TMEM131
ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ 131 (ಟಿಎಂಇಎಂ131) ಎಂಬುದು ಮಾನವರಲ್ಲಿ ಟಿಎಂಇಎಂ131 ಜೀನ್ನಿಂದ ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡಲಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಗಿದೆ. TMEM131 ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅಜ್ಞಾತ ಕಾರ್ಯ 3651 (DUF3651) ನ ಮೂರು ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಎರಡು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಈ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಟಿ ಕೋಶದ ಕಾರ್ಯ ಮತ್ತು ಬೆಳವಣಿಗೆಯಲ್ಲಿ ಒಂದು ಪಾತ್ರವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸಲಾಗಿದೆ. ಟಿ. ಎಂ. ಇ. ಎಂ. 131 ಸಹ ನೀವೆರ್ಜೆಲ್ಟ್ ಸಿಂಡ್ರೋಮ್ ಅನ್ನು ಅಳಿಸಿದಾಗ ಅದಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಲೋಕಸ್ನಲ್ಲಿ (<ಐ. ಡಿ. 1>) ವಾಸಿಸುತ್ತದೆ. ಡೌನ್ ಸಿಂಡ್ರೋಮ್ ರೋಗಿಗಳಲ್ಲಿ ಟಿ ಸೆಲ್ ಫಂಕ್ಷನ್ನಲ್ಲಿ ಟಿಎಂಇಎಂ131 ಪಾತ್ರವು ಹೈಪರ್ಮೆಥೈಲೇಷನ್ ಅನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಈ ಅಧ್ಯಯನದ ಲೇಖಕರು, ಟಿ ಜೀವಕೋಶದ ಬೆಳವಣಿಗೆ ಮತ್ತು ಕಾರ್ಯದಲ್ಲಿ ಟಿಎಂಇಎಂ131 ಗಳು ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ಭಾವಿಸಲಾಗಿದೆ, ಈ ಹೈಪರ್ಮೆಥೈಲೇಷನ್ ಡೌನ್ ಸಿಂಡ್ರೋಮ್ ರೋಗಿಗಳಲ್ಲಿ ನಿಗ್ರಹಿಸಿದ ಪ್ರತಿರಕ್ಷಣಾ ಕಾರ್ಯದಲ್ಲಿ ಒಂದು ಪಾತ್ರವನ್ನು ವಹಿಸಬಹುದು ಎಂದು ಪ್ರಸ್ತಾಪಿಸಿದ್ದಾರೆ. ಟಿ ಕೋಶಗಳ ಅಭಿವೃದ್ಧಿ ಮತ್ತು ವಿಭಿನ್ನತೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಟಿಎಂಇಎಂ131 ಅನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಇತರ ಅಂಗಾಂಶ ಪ್ರಕಾರಗಳಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ ಟಿ ಕೋಶಗಳಲ್ಲಿ ತುಲನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಟ್ಟದ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ವಂಶವಾಹಿ ಅವಲೋಕನ TMEM131 ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ 2ರ ಋಣಾತ್ಮಕ ಡಿಎನ್ಎ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ನ ಮೇಲೆ 98,372,799-98,612,354 ನಿಂದ ಇದೆ (ಸೆನ್ಸ್ ನೋಡಿ). ಜೀನ್ ಉತ್ಪನ್ನವು ಮಾನವ ಜೀನ್ನಲ್ಲಿ 41 ನಿರೀಕ್ಷಿತ ಎಕ್ಸಾನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ 6,657 ಬೇಸ್ ಜೋಡಿ ಎಂಆರ್ಎನ್ಎ ಆಗಿದೆ. ಎನ್ಸೆಂಬಲ್ ಹತ್ತು ಪರ್ಯಾಯ ಸ್ಪ್ಲೈಸ್ ರೂಪಗಳನ್ನು ಊಹಿಸುತ್ತದೆ, ಅವುಗಳಲ್ಲಿ ನಾಲ್ಕು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಕೋಡಿಂಗ್ ಆಗಿವೆ. ಜೆನೋಮಾಟಿಕ್ಸ್ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ ಪುಟದ ಮೂಲಕ ಎಲ್ ಡೊರಾಡೊವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಪ್ರವರ್ತಕರ ಮುನ್ಸೂಚನೆ ಮತ್ತು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ನಡೆಸಲಾಯಿತು. ಊಹಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ಪ್ರವರ್ತಕ ಪ್ರದೇಶವು ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ 2 ರ ಮೈನಸ್ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ನಲ್ಲಿ 1002 ಬೇಸ್ ಜೋಡಿಗಳನ್ನು 98,611,892 ನಿಂದ 98,612,893 ವರೆಗೆ ವ್ಯಾಪಿಸಿದೆ. ಈ ಕಾರ್ಯಕ್ರಮವು ಎರಡು ಸಂಭಾವ್ಯ ಪ್ರತಿಲೇಖನದ ಆರಂಭದ ಸ್ಥಳಗಳನ್ನು ಮುನ್ಸೂಚಿಸಿತು. ಮೊದಲನೆಯದು 98,612,501 ನಿಂದ 98,612,716 ವರೆಗೆ 216 ಬೇಸ್ ಜೋಡಿಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಎರಡನೆಯದು 98,612,262 ನಿಂದ 98,612,443 ವರೆಗೆ 182 ಬೇಸ್ ಜೋಡಿಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಜೀನ್ ನೈಬರ್ಹುಡ್ TMEM131 ಧನಾತ್ಮಕ ಡಿಎನ್ಎ ಸ್ಟ್ರಾಂಡ್ನಲ್ಲಿರುವ ZAP70 ಜೀನ್ಗೆ (98,330,331-98,356,323) ನೇರವಾಗಿ ಪಕ್ಕದಲ್ಲಿದೆ, ಜೊತೆಗೆ 2q11.2 ಲೋಕಸ್ನಲ್ಲಿ ಹಲವಾರು ಸೂಡೋಜೆನ್ಗಳಿವೆ. ಜೀನ್ (ವಿ. ಡಬ್ಲ್ಯು. ಎ. 3ಬಿ) ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ವಾನ್ ವಿಲ್ಲೆಬ್ರಾಂಡ್ ಅಂಶವು ಟಿ. ಎಂ. ಇ. ಎಂ. 131ರಿಂದ ಮೇಲ್ಮುಖವಾಗಿ ಧನಾತ್ಮಕ ಎಳೆ (<ಐ. ಡಿ. 1>-<ಐ. ಡಿ. 2>) ನಲ್ಲಿದೆ. ದುಗ್ಧರಸ ಗ್ರಂಥಿಗಳು, ಗರ್ಭಾಶಯ ಮತ್ತು ಟಿ ಕೋಶಗಳಲ್ಲಿ ಸ್ವಲ್ಪ ಹೆಚ್ಚಿದ ಮಟ್ಟಗಳೊಂದಿಗೆ, ಜೀನ್ ಎಕ್ಸ್ಪ್ರೆಶನ್ ಟಿಎಂಇಎಂ131 ಅನ್ನು ದೇಹದ ಹೆಚ್ಚಿನ ಭಾಗಗಳಲ್ಲಿ ಕಡಿಮೆ ಮತ್ತು ಮಧ್ಯಮ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಹಣ್ಣಿನ ನೊಣ ಭ್ರೂಣಗಳನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸುವಲ್ಲಿ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯ ದತ್ತಾಂಶವು ಬಿ. ಡಿ. ಜಿ. ಪಿ. ಯಿಂದ ಸಿತು ಮುಖಪುಟದಲ್ಲಿ ಲಭ್ಯವಿದೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು/ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು TMEM131 ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಪ್ರಾಥಮಿಕ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಚೆನ್ನಾಗಿ ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಲಾಗಿಲ್ಲ. ಮಾನವನ ರೂಪವು 1883 ರ ಅಮೈನೊ ಆಸಿಡ್ ಅವಶೇಷಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದು, 8.74 ರ ಐಸೊಎಲೆಕ್ಟ್ರಿಕ್ ಪಾಯಿಂಟ್ ಮತ್ತು 205,100 ಡಾಲ್ಟನ್ಗಳ ಆಣ್ವಿಕ ದ್ರವ್ಯರಾಶಿಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಇದು ಅವಶೇಷಗಳಾದ 1,091-1,111 ಮತ್ತು 1,118-1,138ರಲ್ಲಿ ಎರಡು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವುದನ್ನು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಮೂರು DUF3651 ಪ್ರದೇಶಗಳು ಪಕ್ಕದ ಎರಡು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಡೊಮೇನ್ಗಳ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಬದಿಯಲ್ಲಿವೆ. ಇವುಗಳು ಅವಶೇಷಗಳಾದ 173-245,502-582, ಮತ್ತು 639-708 ನಲ್ಲಿವೆ. ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಅಂತರಕೋಶದ ಸ್ಥಳವನ್ನು ಪ್ರಾಯೋಗಿಕವಾಗಿ ನಿರ್ಧರಿಸಲಾಗಿಲ್ಲ, ಆದರೆ ಇದು ಪ್ಲಾಸ್ಮಾ ಮೆಂಬರೇನ್ ಅಥವಾ ಎಂಡೋಪ್ಲಾಸ್ಮಿಕ್ ರೆಟಿಕ್ಯುಲಮ್ನಲ್ಲಿ ವಾಸಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಭಾವಿಸಲಾಗಿದೆ, ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪ್ರದೇಶಗಳ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಮತ್ತು ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಬದಿಗಳೆರಡರಲ್ಲೂ ಪ್ರತಿ ಡೊಮೇನ್ ಸೈಟೋಸೋಲಿಕ್ ಆಗಿರುತ್ತದೆ. ಇದು ಹಲವಾರು ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ತಾಣಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, ಇವುಗಳನ್ನು ಪ್ರಾಯೋಗಿಕವಾಗಿ ಮತ್ತು ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿ ಸಾಧನಗಳೊಂದಿಗೆ ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ನೆಟ್ಫೋಸ್ ಉಪಕರಣವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ಸಂಪೂರ್ಣ ಉದ್ದಕ್ಕೂ 145 ಸಂಭಾವ್ಯ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ತಾಣಗಳನ್ನು ಊಹಿಸಿತು. ಕಂಪ್ಯೂಟೇಶನಲ್ ಸಾಧನಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಟಿಎಂಇಎಂ131ಗಾಗಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ನಡೆಸಲಾಗಿದೆ. MINT ದತ್ತಸಂಚಯದ ಮೂಲಕ ಯಾವುದೇ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲಾಗಿಲ್ಲ. ಸ್ಟ್ರಿಂಗ್ ಹುಡುಕಾಟವು ಪಠ್ಯ ಗಣಿಗಾರಿಕೆಯ ಮೂಲಕ ಹತ್ತು ಸಂಭಾವ್ಯ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿತು, ಆದಾಗ್ಯೂ ಇವುಗಳಲ್ಲಿ ಯಾವುದನ್ನೂ ನಿಜವಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್-ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳೆಂದು ಪರಿಗಣಿಸಬಾರದು. ಫಲಿತಾಂಶಗಳ ಹತ್ತಿರದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಈ ಮುನ್ಸೂಚನೆಗಳು ನಿಜವಾಗಲು ಬಹಳ ಕಡಿಮೆ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಇಂಟ್ಯಾಕ್ಟ್ ಉಪಕರಣವನ್ನು ಸಹ ಬಳಸಲಾಯಿತು, ಮತ್ತು ಇದು ಸೂಪರಾಕ್ಸೈಡ್ ಡಿಸ್ಮುಟೇಸ್ 2 (ಎಸ್ಒಡಿ 2) ನೊಂದಿಗೆ ಸಂಭಾವ್ಯ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆ ಕಂಡುಬಂದಿದೆ ಎಂದು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿತು, ಇದನ್ನು ಯೀಸ್ಟ್ ಎರಡು-ಹೈಬ್ರಿಡ್ ಸ್ಕ್ರೀನಿಂಗ್ ಅಧ್ಯಯನದಲ್ಲಿ ಗುರುತಿಸಲಾಗಿದೆ. ಕನ್ಸರ್ವೇಷನ್ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಸ್ TMEM131 ಅನ್ನು ಅದರ ಎಲ್ಲಾ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳಲ್ಲಿ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ. ಇಡೀ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ಪ್ರೈಮೇಟ್ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚು ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ, ಆದರೆ ಹೆಚ್ಚು ದೂರದ ಹೋಮೋಲಾಗ್ಗಳಲ್ಲಿ ಡಿಯುಎಫ್3651 ಮತ್ತು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಮೆಂಬ್ರೇನ್ ಪ್ರದೇಶಗಳಲ್ಲಿ ಸಂರಕ್ಷಣೆ ಹೆಚ್ಚಾಗಿದೆ. ಸ್ಯಾನ್ ಡಿಯಾಗೋ ಸೂಪರ್ ಕಂಪ್ಯೂಟರ್ ಬಯಾಲಜಿ ವರ್ಕ್ಬೆಂಚ್ ಮೂಲಕ ಬ್ಲಾಸ್ಟ್ ಮತ್ತು ALIGN ಉಪಕರಣವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಚೊನೊಫ್ಲಾಜೆಲೆಟ್ ಮೊನೊಸಿಗಾ ಬ್ರೆವಿಕೋಲಿಸ್ನಂತೆ ಮನುಷ್ಯರಿಗೆ ದೂರದ ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿರುವ ಪ್ರಭೇದಗಳಲ್ಲಿ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ಗಳು ಕಂಡುಬಂದಿವೆ. ಈ ಕೆಳಗಿನ ಕೋಷ್ಟಕವು ಟಿ. ಎಂ. ಇ. ಎಂ. 131ರ ಹೋಮೋಲಾಗ್ಗಳ ಬಗ್ಗೆ ಮಾಹಿತಿಯನ್ನು ನೀಡುತ್ತದೆ. ಪ್ಯಾರಾಲಾಗ್ TMEM131 ಒಂದೇ ಪ್ಯಾರಾಲಾಗ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ, TMEM131L ಅಥವಾ KIAA0922. ಈ ವಂಶವಾಹಿಯು TMEM131 ಅನ್ನು ಹೋಲುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಇದು ಮೂರು DUF3651 ಪ್ರದೇಶಗಳಲ್ಲಿ ಎರಡನೇ ಎರಡನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿಲ್ಲ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು