'The All-Species Living Tree' Project
ಆಲ್-ಸ್ಪೀಸೀಸ್ ಲಿವಿಂಗ್ ಟ್ರೀ ಯೋಜನೆಯು ಎ. ಆರ್. ಬಿ., ಸಿಲ್ವಾ ಆರ್. ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ದತ್ತಸಂಚಯ ಯೋಜನೆ ಮತ್ತು ಎಲ್. ಪಿ. ಎಸ್. ಎನ್. ನಂತಹ ವಿವಿಧ ಶೈಕ್ಷಣಿಕ ಗುಂಪುಗಳು/ಸಂಸ್ಥೆಗಳ ನಡುವಿನ ಸಹಯೋಗವಾಗಿದ್ದು, ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಮತ್ತು ಆರ್ಕಿಯಾದ ಎಲ್ಲಾ ಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಪ್ರಕಟಿತ ಪ್ರಭೇದಗಳ 16ಎಸ್ ಆರ್. ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಅನುಕ್ರಮಗಳ ದತ್ತಸಂಚಯವನ್ನು ಜೋಡಿಸುವ ಗುರಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಒಂದು ಹಂತದಲ್ಲಿ, 23S ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಸಹ ಸಂಗ್ರಹಿಸಲಾಯಿತು, ಆದರೆ ಇದು ನಂತರ ಸ್ಥಗಿತಗೊಂಡಿದೆ. ಪ್ರಸ್ತುತ ಜೋಡಿಸಲಾದ ದತ್ತಸಂಚಯದಲ್ಲಿ 10,950 ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚು ಪ್ರಭೇದಗಳಿವೆ ಮತ್ತು ಹೊಸ ಪ್ರಭೇದಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲಾಗಿದೆ ಅಥವಾ ದತ್ತಸಂಚಯದಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿನಿಧಿಸದ ಪ್ರಭೇದಗಳನ್ನು ಅನುಕ್ರಮಗೊಳಿಸಲಾಗಿರುವುದರಿಂದ ಇನ್ನೂ ಹಲವಾರು ಪ್ರಭೇದಗಳನ್ನು ಸೇರಿಸಲಾಗುತ್ತಿದೆ. ಆರಂಭದಲ್ಲಿ ನಂತರದ ಗುಂಪು ಶೇಕಡಾ 7ರಷ್ಟು ಪ್ರಭೇದಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿತ್ತು. ಇದೇ ರೀತಿಯ (ಮತ್ತು ತೀರಾ ಇತ್ತೀಚಿನ) ಯೋಜನೆಗಳಲ್ಲಿ ಜೆನೋಮಿಕ್ ಎನ್ಸೈಕ್ಲೋಪೀಡಿಯಾ ಆಫ್ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಅಂಡ್ ಆರ್ಕಿಯಾ (ಜಿಇಬಿಎ) ಸೇರಿದೆ, ಇದು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಮತ್ತು ಆರ್ಕಿಯಾದ ಸಂಪೂರ್ಣ ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಕೇಂದ್ರೀಕರಿಸಿದೆ. ಮರವನ್ನು ಬೂಟ್ಸ್ಟ್ರ್ಯಾಪ್ ಇಲ್ಲದೆ ಗರಿಷ್ಠ ಸಂಭವನೀಯತೆಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಿಂದ ರಚಿಸಲಾಗಿದೆಃ ಇದರ ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ ನಿಖರತೆಯನ್ನು ಗಾತ್ರಕ್ಕೆ ವಿನಿಮಯ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಅನೇಕ ಫೈಲಮ್ ಮಟ್ಟದ ಕ್ಲೇಡ್ಗಳನ್ನು ಸರಿಯಾಗಿ ಪರಿಹರಿಸಲಾಗುವುದಿಲ್ಲ (ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಫರ್ಮಿಕ್ಯುಟ್ಸ್). (ಯೂಕಾರ್ಯೋಟ್ಗಳು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಲ್ಲಿ ಇರುವುದಿಲ್ಲ). ಈ ಜಾತಿವಿಜ್ಞಾನವು 16S rRNA ಆಧಾರಿತ LTP _ 01 _ 2022ರ ಸಾರಾಂಶವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಜನವರಿ 2022ರವರೆಗೆ ಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಪ್ರಕಟಿಸಲಾದ ಹೆಸರುಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಎಲ್ಲಾ ಪ್ರಭೇದಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಫೈಲಾದ ಕವಲೊಡೆಯುವ ಕ್ರಮ (ವೋಸ್, 1987) ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಫೈಲಾದ ಕವಲೊಡೆಯುವ ಕ್ರಮ (ಗುಪ್ತಾ, 2001) ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಫೈಲಾದ ಕವಲೊಡೆಯುವ ಕ್ರಮ (ಕ್ಯಾವಲಿಯರ್-ಸ್ಮಿತ್, 2002) ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಫೈಲಾದ ಕವಲೊಡೆಯುವ ಕ್ರಮ (ರಾಪ್ ಮತ್ತು ಜಿಯೋವಾನೋನಿ, 2003) ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಫೈಲಾದ ಕವಲೊಡೆಯುವ ಕ್ರಮ (ಬ್ಯಾಟಿಸ್ಟುಝಿ ಮತ್ತು ಇತರರು, 2004) ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಫೈಲಾದ ಕವಲೊಡೆಯುವ ಕ್ರಮ (ಸಿಕರೆಲ್ಲಿ ಮತ್ತು ಇತರರು, 2006) ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಫೈಲಾದ ಕವಲೊಡೆಯುವ ಕ್ರಮ (ಜೀನೋಮ್ ಟ್ಯಾಕ್ಸಾನಮಿ ಡೇಟಾಬೇಸ್, 2018) ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಫೈಲಾದ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಫೈಲಾದ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಜಾತಿಗಳ ಪಟ್ಟಿ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಕುಲಗಳ ಪಟ್ಟಿ ಎಲ್. ಪಿ. ಎಸ್. ಎನ್., ಅಂಗೀಕೃತ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಮತ್ತು ಆರ್ಕಿಯಲ್ ಹೆಸರುಗಳ ಪಟ್ಟಿ.