Family-based QTL mapping
ಕ್ವಾಂಟಿಟೇಟಿವ್ ಟ್ರ್ಯಾಟ್ ಲೊಕಿ ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ ಅಥವಾ ಕ್ಯೂಟಿಎಲ್ ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ ಎನ್ನುವುದು ಪ್ರಮುಖ ಆರ್ಥಿಕ, ಆರೋಗ್ಯ ಅಥವಾ ಪರಿಸರದ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳಿಗೆ ಕಾರಣವಾದ ವಂಶವಾಹಿಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುವ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಾಗಿದೆ. ಕ್ಯೂಟಿಎಲ್ಗಳನ್ನು ಮ್ಯಾಪ್ ಮಾಡುವುದು ಒಂದು ಪ್ರಮುಖ ಚಟುವಟಿಕೆಯಾಗಿದ್ದು, ಸಸ್ಯ ತಳಿಗಾರರು ಮತ್ತು ತಳಿಶಾಸ್ತ್ರಜ್ಞರು ಸಂಭಾವ್ಯ ಕಾರಣ ವಂಶವಾಹಿಗಳನ್ನು ಆಸಕ್ತಿಯ ಫಿನೋಟೈಪ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಯೋಜಿಸಲು ವಾಡಿಕೆಯಂತೆ ಬಳಸುತ್ತಾರೆ. ಕುಟುಂಬ-ಆಧಾರಿತ ಕ್ಯೂಟಿಎಲ್ ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ ಎಂಬುದು ಕ್ಯೂಟಿಎಲ್ ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ನ ಒಂದು ರೂಪಾಂತರವಾಗಿದ್ದು, ಅಲ್ಲಿ ಬಹು-ಕುಟುಂಬಗಳನ್ನು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಮಾನವರಲ್ಲಿ ವಂಶಾವಳಿ ಮತ್ತು ಗೋಧಿ ವಂಶಾವಳಿಯ ಮಾಹಿತಿಯು ಪೂರ್ವಜರ ಬಗ್ಗೆ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ವಂಶಾವಳಿಯ ದಾಖಲೆಗಳನ್ನು ಇಟ್ಟುಕೊಳ್ಳುವುದು ಶತಮಾನಗಳಷ್ಟು ಹಳೆಯ ಸಂಪ್ರದಾಯವಾಗಿದೆ. ವಂಶಾವಳಿಗಳನ್ನು ಜೀನ್-ಮಾರ್ಕರ್ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಪರಿಶೀಲಿಸಬಹುದು. ಸಸ್ಯಗಳಲ್ಲಿ ಈ ವಿಧಾನವನ್ನು ಸಸ್ಯ ಸಂತಾನೋತ್ಪತ್ತಿ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ಸಂದರ್ಭದಲ್ಲಿ ಚರ್ಚಿಸಲಾಗಿದೆ. ವಂಶಾವಳಿಯ ದಾಖಲೆಗಳನ್ನು ಸಸ್ಯ ತಳಿಗಾರರು ಇಡುತ್ತಾರೆ ಮತ್ತು ವಂಶಾವಳಿ ಆಧಾರಿತ ಆಯ್ಕೆಯು ಹಲವಾರು ಸಸ್ಯ ಪ್ರಭೇದಗಳಲ್ಲಿ ಜನಪ್ರಿಯವಾಗಿದೆ. ಸಸ್ಯದ ವಂಶಾವಳಿಗಳು ಮನುಷ್ಯರಿಗಿಂತ ಭಿನ್ನವಾಗಿರುತ್ತವೆ, ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಸಸ್ಯವು ಹರ್ಮಾಫ್ರೊಡಿಟಿಕ್ ಆಗಿರುವುದರಿಂದ-ಒಬ್ಬ ವ್ಯಕ್ತಿಯು ಗಂಡು ಅಥವಾ ಹೆಣ್ಣು ಆಗಿರಬಹುದು ಮತ್ತು ಸಂಯೋಗವನ್ನು ಯಾದೃಚ್ಛಿಕ ಸಂಯೋಜನೆಗಳಲ್ಲಿ, ಸಂತಾನೋತ್ಪತ್ತಿ ಕುಣಿಕೆಗಳೊಂದಿಗೆ ಮಾಡಬಹುದು. ಸಸ್ಯದ ವಂಶಾವಳಿಗಳು "ಸ್ವಯಂ" ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರಬಹುದು, ಅಂದರೆ. ಸಸ್ಯದ ಸ್ವಯಂ ಪರಾಗಸ್ಪರ್ಶದಿಂದ ಉಂಟಾಗುವ ಸಂತತಿ. ವಂಶಪಾರಂಪರ್ಯ ಸಂಕೇತ ಸಿಂಪಲ್ ಕ್ರಾಸ್ ಸಿಂಬಲ್ ಉದಾಹರಣೆ/ಮೊದಲ ಆರ್ಡರ್ ಕ್ರಾಸ್ ಎಸ್ಒಎನ್ 64/ಕೆಎಲ್ಆರ್ಇ//, ಎರಡನೇ ಆರ್ಡರ್ ಕ್ರಾಸ್ ಐಆರ್ 64/ಕೆಎಲ್ಆರ್ಇ// ಸಿಐಎಎನ್0/3/, ಮೂರನೇ ಆರ್ಡರ್ ಕ್ರಾಸ್ ಟಾಬ್ಸ್/3/ಎಸ್ಒಎನ್ 64/ಕೆಎಲ್ಆರ್ಇ/ಸಿಐಎಎನ್0/4/, ನಾಲ್ಕನೇ ಆರ್ಡರ್ ಕ್ರಾಸ್ ಟಾಬ್ಸ್/3/ಎಸ್ಒಎನ್ 64/ಕೆಎಲ್ಆರ್ಇ/ಸಿಐಎಎನ್0/4/ಎಸ್ಇಇ/ಎನ್/, ಎನ್ಥ್ ಆರ್ಡರ್ ಕ್ರಾಸ್ ಬ್ಯಾಕ್ ಕ್ರಾಸ್ ಸಿಂಬಲ್ * ಎನ್ ಹಲವಾರು ಬಾರಿ ಬ್ಯಾಕ್ ಕ್ರಾಸ್ ಪೇರೆಂಟ್ ಎಡ ಬದಿಯ ಸರಳ ಕ್ರಾಸ್ ಚಿಹ್ನೆಯನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ, ಬ್ಯಾಕ್ ಕ್ರಾಸ್ ಪೇರೆಂಟ್ ಸ್ತ್ರೀ, ಬಲ ಬದಿಯ ಪುರುಷ, ಉದಾಹರಣೆಃ ಎಸ್ಇಇಇ/3 * ಎಎನ್ಇ, ಟಾಬ್ಸ್ * 6 ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕ ವಿಧಾನಗಳ ಮಿತಿ ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕ ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯು ಇಬ್ಬರು ಪೋಷಕರು ಅಥವಾ ಮೂವರು ಪೋಷಕರ ನಡುವಿನ ದಾಟುವಿಕೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಒಂದೇ ಕುಟುಂಬವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ. ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕ ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ ವಿಧಾನಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಕೆಲವು ಪ್ರಮುಖ ಮಿತಿಗಳಿವೆ. ಇವುಗಳಲ್ಲಿ ಕೆಲವು ಸೀಮಿತ ಬಹುರೂಪತೆ ದರಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿವೆ, ಮತ್ತು ಬಹು ಆನುವಂಶಿಕ ಹಿನ್ನೆಲೆಗಳಲ್ಲಿ ಗುರುತು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿತ್ವದ ಯಾವುದೇ ಸೂಚನೆಗಳಿಲ್ಲ. ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ, ಕ್ಯೂಟಿಎಲ್ ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸುವ ಮತ್ತು ಮ್ಯಾಪ್ ಮಾಡುವ ಹೊತ್ತಿಗೆ, ತಳಿ ಬೆಳೆಗಾರರು ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕ ಸಂತಾನೋತ್ಪತ್ತಿ ಮತ್ತು ಆಯ್ಕೆ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಹೊಸ ಕ್ಯೂಟಿಎಲ್ ಅನ್ನು ಒಳನುಗ್ಗಿಸಿದ್ದಾರೆ. ಇದು ಎಂ. ಎ. ಎಸ್. ಅತ್ಯಂತ ಉಪಯುಕ್ತವಾದ ಸಮಯದಲ್ಲಿ (ಅಂದರೆ, ಹೊಸ ಕ್ಯೂ. ಟಿ. ಎಲ್. ಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಿದ ಸ್ವಲ್ಪ ಸಮಯದ ನಂತರ) ಸಂತಾನೋತ್ಪತ್ತಿ ಕಾರ್ಯಕ್ರಮಗಳಲ್ಲಿ ಎಂ. ಎ. ಎಸ್. ನ (ಮಾರ್ಕರ್-ಸಹಾಯಕ ಆಯ್ಕೆ) ಉಪಯುಕ್ತತೆಯನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಕುಟುಂಬ-ಆಧಾರಿತ ಕ್ಯೂಟಿಎಲ್ ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿರುವ ಸಸ್ಯ ಸಂತಾನೋತ್ಪತ್ತಿ ಕುಟುಂಬಗಳನ್ನು ಬಳಸುವ ಮೂಲಕ ಈ ಮಿತಿಯನ್ನು ತೆಗೆದುಹಾಕುತ್ತದೆ. ಸ್ಥೂಲವಾಗಿ, ಅಧ್ಯಯನ ವಿನ್ಯಾಸಗಳಲ್ಲಿ 3 ವರ್ಗಗಳಿವೆಃ ವಿಸ್ತೃತ ಅಥವಾ ಅಣು ಕುಟುಂಬಗಳ ಸಂಬಂಧಿಕರ ದೊಡ್ಡ ಗುಂಪುಗಳನ್ನು ಮಾದರಿ ಮಾಡುವ ಅಧ್ಯಯನ ವಿನ್ಯಾಸಗಳು, ಸಂಬಂಧಿಕರ ಜೋಡಿಗಳನ್ನು ಮಾದರಿ ಮಾಡುವ ಅಧ್ಯಯನ ವಿನ್ಯಾಸಗಳು (ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಒಡಹುಟ್ಟಿದವರ ಜೋಡಿಗಳು) ಅಥವಾ ಸಂಬಂಧವಿಲ್ಲದ ವ್ಯಕ್ತಿಗಳನ್ನು ಮಾದರಿ ಮಾಡುವ ಅಧ್ಯಯನ ವಿನ್ಯಾಸಗಳು. ಸಂಬಂಧವಿಲ್ಲದ ವ್ಯಕ್ತಿಗಳು ಅಪರಿಚಿತ ವಂಶಾವಳಿಯೊಂದಿಗೆ ವ್ಯಕ್ತಿಗಳ ನೈಸರ್ಗಿಕ ಸಂಗ್ರಹವು (ಸಂಬಂಧವಿಲ್ಲವೆಂದು ಪರಿಗಣಿಸಲಾಗಿದೆ) ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ನಕ್ಷೆಯನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ. ಜನಸಂಖ್ಯೆ ಆಧಾರಿತ ಅಸೋಸಿಯೇಷನ್ ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ ತಂತ್ರವು ಈ ರೀತಿಯ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು ಆಧರಿಸಿದೆ. ಸಸ್ಯಗಳ ವಿಷಯದಲ್ಲಿ ಅಂತಹ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯುವುದು ಕಷ್ಟ, ಏಕೆಂದರೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ವ್ಯಕ್ತಿಗಳು ಯಾವುದೋ ಒಂದು ರೀತಿಯಲ್ಲಿ ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿದ್ದಾರೆ. ಅಂತಹ ವಿಧಾನದ ಇತರ ಅನನುಕೂಲವೆಂದರೆ, ನಾವು ಅಂತಹ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು ಕಂಡುಕೊಂಡರೂ ಸಹ, ಅಂತಹ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿ ಆಸಕ್ತಿಯ ಆಲೀಲ್ಗೆ (ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ರೂಪಾಂತರಿತ) ಹೆಚ್ಚಿನ ಆಲೀಲ್ ಆವರ್ತನವನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯುವುದು ಕಷ್ಟ. ಆಲೀಲ್ ಆವರ್ತನದಲ್ಲಿ ಸಮತೋಲನವನ್ನು ಸೃಷ್ಟಿಸುವ ಉದ್ದೇಶಕ್ಕಾಗಿ, ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಕೇಸ್-ನಿಯಂತ್ರಣ ಅಧ್ಯಯನಗಳು. ಇಂತಹ ವಿನ್ಯಾಸವು ಅನೇಕ ಸ್ವತಂತ್ರ ಕುಟುಂಬಗಳಿಂದ ಬಂದ ಸಹೋದರರ ಜೋಡಿಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ. ಪ್ರತಿ ಒಡಹುಟ್ಟಿದವರ ಜೋಡಿಗಳಲ್ಲಿನ ಸದಸ್ಯರನ್ನು ಯಾದೃಚ್ಛಿಕವಾಗಿ ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಲಾಗುವುದಿಲ್ಲ-ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಎರಡೂ ಒಡಹುಟ್ಟಿದವರನ್ನು ಕ್ಯೂಟಿ (ಕಾನ್ಕಾರ್ಡಂಟ್ ಒಡಹುಟ್ಟಿದವರು) ವಿತರಣೆಯ ಒಂದು ಬಾಲದಿಂದ (ಮೇಲಿನ ಅಥವಾ ಕೆಳಗಿನ) ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ ಅಥವಾ ಮೇಲಿನ ಬಾಲದಿಂದ ಒಬ್ಬ ಒಡಹುಟ್ಟಿದವರನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಇತರ ಒಡಹುಟ್ಟಿದವರನ್ನು ಕೆಳಗಿನ ಬಾಲದಿಂದ ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ (ಅಸಂಗತ ಒಡಹುಟ್ಟಿದವರು). ಮತ್ತೊಂದು ಮಾದರಿ ವಿನ್ಯಾಸವು ಒಡಹುಟ್ಟಿದವರ ಜೋಡಿಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರಬಹುದು, ವಿತರಣೆಯ ಮೇಲಿನ ಅಥವಾ ಕೆಳಗಿನ ಬಾಲದಿಂದ ಒಂದನ್ನು ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಉಳಿದ ಒಡಹುಟ್ಟಿದವರಲ್ಲಿ ಯಾದೃಚ್ಛಿಕವಾಗಿ ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ಮೂವರು ಮಕ್ಕಳಲ್ಲಿ ಪೋಷಕರು ಮತ್ತು ಒಬ್ಬ ಸಂತತಿಯು (ಹೆಚ್ಚು ಬಾಧಿತರು) ಸೇರಿದ್ದಾರೆ. ಸಹಯೋಗದ ಅಧ್ಯಯನಗಳಲ್ಲಿ ತ್ರಿವಳಿಗಳನ್ನು ಹೆಚ್ಚು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಮೂವರೂ ಸಂಬಂಧವಿಲ್ಲದವರಾಗಿದ್ದಾರೆ ಎಂಬ ಅಸೋಸಿಯೇಷನ್ ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ನ ಪರಿಕಲ್ಪನೆಯು, ಆದಾಗ್ಯೂ ತ್ರಿವಳಿಗಳು ತಮ್ಮೊಳಗೆ ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿವೆ. ಅಣು ಕುಟುಂಬವು ಎರಡು ತಲೆಮಾರಿನ ಸರಳ ಕುಟುಂಬದ ವಂಶಾವಳಿಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ವಿಸ್ತೃತ ವಂಶಾವಳಿಗಳಲ್ಲಿ ಬಹು ಪೀಳಿಗೆಯ ವಂಶಾವಳಿಗಳು ಸೇರಿವೆ. ಇದು ವಂಶಾವಳಿಯ ಮಾಹಿತಿಯು ಲಭ್ಯವಿರುವಷ್ಟು ಆಳವಾಗಿರಬಹುದು ಅಥವಾ ಅಗಲವಾಗಿರಬಹುದು. ಸಂಪರ್ಕ-ಆಧಾರಿತ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ವಿಸ್ತೃತ ವಂಶಾವಳಿಯು ಆಕರ್ಷಕವಾಗಿದೆ. ಲಿಂಕೇಜ್ ವರ್ಸಸ್ ಅಸೋಸಿಯೇಷನ್ ಅನಾಲಿಸಿಸ್, ಲಿಂಕೇಜ್ ಮತ್ತು ಅಸೋಸಿಯೇಷನ್ ಅನಾಲಿಸಿಸ್ ಜೀನ್ ಅನ್ವೇಷಣೆ, ಸ್ಥಳೀಕರಣ ಮತ್ತು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ಪ್ರಾಥಮಿಕ ಸಾಧನಗಳಾಗಿವೆ. ಈ ವಿಧಾನಗಳ ಪರಿಕಲ್ಪನಾ ಆಧಾರವು ಬಹಳ ಹಿಂದಿನಿಂದಲೂ ತಿಳಿದಿದ್ದರೂ, ಇತ್ತೀಚಿನ ದಶಕಗಳಲ್ಲಿ ಆಣ್ವಿಕ ತಳಿಶಾಸ್ತ್ರದಲ್ಲಿನ ಪ್ರಗತಿಗಳು, ಸಮರ್ಥ ಕ್ರಮಾವಳಿಗಳಲ್ಲಿನ ಅಭಿವೃದ್ಧಿ ಮತ್ತು ಗಣನೆಯ ಶಕ್ತಿಯು ಈ ವಿಧಾನಗಳ ದೊಡ್ಡ ಪ್ರಮಾಣದ ಅನ್ವಯವನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸಿವೆ. ಲಿಂಕೇಜ್ ಅಧ್ಯಯನಗಳು ಕುಟುಂಬಗಳೊಳಗಿನ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳೊಂದಿಗೆ ಕೋಸೆಗ್ರೇಟ್ ಅನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಪ್ರಯತ್ನಿಸುತ್ತವೆಯಾದರೂ, ಅಸೋಸಿಯೇಷನ್ ಅಧ್ಯಯನಗಳು ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ಫಿನೋಟೈಪ್ಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಪ್ರಯತ್ನಿಸುತ್ತವೆ. ಇವು ಒಟ್ಟಾಗಿ, ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು ತನಿಖೆ ಮಾಡಲು ಮತ್ತು ಸಂಕೀರ್ಣ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳ ರೋಗಲಕ್ಷಣವನ್ನು ವಿವರಿಸಲು ಸಾಧನಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುವ ಪೂರಕ ವಿಧಾನಗಳಾಗಿವೆ. ಸಂಪರ್ಕ ಅಧ್ಯಯನಗಳಲ್ಲಿ, ಪಾಲಿಮಾರ್ಫಿಕ್ ಗುರುತುಗಳಿಂದ ಟ್ಯಾಗ್ ಮಾಡಲಾದ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಜೀನೋಮಿಕ್ ಪ್ರದೇಶದೊಂದಿಗೆ ಒಗ್ಗೂಡಿಸುವ ಸ್ಥಳವನ್ನು ಕುಟುಂಬಗಳಲ್ಲಿ ಗುರುತಿಸಲು ನಾವು ಪ್ರಯತ್ನಿಸುತ್ತೇವೆ. ಇದಕ್ಕೆ ವಿರುದ್ಧವಾಗಿ, ಸಹಯೋಗದ ಅಧ್ಯಯನಗಳಲ್ಲಿ, ನಾವು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಆನುವಂಶಿಕ ವ್ಯತ್ಯಾಸ ಮತ್ತು ವ್ಯಕ್ತಿಗಳ ಮಾದರಿಯಲ್ಲಿನ ಗುಣಲಕ್ಷಣದ ವ್ಯತ್ಯಾಸದ ನಡುವಿನ ಪರಸ್ಪರ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ಹುಡುಕುತ್ತೇವೆ, ಇದು ರೂಪಾಂತರದ ಕಾರಣವಾದ ಪಾತ್ರವನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಕುಟುಂಬ-ಆಧಾರಿತ ಸಂಪರ್ಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಜೆನೆಟಿಕ್ ಲಿಂಕೇಜ್ ಎಂಬುದು ವಿಭಿನ್ನ ಸ್ಥಳಗಳಲ್ಲಿನ ಆಲೀಲ್ಗಳು ಕುಟುಂಬಗಳಲ್ಲಿ ಒಗ್ಗೂಡಿಸುವ ವಿದ್ಯಮಾನವಾಗಿದೆ. ಕೋಸೆಗ್ರಿಗೇಷನ್ನ ಬಲವನ್ನು ರಿಕಾಂಬಿನೇಷನ್ ಫ್ರಾಕ್ಷನ್ θ ನಿಂದ ಅಳೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಬೆಸ ಸಂಖ್ಯೆಯ ರಿಕಾಂಬಿನೇಷನ್ನ ಸಂಭವನೀಯತೆಯಾಗಿದೆ. ಹೆಚ್ಚು ಸಂಕೀರ್ಣವಾದ ವಂಶಾವಳಿಯು ಹೆಚ್ಚಿನ ಶಕ್ತಿಯನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. ವ್ಯತ್ಯಾಸ ಘಟಕ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಕ್ವಾಂಟಿಟೇಟಿವ್ ಟ್ರೇಟ್ ಲೋಸಿ (ಕ್ಯೂಟಿಎಲ್) ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ನಲ್ಲಿ ಐಡೆಂಟಿಟಿ ಬೈ ಡಿಸೆಂಟ್ (ಐಬಿಡಿ) ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಅಂದಾಜು ಕೇಂದ್ರ ಅಂಶವಾಗಿದೆ. ಅಲ್ಲೀಲ್ಗಳು ಒಂದೇ ರೀತಿಯ ಫಿನೋಟೈಪಿಕ್ ಪರಿಣಾಮವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವಾಗ ವಿಧದ ಮೂಲಕ ಗುರುತನ್ನು (ಐಬಿಟಿ) ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ವಿಧದಿಂದ ಒಂದೇ ರೀತಿಯ ಆಲೀಲ್ಗಳು ಎರಡು ಗುಂಪುಗಳಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಲಾಗಿದೆ; ಹಿಂದಿನ ಪೀಳಿಗೆಯಲ್ಲಿ ಒಂದೇ ಆಲೀಲ್ನಿಂದ ಹುಟ್ಟಿಕೊಂಡಿದ್ದರಿಂದ ವಂಶದಿಂದ (ಐಬಿಡಿ) ಒಂದೇ ರೀತಿಯದ್ದಾಗಿವೆ; ಮತ್ತು ವಂಶದಿಂದ (ಎನ್ಐಬಿಡಿ) ಒಂದೇ ಅಲ್ಲದ ಅಥವಾ ಪ್ರತ್ಯೇಕ ರೂಪಾಂತರಗಳಿಂದ ಹುಟ್ಟಿಕೊಂಡಿದ್ದರಿಂದ ಸ್ಥಿತಿಯಿಂದ (ಐಬಿಎಸ್) ಒಂದೇ ಆಗಿರುತ್ತವೆ. ಪೋಷಕ-ಆಫ್ಸ್ಪ್ರಿಂಗ್ ಜೋಡಿಗಳು ತಮ್ಮ ಜೀನ್ಗಳ ಐಬಿಡಿಯ 50 ಪ್ರತಿಶತವನ್ನು ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ, ಮತ್ತು ಮೊನೊಜೈಗೋಟಿಕ್ ಅವಳಿಗಳು 100% ಐಬಿಡಿಯನ್ನು ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ. ಸಂಪರ್ಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಲ್ಲಿ ಪ್ರಸ್ತುತವಾದದ್ದು ಪಕ್ಕದ ಸ್ಥಳದಲ್ಲಿರುವ ಆಲೀಲ್ಗಳ ಆನುವಂಶಿಕತೆ (ಅಥವಾ ಕೊಯಿನ್ಹೆರಿಟೆನ್ಸ್); ಆದ್ದರಿಂದ; ಆಲೀಲ್ಗಳು ಇಳಿಯುವಿಕೆಯಿಂದ ಒಂದೇ ಆಗಿವೆಯೇ ಎಂದು ನಿರ್ಧರಿಸುವುದು ನಿರ್ಣಾಯಕ ಪ್ರಾಮುಖ್ಯತೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ (ಅಂದರೆ. ಒಂದೇ ಪೋಷಕರ ಆಲೀಲ್ಗಳಿಂದ ಪ್ರತಿಗಳು) ಅಥವಾ ರಾಜ್ಯದಿಂದ ಮಾತ್ರ ಹೋಲುತ್ತವೆ (ಅಂದರೆ. ಒಂದೇ ರೀತಿ ಕಾಣಿಸಿಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಅಲೀಲ್ಗಳ ಎರಡು ವಿಭಿನ್ನ ಪ್ರತಿಗಳಿಂದ ಪಡೆಯಲಾಗಿದೆ). ಆದ್ದರಿಂದ, ಕುಟುಂಬ-ಆಧಾರಿತ ಸಂಪರ್ಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಮೂರು ವರ್ಗಗಳಿವೆ-ಬಲವಾದ ಮಾದರಿ (ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕ ಲಾಡ್ ಸ್ಕೋರ್ ಮಾದರಿ), ದುರ್ಬಲ ಮಾದರಿ ಆಧಾರಿತ (ವ್ಯತ್ಯಾಸ ಘಟಕಗಳ ವಿಧಾನಗಳು), ಅಥವಾ ಮಾದರಿ ಮುಕ್ತ. ವ್ಯತ್ಯಾಸ ಘಟಕ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಮಿಶ್ರತಳಿಗಳೆಂದು ಪರಿಗಣಿಸಬಹುದು. ಕುಟುಂಬ-ಆಧಾರಿತ ಅಸೋಸಿಯೇಷನ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಲಿಂಕೇಜ್ ಅಸಮತೋಲನ (ಎಲ್ಡಿ) ಮತ್ತು ಅಸೋಸಿಯೇಷನ್ ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ ಸಸ್ಯ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್ ಸಮುದಾಯದಲ್ಲಿ ಗಣನೀಯ ಗಮನವನ್ನು ಸೆಳೆಯುತ್ತಿದೆ, ಏಕೆಂದರೆ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿರುವ ಆನುವಂಶಿಕ ಸಂಪನ್ಮೂಲಗಳ ಸಂಗ್ರಹಗಳನ್ನು ಪರಿಮಾಣಾತ್ಮಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳ ಸ್ಥಳವನ್ನು (ಕ್ಯೂಟಿಎಲ್) ಸೂಕ್ಷ್ಮವಾಗಿ ನಕ್ಷೆ ಮಾಡಲು, ಅಭ್ಯರ್ಥಿ ಜೀನ್ಗಳನ್ನು ಮೌಲ್ಯೀಕರಿಸಲು ಮತ್ತು ಆಸಕ್ತಿಯ ಆಲೀಲ್ಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಬಳಸುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವಿದೆ (ಯು ಮತ್ತು ಬಕ್ಲರ್, 2006). ಅಸೋಸಿಯೇಷನ್ ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ ನಡೆಸಲು ಅಥವಾ ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ಅರ್ಥೈಸಿಕೊಳ್ಳಲು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪ್ರಾಮುಖ್ಯತೆಯ ಮೂರು ಅಂಶಗಳು ಸೇರಿವೆಃ ಉಪಗುಂಪುಗಳಾಗಿ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ರಚನೆಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ, ಉಪಗುಂಪುಗಳ ನಡುವಿನ ಭೇದಾತ್ಮಕ ಆಯ್ಕೆಯ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸಂದರ್ಭದಲ್ಲಿ ನಕಲಿ ಸಂಘಗಳು ಮತ್ತು ಪರಿಣಾಮಗಳನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸಲು ಅದರ ಬಳಕೆ, ಮತ್ತು ಸ್ಥಳೀಯ ರಚನೆಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಎಲ್ಡಿ ಹ್ಯಾಪ್ಲೋಟೈಪ್ಗಳಾಗಿ ಮತ್ತು ರೆಸಲ್ಯೂಶನ್ ಮತ್ತು ಎಲ್ಡಿ ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ನ ಅನ್ವಯದ ಮೇಲೆ ಅದರ ಪರಿಣಾಮಗಳು (ಫ್ಲಿಂಟ್-ಗಾರ್ಸಿಯಾ ಮತ್ತು ಇತರರು. 2003). ಜನಸಂಖ್ಯೆ ಆಧಾರಿತ ಸಂಘಕ್ಕೆ ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿ, ಕುಟುಂಬ ಆಧಾರಿತ ಸಂಘ ಪರೀಕ್ಷೆಗಳು ಹೆಚ್ಚು ಜನಪ್ರಿಯವಾಗುತ್ತಿವೆ. ಕುಟುಂಬ-ಆಧಾರಿತ, ಟ್ರಾನ್-ಡೈಸ್ಕ್ವಿಲಿಬಿರಮ್ ಪರೀಕ್ಷೆಯು (ಟಿಡಿಟಿ) ಇತ್ತೀಚಿನ ವರ್ಷಗಳಲ್ಲಿ ವ್ಯಾಪಕವಾದ ಜನಪ್ರಿಯತೆಯನ್ನು ಗಳಿಸಿದೆ, ಈ ವಿಧಾನವು ಆಫಿಸ್ಪ್ರಿಂಗ್ನ ಮೇಲೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರಲು ಹರಡುವ ಆಲೀಲ್ಗಳ ಮೇಲೆ ಕೇಂದ್ರೀಕರಿಸುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಸಂಪರ್ಕ ಮತ್ತು ಅಸಮತೋಲನ ಎರಡನ್ನೂ ಗಣನೆಗೆ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳಲು ಇದನ್ನು ರೂಪಿಸಲಾಗಿದೆ. ಈ ಪರೀಕ್ಷೆಗೆ ಮೂವರು ವ್ಯಕ್ತಿಗಳ ಜೀನೋಟೈಪ್ ಮಾಹಿತಿಯ ಅಗತ್ಯವಿರುತ್ತದೆ, ಅವುಗಳೆಂದರೆ ಪೀಡಿತ ಮಗು ಮತ್ತು ಎರಡೂ ಜೈವಿಕ ಪೋಷಕರು; ಮತ್ತು ಪರೀಕ್ಷೆಯು ಮಾಹಿತಿಯುಕ್ತವಾಗಿರಲು ಕನಿಷ್ಠ ಒಬ್ಬ ಪೋಷಕರು ಹೆಟೆರೊಜೈಗಸ್ ಆಗಿರಬೇಕು. ಪ್ರಸ್ತಾವಿತ ಪರೀಕ್ಷಾ ಅಂಕಿ ಅಂಶವು ವಾಸ್ತವವಾಗಿ ಮೆಕ್ನೆಮರ್ನ ಚಿ-ಸ್ಕ್ವೇರ್ ಅಂಕಿ ಅಂಶವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಗುಣಲಕ್ಷಣ ಧನಾತ್ಮಕ ಆಲೀಲ್-ಸಂಬಂಧಿತ ಆಲೀಲ್ ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಹರಡುತ್ತದೆ ಎಂಬ ಪರ್ಯಾಯ ಊಹೆಯ ವಿರುದ್ಧ, ಊಹಾತ್ಮಕ ರೋಗಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಆಲೀಲ್ ಹೆಟೆರೋಗೈಗಸ್ ಪೋಷಕರಿಂದ 50 ಪ್ರತಿಶತದಷ್ಟು ಬಾರಿ ಹರಡುತ್ತದೆ ಎಂಬ ಶೂನ್ಯ ಊಹೆಯನ್ನು ಪರೀಕ್ಷಿಸುತ್ತದೆ. ಟಿಡಿಟಿ ಜನಸಂಖ್ಯೆಯ ಶ್ರೇಣೀಕರಣ ಮತ್ತು ಮಿಶ್ರಣದಿಂದ ಪ್ರಭಾವಿತವಾಗಿಲ್ಲ. ಕುಟುಂಬ-ಆಧಾರಿತ ಸಂಯೋಜನೆಯ ಪರೀಕ್ಷೆಯ ಪರಿಕಲ್ಪನೆಯನ್ನು ಪರಿಮಾಣಾತ್ಮಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳಿಗೆ ವಿಸ್ತರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಪರಿಮಾಣಾತ್ಮಕ ಪ್ರಸರಣ ಅಸಮತೋಲನ ಪರೀಕ್ಷೆ (ಕ್ಯೂ. ಟಿ. ಡಿ. ಟಿ.) ಟಿ. ಡಿ. ಟಿ. ಯನ್ನು ಪರಿಮಾಣಾತ್ಮಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು ಮತ್ತು ಅಣು ಅಥವಾ ವಿಸ್ತೃತ ವಂಶಾವಳಿಯ ಕುಟುಂಬಗಳ ಸಂದರ್ಭದಲ್ಲಿ ವಿಸ್ತರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಸಾಮಾನ್ಯೀಕೃತ ಪರೀಕ್ಷೆಯು ಯಾವುದೇ ಕುಟುಂಬದ ಕುಟುಂಬಗಳನ್ನು ಪರೀಕ್ಷೆಯಲ್ಲಿ ಬಳಸಲು ಅನುವು ಮಾಡಿಕೊಡುತ್ತದೆ. ಕ್ಯೂಟಿಡಿಟಿಯನ್ನು ಹ್ಯಾಪ್ಲೋಟೈಪ್ ಆಧಾರಿತ ಅಸೋಸಿಯೇಷನ್ ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ಗೂ ವಿಸ್ತರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಹ್ಯಾಪ್ಲೋಟೈಪ್ಗಳು ಒಂದೇ ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ನ ಮೇಲೆ ನಿಕಟವಾಗಿ ಒಟ್ಟಿಗೆ ಇರುವ ಮತ್ತು ಒಟ್ಟಿಗೆ ಆನುವಂಶಿಕವಾಗಿ ಪಡೆಯುವ ಮಾರ್ಕರ್ ಆಲೀಲ್ಗಳ ಸಂಯೋಜನೆಯನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ. ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಾಂದ್ರತೆಯ ಎಸ್. ಎನ್. ಪಿ. ತಯಾರಕರ ಲಭ್ಯತೆಯೊಂದಿಗೆ, ಸಹಯೋಗದ ಅಧ್ಯಯನಗಳಲ್ಲಿ ಹ್ಯಾಪ್ಲೋಟೈಪ್ಗಳು ಪ್ರಮುಖ ಪಾತ್ರವಹಿಸುತ್ತವೆ. ಮೊದಲನೆಯದಾಗಿ-ಜೀನೋಮ್ನ ಉದ್ದಕ್ಕೂ ಎಲ್ಡಿ ಮಾದರಿಯನ್ನು ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಲು ಹ್ಯಾಪ್ಲೋಟೈಪ್ಗಳು ನಿರ್ಣಾಯಕವಾಗಿವೆ, ಇದು ಅಸೋಸಿಯೇಷನ್ ಅಧ್ಯಯನಗಳಿಗೆ ಅತ್ಯಗತ್ಯವಾಗಿದೆ. ವಾಸ್ತವವಾಗಿ ಎಲ್ಡಿ ಮಾದರಿಯನ್ನು ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಲು ಹ್ಯಾಪ್ಲೋಟೈಪ್ಗಳನ್ನು ಸ್ವತಃ ತಿಳಿದುಕೊಳ್ಳುವುದಕ್ಕಿಂತ ಉತ್ತಮ ಮಾರ್ಗವಿಲ್ಲ. ವರ್ಣತಂತುಗಳ ಉದ್ದಕ್ಕೂ ಆಲೀಲ್ಗಳು ಹೇಗೆ ಸಂಘಟಿತವಾಗಿವೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಹ್ಯಾಪ್ಲೋಟೈಪ್ಗಳು ನಮಗೆ ತಿಳಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಮೌಲ್ಯಮಾಪನಗಳ ಮೇಲೆ ಆನುವಂಶಿಕತೆಯ ಮಾದರಿಯನ್ನು ಪ್ರತಿಬಿಂಬಿಸುತ್ತವೆ. ಎರಡನೆಯದಾಗಿ, ಸಂಕೀರ್ಣ ಗುಣಲಕ್ಷಣದ ವಂಶವಾಹಿಗಳ ನಕ್ಷೆಯ ಅಧ್ಯಯನಗಳಲ್ಲಿ ಏಕ ಗುರುತುಗಳನ್ನು ಆಧರಿಸಿದ ವಿಧಾನಗಳಿಗಿಂತ ಹ್ಯಾಪ್ಲೋಟೈಪ್ಗಳನ್ನು ಆಧರಿಸಿದ ವಿಧಾನಗಳು ಹೆಚ್ಚು ಶಕ್ತಿಯುತವಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಕುಟುಂಬ ವಂಶಾವಳಿಗಳನ್ನು ಚಿತ್ರಿಸುವುದು ಮಾನವ ತಳಿಶಾಸ್ತ್ರದ ಸಂದರ್ಭಕ್ಕಾಗಿ ಹಲವಾರು ವಂಶಾವಳಿ ರೇಖಾಚಿತ್ರ ತಂತ್ರಾಂಶಗಳು ಲಭ್ಯವಿವೆ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಕೋಪ್ (ಸಹಯೋಗಾತ್ಮಕ ವಂಶಾವಳಿ ರೇಖಾಚಿತ್ರ ಪರಿಸರ), ಸಿರಿಲಿಕ್, ಎಫ್. ಟಿ. ಎಂ. (ಕುಟುಂಬ ವೃಕ್ಷ ತಯಾರಕ), ಎಫ್ಟ್ರೀ, ಕಿಂಡರ್ಡ್, ಪಿ. ಇ. ಡಿ. (ಪೆಡಿಗ್ರೀ ರೇಖಾಚಿತ್ರ ತಂತ್ರಾಂಶ), ಪೆಧಂಟರ್, ಪೆಡಿಗ್ರ್ಯಾಫ್, ಪೆಡಿಗ್ರೀ/ಡ್ರಾ, ಪೆಡಿಗ್ರೀ-ವಿಷುಯಲಿಜರ್, ಪೆಡ್ಪ್ಲಾಟ್, ಪೆಡ್ರಾವ್/ಡಬ್ಲ್ಯೂ. ಪಿ. ಇ. ಡಿ. ಆರ್. ಎ. (ವಂಶಾವಳಿ ರೇಖಾಚಿತ್ರ/ಕಿಟಕಿ ವಂಶಾವಳಿ ರೇಖಾಚಿತ್ರ (ಎಂಎಸ್-ವಿಂಡೋ ಮತ್ತು ಪೆಡ್ರಾವ್ನ ಎಕ್ಸ್-ವಿಂಡೋ ಆವೃತ್ತಿ). ಆದಾಗ್ಯೂ, ಸಸ್ಯಗಳಲ್ಲಿನ ವಂಶಾವಳಿಯ ರೇಖಾಚಿತ್ರಕ್ಕೆ ಸಂತಾನೋತ್ಪತ್ತಿ, ಸೆಲ್ಫಿಂಗ್, ರೂಪಾಂತರ, ಪಾಲಿಪ್ಲಾಯ್ಡಿ ಮುಂತಾದ ಕೆಲವು ಹೆಚ್ಚುವರಿ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳ ಅಗತ್ಯವಿರುತ್ತದೆ. ಇದು ಪೆಡಿಮ್ಯಾಪ್ನಲ್ಲಿ ಬೆಂಬಲಿತವಾಗಿದೆ. ದ್ವಿಗುಣಗಳು ಮತ್ತು ಟೆಟ್ರಾಪ್ಲೋಯಿಡ್ಗಳೆರಡರಲ್ಲೂ ಪ್ರತಿಯೊಂದು ರೀತಿಯ ಸಸ್ಯ ವಂಶಾವಳಿಗಳಲ್ಲಿ ಫಿನೋಟೈಪಿಕ್, ಜೀನೋಟೈಪಿಕ್ ಮತ್ತು ಐಬಿಡಿ ಸಂಭವನೀಯತೆಗಳ ದತ್ತಾಂಶದೊಂದಿಗೆ ವಂಶಾವಳಿಯ ದೃಶ್ಯೀಕರಣಕ್ಕಾಗಿ ವಂಶಾವಳಿಯ ನಕ್ಷೆಯನ್ನು ಬಳಸಬಹುದು. ಜೆನೆಟಿಕ್ ಅಸೋಸಿಯೇಷನ್ ಮಾರ್ಕರ್ ಅಸಿಸ್ಟೆಡ್ ಸೆಲೆಕ್ಷನ್ ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಮಾರ್ಕರ್ಗಳು ನೆಸ್ಟೆಡ್ ಅಸೋಸಿಯೇಷನ್ ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ ಫಿಸಿಯೋಲಾಜಿಕಲ್ ಮತ್ತು ಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಗೋಧಿ ಬ್ರೀಡಿಂಗ್ ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಯು ಜೆ, ಬಕ್ಲರ್ ಇಎಸ್ (2006) "ಜೆನೆಟಿಕ್ ಅಸೋಸಿಯೇಷನ್ ಮ್ಯಾಪಿಂಗ್ ಮತ್ತು ಮೆಕ್ಕೆ ಜೋಳದ ಜೀನೋಮ್ ಆರ್ಗನೈಸೇಶನ್" ಅನ್ನು ಸಹ ನೋಡಿ. ಕರ್ ಒಪೀನಿಯನ್ ಬಯೋಟೆಕ್ನಾಲ್ 17:155-160 ಫ್ಲಿಂಟ್-ಗಾರ್ಸಿಯಾ ಎಸ್, ಥಾರ್ನ್ಸ್ಬೆರಿ ಜೆಎಂ, ಬಕ್ಲರ್ ಇಎಸ್ಐವಿ (2003) "ಸಸ್ಯಗಳಲ್ಲಿ ಲಿಂಕೇಜ್ ಅಸಮತೋಲನದ ರಚನೆ". ಅನು ರೆವ್ ಪ್ಲಾಂಟ್ ಬಯೋಲ್ 54:357-374 ಸಂಖ್ಯಾಶಾಸ್ತ್ರೀಯ ಜೆನೆಟಿಕ್ಸ್