DREAM Challenges
ಡ್ರೀಮ್ ಚಾಲೆಂಜಸ್ (ಡಯಲಾಗ್ ಫಾರ್ ರಿವರ್ಸ್ ಎಂಜಿನಿಯರಿಂಗ್ ಅಸೆಸ್ಮೆಂಟ್ ಅಂಡ್ ಮೆಥಡ್ಸ್) ಎಂಬುದು ಜನಸಮೂಹ-ಮೂಲದ ಸ್ಪರ್ಧೆಗಳ ಮೂಲಕ ಬಯೋಮೆಡಿಕಲ್ ಮತ್ತು ಸಿಸ್ಟಮ್ಸ್ ಬಯಾಲಜಿ ಸಂಶೋಧನೆಯನ್ನು ಮುನ್ನಡೆಸುವ ಲಾಭರಹಿತ ಉಪಕ್ರಮವಾಗಿದೆ. 2006ರಲ್ಲಿ ಪ್ರಾರಂಭವಾದ ಡ್ರೀಂ ಚಾಲೆಂಜ್ಗಳು ಸಿನಾಪ್ಸ್ ವೇದಿಕೆಯಲ್ಲಿ ನಡೆಯುವ ಸ್ಪರ್ಧೆಗಳಿಗೆ ವೇದಿಕೆಯನ್ನು ಒದಗಿಸಲು ಸೇಜ್ ಬಯೋನೆಟ್ವರ್ಕ್ಸ್ನೊಂದಿಗೆ ಸಹಕರಿಸುತ್ತವೆ. 15 ವರ್ಷಗಳ ಅವಧಿಯಲ್ಲಿ 60ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಡ್ರೀಮ್ ಚಾಲೆಂಜ್ಗಳನ್ನು ನಡೆಸಲಾಗಿದೆ. ಡ್ರೀಂ ಚಾಲೆಂಜಸ್ಅನ್ನು 2006ರಲ್ಲಿ ಐಬಿಎಂ ರಿಸರ್ಚ್ನ ಗುಸ್ತಾವೊ ಸ್ಟೋಲೋವಿಝ್ಕಿ ಮತ್ತು ಕೊಲಂಬಿಯಾ ವಿಶ್ವವಿದ್ಯಾಲಯದ ಆಂಡ್ರಿಯಾ ಕ್ಯಾಲಿಫಾನೊ ಸ್ಥಾಪಿಸಿದರು. ಡ್ರೀಮ್ ಸಂಸ್ಥೆಯ ಪ್ರಸ್ತುತ ಅಧ್ಯಕ್ಷರು ಕ್ಯಾಲಿಫೋರ್ನಿಯಾ ವಿಶ್ವವಿದ್ಯಾಲಯದ ಪಾಲ್ ಬೌಟ್ರೋಸ್. ಮತ್ತಷ್ಟು ಸಂಘಟನೆಯು ಎಮೆರಿಟಸ್ ಅಧ್ಯಕ್ಷರಾದ ಜಸ್ಟಿನ್ ಗಿನ್ನಿ ಮತ್ತು ಗುಸ್ತಾವೊ ಸ್ಟೋಲೋವಿಝ್ಕಿ ಮತ್ತು ಅನೇಕ ಡ್ರೀಮ್ ನಿರ್ದೇಶಕರನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ವೈಯಕ್ತಿಕ ಸವಾಲುಗಳು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಬಯೋಮೆಡಿಕಲ್ ಸಂಶೋಧನಾ ಪ್ರಶ್ನೆಯನ್ನು ನಿಭಾಯಿಸುವುದರ ಮೇಲೆ ಕೇಂದ್ರೀಕರಿಸುತ್ತವೆ, ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ರೋಗಕ್ಕೆ ಸಂಕುಚಿತಗೊಳ್ಳುತ್ತವೆ. ಸ್ತನ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್, ತೀವ್ರವಾದ ಮೈಲೋಯ್ಡ್ ಲ್ಯುಕೇಮಿಯಾ ಮತ್ತು ಪ್ರಾಸ್ಟೇಟ್ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ಅಥವಾ ಅಂತಹುದೇ ಕಾಯಿಲೆಗಳ ಮೇಲೆ ಕೇಂದ್ರೀಕರಿಸಿದ ಅನೇಕ ಹಿಂದಿನ ಸವಾಲುಗಳೊಂದಿಗೆ ಆಂಕೊಲಾಜಿಯ ಮೇಲೆ ಪ್ರಮುಖ ರೋಗದ ಗಮನ ಕೇಂದ್ರೀಕರಿಸಲಾಗಿದೆ. ವೈಯಕ್ತಿಕ ಸವಾಲಿನಲ್ಲಿ ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ದತ್ತಾಂಶವು ರೋಗದ ಸಂದರ್ಭವನ್ನು ಪ್ರತಿಬಿಂಬಿಸುತ್ತದೆ; ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಮಾನವ ಜೀನೋಮ್ನಲ್ಲಿನ ರೂಪಾಂತರಗಳು, ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮತ್ತು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮಿಕ್ಸ್ನಲ್ಲಿನ ಜೀನ್ ಜಾಲಗಳು ಮತ್ತು ದೊಡ್ಡ ಪ್ರಮಾಣದ ಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ಸ್ನಂತಹ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದ್ದರೂ, ಹೊಸ ಸವಾಲುಗಳು ಏಕ ಕೋಶ ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನಗಳ ಜೊತೆಗೆ ಉದಯೋನ್ಮುಖ ಕರುಳಿನ ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯ ಸಂಬಂಧಿತ ಸಂಶೋಧನಾ ಪ್ರಶ್ನೆಗಳತ್ತ ಬದಲಾಗಿವೆ, ಹೀಗಾಗಿ ವ್ಯಾಪಕ ಸಂಶೋಧನಾ ಸಮುದಾಯದಲ್ಲಿನ ಪ್ರವೃತ್ತಿಗಳನ್ನು ಪ್ರತಿಬಿಂಬಿಸುತ್ತದೆ. ಡ್ರೀಮ್ ಚಾಲೆಂಜ್ಗಳಿಗೆ ಪ್ರೇರಣೆಯೆಂದರೆ, ಸ್ಪರ್ಧೆಗಳ ಮೂಲಕ ಹೆಚ್ಚಿನ ಪ್ರೇಕ್ಷಕರಿಗೆ ಕ್ರೌಡ್-ಸೋರ್ಸಿಂಗ್ ಡೇಟಾದ ಮೂಲಕ, ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒಂದೇ ಘಟಕವು ನಡೆಸಿದ್ದಕ್ಕಿಂತ ಉತ್ತಮ ಮಾದರಿಗಳು ಮತ್ತು ಒಳನೋಟವನ್ನು ಪಡೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ನೇಚರ್ ಪೋರ್ಟ್ಫೋಲಿಯೋ ಮತ್ತು ಪಿಎಲ್ಓಎಸ್ ಪ್ರಕಾಶನ ಗುಂಪುಗಳ ಪ್ರಮುಖ ನಿಯತಕಾಲಿಕಗಳಂತಹ ವೈಜ್ಞಾನಿಕ ಸ್ಥಳಗಳಲ್ಲಿ ಹಿಂದಿನ ಸ್ಪರ್ಧೆಗಳನ್ನು ಪ್ರಕಟಿಸಲಾಗಿದೆ. ಡ್ರೀಮ್ ಚಾಲೆಂಜ್ಗಳ ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ವೆಬ್ ಪ್ಲಾಟ್ಫಾರ್ಮ್ಗಳ ಮೂಲಕ ಘೋಷಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಅತ್ಯುತ್ತಮ ಪ್ರದರ್ಶನ ನೀಡುವ ಭಾಗವಹಿಸುವವರನ್ನು ಐ. ಎಸ್. ಸಿ. ಬಿ ಆಯೋಜಿಸುವ ಆರ್. ಎಸ್. ಜಿ/ಡ್ರೀಮ್ ಜೊತೆಗಿನ ವಾರ್ಷಿಕ ರಿಕಾಂಬ್/ಐ. ಎಸ್. ಸಿ. ಬಿ ಸಮ್ಮೇಳನಗಳಲ್ಲಿ ತಮ್ಮ ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ಪ್ರಸ್ತುತಪಡಿಸಲು ಆಹ್ವಾನಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಡ್ರೀಮ್ ಚಾಲೆಂಜಸ್ ಮುಕ್ತ ವಿಜ್ಞಾನ ಮತ್ತು ದತ್ತಾಂಶಕ್ಕೆ ಒತ್ತು ನೀಡಿದ್ದರೂ, ರೋಗಿಗಳ ಗುಂಪುಗಳಲ್ಲಿ ಜೀನೋಮಿಕ್ಸ್ನಂತಹ ಹೆಚ್ಚು ಸೂಕ್ಷ್ಮ ದತ್ತಾಂಶಗಳಿಂದ ಉಂಟಾಗುವ ಸಮಸ್ಯೆಗಳನ್ನು ತಗ್ಗಿಸುವ ಸಲುವಾಗಿ, "ಮಾದರಿ ದತ್ತಾಂಶ" ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಅಳವಡಿಸಿಕೊಳ್ಳಲಾಗಿದೆ. ಅಂತಹ ಸವಾಲುಗಳಲ್ಲಿ ಭಾಗವಹಿಸುವವರು ತಮ್ಮ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಡಾಕರ್ ಅಥವಾ ಸಿಂಗ್ಯುಲಾರಿಟಿಯಂತಹ ಧಾರಕಗಳ ಮೂಲಕ ಸಲ್ಲಿಸುತ್ತಾರೆ. ಇದು ಮೂಲ ದತ್ತಾಂಶದ ಗೌಪ್ಯತೆಯನ್ನು ಉಳಿಸಿಕೊಳ್ಳಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ ಏಕೆಂದರೆ ಈ ಧಾರಕಗಳನ್ನು ನಂತರ ಗೌಪ್ಯ ದತ್ತಾಂಶದ ಮೇಲೆ ಸಂಘಟಕರು ನಡೆಸುತ್ತಾರೆ. ಇದು ಹೆಚ್ಚು ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕ ಮುಕ್ತ ದತ್ತಾಂಶ ಮಾದರಿಗಿಂತ ಭಿನ್ನವಾಗಿದೆ, ಅಲ್ಲಿ ಭಾಗವಹಿಸುವವರು ಒದಗಿಸಿದ ಮುಕ್ತ ದತ್ತಾಂಶದ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ನೇರವಾಗಿ ಭವಿಷ್ಯ ನುಡಿಯುತ್ತಾರೆ. ಚಾಲೆಂಜ್ ಸಂಸ್ಥೆ ಡ್ರೀಮ್ ಚಾಲೆಂಜ್ ಒಂದು ಪ್ರಮುಖ ಡ್ರೀಮ್/ಸೇಜ್ ಬಯೋನೆಟ್ವರ್ಕ್ಸ್ ಸಂಸ್ಥೆಯ ಗುಂಪು ಮತ್ತು ವಿಸ್ತೃತ ವೈಜ್ಞಾನಿಕ ತಜ್ಞರ ಗುಂಪನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ, ಅವರು ಸವಾಲಿನ ರಚನೆ ಮತ್ತು ಪರಿಕಲ್ಪನೆಗೆ ಅಥವಾ ಪ್ರಮುಖ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಒದಗಿಸುವ ಮೂಲಕ ಕೊಡುಗೆ ನೀಡಿರಬಹುದು. ಹೆಚ್ಚುವರಿಯಾಗಿ, ವ್ಯಾಪಕವಾದ ಸಂಶೋಧನಾ ಸಮುದಾಯವು ಹೊಸ ಡ್ರೀಮ್ ಸವಾಲುಗಳನ್ನು ಪ್ರಸ್ತಾಪಿಸಬಹುದು. ಔಷಧೀಯ ಕಂಪನಿಗಳು ಅಥವಾ ಇತರ ಖಾಸಗಿ ಘಟಕಗಳು ಸಹ ಡ್ರೀಮ್ ಸವಾಲುಗಳಲ್ಲಿ ಭಾಗಿಯಾಗಿರಬಹುದು, ಉದಾಹರಣೆಗೆ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಒದಗಿಸುವಲ್ಲಿ. ಪ್ರಮುಖ ಹಂತಗಳಿಗೆ ಚಾಲೆಂಜ್ ಸ್ಟ್ರಕ್ಚರ್ ಟೈಮ್ಲೈನ್ಗಳನ್ನು (ಪರಿಚಯ ವೆಬಿನಾರ್ಗಳು, ಮಾದರಿ ಸಲ್ಲಿಕೆ ಗಡುವುಗಳು ಮತ್ತು ಭಾಗವಹಿಸುವ ಅಂತಿಮ ಗಡುವು) ಮುಂಚಿತವಾಗಿ ಒದಗಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ವಿಜೇತರನ್ನು ಘೋಷಿಸಿದ ನಂತರ, ಸ್ಪರ್ಧೆಯ ಪ್ರಮುಖ ಆವಿಷ್ಕಾರಗಳನ್ನು ವಿವರಿಸುವ ಪ್ರಕಟಣೆಗಾಗಿ ಪೋಸ್ಟ್ ಹಾಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳನ್ನು ನಡೆಸಲು ಸಂಘಟಕರು ಅತ್ಯುತ್ತಮ ಪ್ರದರ್ಶನ ನೀಡುವ ಸ್ಪರ್ಧಿಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಹಕರಿಸಲು ಪ್ರಾರಂಭಿಸುತ್ತಾರೆ. ಸವಾಲುಗಳನ್ನು ಉಪ-ಸವಾಲುಗಳಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಬಹುದು, ಪ್ರತಿಯೊಂದೂ ಸಂಶೋಧನಾ ಪ್ರಶ್ನೆಯೊಳಗೆ ವಿಭಿನ್ನ ಉಪ-ವಿಷಯವನ್ನು ತಿಳಿಸುತ್ತದೆ. ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ಚಿಕಿತ್ಸೆಯ ಪರಿಣಾಮಕಾರಿತ್ವದ ಮುನ್ಸೂಚನೆಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದಂತೆ, ಇವು ಪ್ರಗತಿ-ಮುಕ್ತ ಬದುಕುಳಿಯುವಿಕೆ, ಒಟ್ಟಾರೆ ಬದುಕುಳಿಯುವಿಕೆ, RECIST ಪ್ರಕಾರ ಅತ್ಯುತ್ತಮ ಒಟ್ಟಾರೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆ, ಅಥವಾ ಘಟನೆಯ (ಪ್ರಗತಿ ಅಥವಾ ಸಾವು) ನಿಖರವಾದ ಸಮಯದ ಪ್ರತ್ಯೇಕ ಮುನ್ಸೂಚನೆಗಳಾಗಿರಬಹುದು. ಭಾಗವಹಿಸುವಿಕೆ ಡ್ರೀಮ್ ಸವಾಲುಗಳ ಸಮಯದಲ್ಲಿ, ಭಾಗವಹಿಸುವವರು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಒದಗಿಸಿದ ದತ್ತಾಂಶದ ಮೇಲೆ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ನಿರ್ಮಿಸುತ್ತಾರೆ ಮತ್ತು ಭವಿಷ್ಯವಾಣಿಗಳು ಅಥವಾ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಸಲ್ಲಿಸುತ್ತಾರೆ, ನಂತರ ಅವುಗಳನ್ನು ಸಂಘಟಕರು ತಡೆಹಿಡಿದ ದತ್ತಾಂಶದ ಮೇಲೆ ಮೌಲ್ಯೀಕರಿಸುತ್ತಾರೆ. ಡ್ರೀಮ್ ಸವಾಲುಗಳು ಭಾಗವಹಿಸುವವರಿಗೆ ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಸೋರಿಕೆ ಮಾಡುವುದನ್ನು ತಪ್ಪಿಸುತ್ತವೆಯಾದರೂ, ಉಪ-ಮಾದರಿ ಅಥವಾ ಸ್ಕ್ರಾಂಬಲ್ಡ್ ಡೇಟಾಸೆಟ್ನಲ್ಲಿ ಭಾಗವಹಿಸುವವರಿಗೆ ಅವರ ಕಾರ್ಯಕ್ಷಮತೆಯನ್ನು ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ ಮಾಡಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡಲು ಮಧ್ಯ-ಸವಾಲು ಸಲ್ಲಿಕೆ ಲೀಡರ್ಬೋರ್ಡ್ಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಲಭ್ಯವಿರುತ್ತವೆ. ಭಾಗವಹಿಸುವವರಿಗೆ ಡ್ರೀಮ್ ಚಾಲೆಂಜ್ಗಳು ಉಚಿತವಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಮುಕ್ತ ಹಂತದಲ್ಲಿ ಯಾರಾದರೂ ವೈಯಕ್ತಿಕವಾಗಿ ಅಥವಾ ತಂಡವಾಗಿ ಭಾಗವಹಿಸಲು ಸಿನಾಪ್ಸ್ ಮೂಲಕ ನೋಂದಾಯಿಸಿಕೊಳ್ಳಬಹುದು. ಒಬ್ಬ ವ್ಯಕ್ತಿಯು ಒಮ್ಮೆ ಮಾತ್ರ ನೋಂದಾಯಿಸಿಕೊಳ್ಳಬಹುದು ಮತ್ತು ಯಾವುದೇ ಉಪನಾಮಗಳನ್ನು ಬಳಸದಿರಬಹುದು. ಕೆಲವು ವಿನಾಯಿತಿಗಳಿವೆ, ಇದು ಒಬ್ಬ ವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ಭಾಗವಹಿಸಲು ಅನರ್ಹಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ, ಉದಾಹರಣೆಗೆಃ ವ್ಯಕ್ತಿಯು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸವಾಲಿಗೆ ದತ್ತಾಂಶಕ್ಕೆ ವಿಶೇಷ ಪ್ರವೇಶವನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತಾನೆ, ಹೀಗಾಗಿ ಅವರಿಗೆ ಅನ್ಯಾಯದ ಪ್ರಯೋಜನವನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತಾನೆ. ವ್ಯಕ್ತಿಯು ಸಿಕ್ಕಿಬಿದ್ದಿದ್ದಾನೆ ಅಥವಾ ವಂಚನೆ ಮಾಡಿದ ಅಥವಾ ಹಿಂದಿನ ಡ್ರೀಮ್ ಚಾಲೆಂಜಸ್ ಅನ್ನು ದುರುಪಯೋಗಪಡಿಸಿಕೊಂಡ ಶಂಕೆಗೆ ಒಳಗಾಗಿದ್ದಾನೆ. ವ್ಯಕ್ತಿಯು ಅಪ್ರಾಪ್ತ ವಯಸ್ಕನಾಗಿರುತ್ತಾನೆ (18 ವರ್ಷಕ್ಕಿಂತ ಕಡಿಮೆ ವಯಸ್ಸಿನವನಾಗಿದ್ದರೆ ಅಥವಾ ನಿವಾಸದ ಅಧಿಕಾರ ವ್ಯಾಪ್ತಿಯಲ್ಲಿ ಬಹುಮತದ ವಯಸ್ಸಿನವನಾಗಿದ್ದರೆ). ಪೋಷಕರ ಒಪ್ಪಿಗೆಯ ಮೂಲಕ ಇದನ್ನು ನಿವಾರಿಸಬಹುದು. ಕ್ರೌಡ್ಸೋರ್ಸಿಂಗ್ ಯೋಜನೆಗಳ ಪಟ್ಟಿಯನ್ನು ಸಹ ನೋಡಿ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಟಿಪ್ಪಣಿಗಳ ವಿಮರ್ಶಾತ್ಮಕ ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ (ಸಿಎಎಫ್ಎ) ಜೀನೋಮ್ ವ್ಯಾಖ್ಯಾನದ ವಿಮರ್ಶಾತ್ಮಕ ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ (ಸಿಎಜಿಐ) ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳ ಮುನ್ಸೂಚನೆಯ ವಿಮರ್ಶಾತ್ಮಕ ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ (ಸಿಎಪಿಆರ್ಐ) ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನೆಯ ಮುನ್ಸೂಚನೆಯ ವಿಮರ್ಶಾತ್ಮಕ ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ (ಸಿಎಎಸ್ಪಿ) ಕಾಗಲ್ ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಅನ್ವಯಿಕ ಯಂತ್ರ ಕಲಿಕೆ ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಕಂಪ್ಯೂಟರ್ ವಿಜ್ಞಾನ ಸ್ಪರ್ಧೆಗಳು ಕ್ರೌಡ್ಸೋರ್ಸಿಂಗ್ ಮುನ್ಸೂಚನೆ ಸ್ಪರ್ಧೆಗಳು ಆಣ್ವಿಕ ಮಾದರಿ ಪ್ರೋಗ್ರಾಮಿಂಗ್ ಸ್ಪರ್ಧೆಗಳು