SmY RNA
ಎಸ್ಎಂವೈ ರಿಬೋನ್ಯೂಕ್ಲಿಕ್ ಆಮ್ಲಗಳು (ಎಸ್ಎಂವೈ ಆರ್ಎನ್ಎಗಳು) ನೆಮಟೋಡ್ ಹುಳುಗಳ ಕೆಲವು ಪ್ರಭೇದಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಸಣ್ಣ ಪರಮಾಣು ಆರ್ಎನ್ಎಗಳ ಒಂದು ಕುಟುಂಬವಾಗಿದೆ. ಅವರು ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ಟ್ರಾನ್ಸ್-ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್ನಲ್ಲಿ ಭಾಗಿಯಾಗಿದ್ದಾರೆಂದು ಭಾವಿಸಲಾಗಿದೆ. ಎಸ್ಎಂವೈ ಆರ್ಎನ್ಎಗಳು ಸುಮಾರು 70-90 ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳ ಉದ್ದವಿರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಎಸ್ಎಂ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗೆ ಒಮ್ಮತದ ಬಂಧಿಸುವ ಸ್ಥಳವನ್ನು ಸುತ್ತುವರೆದಿರುವ ಎರಡು ಕಾಂಡ-ಲೂಪ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಾಮಾನ್ಯ ದ್ವಿತೀಯಕ ರಚನೆಯನ್ನು ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ. ಎಸ್. ಎಂ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸ್ಪ್ಲಿಸಿಯೋಸೋಮಲ್ ಎಸ್. ಎನ್. ಆರ್. ಎನ್. ಪಿ. ಗಳ ಹಂಚಿಕೆಯ ಅಂಶವಾಗಿದೆ. ಎಸ್ಎಂವೈ ಆರ್ಎನ್ಎಗಳು ಕ್ರೊಮಾಡೋರಿಯಾ ವರ್ಗದ ನೆಮಟೋಡ್ಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬಂದಿವೆ, ಇದರಲ್ಲಿ ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲಾದ ನೆಮಟೋಡ್ಗಳು (ಸಿನೋರಹ್ಯಾಬ್ಡೈಟಿಸ್, ಪ್ರಿಸ್ಟಿಯಾಂಕಸ್ ಮತ್ತು ಅಸ್ಕಾರಿಸ್ನಂತಹವು) ಸೇರಿವೆ, ಆದರೆ ಡೊರಿಲೈಮಿಯಾ ವರ್ಗದ ಹೆಚ್ಚು ದೂರದ ಸಂಬಂಧಿತ ಟ್ರೈಚಿನೆಲ್ಲಾ ಸ್ಪೈರಾಲಿಸ್ನಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವುದಿಲ್ಲ. ಪ್ರತಿ ಪ್ರಭೇದದಲ್ಲಿನ ಎಸ್ಎಂವೈ ವಂಶವಾಹಿಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯು ಬದಲಾಗುತ್ತದೆ, ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಿನೋರಹ್ಯಾಬಿಡಿಟಿಸ್ ಮತ್ತು ಪ್ರಿಸ್ಟಿಯನ್ಕಸ್ ಪ್ರಭೇದಗಳು 10-26 ಸಂಬಂಧಿತ ಪ್ಯಾರಾಲೋಗಸ್ ಪ್ರತಿಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದರೆ, ಇತರ ನೆಮಟೋಡ್ಗಳು 1-5 ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ಮೊದಲ ಎಸ್ಎಂವೈ ಆರ್ಎನ್ಎಯನ್ನು 1996ರಲ್ಲಿ ಶುದ್ಧೀಕರಿಸಿದ ಅಸ್ಕಾರಿಸ್ ಲುಂಬ್ರಿಕೋಯಿಡ್ಸ್ ಸ್ಪ್ಲಿಸೋಸೋಮ್ ಸಿದ್ಧತೆಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲಾಯಿತು, ಹಾಗೆಯೇ ಎಸ್ಎಂಎಕ್ಸ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಮತ್ತೊಂದು ಆರ್ಎನ್ಎಯನ್ನು ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಲಾಗದಷ್ಟು ಎಸ್ಎಂವೈಗೆ ಏಕರೂಪವಾಗಿಲ್ಲ. ಸಿನೋರಹ್ಯಾಬ್ಡಿಟಿಸ್ ಎಲಿಗನ್ಸ್ನಲ್ಲಿ ಹನ್ನೆರಡು ಎಸ್ಎಂವೈ ಹೋಮೋಲಾಗ್ಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಸಿನೋರಹ್ಯಾಬ್ಡಿಟಿಸ್ ಬ್ರಿಗ್ಸ್ನಲ್ಲಿ ಹತ್ತು ಹೋಮೋಲಾಗ್ಗಳನ್ನು ಗಣನೆಗೆ ಗುರುತಿಸಲಾಗಿದೆ. ಈ ಎಸ್ಎಂವೈ ವಂಶವಾಹಿಗಳ ಹಲವಾರು ನಕಲುಗಳನ್ನು ಕ್ಲೋನ್ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಸಿ. ಎಲಿಗನ್ಸ್ನಲ್ಲಿ ಸಣ್ಣ ನಾನ್-ಕೋಡಿಂಗ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ನಕಲುಗಳ ವ್ಯವಸ್ಥಿತ ಸಮೀಕ್ಷೆಯಲ್ಲಿ ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸಲಾಗಿದೆ. ಆಂಟಿ ಟಿಎಂಜಿ ಪ್ರತಿಕಾಯಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು C.elegans ನಲ್ಲಿ 2,2,7-ಟ್ರೈಮೆಥೈಲ್ಗುವಾನೋಸಿನ್ (ಟಿಎಂಜಿ) 5 'ಕ್ಯಾಪ್ಡ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ಗಳ ವ್ಯವಸ್ಥಿತ ಸಮೀಕ್ಷೆಯು ಎರಡು ಟಿಎಂಜಿ ಕ್ಯಾಪ್ಡ್ ಎಸ್ಎಂವೈ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಿದೆ. ಈ ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳಲ್ಲಿನ ಸಂಭಾವ್ಯ ಎಸ್ಎಂ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ತಾಣಗಳ ಅನುಕ್ರಮ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಎಸ್ಎಂವೈ, ಯು5 ಎಸ್ಎನ್ಆರ್ಎನ್ಎ, ಯು3 ಎಸ್ಎನ್ಆರ್ಎನ್ಎ ಮತ್ತು ಸ್ಪ್ಲೈಸ್ಡ್ ಲೀಡರ್ ಆರ್ಎನ್ಎಗಳ ಪ್ರತಿಲೇಖನಗಳು (ಎಸ್ಎಲ್1 ಮತ್ತು ಎಸ್ಎಲ್2) ಎಲ್ಲಾ ಒಂದೇ ರೀತಿಯ ಒಮ್ಮತದ ಎಸ್ಎಂ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು (ಎಎಯು4-5ಜಿಜಿಎ) ಹೊಂದಿವೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಯು1, ಯು2 ಮತ್ತು ಯು4 ಎಸ್ಎನ್ಆರ್ಎನ್ಎ ನಕಲುಗಳಲ್ಲಿ ಗುರುತಿಸಲಾದ ಊಹಿಸಲಾದ ಎಸ್ಎಂ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ತಾಣಗಳು ಈ ಒಮ್ಮತದಿಂದ ಭಿನ್ನವಾಗಿವೆ. ಸಿ. ಎಲಿಗನ್ಸ್ನಲ್ಲಿ, ಎಸ್ಎಂವೈ ಆರ್ಎನ್ಎಗಳು ಸ್ಪ್ಲಿಸಿಯೋಸೋಮ್ ಮತ್ತು ಎಸ್ಎಂ, ಎಸ್ಎಲ್75ಪಿ ಮತ್ತು ಎಸ್ಎಲ್26ಪಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಯೋಜಿಸುತ್ತವೆ, ಆದರೆ ಉತ್ತಮ-ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಸಿ. ಎಲಿಗನ್ಸ್ ಎಸ್ಎಲ್1 ಟ್ರಾನ್ಸ್-ಸ್ಪ್ಲಿಸಿಂಗ್ ಎಸ್ಎನ್ಆರ್ಎನ್ಎ ಎಸ್ಎಂ, ಎಸ್ಎಲ್75ಪಿ ಮತ್ತು ಎಸ್ಎಲ್21ಪಿ (ಎಸ್ಎಲ್26ಪಿಯ ಪ್ಯಾರಾಲಾಗ್) ನೊಂದಿಗೆ ಸಂಕೀರ್ಣದಲ್ಲಿ ಸಂಯೋಜಿಸುತ್ತದೆ. ಎಸ್ಎಲ್21ಪಿ ಅಥವಾ ಎಸ್ಎಲ್26ಪಿಯ ಕಾರ್ಯದ ನಷ್ಟವು ಪ್ರತ್ಯೇಕವಾಗಿ ದುರ್ಬಲ ಶೀತ-ಸೂಕ್ಷ್ಮ ಫಿನೋಟೈಪ್ ಅನ್ನು ಮಾತ್ರ ಉಂಟುಮಾಡುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಎಸ್ಎಲ್75ಪಿ ನಾಕ್ಡೌನ್ ನಂತೆ ಎರಡರ ನಾಕ್ಡೌನ್ ಮಾರಕವಾಗಿದೆ. ಈ ಫಲಿತಾಂಶಗಳ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ, ಎಸ್ಎಂವೈ ಆರ್ಎನ್ಎಗಳು ಟ್ರಾನ್ಸ್-ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್ನಲ್ಲಿ ಒಂದು ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ ಎಂದು ನಂಬಲಾಗಿದೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು ನಾನ್-ಕೋಡಿಂಗ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ಸಣ್ಣ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯರ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ಆರ್ಎನ್ಎ ಸ್ಪ್ಲೈಸಿಂಗ್ ನೆಮಟೋಡ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲಗಳು