EF-Ts
ಇಎಫ್-ಟಿಎಸ್ (ಉದ್ದದ ಅಂಶ ಥರ್ಮೋ ಸ್ಥಿರ) ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಉದ್ದದ ಅಂಶಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದಾಗಿದೆ. ಇದು ಮಾನವನ ಮೈಟೊಕಾಂಡ್ರಿಯದಲ್ಲಿ ಟಿ. ಎಸ್. ಎಫ್. ಎಂ. ಎಂದು ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ. ಇದು ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ EF-1B ಅನ್ನು ಹೋಲುತ್ತದೆ. ಇಎಫ್-ಟಿಎಸ್ ಇಎಫ್-ಟು (ಉದ್ದನೆಯ ಅಂಶ ಥರ್ಮೋ ಅಸ್ಥಿರ) ಗೆ ಗ್ವಾನೈನ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ವಿನಿಮಯ ಅಂಶವಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಇಎಫ್-ಟುನಿಂದ ಗ್ವಾನೋಸಿನ್ ಡೈಫಾಸ್ಫೇಟ್ನ ಬಿಡುಗಡೆಯನ್ನು ವೇಗವರ್ಧಿಸುತ್ತದೆ. ಇದು ಇಎಫ್-ಟು ಅನ್ನು ಹೊಸ ಗ್ವಾನೋಸಿನ್ ಟ್ರೈಫಾಸ್ಫೇಟ್ ಅಣುವಿನೊಂದಿಗೆ ಬಂಧಿಸಲು, ಇಎಫ್-ಟಿಎಸ್ ಅನ್ನು ಬಿಡುಗಡೆ ಮಾಡಲು ಮತ್ತು ಮತ್ತೊಂದು ಅಮೈನೋಸೈಲ್ ಟಿಆರ್ಎನ್ಎ ಸೇರ್ಪಡೆಯನ್ನು ವೇಗವರ್ಧಿಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ರಚನೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕ್ಯೂಬಿಟಾ-ರೆಪ್ಲಿಕೇಸ್ ಒಂದು ಟೆಟ್ರಾಮೆರಿಕ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಗಿದೆ, ಅಂದರೆ ಇದು ನಾಲ್ಕು ಉಪಘಟಕಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಈ ಉಪಘಟಕಗಳು ಎರಡು ಉದ್ದನೆಯ ಅಂಶಗಳಾಗಿವೆ, ಇಎಫ್-ಟು ಮತ್ತು ಇಎಫ್-ಟಿಎಸ್, ರೈಬೋಸೋಮಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಉಪಘಟಕ ಎಸ್1, ಮತ್ತು ಆರ್ಎನ್ಎ ಅವಲಂಬಿತ ಆರ್ಎನ್ಎ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ β-ಉಪಘಟಕ. ಎರಡು ಉದ್ದದ ಅಂಶಗಳು ದಿ ಎಲೋಂಗೇಷನ್ ಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಕಾಂಪ್ಲೆಕ್ಸ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಹೆಟೆರೊಡೈಮರ್ ರಚನೆಯನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ, ಇದು ಆರ್. ಡಿ. ಆರ್. ಪಿ β-ಸಬ್ಯೂನಿಟ್ನ ಪಾಲಿಮರೀಕರಣ ಚಟುವಟಿಕೆಗೆ ಅವಶ್ಯಕವಾಗಿದೆ. ಇದರ ದ್ವಿತೀಯಕ ರಚನಾತ್ಮಕ ಘಟಕಗಳು α-ಹೆಲಿಕ್ಸ್, β-ಶೀಟ್ಗಳು ಮತ್ತು β-ಬ್ಯಾರೆಲ್ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತವೆ. ಇಎಫ್-ಟಿಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಮೇಲ್ಭಾಗದ ಬಹುಪಾಲು ಭಾಗವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತವೆ, ಆದರೆ ಇಎಫ್-ಟು ಬೀಟಾ ಬ್ಯಾರೆಲ್ಗಳು ಕಂಡುಬರುವ ಕೆಳಗಿನ ಅರ್ಧವನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ. ಇಎಫ್-ಟುನಲ್ಲಿ ಯಾವುದೇ ಗ್ವಾನೈನ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಸಕ್ರಿಯ ತಾಣಕ್ಕೆ ಬಂಧಿಸದಿದ್ದಾಗ ಈ ರಚನೆಯನ್ನು ಮುಕ್ತವೆಂದು ಪರಿಗಣಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಇಎಫ್-ಟಿಎಸ್ ಸರಪಳಿಯು ನಾಲ್ಕು ಪ್ರಮುಖ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಡೊಮೇನ್, ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಡೊಮೇನ್, ಡೈಮೆರೈಸೇಶನ್ ಡೊಮೇನ್ ಮತ್ತು ಕೋರ್ ಡೊಮೇನ್ ಇವೆಲ್ಲವೂ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ರಚನೆ ಮತ್ತು ಕಾರ್ಯಚಟುವಟಿಕೆಯಲ್ಲಿ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪಾತ್ರವನ್ನು ವಹಿಸುತ್ತವೆ. ಡೈಮೆರೈಸೇಶನ್ ಡೊಮೇನ್ ನಾಲ್ಕು ಆಂಟಿ-ಪ್ಯಾರಲಲ್ α-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಇದು ಡೈಮರ್ ರಚನೆಯ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ರೂಪಿಸಲು ಇಎಫ್-ಟು ಮತ್ತು ಇಎಫ್-ಟಿಗಳ ನಡುವಿನ ಸಂಪರ್ಕದ ಮುಖ್ಯ ಮೂಲವಾಗಿದೆ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಡೊಮೇನ್ ಲೈವ್ಸ್ 1-54 (ಎನ್1-ಎನ್54) ನಿಂದ ವ್ಯಾಪಿಸಿದೆ, ಕೋರ್ ಡೊಮೇನ್ ಎನ್55-ಎನ್179 ರಿಂದ, ಡೈಮೆರೈಸೇಶನ್ ಡೊಮೇನ್ ಎನ್180-ಎನ್228 ರಿಂದ, ಮತ್ತು ಕೊನೆಯದಾಗಿ ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಡೊಮೇನ್ ಎನ್264-ಎನ್282 ನಿಂದ. ಕೋರ್ ಡೊಮೇನ್ ಎರಡು ಉಪ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಸಿ ಮತ್ತು ಎನ್ ಇವು ಅನುಕ್ರಮವಾಗಿ ಇಎಫ್-ಟು ಡೊಮೇನ್ 3 ಮತ್ತು 1 ರೊಂದಿಗೆ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುತ್ತವೆ. ಉದ್ದನೆಯ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯ ಮಾರ್ಗ ಇಎಫ್-ಟಿಎಸ್ ಗ್ವಾನೈನ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ವಿನಿಮಯ ಅಂಶವಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಇಎಫ್-ಟು * ಜಿಡಿಪಿಯ (ನಿಷ್ಕ್ರಿಯ ರೂಪ) ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಇಎಫ್-ಟು * ಜಿಟಿಪಿ (ಸಕ್ರಿಯ) ಗೆ ವೇಗವರ್ಧಿಸುತ್ತದೆ. ಇಎಫ್-ಟು (ಸಕ್ರಿಯ) ನಂತರ ಅಮೈನೋಅಸೈಲ್-ಟಿಆರ್ಎನ್ಎಯನ್ನು ರೈಬೋಸೋಮ್ಗೆ ತಲುಪಿಸುತ್ತದೆ. ಆದ್ದರಿಂದ, ಮತ್ತೊಂದು ವಿಸ್ತರಣೆಯ ಚಕ್ರವನ್ನು ಪೂರ್ಣಗೊಳಿಸಲು ಇಎಫ್-ಟಿಯು ಅನ್ನು ಅದರ ಸಕ್ರಿಯ ಸ್ಥಿತಿಗೆ ಮರುಬಳಕೆ ಮಾಡುವುದು ಇಎಫ್-ಟಿಎಸ್ನ ಮುಖ್ಯ ಪಾತ್ರವಾಗಿದೆ. ಈ ಮಾರ್ಗದ ಬಹುಪಾಲು ಭಾಗವನ್ನು ಇಎಫ್-ಟು ಡೊಮೇನ್ 1 ರ ರಚನಾತ್ಮಕ ಬದಲಾವಣೆಗಳ ಮೂಲಕ ನಿರ್ವಹಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಸಕ್ರಿಯ ಸೈಟ್ ಮತ್ತು ರೈಬೋಸೋಮ್ ಮತ್ತು ಟಿಆರ್ಎನ್ಎಯಿಂದ ಸ್ವಿಚ್ 1 ಮತ್ತು 2 ಪ್ರದೇಶಗಳ ಕುಶಲತೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಮೊದಲನೆಯದಾಗಿ, ಇಎಫ್-ಟಿಯ ಡೊಮೇನ್ 1 ರಲ್ಲಿ ಜಿಟಿಪೇಸ್ ಚಟುವಟಿಕೆಯ ತಾಣವನ್ನು ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಅವಶೇಷಗಳ ಸರಣಿಯಿಂದ ನಿರ್ಬಂಧಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಇಎಫ್-ಟಿಎಸ್ ಮೂಲಕ ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವ ಮೊದಲು ವೇಗವರ್ಧಕ ಅವಶೇಷವಾದ ಹಿಸ್ 84 ಅನ್ನು ನಿಷ್ಕ್ರಿಯ ರೂಪದಲ್ಲಿ ನಿರ್ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ. ಒಮ್ಮೆ ಟಿ. ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಯು ಇ. ಎಫ್.-ಟು. ಗೆ ಬಂಧಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ನಂತರ, ಅದನ್ನು ರೈಬೋಸೋಮ್ಗೆ ತಲುಪಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಜಿ. ಟಿ. ಪಿ. ಯನ್ನು ಜಲವಿಚ್ಛೇದನಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಇ. ಎಫ್.-ಟು. ಅನ್ನು ಟಿ. ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಗೆ ಬಂಧಿಸಲು ಕಡಿಮೆ ಆಕರ್ಷಣೆಯೊಂದಿಗೆ ಬಿಡುತ್ತದೆ. ರೈಬೋಸೋಮ್ ಸ್ವಿಚ್ 1 ಪ್ರದೇಶದ ಕುಶಲತೆಯ ಮೂಲಕ ಇದನ್ನು ಮಾಡುತ್ತದೆ, ಜಿಟಿಪಿ ಜಲವಿಚ್ಛೇದನದ ನಂತರ ದ್ವಿತೀಯಕ ರಚನೆಯು ಪ್ರಾಥಮಿಕವಾಗಿ α-ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳಿಂದ β-ಹೇರ್ಪಿನ್ಗೆ ಬದಲಾಗುತ್ತದೆ. ಇಎಫ್-ಟಿಎಸ್ನಿಂದ ಮತ್ತೊಮ್ಮೆ ಸಕ್ರಿಯಗೊಳ್ಳುವವರೆಗೆ ಚಕ್ರವನ್ನು ಪೂರ್ಣಗೊಳಿಸುವ ನಿಷ್ಕ್ರಿಯ ಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿರುವ ರೈಬೋಸೋಮ್ನಿಂದ ಇಎಫ್-ಟಿಯು ಬಿಡುಗಡೆಯಾಗುತ್ತದೆ. ಇಎಫ್-ಟಿಯ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಡಿ ಗ್ವಾನೈನ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ವಿನಿಮಯಕ್ಕಾಗಿ ಇಎಫ್-ಟಿಎಸ್ನ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಡೊಮೇನ್ನೊಂದಿಗೆ ಸಂವಹನ ನಡೆಸಬೇಕು. ಇತ್ತೀಚಿನ ಅಧ್ಯಯನವು ಮಾರ್ಗದಲ್ಲಿ ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಪ್ರಾಥಮಿಕ ಅವಶೇಷಗಳನ್ನು ನೋಡಲು ಇಎಫ್-ಟು ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಡಿ ಮೇಲೆ ಕೆಲವು ಅವಶೇಷಗಳನ್ನು ಪರಿವರ್ತಿಸುವ ಮೂಲಕ ಗ್ವಾನೈನ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ವಿನಿಮಯದ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯ ಚಲನಶಾಸ್ತ್ರವನ್ನು ಸಂಶೋಧಿಸಿದೆ. ಲ್ಯೂ148 ಮತ್ತು ಗ್ಲು 152ರ ರೂಪಾಂತರವು ಇಎಫ್-ಟಿಎಸ್ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಡೊಮೇನ್ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಡಿಗೆ ಬಂಧಿಸುವ ದರವನ್ನು ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ಕಡಿಮೆ ಮಾಡಿತು, ಈ ಎರಡು ಅವಶೇಷಗಳು ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯ ಮಾರ್ಗದಲ್ಲಿ ಪ್ರಮುಖ ಪಾತ್ರವಹಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ತೀರ್ಮಾನಿಸಿತು. ಈ ಲೇಖನವು ಇಎಫ್-ಟಿಗಳ ಮೇಲೆ ಕೇಂದ್ರೀಕರಿಸುತ್ತದೆ ಏಕೆಂದರೆ ಇದು ಕ್ಯೂಬಿಟಾ-ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯೊಫೇಜ್ನಲ್ಲಿ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿದೆ, ಆದಾಗ್ಯೂ ಅನೇಕ ಜೀವಿಗಳು ಇಎಫ್-ಟಿಗಳಂತೆಯೇ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಇದೇ ರೀತಿಯ ಉದ್ದನೆಯ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಬಳಸುತ್ತವೆ. ಇಎಫ್-ಟಿಎಸ್ ಗ್ವಾನೈನ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ವಿನಿಮಯ ಅಂಶಗಳು ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಗುಂಪಿಗೆ ಸೇರಿದೆ ಮತ್ತು ಈ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಅನೇಕ ವಿಭಿನ್ನ ಜೀವರಾಸಾಯನಿಕ ಮಾರ್ಗಗಳಲ್ಲಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ, ಇದು ಟಿಎಸ್ಎಫ್ ಸೂಪರ್ಫ್ಯಾಮಿಲಿಗೆ ಸೇರಿದೆ. ಇತರ ಜೀವಿಗಳ ನಡುವೆ ಕಂಡುಬರುವ ಬಹುಪಾಲು ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲ ಸಂರಕ್ಷಣೆಯು ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಡೊಮೇನ್ನಲ್ಲಿದೆ, ಅಲ್ಲಿ ಇಎಫ್-ಟಿಗಳು ಇಎಫ್-ಟುಗೆ ಬಂಧಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಗ್ವಾನೈನ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ವಿನಿಮಯವು ಸಂಭವಿಸುತ್ತದೆ. ಇತರ ಜೀವಿಗಳಲ್ಲಿ ಇರುವಂತೆ ಇಎಫ್-ಟಿಗಳ ಪ್ರಮುಖ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಡೊಮೇನ್ನ ಜೋಡಣೆಯನ್ನು ಕೆಳಗೆ ನೀಡಲಾಗಿದೆ. E.Coli: 8-LVKELRETGAGMDCCKALT-20 LACBS: 8-LVAELRKRTEVSITKAREALS-20 ಬಾಸ್ ಟಾರಸ್ಃ 8-LLMKLRKTGYSFINCKKALE-20 ಡ್ರೊಸೊಫಿಲಾಃ 8-ALAALRKKTGYTFANCKKKALE-20 ಎಲ್ಲಾ ನಾಲ್ಕು ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳಲ್ಲಿ ಸಂರಕ್ಷಿತ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳು ಲಿಯು 12 ಮತ್ತು ಆರ್ಗ್ 18 (ಮೇಲಿನ ದಪ್ಪ ಅಕ್ಷರಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ), ಈ ಎರಡು ಅವಶೇಷಗಳು ಗ್ವಾನೈನ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಟೈಡ್ ವಿನಿಮಯದಲ್ಲಿ ಪ್ರಮುಖ ಪಾತ್ರವಹಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ತೀರ್ಮಾನಿಸಬಹುದು ಏಕೆಂದರೆ ಅವು ಕೇವಲ ಎರಡು ಮಾತ್ರ ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಸಂರಕ್ಷಿತವಾಗಿವೆ. ಯುಕಾರ್ಯೋಟ್ಗಳಲ್ಲಿ ಇಎಫ್-1 ಅದೇ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ, ಮತ್ತು ಗ್ವಾನೈನ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ವಿನಿಮಯದ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವು ಇಎಫ್-ಟಿಗಳಂತೆಯೇ ಇರುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ರಚನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಭಿನ್ನವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಪ್ರೊಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಉದ್ದದ ಅಂಶಗಳು ಇಎಫ್-ಟು (ಉದ್ದದ ಅಂಶ ಥರ್ಮೋ ಅಸ್ಥಿರ) ಇಎಫ್-ಜಿ (ಉದ್ದದ ಅಂಶ ಜಿ) ಇಎಫ್-ಪಿ (ಉದ್ದದ ಅಂಶ ಪಿ) ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನುವಾದ ಜಿಟಿಪೇಸ್ ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಜೈವಿಕ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಸಹ ನೋಡಿ.