SET domain
SET ಡೊಮೇನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೊಮೇನ್ ಆಗಿದ್ದು ಅದು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಮೀಥೈಲ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಫರೇಸ್ ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಇದನ್ನು ಮೂಲತಃ ಡ್ರೊಸೊಫಿಲಾ ಟ್ರಿಥೊರಾಕ್ಸ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ನಲ್ಲಿರುವ ದೊಡ್ಡ ಸಂರಕ್ಷಿತ ಪ್ರದೇಶದ ಭಾಗವೆಂದು ಗುರುತಿಸಲಾಯಿತು ಮತ್ತು ತರುವಾಯ ಡ್ರೊಸೊಫಿಲಾ ಸು (ವರ್) 3-9 ಮತ್ತು 'ಎನ್ಹಾನ್ಸರ್ ಆಫ್ ಝೆಸ್ಟೆ' ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಗುರುತಿಸಲಾಯಿತು, ಇದರಿಂದ ಎಸ್ಇಟಿ ಎಂಬ ಸಂಕ್ಷಿಪ್ತ ರೂಪವನ್ನು [ಸು (ವರ್) 3-9, ಎನ್ಹಾನ್ಸರ್-ಆಫ್-ಝೆಸ್ಟೆ ಮತ್ತು ಟ್ರಿಥೊರಾಕ್ಸ್] ಪಡೆಯಲಾಗಿದೆ. ರಚನೆ SET ಡೊಮೇನ್ ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ದೊಡ್ಡ ಮಲ್ಟಿಡೋಮೈನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಒಂದು ಭಾಗವಾಗಿ ಕಾಣಿಸಿಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ, ಮತ್ತು ಇತ್ತೀಚೆಗೆ ವಿಭಿನ್ನ ಡೊಮೇನ್ ಸಂಯೋಜನೆಗಳೊಂದಿಗೆ ವಿಭಿನ್ನ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಮೂರು ರಚನೆಗಳನ್ನು ವಿವರಿಸಲಾಗಿದೆಃ ನ್ಯೂರೋಸ್ಪೋರಾ ಕ್ರಾಸಾ DIM-5, ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಲೈಸಿನ್ ಮೀಥೈಲ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಫರೇಸ್ಗಳ (HKMTs) ಸು (ವರ್) ಕುಟುಂಬದ ಸದಸ್ಯ, ಇದು ಲೈಸಿನ್ 9 ಮೇಲೆ ಹಿಸ್ಟೋನ್ H3 ಅನ್ನು ಮೀಥೈಲೇಟ್ ಮಾಡುತ್ತದೆ, ಮಾನವ SETD7 (SET7 ಅಥವಾ SET9 ಎಂದೂ ಕರೆಯಲ್ಪಡುತ್ತದೆ), ಇದು ಲೈಸಿನ್ 4 ಗಾರ್ಡನ್ ಬಟಾಣಿ ರುಬಿಸ್ಕೋ LSMT ಮೇಲೆ H3 ಅನ್ನು ಮೀಥೈಲೇಟ್ ಮಾಡುತ್ತದೆ, ಇದು ಹಿಸ್ಟೋನ್ಗಳನ್ನು ಮಾರ್ಪಡಿಸದ ಕಿಣ್ವವಾಗಿದೆ, ಆದರೆ ಬದಲಿಗೆ ಕಿಣ್ವ ರುಬಿಸ್ಕೋದ ದೊಡ್ಡ ಉಪಘಟಕದ ಹೊಂದಿಕೊಳ್ಳುವ ಬಾಲದಲ್ಲಿ ಲೈಸಿನ್ 14 ಅನ್ನು ಮೀಥೈಲೇಟ್ ಮಾಡುತ್ತದೆ. SET ಡೊಮೇನ್ ಸ್ವತಃ ಅಸಾಮಾನ್ಯ ರಚನೆಯಾಗಿ ಹೊರಹೊಮ್ಮಿತು. ಎಲ್ಲಾ ಮೂರು ಅಧ್ಯಯನಗಳಲ್ಲಿ, ಎಲೆಕ್ಟ್ರಾನ್ ಸಾಂದ್ರತೆಯ ನಕ್ಷೆಗಳು ಅಡೋಮೆಟ್ ಅಥವಾ ಅಡೋಹ್ಸಿ ಕೋಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ನ ಸ್ಥಳವನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿದರೂ, SET ಡೊಮೇನ್ ಕ್ಯಾನೊನಿಕಲ್/ಅಡೋಮೆಟ್-ಅವಲಂಬಿತ ಮೀಥೈಲ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಫರೇಸ್ ಪದರಕ್ಕೆ ಯಾವುದೇ ಹೋಲಿಕೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿಲ್ಲ. ಎಸ್ಇಟಿ ಡೊಮೇನ್ನ ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಮೋಟಿಫ್ನಲ್ಲಿ ಕಟ್ಟುನಿಟ್ಟಾಗಿ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿರುವ ಟೈರೋಸಿನ್, ಸಬ್ಸ್ಟ್ರೇಟ್ ಲೈಸಿನ್ನ ಪ್ರೊಟೋನೇಟೆಡ್ ಅಮೈನೋ ಗುಂಪಿನಿಂದ ಪ್ರೋಟಾನ್ ಅನ್ನು ಹೊರತೆಗೆಯುವಲ್ಲಿ ತೊಡಗಬಹುದು, ಇದು ಅಡೋಮೆಟ್ ಕೋಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ನ ಸಲ್ಫೋನಿಯಂ ಮೀಥೈಲ್ ಗುಂಪಿನ ಮೇಲೆ ಅದರ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಫಿಲಿಕ್ ದಾಳಿಯನ್ನು ಉತ್ತೇಜಿಸುತ್ತದೆ. ಕೋಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ನ ಮೇಲೆ ತಮ್ಮ ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ತಲಾಧಾರಗಳನ್ನು ಬಂಧಿಸುವ ಪ್ರವೃತ್ತಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಶಾಸ್ತ್ರೀಯ ಪ್ರಕಾರದ ಅಡೋಮೆಟ್-ಅವಲಂಬಿತ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮೀಥೈಲ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಫರೇಸ್ಗಳಿಗೆ ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿ, ಅಡೋಮೆಟ್ ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಸೀಳಿನಲ್ಲಿ ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ರುಬಿಸ್ಕೋ ಎಲ್ಎಸ್ಎಂಟಿ ರಚನೆಯಿಂದ ಗುರುತಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ ತಲಾಧಾರವನ್ನು ಕಿಣ್ವದಿಂದ ಬಿಡುಗಡೆ ಮಾಡದೆಯೇ ಅನೇಕ ಸುತ್ತುಗಳ ಮೆತಿಲೀಕರಣಕ್ಕೆ ಹೇಗೆ ಒಳಪಡಿಸಬಹುದು ಎಂಬುದನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಇದಕ್ಕೆ ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿ, SET7/9 ತನ್ನ ತಲಾಧಾರಕ್ಕೆ ಕೇವಲ ಒಂದು ಮೀಥೈಲ್ ಗುಂಪನ್ನು ಮಾತ್ರ ಸೇರಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಗುತ್ತದೆ. SET ಡೊಮೇನ್ ಮತ್ತು ಮಯೋಟುಬುಲಾರಿನ್-ಸಂಬಂಧಿತ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಸಂಯೋಜನೆಯು ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ನಿಯಂತ್ರಣವನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಎಸ್ಇಟಿ ಡೊಮೇನ್-ಹೊಂದಿರುವ ಡ್ರೊಸೊಫಿಲಾ ಮೆಲನೊಗಾಸ್ಟರ್ (ಹಣ್ಣಿನ ನೊಣ) ಪ್ರೋಟೀನ್, ಝೆಸ್ಟೆಯ ವರ್ಧಕ, ವಿಭಾಗ ನಿರ್ಣಯದಲ್ಲಿ ಒಂದು ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಮತ್ತು ಸಸ್ತನಿ ಹೋಮೋಲಾಗ್ ಜೀನ್ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಮತ್ತು ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ರಚನೆಯ ನಿಯಂತ್ರಣದಲ್ಲಿ ಭಾಗಿಯಾಗಿರಬಹುದು. ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಲೈಸಿನ್ ಮೆತಿಲೀಕರಣವು ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಕಾರ್ಯ ಮತ್ತು ಜೀನ್ ಕಾರ್ಯದ ಎಪಿಜೆನೆಟಿಕ್ ನಿಯಂತ್ರಣವನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುವ ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಸಂಕೇತದ ಭಾಗವಾಗಿದೆ. ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಲೈಸಿನ್ ಮೀಥೈಲ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಫರೇಸ್ಗಳು (ಎಚ್ಎಮ್ಟಿಎಸ್) ವಿವಿಧ ಸ್ವೀಕಾರಕ ಲೈಸಿನ್ಗಳಿಗೆ ಅವುಗಳ ತಲಾಧಾರದ ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆ ಮತ್ತು ಅವು ವರ್ಗಾಯಿಸುವ ಮೀಥೈಲ್ ಗುಂಪುಗಳ (ಒಂದು, ಎರಡು, ಅಥವಾ ಮೂರು) ಸಂಖ್ಯೆಗೆ ಅವುಗಳ ಉತ್ಪನ್ನದ ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆ ಎರಡರಲ್ಲೂ ಭಿನ್ನವಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಕೇವಲ ಒಂದು ವಿನಾಯಿತಿಯೊಂದಿಗೆ, ಎಚ್ಎಮ್ಟೇಸ್ಗಳು ಎಸ್ಇಟಿ ಕುಟುಂಬಕ್ಕೆ ಸೇರಿವೆ, ಇದನ್ನು ಎಸ್ಇಟಿ ಡೊಮೇನ್ನ ಸುತ್ತಮುತ್ತಲಿನ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ಪ್ರಕಾರ ವರ್ಗೀಕರಿಸಬಹುದು. ಮಾನವನ SET7/9, ಒಂದು ಮೊನೊ-ಮೀಥೈಲೇಸ್ನ ರಚನಾತ್ಮಕ ಅಧ್ಯಯನಗಳು, ಹಿಸ್ಟೋನ್-ಗುರಿಗಾಗಿ ಕಿಣ್ವದ ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆಗೆ ಆಣ್ವಿಕ ಆಧಾರವನ್ನು ಮತ್ತು ಮೀಥೈಲೇಷನ್ ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆಗಳನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸುವಲ್ಲಿ SET ಡೊಮೇನ್ನಲ್ಲಿನ ಅಸ್ಥಿರ ಅವಶೇಷಗಳ ಪಾತ್ರಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿವೆ. ಎಸ್. ಯು. ವಿ. 39 ಎಸ್. ಇ. ಟಿ. ಕುಟುಂಬದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವಂತೆ, ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಪೂರ್ವ-ಎಸ್. ಇ. ಟಿ. ಡೊಮೇನ್ (), ಒಂಬತ್ತು ಅಸ್ಥಿರ ಸಿಸ್ಟೀನ್ ಅವಶೇಷಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದು, ಅವುಗಳನ್ನು ಎರಡು ಭಾಗಗಳಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇವು ಬದಲಾಗುವ ಉದ್ದದ ಪ್ರದೇಶದಿಂದ ಬೇರ್ಪಟ್ಟಿವೆ. ಈ 9 ಸಿಸ್ಟೀನ್ಗಳು 3 ಸತು ಅಯಾನುಗಳನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸಿ ತ್ರಿಕೋನ ಸಮೂಹವನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ, ಅಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಸತು ಅಯಾನುಗಳನ್ನು 4 ನಾಲ್ಕು ಸಿಸ್ಟೀನ್ಗಳು ಸಂಯೋಜಿಸಿ ಟೆಟ್ರಾಹೆಡ್ರಲ್ ಸಂರಚನೆಯನ್ನು ನೀಡುತ್ತವೆ. ಈ ಡೊಮೇನ್ನ ಕಾರ್ಯವು ರಚನಾತ್ಮಕವಾಗಿದ್ದು, ಯಾದೃಚ್ಛಿಕ ಸುರುಳಿಗಳ 2 ಉದ್ದದ ಭಾಗಗಳನ್ನು ಒಟ್ಟಿಗೆ ಹಿಡಿದಿಟ್ಟುಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಬಾಲದೊಂದಿಗೆ ಸಂವಹನ ಮಾಡದಿದ್ದಾಗ ಮತ್ತು ಸತುವಿನ ಅನುಪಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿ ಪೋಸ್ಟ್-ಎಸ್ಇಟಿ ಡೊಮೇನ್ () ಸೇರಿದಂತೆ ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಪ್ರದೇಶವು ಅಸ್ತವ್ಯಸ್ತಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಎಸ್ಇಟಿ ನಂತರದ ಡೊಮೇನ್ನಲ್ಲಿರುವ ಮೂರು ಸಂರಕ್ಷಿತ ಸಿಸ್ಟೀನ್ಗಳು ಎಸ್ಇಟಿ ಡೊಮೇನ್ ಸಕ್ರಿಯ ಸೈಟ್ಗೆ ಹತ್ತಿರವಿರುವ ಗಂಟು ತರಹದ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ ನಾಲ್ಕನೇ ಸಂರಕ್ಷಿತ ಸಿಸ್ಟೀನ್ಗೆ ಜೋಡಿಸಿದಾಗ ಸತು-ಬಂಧಿಸುವ ತಾಣವನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ. ಎಸ್-ಅಡೆನೊಸಿಲ್-ಎಲ್-ಮೆಥಿಯೋನಿನ್-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಮತ್ತು ಹಿಸ್ಟೋನ್ ಬಾಲ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳಲ್ಲಿ ಭಾಗವಹಿಸುವ ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಅವಶೇಷಗಳನ್ನು ಎಸ್ಇಟಿ ನಂತರದ ರಚನಾತ್ಮಕ ಪ್ರದೇಶವು ತರುತ್ತದೆ. ಮೂರು ಸಂರಕ್ಷಿತ ಸಿಸ್ಟೀನ್ ಅವಶೇಷಗಳು ಎಚ್ಎಮ್ಟೇಸ್ ಚಟುವಟಿಕೆಗೆ ಅತ್ಯಗತ್ಯವಾಗಿವೆ, ಏಕೆಂದರೆ ಸೆರಿನ್ನೊಂದಿಗೆ ಬದಲಿಸುವುದರಿಂದ ಎಚ್ಎಮ್ಟೇಸ್ ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು ರದ್ದುಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಮಾನವ ಜೀನ್ಗಳ ಎನ್ಕೋಡಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಉದಾಹರಣೆಗಳೆಂದರೆಃ ASH1L, SET ಡೊಮೇನ್ (AWS) EHMT1 (FP13812), EHMT2 (BAT8), EZH1, EZH2MLL, MLL2, MLL3, MLL5NSD1 PRDM1, PRDM2, PRDM5SETD1A, SETD2, SETD3, SETD4, SETD5, SETD6, SETD7, SETD8, SETDB1, SETDB2, SETMAR, SMYD1, SMYD3.