Citrate synthase family
ಆಣ್ವಿಕ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರದಲ್ಲಿ, ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಸಿಟ್ರೇಟ್ ಸಿಂಥೇಸ್ ಕುಟುಂಬವು ಕಿಣ್ವಗಳಾದ ಸಿಟ್ರೇಟ್ ಸಿಂಥೇಸ್ ಮತ್ತು ಸಂಬಂಧಿತ ಕಿಣ್ವಗಳಾದ 2-ಮೀಥೈಲ್ಸಿಟ್ರೇಟ್ ಸಿಂಥೇಸ್ ಮತ್ತು ಎಟಿಪಿ ಸಿಟ್ರೇಟ್ ಲೈಸ್ ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಸಿಟ್ರೇಟ್ ಸಿಂಥೇಸ್ ಕಿಣ್ವಗಳ ಒಂದು ಸಣ್ಣ ಕುಟುಂಬದ ಸದಸ್ಯರಾಗಿದ್ದು, ಲೋಹದ ಅಯಾನು ಕೋಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ಗಳ ಉಪಸ್ಥಿತಿಯಿಲ್ಲದೆ ನೇರವಾಗಿ ಇಂಗಾಲ-ಇಂಗಾಲದ ಬಂಧವನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ. ಇದು ಕ್ರೆಬ್ಸ್ ಚಕ್ರದಲ್ಲಿ ಮೊದಲ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ವೇಗವರ್ಧಿಸುತ್ತದೆ, ಅವುಗಳೆಂದರೆ ಆಕ್ಸಲೋಅಸಿಟೇಟ್ ಮತ್ತು ಅಸಿಟೈಲ್-ಕೋಎಂಜೈಮ್ ಎ ಅನ್ನು ಸಿಟ್ರೇಟ್ ಮತ್ತು ಕೋಎಂಜೈಮ್ ಎ ಆಗಿ ಪರಿವರ್ತಿಸುವುದು. ಈ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯು ಶಕ್ತಿಯ ಉತ್ಪಾದನೆಗೆ ಮತ್ತು ಇಂಗಾಲದ ಸಮೀಕರಣಕ್ಕೆ ಮುಖ್ಯವಾಗಿದೆ. ಈ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯು 2-ಹಂತದ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಲ್ಲಿ ಕೋವೆಲೆಂಟ್ ಅಲ್ಲದ ಸಿಟ್ರಿಲ್-ಕೋಎಂಜೈಮ್ ಎ ಮಧ್ಯಂತರದ ಮೂಲಕ ಮುಂದುವರಿಯುತ್ತದೆ (ಆಲ್ಡೋಲ್-ಕ್ಲೈಸೆನ್ ಘನೀಕರಣದ ನಂತರ ಸಿಟ್ರಿಲ್-ಕೋಎಯ ಜಲವಿಚ್ಛೇದನ). ಸಿಟ್ರೇಟ್ ಸಿಂಥೇಸ್ ಕಿಣ್ವಗಳು ಎರಡು ವಿಭಿನ್ನ ರಚನಾತ್ಮಕ ವಿಧಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆಃ ಟೈಪ್ I ಕಿಣ್ವಗಳು (ಯುಕಾರ್ಯೋಟ್ಗಳು, ಗ್ರಾಮ್-ಪಾಸಿಟಿವ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಮತ್ತು ಆರ್ಕಿಯಾದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ) ಹೋಮೋಡೈಮರ್ಗಳನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಗ್ರಾಮ್-ನೆಗೆಟಿವ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಮತ್ತು ಹೆಕ್ಸಾಮೆರಿಕ್ ರಚನೆಯಲ್ಲಿರುವ ಟೈಪ್ II ಕಿಣ್ವಗಳಿಗಿಂತ ಚಿಕ್ಕದಾದ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ಎರಡೂ ವಿಧಗಳಲ್ಲಿ, ಮೊನೊಮರ್ ಎರಡು ಡೊಮೇನ್ಗಳಿಂದ ಕೂಡಿದೆಃ ಎರಡು ರಚನಾತ್ಮಕ ಪುನರಾವರ್ತನೆಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ದೊಡ್ಡ ಆಲ್ಫಾ-ಹೆಲಿಕಲ್ ಡೊಮೇನ್, ಅಲ್ಲಿ ಎರಡನೇ ಪುನರಾವರ್ತನೆಯು ಸಣ್ಣ ಆಲ್ಫಾ-ಹೆಲಿಕಲ್ ಡೊಮೇನ್ನಿಂದ ಅಡ್ಡಿಯಾಗುತ್ತದೆ. ಈ ಡೊಮೇನ್ಗಳ ನಡುವಿನ ಸೀಳು ಸಕ್ರಿಯ ತಾಣವನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ, ಅಲ್ಲಿ ಸಿಟ್ರೇಟ್ ಮತ್ತು ಅಸಿಟೈಲ್-ಕೋಎಂಜೈಮ್ ಎ ಎರಡೂ ಬಂಧಿಸುತ್ತವೆ. ಆಕ್ಸಲೋಸಿಟೇಟ್ ಲಿಗ್ಯಾಂಡ್ನ ಬಂಧನದ ಮೇಲೆ ಕಿಣ್ವವು ರಚನಾತ್ಮಕ ಬದಲಾವಣೆಗೆ ಒಳಗಾಗುತ್ತದೆ, ಇದರಿಂದಾಗಿ ಸಕ್ರಿಯ ಸೈಟ್ ಸೀಳು ಅಸಿಟೈಲ್-ಕೋಎ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್ ಅನ್ನು ರೂಪಿಸುವ ಸಲುವಾಗಿ ಮುಚ್ಚುತ್ತದೆ. ಡೊಮೇನ್ ಮುಚ್ಚುವಿಕೆಗೆ ಅಗತ್ಯವಾದ ಶಕ್ತಿಯು ತಲಾಧಾರದೊಂದಿಗೆ ಕಿಣ್ವದ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯಿಂದ ಬರುತ್ತದೆ. ಟೈಪ್ II ಕಿಣ್ವಗಳು ಹೆಚ್ಚುವರಿ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಬೀಟಾ-ಶೀಟ್ ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ, ಮತ್ತು ಕೆಲವು ಟೈಪ್ II ಕಿಣ್ವಗಳು ಎನ್ಎಡಿಎಚ್ನಿಂದ ಅಲೋಸ್ಟೆರಿಕಲ್ ಆಗಿ ಪ್ರತಿಬಂಧಿಸಲ್ಪಡುತ್ತವೆ. 2-ಮೀಥೈಲ್ಸಿಟ್ರೇಟ್ ಸಿಂಥೇಸ್ ಆಕ್ಸಲೋಅಸಿಟೇಟ್ ಮತ್ತು ಪ್ರೊಪಾನೊಯಿಲ್-CoA ಅನ್ನು (2R, 3S)-2-ಹೈಡ್ರಾಕ್ಸಿಬ್ಯೂಟೇನ್-1,2,3-ಟ್ರೈಕಾರ್ಬಾಕ್ಸಿಲೇಟ್ ಮತ್ತು ಕೋಎಂಜೈಮ್ A ಆಗಿ ಪರಿವರ್ತಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಕಿಣ್ವವು ಪ್ರೊಪಿಯೊನೇಟ್ ಮೇಲೆ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಪ್ರಚೋದಿಸಲ್ಪಡುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಟೈಪ್ II ಹೆಕ್ಸಾಮೆರಿಕ್ ಸಿಟ್ರೇಟ್ ಸಿಂಥೇಸ್ ರಚನಾತ್ಮಕವಾಗಿದೆ. ಎಟಿಪಿ ಸಿಟ್ರೇಟ್ ಲೈಸ್, ಸಿಟ್ರೇಟ್ನ ಸಿಒಎ-ಅವಲಂಬಿತ ಸೀಳನ್ನು ಆಕ್ಸಲೋಅಸಿಟೇಟ್ ಮತ್ತು ಅಸಿಟೈಲ್-ಸಿಒಎ ಆಗಿ ವೇಗವರ್ಧಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಇಂಗಾಲದ ಡೈಆಕ್ಸೈಡ್ ಅನ್ನು ಸರಿಪಡಿಸಲು ವಿವಿಧ ಆಟೋಟ್ರೊಫಿಕ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಮತ್ತು ಆರ್ಕಿಯಾಗಳು ಬಳಸುವ ಸಿಒ2 ಸಮೀಕರಣದ ರಿಡಕ್ಟಿವ್ ಟ್ರೈಕಾರ್ಬಾಕ್ಸಿಲಿಕ್ ಆಸಿಡ್ ಮಾರ್ಗದಲ್ಲಿ ಪ್ರಮುಖ ಹಂತವಾಗಿದೆ. ಎಟಿಪಿ ಸಿಟ್ರೇಟ್ ಲೈಸ್ ಎರಡು ವಿಭಿನ್ನ ಉಪಘಟಕಗಳಿಂದ ಕೂಡಿದೆ. ಯುಕಾರ್ಯೋಟ್ಗಳಲ್ಲಿ, ಎಟಿಪಿ ಸಿಟ್ರೇಟ್ ಲೈಸ್ ಒಂದೇ ದೊಡ್ಡ ಪಾಲಿಪೆಪ್ಟೈಡ್ನ ಹೋಮೊಟೆಟ್ರಾಮರ್ ಆಗಿದೆ, ಮತ್ತು ಇದನ್ನು ಮೈಟೊಕಾಂಡ್ರಿಯದಿಂದ ಉತ್ಪತ್ತಿಯಾಗುವ ಸಿಟ್ರೇಟ್ನಿಂದ ಸೈಟೋಸೊಲಿಕ್ ಅಸಿಟೈಲ್-ಕೋಎ ಅನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸಲು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳು