Thymoproteasome
ಥೈಮೋಪ್ರೊಟೀಸೋಮ್ ಒಂದು ವಿಶೇಷ ರೀತಿಯ ಪ್ರೋಟೀಸೋಮ್ ಆಗಿದ್ದು, ಇದು ಕಶೇರುಕಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ. ದೇಹದಲ್ಲಿ ಇದು ಥೈಮಸ್ನಲ್ಲಿ ಇದೆ, ಪ್ರತ್ಯೇಕವಾಗಿ ಕಾರ್ಟಿಕಲ್ ಥೈಮಿಕ್ ಎಪಿಥೀಲಿಯಲ್ ಕೋಶಗಳಲ್ಲಿ (ಸಿಟಿಇಸಿಗಳು) ಇದೆ. ಆದರೆ ಥೈಮಸ್ನಲ್ಲಿ ನಾವು ಥೈಮೋಸೈಟ್ಗಳು, ಡೆಂಡ್ರೈಟಿಕ್ ಕೋಶಗಳು ಮತ್ತು ಮೆಡ್ಯುಲರ್ ಥೈಮಿಕ್ ಎಪಿಥೀಲಿಯಲ್ ಕೋಶಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುವ ಇಮ್ಯುನೊಪ್ರೊಟೀಸೋಮ್ ಎಂಬ ಮತ್ತೊಂದು ರೀತಿಯ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪ್ರೋಟಿಸೋಮ್ ಅನ್ನು ಸಹ ಕಾಣಬಹುದು. ಇದನ್ನು ಮೊದಲ ಬಾರಿಗೆ 2007 ರಲ್ಲಿ ಮೌಸ್ ಜೀನೋಮ್ನಲ್ಲಿ ಪಿ. ಎಸ್. ಎಂ. ಬಿ. 5 ಲೋಕಸ್ಗೆ ಸಮೀಪದಲ್ಲಿರುವ ಅಂತರ್ನಿರ್ಮಿತವಲ್ಲದ ಅನುಕ್ರಮಕ್ಕಾಗಿ ಹುಡುಕಾಟದ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ವಿವರಿಸಲಾಗಿದೆ. ಪಿಎಸ್ಎಂಬಿ5 ಲೋಕಸ್ ಪ್ರಮಾಣಿತ β5 ಪ್ರೋಟೀಸೋಮ್ ಉಪಘಟಕವನ್ನು ಸಂಕೇತಿಸುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಈ ಅನುಕ್ರಮವು ಥೈಮೋಪ್ರೊಟೀಸೋಮ್ಗೆ ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾದ ರೂಪಾಂತರದ ಉಪಘಟಕ β5t (ಪಿಎಸ್ಎಂಬಿ11) ಅನ್ನು ಸಂಕೇತಿಸುತ್ತದೆ. ಈ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಂಕೀರ್ಣದ ಪ್ರಾಮುಖ್ಯತೆಯು ಟಿ ಕೋಶಗಳ ಧನಾತ್ಮಕ ಆಯ್ಕೆಯಲ್ಲಿ ಅದರ ಒಳಗೊಳ್ಳುವಿಕೆಯಾಗಿದೆ. ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಪ್ರೋಟೀಸೋಮ್ಗಳು ಜೀವಕೋಶಗಳಲ್ಲಿನ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಂಕೀರ್ಣಗಳಾಗಿವೆ, ಇದು ಯುಬಿಕ್ವಿಟಿನ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳಿಂದ ಗುರುತಿಸಲಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಕೆಳಮಟ್ಟಕ್ಕಿಳಿಸುತ್ತದೆ. ಪ್ರೋಟೀಸೋಮ್ಗಳು ಎಲ್ಲಾ ಯುಕಾರ್ಯೋಟ್ಗಳಲ್ಲಿ ಇರುತ್ತವೆ. ವಿಭಿನ್ನ ವೇಗವರ್ಧಕ ಉಪಘಟಕಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳು ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿವೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಲಾಗಿದೆ. ವಿವರಿಸಲಾದ ಮೊದಲ ವಿಧದ ಪ್ರೋಟೀಸೋಮ್ ಇಮ್ಯುನೊಪ್ರೊಟೀಸೋಮ್ ಆಗಿದೆ, ಇದು ಎಲ್ಲಾ ದವಡೆ ಕಶೇರುಕಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ. ಎಂ. ಎಚ್. ಸಿ. I ಸಂಕೀರ್ಣಕ್ಕೆ ಬಂಧಿಸಲಾದ ಪ್ಲಾಸ್ಮಾಟಿಕ್ ಮೆಂಬರೇನ್ನ ಮೇಲ್ಮೈಯಲ್ಲಿ ಪ್ರಸ್ತುತಪಡಿಸಲು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಕೆಳಮಟ್ಟಕ್ಕಿಳಿಸುವುದು ಇದರ ಕಾರ್ಯವಾಗಿದೆ. ಇಂಟರ್ಫೆರಾನ್ ಗಾಮಾ ಅಥವಾ ಇತರ ಉರಿಯೂತದ ಸೈಟೋಕಿನ್ಗಳಂತಹ ಉರಿಯೂತದ ಪ್ರಚೋದಕಗಳನ್ನು ಜೀವಕೋಶಗಳು ಪತ್ತೆ ಮಾಡಿದಾಗ ಇಮ್ಯುನೊಪ್ರೊಟೀಸೋಮ್ ಸಕ್ರಿಯಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಮುಂದಿನ ವಿಧವು ಥೈಮೋಪ್ರೊಟೀಸೋಮ್ ಆಗಿದೆ, ಇದು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳ ಅವನತಿಯಲ್ಲಿ ತೊಡಗಿದೆ, ಅದರ ತುಣುಕುಗಳನ್ನು ನಂತರ ಥೈಮಸ್ನಲ್ಲಿರುವ ಟಿ ಕೋಶಗಳಿಗೆ ನೀಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ಸ್ಟ್ರಕ್ಚರ್ ಪ್ರೋಟಿಯೋಸೋಮ್ಗಳು 20S ವೇಗವರ್ಧಕ ಕೋರ್ ಅನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ, ಇದು ಸ್ವತಃ ಆಲ್ಫಾ ಉಪಘಟಕಗಳ ಎರಡು ಹೊರಗಿನ ಉಂಗುರಗಳು ಮತ್ತು ಬೀಟಾ ಉಪಘಟಕಗಳ ಎರಡು ಒಳಗಿನ ಉಂಗುರಗಳಿಂದ ರಚಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ. ವೇಗವರ್ಧಕ ಚಟುವಟಿಕೆಯು β1, β2 ಮತ್ತು β5 ಉಪಘಟಕಗಳಿಂದ ಮಾತ್ರ ಹೊಂದಿಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಪ್ರೋಟೀಸೋಮ್ನ ಮೂಲ ವಿಧದಲ್ಲಿ ಈ ಉಪಘಟಕಗಳು ಅನುಕ್ರಮವಾಗಿ ಕ್ಯಾಸ್ಪೇಸ್, ಟ್ರಿಪ್ಸಿನ್ ತರಹದ ಮತ್ತು ಕೈಮೋಟ್ರಿಪ್ಸಿನ್ ತರಹದ ಚಟುವಟಿಕೆಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ಸಂಪೂರ್ಣ ಪ್ರೋಟೀಸೋಮ್ ಅನ್ನು ರೂಪಿಸಲು ಎರಡು 19S ನಿಯಂತ್ರಕ ಸಂಕೀರ್ಣಗಳನ್ನು 20S ಕೋರ್ ನ ಎರಡೂ ಬದಿಗಳಿಗೆ ಜೋಡಿಸಲಾಗಿದೆ. 26S ಎಂದು ವಿನ್ಯಾಸಗೊಳಿಸಲಾದ ಈ ಸಂಪೂರ್ಣ ಸಂಕೀರ್ಣವು ನಂತರ ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ. ಥೈಮೋಪ್ರೊಟೀಸೋಮ್ನಲ್ಲಿ ವೇಗವರ್ಧಕ ಉಪಘಟಕಗಳನ್ನು ಅವುಗಳ ರೂಪಾಂತರಗಳಾದ β1i, β2i ಮತ್ತು β5tಗಳಿಂದ ಬದಲಾಯಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಮೊದಲ ಎರಡು ಉಪಘಟಕಗಳು ಇಮ್ಯುನೊಪ್ರೊಟೀಸೋಮ್ನಲ್ಲಿಯೂ ಇರುತ್ತವೆ, ಆದರೆ ಕೊನೆಯದು ಥೈಮೋಪ್ರೊಟೀಸೋಮ್ಗೆ ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿದೆ. β5t ಉಪಘಟಕದ ಸಕ್ರಿಯ ಪ್ರೋಟಿಯೋಲಿಟಿಕ್ ಕೇಂದ್ರವು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಹೈಡ್ರೋಫಿಲಿಕ್ ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲದ ಅವಶೇಷಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ. ಇದಕ್ಕೆ ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿ, β5 ಮತ್ತು β5i ಎರಡೂ ಉಪಘಟಕಗಳು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿಕ್ ಅವಶೇಷಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ಈ ಬದಲಾವಣೆಯು ಅವುಗಳ ವಿಭಿನ್ನ ಪ್ರೋಟಿಯೋಲೈಟಿಕ್ ಚಟುವಟಿಕೆಗಳಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಹೀಗಾಗಿ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಪ್ರೋಟೀನ್ ತುಣುಕು ಉತ್ಪಾದನೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ. β5t ಉಪಘಟಕವು ವಿವಿಧ S1 ಪಾಕೆಟ್ಗಳನ್ನು ಸಹ ಸೃಷ್ಟಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಸಂಸ್ಕರಿಸಿದ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ನ C-ಟರ್ಮಿನಸ್ ಅನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸುತ್ತದೆ. ಇದು ಟ್ರಿಪ್ಸಿನ್ ತರಹದ ಮತ್ತು ಕ್ಯಾಸ್ಪೇಸ್ ತರಹದ ಚಟುವಟಿಕೆಗಳ ಮೇಲೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರದೆ ಕೈಮೋಟ್ರಿಪ್ಸಿನ್ ತರಹದ ಚಟುವಟಿಕೆಯಲ್ಲಿ ಇಳಿಕೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ. ಥೈಮೋಪ್ರೊಟೀಸೋಮ್ β5t ಉಪಘಟಕದ ಕಾರಣದಿಂದಾಗಿ ವಿವಿಧ ಅನುಕ್ರಮಗಳು ಮತ್ತು ಪೆಪ್ಟೈಡ್ಗಳ ಪ್ರಮಾಣವನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸುತ್ತದೆ. ಮೂಲ ಪ್ರೋಟೀಸೋಮ್ ವಂಶವಾಹಿಯ ನಕಲು ಮಾಡುವಿಕೆಯು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಉಪಘಟಕಗಳ (β5t/i) ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಬಹುಪಾಲು ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವಾಗಿದೆ. ಆ ಪ್ರತಿರೂಪಗಳು ಹೊಂದಾಣಿಕೆಯ ಪ್ರತಿರಕ್ಷೆಯ ಬೆಳವಣಿಗೆಯಲ್ಲಿ ಪಾತ್ರ ವಹಿಸಿರಬಹುದು. ಎಂ. ಎಚ್. ಸಿ. I ಸಂಕೀರ್ಣದಲ್ಲಿ ಪ್ರದರ್ಶಿಸಲು ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳನ್ನು ಪೆಪ್ಟೈಡ್ಗಳಿಗೆ ಬೇರ್ಪಡಿಸುವುದು ಥೈಮೋಪ್ರೊಟೀಸೋಮ್ನ ಕಾರ್ಯವಾಗಿದೆ. ಈ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ಗಳು ಸಿಡಿ8 + ಟಿ ಲಿಂಫೋಸೈಟ್ಗಳ ಧನಾತ್ಮಕ ಆಯ್ಕೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಥೈಮಸ್ನಲ್ಲಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ. ಥೈಮೋಪ್ರೊಟೀಸೋಮ್ ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ಸ್ವಯಂ, ಎಂ. ಎಚ್. ಸಿ-ಸಂಬಂಧಿತ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ಗಳನ್ನು ಅಥವಾ ದೇಹದ ಇತರ ಭಾಗಗಳಲ್ಲಿ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸುವ ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕ ಸ್ವಯಂ-ಪೆಪ್ಟೈಡ್ಗಳಿಗಿಂತ ಭಿನ್ನವಾಗಿರುವ ಸ್ವಯಂ-ಪೆಪ್ಟೈಡ್ಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. ಥೈಮೋಪ್ರೊಟೀಸೋಮ್ನ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲು β5t ಕೊರತೆಯಿರುವ ಇಲಿಗಳನ್ನು ಬಳಸಲಾಯಿತು. ಅಂತಹ ಇಲಿಗಳು ಆರೋಗ್ಯಕರ ಇಲಿಗಳಷ್ಟೇ ದೊಡ್ಡದಾದ ಥೈಮಸ್ಗಳನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದವು, ಆದರೆ ಅವುಗಳ ಸಿಟಿಇಸಿಗಳು ಇನ್ನು ಮುಂದೆ ಥೈಮೋಪ್ರೊಟೀಸೋಮ್ಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರಲಿಲ್ಲ. ಈ ಇಲಿಗಳಲ್ಲಿ ಇದನ್ನು ಇಮ್ಯುನೊಪ್ರೊಟೀಸೋಮ್ನಿಂದ ಬದಲಾಯಿಸಲಾಯಿತು, ಇದು ಅದರ ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಸಾಕಷ್ಟು ಪುನರಾವರ್ತಿಸಲಿಲ್ಲ. ಇದು ನಂತರ ಅವರ ಸಿಡಿ8 + ಟಿ ಲಿಂಫೋಸೈಟ್ಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯನ್ನು ಸುಮಾರು 20 ಪ್ರತಿಶತದಷ್ಟು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡಿತು, ಇದು ಟಿ ಜೀವಕೋಶದ ಬೆಳವಣಿಗೆಯಲ್ಲಿ ಥೈಮೋಪ್ರೊಟೀಸೋಮ್ನ ಪ್ರಮುಖ ಪಾತ್ರವನ್ನು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಫಾಕ್ಸ್ಎನ್-1 ವಂಶವಾಹಿಯ ಕೊರತೆಯಿರುವ ನಗ್ನ ಇಲಿಗಳ ನಾಕ್ಔಟ್ ಮಾದರಿಯಲ್ಲಿ, ಥಾಮಸ್ನಲ್ಲಿ β5tನ ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿಯಲ್ಲಿ ಫಾಕ್ಸ್ಎನ್1 ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶವು ಒಳಗೊಂಡಿರುವುದು ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿದೆ. ಇದರ ಪ್ರವರ್ತಕವು (5′-ACGC-3′ ಅನುಕ್ರಮದೊಂದಿಗೆ) ಫಾಕ್ಸ್ಎನ್1 ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಕ್ಕೆ ಹೆಚ್ಚು ಸಂರಕ್ಷಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ. ಈ ಪ್ರವರ್ತಕದಲ್ಲಿನ ರೂಪಾಂತರವು β5t ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮತ್ತು CD8 + T ಕೋಶಗಳ ಉತ್ಪಾದನೆಯಲ್ಲಿ ಇಳಿಕೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ. ಥೈಮಿಕ್ ಎಪಿಥೀಲಿಲಾಲ್ ಗೆಡ್ಡೆಗಳ ರೋಗನಿರ್ಣಯದಲ್ಲಿ β5t ಸಬ್ಯೂನಿಟ್ ಥೈಮಿಕ್ ಎಪಿಥೀಲಿಯಲ್ ಗೆಡ್ಡೆಗಳು ಆರು ವರ್ಗಗಳ (ಎ, ಎಬಿ, ಬಿ 1, ಬಿ 2, ಬಿ 3 ಮತ್ತು ಸಿ) ಗುಂಪನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತವೆ, ಅವು ಅದರ ಹಿಸ್ಟಾಲಜಿ ಮತ್ತು ರೂಪವಿಜ್ಞಾನವನ್ನು ಆಧರಿಸಿವೆ. ಆ ಗೆಡ್ಡೆಗಳ ರೋಗನಿರ್ಣಯವು ಸಮಸ್ಯಾತ್ಮಕವಾಗಿದೆ ಏಕೆಂದರೆ ಅವುಗಳ ವಿರಳತೆ ಮತ್ತು ಸೈಟೋಲಾಜಿಕಲ್ ಮತ್ತು ರಚನಾತ್ಮಕ ಮಾದರಿಗಳಲ್ಲಿನ ವ್ಯತ್ಯಾಸದಿಂದಾಗಿ. ಮೇಲೆ ತಿಳಿಸಿದ ಫಾಕ್ಸ್ ಎನ್ 1 ಅನ್ನು ಮಾರ್ಕರ್ ಆಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತಿತ್ತು, ಆದರೆ ಇದು ಶ್ವಾಸಕೋಶದ ಕಾರ್ಸಿನೋಮ್ನಂತಹ ಇತರ ಗೆಡ್ಡೆಗಳಲ್ಲಿ ಕಾಣಿಸಿಕೊಳ್ಳುವ ಸಮಸ್ಯೆಯಿದೆ. β5t ಉಪಘಟಕದ ಇತ್ತೀಚಿನ ಸಂಶೋಧನೆಯು ಇದನ್ನು ಥೈಮಿಕ್ ಎಪಿಥೀಲಿಯಲ್ ಗೆಡ್ಡೆಗಳ ಕೆಲವು ವರ್ಗಗಳ ರೋಗನಿರ್ಣಯದ ಗುರುತುಗಳಾಗಿ ಬಳಸಬಹುದು ಎಂದು ತೋರಿಸಿದೆ. β5t ಉಪಘಟಕವು ಬಿ ವಿಧದ ಗೆಡ್ಡೆಗಳಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚು ವ್ಯಕ್ತವಾಗುತ್ತದೆ, ಎ. ಬಿ. ಯಲ್ಲಿ ಕಡಿಮೆ ಮತ್ತು ಎ ಪ್ರಕಾರದಲ್ಲಿ ವ್ಯಕ್ತವಾಗುವುದಿಲ್ಲ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಂಕೀರ್ಣಗಳು