Retrozyme
ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳು ಸಸ್ಯಗಳ ಜೀನೋಮ್ಗಳಲ್ಲಿ ಮೊದಲು ಪತ್ತೆಯಾದ ರೆಟ್ರೋಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ಗಳ ಒಂದು ಕುಟುಂಬವಾಗಿದ್ದು, ಈಗ ಪ್ರಾಣಿಗಳ ಜೀನೋಮ್ಗಳಲ್ಲಿಯೂ ಸಹ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ. ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳು ತಮ್ಮ ಅನುಕ್ರಮಗಳಲ್ಲಿ ಹ್ಯಾಮರ್ಹೆಡ್ ರೈಬೊಜೈಮ್ (ಎಚ್ಎಚ್ಆರ್) ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ (ಆದ್ದರಿಂದ ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ ಎಂಬ ಹೆಸರು ರೆಟ್ರೋಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ ಮತ್ತು ಹ್ಯಾಮರ್ಹೆಡ್ ರೈಬೊಜೈಮ್ಗಳ ಸಂಯೋಜನೆಯಾಗಿದೆ), ಆದಾಗ್ಯೂ ಅವು ಯಾವುದೇ ಕೋಡಿಂಗ್ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವುದಿಲ್ಲ. ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳು ಸ್ವಾಯತ್ತವಲ್ಲದ ರೆಟ್ರೊಲೆಮೆಂಟ್ಗಳಾಗಿವೆ, ಮತ್ತು ಆದ್ದರಿಂದ ಜೀನೋಮ್ನ ಹೊಸ ಪ್ರದೇಶಗಳಿಗೆ ತೆರಳಲು ಇತರ ಅಂಶಗಳಿಂದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಎರವಲು ಪಡೆಯುತ್ತವೆ. ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳನ್ನು ಕೋವೆಲೆಂಟ್ ಕ್ಲೋಸ್ಡ್ ಸರ್ಕ್ಯುಲರ್ ಆರ್ಎನ್ಎಗಳಾಗಿ (ಸಿಆರ್ಆರ್ಎನ್ಎಗಳು ಅಥವಾ ಸಿಸಿಆರ್ಎನ್ಎಗಳು) ಸಕ್ರಿಯವಾಗಿ ಲಿಪ್ಯಂತರ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಎರಡೂ ಧ್ರುವಗಳಲ್ಲಿ ಪತ್ತೆಹಚ್ಚಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಅವುಗಳ ಜೀವನಚಕ್ರದಲ್ಲಿ ರೋಲಿಂಗ್ ಸರ್ಕಲ್ ರೆಪ್ಲಿಕೇಶನ್ನ ಬಳಕೆಯನ್ನು ಸೂಚಿಸಬಹುದು. ಸಸ್ಯಗಳಲ್ಲಿನ ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ನ ಜೀನೋಮಿಕ್ ರಚನೆಯು ಕೇಂದ್ರ ಸಂಕೇತವಲ್ಲದ ಪ್ರದೇಶವನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತದೆ, ಇದು ಸುಮಾರು 300-600 nt ಅನ್ನು ವಿಸ್ತರಿಸಬಹುದು, ಇದು HHR ಮೋಟಿಫನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಸುಮಾರು 300-400 nt ಉದ್ದದ ಟರ್ಮಿನಲ್ ಪುನರಾವರ್ತನೆಗಳಿಂದ ಸುತ್ತುವರೆದಿದೆ. ಅವು ಎರಡು ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಸಹ ಹೊಂದಿವೆ (ಟಿಆರ್ಎನ್ಎ-ಮೆಟ್ ಅನುಕ್ರಮಕ್ಕೆ ಪೂರಕವಾದ ಪ್ರೈಮರ್ ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಸೈಟ್ (ಪಿಬಿಎಸ್) ಮತ್ತು ಸಜ್ಜುಗೊಳಿಸುವಿಕೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಪ್ರಧಾನ ಡಿಎನ್ಎ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆಗೆ ಅಗತ್ಯವಾದ ಪಾಲಿ-ಪ್ಯೂರಿನ್ ಟ್ರ್ಯಾಕ್ಟ್ (ಪಿಪಿಟಿ)). ಸಸ್ಯದ ಜೀನೋಮ್ಗಳ ಇತರ ಅಂಶಗಳಿಗೆ ಹೋಲಿಸಿದರೆ ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ನ ಅತ್ಯಂತ ವಿಶಿಷ್ಟ ಲಕ್ಷಣವೆಂದರೆ ಹ್ಯಾಮರ್ ಹೆಡ್ ರೈಬೊಜೈಮ್. ಇಲ್ಲದಿದ್ದರೆ, ಅವು ಸಸ್ಯದ ಜೀನೋಮ್ಗಳ ಇತರ ಪರಿಚಿತ ಲಕ್ಷಣಗಳಾದ ಟರ್ಮಿನಲ್-ರಿಪೀಟ್ ರೆಟ್ರೋಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ಸ್ ಇನ್ ಮಿನಿಯೇಚರ್ (TRIMs) ಮತ್ತು ಸ್ಮಾಲ್ LTR ರೆಟ್ರೋಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ಸ್ (SMARTs) ಗಳನ್ನು ಹೋಲುತ್ತವೆ. ಪಿಬಿಎಸ್, ಪಿಪಿಟಿ ಮತ್ತು ಎಚ್ಎಚ್ಆರ್ ಮೋಟಿಫ್ಗಳು ಸಂರಕ್ಷಣೆ ಮತ್ತು ಹೋಮೋಲಜಿಯನ್ನು ತೋರಿಸುವ ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ಏಕೈಕ ಭಾಗಗಳಾಗಿವೆ. ಪ್ರಸ್ತುತ, ಅನೇಕ ಯುಕಾರ್ಯೋಟ್ಗಳಲ್ಲಿ ಪೆನೆಲೋಪ್ ತರಹದ ಅಂಶಗಳು (ಪಿಎಲ್ಇಗಳು) ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ದೊಡ್ಡ ರೆಟ್ರೊಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ ಕುಟುಂಬದಿಂದ ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳು ವಿಕಸನಗೊಂಡಿವೆ ಎಂದು ಭಾವಿಸಲಾಗಿದೆ. ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳು ಪಿಎಲ್ಇಗಳೊಂದಿಗೆ ಹಲವಾರು ವಿಶಿಷ್ಟ ಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ, ಇದರಲ್ಲಿ ಟೈಪ್ I ಎಚ್ಎಚ್ಆರ್, ಟಂಡೆಮ್ ಪ್ರತಿಗಳಾಗಿ ಸಂಭವಿಸುವುದು ಮತ್ತು ಇಲ್ಲಿಯವರೆಗಿನ ಎಲ್ಲಾ ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಿದ ಮೆಟಾಝೋನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಸಹ-ಅಸ್ತಿತ್ವವಿದೆ. ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳು ಪ್ರಸ್ತುತ 170 ಎನ್. ಟಿ. ಯಷ್ಟು ಚಿಕ್ಕದಾದ ಮತ್ತು 1,116 ಎನ್. ಟಿ. ಯಷ್ಟು ದೊಡ್ಡದಾದ ಅನುಕ್ರಮ ಗಾತ್ರಗಳನ್ನು ತಲುಪುತ್ತವೆ. ಸಣ್ಣ ರೆಟ್ರೊಜೈಮ್ಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಅಕಶೇರುಕಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಮೆಡಿಟರೇನಿಯನ್ ಮುಸಲ್ (ಮೈಟಿಲಸ್ ಗ್ಯಾಲೊಪ್ರೊವಿನ್ಷಿಯಾಲಿಸ್) ನ ಜೀನೋಮ್ನಲ್ಲಿರುವ 300 ಎನ್. ಟಿ ರೆಟ್ರೊಜೈಮ್. ತಿಳಿದಿರುವ ಅತಿದೊಡ್ಡ ರೆಟ್ರೊಜೈಮ್ 1,116 ಎನ್. ಟಿ ಉದ್ದವಾಗಿದೆ, ಇದು ಜಾಟ್ರೋಫಾ ಕರ್ಕಾಸ್ನ ತಳಿಯ ಜೀನೋಮ್ನಲ್ಲಿ ಪತ್ತೆಯಾಗಿದೆ. ಪ್ರಸ್ತುತ, ರೆಟ್ರೊಜೈಮ್ಗಳು ಮತ್ತು ಅಂತಹುದೇ ಅಂಶಗಳಿಗೆ ಇರುವ ಏಕೈಕ ದತ್ತಸಂಚಯವೆಂದರೆ ವೈರಾಯಿಡ್ಡಿಬಿ, ಇದು ಪ್ರಸ್ತುತ ನ್ಯಾಷನಲ್ ಸೆಂಟರ್ ಫಾರ್ ಬಯೋಟೆಕ್ನಾಲಜಿ ಇನ್ಫರ್ಮೇಷನ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೋಟೈಡ್ ದತ್ತಸಂಚಯದಿಂದ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳಲಾದ 73 ರೆಟ್ರೊಜೈಮ್ಗಳ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ. ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳ ಅನುಕ್ರಮಗಳನ್ನು ಆರಂಭದಲ್ಲಿ ನೇರವಾಗಿ ಮತ್ತು ಪ್ರತ್ಯೇಕವಾಗಿ ಜೆನ್ಬ್ಯಾಂಕ್ನಿಂದ ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲಾಯಿತು ಮತ್ತು ಡೌನ್ಲೋಡ್ ಮಾಡಲಾಯಿತು, ಏಕೆಂದರೆ ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳು ಪ್ರಸ್ತುತ ಯಾವುದೇ ವರ್ಗೀಕರಣ ವರ್ಗೀಕರಣವನ್ನು ಹೊಂದಿಲ್ಲ. ಪ್ರಯೋಗಾಲಯದಲ್ಲಿ ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳನ್ನು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲು ಕೆಲವು ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ. ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳು ಸಸ್ಯಗಳ ವಿವಿಧ ಅಂಗಾಂಶಗಳಲ್ಲಿ ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿ ಸಂಗ್ರಹವಾಗುತ್ತವೆ. ಇದಲ್ಲದೆ, ಕೆಲವು ಜಾತಿಯ ಸಸ್ಯಗಳ ಸಾಕುಪ್ರಾಣಿಗಳು ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳ ಗಣನೀಯವಾಗಿ ಕಡಿಮೆ ಪ್ರತಿಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ, ಇದು ಸಾಕುಪ್ರಾಣಿಗಳು ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ ಅನುಕ್ರಮಗಳ ಮೇಲೆ ಋಣಾತ್ಮಕ ಆಯ್ಕೆಯ ಒತ್ತಡವನ್ನು ಅನ್ವಯಿಸುತ್ತದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಸಸ್ಯಗಳಲ್ಲಿನ ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳ ಮತ್ತೊಂದು ಆಸಕ್ತಿದಾಯಕ ಲಕ್ಷಣವೆಂದರೆ ಅವುಗಳ ಸಕ್ರಿಯ ಪ್ರತಿಲೇಖನ, ಬಹುಪಾಲು ರೆಟ್ರೋಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ಗಳು ನಿಷ್ಕ್ರಿಯವಾಗಿದ್ದರೂ ಸಹ. ತಿಳಿದಿರುವ ಅತ್ಯಂತ ಚಿಕ್ಕ ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳು ಅಕಶೇರುಕಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ, ಅಲ್ಲಿ ಅವು 170-400 nt ವ್ಯಾಪ್ತಿಯಲ್ಲಿರಬಹುದು. ಅವುಗಳನ್ನು ಕನಿಷ್ಠ, ಹೆಚ್ಚಿನ ಜೀವಕೋಶದ ಪ್ರಕಾರಗಳಲ್ಲಿ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ ಎಂದು ತೋರುತ್ತದೆ. ಸಸ್ಯಗಳಂತೆಯೇ, ಪ್ರಾಣಿಗಳಲ್ಲಿನ ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳು ದೈಹಿಕ ಕೋಶಗಳು ಮತ್ತು ಸೂಕ್ಷ್ಮಾಣು ಕೋಶಗಳೆರಡರಲ್ಲೂ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿ ವ್ಯಕ್ತವಾಗುತ್ತವೆ. ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳು ರೇಖೀಯ ಮತ್ತು ವೃತ್ತಾಕಾರದ ಎರಡೂ ರೂಪಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬಂದಿವೆಯಾದರೂ, ವೃತ್ತಾಕಾರದ ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳ ಮಟ್ಟಗಳು ವಿವೊದಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚು ಹೇರಳವಾಗಿ ಕಂಡುಬಂದಿವೆ ಮತ್ತು ರೇಖೀಯ ರೂಪಗಳು ಪುನರಾವರ್ತನೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಎಚ್ಎಚ್ಆರ್ ಮೋಟಿಫ್ನ ಸ್ವಯಂ-ಶುದ್ಧೀಕರಣದ ಉತ್ಪನ್ನವಾಗಿರಬಹುದು ಅಥವಾ ಶುದ್ಧೀಕರಣದ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಸ್ವಯಂಪ್ರೇರಿತ ಒಡೆಯುವಿಕೆಯ ಪರಿಣಾಮವಾಗಿರಬಹುದು. ಪ್ರಾಣಿಗಳ ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳು ಸಸ್ಯ ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳೊಂದಿಗೆ ಹಲವಾರು ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ. ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಚಕ್ರದಲ್ಲಿ ವಿವಿಧ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು ಸಸ್ಯ ಮತ್ತು ಪ್ರಾಣಿಗಳ ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳನ್ನು ವೃತ್ತಾಕಾರವಾಗಿ ಮತ್ತು ಹಿಮ್ಮುಖವಾಗಿ ನಕಲಿಸುತ್ತವೆ. ಪ್ರಾಣಿಗಳ ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳು ಸಸ್ಯ ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಎಲ್ಲಾ ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ದೀರ್ಘ-ಟರ್ಮಿನಲ್ ಪುನರಾವರ್ತನೆಗಳು, ಪಿಬಿಎಸ್ಗಳು ಮತ್ತು ಪಿಪಿಟಿಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವುದಿಲ್ಲ. ಸಸ್ಯದ ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳು ಎಚ್ಎಚ್ಆರ್ ಮೋಟಿಫ್ನ ಒಂದು ಅಥವಾ ಎರಡು ಪ್ರತಿಗಳನ್ನು ಮಾತ್ರ ಹೊಂದಿದ್ದರೂ, ಪ್ರಾಣಿಗಳ ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳು ಅಂತಹ ಅನೇಕ ಪ್ರತಿಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರಬಹುದು. ಪ್ರಾಣಿಗಳ ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳು ಚಿಕ್ಕದಾದ ಅನುಕ್ರಮ ಪುನರಾವರ್ತನೆಗಳನ್ನು ಸಹ ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ, ಅವು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಗುರಿ ಬದಿಯ ನಕಲುಗಳಿಂದ (ಟಿಎಸ್ಡಿಗಳು) ಸುತ್ತುವರೆದಿರುತ್ತವೆ. ಪ್ರಾಣಿಗಳಲ್ಲಿನ ಟಿಎಸ್ಡಿಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ 8-12 ಬಿಪಿ ಆಗಿರುತ್ತವೆ, ಸಸ್ಯಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ 4 ಬಿಪಿ ಟಿಎಸ್ಡಿಗಳಿಗಿಂತ ಸ್ವಲ್ಪ ದೊಡ್ಡದಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಚಕ್ರ ರೆಟ್ರೊಜೈಮ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಮೊದಲು ಆತಿಥೇಯದಲ್ಲಿರುವ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ನಿಂದ ಲಿಪ್ಯಂತರ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ಉತ್ಪನ್ನವು ಒಲಿಗೋಮೆರಿಕ್ ಆರ್ಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮವಾಗಿದ್ದು, ಇದು ರೆಟ್ರೊಜೈಮ್ ಅನುಕ್ರಮದ ಅನೇಕ ಪ್ರತಿಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಒಂದೇ ಪ್ರತಿಲೇಖನವಾಗಿದೆ. ಹ್ಯಾಮರ್ಹೆಡ್ ರೈಬೊಜೈಮ್ ಮೋಟಿಫ್ ನಂತರ ಒಲಿಗೊಮೆರಿಕ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ ಅನ್ನು ಹಲವಾರು ಮೊನೊಮೆರಿಕ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟ್ಗಳಾಗಿ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಲು ಸ್ವಯಂ-ಸೀಳುವಿಕೆಯನ್ನು ಸ್ವಯಂಚಾಲಿತವಾಗಿ ನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ, ಪ್ರತಿಯೊಂದೂ ರೆಟ್ರೊಜೈಮ್ ಅನುಕ್ರಮದ ಒಂದು ನಕಲನ್ನು ಮಾತ್ರ ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಈ ಪ್ರತಿಯು ಪ್ರತಿಕೃತಿ ಚಕ್ರದ ಮಧ್ಯಂತರವಾಗಿದ್ದು, 5 '-ಹೈಡ್ರಾಕ್ಸಿಲ್ ಮತ್ತು 2'-3 '-ಸೈಕ್ಲಿಕ್ ಫಾಸ್ಫೇಟ್ ತುದಿಗಳೊಂದಿಗೆ ಮೂಲ ಅನುಕ್ರಮದ ವಿರುದ್ಧ ಧ್ರುವೀಯತೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಆತಿಥೇಯದಲ್ಲಿರುವ ಲಿಗೇಸ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ನಂತರ ಈ ಮಧ್ಯಂತರವನ್ನು ಸ್ಥಿರವಾದ, ವೃತ್ತಾಕಾರದ ಆರ್ಎನ್ಎ ಅಣುವಾಗಿ ವೃತ್ತಾಕಾರಗೊಳಿಸಬಹುದು. ಸಸ್ಯಗಳಲ್ಲಿ, ಈ ಲಿಗೇಸ್ ಕ್ಲೋರೋಪ್ಲಾಸ್ಟ್ ಟಿಆರ್ಎನ್ಎ ಲಿಗೇಸ್ ಆಗಿದೆ. ಸರ್ಕ್ಯುಲರೈಸೇಶನ್ಗಾಗಿ ಕ್ಲೋರೋಪ್ಲಾಸ್ಟ್ ಟಿ. ಆರ್. ಎನ್. ಎ ಲಿಗೇಸ್ನ ಅವಲಂಬನೆಯು ವೈರೋಯಿಡ್ಗಳ ಅವ್ಸನ್ವೈರೊಯಿಡೇ ಕುಟುಂಬದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ. ಪ್ರಾಣಿಗಳಲ್ಲಿ, ಲಿಗೇಸ್ ಒಂದು ಆರ್ ಟಿ ಸಿ ಬಿ ಟಿ ಆರ್ ಎನ್ ಎ ಲಿಗೇಸ್ ಆಗಿದೆ. ರೆಟ್ರೊಜೈಮ್ ಆರ್ಎನ್ಎಯ ಅನುಗುಣವಾದ ಪೂರಕ ಡಿಎನ್ಎಯನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸಲು ವಿಭಿನ್ನ ರೆಟ್ರೊಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸಾನ್ನಿಂದ ರಿವರ್ಸ್ ಟ್ರಾನ್ಸ್ಕ್ರಿಪ್ಟೇಸ್ ಚಟುವಟಿಕೆಯು ಅಗತ್ಯವಾಗಿರುತ್ತದೆ, ಮತ್ತು ಈ ಸಿಡಿಎನ್ಎಯ ಧ್ರುವೀಯತೆಯು ಮೂಲ ಅನುಕ್ರಮದ ಧ್ರುವೀಯತೆಗೆ ಅನುರೂಪವಾಗಿದೆ. ಸಸ್ಯ ಮತ್ತು ಪ್ರಾಣಿಗಳ ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳು ತಮ್ಮ ಆರ್ಎನ್ಎ ಅಣುವಿನ ಸಿಡಿಎನ್ಎ ನಕಲನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸಲು ವಿಭಿನ್ನ ರೆಟ್ರೋಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ಗಳನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿವೆ. ಸಸ್ಯಗಳಲ್ಲಿ, ಜಿಪ್ಸಿ ಕುಟುಂಬದ ಎಲ್ಟಿಆರ್ ರೆಟ್ರೋಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ಗಳನ್ನು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಪ್ರಾಣಿಗಳಲ್ಲಿ ಯಾವ ರೀತಿಯ ರೆಟ್ರೋಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ಗಳನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಲಾಗಿದೆ ಎಂಬುದು ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿಲ್ಲವಾದರೂ, ಇವು ಲೈನ್ಗಳು ಅಥವಾ ಪಿಎಲ್ಇಗಳಂತಹ ವರ್ಗಗಳಾಗಿರಬಹುದು. ಡಿಎನ್ಎ ನಕಲನ್ನು ತಯಾರಿಸಿದ ನಂತರ, ರೆಟ್ರೊಜೈಮ್ ಅನುಕ್ರಮವು ಜೀನೋಮಿಕ್ ಲೋಕಿಯಲ್ಲಿ ತನ್ನನ್ನು ತಾನು ಮರು-ಸೇರಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ಅವಕಾಶವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಸಂಚಾರಿ ಆನುವಂಶಿಕ ಅಂಶಗಳೊಂದಿಗಿನ ಸಂಬಂಧಗಳು ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳು ಸಂಚಾರಿ ಆನುವಂಶಿಕ ಅಂಶಗಳ (ಎಂಜಿಇ) ಪ್ರಕಾರಗಳಿಗೆ, ವಿಶೇಷವಾಗಿ ವೈರೋಯಿಡ್ಗಳು, ಉಪಗ್ರಹ ಆರ್ಎನ್ಎಗಳು (ಸ್ಯಾಟರ್ಎನ್ಎಗಳು) ಮತ್ತು ರಿಬೊಜೈವಿರಿಯಾಗಳಿಗೆ (ಇತ್ತೀಚೆಗೆ ವಿವರಿಸಲಾದ ವೈರಸ್ಗಳ ಕ್ಷೇತ್ರ) ಹತ್ತಿರದ ಹೋಲಿಕೆಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ. ಮೊದಲನೆಯದಾಗಿ, ಹ್ಯಾಮರ್ ಹೆಡ್ ರೈಬೊಜೈಮ್ (ಎಚ್ಎಚ್ಆರ್) ವಿಶಿಷ್ಟ ಲಕ್ಷಣವು ಈ ಎಲ್ಲಾ ಅಂಶಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ. ಈ ಅಂಶಗಳು ರೋಲಿಂಗ್ ಸರ್ಕಲ್ ರೆಪ್ಲಿಕೇಷನ್ ಮೂಲಕ ಪುನರಾವರ್ತಿಸುತ್ತವೆ, ಅಲ್ಲಿ ಎಚ್ಎಚ್ಆರ್ ಮೋಟಿಫ್ ಸಂರಕ್ಷಿತ ಸ್ಥಳದಲ್ಲಿ ವೃತ್ತಾಕಾರದ ಆರ್ಎನ್ಎ ಅಣುವನ್ನು ಬೇರ್ಪಡಿಸುವ ಸ್ವಯಂ-ವೇಗವರ್ಧಕ ಪಾತ್ರವನ್ನು ವಹಿಸುತ್ತದೆ. ಇದಲ್ಲದೆ, ಈ ಎಲ್ಲಾ ಅಂಶಗಳು ತಮ್ಮ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ನಕಲು ಮಾಡಲು ಆತಿಥೇಯ ಪಾಲಿಮರೇಸ್ ಅನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿವೆ ಮತ್ತು ಅವುಗಳನ್ನು ವೃತ್ತಾಕಾರದ ಆರ್ಎನ್ಎ ಅಣುವಾಗಿ ಮರುಪರಿಚಲನೆ ಮಾಡಲು ಲಿಗೇಸ್ ಅನ್ನು ಅವಲಂಬಿಸಿವೆ. ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳು ಶಾಖೆಯ ಸಂರಚನೆಗಳನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ, ಹಾಗೆಯೇ ಕೆಲವು ಸ್ಯಾಟ್ಆರ್ಎನ್ಎಗಳು ಮತ್ತು ಅವ್ಸನ್ವೈರೊಯಿಡೆಗಳು (ವೈರೋಯಿಡ್ಗಳ ಎರಡು ವರ್ಗಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದು). ಅವುಗಳ ಸರಳತೆಯಿಂದಾಗಿ, ವೈರೋಯಿಡ್ಗಳು ಹುಟ್ಟಿಕೊಂಡಿವೆ ಮತ್ತು ಆರ್ಎನ್ಎ ಪ್ರಪಂಚದ ಅವಶೇಷಗಳಾಗಿವೆ ಎಂದು ಹಲವರು ಸೂಚಿಸಿದ್ದಾರೆ. ವೈರೋಯಿಡ್ಗಳು ಇತರ ವೈರಸ್ಗಳಿಂದ ಉತ್ಪತ್ತಿಯಾಗುತ್ತವೆ, ಗಾತ್ರದಲ್ಲಿ ಕ್ಷೀಣಿಸಿವೆ ಮತ್ತು ಯಾವುದೇ ಪ್ರೋಟೀನ್-ಕೋಡಿಂಗ್ ಜೀನ್ಗಳನ್ನು ಕಳೆದುಕೊಂಡಿವೆ ಎಂದು ಇತರ ಸಲಹೆಗಳು ಸೇರಿವೆ. ಈ ಸಲಹೆಗಳಿಗೆ ಹಲವಾರು ಸವಾಲುಗಳನ್ನು ಒಡ್ಡಲಾಗಿದೆ. ಹೂಬಿಡುವ ಸಸ್ಯಗಳಲ್ಲಿನ ವೈರೋಯಿಡ್ಗಳು ಮತ್ತು ಉಪಗ್ರಹ ಆರ್ಎನ್ಎಗಳ ಸೀಮಿತ ವ್ಯಾಪ್ತಿಯು (ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಮತ್ತು ಆರ್ಕಿಯಾದಲ್ಲಿ ಯಾವುದೂ ಕಂಡುಬಂದಿಲ್ಲ) ಅವುಗಳ ಮೂಲವು ಯುಕಾರ್ಯೋಟ್ಗಳ ಹೊರಹೊಮ್ಮುವಿಕೆಯ ನಂತರದ ದಿನಾಂಕವನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ಇತ್ತೀಚಿನ ಸಂಶೋಧನೆ ಮತ್ತು ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ಪ್ರಗತಿಗಳು ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳು ವೈರೋಯಿಡ್ಗಳು ಮತ್ತು ಸ್ಯಾಟರ್ಎನ್ಎಗಳ ಮೂಲದ ಮೂಲವೆಂದು ಪ್ರಸ್ತುತ ಊಹೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗಿವೆ. ರೈಬೋಸೈವೈರಸ್ಗಳೊಂದಿಗಿನ ಸಂಬಂಧವು ಕಡಿಮೆ ನೇರವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ರೈಬೋಸೈವೈರಸ್ಗಳು ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳು, ವೈರೋಯಿಡ್ಗಳು ಮತ್ತು ಉಪಗ್ರಹಗಳಿಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ಸಂಕೀರ್ಣವಾಗಿವೆ. ಅವು ಪ್ರೋಟೀನ್-ಕೋಡಿಂಗ್ ಜೀನ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಏಕೈಕ ವೈರಾಯ್ಡ್ ತರಹದ ಅಂಶಗಳಾಗಿವೆ. ಈ ಜೀನ್ ಕ್ಯಾಪ್ಸಿಡ್ಗೆ ಸಂಕೇತಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಭಾಷಾಂತರದ ನಂತರದ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳಿಗೆ ಒಳಗಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ವಿವಿಧ ರೂಪಗಳಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ, ಇದು ಒಟ್ಟಾಗಿ ಆತಿಥೇಯದಲ್ಲಿ ವಿವಿಧ ಕಾರ್ಯಗಳನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಅವರ ಜೀವನಚಕ್ರವನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ. ಇದಲ್ಲದೆ, ರೈಬೊಜೈವೈರಸ್ಗಳು ಪ್ರಾಣಿಗಳ ವಂಶಾವಳಿಗಳಲ್ಲಿ ಮಾತ್ರ ಸೂಕ್ಷ್ಮವಾಗಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ, ಆದರೆ ವೈರೋಯಿಡ್ಗಳು ಮತ್ತು ಉಪಗ್ರಹ ಆರ್ಎನ್ಎಗಳು ಸಸ್ಯಗಳಲ್ಲಿ ಮಾತ್ರ ಸಾಂಕ್ರಾಮಿಕವೆಂದು ತಿಳಿದುಬಂದಿದೆ. ಪ್ರಾಣಿಗಳಲ್ಲಿ ರೈಬೋಸೈವೈರಸ್ಗಳ ಕಿರಿದಾದ ಹರಡುವಿಕೆಯು, ಸಸ್ಯಗಳಲ್ಲಿನ ವೈರೋಯಿಡ್ಗಳ ಮೂಲಕ್ಕೆ ಬಲವಾದ ಪುರಾವೆಗಳೊಂದಿಗೆ ಸೇರಿ, ರೈಬೋಸೈವೈರಸ್ಗಳು ಎಂಜಿಇಗಳ ಇತ್ತೀಚಿನ ವರ್ಗಗಳಾಗಿವೆ ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ರೈಬೋಸೈವೈರಸ್ಗಳು ವೈರೋಯಿಡ್ಗಳಿಂದ ಹೊರಹೊಮ್ಮಿರಬಹುದು ಮತ್ತು ನಂತರ ಸಮತಲ ಜೀನ್ ವರ್ಗಾವಣೆಯ ಮೂಲಕ ಪ್ರಾಣಿಗಳಿಗೆ ವರ್ಗಾವಣೆಯಾಗಬಹುದು, ಕೆಲವು ಹಂತದಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್-ಕೋಡಿಂಗ್ ಜೀನ್ ಅನ್ನು ಪಡೆದುಕೊಳ್ಳಬಹುದು. ಪರ್ಯಾಯವಾಗಿ, ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳು ಸಸ್ಯಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರಾಣಿಗಳೆರಡರಲ್ಲೂ ತಿಳಿದಿರುವುದರಿಂದ, ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳು ಸ್ವತಂತ್ರವಾಗಿ ಪ್ರಾಣಿಗಳ ವಂಶಾವಳಿಗಳಲ್ಲಿ ರೈಬೊಜೈವೈರಸ್ಗಳಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗಿರಬಹುದು. ವೈರೋಯಿಡ್ಗಳು ಮತ್ತು ಇತರ ವೈರಾಯ್ಡ್ ತರಹದ ಅಂಶಗಳು ರೆಟ್ರೋಜೈಮ್ಗಳಿಂದ ಒಮ್ಮೆ ಅಥವಾ ಹಲವಾರು ಬಾರಿ ಹೊರಹೊಮ್ಮಿವೆಯೇ ಎಂಬುದು ಅಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿದೆ, ಮತ್ತು ಅವು ಆರ್ಎನ್ಎ ಜಗತ್ತಿನಲ್ಲಿ ಪತ್ತೆಹಚ್ಚುವ ಸಾಧ್ಯತೆಯಿಲ್ಲದಿದ್ದರೂ, ಕೆಲವರು ಇನ್ನೂ ಕನಿಷ್ಠ ಪ್ರತಿಕೃತಿಗಳಾಗಿ ತಮ್ಮ ಪ್ರಾಮುಖ್ಯತೆಯನ್ನು ಒತ್ತಿಹೇಳುತ್ತಾರೆ. ಹ್ಯಾಮರ್ ಹೆಡ್ ರೈಬೋಸೈಮ್ ರೆಟ್ರೋಟ್ರಾನ್ಸ್ಪೋಸನ್ ರೈಬೋಸೈವಿರಿಯಾ ಸ್ಯಾಟಲೈಟ್ (ಬಯಾಲಜಿ) ವೈರಾಡ್ ವೈರಸ್ ರೆಫರೆನ್ಸ್ ಬಾಹ್ಯ ಕೊಂಡಿಗಳು ವೈರಾಡ್ ಡಿಬಿ, ವೈರಾಡ್ ಮತ್ತು ವೈರಾಡ್ ತರಹದ ವೃತ್ತಾಕಾರದ ಆರ್ಎನ್ಎಗಳ ಮೊಬೈಲ್ ಜೆನೆಟಿಕ್ ಅಂಶಗಳ ದತ್ತಸಂಚಯವನ್ನು ಸಹ ನೋಡಿ.