DEPDC5
ಡಿಇಪಿಡಿಸಿ5 (ಅಥವಾ ಡಿಇಪಿ ಡೊಮೇನ್-ಹೊಂದಿರುವ 5) ಎಂಬುದು ಸರಿಯಾಗಿ ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳದ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಮಾನವ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಗಿದೆ ಆದರೆ ಹಲವಾರು ಅಧ್ಯಯನಗಳಲ್ಲಿ ಇದು ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ನೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧ ಹೊಂದಿದೆ. ಇದು ಕ್ರೋಮೋಸೋಮ್ 22ರಲ್ಲಿರುವ ಅದೇ ಹೆಸರಿನ ಜೀನ್ನಿಂದ ಸಂಕೇತಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ. ಕಾರ್ಯ ಡಿಇಪಿಡಿಸಿ5ನ ಕಾರ್ಯವು ಇನ್ನೂ ತಿಳಿದಿಲ್ಲ, ಆದರೆ ಡಿಇಪಿಡಿಸಿ5 ಮತ್ತು ಡಿಸ್ಹೆವೆಲ್ಡ್-1 (ಡಿವಿಎಲ್1) ನ ಡಿಇಪಿ ಡೊಮೇನ್ಗಳ ನಡುವಿನ ಹೋಮೋಲಜಿಯ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಇಂಟ್ರಾಸೆಲ್ಲ್ಯುಲರ್ ಸಿಗ್ನಲ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಡಕ್ಷನ್ನಲ್ಲಿ ಇದನ್ನು ಸೂಚಿಸಲಾಗಿದೆ. ಈ ವಂಶವಾಹಿಯಲ್ಲಿನ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಫೋಕಲ್ ಅಪಸ್ಮಾರದ ಪ್ರಕರಣಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿವೆ (ಡೋಯಿಃ 10.1038/ng.2601). ಹೋಮೋ ಸೇಪಿಯನ್ಸ್ನಲ್ಲಿ, ಡಿ. ಇ. ಪಿ. ಡಿ. ಸಿ. 5 ವಂಶವಾಹಿಯನ್ನು ಪಿ. ಆರ್. ಆರ್. ಎಲ್. 14 ಮತ್ತು ವೈ. ಡಬ್ಲ್ಯೂ. ಎಚ್. ಎ. ಎಚ್ ವಂಶವಾಹಿಗಳ ನಡುವಿನ ವರ್ಣತಂತು 22, <ಐ. ಡಿ. 1> ನ ಉದ್ದನೆಯ ತೋಳಿಗೆ ಸ್ಥಳೀಕರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಈ ವಂಶವಾಹಿಯ ವೈದ್ಯಕೀಯ ಪ್ರಸ್ತುತತೆಯು ಇಂಟ್ರಾನಿಕ್ ಎಸ್. ಎನ್. ಪಿ. (ಆರ್. ಎಸ್. 1012068) ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ, ಇದು 2 ಪಟ್ಟು ಹೆಪಟೊಸೆಲ್ಯುಲರ್ ಕಾರ್ಸಿನೋಮ-ಅಪಾಯದ ಹೆಚ್ಚಳದೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ. ಡಿಇಪಿ ಡೊಮೇನ್ ತನ್ನ ಹೆಸರನ್ನು ಡಿಸ್ಹೀವೆಲ್ಡ್, ಎಗಲ್-10 ಮತ್ತು ಪ್ಲೆಕ್ಸ್ಟ್ರಿನ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳಿಂದ ಪಡೆದಿದೆ, ಪ್ರತಿಯೊಂದೂ ಈ ಡೊಮೇನ್ನ ರೂಪಾಂತರವನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಇದು 82 ಅವಶೇಷಗಳನ್ನು ವ್ಯಾಪಿಸಿದೆ ಮತ್ತು ಸಿ-ಟರ್ಮಿನಸ್ನಿಂದ 343 ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಸ್ವಿಸ್-ಮಾದರಿಯು ಡೊಮೇನ್ನೊಳಗೆ ಎರಡು ಬೀಟಾ ಶೀಟ್ಗಳು ಮತ್ತು ಮೂರು ಆಲ್ಫಾ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳನ್ನು ಊಹಿಸುತ್ತದೆ. ಅದರ ನಿಖರವಾದ ಕಾರ್ಯವು ತಿಳಿದಿಲ್ಲವಾದರೂ, ಡಿ. ಇ. ಪಿ. ಡಿ. ಸಿ. 5 ಡಿ. ಇ. ಪಿ. ಡೊಮೇನ್ ಎನ್. ಸಿ. ಬಿ. ಐ. ಯಲ್ಲಿ ಸಿ. ಬಿ. ಎಲ್. ಎ. ಎಸ್. ಟಿ. ಅನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸುವಾಗ ಡಿ. ವಿ. ಎಲ್. 1ರ ಡಿ. ಇ. ಪಿ. ಡೊಮೇನ್ಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ರಚನಾತ್ಮಕ ಹೋಲಿಕೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಜೋಡಣೆಯು 1.00e-08 ಮೌಲ್ಯವನ್ನು ಸ್ಕೋರ್ ಮಾಡುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಎರಡು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಡಿಇಪಿ ಡೊಮೇನ್ಗಳ ನಡುವೆ 30 ಪ್ರತಿಶತ ಗುರುತನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಡಿ. ವಿ. ಎಲ್. 1ರಲ್ಲಿ, ಡಿ. ಇ. ಪಿ. ಡೊಮೇನ್, ಡಬ್ಲ್ಯೂ. ಎನ್. ಟಿ. ಸಿಗ್ನಲಿಂಗ್ ಮಾರ್ಗದ ಭಾಗವಾಗಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ನನ್ನು ಪ್ಲಾಸ್ಮಾ ಮೆಂಬರೇನ್ಗೆ ಸ್ಥಳೀಕರಣಗೊಳಿಸುವಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿದೆ. ಡಿಯುಎಫ್ 3608 ಡೊಮೇನ್ ಎನ್-ಟರ್ಮಿನಸ್ನಿಂದ 99 ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ ಮತ್ತು ಸ್ವತಃ 280 ಅಮೈನೊ ಆಮ್ಲಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಈ ಡೊಮೇನ್ನೊಳಗೆ ಕನಿಷ್ಠ ಒಂದು ಬೀಟಾ ಶೀಟ್ ಮತ್ತು ಎರಡು ಆಲ್ಫಾ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳನ್ನು ಪಿಇಎಲ್ಇ ಊಹಿಸುತ್ತದೆ. ಇದು 26 ಹೆಚ್ಚು ಸಂರಕ್ಷಿತ ಅವಶೇಷಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಅನುವಾದದ ನಂತರದ ಹಲವಾರು ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳನ್ನು ಸಹ ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ಈ ಎರಡೂ ಘಟನೆಗಳನ್ನು ಈ ಲೇಖನದಲ್ಲಿ ನಂತರ ವಿವರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಡಿ. ಯು. ಎಫ್. 3608ನ ಕಾರ್ಯಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಪುರಾವೆಗಳನ್ನು ಯೀಸ್ಟ್ ಹೋಮೋಲಾಗ್ ಇಮ್ಲ್1ಪಿ ಯಲ್ಲಿ ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ. ಐ. ಎಂ. ಎಲ್. ಪಿ. 1ನ ಡಿ. ಯು. ಎಫ್. 3608 ಎರಡು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಪಾಲುದಾರರಾದ ಎನ್. ಪಿ. ಆರ್. 2 ಮತ್ತು ಎನ್. ಪಿ. ಆರ್. 3 ಅನ್ನು ಬಂಧಿಸಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ ಎಂದು ಭಾವಿಸಲಾಗಿದೆ. ಒಟ್ಟಾಗಿ, ಈ ಮೂರು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಇಮ್ಲ್ 1-ಎನ್. ಪಿ. ಆರ್ 2-ಎನ್. ಪಿ. ಆರ್ 3 ಸಂಕೀರ್ಣವನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು "ನೈಟ್ರೋಜನ್ ಅಲ್ಲದ ಹಸಿವು" ಆಟೋಫಾಗಿ ನಿಯಂತ್ರಣದಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿಕೊಂಡಿವೆ. ಇದನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿದ ಸಂಶೋಧಕರು ಡಿಯುಎಫ್ 3608 ಅನ್ನು ಆರ್ಎಎನ್ಎಸ್ ಎಂದು ಮರುನಾಮಕರಣ ಮಾಡಲು ಪ್ರಸ್ತಾಪಿಸಿದ್ದಾರೆ (ನೈಟ್ರೋಜನ್ ಅಲ್ಲದ ಹಸಿವಿನ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರೇರಿತವಾದ ಆಟೋಫಾಗಿಗೆ ಅಗತ್ಯ). ಸೆಕೆಂಡರಿ ಸ್ಟ್ರಕ್ಚರ್ ಸೆಕೆಂಡರಿ ಸ್ಟ್ರಕ್ಚರ್ ಪ್ರಿಡಿಕ್ಷನ್ ಟೂಲ್ ಪಿಇಎಲ್ಇಯ ಸರ್ವಾನುಮತದ ಒಮ್ಮತದ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ, ಡಿಇಪಿಡಿಸಿ5 ಕನಿಷ್ಠ ಹತ್ತು ಆಲ್ಫಾ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳು ಮತ್ತು ಒಂಬತ್ತು ಬೀಟಾ ಶೀಟ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಈ ದ್ವಿತೀಯಕ ರಚನೆಗಳ ಸ್ಥಳಗಳನ್ನು ಕೆಳಗಿನ ಚಿತ್ರದಲ್ಲಿ ವಿವರಿಸಲಾಗಿದೆಃ ಕೆಂಪು ಮುಖ್ಯಾಂಶಗಳು ಆಲ್ಫಾ ಹೆಲಿಕ್ಸ್ ಮತ್ತು ನೀಲಿ ಮುಖ್ಯಾಂಶಗಳು ಬೀಟಾ ಶೀಟ್ಗಳಾಗಿವೆ. ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಸ್ಯಾಕರೊಮೈಸಿಸ್ ಸೆರೆವಿಸಿಯಾ ಮತ್ತು ಅಲ್ಬುಗೋ ಲೈಬಾಚಿ ಸೇರಿದಂತೆ ಮಾನವನ ಡಿಇಪಿಡಿಸಿ5ಗೆ ಆರ್ಥೋಲೋಗಸ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಅತ್ಯಂತ ದೂರದ ಸಂಬಂಧಿತ ಜೀವಿಗಳಾಗಿವೆ. ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳಲ್ಲಿ, ಪ್ರೋಟೀನಿನ ಹೆಸರು ಐಎಂಎಲ್1ಪಿ, ಅಥವಾ ವ್ಯಾಕ್ಯುಲಾರ್ ಮೆಂಬರೇನ್-ಸಂಬಂಧಿತ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಐಎಂಎಲ್1. ಇತರ ಜೀವಿಗಳಲ್ಲಿನ ಹೆಸರಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳಲ್ಲಿ ಸಿಜಿ12090 (ಡ್ರೊಸೊಫಿಲಾ) ಮತ್ತು ಎಜಿಎಪಿ007010 (ಸೊಳ್ಳೆ) ಸೇರಿವೆ. ಮಾನವರು ಮತ್ತು ಇತರ ಕಶೇರುಕ ಪ್ರಭೇದಗಳ ನಡುವೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಂರಕ್ಷಣೆ ಇದೆ, ಇದು ಸಿಕ್ಲಿಡ್ಗಳಲ್ಲಿ ಶೇಕಡಾ 74ರಿಂದ ಹಿಡಿದು ಚಿಂಪಾಂಜಿಗಳಲ್ಲಿ ಶೇಕಡಾ 99ರಷ್ಟು ಗುರುತನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಈ ಕೆಳಗಿನ ಕೋಷ್ಟಕವು ಮಾನವ ಡಿ. ಇ. ಪಿ. ಡಿ. ಸಿ. 5 ಗೆ ಆರ್ಥೋಲೋಗಸ್ ಆಗಿರುವ 20 ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಸಾರಾಂಶಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಪ್ರಾಣಿಗಳು ಮತ್ತು ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಬೇರ್ಪಟ್ಟಾಗಿನಿಂದ 30 ಅವಶೇಷಗಳನ್ನು ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ, ಅವುಗಳಲ್ಲಿ 26 ಡಿಯುಎಫ್ 3608 ಡೊಮೇನ್ನಲ್ಲಿವೆ. ಈ ಕೆಳಗಿನ ಬಹು ಅನುಕ್ರಮ ಜೋಡಣೆಯು ಡಿಯುಎಫ್ ಡೊಮೇನ್ನ ಈ ಸಂರಕ್ಷಣೆಯನ್ನು ವಿವರಿಸುತ್ತದೆ; ಅಕಶೇರುಕ ಮತ್ತು ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಕ್ಲೇಡ್ಗಳ ಪ್ರತಿನಿಧಿಗಳು ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ಹಸಿರು ಬಣ್ಣದ ಅವಶೇಷಗಳೊಂದಿಗೆ ಮಾನವ ಡಿಯುಎಫ್ 3608 ಗೆ ಜೋಡಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿರುತ್ತಾರೆ. ಯಾವುದೇ ಮಾನವ ಡಿಇಪಿಡಿಸಿ5 ಪ್ಯಾರಾಲಾಗ್ಗಳಿಲ್ಲ, ಆದರೆ 64 ಮಾನವ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಏಕರೂಪದ ಡಿಇಪಿ ಡೊಮೇನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ. ಮಾನವ ಡಿ. ಇ. ಪಿ. ಡಿ. ಸಿ. 5 ನ ಅತ್ಯಂತ ದೂರದ ಸಂಬಂಧಿತ ಆರ್ಥೋಲಾಗ್ ಆಗಿರುವ ಯೀಸ್ಟ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಐ. ಎಂ. ಎಲ್. 1 ಗೆ ಯಾವುದೇ ಗುರುತಿಸಲಾದ ಪ್ಯಾರಾಲಾಗ್ಗಳಿಲ್ಲ. ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಡಿಇಪಿಡಿಸಿ5 ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ಮಾನವ ಅಂಗಾಂಶದಲ್ಲಿ ಆರ್ಟಿ-ಪಿಸಿಆರ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆ ಮತ್ತು ಡಿಎನ್ಎ ಮೈಕ್ರೋಅರೇ ಅಧ್ಯಯನಗಳಲ್ಲಿ ಸರ್ವವ್ಯಾಪಿ ಎಂದು ಈ ಕೆಳಗಿನ ಪಟ್ಟಿಯಲ್ಲಿ ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಹೆಪಟೊಸೆಲ್ಯುಲರ್ ಕಾರ್ಸಿನೋಮ ಹೊಂದಿರುವ ರೋಗಿಗಳ ಮೇಲೆ ನಡೆಸಿದ ಒಂದು ಅಧ್ಯಯನವು ಟ್ಯೂಮರ್ ಅಲ್ಲದ ಅಂಗಾಂಶಗಳಿಗಿಂತ ಟ್ಯೂಮರ್ ಅಂಗಾಂಶದಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಡಿಇಪಿಡಿಸಿ5 ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿದಿದೆ. ಇದಕ್ಕೆ ವಿರುದ್ಧವಾಗಿ, ಎರಡು ಗ್ಲಿಯೊಬ್ಲಾಸ್ಟೋಮಾ ಪ್ರಕರಣಗಳಲ್ಲಿ ಡಿಇಪಿಡಿಸಿ5 ಎಂಬ ಮೂರು ವಂಶವಾಹಿಗಳ ಏಕರೂಪದ ಅಳಿಸುವಿಕೆಯು ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. ಇತರ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ವೈಪರೀತ್ಯಗಳಲ್ಲಿ ಎಂ. ಡಿ. ಎ.-ಎಂ. ಬಿ.-221 ಸ್ತನ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ಜೀವಕೋಶದ ರೇಖೆಯಲ್ಲಿ ಶೂನ್ಯ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮತ್ತು ಪಿ116 (ಜೆ. ಎ. ಪಿ. 70 ಋಣಾತ್ಮಕ) ಜೀವಕೋಶದ ರೇಖೆಯಲ್ಲಿ ಕಡಿಮೆ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಸೇರಿವೆ. ಅನುವಾದದ ನಂತರದ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳು ಈ ಕೆಳಗಿನ ಅನುವಾದದ ನಂತರದ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳನ್ನು ಮಾನವ ಡಿಇಪಿಡಿಸಿ5 ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಾಗಿ ಎಕ್ಸ್ಪೇಸಿ ಮತ್ತು ಫಾಸ್ಫೋಸೈಟ್ ಪ್ಲಸ್ನಲ್ಲಿ ಸಂಗ್ರಹಿಸಲಾದ ಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ ಸಾಧನಗಳೊಂದಿಗೆ ಊಹಿಸಲಾಗಿದೆ. ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆ ಡಿ. ಇ. ಪಿ. ಡಿ. ಸಿ. 5 ಪ್ರಾಯಶಃ ಪ್ರೋಟೀಸೋಮ್ ಉಪಘಟಕವಾದ ಪಿ. ಎಸ್. ಎಂ. ಎ. 3 ನೊಂದಿಗೆ ಸಂವಹನ ನಡೆಸಬಹುದು ಎಂಬುದಕ್ಕೆ ಕೋಇಮ್ಯುನೊಪ್ರೆಸಿಪಿಟೇಶನ್ ಮತ್ತು ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಷನ್ ಫ್ಯಾಕ್ಟರ್ ಎಂ. ವೈ. ಸಿ. ಯಿಂದ ಸಾಕ್ಷಿಯಾಗಿದೆ. ಡಿಇಪಿಡಿಸಿ5 ಎನ್ಪಿಆರ್ಎಲ್2 ಮತ್ತು ಎನ್ಪಿಆರ್ಎಲ್3 ಹೊಂದಿರುವ "ಗ್ಯಾಟರ್1" ಸಂಕೀರ್ಣದಲ್ಲಿದೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು