FepA
ಅನೇಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳು ಸೈಡರೋಫೋರ್ಗಳು ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಸಣ್ಣ ಕಬ್ಬಿಣ-ಬಂಧಿಸುವ ಅಣುಗಳನ್ನು ಸ್ರವಿಸುತ್ತವೆ, ಅವು ಫೆರಿಕ್ ಅಯಾನುಗಳೊಂದಿಗೆ ಬಲವಾಗಿ ಬಂಧಿಸುತ್ತವೆ. ಎಫ್ಇಪಿಎ ಒಂದು ಅವಿಭಾಜ್ಯ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಹೊರ ಮೆಂಬರೇನ್ ಪೋರಿನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಗಿದ್ದು ಅದು ಹೊರ ಮೆಂಬರೇನ್ ರಿಸೆಪ್ಟರ್ ಕುಟುಂಬಕ್ಕೆ ಸೇರಿದೆ ಮತ್ತು ಸೈಡರೋಫೋರ್ ಎಂಟ್ರೊಬ್ಯಾಕ್ಟಿನ್ನಿಂದ ಬಂಧಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ಕಬ್ಬಿಣದ ಸಕ್ರಿಯ ಸಾಗಣೆಯನ್ನು ಬಾಹ್ಯಕೋಶೀಯ ಸ್ಥಳದಿಂದ ಗ್ರಾಮ್-ನಕಾರಾತ್ಮಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಪೆರಿಪ್ಲಾಸಂಗೆ ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. ಫೆಪಾ ಸಹ ವಿಟಮಿನ್ ಬಿ12 ಮತ್ತು ಕೊಲಿಸಿನ್ ಬಿ ಮತ್ತು ಡಿ ಅನ್ನು ಸಾಗಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಈ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಲಿಗಂಡ್-ಗೇಟೆಡ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಚಾನೆಲ್ಗಳ ಕುಟುಂಬಕ್ಕೆ ಸೇರಿದೆ. ಹೊರಗಿನ ಮೆಂಬರೇನ್ಗೆ ಯಾವುದೇ ಶಕ್ತಿಯು ನೇರವಾಗಿ ಲಭ್ಯವಿಲ್ಲದ ಕಾರಣ, ಫೆಪಾ ಮೂಲಕ ಫೆರಿಕ್-ಎಂಟರೊಬ್ಯಾಕ್ಟಿನ್ನ ಸಾಗಣೆಯನ್ನು ನಡೆಸುವ ಶಕ್ತಿಯು ಒಳಗಿನ ಮೆಂಬರೇನ್ ಸಂಕೀರ್ಣವಾದ ಟನ್ಬಿ-ಎಕ್ಸ್ಬಿಬಿ-ಎಕ್ಸ್ಬಿಯಿಂದ ಉತ್ಪತ್ತಿಯಾಗುವ ಪ್ರೋಟಾನ್ ಪ್ರೇರಕ ಬಲದಿಂದ (ಎಲೆಕ್ಟ್ರೋಕೆಮಿಕಲ್ ಗ್ರೇಡಿಯಂಟ್) ಹುಟ್ಟುತ್ತದೆ. ಈ ಬಲವನ್ನು ಫೆಪಾ ಮತ್ತು ಟನ್ಬಿ ನಡುವಿನ ನೇರ ಸಂವಹನದ ಮೂಲಕ ಭೌತಿಕವಾಗಿ ಫೆಪಾಕ್ಕೆ ರವಾನಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಎಕ್ಸ್-ರೇ ಸ್ಫಟಿಕಶಾಸ್ತ್ರವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಫೆಪಾ ರಚನೆಯು 724-ಅವಶೇಷದ 22-ಎಳೆಗಳ β-ಬ್ಯಾರೆಲ್ ಎಂದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. ಬ್ಯಾರೆಲ್ನ ಬಾಹ್ಯಕೋಶೀಯ ಭಾಗವು ಫೆರಿಕ್-ಎಂಟರೊಬ್ಯಾಕ್ಟಿನ್ಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ-ಆಕರ್ಷಣೆಯ ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚಿನ-ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆಯ ಲಿಗಂಡ್-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ತಾಣಗಳಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುವ ಲೂಪ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಸ್ ಹೈಡ್ರೋಫಿಲಿಕ್ ಬ್ಯಾರೆಲ್ನೊಳಗೆ ಸಣ್ಣ ಪ್ಲಗ್ ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ರಂಧ್ರವನ್ನು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿಯಾಗಿ ಮುಚ್ಚುತ್ತದೆ. ಇದೇ ರೀತಿಯ ಟನ್ಬಿ-ಅವಲಂಬಿತ ಹೊರಗಿನ ಮೆಂಬರೇನ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋರ್ಟರ್ ಆಗಿರುವ ಫುವಾ ಅಧ್ಯಯನಗಳು, ರಂಧ್ರದ ಒಳಗಿನ ಗೋಡೆಗಳಿಗೆ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಸ್ ಡೊಮೇನ್ನ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯು ಒಂಬತ್ತು ಉಪ್ಪು-ಸೇತುವೆಗಳು ಮತ್ತು 60 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಹೈಡ್ರೋಜನ್ ಬಂಧಗಳಿಂದ ಬಲಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಸ್ ರಂಧ್ರದಲ್ಲಿ ಎರಡು ಬಾಹ್ಯಕೋಶೀಯ ಲೂಪ್ಗಳನ್ನು ಸಹ ಹೊಂದಿದೆ, ಇದು ನಿಖರವಾದ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವು ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿಲ್ಲದಿದ್ದರೂ, ಲಿಗಂಡ್-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಮತ್ತು ಟನ್ಬಿ-ಮಧ್ಯಸ್ಥಿಕೆಯ ಸಾಗಣೆಯ ನಡುವಿನ ಸಿಗ್ನಲ್ ವರ್ಗಾವಣೆಗೆ ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ ಎಂದು ಭಾವಿಸಲಾಗಿದೆ. ಎಫ್ಇಪಿಎಯ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಸ್ ಡೊಮೇನ್ನ 12ರಿಂದ 18ರವರೆಗಿನ ಅವಶೇಷಗಳು ಟೋನ್ಬಿ ಬಾಕ್ಸ್ ಎಂಬ ಪ್ರದೇಶವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತವೆ, ಇದು ಕನಿಷ್ಠ ಒಂದು ಪ್ರೊಲೈನ್ ಮತ್ತು ಗ್ಲೈಸಿನ್ ಅವಶೇಷವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ. ಎಂಟರೊಬ್ಯಾಕ್ಟಿನ್ 2,3-ಡೈಹೈಡ್ರಾಕ್ಸಿಬೆನ್ಝಾಯ್ಲ್ಸೆರಿನ್ನ ಆವರ್ತಕ ಟ್ರೈ-ಈಸ್ಟರ್ ಆಗಿದ್ದು 719 ಡಾ ಆಣ್ವಿಕ ದ್ರವ್ಯರಾಶಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಇದು ಮೂರು ಕ್ಯಾಟೆಕೋಲ್ ಗುಂಪುಗಳಿಂದ ಆರು ಆಮ್ಲಜನಕಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಫೆರಿಕ್ ಅಯಾನುಗಳನ್ನು ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ, ಒಟ್ಟಾರೆ ಚಾರ್ಜ್ ಅನ್ನು-3 ನೀಡುತ್ತದೆ. ಬಂಧಿಸುವ ಕ್ಯಾಟೆಕೋಲ್ನಂತೆಯೇ, ಎಂಟ್ರೊಬ್ಯಾಕ್ಟಿನ್ ಸಹ ಲೋಹದ ಕೇಂದ್ರವನ್ನು ವಿಭಜಿಸುವ ಮೂರು ಪಟ್ಟು ಸಮ್ಮಿತಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಎಂದು ಭಾವಿಸಲಾಗಿದೆ. ಕಾರ್ಯ ಕಬ್ಬಿಣವು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಈ ಗುಂಪಿನ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳು ತಮ್ಮನ್ನು ತಾವು ಕಂಡುಕೊಳ್ಳುವ ಪರಿಸರದಲ್ಲಿ ಸುಲಭವಾಗಿ ಲಭ್ಯವಿರುವುದಿಲ್ಲ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಉಸಿರಾಟದ ಸಹ-ಕಿಣ್ವಗಳು ಮತ್ತು ಡಿಎನ್ಎ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಯಲ್ಲಿ ಅದರ ಪಾತ್ರದಿಂದಾಗಿ ಜೀವನವನ್ನು ಉಳಿಸಿಕೊಳ್ಳಲು ಕಬ್ಬಿಣವು ಅತ್ಯಗತ್ಯವಾಗಿದೆ, ಆದ್ದರಿಂದ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳು ಕಬ್ಬಿಣದ ಸೇವನೆಯ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವನ್ನು ಹೊಂದಲು ಹೊಂದಿಕೊಳ್ಳಬೇಕು. ಎಫ್ಇ3 + ಬಹಳ ಕಡಿಮೆ ಕರಗುವಿಕೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವುದರಿಂದ, ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಸುತ್ತಮುತ್ತಲಿನ ಪರಿಸರದಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಎಫ್ಇ3 + ಅಯಾನುಗಳು (ಉದಾಹರಣೆಗೆ. ಮಣ್ಣು) ಕಬ್ಬಿಣದ ಆಕ್ಸೈಡ್ಗಳು ಅಥವಾ ಹೈಡ್ರಾಕ್ಸೈಡ್ಗಳಾಗಿ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿರುತ್ತದೆ, ಆದ್ದರಿಂದ ಮುಕ್ತವಾದ ಫೆ3 + ಸಂಖ್ಯೆಯು ಕಡಿಮೆಯಾಗಿದೆ. ಆದ್ದರಿಂದ, ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಗಳು ರಹಸ್ಯ ಸೈಡರೋಫೋರ್ಗಳಾಗಿ, ಫೆ3 +-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ಗಳಾಗಿ, ಸುತ್ತಮುತ್ತಲಿನ ಪ್ರದೇಶಗಳಿಗೆ ವಿಕಸನಗೊಂಡಿವೆ ಮತ್ತು ನಂತರ ಸಕ್ರಿಯವಾಗಿ ಫೆ3 +-ಸಂಕೀರ್ಣವನ್ನು ಸಕ್ರಿಯ ಸಾಗಣೆಯ ಮೂಲಕ ಜೀವಕೋಶಕ್ಕೆ ಮರಳಿ ಸಾಗಿಸುತ್ತವೆ. ಇದನ್ನು ಅದರ ಆತಿಥೇಯದೊಳಗೆ ರೋಗಕಾರಕ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದೊಂದಿಗೆ ಸಹ ಕಾಣಬಹುದು, ಅಲ್ಲಿ ಕಬ್ಬಿಣವು ಹಿಮೋಗ್ಲೋಬಿನ್, ಟ್ರಾನ್ಸ್ಫೆರ್ರಿನ್, ಲ್ಯಾಕ್ಟೋಫೆರ್ರಿನ್ ಮತ್ತು ಫೆರಿಟಿನ್ಗಳಿಂದ ಬಿಗಿಯಾಗಿ ಬಂಧಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ ಮತ್ತು ಆದ್ದರಿಂದ ಸಾಂದ್ರತೆಯು ಕಡಿಮೆಯಾಗಿದೆ (10−24 mol L−1). ಇಲ್ಲಿ ಇದು ಅತಿಥೇಯದ ಕಬ್ಬಿಣ-ಬಂಧಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಿಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿನ ಆಕರ್ಷಣೆಯನ್ನು (1049ರ ರಚನೆಯ ಸ್ಥಿರಾಂಕದೊಂದಿಗೆ, ಅಥವಾ ([ಎಂಎಲ್])/([ಎಂ] [ಎಲ್]) ಹೊಂದಿರುವ) ಸೈಡರೋಫೋರ್ಗಳನ್ನು ಎಫ್ಇ3 + ಗೆ ಸ್ರವಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಆದ್ದರಿಂದ ಕಬ್ಬಿಣವನ್ನು ತೆಗೆದುಹಾಕುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ನಂತರ ಜೀವಕೋಶದೊಳಗೆ ಸಾಗಿಸುತ್ತದೆ. ಆಂಥ್ರಾಕ್ಸ್ಗೆ ಕಾರಣವಾಗುವ ಗ್ರಾಂ-ಪಾಸಿಟಿವ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಬ್ಯಾಸಿಲಸ್ ಆಂಥ್ರಾಸಿಸ್, ಎರಡು ಸೈಡರೋಫೋರ್ಗಳನ್ನು ಸ್ರವಿಸುತ್ತದೆಃ ಬ್ಯಾಸಿಲಿಬ್ಯಾಕ್ಟಿನ್ ಮತ್ತು ಪೆಟ್ರೋಬ್ಯಾಕ್ಟಿನ್. ಎಸ್ಚೆರಿಚಿಯಾ ಕೋಲಿ ಅನೇಕ ಕಬ್ಬಿಣದ-ಸೈಡರೋಫೋರ್ ಸಾಗಣೆಗಳನ್ನು ರಹಸ್ಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಕೇವಲ ಒಂದು ಸೈಡರೋಫೋರ್ ಅನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸುತ್ತದೆ-ಎಂಟರೊಬ್ಯಾಕ್ಟಿನ್. ಫೆರಿಕ್ ಎಂಟ್ರೊಬ್ಯಾಕ್ಟಿನ್ ಗ್ರಾಹಕ ಫೆಪಾ ಫೆರಿಕ್ ಎಂಟ್ರೊಬ್ಯಾಕ್ಟಿನ್ (ಫೀಎಂಟ್) ನ ಕ್ಯಾಟೆಕೋಲೇಟ್ ಭಾಗವನ್ನು ಗುರುತಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಅದನ್ನು ಬಾಹ್ಯಕೋಶೀಯ ಸ್ಥಳದಿಂದ ಬಾಹ್ಯ ಪೊರೆಯಾದ್ಯಂತ ಪೆರಿಪ್ಲಾಸಂಗೆ ಸಾಗಿಸುತ್ತದೆ. ಬಂಧಿಸುವಿಕೆಯು ಎರಡು ಹಂತಗಳಲ್ಲಿದೆ ಎಂದು ಭಾವಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಫೀನ್ಟ್ ಅನ್ನು ಗುರುತಿಸುವ ವೇಗದ ಹೆಜ್ಜೆ, ಮತ್ತು ನಿಧಾನಗತಿಯ ಹೆಜ್ಜೆ, ಇದು ಸ್ಥಳಾಂತರದ ಮೊದಲ ಹಂತವಾಗಿರಬಹುದು-ಸ್ಥಳಾಂತರಕ್ಕಾಗಿ ಸಂಕೀರ್ಣವನ್ನು ಸಿದ್ಧಪಡಿಸುವುದು. ಎರಡೂ ಹಂತಗಳು TonB-ExbB-ExbD ಸಂಕೀರ್ಣ ಮತ್ತು ಅದು ಒದಗಿಸುವ ಪ್ರೋಟಾನ್ ಪ್ರೇರಕ ಶಕ್ತಿಯಿಂದ ಸ್ವತಂತ್ರವಾಗಿ ಸಂಭವಿಸುತ್ತವೆ. ಪೆರಿಪ್ಲಾಸಂನಲ್ಲಿ, ಫೀಂಟ್ ಅನ್ನು ಫೆಪಿಬಿ ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಸೈಟೋಪ್ಲಾಸ್ಮಿಕ್ ಫೆಪಿಸಿ ವೇಗವರ್ಧಿಸುವ ಎಟಿಪಿ ಜಲವಿಚ್ಛೇದನದಿಂದ ಒದಗಿಸುವ ಶಕ್ತಿಯೊಂದಿಗೆ ಸಕ್ರಿಯ ಸಾರಿಗೆಯ ಮೂಲಕ ಅವಿಭಾಜ್ಯ ಆಂತರಿಕ ಮೆಂಬರೇನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಾದ ಫೆಪ್ಜಿ ಮತ್ತು ಫೆಪ್ಡಿಗೆ ರವಾನೆಯಾಗುತ್ತದೆ. ಸೈಟೋಪ್ಲಾಸಂನಲ್ಲಿ, ಫೆಸ್ ಎಂಟ್ರೊಬ್ಯಾಕ್ಟಿನ್ ಎಸ್ಟರೇಸ್ ಜಲವಿಚ್ಛೇದನಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಇದು ಎಂಟ್ರೊಬ್ಯಾಕ್ಟಿನ್ ಅನ್ನು ಬೇರ್ಪಡಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಫೆಸ್3 + ಅನ್ನು ಬಿಡುಗಡೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ, ಇದು ತರುವಾಯ ಅದೇ ಪ್ರೋಟೀನ್, ಫೆಸ್ನಿಂದ ಫೆಸ್2 + ಗೆ ಕಡಿಮೆಯಾಗುತ್ತದೆ. ಸಂಭಾವ್ಯ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳು ಎಂಟ್ರೋಬ್ಯಾಕ್ಟಿನ್ ಫೆರಿಕ್ ಕಬ್ಬಿಣವನ್ನು ಬಂಧಿಸಿದಾಗ, ಇದು ಅಣುವಿನ 3-ಆಯಾಮದ ರಚನೆಯನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಚಾರ್ಜ್ ಅನ್ನು ತಟಸ್ಥದಿಂದ ಋಣಾತ್ಮಕ 3 ಕ್ಕೆ ಬದಲಾಯಿಸುತ್ತದೆ. ಬಾಹ್ಯಕೋಶೀಯ ಕುಣಿಕೆಗಳಿಂದ ರೂಪುಗೊಂಡ ಫೆಪಾ ಬಂಧಿಸುವ ತಾಣವು ಧನಾತ್ಮಕ ಆವೇಶದ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳಿಂದ ಕೂಡಿದೆ. ಚಾರ್ಜ್-ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆ ಮತ್ತು ಬ್ಯಾರೆಲ್ನ ಗಾತ್ರದ ನಿರ್ಬಂಧದ ಸಂಯೋಜನೆಯು ಫೆರಾ ಆಮದುಗಳನ್ನು ಫೆರಿಕ್-ಎಂಟರೊಬ್ಯಾಕ್ಟಿನ್ಗೆ ಹೆಚ್ಚು ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿಸುತ್ತದೆ. ಸಾರಿಗೆಯ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವು ಏರ್ ಲಾಕನ್ನು ಹೋಲುತ್ತದೆ ಎಂದು ವಿವರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಲಿಗಂಡ್ ಅನ್ನು ಬಂಧಿಸಿದಾಗ, ಬಾಹ್ಯಕೋಶೀಯ ಬದಿಯಲ್ಲಿ ರಂಧ್ರವನ್ನು ಮುಚ್ಚಲು ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ, ಹೀಗಾಗಿ ರಂಧ್ರದ ಮೂಲಕ ಏನನ್ನೂ ನಿರ್ಗಮಿಸುವುದನ್ನು ತಡೆಯುತ್ತದೆ. ಫೆಪಾ ನಂತರ 5 ಅಮೈನೊ ಆಸಿಡ್ ಒಮ್ಮತದ ಅನುಕ್ರಮದ ಮೂಲಕ ಟನ್ಬಿಯೊಂದಿಗೆ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ಗೆ ಬದಲಾವಣೆಯನ್ನು ಪ್ರೇರೇಪಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಪೆರಿಪ್ಲಾಸ್ಮಿಕ್ ಬದಿಗೆ ಚಾನೆಲ್ ಅನ್ನು ತೆರೆಯುತ್ತದೆ. ಇದು ಅಯಾನುಗಳು ಮತ್ತು ಸಣ್ಣ ಅಣುಗಳು ಎರಡೂ ದಿಕ್ಕುಗಳಲ್ಲಿ ಹಾದುಹೋಗಲು ಅವಕಾಶ ನೀಡದೆ ಫೆರಿಕ್-ಎಂಟರೊಬ್ಯಾಕ್ಟಿನ್ ಅನ್ನು ಸಾಗಿಸಲು ಫೆಪಾಕ್ಕೆ ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಲಿಗಂಡ್ ಅನ್ನು ಫೆಪಾ ಬಂಧಿಸಿದಾಗ, ರಂಧ್ರವನ್ನು ತೆರೆಯಲು ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಡೊಮೇನ್ನ ಸಂರಚನೆಯನ್ನು ಬದಲಾಯಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಲಿಗಂಡ್ ಹಾದುಹೋಗಲು ಬ್ಯಾರೆಲ್ನೊಳಗೆ ಜಾಗವನ್ನು ಹೇಗೆ ತೆರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ ಎಂಬುದರ ಬಗ್ಗೆ ವಿವಾದವಿದೆ. ಒಂದೋ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಪ್ಲಗ್ ಡೊಮೇನ್ ಬ್ಯಾರೆಲ್ನೊಳಗೆ ಉಳಿಯುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ರಂಧ್ರವನ್ನು ರಚಿಸಲು ರಚನಾತ್ಮಕ ಬದಲಾವಣೆಗಳಿಗೆ ಒಳಗಾಗುತ್ತದೆ ಅಥವಾ ಅದು ತಾತ್ಕಾಲಿಕವಾಗಿ ಬ್ಯಾರೆಲ್ನಿಂದ ಹೊರಬರುತ್ತದೆ. ಸ್ಥಳಾಂತರಕ್ಕಾಗಿ ಇಡೀ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ತೆಗೆದುಹಾಕುವುದು ಶಕ್ತಿಯುತವಾಗಿ ಅಸಂಬದ್ಧವಾಗಿದೆ ಎಂದು ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ, ಏಕೆಂದರೆ ಇದಕ್ಕೆ ಉಪ್ಪು ಸೇತುವೆಗಳು ಮತ್ತು ಹಲವಾರು ಹೈಡ್ರೋಜನ್ ಬಂಧಗಳ ಒಡೆಯುವಿಕೆಯ ಅಗತ್ಯವಿರುತ್ತದೆ, ಆದಾಗ್ಯೂ, ಬ್ಯಾರೆಲ್ ನೀರು ತುಂಬಿರುವುದರಿಂದ, ಅಗತ್ಯವಿರುವ ಶಕ್ತಿಯು ಹಿಂದೆ ಯೋಚಿಸಿದ್ದಕ್ಕಿಂತ ತುಂಬಾ ಕಡಿಮೆ ಇರುತ್ತದೆ. ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಪ್ಲಗ್ನ ಅಳಿಸುವಿಕೆಯ ರೂಪಾಂತರವನ್ನು ಬಳಸುವ ಮೂಲಕ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಸ್ನ ಪಾತ್ರವನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ; ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ಇನ್ನೂ ಮೆಂಬರೇನ್ಗೆ ಸೇರಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಯಿತು, ಆದರೆ ದೊಡ್ಡ ಅಣುಗಳಿಗೆ ಆಯ್ದವಲ್ಲದ ರಂಧ್ರವಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಜೀವಕೋಶದ ಹೆಚ್ಚಿದ ಪ್ರವೇಶಸಾಧ್ಯತೆಯಿಂದ ಮಾಲ್ಟೊಟೆಟ್ರಾಸ್, ಮಾಲ್ಟೋಪೆಂಟಾಸ್, ಫೆರಿಕ್ರೋಮ್, ಜೊತೆಗೆ ಅಲ್ಬೊಮೈಸಿನ್, ವ್ಯಾನ್ಕೊಮೈಸಿನ್ ಮತ್ತು ಬಾಸಿಟ್ರಾಸಿನ್ ಸೇರಿದಂತೆ ಹಲವಾರು ಪ್ರತಿಜೀವಕಗಳಿಂದ ಪ್ರದರ್ಶಿಸಲ್ಪಡುತ್ತದೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಇದನ್ನು ಎಚ್ಚರಿಕೆಯಿಂದ ಪರಿಗಣಿಸಬೇಕಾಗಿದೆ, ಏಕೆಂದರೆ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಪ್ಲಗ್ನ ಅನುಪಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿ ಬ್ಯಾರೆಲ್ನ ಸಂರಚನೆಯು ಬದಲಾಗಬಹುದು. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಹೊರಗಿನ ಪೊರೆಯ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು