Secretomics
ಸೀಕ್ರೆಟೋಮಿಕ್ಸ್ ಎಂಬುದು ಒಂದು ರೀತಿಯ ಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ಸ್ ಆಗಿದ್ದು, ಇದು ಸ್ರವಿಸುವ ಕೋಶದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ-ಜೀವಕೋಶ, ಅಂಗಾಂಶ ಅಥವಾ ಜೀವಿಗಳ ಎಲ್ಲಾ ಸ್ರವಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು. ಸ್ರವಿಸಿದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಜೀವಕೋಶದ ಸಂಕೇತ ಮತ್ತು ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್ ಮರುರೂಪಿಸುವಿಕೆ ಸೇರಿದಂತೆ ವಿವಿಧ ದೈಹಿಕ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿಕೊಂಡಿವೆ, ಆದರೆ ಮಾರಣಾಂತಿಕ ಜೀವಕೋಶಗಳ ಆಕ್ರಮಣ ಮತ್ತು ಮೆಟಾಸ್ಟಾಸಿಸ್ಗೆ ಸಹ ಅವಿಭಾಜ್ಯವಾಗಿವೆ. ಹೀಗಾಗಿ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ಗೆ ಜೈವಿಕ ಗುರುತುಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯುವಲ್ಲಿ ಮತ್ತು ರೋಗಕಾರಕದ ಆಣ್ವಿಕ ಆಧಾರವನ್ನು ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳುವಲ್ಲಿ ಸೀಕ್ರೆಟಾಮಿಕ್ಸ್ ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಮಹತ್ವದ್ದಾಗಿದೆ. ಸ್ರವಿಸುವಿಕೆಯ (ಬಾಹ್ಯಕೋಶೀಯ ಮ್ಯಾಟ್ರಿಕ್ಸ್) ಕರಗದ ಭಾಗದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಮ್ಯಾಟ್ರಿಸೋಮಿಕ್ಸ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. 2000 ರಲ್ಲಿ ಸ್ರಾವದ ಇತಿಹಾಸ ಟಿಜಲ್ಸ್ಮಾ ಮತ್ತು ಇತರರು. ಯೂಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಂ ಬಿ. ಸಬ್ಟಿಲಿಸ್ನ ಅಧ್ಯಯನದಲ್ಲಿ ಅವರು 'ಸೀಕ್ರೆಟೋಮ್' ಎಂಬ ಪದವನ್ನು ಸೃಷ್ಟಿಸಿದರು. ಅವರು ಸ್ರವಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಎಲ್ಲಾ ಸ್ರವಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಸ್ರವಿಸುವ ಯಂತ್ರೋಪಕರಣಗಳು ಎಂದು ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸಿದ್ದಾರೆ. ಬಿ. ಸಬ್ಟಿಲಿಸ್ನಲ್ಲಿನ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ದತ್ತಸಂಚಯ ಮತ್ತು ಸೀಳು ತಾಣಗಳು ಮತ್ತು ಸ್ರವಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ಅಮೈನೋ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಸಿಗ್ನಲ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ಗಳನ್ನು ನೋಡುವ ಅಲ್ಗಾರಿದಮ್ ಅನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಅವರು ಜೀವಕೋಶದಿಂದ ಪ್ರೋಟಿಯೋಮ್ನ ಯಾವ ಭಾಗವು ಸ್ರವಿಸುತ್ತದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಊಹಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಯಿತು. 2001 ರಲ್ಲಿ ಅದೇ ಪ್ರಯೋಗಾಲಯವು ಸ್ರವಿಸುವಿಕೆಯ ಮಾನದಂಡವನ್ನು ನಿಗದಿಪಡಿಸಿತು-ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಆಧರಿಸಿದ ಭವಿಷ್ಯವಾಣಿಗಳು ಮಾತ್ರ ಸ್ರವಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸಲು ಸಾಕಾಗುವುದಿಲ್ಲ. ಅವರು ಬಿ. ಸಬ್ಟಿಲಿಸ್ನಿಂದ ಸ್ರವಿಸುವ 82 ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ದ್ವಿ-ಆಯಾಮದ ಜೆಲ್ ಎಲೆಕ್ಟ್ರೋಫೋರೆಸಿಸ್ ಮತ್ತು ಮಾಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಮೆಟ್ರಿಯನ್ನು ಬಳಸಿದರು, ಅವುಗಳಲ್ಲಿ ಕೇವಲ 48 ಅನ್ನು ಅವರ ಹಿಂದಿನ ಕಾಗದದ ಜೀನೋಮ್ ಆಧಾರಿತ ವಿಧಾನವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಊಹಿಸಲಾಗಿತ್ತು. ಇದು ನಿರೀಕ್ಷಿತ ಸಂಶೋಧನೆಗಳ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪರಿಶೀಲನೆಯ ಅಗತ್ಯವನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಸ್ರವಿಸುವ ಮಾರ್ಗಗಳ ಸಂಕೀರ್ಣ ಸ್ವರೂಪವನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿದಂತೆ-ಅವುಗಳೆಂದರೆ ಸ್ರವಿಸುವಿಕೆಯ ಅನೇಕ ಶಾಸ್ತ್ರೀಯವಲ್ಲದ ಮಾರ್ಗಗಳಿವೆ ಮತ್ತು ಶಾಸ್ತ್ರೀಯ ಸ್ರವಿಸುವ ಮಾರ್ಗದ ಭಾಗವಾಗಿರುವ ಅನೇಕ ಸ್ರವಿಸದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಿವೆ-ಸ್ರವಿಸುವಿಕೆಯ ಹೆಚ್ಚು ಆಳವಾದ ವ್ಯಾಖ್ಯಾನವು ಅಗತ್ಯವಾಯಿತು. 2010ರಲ್ಲಿ, ಅಗ್ರವಾಲ್ ಮತ್ತು ಇತರರು. ಸ್ರವಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು "ರಚನಾತ್ಮಕ ಮತ್ತು ನಿಯಂತ್ರಿತ ಸ್ರವಿಸುವ ಅಂಗಕಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ತಿಳಿದಿರುವ ಮತ್ತು ಅಜ್ಞಾತ ಸ್ರವಿಸುವ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳ ಮೂಲಕ ಯಾವುದೇ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸಮಯ ಮತ್ತು ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ಜೀವಕೋಶ, ಅಂಗಾಂಶ, ಅಂಗ ಅಥವಾ ಜೀವಿಗಳಿಂದ ಬಾಹ್ಯಕೋಶೀಯ ಜಾಗಕ್ಕೆ ಸ್ರವಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಜಾಗತಿಕ ಗುಂಪು" ಎಂದು ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸಲು ಸಲಹೆ ನೀಡಿದರು. ಸ್ರವಿಸುವಿಕೆಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಸವಾಲುಗಳು ಮಾಲಿನ್ಯಕಾರಕಗಳು ಸಂಸ್ಕೃತಿಯಲ್ಲಿ, ಜೀವಕೋಶಗಳು ಮಾಲಿನ್ಯಕಾರಕಗಳಿಂದ ಆವೃತವಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಜೀವಕೋಶ ಸಂವರ್ಧನ ಮಾಧ್ಯಮ ಮತ್ತು ಜೀವಕೋಶದ ಅವಶೇಷಗಳಿಂದ ಬರುವ ಗೋವಿನ ಸೀರಮ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಾಗಿ ಬಳಸುವ ಸ್ರವಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಸಂಗ್ರಹವನ್ನು ಕಲುಷಿತಗೊಳಿಸಬಹುದು. ಫೈಬ್ರೊನೆಕ್ಟಿನ್ ಮತ್ತು ಫೈಬುಲಿನ್-1 ನಂತಹ ಅನೇಕ ಗೋವಿನ ಬಾಹ್ಯಕೋಶೀಯ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳು ಮಾನವನ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಹೋಲುತ್ತವೆಯಾದ್ದರಿಂದ ಗೋವಿನ ಮಾಲಿನ್ಯಕಾರಕಗಳು ಒಂದು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸವಾಲನ್ನು ಪ್ರಸ್ತುತಪಡಿಸುತ್ತವೆ. ಈ ಮಾಲಿನ್ಯಕಾರಕಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಹಾಕಲು, ಎಸ್ಎಫ್ಎಂನಲ್ಲಿ ಕಾವುಕೊಡುವ ಮೊದಲು ಮತ್ತು ಸ್ರವಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸುವ ಮೊದಲು ಜೀವಕೋಶಗಳನ್ನು ಪಿಬಿಎಸ್ ಅಥವಾ ಸೀರಮ್-ಫ್ರೀ ಮೀಡಿಯಂ (ಎಸ್ಎಫ್ಎಂ) ನಿಂದ ತೊಳೆಯಬಹುದು. ಜೀವಕೋಶಗಳು ಸ್ಫೋಟಗೊಳ್ಳದಂತೆ, ಅಂತರ್ಜೀವಕೋಶದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಬಿಡುಗಡೆ ಮಾಡದಂತೆ ಕಾಳಜಿ ವಹಿಸಬೇಕು. ಇದರ ಜೊತೆಗೆ, ಎಸ್ಎಫ್ಎಂನಲ್ಲಿನ ಪೋಷಕಾಂಶಗಳ ಕೊರತೆಯಿಂದ ಪ್ರಚೋದಿಸಬಹುದಾದ ಚಯಾಪಚಯ ಒತ್ತಡವು ಸ್ರವಿಸುವಿಕೆಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಮೇಲೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರದಂತೆ ಕಾವುಕೊಡುವ ಸಮಯ ಮತ್ತು ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳನ್ನು ಉತ್ತಮಗೊಳಿಸಬೇಕು. ಕಡಿಮೆ ಸಾಂದ್ರತೆಯ ಕೆಲವು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಕಡಿಮೆ ಪ್ರಮಾಣದಲ್ಲಿ ಸ್ರವಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ನಂತರ ಜೀವಕೋಶದ ಸಂಸ್ಕೃತಿಯ ಮಧ್ಯಮ ಅಥವಾ ದೇಹದ ದ್ರವದಲ್ಲಿ ಮತ್ತಷ್ಟು ದುರ್ಬಲಗೊಳ್ಳುತ್ತವೆ, ಇದರಿಂದಾಗಿ ಈ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಲು ಮತ್ತು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಲು ಕಷ್ಟವಾಗುತ್ತದೆ. ಟಿ. ಸಿ. ಎ. ಮಳೆಯಂತಹ ಸಾಂದ್ರತೆಯ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಬಳಸಬಹುದು ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಒಂದೇ ಅಣುಗಳನ್ನು ಸಹ ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಬಲ್ಲ ಪ್ರತಿಕಾಯ ಮೈಕ್ರೋಅರೇಗಳಂತಹ ಹೆಚ್ಚು ಸೂಕ್ಷ್ಮ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಬಳಸಬಹುದು. ಇನ್ ವಿಟ್ರೊ ಅಧ್ಯಯನಗಳ ಪ್ರಸ್ತುತತೆ ಅನೇಕ ಸ್ರವಿಸುವ ಅಧ್ಯಯನಗಳನ್ನು ಇನ್ ವಿಟ್ರೊದಲ್ಲಿ ಜೀವಕೋಶ ಸಂಸ್ಕರಣಾ ವಿಧಾನಗಳೊಂದಿಗೆ ನಡೆಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಅದೇ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ವಿವೊದಲ್ಲಿ ಸ್ರವಿಸುತ್ತವೆಯೇ ಎಂಬುದು ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿಲ್ಲ. ಹೆಚ್ಚು ಹೆಚ್ಚು ಅಧ್ಯಯನಗಳು, ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ಸ್ರವಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ನೋಡುವವರು, ಇನ್ ವಿಟ್ರೊದಲ್ಲಿ ಪಡೆದ ಫಲಿತಾಂಶಗಳ ಪ್ರಸ್ತುತತೆಯನ್ನು ದೃಢೀಕರಿಸಲು ಇನ್ ವಿವೋ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಬಳಸುತ್ತಿದ್ದಾರೆ. ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಸ್ರವಿಸುವ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ನಡೆಸುವ ಸಲುವಾಗಿ ಗೆಡ್ಡೆಯ ಪಕ್ಕದಲ್ಲಿ ಸಮೀಪದ ಜೈವಿಕ ದ್ರವಗಳನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸಬಹುದು. ವಿಧಾನಗಳು ಜೀನೋಮ್-ವೈಡ್ ಮುನ್ಸೂಚನೆ ಅನೇಕ ಸ್ರವಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ, ಇದು ಅನುವಾದಿತ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಎಂಡೋಪ್ಲಾಸ್ಮಿಕ್ ರೆಟಿಕ್ಯುಲಮ್ಗೆ ಚಲಿಸುವಂತೆ ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ, ಅಲ್ಲಿ ಸಂಸ್ಕರಣೆಯು ಸಂಭವಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಅದು ಅಂತಿಮವಾಗಿ ಸ್ರವಿಸುವಿಕೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ. ಈ ಸಿಗ್ನಲ್ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ಗಳ ಉಪಸ್ಥಿತಿಯನ್ನು ಜೀವಕೋಶದ ಸ್ರವಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಊಹಿಸಲು ಬಳಸಬಹುದು. ಕೆಲವು ಸ್ರವಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಶಾಸ್ತ್ರೀಯ ಸಂಕೇತ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವುದಿಲ್ಲ. ಇವುಗಳನ್ನು 'ಲೀಡರ್ ಲೆಸ್ ಸ್ರವಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು' (ಎಲ್. ಎಸ್. ಪಿಗಳು) ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ಜೀನೋಮ್-ವೈಡ್ ಪ್ರಿಡಿಕ್ಷನ್ ವಿಧಾನಗಳು ವಿವಿಧ ಸಮಸ್ಯೆಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ. ಸುಳ್ಳು ಧನಾತ್ಮಕ ಮತ್ತು ಸುಳ್ಳು ಋಣಾತ್ಮಕ ಸಾಧ್ಯತೆಗಳು ಹೆಚ್ಚಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಇದಲ್ಲದೆ, ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯು ಪರಿಸರ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಿಂದ ಹೆಚ್ಚು ಪ್ರಭಾವಿತವಾಗಿದೆ, ಅಂದರೆ ಜೀನೋಮ್ ಅಥವಾ ಸಿಡಿಎನ್ಎ ಗ್ರಂಥಾಲಯದಿಂದ ಊಹಿಸಲಾದ ಸ್ರವಿಸುವಿಕೆಯು ನಿಜವಾದ ಸ್ರವಿಸುವಿಕೆಯೊಂದಿಗೆ ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಹೊಂದಿಕೆಯಾಗುವ ಸಾಧ್ಯತೆಯಿಲ್ಲ. ಯಾವುದೇ ನಿರೀಕ್ಷಿತ ಸ್ರವಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಮೌಲ್ಯೀಕರಿಸಲು ಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ ವಿಧಾನಗಳು ಅಗತ್ಯವಾಗಿವೆ. ಕ್ಯೂರೇಶನ್ ಮತ್ತು ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನಲ್ ಮುನ್ಸೂಚನೆ ಎರಡರ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಹಲವಾರು ಜೀನೋಮ್-ವೈಡ್ ಸೀಕ್ರೆಟೋಮ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್ಗಳು ಅಥವಾ ಜ್ಞಾನ ನೆಲೆಗಳು ಲಭ್ಯವಿವೆ. ಈ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳು ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಸ್ರವಿಸುವ ದತ್ತಸಂಚಯ (ಎಫ್ಎಸ್ಡಿ), ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಸ್ರವಿಸುವ ಜ್ಞಾನಕೋಶ (ಫನ್ಸೆಕೆಬಿ) ಮತ್ತು ಲ್ಯಾಕ್ಟಿಕ್ ಆಮ್ಲ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಸ್ರವಿಸುವ ದತ್ತಸಂಚಯವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿವೆ. ಮಾನವ ಮತ್ತು ಪ್ರಾಣಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಉಪಕೋಶೀಯ ಸ್ಥಳ ದತ್ತಸಂಚಯ (ಮೆಟಾಸೆಕೆಕೆಬಿ) ಮತ್ತು ಪ್ರೊಟಿಸ್ಟ್ ಉಪಕೋಶೀಯ ಪ್ರೋಟಿಯೋಮ್ ದತ್ತಸಂಚಯ (ಪ್ರೊಟಾಸೆಕೆಕೆಬಿ) ಕೂಡ ಇತ್ತೀಚೆಗೆ ಬಿಡುಗಡೆಯಾಗಿವೆ. ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನಲ್ ಮುನ್ಸೂಚನೆಯಲ್ಲಿ ಕೆಲವು ದೋಷಗಳಿದ್ದರೂ, ಈ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಉಪಕೋಶೀಯ ಸ್ಥಳಗಳನ್ನು ಮತ್ತಷ್ಟು ನಿರೂಪಿಸಲು ಉಪಯುಕ್ತ ಸಂಪನ್ಮೂಲಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತವೆ. ಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ ವಿಧಾನಗಳು ಮಾಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಮೆಟ್ರಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಸ್ರವಿಸುವಿಕೆಗೆ ಅವಿಭಾಜ್ಯವಾಗಿದೆ. ಸ್ರವಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಸೀರಮ್ ಅಥವಾ ಸೂಪರ್ನೇಟಂಟ್ ಅನ್ನು ಪ್ರೋಟಿಯೇಸ್ನೊಂದಿಗೆ ಜೀರ್ಣಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು 2ಡಿ ಜೆಲ್ ಎಲೆಕ್ಟ್ರೋಫೋರೆಸಿಸ್ ಅಥವಾ ಕ್ರೊಮ್ಯಾಟೋಗ್ರಾಫಿಕ್ ವಿಧಾನಗಳಿಂದ ಬೇರ್ಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ನಂತರ ಮಾಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಮೆಟ್ರಿ ಮೂಲಕ ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಉತ್ಪತ್ತಿಯಾಗುವ ಪೆಪ್ಟೈಡ್-ಮಾಸ್ ಫಿಂಗರ್ಪ್ರಿಂಟ್ ಅನ್ನು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಡೇಟಾಬೇಸ್ ಮೂಲಕ ಚಲಾಯಿಸಬಹುದು. ಜೀವಕೋಶ ಸಂಸ್ಕೃತಿಯಲ್ಲಿ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳಿಂದ ಸ್ಥಿರ ಐಸೊಟೋಪ್ ಲೇಬಲಿಂಗ್ (ಎಸ್. ಐ. ಎಲ್. ಎ. ಸಿ) ಸ್ರವಿಸುವಿಕೆಯಲ್ಲಿ ಒಂದು ಪ್ರಮುಖ ವಿಧಾನವಾಗಿ ಹೊರಹೊಮ್ಮಿದೆ-ಇದು ಜೀವಕೋಶ ಸಂಸ್ಕೃತಿಯಲ್ಲಿ ಸ್ರವಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಗೋವಿನ ಸೀರಮ್ ಮಾಲಿನ್ಯಕಾರಕಗಳ ನಡುವಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸವನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಸಾಮಾನ್ಯ ಮಾಧ್ಯಮದಲ್ಲಿ ಬೆಳೆಯುವ ಜೀವಕೋಶಗಳು ಮತ್ತು ಸ್ಥಿರ-ಐಸೋಟೋಪ್ ಲೇಬಲ್ ಮಾಡಲಾದ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳೊಂದಿಗೆ ಮಧ್ಯಮದಲ್ಲಿ ಬೆಳೆಯುವ ಜೀವಕೋಶಗಳಿಂದ ಸೂಪರ್ನಾಟಂಟ್ ಅನ್ನು 1:1 ಅನುಪಾತದಲ್ಲಿ ಬೆರೆಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಮಾಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಮೆಟ್ರಿ ಮೂಲಕ ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಸೀರಮ್ನಲ್ಲಿನ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಾಲಿನ್ಯಕಾರಕಗಳು ಕೇವಲ ಒಂದು ಉತ್ತುಂಗವನ್ನು ಮಾತ್ರ ತೋರಿಸುತ್ತವೆ ಏಕೆಂದರೆ ಅವು ಲೇಬಲ್ ಮಾಡಲಾದ ಸಮಾನತೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವುದಿಲ್ಲ. ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಸಂಸ್ಕೃತಿಯಲ್ಲಿ ಮಾನವ ಕೊಂಡ್ರೋಸೈಟ್ಗಳಿಂದ ಸ್ರವಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಮತ್ತು ಸೀರಮ್ ಮಾಲಿನ್ಯಕಾರಕಗಳ ನಡುವಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸವನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಎಸ್. ಐ. ಎಲ್. ಎ. ಸಿ ವಿಧಾನವನ್ನು ಯಶಸ್ವಿಯಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗಿದೆ. ಪ್ರತಿಕಾಯ ಸೂಕ್ಷ್ಮ ವ್ಯೂಹವು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಲು ಅತ್ಯಂತ ಸೂಕ್ಷ್ಮ ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚಿನ-ಥ್ರೋಪುಟ್ ವಿಧಾನವಾಗಿದ್ದು, ಇದು ಇತ್ತೀಚೆಗೆ ಸ್ರವಿಸುವ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಭಾಗವಾಗಿದೆ. ಪ್ರತಿಕಾಯಗಳು, ಅಥವಾ ಇನ್ನೊಂದು ರೀತಿಯ ಬಂಧಕ ಅಣುವನ್ನು ಘನ ಆಧಾರದಲ್ಲಿ ಜೋಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಪ್ರತಿದೀಪಕವಾಗಿ ಲೇಬಲ್ ಮಾಡಲಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಿಶ್ರಣವನ್ನು ಸೇರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ಸಿಗ್ನಲ್ ತೀವ್ರತೆಗಳನ್ನು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಆಂಟಿಬಾಡಿ ಮೈಕ್ರೋಅರೇಗಳು ಅತ್ಯಂತ ಬಹುಮುಖವಾಗಿವೆ-ಅವುಗಳನ್ನು ಮಿಶ್ರಣದಲ್ಲಿನ ಪ್ರೋಟೀನಿನ ಪ್ರಮಾಣ, ವಿಭಿನ್ನ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಐಸೋಫಾರ್ಮ್ಗಳು, ಅನುವಾದದ ನಂತರದ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಜೀವರಾಸಾಯನಿಕ ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಲು ಬಳಸಬಹುದು. ಇದಲ್ಲದೆ, ಈ ಮೈಕ್ರೋಅರೇಗಳು ಹೆಚ್ಚು ಸೂಕ್ಷ್ಮವಾಗಿರುತ್ತವೆ-ಅವು ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಏಕ ಅಣುಗಳನ್ನು ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಬಲ್ಲವು. ಆಂಟಿಬಾಡಿ ಮೈಕ್ರೋಅರೇಗಳನ್ನು ಪ್ರಸ್ತುತ ಮಾನವನ ಪ್ಲಾಸ್ಮಾ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಲು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತಿದೆ ಆದರೆ ಸಂಸ್ಕರಿಸಿದ ಜೀವಕೋಶಗಳು ಮತ್ತು ದೇಹದ ದ್ರವ ಸ್ರವಿಸುವಿಕೆಗೆ ಸಹ ಬಳಸಬಹುದು, ಇದು ಒಂದೇ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಅನೇಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಉಪಸ್ಥಿತಿಯನ್ನು ಹುಡುಕುವ ಸರಳ ಮಾರ್ಗವನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. ಪರಿಣಾಮಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರಾಮುಖ್ಯತೆ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ಜೈವಿಕ ಗುರುತುಗಳ ಆವಿಷ್ಕಾರ ಸಾಮಾನ್ಯ ದೈಹಿಕ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳಲ್ಲಿ ಮುಖ್ಯವಾದುದಲ್ಲದೆ, ಸ್ರವಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಜೀವಕೋಶದ ಬೆಳವಣಿಗೆ, ವಲಸೆ, ಆಕ್ರಮಣ ಮತ್ತು ಆಂಜಿಯೋಜೆನೆಸಿಸ್ ಮೂಲಕ ಟ್ಯೂಮರಿಜೆನೆಸಿಸ್ನಲ್ಲಿ ಅವಿಭಾಜ್ಯ ಪಾತ್ರವನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ, ಇದು ಸ್ರವಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ಜೈವಿಕ ಗುರುತುಗಳ ಆವಿಷ್ಕಾರಕ್ಕೆ ಅತ್ಯುತ್ತಮ ವಿಧಾನವನ್ನಾಗಿ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಬಯೋಮಾರ್ಕರ್ಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲು ದೇಹದ ದ್ರವ ಅಥವಾ ಸಂಪೂರ್ಣ ಸೀರಮ್ ಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ ವಿಧಾನವನ್ನು ಬಳಸುವುದು ಅತ್ಯಂತ ಕಷ್ಟಕರವಾಗಬಹುದು-ದೇಹದ ದ್ರವಗಳು ಸಂಕೀರ್ಣ ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚು ವ್ಯತ್ಯಾಸಗೊಳ್ಳುತ್ತವೆ. ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ಜೀವಕೋಶದ ರೇಖೆಗಳು ಅಥವಾ ರೋಗಪೀಡಿತ ಅಂಗಾಂಶಗಳ ರಹಸ್ಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಬಯೋಮಾರ್ಕರ್ ಆವಿಷ್ಕಾರಕ್ಕೆ ಸರಳ ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚು ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾದ ಪರ್ಯಾಯವನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ. ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ಸ್ರವಿಸುವಿಕೆಯ ಎರಡು ಪ್ರಮುಖ ಜೈವಿಕ ಮೂಲಗಳೆಂದರೆ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ಜೀವಕೋಶದ ಲೈನ್ ಸೂಪರ್ನೇಟಂಟ್ಗಳು ಮತ್ತು ಸಮೀಪದ ಜೈವಿಕ ದ್ರವಗಳು, ಅವು ಗೆಡ್ಡೆಯ ಸಂಪರ್ಕದಲ್ಲಿರುವ ದ್ರವಗಳಾಗಿವೆ. ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ಸೆಲ್ ಲೈನ್ ಸೂಪರ್ನೇಟಂಟ್ ಸ್ರವಿಸುವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಆಕರ್ಷಕ ಮೂಲವಾಗಿದೆ. ಅನೇಕ ಪ್ರಮಾಣೀಕೃತ ಜೀವಕೋಶದ ರೇಖೆಗಳು ಲಭ್ಯವಿವೆ ಮತ್ತು ಸಮೀಪದ ದೇಹದ ದ್ರವಕ್ಕಿಂತ ಸೂಪರ್ನೇಟಂಟ್ ಅನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸುವುದು ತುಂಬಾ ಸರಳವಾಗಿದೆ. ಆದರೆ ಜೀವಕೋಶದ ರೇಖೆಯ ಸ್ರವಿಸುವಿಕೆಯು ಅದರ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಸೂಕ್ಷ್ಮ ಪರಿಸರದಲ್ಲಿ ನಿಜವಾದ ಗೆಡ್ಡೆಯ ಉತ್ತಮ ಪ್ರಾತಿನಿಧ್ಯವಾಗಿದೆಯೇ ಎಂಬುದು ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿಲ್ಲ ಮತ್ತು ಪ್ರಮಾಣೀಕೃತ ಜೀವಕೋಶದ ರೇಖೆಯು ನಿಜವಾದ ಗೆಡ್ಡೆಯ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯನ್ನು ವಿವರಿಸುವುದಿಲ್ಲ. ಸಮೀಪದ ದ್ರವಗಳ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಮಾನವನ ಗೆಡ್ಡೆಯ ಸ್ರವಿಸುವಿಕೆಯ ಬಗ್ಗೆ ಉತ್ತಮ ಕಲ್ಪನೆಯನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಈ ವಿಧಾನವು ಅದರ ನ್ಯೂನತೆಗಳನ್ನು ಸಹ ಹೊಂದಿದೆ. ಸಮೀಪದ ದ್ರವಗಳನ್ನು ಸಂಗ್ರಹಿಸುವ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಇನ್ನೂ ಪ್ರಮಾಣೀಕರಿಸಬೇಕಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಮಾರಣಾಂತಿಕವಲ್ಲದ ನಿಯಂತ್ರಣಗಳ ಅಗತ್ಯವಿದೆ. ಇದಲ್ಲದೆ, ರೋಗಿಗಳ ನಡುವಿನ ಪರಿಸರ ಮತ್ತು ಆನುವಂಶಿಕ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಸಂಕೀರ್ಣಗೊಳಿಸಬಹುದು. ರಹಸ್ಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಶ್ವಾಸಕೋಶದ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್, ಯಕೃತ್ತಿನ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್, ಪ್ಯಾಂಕ್ರಿಯಾಟಿಕ್ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್, ಕೊಲೊರೆಕ್ಟಲ್ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್, ಪ್ರಾಸ್ಟೇಟ್ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ಮತ್ತು ಸ್ತನ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ಸೇರಿದಂತೆ ಅನೇಕ ರೀತಿಯ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ಗಳಲ್ಲಿ ಸಂಭಾವ್ಯ ಹೊಸ ಬಯೋಮಾರ್ಕರ್ಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿದಿದೆ. ಪ್ರಾಸ್ಟೇಟ್-ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪ್ರತಿಜನಕ (ಪಿಎಸ್ಎ), ಪ್ರಾಸ್ಟೇಟ್ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ಗೆ ಪ್ರಸ್ತುತ ಪ್ರಮಾಣಿತ ಬಯೋಮಾರ್ಕರ್, ಕಡಿಮೆ ರೋಗನಿರ್ಣಯದ ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ-ಪಿಎಸ್ಎ ಮಟ್ಟಗಳು ಯಾವಾಗಲೂ ಆಕ್ರಮಣಕಾರಿ ಮತ್ತು ಆಕ್ರಮಣಕಾರಿಯಲ್ಲದ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ನ ನಡುವೆ ತಾರತಮ್ಯವನ್ನು ತೋರಿಸುವುದಿಲ್ಲ-ಮತ್ತು ಆದ್ದರಿಂದ ಉತ್ತಮ ಬಯೋಮಾರ್ಕರ್ ಬಹಳವಾಗಿ ಅಗತ್ಯವಿದೆ. ಪ್ರಾಸ್ಟೇಟ್ ಜೀವಕೋಶದ ರೇಖೆಗಳ ಸ್ರವಿಸುವ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು, ಒಂದು ಅಧ್ಯಯನವು ಆರೋಗ್ಯಕರ ನಿಯಂತ್ರಣಗಳಿಗಿಂತ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ರೋಗಿಗಳ ಸೀರಮ್ನಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಅನೇಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲು ಸಾಧ್ಯವಾಯಿತು. ಸ್ತನ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ಅನ್ನು ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಲು ಬಯೋಮಾರ್ಕರ್ಗಳ ಅಗತ್ಯವೂ ಇದೆ-ಪ್ರಸ್ತುತ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ನ ನಂತರದ ಹಂತಗಳ ಮೇಲ್ವಿಚಾರಣೆಗಾಗಿ ಮಾತ್ರ ಬಯೋಮಾರ್ಕರ್ಗಳು ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿವೆ. ಸ್ತನ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ಜೀವಕೋಶದ ರೇಖೆಗಳ ರಹಸ್ಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ALCAM ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ಭರವಸೆಯ ರೋಗನಿರ್ಣಯದ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಹೊಸ ಬಯೋಮಾರ್ಕರ್ ಆಗಿ ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲು ಕಾರಣವಾಯಿತು. ಸಹಾಯಕ ಸಂತಾನೋತ್ಪತ್ತಿ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನಗಳು ಮಾನವ ಭ್ರೂಣದ ಸ್ರವಿಸುವಿಕೆಯನ್ನು ವಿಶ್ಲೇಷಿಸುವುದು ಭ್ರೂಣಗಳ ಕಾರ್ಯಸಾಧ್ಯತೆಯನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲು ಆಕ್ರಮಣಶೀಲವಲ್ಲದ ವಿಧಾನವನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲು ಸಹಾಯಕವಾಗಬಹುದು. ಐವಿಎಫ್ನಲ್ಲಿ, ಹೆಚ್ಚಿನ ಕಸಿ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಭ್ರೂಣಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯುವ ಪ್ರಯತ್ನದಲ್ಲಿ ರೂಪವಿಜ್ಞಾನದ ಮಾನದಂಡಗಳ ಮೇಲೆ ಮೌಲ್ಯಮಾಪನ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ಮೌಲ್ಯಮಾಪನದ ಹೆಚ್ಚು ಪರಿಮಾಣಾತ್ಮಕ ವಿಧಾನವನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯುವುದು ಐವಿಎಫ್ನಲ್ಲಿ ಬಳಸುವ ಭ್ರೂಣಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ, ಇದರಿಂದಾಗಿ ಉನ್ನತ ಶ್ರೇಣಿಯ ಗರ್ಭಧಾರಣೆಗಳನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡಬಹುದು. ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಒಂದು ಅಧ್ಯಯನವು ಅನೇಕ ಬ್ಲಾಸ್ಟೋಸಿಸ್ಟ್ಗಳಿಗೆ ರಹಸ್ಯವಾದ ಬೆರಳಚ್ಚುಗಳನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲು ಸಾಧ್ಯವಾಯಿತು ಮತ್ತು ಸಾಮಾನ್ಯ ಮತ್ತು ಅಸಹಜ ಸಂಖ್ಯೆಯ ವರ್ಣತಂತುಗಳೊಂದಿಗೆ ಬ್ಲಾಸ್ಟೋಸಿಸ್ಟ್ಗಳ ನಡುವೆ ವ್ಯತ್ಯಾಸವನ್ನು ಗುರುತಿಸಬಲ್ಲ 9 ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿದಿದೆ. ಈ ರೀತಿಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಭ್ರೂಣದ ಜೀವಕೋಶಗಳ ಬಯಾಪ್ಸಿ ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಮತ್ತು ಬೆಳವಣಿಗೆಗೆ ಹಾನಿಕಾರಕವಾದ ಪ್ರಿ ಇಂಪ್ಲಾಂಟೇಶನ್ ಜೆನೆಟಿಕ್ ಸ್ಕ್ರೀನಿಂಗ್ (ಪಿಜಿಎಸ್) ಅನ್ನು ಬದಲಿಸಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ಸ್ ಸ್ರಾವ