Acriflavine resistance protein family
ಎಸ್ಚೆರಿಚಿಯಾ ಕೋಲಿ ಆಕ್ರಿಫ್ಲಾವಿನ್ ಪ್ರತಿರೋಧವು (ಎಸಿಆರ್ಎ ಮತ್ತು ಎಸಿಆರ್ಬಿ ಜೀನ್ಗಳು) ಬಹು-ಔಷಧ ಎಫ್ಲಕ್ಸ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯನ್ನು ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡುತ್ತದೆ, ಇದು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾವನ್ನು ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಇನ್ಹಿಬಿಟರ್ಗಳ ವಿರುದ್ಧ ರಕ್ಷಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ನಂಬಲಾಗಿದೆ. ಇ. ಕೋಲಿ ಎಕ್ರಿಬಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪ್ರೋಟಾನ್-ಪ್ರೇರಕ ಶಕ್ತಿಯಿಂದ ಶಕ್ತಿಯುತವಾದ ಸಾಗಣೆದಾರನಾಗಿದ್ದು, ಪ್ರಸ್ತುತ ಬಳಸಲಾಗುವ ಹೆಚ್ಚಿನ ಪ್ರತಿಜೀವಕಗಳು, ಸೋಂಕುನಿವಾರಕಗಳು, ವರ್ಣಗಳು ಮತ್ತು ಮಾರ್ಜಕಗಳಿಂದ ಹಿಡಿದು ಸರಳ ದ್ರಾವಕಗಳವರೆಗೆ ತಿಳಿದಿರುವ ಎಲ್ಲಾ ಮಲ್ಟಿಡ್ರಗ್ ಪಂಪ್ಗಳಲ್ಲಿ ವಿಶಾಲವಾದ ತಲಾಧಾರದ ನಿರ್ದಿಷ್ಟತೆಯನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಲಿಗಂಡ್-ಮುಕ್ತ ಎ. ಸಿ. ಆರ್. ಬಿ. ಯ ರಚನೆಯು ಇದು ಪ್ರತಿ ಉಪಘಟಕಕ್ಕೆ 110ಕೆ. ಡಿ. ಎ. ಯ ಹೋಮೋಟ್ರೈಮರ್ ಎಂದು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಪ್ರತಿ ಉಪಘಟಕವು 12 ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಹೆಲಿಕ್ಸ್ 1 ಮತ್ತು 2 ಮತ್ತು ಹೆಲಿಕ್ಸ್ 7 ಮತ್ತು 8ರ ನಡುವೆ ಎರಡು ದೊಡ್ಡ ಪೆರಿಪ್ಲಾಸ್ಮಿಕ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು (ಪ್ರತಿಯೊಂದೂ 300 ಅವಶೇಷಗಳನ್ನು ಮೀರುತ್ತದೆ) ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಅತಿಯಾಗಿ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಿದ AcrB ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಕ್ಷ-ಕಿರಣ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಮೂರು ಪೆರಿಪ್ಲಾಸ್ಮಿಕ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳು ಮಧ್ಯದಲ್ಲಿ, ಕೊಳವೆಯಂತಹ ರಚನೆ ಮತ್ತು ಸಂಪರ್ಕಿತ ಕಿರಿದಾದ (ಅಥವಾ ಮುಚ್ಚಿದ) ರಂಧ್ರವನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಿದೆ. ಸಬ್ಯೂನಿಟ್ ಇಂಟರ್ಫೇಸ್ಗಳಲ್ಲಿರುವ ಮೂರು ವೆಸ್ಟಿಬ್ಯೂಲ್ಗಳ ಮೂಲಕ ರಂಧ್ರವನ್ನು ಪೆರಿಪ್ಲಾಸಂಗೆ ತೆರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ. ಪೆರಿಪ್ಲಾಜಮ್ ಮತ್ತು ಸೈಟೋಪ್ಲಾಸ್ಮಿಕ್ ಮೆಂಬರೇನ್ನ ಹೊರಗಿನ ಕರಪತ್ರದಿಂದ ಔಷಧಿಗಳ ನೇರ ಪ್ರವೇಶವನ್ನು ಅನುಮತಿಸಲು ಈ ವೆಸ್ಟಿಬ್ಯೂಲ್ಗಳನ್ನು ಪ್ರಸ್ತಾಪಿಸಲಾಗಿದೆ. ಎಸಿಆರ್ಬಿ ಪ್ರೊಟೊಮರ್ಗಳ ಮೂರು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳು ದೊಡ್ಡ, 30ಎ-ಅಗಲದ ಕೇಂದ್ರ ಕುಹರವನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ, ಇದು ಸೈಟೋಪ್ಲಾಸ್ಮಿಕ್ ಮೆಂಬರೇನ್ ಅನ್ನು ವ್ಯಾಪಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಇ. ಕೋಲಿಯಿಂದ ಟ್ರೈಮೆರಿಕ್ ಎಸಿಆರ್ಬಿ ಪಂಪ್ನ ಸೈಟೋಪ್ಲಾಸಂ ಎಕ್ಸ್-ರೇ ಸ್ಫಟಿಕಶಾಸ್ತ್ರೀಯ ರಚನೆಗಳಿಗೆ ವಿಸ್ತರಿಸುತ್ತದೆ, ನಾಲ್ಕು ರಚನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ವೈವಿಧ್ಯಮಯ ಲಿಗಂಡ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಲಿಗ್ಯಾಂಡ್ನ ಮೂರು ಅಣುಗಳು 5000 ಕ್ಯೂಬಿಕ್ ಆಂಗ್ಸ್ಟ್ರಾಮ್ಗಳ ಅತ್ಯಂತ ದೊಡ್ಡ ಕೇಂದ್ರ ಕುಹರಕ್ಕೆ ಏಕಕಾಲದಲ್ಲಿ ಬಂಧಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಿದೆ, ಮುಖ್ಯವಾಗಿ ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್, ಆರೊಮ್ಯಾಟಿಕ್ ಸ್ಟ್ಯಾಕಿಂಗ್ ಮತ್ತು ವ್ಯಾನ್ ಡೆರ್ ವಾಲ್ಸ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳಿಂದ. ಪ್ರತಿ ಲಿಗಂಡ್ ಬಂಧಿಸಲು ಸ್ವಲ್ಪ ವಿಭಿನ್ನವಾದ ಎಸಿಆರ್ಬಿ ಅವಶೇಷಗಳ ಉಪವಿಭಾಗವನ್ನು ಬಳಸುತ್ತದೆ. ಬಂಧಿಸಲಾದ ಲಿಗಂಡ್ ಅಣುಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಪರಸ್ಪರ ಸಂವಹನ ನಡೆಸಿ, ಬಂಧವನ್ನು ಸ್ಥಿರಗೊಳಿಸುತ್ತವೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕುಟುಂಬಗಳು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಸಾಗಣೆದಾರರು