ORF9b
ಒಆರ್ಎಫ್9ಬಿ (ಹಿಂದೆ ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ ಒಆರ್ಎಫ್13 ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತಿತ್ತು) ಎಂಬುದು ಸಾರ್ಸ್-ಕೋವ್ ಮತ್ತು ಸಾರ್ಸ್-ಕೋವ್-2 ಸೇರಿದಂತೆ ಉಪಜಾತಿ ಸರ್ಬೆಕೊವೈರಸ್ನ ಕೊರೊನಾವೈರಸ್ಗಳಲ್ಲಿ ವೈರಲ್ ಪೂರಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ಸಂಕೇತಿಸುವ ಜೀನ್ ಆಗಿದೆ. ಇದು ಅತಿಕ್ರಮಿಸುವ ಜೀನ್ ಆಗಿದ್ದು, ಇದರ ತೆರೆದ ಓದುವ ಚೌಕಟ್ಟು ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಎನ್ ಜೀನ್ನೊಳಗೆ ಇರುತ್ತದೆ, ಇದು ಕೊರೊನಾವೈರಸ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಕ್ಯಾಪ್ಸಿಡ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ಸಂಕೇತಿಸುತ್ತದೆ. ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಎಸ್. ಎ. ಆರ್. ಎಸ್.-ಸಿ. ಓ. ವಿ. ಯಲ್ಲಿ 97 ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲದ ಅವಶೇಷಗಳು ಮತ್ತು ಎಸ್. ಎ. ಆರ್. ಎಸ್.-ಸಿ. ಓ. ವಿ.-2ರಲ್ಲಿ 98 ಆಗಿದ್ದು, ಎರಡೂ ಸಂದರ್ಭಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೈಮರ್ ಅನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ. ವೈಜ್ಞಾನಿಕ ಸಾಹಿತ್ಯದಲ್ಲಿ ಈ ವಂಶವಾಹಿಗೆ ಬಳಸಲಾದ ನಾಮಕರಣದಲ್ಲಿ ಅಸಮಂಜಸತೆ ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. SARS-CoV ಕುರಿತ ಕೆಲವು ಸಂಶೋಧನೆಗಳಲ್ಲಿ, ಇದನ್ನು ORF13 ಎಂದು ಉಲ್ಲೇಖಿಸಲಾಗಿದೆ. ಇದನ್ನು ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ ಒಆರ್ಎಫ್9ಎ ಎಂದೂ ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದರ ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ ಎಸ್ಎಆರ್ಎಸ್-ಕೋವ್ ನಲ್ಲಿ 76 ಕೋಡಾನ್ಗಳ ಕೆಳಮುಖ ಒಆರ್ಎಫ್ ಉಂಟಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಎನ್ ಜೀನ್ನೊಂದಿಗೆ ಅತಿಕ್ರಮಿಸುತ್ತದೆ, ಇದನ್ನು ಒಆರ್ಎಫ್9ಬಿ ಎಂದು ಹೆಸರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ನಾಮಕರಣವು ಉದ್ದವಾದ ಒಆರ್ಎಫ್ ಅನ್ನು 9ಬಿ ಎಂದು ಮತ್ತು ಕೆಳಭಾಗದ, ಚಿಕ್ಕದಾದ ಒಆರ್ಎಫ್ ಅನ್ನು ಒಆರ್ಎಫ್9ಸಿ ಎಂದು ಉಲ್ಲೇಖಿಸುತ್ತದೆ. ರಚನೆ ಒಆರ್ಎಫ್9ಬಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಎಸ್ಎಆರ್ಎಸ್-ಕೋವ್ ನಲ್ಲಿ 97 ಮತ್ತು ಎಸ್ಎಆರ್ಎಸ್-ಕೋವ್-2 ನಲ್ಲಿ 98 ಅಮೈನೊ ಆಸಿಡ್ ಅವಶೇಷಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಇದು ಮಧ್ಯದಲ್ಲಿ ಲಿಪಿಡ್ಗಳನ್ನು ಬಂಧಿಸುವ ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಕುಹರದೊಂದಿಗೆ ಬೀಟಾ ಶೀಟ್-ಸಮೃದ್ಧ ಹೋಮೋಡೈಮರ್ ಅನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ. ಲಿಪಿಡ್-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಕುಹರವು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ಪೊರೆಗಳಿಗೆ ಲಂಗರು ಹಾಕುವ ಅಸಾಮಾನ್ಯ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸಬಹುದು. SARS-CoV-2 ORF9b ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಒಂದು ತುಣುಕನ್ನು ಟಾಮ್ 70ನೊಂದಿಗೆ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಂಕೀರ್ಣದಲ್ಲಿ ರಚನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ನಿರೂಪಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದರಲ್ಲಿ ORF9b ಪ್ರತ್ಯೇಕವಾಗಿ ಕಂಡುಬರುವ ಬೀಟಾ-ಶೀಟ್ ರಚನೆಯ ಬದಲು ಆಲ್ಫಾ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಅನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಮಡಿಕೆ ಬದಲಾಯಿಸುವ ನಡವಳಿಕೆಯು ಬಯೋಇನ್ಫರ್ಮ್ಯಾಟಿಕ್ಸ್ ಮುನ್ಸೂಚನೆಗಳೊಂದಿಗೆ ಸ್ಥಿರವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು SARS-CoV ಹೋಮೋಲಾಗ್ಗೆ ಸಹ ಸಂಭವಿಸಬಹುದು. ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮತ್ತು ಸ್ಥಳೀಕರಣ ಒಆರ್ಎಫ್9ಬಿ ಎನ್ ಜೀನ್ ಎನ್ಕೋಡಿಂಗ್ ಕೊರೊನಾವೈರಸ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಕ್ಯಾಪ್ಸಿಡ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ತೆರೆದ ಓದುವ ಚೌಕಟ್ಟಿನೊಳಗೆ ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಎರಡು ಅತಿಕ್ರಮಿಸುವ ಜೀನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದಾಗಿದೆ, ಇನ್ನೊಂದು ಒಆರ್ಎಫ್9ಸಿ ಆಗಿದೆ. ಒಆರ್ಎಫ್9ಬಿ ಅನ್ನು ಅದರ ಬೈಸ್ಟ್ರಾನಿಕ್ ಉಪಜಾತಿ ಆರ್ಎನ್ಎಯಿಂದ ರೈಬೋಸೋಮ್ ಸೋರಿಕೆಯ ಸ್ಕ್ಯಾನಿಂಗ್ ಮೂಲಕ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಅದರ ನೆರೆಯ ಒಆರ್ಎಫ್9ಸಿಗಿಂತ ಭಿನ್ನವಾಗಿ, ಅದರ ಉದ್ದವನ್ನು ಸರ್ಬೆಕೊವೈರಸ್ಗಳಲ್ಲಿ ಚೆನ್ನಾಗಿ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಇದು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಪ್ರೋಟೀನ್-ಕೋಡಿಂಗ್ ಜೀನ್ ಎಂಬುದಕ್ಕೆ ಬಲವಾದ ಪುರಾವೆಗಳಿವೆ. ಸಾರ್ಸ್-ಕೋವ್ ನಲ್ಲಿ, ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ಎಂಡೋಪ್ಲಾಸ್ಮಿಕ್ ರೆಟಿಕ್ಯುಲಮ್ (ಇಆರ್) ಮತ್ತು ಅಂತರ್ಜೀವಕೋಶದ ಕೋಶಕಗಳಿಗೆ ಸ್ಥಳೀಕರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಇದು ಪರಮಾಣು ಸ್ಥಳೀಕರಣದ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಹೊಂದಿಲ್ಲ ಆದರೆ ನಿಷ್ಕ್ರಿಯ ಪ್ರಸರಣದ ಮೂಲಕ ಜೀವಕೋಶದ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್ ಅನ್ನು ಪ್ರವೇಶಿಸಬಹುದು; ಆದಾಗ್ಯೂ ಇದು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಸ್ನಿಂದ ನಿರ್ಗಮಿಸಲು ಪರಮಾಣು ರಫ್ತು ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. SARS-CoV-2 ನಲ್ಲಿ, ಇದು ಮೈಟೊಕಾಂಡ್ರಿಯದ ಪೊರೆಯೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ ಎಂದು ವರದಿಯಾಗಿದೆ. ORF9b ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಸರಿಯಾಗಿ ನಿರೂಪಿಸಲಾಗಿಲ್ಲ. ವೈರಲ್ ಪುನರಾವರ್ತನೆಗೆ ಇದು ಅನಿವಾರ್ಯವಲ್ಲ. ವೈರಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳು ಒಆರ್ಎಫ್9ಬಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಒಆರ್ಎಫ್6, ನಾನ್-ಸ್ಟ್ರಕ್ಚರಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ 5, ನಾನ್-ಸ್ಟ್ರಕ್ಚರಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ 14 ಮತ್ತು ಕೊರೊನಾವೈರಸ್ ಎನ್ವಲಪ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸೇರಿದಂತೆ ಹಲವಾರು ಇತರ ವೈರಲ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ವರದಿಯಾಗಿದೆ. ಇದು ಪ್ರೌಢ SARS-CoV ವೈರಿಯನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಪತ್ತೆಯಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಆದ್ದರಿಂದ ಇದು ಸಣ್ಣ ವೈರಲ್ ರಚನಾತ್ಮಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಗಿರಬಹುದು. ಆತಿಥೇಯ ಜೀವಕೋಶದ ಪರಿಣಾಮಗಳು ಒಆರ್ಎಫ್9ಬಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆತಿಥೇಯದ ಪ್ರತಿರಕ್ಷಣಾ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಮಾರ್ಪಡಿಸುವಲ್ಲಿ ಭಾಗಿಯಾಗಿರಬಹುದು. SARS-CoV-2 ಪ್ರೋಟೀನ್ ಹೊರಗಿನ ಮೆಂಬರೇನ್ (TOM) ಸಂಕೀರ್ಣದ ಮೈಟೊಕಾಂಡ್ರಿಯದ ಟ್ರಾನ್ಸೊಕೇಸ್ನ ಒಂದು ಘಟಕವಾದ ಟಾಮ್ 70 ರೊಂದಿಗಿನ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳ ಮೂಲಕ ಇಂಟರ್ಫೆರಾನ್ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ನಿಗ್ರಹಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ವರದಿಯಾಗಿದೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಕೊರೊನಾವೈರಸ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು