕ ಇತರ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ (ಸಂಖ್ಯೆಗಳು ಎಎ ಸಂಖ್ಯೆಗಳು): ಸಿಎಚ್1/ಟಿಎಝಡ್1 ಡೊಮೇನ್, ಸಿಬಿಪಿ [347-433], ಪಿ300 [323-423] ಕೆಐಎಕ್ಸ್ ಡೊಮೇನ್, ಸಿಬಿಪಿ [587-666], ಪಿ300 [566-645] ಬ್ರೋಮೋಡೋಮೈನ್, ಸಿಬಿಪಿ [1103-1175], ಪಿ300 [1067-1139] ಸಿಎಚ್2 ಡೊಮೇನ್ (), ಸಿಬಿಪಿ [1191-1317, ಪಿ300 [1155-1280]. ಎಚ್ಎಟಿ ಡೊಮೇನ್, ಸಿಬಿಪಿ [1323-1700], ಪಿ300 [1287-1663] ಸಿಎಚ್3/ಝಡ್ಝಡ್ ಡೊಮೇನ್, ಸಿಬಿಪಿ [1701-1744], ಪಿ300 [1664-1707] ಸಿಎಚ್3/ಟಿಎಝಡ್2 ಡೊಮೇನ್, ಸಿಬಿಪಿ [1765-1846], ಪಿ300 [1728-1809] ಐಆರ್ಎಫ್-3 ಬೈಂಡಿಂಗ್ (ಐ-ಬಿಐಡಿ), ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯರ್ ರಿಸೆಪ್ಟರ್ ಕೋಆಕ್ಟಿವೇಟರ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ (ಎನ್ಸಿಬಿಡಿ), ಅಥವಾ ಎಸ್ಆರ್ಸಿ1 ಇಂಟರಾಕ್ಷನ್ ಡೊಮೇನ್ (ಎಸ್ಐಡಿ;), ಸಿಬಿಪಿ [2020-2113, ಪಿ300 [1992-2098. ಎಲ್ಲಾ ಮೂರು ಸಿಎಚ್ (ಸಿಸ್ಟೀನ್/ಹಿಸ್ಟಿಡಿನ್-ಸಮೃದ್ಧ) ಡೊಮೇನ್ಗಳು ಸತು ಬೆರಳುಗಳಾಗಿವೆ. ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳು ಮಾನವ ಮತ್ತು ಪ್ರಾಣಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳುಃ ಯೀಸ್ಟ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಃ ವೈರಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಃ ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು KIXBASE, KIX-ಸೂಪರ್ ಫ್ಯಾಮಿಲಿ ಡೊಮೇನ್ಗಳು ಮತ್ತು PDB ರಚನೆಗಳ ಡೇಟಾಬೇಸ್ (HMM ತರಬೇತಿ ಡೇಟಾಸೆಟ್) ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳು ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ