Toxic Small RNA
ಆಣ್ವಿಕ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರದಲ್ಲಿ, ಟಾಕ್ಸಿಕ್ ಸ್ಮಾಲ್ ಆರ್ಎನ್ಎ (ಟಿಎಸ್ಆರ್ಎನ್ಎ, ಟಿಆರ್ಎನ್ಎ-ಪಡೆದ ಸಣ್ಣ ಆರ್ಎನ್ಎಯೊಂದಿಗೆ ಗೊಂದಲಕ್ಕೀಡಾಗಬಾರದು) ಎಂಬುದು ಟ್ರಾನ್ಸ್-ಎನ್ಕೋಡೆಡ್ ಸಣ್ಣ ನಾನ್-ಕೋಡಿಂಗ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ಕುಟುಂಬವಾಗಿದ್ದು, ಇದು ಪ್ರತ್ಯೇಕವಾಗಿ ಬೆಟಾಪ್ರೊಟೋಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಇಂಟರ್ಜೆನಿಕ್ ಪ್ರದೇಶಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ. ಹಲವಾರು ಪ್ಯಾರಾಲೋಗಸ್ ಲೋಕಿಯು ಪ್ರತಿ ಕೋಡಿಂಗ್ ಜೀನೋಮ್ನಲ್ಲಿ ಇದೇ ರೀತಿಯ (ಆದರೆ ಒಂದೇ ಅಲ್ಲದ) ಟಿಎಸ್ಆರ್ಎನ್ಎಗಳನ್ನು ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಬಹುದು. ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ, ಬರ್ಕ್ಹೋಲ್ಡೇರಿಯಾದ ಪ್ರತಿಯೊಂದು ಪ್ರಭೇದವು 3ರಿಂದ 5 ಏಕರೂಪದ ಟಿಎಸ್ಆರ್ಎನ್ಎಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಬರ್ಕ್ಹೋಲ್ಡೇರಿಯಾ ವಂಶಾವಳಿಯ ನಾಲ್ಕು ಪ್ರಭೇದಗಳೊಂದಿಗಿನ ಪ್ರಯೋಗಗಳು ಲಾಗರಿಥಮಿಕ್ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಹಂತಗಳಲ್ಲಿ ಟಿಎಸ್ಆರ್ಎನ್ಎಗಳ ಸಂರಕ್ಷಿತ ಮತ್ತು ರಚನಾತ್ಮಕ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ತೋರಿಸಿದವು. ಬರ್ಕ್ಹೋಲ್ಡೇರಿಯಾ ಸೆನೊಸೆಪಾಸಿಯಾದಲ್ಲಿನ 4 ಟಿಎಸ್ಆರ್ಎನ್ಎಗಳ ದ್ವಿತೀಯಕ ರಚನೆಗಳ ಅನುಕ್ರಮ ಮತ್ತು ರಚನೆಯ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು ಅವು ಡಬಲ್ ಹೇರ್ಪಿನ್ ರಚನೆಗಳನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ, ಈ ರಚನೆಯು ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಯನ್ನು ಸಂಸ್ಕರಿಸಿದ ನಂತರವೇ ಫಲಿತಾಂಶವನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ (ಎನ್. ಸಿ. ಎಸ್. 27ರಲ್ಲಿರುವಂತೆ). ವಿಶಿಷ್ಟವಾಗಿ, ದ್ವಿತೀಯ ರಚನೆಯ ಜೋಡಿಸದ ಭಾಗಗಳಲ್ಲಿ ಸಿಯು-ಸಮೃದ್ಧ (ಸೈಟೋಸಿನ್ ಮತ್ತು ಯುರಾಸಿಲ್ ಸಮೃದ್ಧ) ಪ್ರದೇಶವಿದೆ. ಈ ಸಿಯು-ಸಮೃದ್ಧ ಪ್ರದೇಶವು ಎಂಆರ್ಎನ್ಎಗಳ ರೈಬೋಸೋಮ್-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್ (ಆರ್ಬಿಎಸ್) ಅನ್ನು ಬಂಧಿಸುವ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಪ್ರದೇಶವೆಂದು ಸೂಚಿಸಲಾಗಿದೆ. ಕಾರ್ಯ ಕ್ರಿಯೆಯ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವು ಗುರಿಯನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿ ಬದಲಾಗಬಹುದಾದರೂ, ಟಿಎಸ್ಆರ್ಎನ್ಎಗಳು ಅನೇಕ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎಗಳ ರೈಬೋಸೋಮ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಬಂಧಿಸುವ ಮೂಲಕ ಜೀನ್ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸಲಾಗಿದೆ. ಹರ್ಬಾಸ್ಪಿರಿಲ್ಲಮ್ ಸೆರೋಪೆಡಿಕೆಯಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಟಿಎಸ್ಆರ್ಎನ್ಎಗಳ ಕಡಿಮೆ ಜಿಸಿ (ಗ್ವಾನೈನ್ ಮತ್ತು ಸೈಟೋಸಿನ್) ಅಂಶವು ಈ ಊಹೆಯನ್ನು ಬೆಂಬಲಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಸ್ಥಿರಗೊಳಿಸಲು ಚಾಪೆರೋನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಎಚ್ಎಫ್ಕ್ಯು ಅಗತ್ಯವಿರುವ ಸಾಧ್ಯತೆಯಿದೆ, ಆದರೆ ಅದರ ಪಾತ್ರ ಅಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿದೆ. ಸ್ಥೂಲವಾಗಿ, ಟಿಎಸ್ಆರ್ಎನ್ಎಗಳು ಬರ್ಕ್ಹೋಲ್ಡೇರಿಯಾದಲ್ಲಿ ಕಾರ್ಬೋಹೈಡ್ರೇಟ್ ಮತ್ತು ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲ ಚಯಾಪಚಯವನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸಲಾಗಿದೆ. ಬಿ. ಸೆನೊಸೆಪಾಸಿಯಾವನ್ನು ಹಸಿವಿನ ವಾತಾವರಣಕ್ಕಿಂತ ಗ್ಲುಕೋಸ್-ಭರಿತ ಮಾಧ್ಯಮದಲ್ಲಿ ಬೆಳೆಸಿದಾಗ ಅವು ಹೆಚ್ಚು ವ್ಯಕ್ತವಾಗುತ್ತವೆ. ಇದಕ್ಕೆ ವಿರುದ್ಧವಾಗಿ, ಟಿಎಸ್ಆರ್ಎನ್ಎಗಳ ಅತಿಯಾದ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯು ಅಮೈನೋ-ಆಮ್ಲ ಸಮೃದ್ಧ ಪರಿಸರದಲ್ಲಿ ಬೆಳವಣಿಗೆಯನ್ನು ಕುಂಠಿತಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಈ ಕ್ಷೀಣಿಸುವಿಕೆಯು ಮಾಧ್ಯಮದ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ವಿಷಯಗಳ ಮೇಲೆ ಅವಲಂಬಿತವಾಗಿರುತ್ತದೆ, ಏಕೆಂದರೆ ಅನೇಕ ಪರಿಸರಗಳಲ್ಲಿ ಸಾಮಾನ್ಯ ಬೆಳವಣಿಗೆಯು ಇನ್ನೂ ಸಂಭವಿಸುತ್ತದೆ. ಹೆಚ್ಚಿನ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಟಿಎಸ್ಆರ್ಎನ್ಎಗಳು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಲಕ್ಷಣರಹಿತವಾಗಿದ್ದರೂ, ಎನ್. ಸಿ. ಎಸ್. 27ರ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲಾಗಿದೆ. ಇದು ಸಂರಕ್ಷಿತ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಇದು ಅನೇಕ ಸಾರಿಗೆ ಮತ್ತು ಚಯಾಪಚಯ ನಕಲುಗಳ ಶೈನ್-ಡಾಲ್ಗಾರ್ನೋ ಅನುಕ್ರಮದ ಹಿಮ್ಮುಖ ಪೂರಕವಾಗಿದೆ. ಸಂಭಾವ್ಯ ಗುರಿಗಳಲ್ಲಿ ಕಾರ್ಬೋಹೈಡ್ರೇಟ್ ಸಾಗಣೆ ಮತ್ತು ಆರೊಮ್ಯಾಟಿಕ್ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳ ಅವನತಿಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುವ ಅನೇಕ ಜೀನ್ಗಳು ಸೇರಿವೆ. ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಗುರಿಗಳಲ್ಲಿ 4-ಹೈಡ್ರಾಕ್ಸಿಫೆನಿಲ್ಪೈರುವಿಕ್ ಆಮ್ಲ ಡೈಆಕ್ಸಿಜನೇಸ್ (ಎಚ್. ಪಿ. ಪಿ. ಡಿ) ಮತ್ತು ಇಂಡೋಲೆಪೈರುವೇಟ್ ಫೆರೆಡಾಕ್ಸಿನ್ ಆಕ್ಸಿಡೊರೆಡಕ್ಟೇಸ್ (ಐ. ಓ. ಆರ್) ಸೇರಿವೆ. ಈ ಕಿಣ್ವಗಳು ಫೆನೈಲಾಲನೈನ್ ಮತ್ತು ಟೈರೋಸಿನ್ ಕ್ಯಾಟಬೋಲಿಸಮ್ನಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿಕೊಂಡಿವೆ. ಇತರ ಸಂಭಾವ್ಯ ಗುರಿಗಳಲ್ಲಿ ಗ್ಲಿಸರಾಲ್ ಕೈನೇಸ್ ಮತ್ತು ಎಟಿಪಿ-ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಕ್ಯಾಸೆಟ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋರ್ಟರ್ಗಳಲ್ಲಿ (ಎಬಿಸಿ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋರ್ಟರ್ಗಳು) ಸಬ್ಸ್ಟ್ರೇಟ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಸೇರಿವೆ. ಆದ್ದರಿಂದ, ಟಿಎಸ್ಆರ್ಎನ್ಎಗಳು ಕಾರ್ಬೋಹೈಡ್ರೇಟ್ ಮತ್ತು ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲ ಚಯಾಪಚಯವನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ಅನೇಕ ಪುರಾವೆಗಳು ಸೂಚಿಸುತ್ತವೆ, ಆದಾಗ್ಯೂ, ಕಾರ್ಯವನ್ನು ದೃಢೀಕರಿಸಲಾಗಿಲ್ಲ. ತುಲನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡದ ಟಿಎಸ್ಆರ್ಎನ್ಎ, ಎನ್ಸಿಎಸ್ 62, ಟಿಎನ್-ಸೆಕ್ ದತ್ತಾಂಶದ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಅಗತ್ಯವೆಂದು ಸೂಚಿಸಲಾಗಿದೆ. ಮೂಲತಃ, ಕ್ಲೋನಿಂಗ್ ವಾಹಕದ ಮೇಲೆ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಿದಾಗ ಇ. ಕೋಲಿ ಬೆಳವಣಿಗೆಯನ್ನು ತಡೆಯುವುದು ಕಂಡುಬಂದ ಕಾರಣ ಟಿಎಸ್ಆರ್ಎನ್ಎಗಳನ್ನು ಹೆಸರಿಸಲಾಯಿತು. ಟಿಎಸ್ಆರ್ಎನ್ಎಗಳು ಯಾವ ವಿಧಾನದಿಂದ ವಿಷಕಾರಿಯಾಗಿವೆ ಎಂಬುದು ಇನ್ನೂ ತಿಳಿದಿಲ್ಲ. ಟಿಎಸ್ಆರ್ಎನ್ಎಗಳು ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಮಾಧ್ಯಮದಲ್ಲಿದ್ದಾಗ ಇ. ಕೋಲಿಗೆ ವಿಷಕಾರಿಯಾಗಿರುವುದಿಲ್ಲ, ಅಥವಾ ಇ. ಕೋಲಿಯೊಂದಿಗೆ ಬೆಳೆಸಿದಾಗ ಬಿ. ಸೆನೊಸೆಪಾಸಿಯಾದಿಂದ ಸ್ರವಿಸುವುದಿಲ್ಲ. ಹೆಚ್ಚುವರಿಯಾಗಿ, ಈ ಆರ್. ಎನ್. ಎ ಅಣುಗಳು ಕಂಡುಬರುವ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳಿಗೆ ಅವು ವಿಷಕಾರಿಯಾಗಿರುವುದಿಲ್ಲ (ಬಿ. ಸೆನೊಸೆಪಾಸಿಯಾ). ಎನ್. ಸಿ. ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಗಳ ಈ ಕುಟುಂಬಕ್ಕೆ ಹೆಸರು ಬದಲಾವಣೆಯನ್ನು ಸೂಚಿಸಲಾಗಿದೆ. ಅವುಗಳ ರಚನೆಯ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ, ಕೆಲವು ಟಿಎಸ್ಆರ್ಎನ್ಎಗಳನ್ನು 'ಡಬಲ್ ಹೇರ್ಪಿನ್ ಆರ್ಎನ್ಎಗಳು' ಎಂದು ಕರೆಯಲು ಪ್ರಸ್ತಾಪಿಸಲಾಗಿದೆ. ಮೂಲತಃ 2015 ರಲ್ಲಿ ಗುರುತಿಸಲಾದ ಟಿಎಸ್ಆರ್ಎನ್ಎ (ಎನ್ಸಿಎಸ್ 27) ಅನ್ನು ಬರ್ಕ್ಹೋಲ್ಡೇರಿಯಾ ಡಬಲ್-ಹೇರ್ಪಿನ್ ಎಸ್ಆರ್ಎನ್ಎ ನಿಯಂತ್ರಕಕ್ಕಾಗಿ ಬಿಡಿಎಚ್ಆರ್ 1 ಎಂಬ ಹೆಸರನ್ನು ಸೂಚಿಸಲಾಗಿದೆ. ಎಸ್ಶೆರಿಚಿಯಾ ಕೋಲಿ ಎಸ್ಆರ್ಎನ್ಎ ಜೀವಕೋಶದ ಹೊರಗಿನ ಆರ್ಎನ್ಎ ಪಟ್ಟಿ ಆರ್ಎನ್ಎಗಳ ಆರ್ಫಾಮ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ಹಸ್ತಕ್ಷೇಪ ಸಣ್ಣ ಮಧ್ಯಪ್ರವೇಶಿಸುವ ಆರ್ಎನ್ಎ ಸಣ್ಣ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಲಾರ್ ಆರ್ಎನ್ಎ-ಪಡೆದ ಮೈಕ್ರೋಆರ್ಎನ್ಎ ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು ಪ್ಯಾನ್ಡಾಟಾಕ್ಸ್-ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಕ್ಕೆ ವಿಷಕಾರಿಯಾದ ವಂಶವಾಹಿಗಳ ದತ್ತಸಂಚಯ ಆರ್ಫಾಮ್ ಡೇಟಾಬೇಸ್-ಸಂಬಂಧಿತ ಎನ್ಸಿಆರ್ಎನ್ಎಗಳ ನೂರಾರು ಕುಟುಂಬಗಳ ಸಂಗ್ರಹಿತ ಪಟ್ಟಿ ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ನಾನ್-ಕೋಡಿಂಗ್ ಆರ್ಎನ್ಎ