Elongation factor P
ಇಎಫ್-ಪಿ (ಎಲೋಂಗೇಷನ್ ಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಪಿ) ಒಂದು ಅತ್ಯಗತ್ಯ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಗಿದ್ದು, ಇದು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯಲ್ಲಿ ಮೊದಲ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧಗಳ ರಚನೆಯನ್ನು ಉತ್ತೇಜಿಸುತ್ತದೆ. ಸತತ ಪ್ರೊಲೈನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್ಗಳು ಸ್ಥಗಿತಗೊಳ್ಳುವುದನ್ನು ಇಎಫ್-ಪಿ ತಡೆಯುತ್ತದೆ ಎಂದು ಅಧ್ಯಯನಗಳು ತೋರಿಸುತ್ತವೆ. ಇಎಫ್-ಪಿ ಪೆಪ್ಟಿಡಿಲ್ ಟಿಆರ್ಎನ್ಎ (ಪಿ ಸೈಟ್) ಮತ್ತು ನಿರ್ಗಮಿಸುವ ಟಿಆರ್ಎನ್ಎ (ಇ ಸೈಟ್) ಗಾಗಿ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್ನ ನಡುವೆ ಇರುವ ಸೈಟ್ಗೆ ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ. ಇದು ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಉಪಘಟಕಗಳೆರಡನ್ನೂ ವ್ಯಾಪಿಸಿದೆ, ಅದರ ಅಮೈನೋ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ಅಮೈನೋಸೈಲ್ ಸ್ವೀಕಾರಕ ಕಾಂಡದ ಪಕ್ಕದಲ್ಲಿ ಇರಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಅದರ ಕಾರ್ಬಾಕ್ಸಿಲ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ಪಿ ಸೈಟ್-ಬೌಂಡ್ ಇನಿಶಿಯೇಟರ್ ಟಿಆರ್ಎನ್ಎಯ ಆಂಟಿಕೋಡಾನ್ ಕಾಂಡ-ಲೂಪ್ನ ಪಕ್ಕದಲ್ಲಿ ಇರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಇಎಫ್-ಪಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಕಾರ ಮತ್ತು ಗಾತ್ರವು ಟಿಆರ್ಎನ್ಎಗೆ ಹೋಲುತ್ತದೆ ಮತ್ತು 30ಎಸ್ ಉಪಘಟಕದ ನಿರ್ಗಮನ "ಇ" ಸೈಟ್ ಮತ್ತು 50ಎಸ್ ಉಪಘಟಕದ ಪೆಪ್ಟಿಡಿಲ್-ಟ್ರಾನ್ಸ್ಫರೇಸ್ ಸೆಂಟರ್ (ಪಿಟಿಸಿ) ಮೂಲಕ ರೈಬೋಸೋಮ್ನೊಂದಿಗೆ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುತ್ತದೆ. ಇಎಫ್-ಪಿ ಎಂಬುದು ಅಜ್ಞಾತ ಕಾರ್ಯದ ಅನುವಾದದ ಅಂಶವಾಗಿದೆ, ಆದ್ದರಿಂದ ಇದು ಬಹುಶಃ ಅಮೈನೋಸೈಲ್-ಟಿಆರ್ಎನ್ಎಗೆ ರೈಬೋಸೋಮ್ನ ಆಕರ್ಷಣೆಯನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸುವ ಮೂಲಕ ಪರೋಕ್ಷವಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ, ಹೀಗಾಗಿ ಪೆಪ್ಟಿಡಿಲ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಫರೇಸ್ಗೆ ಸ್ವೀಕಾರಕಗಳಾಗಿ ಅವುಗಳ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕತೆಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ. ಇಎಫ್-ಪಿ ಮೂರು ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆಃ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಕೆಒಡಬ್ಲ್ಯೂ ತರಹದ ಡೊಮೇನ್ ಎ ಸೆಂಟ್ರಲ್ ಒಬಿ ಡೊಮೇನ್, ಇದು ಒಲಿಗೋನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪದರವನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಪ್ರದೇಶವು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲಗಳಾದ ಎ ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ಬಂಧಿಸುವಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿದೆಯೇ ಎಂಬುದು ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿಲ್ಲ, ಇದು ಒಬಿ-ಪಟ್ಟುಗಳನ್ನು ಅಳವಡಿಸಿಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ, ಐದು ಬೀಟಾ-ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ಗಳು ಗ್ರೀಕ್-ಕೀ ಟೋಪೋಲಜಿ ಯುಕಾರ್ಯೋಟ್ಸ್ನಲ್ಲಿ ಬೀಟಾ-ಬ್ಯಾರೆಲ್ ಅನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಆರ್ಕಿಯಾದಲ್ಲಿ ಇಎಫ್-ಪಿ ಕೊರತೆಯಿದೆ. ಈ ಕ್ಷೇತ್ರಗಳಲ್ಲಿ, ಇದೇ ರೀತಿಯ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಆರ್ಕಿಯೋ-ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಇನಿಶಿಯೇಶನ್ ಫ್ಯಾಕ್ಟರ್, a/eIF-5A ನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು EF-P ಯೊಂದಿಗೆ ಕೆಲವು ಸಾಧಾರಣ ಅನುಕ್ರಮ ಮತ್ತು ರಚನಾತ್ಮಕ ಹೋಲಿಕೆಯನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುತ್ತದೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಇಎಫ್-ಪಿ ಮತ್ತು ಇಐಎಫ್-5ಎ ನಡುವೆ ಪ್ರಮುಖ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳಿವೆ. (ಎ) ಇಎಫ್-ಪಿ ಎಲ್-ಆಕಾರದ ಟಿಆರ್ಎನ್ಎಯಂತೆಯೇ ರಚನೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಮತ್ತು ಇದು ಮೂರು (ಐ, II ಮತ್ತು III) β-ಬ್ಯಾರೆಲ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಇದಕ್ಕೆ ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿ, ಇಐಎಫ್-5ಎ ಗಾತ್ರದ ವ್ಯತ್ಯಾಸದೊಂದಿಗೆ ಕೇವಲ ಎರಡು ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು (ಸಿ ಮತ್ತು ಎನ್) ಹೊಂದಿದೆ. (ಬಿ) ಇದಲ್ಲದೆ, ಅದರ ಚಟುವಟಿಕೆಗೆ ಅತ್ಯಗತ್ಯವಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್-ಅಲ್ಲದ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲ ಹೈಪುಸಿನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಇಐಎಫ್-5ಎಗೆ ವಿರುದ್ಧವಾಗಿ, ಇಎಫ್-ಪಿ ಸಾದೃಶ್ಯದ ಸ್ಥಾನದಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿಲೇಖನದ ನಂತರದ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುತ್ತದೆ (ಲೈಸಿನ್ ಅವಶೇಷದ β-ಲೈಸೈಲೇಷನ್, ಅರ್ಜಿನೈನ್ ಅವಶೇಷದ ರ್ಯಾಮ್ನೋಸೈಲೇಷನ್, ಅಥವಾ ಯಾವುದೂ ಇಲ್ಲ). ಕಾರ್ಯ ಯುಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಲ್ಲಿ, ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಉತ್ತೇಜಿಸುವ ಅಂಶಗಳ ಮೂರು ಗುಂಪುಗಳಿವೆಃ ಆರಂಭದ ಅಂಶಗಳು, ಉದ್ದದ ಅಂಶಗಳು ಮತ್ತು ಮುಕ್ತಾಯದ ಅಂಶಗಳು. ಭಾಷಾಂತರದ ಉದ್ದನೆಯ ಹಂತವನ್ನು ಇಎಫ್-ಟು, ಇಎಫ್-ಟಿಎಸ್ ಮತ್ತು ಇಎಫ್-ಜಿ ಎಂಬ ಮೂರು ಸಾರ್ವತ್ರಿಕ ಉದ್ದದ ಅಂಶಗಳಿಂದ ಉತ್ತೇಜಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಇಎಫ್-ಪಿ ಅನ್ನು 1975 ರಲ್ಲಿ ಗ್ಲಿಕ್ ಮತ್ತು ಗ್ಯಾನೋಜಾ ಅವರು ಕಂಡುಹಿಡಿದರು, ಇದು ಆರಂಭಿಕ ಎಫ್ಮೆಟ್-ಟಿಆರ್ಎನ್ಎ (ಎಫ್ಮೆಟ್) ಮತ್ತು ಎಎ-ಟಿಆರ್ಎನ್ಎ, ಪುರೊಮೈಸಿನ್ (ಪಿಎಂಎನ್) ನ ಅನುಕರಣೆಯ ನಡುವೆ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧ ರಚನೆಯ ಇಳುವರಿಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸಿದ ಅಂಶವಾಗಿದೆ. ಇಎಫ್-ಪಿ ಅನುಪಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿ ಉತ್ಪನ್ನ ರಚನೆಯ ಕಡಿಮೆ ಇಳುವರಿಯನ್ನು ಸ್ಥಗಿತಗೊಂಡ ರೈಬೋಸೋಮ್ನಿಂದ ಪೆಪ್ಟಿಡಿಲ್-ಟಿಆರ್ಎನ್ಎ ನಷ್ಟದಿಂದ ವಿವರಿಸಬಹುದು. ಹೀಗಾಗಿ, ಇಎಫ್-ಪಿ ಅನುವಾದ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯ ಕನಿಷ್ಠ ಇನ್ ವಿಟ್ರೊದ ಅಗತ್ಯ ಅಂಶವಲ್ಲ, ಆದಾಗ್ಯೂ, ಇಎಫ್-ಪಿಯ ಅನುಪಸ್ಥಿತಿಯು ಅನುವಾದ ದರವನ್ನು ಮಿತಿಗೊಳಿಸಬಹುದು, ಪ್ರತಿಜೀವಕ ಸೂಕ್ಷ್ಮತೆಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸಬಹುದು ಮತ್ತು ಬೆಳವಣಿಗೆಯನ್ನು ನಿಧಾನಗೊಳಿಸಬಹುದು. ಅದರ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಪೂರ್ಣಗೊಳಿಸಲು, ಇಎಫ್-ಪಿ ಇ-ಸೈಟ್ ಮೂಲಕ ವಿರಾಮಗೊಳಿಸಲಾದ ರೈಬೋಸೋಮ್ಗಳನ್ನು ಪ್ರವೇಶಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಪಿ-ಸೈಟ್ ಟಿಆರ್ಎನ್ಎಯೊಂದಿಗಿನ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳ ಮೂಲಕ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಬಂಧದ ರಚನೆಯನ್ನು ಸುಗಮಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಎಲ್ಲಾ ಜೀವಕೋಶಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರೊಲೈನ್ ಸ್ಟ್ರೆಚ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಉಪವಿಭಾಗದ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ಇಎಫ್-ಪಿ ಮತ್ತು ಇಐಎಫ್-5ಎ ಎರಡೂ ಅತ್ಯಗತ್ಯವಾಗಿವೆ. ಪ್ರಾರಂಭಕ ಟಿಆರ್ಎನ್ಎಯನ್ನು ಪಿ/ಐ ಸೈಟ್ಗೆ ಬಂಧಿಸಿದ ನಂತರ, ಇ/ಪಿ ಅನ್ನು ಇ ಸೈಟ್ಗೆ ಬಂಧಿಸುವ ಮೂಲಕ ಅದನ್ನು ಪಿ ಸೈಟ್ಗೆ ಸರಿಯಾಗಿ ಇರಿಸಲಾಗಿದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸಲಾಗಿದೆ. ಹೆಚ್ಚುವರಿಯಾಗಿ, ಇಎಫ್-ಪಿ ಮೂರು ಅಥವಾ ಅದಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ಸತತ ಪ್ರೊಲೈನ್ ಅವಶೇಷಗಳ ಸಮರ್ಥ ಅನುವಾದಕ್ಕೆ ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಸ್ಟ್ರಕ್ಚರ್ ಇಎಫ್-ಪಿ ಎಂಬುದು ಇಎಫ್ಪಿ ಜೀನ್ನಿಂದ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ 21 ಕೆಡಿಎ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಗಿದೆ. ಇಎಫ್-ಪಿ ಮೂರು β-ಬ್ಯಾರೆಲ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು (I, II ಮತ್ತು III) ಒಳಗೊಂಡಿದೆ ಮತ್ತು ಎಲ್ ಆಕಾರದ ಟಿಆರ್ಎನ್ಎ ರಚನೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಇ. ಎಫ್.-ಪಿ. ಯ ಡೊಮೈನ್ II ಮತ್ತು III ಪರಸ್ಪರ ಹೋಲುತ್ತವೆ. ಟಿಆರ್ಎನ್ಎಯೊಂದಿಗೆ ಇಎಫ್-ಪಿ ಯ ರಚನಾತ್ಮಕ ಹೋಲಿಕೆಯ ಹೊರತಾಗಿಯೂ, ಇಎಫ್-ಪಿ ಶಾಸ್ತ್ರೀಯ ಟಿಆರ್ಎನ್ಎ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್ನಲ್ಲಿ ರೈಬೋಸೋಮ್ಗೆ ಬಂಧಿಸುವುದಿಲ್ಲ, ಆದರೆ ಪಿ ಮತ್ತು ಇ ಸೈಟ್ಗಳ ನಡುವೆ ಇರುವ ವಿಶಿಷ್ಟ ಸ್ಥಾನದಲ್ಲಿದೆ ಎಂದು ಅಧ್ಯಯನಗಳು ತೋರಿಸಿವೆ. ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಉದ್ದದ ಅಂಶಗಳು EF-Ts (ಉದ್ದದ ಅಂಶ ಥರ್ಮೋ ಸ್ಥಿರ) EF-ಟು (ಉದ್ದದ ಅಂಶ ಥರ್ಮೋ ಅಸ್ಥಿರ) EF-G (ಉದ್ದದ ಅಂಶ G) EIF5A ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನುವಾದ GTPase ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಸಹ ನೋಡಿ.