Vitamin B12-binding domain
ಆಣ್ವಿಕ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರದಲ್ಲಿ, ವಿಟಮಿನ್ ಬಿ12-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್ ಎಂಬುದು ಕೋಬಾಲಮಿನ್ (ವಿಟಮಿನ್ ಬಿ12) ನೊಂದಿಗೆ ಬಂಧಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೊಮೇನ್ ಆಗಿದೆ. ಇದು ಕೋಬಾಲ್ಟನ್ನು ಮೀಥೈಲ್ ಗುಂಪಿಗೆ (ಮೀಥೈಲ್ ಕೋಬಾಲಮಿನ್) ಅಥವಾ 5 '-ಡಿಯೋಕ್ಸಿಯಾಡೆನೊಸಿನ್ (ಅಡೆನೊಸೈಲ್ ಕೋಬಾಲಮಿನ್) ಗೆ ಬಂಧಿಸಿ ಕೋಬಾಲ್ಟ್ನೊಂದಿಗೆ ಕೋಬಾಲಮಿನ್ ಕೋಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ನ ಎರಡು ವಿಭಿನ್ನ ರೂಪಗಳನ್ನು ಬಂಧಿಸಬಹುದು. ಕೋಬಾಲಮಿನ್-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳು ಮುಖ್ಯವಾಗಿ ಪ್ರಾಣಿಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟ್ಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಕಿಣ್ವಗಳ ಎರಡು ಕುಟುಂಬಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ, ಅವು ಕೋಬಾಲ್ಟ್-ಕಾರ್ಬನ್ ಬಂಧದಲ್ಲಿ ವಿಭಿನ್ನ ರೀತಿಯ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ಮಾಡುತ್ತವೆ. ಮೀಥೈಲ್ ಕೋಬಾಲಮಿನ್ ಅಗತ್ಯವಿರುವ ಕಿಣ್ವಗಳು ಮೀಥೈಲ್ ವರ್ಗಾವಣೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ನಡೆಸುತ್ತವೆ. ಅಡೆನೊಸೈಲ್ಕೋಬಾಲಮಿನ್ ಅಗತ್ಯವಿರುವ ಕಿಣ್ವಗಳು ವೇಗವರ್ಧಕ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ಉಂಟುಮಾಡುತ್ತವೆ, ಇದರಲ್ಲಿ ಮೊದಲ ಹಂತವೆಂದರೆ ಅಡೆನೊಸೈಲ್ಕೋಬಾಲಮಿನ್ ಸೀಳಿ ಕೋಬ್ (II) ಅಲಾಮಿನ್ ಮತ್ತು 5 '-ಡಿಯೋಕ್ಸಿಯಾಡೆನೊಸಿಲ್ ರಾಡಿಕಲ್ ಅನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಹೀಗೆ ರಾಡಿಕಲ್ ಜನರೇಟರ್ಗಳಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ. ಎರಡೂ ರೀತಿಯ ಕಿಣ್ವಗಳಲ್ಲಿ ಬಿ12-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್ ಕೋಬಾಲಮಿನ್ ಕೋಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ಗಳ ಕೋಬಾಲ್ಟ್ ಪರಮಾಣುಗಳನ್ನು ಬಂಧಿಸಲು ಹಿಸ್ಟಿಡಿನ್ ಅನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ. ಈ ಹಿಸ್ಟಿಡಿನ್ ಅನ್ನು ಡಿಎಕ್ಸ್ಎಚ್ಎಕ್ಸ್ಎಕ್ಸ್ಜಿ ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಹುದುಗಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಡೊಮೇನ್ನ ಅತ್ಯಂತ ಸಂರಕ್ಷಿತ ಪ್ರಾಥಮಿಕ ಅನುಕ್ರಮ ಲಕ್ಷಣವಾಗಿದೆ. ಕೋಬಾಲಮಿನ್-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಸೇರಿವೆಃ ಪ್ರಾಣಿ ಮತ್ತು ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಮೆಥಿಯೋನಿನ್ ಸಿಂಥೇಸ್ (), ಇದು ಮೀಥೈಲ್ ಗುಂಪಿನ ವರ್ಗಾವಣೆಯನ್ನು ಮೀಥೈಲ್-ಕೋಬಾಲಮಿನ್ ನಿಂದ ಹೋಮೋಸಿಸ್ಟೈನ್ಗೆ ವೇಗವರ್ಧಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಕಿಣ್ವ-ಬದ್ಧ ಕೋಬ್ (I) ಅಲಾಮಿನ್ ಮತ್ತು ಮೆಥಿಯೋನಿನ್ ಅನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ. ಪ್ರೊಪಿಯೋನಿಲ್-ಕೋಎ ಮೂಲಕ ಟ್ರೈಕಾರ್ಬಾಕ್ಸಿಲಿಕ್ ಆಮ್ಲ ಚಕ್ರಕ್ಕೆ ಹಲವಾರು ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳು, ಬೆಸ-ಸರಪಳಿ ಕೊಬ್ಬಿನಾಮ್ಲಗಳು ಮತ್ತು ಕೊಲೆಸ್ಟರಾಲ್ನ ಅವನತಿಯಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿರುವ ಪ್ರಾಣಿ ಮತ್ತು ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಮೀಥೈಲ್ಮಾಲೋನಿಲ್-ಕೋಎ ಮ್ಯೂಟೇಸ್ (). ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಲೈಸಿನ್ 5,6-ಅಮಿನೋಮ್ಯುಟೇಸ್ (). ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಗ್ಲುಟಮೇಟ್ ಮ್ಯೂಟೇಸ್ (). ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಮೀಥೈಲೀನ್ಗ್ಲುಟರೇಟ್ ಮ್ಯೂಟೇಸ್ (). ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಐಸೊಬ್ಯುಟೈರಿಲ್-CoA ಮ್ಯೂಟೇಸ್ (). ಕೋಬಾಲಮಿನ್-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್ನ ಮುಖ್ಯ ರಚನೆಯು ಐದು-ಎಳೆಗಳುಳ್ಳ ಆಲ್ಫಾ/ಬೀಟಾ (ರಾಸ್ಮನ್) ಪದರದಿಂದ ನಿರೂಪಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ, ಇದು ಮೂರು ಪದರಗಳಲ್ಲಿ (ಆಲ್ಫಾ/ಬೀಟಾ/ಆಲ್ಫಾ) 4-5 ಆಲ್ಫಾ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳಿಂದ ಸುತ್ತುವರೆದಿರುವ 5 ಸಮಾನಾಂತರ ಬೀಟಾ-ಹಾಳೆಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಕೋಬಾಲಮಿನ್ ಅನ್ನು ಬಂಧಿಸಿದ ನಂತರ, ಬಂಧಿಸುವ ಸ್ಥಳದ ಪ್ರಮುಖ ಅಂಶಗಳು ರಚನೆಯಾದಂತೆ ತೋರುತ್ತದೆ, ಇದರಲ್ಲಿ ಕೋಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ನ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ 'ಬಾಲ' ಕ್ಕೆ ಅನುಗುಣವಾಗಿ ಸೀಳುಗಳ ಒಂದು ಬದಿಯಲ್ಲಿ ರೂಪುಗೊಳ್ಳುವ ಆಲ್ಫಾ-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಸೇರಿದೆ. ಕೋಬಾಲಮಿನ್ ನಲ್ಲಿ, ಕೋಬಾಲ್ಟ್ ಪರಮಾಣು ಮುಕ್ತವಾಗಿರಬಹುದು (ಡಿಎಂಬಿ-ಆಫ್) ಅಥವಾ ಪಿಹೆಚ್ ಪ್ರಕಾರ ಡೈಮೀಥೈಲ್ ಬೆಂಜಿಮಿಡಾಜೋಲ್ (ಡಿಎಂಬಿ-ಆನ್) ಗೆ ಬದ್ಧವಾಗಿರಬಹುದು. ಕೋಬಾಲಮಿನ್-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್ಗೆ ಬಂಧಿಸಿದಾಗ, ಡೈಮೀಥೈಲ್ ಬೆನ್ಜಿಮಿಡಾಜೋಲ್ ಲಿಗಂಡ್ ಅನ್ನು ಡಿಎಕ್ಸ್ಎಚ್ಎಕ್ಸ್ಎಕ್ಸ್ಜಿ ಮೋಟಿಫ್ನ ಸಕ್ರಿಯ ಹಿಸ್ಟಿಡಿನ್ (ಹಿಸ್-ಆನ್) ನಿಂದ ಬದಲಾಯಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಡೈಮೀಥೈಲ್ ಬೆಂಜಿಮಿಡಾಜೋಲ್ ಅನ್ನು ಹಿಸ್ಟಿಡಿನ್ ನಿಂದ ಬದಲಾಯಿಸುವುದರಿಂದ ವೇಗವರ್ಧಕ ಮತ್ತು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವ ಚಕ್ರಗಳ ನಡುವೆ ಬದಲಾಯಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಮೆಥಿಯೋನಿನ್ ಸಿಂಥೇಸ್ನಲ್ಲಿ ಕೋಬಾಲಮಿನ್ ಕೋಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಅನ್ನು ಕೋಬಾಲಮಿನ್-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್ ಮತ್ತು ಸುಮಾರು 90 ಅವಶೇಷಗಳ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಡೊಮೇನ್ ನಡುವೆ ಸ್ಯಾಂಡ್ವಿಚ್ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಎರಡು ಜೋಡಿ ಆಂಟಿಪಾರಲೆಲ್ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಹೆಲಿಕಲ್ ಬಂಡಲ್ ಅನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಡೊಮೇನ್ 4-ಹೆಲಿಕಲ್ ಬಂಡಲ್ ಕ್ಯಾಪ್ ಅನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ, ಈ ಕಿಣ್ವದ ಸಕ್ರಿಯ ರಚನೆಗೆ ಪರಿವರ್ತನೆಯಲ್ಲಿ, 4-ಹೆಲಿಕಲ್ ಕ್ಯಾಪ್ ತಿರುಗುತ್ತದೆ, ಕೋಬಾಲಮಿನ್ ಕೋಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಅನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವ ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ಬಂಧಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳು