Hfq binding sRNA
ಎಚ್ಎಫ್ಕ್ಯು ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಎಸ್ಆರ್ಎನ್ಎ ಎಂಬುದು ಎಚ್ಎಫ್ಕ್ಯು ಎಂಬ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಆರ್ಎನ್ಎ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ಬಂಧಿಸುವ ಎಸ್ಆರ್ಎನ್ಎ ಆಗಿದೆ. ಹಲವಾರು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಸಣ್ಣ ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಗಳು ಎಚ್. ಎಫ್. ಕ್ಯು. ಗೆ ಬಂಧಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ (ಪಟ್ಟಿಯನ್ನು ನೋಡಿ). ಈ ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಗಳಲ್ಲಿ ಅನೇಕವು ಮೂರು ಕಾಂಡ-ಲೂಪ್ಗಳಿಂದ ಕೂಡಿದ ಒಂದೇ ರೀತಿಯ ರಚನೆಯನ್ನು ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ. ಹಲವಾರು ಅಧ್ಯಯನಗಳು ಈ ಪಟ್ಟಿಯನ್ನು ವಿಸ್ತರಿಸಿವೆ ಮತ್ತು ಸಾಲ್ಮೊನೆಲ್ಲಾ ಟೈಫಿಮುರಿಯಂನಲ್ಲಿ ಒಟ್ಟು 64 ಎಚ್ಎಫ್ಕ್ಯು ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಎಸ್ಆರ್ಎನ್ಎಯನ್ನು ಪ್ರಾಯೋಗಿಕವಾಗಿ ಮೌಲ್ಯೀಕರಿಸಿವೆ. ಸಾಲ್ಮೊನೆಲ್ಲಾದಲ್ಲಿನ ಎಚ್ಎಫ್ಕ್ಯು ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್ಗಳ ಮೇಲೆ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೋಮ್ ವ್ಯಾಪಕ ಅಧ್ಯಯನವು ಎಸ್ಆರ್ಎನ್ಎಗಳೊಳಗೆ 126 ಎಚ್ಎಫ್ಕ್ಯು ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್ಗಳನ್ನು ಮ್ಯಾಪ್ ಮಾಡಿದೆ. ಎಚ್ಎಫ್ಕ್ಯು ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಆರ್ಎನ್ಎಗಳು 5 '-ಅಯಾಯಾ-3' ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ಸಮೃದ್ಧವಾಗಿವೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲು ಜೀನೋಮಿಕ್ ಸೆಲೆಕ್ಸ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಲಾಗಿದೆ. ಜೀನೋಮ್-ವೈಡ್ ಅಧ್ಯಯನವು ಸಸ್ಯ ರೋಗಕಾರಕ ಎರ್ವಿನಿಯಾ ಅಮಿಲೋವೊರಾದಲ್ಲಿ 40 ಅಭ್ಯರ್ಥಿ ಎಚ್ಎಫ್ಕ್ಯು-ಅವಲಂಬಿತ ಎಸ್ಆರ್ಎನ್ಎಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಿದೆ. ಅವುಗಳಲ್ಲಿ 12ನ್ನು ನಾರ್ದರ್ನ್ ಬ್ಲಾಟ್ ದೃಢಪಡಿಸಿದೆ. ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಎಚ್ಎಫ್ಕ್ಯು ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಎಸ್ಆರ್ಎನ್ಎಗಳು ಡಿಐಸಿಎಫ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ಡಿಎಸ್ಆರ್ಎ ಆರ್ಎನ್ಎ ಎಫ್ಎನ್ಆರ್ಎಸ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ಗ್ಯಾಡ್ವೈ ಆರ್ಎನ್ಎ ಜಿಸಿವಿಬಿ ಆರ್ಎನ್ಎ ಇಸರ್ಜೆ ಆರ್ಎನ್ಎ ಮೈಕಾ ಆರ್ಎನ್ಎ ಮೈಕಾ ಆರ್ಎನ್ಎ ಮೈಕಾ ಆರ್ಎನ್ಎ ಮೈಕಾ ಆರ್ಎನ್ಎ ಮೈಕಾ ಆರ್ಎನ್ಎ ಓಮ್ರಾ ಆರ್ಎನ್ಎ/ಓಮರ್ಬಿ ಆರ್ಎನ್ಎ/ರೈಗಾ ಆರ್ಎನ್ಎ ಮೈಕಾ ಆರ್ಎನ್ಎ ಓಮ್ರಾ ಆರ್ಎನ್ಎ/ರೈಗ್ಬಿ ಆರ್ಎನ್ಎ/ರೈಗ್ಬಿ ಆರ್ಎನ್ಎ ಆಕ್ಸಿಎಸ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ಕ್ಯೂಆರ್ಆರ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ಆರ್ಎಂಎ ಆರ್ಎನ್ಎ ಆರ್ಆರ್ಎನ್ಎ ರೈಬಿಬಿ ಆರ್ಎನ್ಎ ರೈಡ್ಸಿ ಆರ್ಎನ್ಎ ರೈಬ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ರೈಬ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ರೈಬ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ರೈಬ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ರೈಬ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ರೈಬ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ರೈಬ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ರೈಬ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ರೈಬ್ ಆರ್ಎನ್ಎ