Twisted intercalating nucleic acid
ಟ್ವಿಸ್ಟೆಡ್ ಇಂಟರ್ಕ್ಯಾಲೇಟಿಂಗ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಸಿಡ್ (ಟಿಐಎನ್ಎ) ಒಂದು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಸಿಡ್ ಅಣುವಾಗಿದ್ದು, ಟ್ರಿಪಲ್ಎಕ್ಸ್-ರೂಪಿಸುವ ಆಲಿಗೋನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳಿಗೆ (ಟಿಎಫ್ಒ) ಸೇರಿಸಿದಾಗ, ಡಬಲ್-ಸ್ಟ್ರಾಂಡೆಡ್ ಡಿಎನ್ಎ (ಡಿಎಸ್ಡಿಎನ್ಎ) ಮತ್ತು ಟಿಎಫ್ಒಗಳಿಂದ ಹೂಗ್ಸ್ಟೀನ್ ಟ್ರಿಪಲ್ಎಕ್ಸ್ ಡಿಎನ್ಎ ರಚನೆಯನ್ನು ಸ್ಥಿರಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ತ್ರಿವಳಿ ಬಂಧದ ಸುತ್ತಲೂ ತಿರುಗಿಸುವ ಅದರ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವು ತ್ರಿವಳಿ ಡಿಎನ್ಎ ಅನ್ನು ರೂಪಿಸುವ ಸಲುವಾಗಿ ಡಬಲ್ ಸ್ಟ್ರ್ಯಾಂಡೆಡ್ ಡಿಎನ್ಎ ಒಳಗೆ ಪರಸ್ಪರ ಸಂವಹನವನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ. ಕೆಲವು ಸಂರಚನೆಗಳು ವ್ಯಾಟ್ಸನ್-ಕ್ರಿಕ್ ಆಂಟಿಪ್ಯಾರಲಲ್ ಡ್ಯುಪ್ಲೆಕ್ಸ್ ಡಿಎನ್ಎಯನ್ನು ಸ್ಥಿರಗೊಳಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಟಿನಾ-ಡಿಎನ್ಎ ಪ್ರೈಮರ್ಗಳು ಪಿಸಿಆರ್ನಲ್ಲಿ ಬಂಧಿಸುವಿಕೆಯ ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಜಿ-ಕ್ವಾಡ್ರುಪ್ಲೆಕ್ಸ್ಗಳಲ್ಲಿ ಟಿನಾ ಅಳವಡಿಕೆಗಳ ಬಳಕೆಯು ಎಚ್ಐವಿ-1 ವಿರೋಧಿ ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಟಿನಾ ಸ್ಥಿರಗೊಳಿಸಿದ ಪಿಟಿ ಡಿಎನ್ಎ ಆಧಾರಿತ ಕ್ಲಿನಿಕಲ್ ಡಯಾಗ್ನೋಸ್ಟಿಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳ ಸುಧಾರಿತ ಸೂಕ್ಷ್ಮತೆ ಮತ್ತು ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆಯನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುತ್ತದೆ. ಟ್ರಿಪಲ್ಎಕ್ಸ್ ಡಿಎನ್ಎ ಟ್ರಿಪಲ್ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳು ಏಕ-ಎಳೆ ಟ್ರಿಪಲ್ಎಕ್ಸ್-ರೂಪಿಸುವ ಆಲಿಗೋನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ (ಟಿಎಫ್ಒ) ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪ್ರಮುಖ ತೋಡು ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳ ಮೂಲಕ ಡಿಎಸ್ಡಿಎನ್ನ ಪ್ಯೂರಿನ್-ಹೊಂದಿರುವ ಎಳೆಗೆ ಬಂಧಿಸಿದಾಗ ರೂಪುಗೊಳ್ಳುತ್ತವೆ. ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ, ಸಮಾನಾಂತರ (ಪಿರಿಮಿಡಿನ್) ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಮೋಟಿಫ್ನಲ್ಲಿ ದೈಹಿಕ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ಪಿಹೆಚ್-ಸೆನ್ಸಿಟಿವ್ ಸಿ +-ಜಿ-ಸಿ ಹೂಗ್ಸ್ಟೀನ್ ಬೇಸ್ ಟ್ರಿಪ್ಲೆಕ್ಸ್ಗಳ ರಚನೆಯ ಅಗತ್ಯತೆಯಿಂದಾಗಿ ಟಿಎಫ್ಒನ ಮೂರನೇ ಹಂತದ ಆಕರ್ಷಣೆಯು ಕಡಿಮೆಯಾಗಿದೆ. ಟಿಎಫ್ಓಗಳ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳನ್ನು ಅವುಗಳ ಗುರಿಗಳಿಗೆ ಅವುಗಳ ಬಂಧಿಸುವ ಸಂಬಂಧಗಳನ್ನು ಸುಧಾರಿಸಲು ಮತ್ತು ಹೊಸ ಟ್ರಿಪ್ಲೆಕ್ಸ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಬೇಸ್ಗಳ ವಿನ್ಯಾಸದೊಂದಿಗೆ ಡಿಎಸ್ಡಿಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ನಿರ್ಬಂಧಗಳನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡಲು ಪ್ರಯತ್ನಿಸಲಾಗಿದೆ. ಇತ್ತೀಚೆಗೆ, ಹೋಮೋಪೈರಿಮಿಡಿನ್ ಆಲಿಗೋಡಿಯೊಕ್ಸಿನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳ ಮಧ್ಯದಲ್ಲಿ (ಆರ್)-1-ಓ-[4-(1-ಪೈರಿನೈಲ್ಥಿನೈಲ್) ಫಿನೈಲ್ಮೆಥೈಲ್] ಗ್ಲಿಸರಾಲ್ (ಟಿನಾ) ನ ಉಬ್ಬು ಒಳಸೇರಿಸುವಿಕೆಯು ಹೂಗ್ಸ್ಟೀನ್-ರೀತಿಯ ಟ್ರಿಪ್ಲೆಕ್ಸ್ಗಳು ಮತ್ತು ಡ್ಯುಪ್ಲೆಕ್ಸ್ಗಳಲ್ಲಿ ಉಷ್ಣ ಸ್ಥಿರತೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗಬಹುದು ಎಂದು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ, ಆದರೆ ಅದೇ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ಅಂಶದ ವ್ಯಾಟ್ಸನ್-ಕ್ರಿಕ್-ರೀತಿಯ ಡ್ಯುಪ್ಲೆಕ್ಸ್ಗಳು ಅಸ್ಥಿರಗೊಂಡಿವೆ. ಟಿಎಂ ಅನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸಲು, ಬೇಸ್ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಗಳನ್ನು ಟಿಎಫ್ಒನ ಮಧ್ಯಭಾಗದಲ್ಲಿ ಇಡಬೇಕು ಮತ್ತು ಸಾಧ್ಯವಾದಾಗ, ಎ, ಸಿ ಅಥವಾ ಟಿ ಯಿಂದ ಜಿ ಬೇಸ್ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಗಳನ್ನು ತಪ್ಪಿಸಬೇಕು. ಬೇಸ್ ಅಸಮತೋಲನವನ್ನು ಬೇಸ್ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯ ಎರಡೂ ಬದಿಗಳಲ್ಲಿ ಟಿನಾವನ್ನು ಪರಸ್ಪರ ಜೋಡಿಸುವ ಮೂಲಕ ತಟಸ್ಥಗೊಳಿಸಬಹುದು ಮತ್ತು ಟಿನಾ ಇಂಟರ್ಕ್ಯಾಲೇಟಿಂಗ್ ಡೈರೆಕ್ಟ್ 3 'ಅಥವಾ 5' ನಿಂದ ಮರೆಮಾಚಬಹುದು. ಅನ್ವಯಿಕೆಗಳು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆ ಡಿ. ಎನ್. ಎ. ಸಂಕರೀಕರಣವನ್ನು ಬಳಸುವ ರೋಗನಿರ್ಣಯದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳು ಆಂಟಿಪಾರಲೆಲ್ ಡ್ಯುಪ್ಲೆಕ್ಸ್ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳ ವಿಯೋಜನೆಯಿಂದ ಸೀಮಿತವಾಗಿವೆ. ಆರ್ಥೋ-ಟಿಐಎನ್ಎಯಂತಹ ಇಂಟರ್ಕ್ಯಾಲೇಟರ್ಗಳಂತಹ ಡಿಎನ್ಎ ಸ್ಥಿರಗೊಳಿಸುವ ಅಣುಗಳನ್ನು ಬಳಸುವ ಮೂಲಕ ಇದನ್ನು ಸುಧಾರಿಸಬಹುದು, ಇದು ಡ್ಯುಪ್ಲೆಕ್ಸ್ ರಚನೆಯನ್ನು ಸ್ಥಿರಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. 3 'ಮತ್ತು 5' ತುದಿಗಳಲ್ಲಿ ಇಂಟರ್ಕ್ಯಾಲೇಟಿಂಗ್ ಪ್ರೈಮರ್ಗಳನ್ನು ಬಳಸಿದಾಗ ಸ್ಥಿರತೆಯಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಹೆಚ್ಚಳ ಸಂಭವಿಸಿದೆ ಎಂದು ಅಧ್ಯಯನಗಳು ತೋರಿಸುತ್ತವೆ. ಒಲಿಗೋನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ನಲ್ಲಿ ಟಿನಾ ಅಣುವಿನ ನಿಯೋಜನೆಯು ಪ್ರೋಬ್ ಸಂಕರೀಕರಣದ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾತ್ಮಕ ಸಂವೇದನೆಯನ್ನು ಸುಧಾರಿಸುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಪ್ಯಾರಾ-ಟಿಐಎನ್ಎ ಅಣುಗಳು ಎಲ್ಲಾ ಸ್ಥಾನಗಳಲ್ಲಿ ಟಿಎಂ ಅನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುತ್ತವೆ, ವಿಶೇಷವಾಗಿ ಒಲಿಗೋನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ನ ಮಧ್ಯದಲ್ಲಿದ್ದಾಗ, ಆರ್ಥೋ-ಟಿಐಎನ್ಎ ಅಣುಗಳಲ್ಲಿ, ಕೇಂದ್ರದಲ್ಲಿ ತಟಸ್ಥಗೊಳಿಸುವಿಕೆಯೊಂದಿಗೆ ಎಲ್ಲಿಯಾದರೂ ಸುಧಾರಣೆ ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. ಆಂತರಿಕ ಟಿನಾ ಅಣುವಿನೊಂದಿಗೆ ಟರ್ಮಿನಲ್ ಪ್ಯಾರಾ-ಅಥವಾ ಆರ್ಥೋ-ಅಣುವಿನ ಸಂಯೋಜನೆಯು ಟಿಎಂನ ಹೆಚ್ಚಿನ ಹೆಚ್ಚಳವನ್ನು ತೋರಿಸಿದೆ. ಟಿಎಂನಲ್ಲಿ ಗರಿಷ್ಠ ಹೆಚ್ಚಳಕ್ಕಾಗಿ ಟಿನಾ ಅಣುಗಳನ್ನು ಟರ್ಮಿನಲ್ ಆಗಿ ಇರಿಸಬೇಕು. ಟಿಎಂನಲ್ಲಿನ ಹೆಚ್ಚಳವು ಪಿಸಿಆರ್ನಂತಹ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳ ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ. ಎಚ್ಐವಿ-1 ವಿರೋಧಿ ಚಟುವಟಿಕೆ ಇತ್ತೀಚಿನ ಅಧ್ಯಯನಗಳು ಜಿ-ಕ್ವಾಡ್ರುಪ್ಲೆಕ್ಸ್ಗಳಲ್ಲಿ ಟಿನಾ ಅಳವಡಿಕೆಗಳ ಬಳಕೆಯು ಎಚ್ಐವಿ-1 ವಿರೋಧಿ ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಿದೆ. ಅಂತಹ ಅಧ್ಯಯನಗಳಲ್ಲಿ, ಜೀವಕೋಶದ ರೇಖೆಗಳ ಮೇಲೆ ಎಚ್ಐವಿ-1 ವಿರೋಧಿ ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುವ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ರೂಪಿಸುವ ಎರಡು ಜಿ ಕ್ವಾಡ್ರುಪ್ಲೆಕ್ಸ್ಗಳನ್ನು ಲಾಕ್ಡ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಸಿಡ್ (ಎಲ್ಎನ್ಎ) ಅಥವಾ ಟಿನಾ ಅಳವಡಿಕೆಗಳನ್ನು ಬಳಸಿ ಮಾರ್ಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ. ಇದರ ಸಂಯೋಜನೆಯು ಎಚ್ಐವಿ-1 ವಿರೋಧಿ ಚಟುವಟಿಕೆಯ 8 ಪಟ್ಟು ಸುಧಾರಣೆಯನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು 5 'ಫಾಸ್ಫೇಟ್ನ ಪರಿಚಯವು ಜಿ-ಕ್ವಾಡ್ರುಪ್ಲೆಕ್ಸ್ನ ಡೈಮೆರೈಸೇಶನ್ ಅನ್ನು ತಡೆಯುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಆಲಿಗೋನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ಗಳನ್ನು ರೂಪಿಸುವ ಅನೇಕ ಆಂಟಿವೈರಲ್ ಕ್ವಾಡ್ರುಪ್ಲೆಕ್ಸ್ಗಳು ಹೆಚ್ಚು ಉಷ್ಣವಾಗಿ ಸ್ಥಿರವಾದ ಜಿ-ಕ್ವಾಡ್ರುಪ್ಲೆಕ್ಸ್ಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಹೈ-ಆರ್ಡರ್ ಜಿ ಕ್ವಾಡ್ರುಪ್ಲೆಕ್ಸ್ ರಚನೆಗಳನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ, ಇವು ಆಂಟಿವೈರಲ್ ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು ಗಮನಿಸಬಹುದು. ಚಿಕಿತ್ಸಕ ಅನ್ವಯಿಕೆಗಳಾದ ಟಿ. ಎಫ್. ಓ. ಗಳು ತಮ್ಮ ಹೆಚ್ಚಿನ ಅನುಕ್ರಮ ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆಯಿಂದಾಗಿ ಜೀನ್-ವಿರೋಧಿ ಚಿಕಿತ್ಸೆಯಲ್ಲಿ ಭರವಸೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ವಿವೊದಲ್ಲಿನ ಪೊಟ್ಯಾಸಿಯಮ್ ಮಟ್ಟಗಳು ಟಿಎಫ್ಒಗಳನ್ನು ಜಿ-ಕ್ವಾರ್ಟೆಟ್ ರಚನೆಗಳನ್ನು ಏಕಾಂಗಿಯಾಗಿ ರೂಪಿಸಲು ಉತ್ತೇಜಿಸುತ್ತವೆ, ಟಿಎಫ್ಒಎಸ್ ಟ್ರಿಪ್ಲೆಕ್ಸ್ ರಚನೆಯಲ್ಲಿ ಸಂವಹನ ಮಾಡುವುದನ್ನು ತಡೆಯುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಟಿಎಫ್ಒ ಕೋಶ ಚಿಕಿತ್ಸೆಗಳ ಪರಿಣಾಮಕಾರಿತ್ವವನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಪರಮಶಿವಮ್ ಮತ್ತು ಇತರರು ತೋರಿಸಿದಂತೆ, ಹೆಚ್ಚಿನ ಗ್ವಾನೈನ್ ಸಾಂದ್ರತೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಟಿಎಫ್ಓಗಳಲ್ಲಿ (ಆರ್)-1-ಒ-[4-(1-ಪೈರಿನೈಲ್ಥಿನೈಲ್) ಫಿನೈಲ್ಮೆಥೈಲ್] ಗ್ಲಿಸರಾಲ್ (ಟಿನಾ) ಅನ್ನು ಸೇರಿಸುವುದರಿಂದ ಪೊಟ್ಯಾಸಿಯಮ್ ಮೂಲಕ ಸ್ವಯಂ-ಸಂಯೋಜನೆಯ ಉಪಸ್ಥಿತಿಯನ್ನು ಬಹಳವಾಗಿ ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ನಂತರ, ಟಿನಾ-ಟಿಎಫ್ಒಗಳನ್ನು ಭವಿಷ್ಯದಲ್ಲಿ ವಿವೊದಲ್ಲಿ ಜೀನೋಮ್ ಅನ್ನು ಗುರಿಯಾಗಿಸಲು ಮತ್ತು ಚಿಕಿತ್ಸಕ ಅಂತ್ಯದ ಕಡೆಗೆ ಜೀನೋಮ್ ಕುಶಲತೆಯನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸಲು ಬಳಸಬಹುದು. ಪ್ಯೂರಿನ್ ಟಿನಾ-ಟಿಎಫ್ಒಗಳ ಬಳಕೆಯು ಕೆಆರ್ಎಎಸ್ ಪ್ರೋಟೋ-ಆಂಕೋಜೀನ್ಗೆ ಪ್ರತಿಜನಕ ಅಣುಗಳಾಗಿ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಭರವಸೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯಿಕ್ ಆಮ್ಲಗಳು