B-box zinc finger
ಆಣ್ವಿಕ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರದಲ್ಲಿ ಬಿ-ಬಾಕ್ಸ್-ರೀತಿಯ ಸತು ಬೆರಳಿನ ಡೊಮೇನ್ ಸುಮಾರು 40 ಅಮೈನೊ ಆಸಿಡ್ ಅವಶೇಷಗಳ ಉದ್ದದ ಸಣ್ಣ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೊಮೇನ್ ಆಗಿದೆ. ಬಿ-ಬಾಕ್ಸ್ ಸತು ಬೆರಳುಗಳನ್ನು ಎರಡು ಗುಂಪುಗಳಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಬಹುದು, ಅಲ್ಲಿ ವಿಧಗಳು 1 ಮತ್ತು 2 ಬಿ-ಬಾಕ್ಸ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳು ಅವುಗಳ ಒಮ್ಮತದ ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಮತ್ತು 7-8 ಸತು-ಬಂಧಿಸುವ ಅವಶೇಷಗಳ ಅಂತರದಲ್ಲಿ ಭಿನ್ನವಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಹಲವಾರು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು 1 ಮತ್ತು 2 ಬಿ-ಪೆಟ್ಟಿಗೆಗಳೆರಡನ್ನೂ ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ, ಇದು ಈ ಎರಡು ಕ್ಷೇತ್ರಗಳ ನಡುವೆ ಕೆಲವು ಮಟ್ಟದ ಸಹಕಾರವನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಸಂಭವಿಸುವ ಬಿ-ಬಾಕ್ಸ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳು ವಿವಿಧ ಜೀವಿಗಳಿಂದ 1500 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ. ಅವು ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ರಿಂಗ್ ಬೆರಳು (ಮೂಲತಃ ಎ-ಬಾಕ್ಸ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತಿತ್ತು), ನಂತರ 1-2 ಬಿ-ಬಾಕ್ಸ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಕಾಯಿಲ್ಡ್-ಕಾಯಿಲ್ ಡೊಮೇನ್ (ರಿಂಗ್, ಬಿ-ಬಾಕ್ಸ್, ಕಾಯಿಲ್ಡ್-ಕಾಯಿಲ್ಗೆ ಆರ್ಬಿಸಿಸಿ ಎಂದೂ ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತಿತ್ತು) ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಟ್ರಿಮ್ (ತ್ರಿಪಕ್ಷೀಯ ಮೋಟಿಫ) ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ. ಟ್ರಿಮ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಟೈಪ್ 2 ಬಿ-ಬಾಕ್ಸ್ ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಟೈಪ್ 1 ಬಿ-ಬಾಕ್ಸ್ ಅನ್ನು ಸಹ ಹೊಂದಿರಬಹುದು. ರಿಂಗ್ ಅಥವಾ ಕಾಯಿಲ್ಡ್-ಕಾಯಿಲ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಲ್ಲಿ, ಬಿ-ಬಾಕ್ಸ್ ಡೊಮೇನ್ ಪ್ರಾಥಮಿಕವಾಗಿ ಟೈಪ್ 2 ಆಗಿರುತ್ತದೆ. ಅನೇಕ ವಿಧದ 2 ಬಿ-ಬಾಕ್ಸ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಯುಬಿಕ್ವಿಟೈನೈಲೇಷನ್ನಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿಕೊಂಡಿವೆ. ಬಿ-ಬಾಕ್ಸ್ ಜಿಂಕ್ ಫಿಂಗರ್ ಡೊಮೇನ್ ಹೊಂದಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳು, ರಿಬೋನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರೊಟೊ-ಆನ್ಕೊಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತವೆ; ಉದಾಹರಣೆಗೆ, MID1, MID2, TRIM9, Tಏನಏಲ, TRIM36, TRIM63, TRIFIC, NCL1 ಮತ್ತು CONSTANS ತರಹದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು. ಮೈಕ್ರೊಟ್ಯೂಬ್ಯೂಲ್-ಸಂಬಂಧಿತ ಇ3 ಲಿಗೇಸ್ ಎಮ್ಐಡಿ1 (ಇಸಿ) ಒಂದು ವಿಧದ 1 ಬಿ-ಬಾಕ್ಸ್ ಜಿಂಕ್ ಫಿಂಗರ್ ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಎಮ್ಐಡಿ1 ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ಆಲ್ಫಾ-4 ಅನ್ನು ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಫಾಸ್ಫೇಟೇಸ್ 2ಎ (ಪಿಪಿ2ಎಸಿ) ಯ ವೇಗವರ್ಧಕ ಉಪಘಟಕವನ್ನು ನೇಮಿಸುತ್ತದೆ. ಪ್ರೋಟೀಸೋಮ್-ಮಧ್ಯಸ್ಥಿಕೆಯ ಅವನತಿಗಾಗಿ ಪಿಪಿ2ಎಸಿಯನ್ನು ಗುರಿಯಾಗಿಸಲು ಈ ಸಂಕೀರ್ಣವು ಅಗತ್ಯವಾಗಿದೆ. MID1 B-ಪೆಟ್ಟಿಗೆಯು ಎರಡು ಸತು ಅಯಾನುಗಳನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಬೀಟಾ/ಬೀಟಾ/ಆಲ್ಫಾ ಕ್ರಾಸ್-ಬ್ರೇಸ್ ರಚನೆಯನ್ನು ಅಳವಡಿಸಿಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ, ಇದು ZZ, ಪಿಎಚ್ಡಿ, ರಿಂಗ್ ಮತ್ತು ಎಫ್ವೈವಿಇ ಸತು ಬೆರಳುಗಳಂತೆಯೇ ಇರುತ್ತದೆ. ಡೊಮೇನ್ನ ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಹೋಮೋಲಾಗ್ಗಳು ಹಲವಾರು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ವಂಶಾವಳಿಗಳು ಮತ್ತು ಮೆಥನೋಜೆನಿಕ್ ಆರ್ಕಿಯಾದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ, ಮತ್ತು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ರಾಂಬೊಯಿಡ್ ತರಹದ ಸೆರಿನ್ ಪೆಪ್ಟಿಡೇಸ್ ಮತ್ತು Zn-ಅವಲಂಬಿತ ಮೆಟಾಲೊಪೆಪ್ಟಿಡೇಸ್ನಂತಹ ಪೆಪ್ಟಿಡೇಸ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳಿಗೆ ಸಮ್ಮಿಳನಗಳನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತವೆ. ಇತರ ಆವೃತ್ತಿಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಡಿಎನ್ಎಜೆ, ಎಫ್ಎಚ್ಎ, ಎಸ್ಎಚ್3, ಡಬ್ಲ್ಯುಡಿ40 ಮತ್ತು ಟೆಟ್ರಾಟ್ರಿಕೊಪೆಪ್ಟೈಡ್ ರಿಪೀಟ್ಗಳಂತಹ ಡೊಮೇನ್ಗಳಿಗೆ ಫ್ಯೂಷನ್ಗಳನ್ನು ಸಹ ತೋರಿಸಬಹುದು. ಈ ಸಂಘಗಳು ಒಟ್ಟಾಗಿ ಪ್ರೋಟಿಯೋಲಿಟಿಕ್ ಸಂಸ್ಕರಣೆ, ಪದರ-ಸಂಬಂಧಿತ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಮಡಿಕೆ ಅಥವಾ ಸ್ಥಿರತೆಯಲ್ಲಿ ಬಿ-ಬಾಕ್ಸ್ ಜಿಂಕ್ ಫಿಂಗರ್ ಡೊಮೇನ್ನ ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಹೋಮೋಲಾಗ್ಗಳಿಗೆ ಒಂದು ಪಾತ್ರವನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ. ಡೊಮೇನ್ ವಾಸ್ತುಶಿಲ್ಪದ ವಾಕ್ಯರಚನೆಯು ಎಎನ್1 ಸತು ಬೆರಳು ಮತ್ತು ಎಲ್ಐಎಂ ಡೊಮೇನ್ಗಳ ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಹೋಮೋಲಾಗ್ಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವಂತೆ ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ಹೋಲುತ್ತದೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು ಪ್ಲಾಂಟ್ ಟಿಎಫ್ಡಿಬಿಯಲ್ಲಿ ಸಿಒ ತರಹದ ಕುಟುಂಬ, ಡಿಬಿಬಿ ಕುಟುಂಬಃ ಪ್ಲಾಂಟ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಷನ್ ಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ ಸಹ ನೋಡಿ ಝಿಂಕ್ ಫಿಂಗರ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳು