ArrayTrack
অ্যারেট্র্যাক একটি বহুমুখী বায়োইনফরমেটিক্স টুল যা প্রাথমিকভাবে মাইক্রো অ্যারে ডেটা ম্যানেজমেন্ট, বিশ্লেষণ এবং ব্যাখ্যার জন্য ব্যবহৃত হয়। অ্যারেট্র্যাক 2001 সালে মার্কিন খাদ্য ও ওষুধ প্রশাসনের জন্য অভ্যন্তরীণ ফিল্টার অ্যারে গবেষণা সমর্থন করার জন্য তৈরি করা হয়েছিল এবং 2003 সালে মাইক্রোএরেগুলির জন্য একটি সমন্বিত গবেষণা সরঞ্জাম হিসাবে জনসাধারণের জন্য অবাধে উপলব্ধ করা হয়েছিল। তারপর থেকে, অ্যারেট্র্যাকের প্রতি বছর গড়ে প্রায় 5,000 ব্যবহারকারী রয়েছে। ন্যাশনাল সেন্টার ফর টক্সিকোলজিকাল রিসার্চ দ্বারা এটি নিয়মিত আপডেট করা হয়। বৈশিষ্ট্য অ্যারেট্র্যাক তিনটি প্রধান উপাদান নিয়ে গঠিতঃ স্টাডি ডেটাবেস, টুলস এবং লাইব্রেরি, যা যথাক্রমে প্রাথমিকভাবে তথ্য ব্যবস্থাপনা, বিশ্লেষণ এবং ব্যাখ্যা পরিচালনা করে। এই উপাদানগুলির প্রত্যেকটি অন্য দুটি থেকে সরাসরি অ্যাক্সেস করা যেতে পারে, উদাহরণস্বরূপ, বিশ্লেষণ সরঞ্জামগুলি অধ্যয়ন ডাটাবেসে সঞ্চিত পরীক্ষামূলক তথ্যগুলিতে সরাসরি ব্যবহার করা যেতে পারে এবং ফলাফলগুলি থেকে আবিষ্কৃত উল্লেখযোগ্য জিনগুলি অতিরিক্ত টীকা এবং সম্পর্কিত প্রোটিন, পথ, জিন অন্টোলজি শর্তাবলী ইত্যাদি দেখার জন্য গ্রন্থাগারে জিজ্ঞাসা করা যেতে পারে। স্টাডি ডেটাবেসঃ স্টাডি ডেটাবেসে ব্যবহারকারী-আমদানিকৃত পরীক্ষার ডেটা রয়েছে, যার মধ্যে কাঁচা ডেটা এবং টীকা ডেটা উভয়ই রয়েছে। এটি মূলত মাইক্রো অ্যারে ডেটা পরিচালনা করতে ব্যবহৃত হয়, তবে প্রোটিওমিক্স এবং মেটাবোলোমিক্স ডেটা সমর্থন করে। আমদানি করা তথ্য প্রাথমিকভাবে মালিকের কাছে ব্যক্তিগত তবে অন্যান্য ব্যবহারকারীদের জন্য উপলব্ধ করা যেতে পারে। স্টাডি ডেটাবেস উল্লেখযোগ্য জিন তালিকাও সংরক্ষণ করে, যা সরাসরি অ্যারেট্র্যাকের তথ্য বিশ্লেষণের ফলাফল থেকে তৈরি করা যেতে পারে। সরঞ্জামঃ অ্যারেট্র্যাকে বিভিন্ন ধরনের বিশ্লেষণ এবং ভিজ্যুয়ালাইজেশন সরঞ্জাম পাওয়া যায়, যার মধ্যে রয়েছে টি-টেস্ট, এ. এন. ও. ভি. এ এবং এস. এ. এম-টেস্ট সহ পরিসংখ্যানগত বিশ্লেষণ সরঞ্জাম; শ্রেণিবদ্ধ ক্লাস্টারিং বিশ্লেষণ এবং প্রধান উপাদান বিশ্লেষণ সহ তত্ত্বাবধানহীন প্যাটার্ন আবিষ্কার সরঞ্জাম; এবং কে-নিকটতম প্রতিবেশী এবং রৈখিক বৈষম্যমূলক বিশ্লেষণ সহ মডেল ভবিষ্যদ্বাণী সরঞ্জাম। যদিও অ্যারেট্র্যাকের সরঞ্জামগুলি আমদানি করা ডেটা সামঞ্জস্য করার জন্য ডিজাইন করা হয়েছে, তবে এগুলি বাহ্যিক ডেটার সাথেও সামঞ্জস্যপূর্ণ। গ্রন্থাগারঃ অ্যারেট্র্যাক গ্রন্থাগারগুলির একটি সংগ্রহ হোস্ট করে যা নির্দিষ্ট টীকা তথ্য সংরক্ষণ করে, যা একটি গতিশীল স্প্রেডশীট বিন্যাসে দেখা যায়। জিন, প্রোটিন, পথ, জিন অন্টোলজি শর্তাবলী, রাসায়নিক যৌগ, এসএনপি, কিউটিএল, চিপের প্রকার এবং আরও অনেক কিছুর জন্য একটি নির্দিষ্ট গ্রন্থাগার রয়েছে। প্রতিটি গ্রন্থাগার মাল্টি-ইনপুট অনুসন্ধান, বাছাই, ফিল্টারিং, কপি-পেস্টিং এবং রপ্তানি সমর্থন করে। গ্রন্থাগারগুলিকে সংরক্ষিত জিন তালিকা, বিশ্লেষণের ফলাফল এবং অন্যান্য গ্রন্থাগারগুলির কাঙ্ক্ষিত বিষয়বস্তুর জন্য সরাসরি জিজ্ঞাসা করা যেতে পারে। যে কোনও গ্রন্থাগারে একটি নির্দিষ্ট এন্ট্রি তথ্যের মূল উৎস সহ অনেক জনপ্রিয় পাবলিক জ্ঞানের ভিত্তিতে সমতুল্য এন্ট্রির সাথে যুক্ত করা যেতে পারে। অ্যারেট্র্যাক সরাসরি অন্যান্য বায়োইনফরম্যাটিক্স সফ্টওয়্যারের সাথে সংহত করা হয়েছে, যেমন পাথওয়ে বিশ্লেষণ সরঞ্জাম জেনেগো মেটাকোর এবং ইনজেনুইটি পাথওয়ে বিশ্লেষণ। অ্যাক্সেসিবিলিটি অ্যারেট্র্যাক জনসাধারণের জন্য বিনামূল্যে উপলব্ধ এবং অনলাইনে অ্যাক্সেস করা যায়। এটি জাভা-ভিত্তিক ইন্টারফেস ব্যবহার করে ক্লায়েন্টের কম্পিউটারে চালানো হয় যা এফডিএ দ্বারা হোস্ট করা ওরাকল ডাটাবেসের সাথে সংযুক্ত। একটি জাভা-ভিত্তিক অ্যাপ্লিকেশন হিসাবে, অ্যারেট্র্যাক উইন্ডোজ, ম্যাক এবং লিনাক্স মেশিনের সাথে সামঞ্জস্যপূর্ণ। রেফারেন্স বাহ্যিক লিঙ্ক অ্যারেট্র্যাক প্রধান পাতা বায়োইনফরম্যাটিক্স সফ্টওয়্যার মাইক্রোএরে