Isotope-coded affinity tag
ಐಸೊಟೋಪ್-ಕೋಡೆಡ್ ಅಫಿನಿಟಿ ಟ್ಯಾಗ್ (ಐಸಿಎಟಿ) ಎಂಬುದು ರಾಸಾಯನಿಕ ಲೇಬಲಿಂಗ್ ಕಾರಕಗಳನ್ನು ಬಳಸುವ ಮಾಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಮೆಟ್ರಿ ಮೂಲಕ ಪರಿಮಾಣಾತ್ಮಕ ಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ಸ್ಗಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುವ ಇನ್-ವಿಟ್ರೊ ಐಸೊಟೋಪಿಕ್ ಲೇಬಲಿಂಗ್ ವಿಧಾನವಾಗಿದೆ. ಈ ರಾಸಾಯನಿಕ ಶೋಧಕಗಳು ಮೂರು ಅಂಶಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತವೆಃ ಅಮೈನೊ ಆಸಿಡ್ ಸೈಡ್ ಚೈನ್ ಅನ್ನು ಲೇಬಲ್ ಮಾಡಲು ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಗುಂಪು (ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಸಿಸ್ಟೀನ್ ಅವಶೇಷಗಳನ್ನು ಮಾರ್ಪಡಿಸಲು ಅಯೋಡೋಅಸಿಟಮೈಡ್), ಐಸೊಟೋಪಿಕ್ ಕೋಡೆಡ್ ಲಿಂಕರ್, ಮತ್ತು ಲೇಬಲ್ ಮಾಡಲಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು/ಪೆಪ್ಟೈಡ್ಗಳ ಆಕರ್ಷಣೆಯನ್ನು ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲು ಟ್ಯಾಗ್ (ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಬಯೋಟಿನ್). ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಒಟ್ಟುಗೂಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ನಂತರ ಕ್ರೊಮ್ಯಾಟೋಗ್ರಫಿಯ ಮೂಲಕ ಬೇರ್ಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ನಂತರ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ನಡುವಿನ ದ್ರವ್ಯರಾಶಿ-ಚಾರ್ಜ್ ಅನುಪಾತವನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲು ಮಾಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಮೀಟರ್ ಮೂಲಕ ಕಳುಹಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಪೆಪ್ಟೈಡ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಸಿಸ್ಟೀನ್ ಅನ್ನು ಮಾತ್ರ ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಬಹುದು. ಪೆಪ್ಟೈಡ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಸಿಸ್ಟೀನ್ ಅನ್ನು ಮಾತ್ರ ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಲಾಗುತ್ತದೆಯಾದ್ದರಿಂದ, ಆಗಾಗ್ಗೆ ಅನುವಾದದ ನಂತರದ ಮಾರ್ಪಾಡು ಕಳೆದುಹೋಗುತ್ತದೆ. ಮೂಲ ಟ್ಯಾಗ್ಗಳನ್ನು ಡ್ಯೂಟೇರಿಯಂ ಬಳಸಿ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲಾಯಿತು, ಆದರೆ ನಂತರ ಅದೇ ಗುಂಪು ದ್ರವರೂಪದ ಕ್ರೊಮ್ಯಾಟೋಗ್ರಫಿಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಗರಿಷ್ಠ ಪ್ರತ್ಯೇಕತೆಯ ಸಮಸ್ಯೆಗಳನ್ನು ತಪ್ಪಿಸಲು 13ಸಿ ಬಳಸಿ ಟ್ಯಾಗ್ಗಳನ್ನು ಮರುವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಿತು, ಏಕೆಂದರೆ ಡ್ಯೂಟೇರಿಯಂ ಕಾಲಮ್ನ ಸ್ಥಾಯಿ ಹಂತದೊಂದಿಗೆ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುತ್ತದೆ. ಕ್ವಾಂಟಿಟೇಟಿವ್ ಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ಸ್ ಎರಡು ಪ್ರೋಟಿಯೋಮ್ಗಳ ಪರಿಮಾಣಾತ್ಮಕ ಹೋಲಿಕೆಗಾಗಿ, ಒಂದು ಮಾದರಿಯನ್ನು ಐಸೊಟೋಪಿಕಲಿ ಲೈಟ್ (ಡಿ0) ಪ್ರೋಬ್ ಮತ್ತು ಇನ್ನೊಂದನ್ನು ಐಸೊಟೋಪಿಕಲಿ ಹೆವಿ (ಡಿ8) ಆವೃತ್ತಿಯೊಂದಿಗೆ ಲೇಬಲ್ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ. ದೋಷವನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡಲು, ಎರಡೂ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ನಂತರ ಸಂಯೋಜಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಪ್ರೋಟಿಯೇಸ್ನೊಂದಿಗೆ (ಅಂದರೆ, ಟ್ರಿಪ್ಸಿನ್) ಜೀರ್ಣವಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಐಸೊಟೋಪ್-ಕೋಡೆಡ್ ಟ್ಯಾಗಿಂಗ್ ಕಾರಕಗಳೊಂದಿಗೆ ಲೇಬಲ್ ಮಾಡಲಾದ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ಗಳನ್ನು ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲು ಅವಿಡಿನ್ ಅಫಿನಿಟಿ ಕ್ರೊಮ್ಯಾಟೋಗ್ರಫಿಗೆ ಒಳಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಈ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ಗಳನ್ನು ನಂತರ ಲಿಕ್ವಿಡ್ ಕ್ರೊಮ್ಯಾಟೋಗ್ರಫಿ-ಮಾಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಮೆಟ್ರಿ (ಎಲ್ಸಿ-ಎಂಎಸ್) ಮೂಲಕ ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಎರಡು ಮಾದರಿಗಳಲ್ಲಿನ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಸಂಬಂಧಿತ ಮಟ್ಟವನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲು ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿ ಮಾಸ್-ಟ್ಯಾಗ್ ಮಾಡಲಾದ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಜೋಡಿಗಳ ಸಿಗ್ನಲ್ ತೀವ್ರತೆಗಳ ಅನುಪಾತಗಳನ್ನು ಪ್ರಮಾಣೀಕರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಜೀವರಸಾಯನಶಾಸ್ತ್ರ ಪತ್ತೆ ವಿಧಾನಗಳು ಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ಸ್