RNA motif
ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ವಿಶಿಷ್ಟ ಲಕ್ಷಣವು ಸಂಬಂಧಿತ ರಚನೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಗಳ ಗುಂಪಿನ ವಿವರಣೆಯಾಗಿದೆ. ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ವಿಶಿಷ್ಟ ಲಕ್ಷಣಗಳು ಪ್ರಾಥಮಿಕ ಅನುಕ್ರಮ ಮತ್ತು ಸಂಬಂಧಿತ ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಗಳ ದ್ವಿತೀಯಕ ರಚನೆಯೊಳಗಿನ ವೈಶಿಷ್ಟ್ಯಗಳ ಮಾದರಿಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತವೆ. ಹೀಗಾಗಿ, ಇದು ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಯ ದ್ವಿತೀಯಕ ರಚನೆಯನ್ನು ಸೇರಿಸಲು ಅನುಕ್ರಮ ಲಕ್ಷಣದ ಪರಿಕಲ್ಪನೆಯನ್ನು ವಿಸ್ತರಿಸುತ್ತದೆ. "ಆರ್. ಎನ್. ಎ ಮೋಟಿಫ" ಎಂಬ ಪದವು ಮಾದರಿ ಮತ್ತು ಅದಕ್ಕೆ ಹೊಂದಿಕೆಯಾಗುವ ಆರ್. ಎನ್. ಎ ಅನುಕ್ರಮಗಳೆರಡನ್ನೂ ಉಲ್ಲೇಖಿಸಬಹುದು. ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಗಳ ವಿಶಿಷ್ಟ ಲಕ್ಷಣಗಳ ವಿವರಣೆಗಳನ್ನು ಎರಡು ಮುಖ್ಯ ರೂಪಗಳಲ್ಲಿ ವಿವರಿಸಬಹುದುಃ ಬಹು ಅನುಕ್ರಮ ಜೋಡಣೆ ಅಥವಾ ಸ್ಪಷ್ಟ ಹುಡುಕಾಟ ಮಾದರಿ. ಒಂದು ಜೋಡಣೆಯನ್ನು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಒಮ್ಮತದ ದ್ವಿತೀಯ ರಚನೆಯೊಂದಿಗೆ ಹೆಚ್ಚಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಅಂದರೆ. ಎಲ್ಲಾ ಅಥವಾ ಹೆಚ್ಚಿನ ಆರ್ಎನ್ಎಗಳಿಗೆ ಸಾಮಾನ್ಯವಾದ ರಚನೆ. ಜೋಡಣೆಯಲ್ಲಿನ ಅನುಕ್ರಮಗಳು ನಂತರ ಸಂರಕ್ಷಣೆಯ ಮಾದರಿಯನ್ನು ಸೂಚ್ಯವಾಗಿ ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸುತ್ತವೆ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಯ ಹೆಚ್ಚುವರಿ ಉದಾಹರಣೆಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲು ಇದನ್ನು ಬಳಸಬಹುದು. ಈ ಹುಡುಕಾಟ ತಂತ್ರವನ್ನು ಇತರರ ಜೊತೆಗೆ, ಇನ್ಫರ್ನಲ್ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ ಪ್ಯಾಕೇಜ್ ಜಾರಿಗೆ ತರುತ್ತದೆ. ಆರ್ಫಾಮ್ ದತ್ತಸಂಚಯವು ಬಹು ಅನುಕ್ರಮ ಜೋಡಣೆಗಳ ಸಂಗ್ರಹವಾಗಿದ್ದು, ಇದು ವಿಶ್ವಾಸಾರ್ಹವಾಗಿ ತಿಳಿದಿರುವ ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಲಕ್ಷಣಗಳ ಮತ್ತು ಸಂಬಂಧಿತ ಮಾಹಿತಿಯ ದೊಡ್ಡ ಉಪವಿಭಾಗವನ್ನು ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸುತ್ತದೆ. ಅದರ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಇನ್ಫರ್ನಲ್ ಸಾಫ್ಟ್ವೇರ್ನೊಂದಿಗೆ ಅನುಕ್ರಮ ದತ್ತಸಂಚಯಗಳಲ್ಲಿ ಅಂತಹ ಆರ್ಎನ್ಎಗಳ ಉದಾಹರಣೆಗಳನ್ನು ಹುಡುಕಲು ಬಳಸಬಹುದು, ಉದಾಹರಣೆಗೆ. ಜೀನೋಮ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳು. ಪರ್ಯಾಯವಾಗಿ, ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಸ್ಪಷ್ಟವಾದ ಹುಡುಕಾಟ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ವಿವರಿಸಬಹುದು, ಇದು ಹೆಲಿಕ್ಸ್ಗಳು ಎಲ್ಲಿ ರೂಪುಗೊಳ್ಳಬೇಕು ಎಂಬುದರ ನಿರ್ಬಂಧಗಳೊಂದಿಗೆ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪ್ರಾಥಮಿಕ ಅನುಕ್ರಮ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ವ್ಯಾಖ್ಯಾನಿಸುತ್ತದೆ. ಅಂತಹ ಮಾದರಿಗಳನ್ನು ದೊಡ್ಡ ಅನುಕ್ರಮ ದತ್ತಸಂಚಯದಲ್ಲಿ ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲು ಬಳಸಬಹುದು. ಹಲವಾರು ತಂತ್ರಾಂಶ ಪ್ಯಾಕೇಜುಗಳು ಅಂತಹ ಹುಡುಕಾಟವನ್ನು ಕಾರ್ಯಗತಗೊಳಿಸುತ್ತವೆ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ. ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ರೋಬೋ ಮತ್ತು ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಮೋಟಿಫ್. ಹೊಸ ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಲಕ್ಷಣಗಳ ಆವಿಷ್ಕಾರ ಹೊಸ ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲು ಅನೇಕ ವಿಧಾನಗಳು ತುಲನಾತ್ಮಕ ವಿಧಾನವನ್ನು ಬಳಸುತ್ತವೆ, ಇದರಲ್ಲಿ ಸಂರಕ್ಷಿತ ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಯ ವಿಶಿಷ್ಟ ಸಂಕೇತಗಳನ್ನು ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಲು ವಿಭಿನ್ನ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಒಟ್ಟಿಗೆ ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಅಂತಹ ವಿಧಾನಗಳು ಯಶಸ್ವಿಯಾದಾಗ, ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ ಬರುವ ಹೊಸ ಸಂರಕ್ಷಿತ ಆರ್ಎನ್ಎಯನ್ನು ಆರ್ಎನ್ಎ ಮೋಟಿಫ್ನಂತೆ ನೋಡಬಹುದು, ಇದನ್ನು ಜೋಡಣೆ ಅಥವಾ ಮಾದರಿಯನ್ನು ಬಳಸಿ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಬಹುದು. ಒಂದು ಆರಂಭಿಕ ಉದಾಹರಣೆಯೆಂದರೆ ಟಿ-ಬಾಕ್ಸ್ ಅನ್ನು ಆಧರಿಸಿದ ಆರ್ಎನ್ಎ ಮೋಟಿಫ್, ಇದು 1993 ರಲ್ಲಿ ಅಮೈನೋಸೈಲ್-ಟಿಆರ್ಎನ್ಎ ಸಿಂಥೆಟೇಸ್ ಜೀನ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದೆ ಎಂದು ನಿರ್ಧರಿಸಲಾಯಿತು. ಈ ಆರ್. ಎನ್. ಎ ಮೋಟಿಫನ್ನು ಜೀನ್ಗಳನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುವ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವನ್ನು ನಂತರ ಪ್ರದರ್ಶಿಸಲಾಯಿತು, ಹೀಗಾಗಿ ಆರ್. ಎನ್. ಎ ಮೋಟಿಫ್ನ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಪ್ರಾಮುಖ್ಯತೆಯನ್ನು ಸ್ಥಾಪಿಸಲಾಯಿತು. ನಂತರ, 1997ರಲ್ಲಿ, ಬಿ12-ಪೆಟ್ಟಿಗೆ ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುವ ಸಂರಕ್ಷಿತ ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ವಿಶಿಷ್ಟ ಲಕ್ಷಣವು ಬಿ12 ಚಯಾಪಚಯ ಕ್ರಿಯೆಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ವಂಶವಾಹಿಗಳ ಮೇಲ್ಭಾಗದಲ್ಲಿ ಪತ್ತೆಯಾಯಿತು. ಈ ಆರ್ಎನ್ಎ ವಿಶಿಷ್ಟ ಲಕ್ಷಣವು ಕೋಬಾಲಮಿನ್ ರೈಬೋಸ್ವಿಚ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುವ ಸಹ-ಅಂಶವಾದ ಅಡೆನೊಸೈಲ್ಕೋಬಾಲಮಿನ್ ಅನ್ನು ಬಂಧಿಸುವ ರೈಬೋಸ್ವಿಚ್ನ ಒಂದು ಭಾಗಕ್ಕೆ ಅನುರೂಪವಾಗಿದೆ ಎಂದು ನಂತರ ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. (ನಂತರದ ರೂಪಾಂತರಗಳು ಇತರ ಕೋಬಾಲಮಿನ್ ಉತ್ಪನ್ನಗಳನ್ನು ಬಂಧಿಸುತ್ತವೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ.) ಆರ್. ಎನ್. ಎ. ಲಕ್ಷಣಗಳ ಅನೇಕ ಇತರ ಉದಾಹರಣೆಗಳು, ಅವುಗಳ ಕಾರ್ಯಗಳನ್ನು ನಂತರ ನಿರ್ಧರಿಸಲಾಯಿತು, ವಿಶೇಷವಾಗಿ ರೈಬೋಸ್ವಿಚ್ರ ಸಂದರ್ಭದಲ್ಲಿ ತಿಳಿದಿವೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಇತರ ರೀತಿಯ ಆರ್ಎನ್ಎ ವಿಶಿಷ್ಟ ಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕವಾಗಿ ನಿರೂಪಿಸಲಾಗಿದೆ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ 6ಸಿ ಆರ್ಎನ್ಎಯಂತಹ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದ ಎಸ್ಆರ್ಎನ್ಎಗಳು, ಇದನ್ನು 2007ರಲ್ಲಿ ಒಂದು ವಿಶಿಷ್ಟ ಲಕ್ಷಣವಾಗಿ ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲಾಯಿತು ಮತ್ತು 2016ರಲ್ಲಿ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕವಾಗಿ ನಿರೂಪಿಸಲಾಗಿದೆ, ಅಥವಾ ಟ್ವಿಸ್ಟರ್ ರೈಬೋಸೈಮ್ನಂತಹ ರೈಬೋಸೈಮ್ಗಳು, ಇದನ್ನು ಆರ್ಎನ್ಎ ವಿಶಿಷ್ಟ ಲಕ್ಷಣವಾಗಿ ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಲಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಅದೇ ಪ್ರಕಟಣೆಯಲ್ಲಿ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕವಾಗಿ ನಿರೂಪಿಸಲಾಗಿದೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಆರ್ಎನ್ಎ