Transmembrane protein 89
ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ 89 (ಟಿಎಂಇಎಂ89) ಎಂಬುದು ಮಾನವರಲ್ಲಿ ಟಿಎಂಇಎಂ89 ಜೀನ್ನಿಂದ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಗಿದೆ. ವಂಶವಾಹಿ ರಚನೆ ಟಿಎಂಇಎಂ89 ವಂಶವಾಹಿಯು ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ 3 (3p21.31) ನ ಮೈನಸ್ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ನಲ್ಲಿ 48,658,192 ನಿಂದ 48,659,288 ವರೆಗೆ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ ಮತ್ತು 1,011 ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳ ಉದ್ದವಿರುತ್ತದೆ. ಜೀನ್ ಎರಡು ಎಕ್ಸಾನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಈ ಎರಡು ಎಕ್ಸಾನ್ಗಳು ಪರ್ಯಾಯವಾಗಿ ಜೋಡಿಸಲ್ಪಡುತ್ತವೆ ಎಂದು ಊಹಿಸಲಾಗಿಲ್ಲ. ವಂಶವಾಹಿ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ TMEM89 ವಂಶವಾಹಿಯು ವೃಷಣಗಳಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚು ವ್ಯಕ್ತವಾಗುತ್ತದೆ. ಹೊಟ್ಟೆ, ಮೂತ್ರಪಿಂಡಗಳು, ಹೃದಯ, ಅಂಡಾಶಯಗಳು, ಥೈರಾಯ್ಡ್, ಕೊಲೊನ್, ಮೂಳೆ ಮಜ್ಜೆ ಮತ್ತು ಮೂತ್ರಜನಕಾಂಗದ ಅಂಗಾಂಶಗಳಂತಹ ಇತರ ಅಂಗಾಂಶಗಳಲ್ಲಿ TMEM89 ಕಡಿಮೆ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ವ್ಯಕ್ತವಾಗುತ್ತದೆ. ಈ ವಂಶವಾಹಿಯು ಭ್ರೂಣದ ಹೃದಯ, ಹೊಟ್ಟೆ, ಮೂತ್ರಪಿಂಡ ಮತ್ತು ಕರುಳಿನ ಅಂಗಾಂಶಗಳಲ್ಲಿಯೂ ಸಹ ವ್ಯಕ್ತವಾಗುತ್ತದೆ. ಇಮ್ಯುನೊಹಿಸ್ಟೋಕೆಮಿಸ್ಟ್ರಿ ದತ್ತಾಂಶವು ಕೊಲೊನ್, ಫಾಲೋಪಿಯನ್ ಟ್ಯೂಬ್, ಮೂತ್ರಪಿಂಡ ಮತ್ತು ವೃಷಣ ಅಂಗಾಂಶಗಳ ಜೀವಕೋಶದ ಪೊರೆಗಳಲ್ಲಿ ಇರುವ TMEM89 ಅನ್ನು ಸಹ ಕಂಡುಹಿಡಿದಿದೆ. ಟಿಎಂಇಎಂ89 ವಂಶವಾಹಿಯ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯು ಮೌಸ್ನ ಸೆರೆಬೆಲ್ಲಮ್ನಿಂದ ಮೆದುಳಿನ ಅಂಗಾಂಶದಲ್ಲಿ ಕಡಿಮೆ ಪ್ರಮಾಣದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ನೆರೆಹೊರೆಯ ಹ್ಯೂಮನ್ ಟಿಎಂಇಎಂ89 ಹ್ಯೂಮನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಟ್ಲಾಸ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಕ್ಲಸ್ಟರ್ 23: ಸ್ಪರ್ಮಾಟಿಡ್ಸ್-ಫ್ಲಾಜೆಲ್ಲಮ್ ಮತ್ತು ಗೋಲ್ಗಿ ಸಂಸ್ಥೆಯ ಒಂದು ಭಾಗವಾಗಿದೆ. 15 ಹತ್ತಿರದ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ನೆರೆಹೊರೆಗಳಲ್ಲಿ OR4M1, ANTXRL, TGIF2LX, CPXCR1, C3orf84, CXorf66, CLDN17, C11orf94, USP50, SPDYE4, MMP20, SSMEM1, C17orf98, SPACA1, ಮತ್ತು LYZL1 ಸೇರಿವೆ. ಅಮರವಾದ ಎಚ್ಐಪಾಡ್ ಲೈನ್ ಕೋಶಗಳಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ ಆಮ್ನಿಯೋಟಿಕ್ ದ್ರವದಿಂದ ಪಡೆದ ಎಚ್ಎಕೆಪಿಸಿ-ಪಿ ಕೋಶಗಳಲ್ಲಿ ಡಿಫರೆನ್ಷಿಯಲ್ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಟಿಎಂಇಎಂ89 ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯು ತುಂಬಾ ಹೆಚ್ಚಾಗಿದೆ. ನಿಯಂತ್ರಣಕ್ಕೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ ಮ್ಯಾಕ್ರೋಫೇಜ್ ಮೈಗ್ರೇಷನ್ ಇನ್ಹಿಬಿಟರಿ ಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ (ಎಂಐಎಫ್) ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಜೀವಕೋಶಗಳಲ್ಲಿ ಟಿಎಂಇಎಂ89 ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯು ಹೆಚ್ಚಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಮಾನವನ ಭ್ರೂಣದ ಕಾಂಡಕೋಶಗಳು, ಬಡಿತದ ಕಾರ್ಡಿಯೋಮಯೋಸೈಟ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಭ್ರೂಣದ ದೇಹಗಳು ಮತ್ತು ಭ್ರೂಣದ ಹೃದಯದಿಂದ ಕಾರ್ಡಿಯೋಮಯೋಸೈಟ್ಗಳ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ, ಮಾನವನ ಭ್ರೂಣದ ಕಾಂಡಕೋಶಗಳಿಂದ ಬರುವ ಕಾರ್ಡಿಯೋಮಯೋಸೈಟ್ಗಳಲ್ಲಿ ಟಿಎಂಇಎಂ89 ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯು ಅತ್ಯಂತ ಕಡಿಮೆಯಾಗಿದೆ. ಕ್ಲಿನಿಕಲ್ ಪ್ರಾಮುಖ್ಯತೆಯ ಟಿಎಂಇಎಂ89ನ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯು ಮೇಲ್ಭಾಗದ ಮೂತ್ರನಾಳದ ಕಾರ್ಸಿನೋಮಗಳಲ್ಲಿ ನಿಯಂತ್ರಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ ಎಂದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ, ಮತ್ತು ಆದ್ದರಿಂದ ಈ ರೀತಿಯ ಕಾರ್ಸಿನೋಮಗಳಿಗೆ ಸಂಭಾವ್ಯ ಬಯೋಮಾರ್ಕರ್ ಸ್ರವಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಎಂದು ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ. ಟಿಎಂಇಎಂ89 ವಂಶವಾಹಿಯು ಸ್ವಲೀನತೆ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರಮ್ ಅಸ್ವಸ್ಥತೆಯ ತೀವ್ರತೆಯ ಸಂಭಾವ್ಯ ಮಾರ್ಪಾಡು ಎಂದು ಎಸ್ಎನ್ಪಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. ಹಂತ 1 ವೃಷಣದ ಸೂಕ್ಷ್ಮಾಣು ಕೋಶದ ಗೆಡ್ಡೆಗಳಲ್ಲಿ ಸಂಭವನೀಯ ಮರುಕಳಿಸುವಿಕೆಯ ಅಪಾಯದ ಸ್ಕೋರ್ ಅನ್ನು ಊಹಿಸಿದ ಮಾದರಿಯಲ್ಲಿ TMEM89 ನ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ಸಹ ಬಳಸಲಾಯಿತು. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸ್ಟ್ರಕ್ಚರ್ ಪ್ರೈಮರಿ ಮಾನವನ ಟಿಎಂಇಎಂ89 ಪ್ರೋಟೀನ್ 159 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಈ ಪ್ರೋಟೀನ್ ~ 17.5kDa ನ ಆಣ್ವಿಕ ದ್ರವ್ಯರಾಶಿಯನ್ನು ಮತ್ತು ~ 10 pI ನ ಐಸೊಎಲೆಕ್ಟ್ರಿಕ್ ಬಿಂದುವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಹೆಚ್ಚು ಮೂಲಭೂತ ಪಿಐ ಹೊಂದಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಮೈಟೊಕಾಂಡ್ರಿಯ ಅಥವಾ ಪ್ಲಾಸ್ಮಾ ಮೆಂಬರೇನ್ನೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿವೆ ಮತ್ತು ಕಡಿಮೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನೆಯು ಎರಡು ಟೋಪೋಲಾಜಿಕಲ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು (ಬಾಹ್ಯಕೋಶೀಯ ಮತ್ತು ಸೈಟೋಪ್ಲಾಸ್ಮಿಕ್) ಮತ್ತು ಹೆಲಿಕಲ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಮಾನವನ ಟಿಎಂಇಎಂ89 ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳಾದ ಹಿಸ್ಟಿಡಿನ್, ಲ್ಯೂಸಿನ್ ಮತ್ತು ಟ್ರಿಪ್ಟೋಫಾನ್ನಲ್ಲಿ ಸಮೃದ್ಧವಾಗಿದೆ. ಮಾನವನ ಟಿಎಂಇಎಂ89 ಪ್ರೋಟೀನ್ನಲ್ಲಿ ಆಸ್ಪರ್ಟೇಟ್, ಆಸ್ಪ್ಯಾರಜಿನ್ ಮತ್ತು ಫೆನೈಲಾಲನೈನ್ ಎಂಬ ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳು ಕಡಿಮೆ ಪ್ರಮಾಣದಲ್ಲಿ ಇರುತ್ತವೆ. ಇಡಿ ಯಂತಹ ಅಮಿನೋ ಆಮ್ಲದ ಮಾದರಿಗಳು ಮಾನವನ ಟಿಎಂಇಎಂ89 ಪ್ರೋಟೀನ್ನಲ್ಲಿ ಕಡಿಮೆ ಪ್ರಮಾಣದಲ್ಲಿ ಇರುತ್ತವೆ, ಆದರೆ ಕೆಆರ್-ಇಡಿ ಮಾದರಿಯು ಹೆಚ್ಚಿನ ಪ್ರಮಾಣದಲ್ಲಿ ಇರುತ್ತದೆ. ಮಾನವನ ಟಿಎಂಇಎಂ89 ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಬಾಹ್ಯಕೋಶೀಯ ಡೊಮೇನ್ನೊಳಗೆ, ನಿಯಮಿತ ಅಂತರದೊಂದಿಗೆ 3 ಸಿಸ್ಟೀನ್ಗಳಿವೆ. ಸೈಟೋಪ್ಲಾಸ್ಮಿಕ್ ಡೊಮೇನ್ನಲ್ಲಿ, ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳು 3-5 ಮತ್ತು 25-27 ನಿಂದ ಎರಡು ಧನಾತ್ಮಕ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳು ಹರಿಯುತ್ತವೆ. ಈ ವಿಭಿನ್ನ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಮಾದರಿಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಬಲಭಾಗದಲ್ಲಿರುವ ಚಿತ್ರಗಳಲ್ಲಿ ದೃಶ್ಯೀಕರಿಸಬಹುದು. ಸೆಕೆಂಡರಿ ಟಿಎಂಇಎಂ89 ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕೇವಲ α-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಮತ್ತು ಎಳೆಗಳಿಂದ ಕೂಡಿದೆ. α-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳನ್ನು ಎಲ್ಲಾ ಮೂರು ಡೊಮೇನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಉದ್ದಕ್ಕೂ ವಿತರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ತೃತೀಯ ಮಾನವ ಟಿ. ಎಂ. ಇ. ಎಂ. 89ರ ತೃತೀಯ ರಚನೆಯನ್ನು ಆಲ್ಫಾಫೋಲ್ಡ್ ಮತ್ತು ಐ-ಟಾಸರ್ ತಂತ್ರಾಂಶವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ. ಈ ರಚನೆಗಳನ್ನು ಬಲಭಾಗದಲ್ಲಿ ಕಾಣಬಹುದು. ಅನುವಾದದ ನಂತರದ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳು TMEM89 ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳಿಂದ ಊಹಿಸಲಾದ N-ಮಿರಿಸ್ಟೈಲೇಷನ್ ಸೈಟ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳಿಂದ ಊಹಿಸಲಾದ Src ಹೋಮೋಲಜಿ 3 (SH3) ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್ 106-111, ಮತ್ತು ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲ S117 ನಲ್ಲಿ ಸಂರಕ್ಷಿತ ಊಹಿಸಲಾದ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಸೈಟ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಎನ್-ಮೈರಿಸ್ಟೈಲೇಷನ್ ಎಂಬುದು ಪ್ರೋಟೀನ್-ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳು, ಜೀವಕೋಶ ಸಂಕೇತಗಳು ಮತ್ತು ಎಂಡೋಮೆಂಬ್ರೇನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ಲಾಸ್ಮಾ ಮೆಂಬರೇನ್ಗೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಗುರಿಯಾಗಿಸುವಲ್ಲಿ ಪಾತ್ರಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಲಿಪಿಡ್ ಮಾರ್ಪಾಡಾಗಿದೆ. ಎಸ್. ಎಚ್. 3 ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಸಿಗ್ನಲ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಡಕ್ಷನ್ ಮಾರ್ಗಗಳು, ಸೈಟೋಸ್ಕೆಲಿಟನ್ ಸಂಘಟನೆ, ಮೆಂಬರೇನ್ ಕಳ್ಳಸಾಗಣೆ ಅಥವಾ ಆರ್ಗನೆಲ್ ಜೋಡಣೆಯಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿಕೊಂಡಿರುತ್ತವೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಸಂಕೇತ ವರ್ಗಾವಣೆ, ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆ, ಜೀವಕೋಶ ವಿಭಜನೆ, ಜೀವಕೋಶದ ಬೆಳವಣಿಗೆ, ಬೆಳವಣಿಗೆ ಮತ್ತು ವಯಸ್ಸಾದೊಂದಿಗೆ ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಒಂದು ಪ್ರಮುಖ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಾಗಿದೆ. ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳು ಮಾನವನ ಟಿಎಂಇಎಂ89 ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಿ4ಎ, ಆರ್ಬಿಎಂ15ಬಿ, ಗೋಲ್ಗಾ6ಎ, ಪಿಎಫ್ಕೆಎಫ್ಬಿ4, ಡಾಕ್3, ಎಂಎಪಿಕೆಎಪಿಕೆ3, ಝೆಡ್ಎನ್ಎಫ್557, ಮತ್ತು ಝೆಡ್ಬಿಟಿ47 ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುತ್ತದೆ. ಹೋಮೋಲಾಗ್ಸ್ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಸ್ ಟಿಎಂಇಎಂ89ರ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಸ್ ಸಸ್ತನಿಗಳಲ್ಲಿ ಮಾತ್ರ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ. ಟಿಎಂಇಎಂ89 ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರದ ಏಕೈಕ ಸಸ್ತನಿ ಟ್ಯಾಕ್ಸನ್ ಎಂದರೆ ಮೊನೊಟ್ರೆಮ್ಗಳು. ಮಾನವ ಟಿ. ಎಂ. ಇ. ಎಂ. 89ರ ಕೆಲವು ಅಕ್ಷರವಿನ್ಯಾಸಗಳ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಕೋಷ್ಟಕವನ್ನು ಕೆಳಗೆ ನೀಡಲಾಗಿದೆ. ಬಹು ಅನುಕ್ರಮ ಜೋಡಣೆ ಮತ್ತು ಎನ್-ಮಿರಿಸ್ಟೈಲೇಷನ್ ಸೈಟ್ ಜೋಡಣೆಯನ್ನು ಬಲಕ್ಕೆ ಮಾಡಲು ಈ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳನ್ನು ಬಳಸಲಾಯಿತು. ಬಲಭಾಗದಲ್ಲಿರುವ ಅಂಕಿ ಅಂಶಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವಂತೆ, ಮಾನವ ಟಿಎಂಇಎಂ89 ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಸೈಟೋಪ್ಲಾಸ್ಮಿಕ್ ಮತ್ತು ಬಾಹ್ಯಕೋಶೀಯ ಡೊಮೇನ್ಗಳೊಳಗಿನ ಸಂರಕ್ಷಿತ ಪ್ರದೇಶಗಳು ಅತ್ಯಂತ ಸಂರಕ್ಷಿತವೆಂದು ತೋರುತ್ತದೆ. ಈ ಸಂರಕ್ಷಿತ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳಲ್ಲಿ ಕೆಲವು ಸೈಟೋಪ್ಲಾಸ್ಮಿಕ್ ಮತ್ತು ಬಾಹ್ಯಕೋಶೀಯ ಪ್ರದೇಶಗಳಲ್ಲಿ α-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳ ಭಾಗವಾಗಿವೆ. ಮಾನವ ವರ್ಣತಂತು 3ರ ಬಗೆಗಿನ ಜೀನ್ಗಳ ಉಲ್ಲೇಖಗಳು