Gard model
ವಿಕಸನೀಯ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರದಲ್ಲಿ, GARD (ಗ್ರೇಡೆಡ್ ಆಟೋಕ್ಯಾಟಾಲಿಸಿಸ್ ರೆಪ್ಲಿಕೇಷನ್ ಡೊಮೈನ್) ಮಾದರಿಯು ಹೋಮಿಯೋಸ್ಟಾಟಿಕ್-ಬೆಳವಣಿಗೆ ಮತ್ತು ಸಂಯೋಜನೆಯ-ಜೋಡಣೆಗಳ ವಿದಳನಕ್ಕೆ ಸಾಮಾನ್ಯ ಚಲನ ಮಾದರಿಯಾಗಿದ್ದು, ಲಿಪಿಡ್ಗಳ ಕಡೆಗೆ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಅನ್ವಯವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಅಬಿಯೋಜೆನೆಸಿಸ್ನ ಸಂದರ್ಭದಲ್ಲಿ, ಲಿಪಿಡ್-ಪ್ರಪಂಚವು ಲಿಪಿಡ್ಗಳಂತಹ ಸರಳ ಅಣುಗಳ ಜೋಡಣೆಗಳು ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಬಹುದು ಮತ್ತು ಹರಡಬಹುದು, ಹೀಗೆ ವಿಕಾಸಕ್ಕೆ ಒಳಗಾಗಬಹುದು ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಈ 'ಸಂಯೋಜನೆಯ ಸಭೆಗಳು' ಜೀವನದ ಮೂಲದಲ್ಲಿ ಒಂದು ಪಾತ್ರವನ್ನು ವಹಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸಲಾಗಿದೆ. ಕಲ್ಪನೆಯೆಂದರೆ, ಪೀಳಿಗೆಯಾದ್ಯಂತ ವರ್ಗಾವಣೆಯಾಗುವ ಮಾಹಿತಿಯು ಸಂಯೋಜಿತ ಮಾಹಿತಿಯಾಗಿದೆ-ಜೋಡಣೆಯೊಳಗಿನ ಅಣುಗಳ ವಿವಿಧ ಪ್ರಕಾರಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರಮಾಣಗಳು. ಇದು ಆರ್ಎನ್ಎ ಅಥವಾ ಡಿಎನ್ಎಯಲ್ಲಿ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಮಾಹಿತಿಯಿಂದ ಭಿನ್ನವಾಗಿದೆ, ಇದು ಅಂತಹ ಅಣುವಿನಲ್ಲಿನ ಬೇಸ್ಗಳ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಅನುಕ್ರಮವಾಗಿದೆ. ಹೀಗಾಗಿ, ಈ ಮಾದರಿಯನ್ನು ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ವಿಶ್ವ ಊಹೆಗೆ ಪರ್ಯಾಯ ಅಥವಾ ಪೂರ್ವಜರಾಗಿ ನೋಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ಮಾದರಿಯು ಜೋಡಣೆಯ ಸಂಯೋಜನೆಯ ವಾಹಕವನ್ನು ಹೀಗೆ ಬರೆಯಲಾಗಿದೆಃ ಜೋಡಣೆಯೊಳಗೆ ಲಿಪಿಡ್ ಟೈಪ್ I ನ ಆಣ್ವಿಕ ಎಣಿಕೆಗಳು ಎಲ್ಲಿವೆ, ಮತ್ತು ಎನ್ಜಿ ಎಂದರೆ ಎಷ್ಟು ವಿಭಿನ್ನ ಲಿಪಿಡ್ ಪ್ರಕಾರಗಳು ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿವೆ (ಸಂಗ್ರಹದ ಗಾತ್ರ). ಅಣುವಿನ ಪ್ರಕಾರ I ರ ಎಣಿಕೆಯಲ್ಲಿನ ಬದಲಾವಣೆಯನ್ನು ಹೀಗೆ ವಿವರಿಸಲಾಗಿದೆಃ ಮತ್ತು ಬೇಸಲ್ ಫಾರ್ವರ್ಡ್ (ಜಾಯಿನಿಂಗ್) ಮತ್ತು ಬ್ಯಾಕ್ವರ್ಡ್ (ಲೀವಿಂಗ್) ದರ ಸ್ಥಿರಾಂಕಗಳು, βij ಎಂಬುದು ಪರಿಸರದ ಪ್ರಕಾರ I ಮೇಲೆ ಜೋಡಣೆಯೊಳಗೆ ಅಣುವಿನ ಪ್ರಕಾರ J ನಿಂದ ಉಂಟಾಗುವ ಋಣಾತ್ಮಕವಲ್ಲದ ದರ ವರ್ಧನೆಯಾಗಿದೆ, ಮತ್ತು ρ ಎಂಬುದು ಪ್ರತಿ ಅಣುವಿನ ಪ್ರಕಾರದ ಪರಿಸರದ ಸಾಂದ್ರತೆಯಾಗಿದೆ. β ಅನ್ನು ನಿರ್ದೇಶಿತ, ತೂಕದ, ಸಂಕೀರ್ಣ ಜಾಲವಾಗಿ ನೋಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ಜೋಡಣೆಯ ಪ್ರಸ್ತುತ ಗಾತ್ರವು. ಜೋಡಣೆಯು ಗರಿಷ್ಠ ಗಾತ್ರವನ್ನು ತಲುಪಿದ ನಂತರ ವಿದಳನ ಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಹೇರುವ ಮೂಲಕ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯನ್ನು ಸಮತೋಲನದಿಂದ ದೂರ ಇಡಲಾಗುತ್ತದೆ, ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಎನ್ಜಿ ಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಎನ್ ಮ್ಯಾಕ್ಸ್. ಈ ವಿಭಜನೆಯ ಕ್ರಿಯೆಯು ಒಂದೇ ಗಾತ್ರದ ಎರಡು ಸಂತತಿಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಅವುಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದನ್ನು ಮತ್ತೆ ಬೆಳೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ಈ ಮಾದರಿಯು ಗಿಲ್ಲೆಸ್ಪಿ ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಮಾಂಟೆ ಕಾರ್ಲೊ ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್ ಆಧಾರಿತ ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್ಗಳಿಗೆ ಒಳಪಟ್ಟಿರುತ್ತದೆ. 2010 ರಲ್ಲಿ, ಇಯರ್ಸ್ ಸ್ಜಾತ್ಮರಿ ಮತ್ತು ಸಹಯೋಗಿಗಳು GARD ಅನ್ನು ಮೂಲರೂಪದ ಚಯಾಪಚಯ-ಮೊದಲ ಸಾಕ್ಷಾತ್ಕಾರವಾಗಿ ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಿದ್ದಾರೆ. ಅವರು ಮಾದರಿಯಲ್ಲಿ ಆಯ್ಕೆ ಗುಣಾಂಕವನ್ನು ಪರಿಚಯಿಸಿದ್ದಾರೆ, ಇದು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಗುರಿಗೆ ಅವು ಎಷ್ಟು ಹೋಲುತ್ತವೆ ಅಥವಾ ಭಿನ್ನವಾಗಿವೆ ಎಂಬುದರ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಜೋಡಣೆಗಳ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ದರವನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ ಅಥವಾ ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಸಭೆಯ ಶ್ರೇಯಾಂಕವು ಆಯ್ಕೆಯ ಒತ್ತಡದಿಂದ ಪ್ರಭಾವಿತವಾಗಿಲ್ಲ ಎಂದು ಅವರು ಕಂಡುಕೊಂಡರು ಮತ್ತು GARD ಡಾರ್ವಿನ್ನ ವಿಕಾಸವನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುವುದಿಲ್ಲ ಎಂದು ತೀರ್ಮಾನಿಸಿದರು. 2012ರಲ್ಲಿ ಈ ಟೀಕೆಯು ತಪ್ಪಾಗಿದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಯಿತು ಮತ್ತು ಇದನ್ನು ಡೊರಾನ್ ಲ್ಯಾನ್ಸೆಟ್ ಮತ್ತು ಓಮರ್ ಮಾರ್ಕೋವಿಚ್ ನಿರಾಕರಿಸಿದರು. 2010 ರ ಪ್ರಬಂಧದ ಎರಡು ಪ್ರಮುಖ ನ್ಯೂನತೆಗಳೆಂದರೆಃ (1) ಅವರು ಸಾಮಾನ್ಯ ಸಭೆಯ ಮೇಲೆ ಕೇಂದ್ರೀಕರಿಸಿದ್ದಾರೆ ಮತ್ತು ಸಂಯೋಜನೆ ಅಥವಾ ಸಂಯೋಜನೆಯ ಮೇಲೆ ಅಲ್ಲ (ಅನುಕ್ರಮವಾಗಿ ನಿಷ್ಠೆಯಿಂದ ಪುನರಾವರ್ತಿಸುವ ಮತ್ತು ಕ್ವಾಸಿಸ್ ಪ್ರಭೇದಗಳು); (2) ಅವರು ಆಯ್ಕೆಯನ್ನು ಪರೀಕ್ಷಿಸಲು ಒಂದೇ, ಯಾದೃಚ್ಛಿಕ, ಅನುಕರಣೆಯನ್ನು ಮಾತ್ರ ಮಾಡಿದ್ದಾರೆ. ಕ್ವಾಸಿಸ್ಪೀಸೀಸ್ ಕ್ವಾಸಿಸ್ಪೀಸೀಸ್ ಮಾದರಿಯು ತುಲನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ರೂಪಾಂತರಗಳೊಂದಿಗೆ ಪುನರಾವರ್ತಿಸುವ ಪ್ರತಿಕೃತಿಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು ವಿವರಿಸುತ್ತದೆ. ರೂಪಾಂತರಗಳು ಮತ್ತು ಬೆನ್ನಿನ ರೂಪಾಂತರಗಳಿಂದಾಗಿ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯು ಅಂತಿಮವಾಗಿ ಮಾಸ್ಟರ್-ರೆಪ್ಲಿಕೇಟರ್ (ಮಾಸ್ಟರ್ ಸೀಕ್ವೆನ್ಸ್) ಸುತ್ತ ಕೇಂದ್ರೀಕೃತವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಜಿ. ಎ. ಆರ್. ಡಿ. ಯ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯು ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ವೈರಸ್ಗಳಂತಹ ಶಾಸ್ತ್ರೀಯ ಕ್ವಾಸಿಸ್ ಪ್ರಭೇದಗಳಂತೆಯೇ ಮಾಸ್ಟರ್-ಕಾಂಪೊಟೈಪ್ನ ಸುತ್ತಲೂ ಕ್ವಾಸಿಸ್ ಪ್ರಭೇದವನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ದೋಷ ದುರಂತವನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಅಬಿಯೋಜೆನೆಸಿಸ್ ಪ್ರೊಟೊಸೆಲ್ ರೆಫರೆನ್ಸಸ್ ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು GARD10 MATLAB ಕೋಡ್ ಅನ್ನು ಸಹ ನೋಡಿ (ಮಾರ್ಕೋವಿಚ್ ಮತ್ತು ಲ್ಯಾನ್ಸೆಟ್, 2012 ಅನ್ನು ನೋಡಿ): https://github.com/ModelingOriginsofLife/GARD GARD ಅನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿದ ವೀಜ್ಮನ್ ಇನ್ಸ್ಟಿಟ್ಯೂಟ್ ಆಫ್ ಸೈನ್ಸ್ನ ಡೊರಾನ್ ಲ್ಯಾನ್ಸೆಟ್ ಮುಖಪುಟ. ವೀಜ್ಮನ್ ಇನ್ಸ್ಟಿಟ್ಯೂಟ್ನಲ್ಲಿ ಒರಿಜಿನ್ ಆಫ್ ಲೈಫ್ (OOL). ವಿಕಾಸಾತ್ಮಕ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ ಜೀವನದ ಮೂಲ ಸಂಭವನೀಯ ಅನುಕರಣೆ