ORF9c
ಒಆರ್ಎಫ್9ಸಿ (ಹಿಂದೆ ಒಆರ್ಎಫ್14 ಎಂದೂ ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತಿತ್ತು) ಎಂಬುದು ಸರ್ಬೆಕೊವೈರಸ್ ಉಪಜಾತಿಯ ಕೊರೊನಾವೈರಸ್ ಜೀನೋಮ್ಗಳಲ್ಲಿನ ಓಪನ್ ರೀಡಿಂಗ್ ಫ್ರೇಮ್ (ಒಆರ್ಎಫ್) ಆಗಿದೆ. ಇದು ಸಾರ್ಸ್-ಕೋವ್-2 ಜೀನೋಮ್ನಲ್ಲಿ 73 ಕೋಡಾನ್ಗಳಷ್ಟು ಉದ್ದವಾಗಿದೆ. ಇದನ್ನು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಸರ್ಬೆಕೊವೈರಸ್ ವೈರಲ್ ಆಕ್ಸೆಸರಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಜೀನ್ಗಳ ಪಟ್ಟಿಗಳಲ್ಲಿ ಸೇರಿಸಲಾಗಿದೆಯಾದರೂ, ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಮತ್ತು ಜೈವಿಕ ಮಾಹಿತಿಯ ಪುರಾವೆಗಳು ಒಆರ್ಎಫ್9ಸಿ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಪ್ರೋಟೀನ್-ಕೋಡಿಂಗ್ ಜೀನ್ ಆಗಿರಬಾರದು ಎಂದು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ. ವೈಜ್ಞಾನಿಕ ಸಾಹಿತ್ಯದಲ್ಲಿ ಈ ವಂಶವಾಹಿಗೆ ಬಳಸಲಾದ ನಾಮಕರಣದಲ್ಲಿ ಅಸಮಂಜಸತೆ ಕಂಡುಬಂದಿದೆ. SARS-CoV ಕುರಿತ ಕೆಲವು ಸಂಶೋಧನೆಗಳಲ್ಲಿ, ಇದನ್ನು ORF14 ಎಂದು ಉಲ್ಲೇಖಿಸಲಾಗಿದೆ. ಇದನ್ನು ಕೆಲವೊಮ್ಮೆ ಒಆರ್ಎಫ್9ಬಿ ಎಂದು ಕರೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಅದರ ಉದ್ದವಾದ ಅಪ್ಸ್ಟ್ರೀಮ್ ನೆರೆಯ ಒಆರ್ಎಫ್9ಬಿಗೆ ಒಆರ್ಎಫ್9ಎ ಎಂಬ ಹೆಸರನ್ನು ನೀಡಲಾಯಿತು. ಪ್ರಸ್ತುತ ಶಿಫಾರಸು ಮಾಡಲಾದ ನಾಮಕರಣವು ಈ ವಂಶವಾಹಿಯನ್ನು ಒಆರ್ಎಫ್9ಸಿ ಎಂದು ಮತ್ತು ಅಪ್ಸ್ಟ್ರೀಮ್ ವಂಶವಾಹಿಯನ್ನು ಒಆರ್ಎಫ್9ಬಿ ಎಂದು ಉಲ್ಲೇಖಿಸುತ್ತದೆ. ಅಭಿವ್ಯಕ್ತಿ ಮತ್ತು ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳು ಒಆರ್ಎಫ್9ಸಿ ಎನ್ ಜೀನ್ ಎನ್ಕೋಡಿಂಗ್ ಕೊರೊನಾವೈರಸ್ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೊಕ್ಯಾಪ್ಸಿಡ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ನ ತೆರೆದ ಓದುವ ಚೌಕಟ್ಟಿನೊಳಗೆ ಸಂಪೂರ್ಣವಾಗಿ ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಎರಡು ಅತಿಕ್ರಮಿಸುವ ಜೀನ್ಗಳಲ್ಲಿ ಒಂದಾಗಿದೆ, ಇನ್ನೊಂದು ಒಆರ್ಎಫ್9ಬಿ ಆಗಿದೆ. SARS-CoV-2 ಸೋಂಕಿನ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ORF9c ಅನ್ನು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕವಾಗಿ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಲಾಗುತ್ತದೆಯೇ ಎಂಬುದು ಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿಲ್ಲ; ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ಇದನ್ನು ಅನುವಾದಿಸಲಾಗಿಲ್ಲ ಎಂದು ವರದಿಯಾಗಿದೆ. ಪ್ರಾಯೋಗಿಕವಾಗಿ ಅತಿಯಾಗಿ ವ್ಯಕ್ತಪಡಿಸಿದಾಗ, ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸಿಗ್ಮಾ ಗ್ರಾಹಕಗಳೊಂದಿಗೆ ಮತ್ತು ಎನ್ಎಫ್-ಕೆಬಿ ಮಾರ್ಗದೊಂದಿಗೆ ಸಂವಹನ ನಡೆಸುತ್ತದೆ. SARS-CoV ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೈಮರ್ ಅಥವಾ ಹೈಯರ್-ಆರ್ಡರ್ ಆಲಿಗೋಮರ್ ರಚನೆಯನ್ನು ಸೂಚಿಸುವ ಸ್ವಯಂ-ಸಂವಹನಗಳನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ. ಎವಲ್ಯೂಷನ್ ಒಆರ್ಎಫ್9ಸಿ, ಸಾರ್ಸ್-ಕೋವ್ ಮತ್ತು ಸಾರ್ಸ್-ಕೋವ್-2 ನಡುವೆ ಸುಮಾರು 74 ಪ್ರತಿಶತ ಅನುಕ್ರಮ ಗುರುತನ್ನು ಹೊಂದಿದೆ. SARS-CoV-2 ರೂಪಾಂತರಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದರಲ್ಲಿ ಅಕಾಲಿಕ ಸ್ಟಾಪ್ ಕೋಡಾನ್ಗಳನ್ನು ಪರಿಚಯಿಸಲಾಗಿದೆ ಅಥವಾ ಅದರ ಪ್ರಾರಂಭದ ಕೋಡಾನ್ ಎಲ್ಲಿ ಕಳೆದುಹೋಗಿದೆ, ಮತ್ತು ಅಮೈನೊ ಆಸಿಡ್ ಅನುಕ್ರಮವನ್ನು ಕಳಪೆಯಾಗಿ ಸಂರಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ, ಇದು ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಅನ್ನು ಎನ್ಕೋಡ್ ಮಾಡುವುದಿಲ್ಲ ಎಂಬ ಊಹೆಯನ್ನು ಬೆಂಬಲಿಸುತ್ತದೆ. ಉಲ್ಲೇಖಗಳು ಕೊರೊನಾವೈರಸ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ಗಳು