Protein folding
প্রোটিন ভাঁজ হল একটি শারীরিক প্রক্রিয়া যেখানে একটি প্রোটিন শৃঙ্খল তার স্থানীয় ত্রিমাত্রিক কাঠামোতে রূপান্তরিত হয়, সাধারণত একটি "ভাঁজ" গঠন, যার দ্বারা প্রোটিন জৈবিকভাবে কার্যকরী হয়ে ওঠে। একটি দ্রুত এবং পুনরুত্পাদনযোগ্য প্রক্রিয়ার মাধ্যমে, একটি পলিপেপটাইড একটি এলোমেলো কুণ্ডলী থেকে তার বৈশিষ্ট্যযুক্ত ত্রিমাত্রিক কাঠামোতে ভাঁজ হয়ে যায়। এম. আর. এন. এ-র একটি ক্রম থেকে অ্যামিনো অ্যাসিডের একটি রৈখিক শৃঙ্খলে রূপান্তরিত হওয়ার পরে প্রতিটি প্রোটিন প্রথমে একটি অনাবৃত পলিপেপটাইড বা এলোমেলো কুণ্ডলী হিসাবে বিদ্যমান থাকে। এই পর্যায়ে, পলিপেপটাইডের কোনও স্থিতিশীল (অর্থাৎ দীর্ঘস্থায়ী) ত্রিমাত্রিক কাঠামোর অভাব রয়েছে (প্রথম চিত্রের বাম দিকটি দেখুন)। পলিপেপটাইড শৃঙ্খলটি একটি রাইবোজোম দ্বারা সংশ্লেষিত হওয়ার সাথে সাথে রৈখিক শৃঙ্খলটি তার ত্রিমাত্রিক কাঠামোতে ভাঁজ হতে শুরু করে। পলিপেপটাইড শৃঙ্খলের রূপান্তরের সময়ও অনেক প্রোটিনের ভাঁজ শুরু হয়। অ্যামিনো অ্যাসিডগুলি একে অপরের সাথে মিথস্ক্রিয়া করে একটি সুনির্দিষ্ট ত্রিমাত্রিক কাঠামো তৈরি করে, ভাঁজ করা প্রোটিন (চিত্রের ডান দিকটি দেখুন), যা স্থানীয় অবস্থা হিসাবে পরিচিত। ফলস্বরূপ ত্রিমাত্রিক কাঠামো অ্যামিনো-অ্যাসিড ক্রম বা প্রাথমিক কাঠামো দ্বারা নির্ধারিত হয় (যেমন, আনফিনসেনের মতবাদ)। সঠিক ত্রিমাত্রিক কাঠামো কার্যকারিতার জন্য অপরিহার্য, যদিও কার্যকরী প্রোটিনের কিছু অংশ উন্মুক্ত থাকতে পারে, যা নির্দেশ করে যে প্রোটিন গতিবিদ্যা গুরুত্বপূর্ণ। স্থানীয় কাঠামোর মধ্যে ভাঁজ করতে ব্যর্থ হলে সাধারণত নিষ্ক্রিয় প্রোটিন তৈরি হয়, তবে কিছু ক্ষেত্রে, ভুল ভাঁজ করা প্রোটিনগুলির পরিবর্তিত বা বিষাক্ত কার্যকারিতা থাকে। বেশ কয়েকটি নিউরোডিজেনারেটিভ এবং অন্যান্য রোগগুলি ভুল ভাঁজ করা প্রোটিন দ্বারা গঠিত অ্যামাইলয়েড ফাইব্রিলের সঞ্চয়ের ফলে হয় বলে মনে করা হয়, যার সংক্রামক জাতগুলি প্রিওন নামে পরিচিত। অনেক অ্যালার্জি কিছু প্রোটিনের ভুল ভাঁজ হওয়ার কারণে হয় কারণ ইমিউন সিস্টেম নির্দিষ্ট প্রোটিন কাঠামোর জন্য অ্যান্টিবডি তৈরি করে না। প্রোটিনের বিকৃতি হল একটি ভাঁজ থেকে একটি অনাবৃত অবস্থায় রূপান্তরের প্রক্রিয়া। এটি রান্না, পোড়া, প্রোটিনপ্যাথি এবং অন্যান্য প্রসঙ্গে ঘটে। ভাঁজ প্রক্রিয়াটির সময়কাল আগ্রহের প্রোটিনের উপর নির্ভর করে নাটকীয়ভাবে পরিবর্তিত হয়। কোষের বাইরে অধ্যয়ন করার সময়, ধীরতম ভাঁজ হওয়া প্রোটিনগুলিকে ভাঁজ করতে অনেক মিনিট বা ঘন্টা সময় লাগে, প্রাথমিকভাবে প্রোলিন আইসোমেরাইজেশনের কারণে, এবং প্রক্রিয়াটি সম্পূর্ণ হওয়ার আগে চেকপয়েন্টের মতো বেশ কয়েকটি মধ্যবর্তী অবস্থার মধ্য দিয়ে যেতে হয়। অন্যদিকে, একশো অ্যামিনো অ্যাসিড পর্যন্ত দৈর্ঘ্যের খুব ছোট একক-ডোমেন প্রোটিন সাধারণত একটি ধাপে ভাঁজ হয়। মিলিসেকেন্ডের সময় স্কেলগুলি আদর্শ, এবং দ্রুততম পরিচিত প্রোটিন ভাঁজ প্রতিক্রিয়া কয়েক মাইক্রোসেকেন্ডের মধ্যে সম্পূর্ণ হয়। একটি প্রোটিনের ভাঁজ সময় স্কেল তার আকার, যোগাযোগের ক্রম এবং সার্কিট টপোলজির উপর নির্ভর করে। 1960-এর দশকের শেষের দিক থেকে গণনামূলক জীববিজ্ঞানের জন্য প্রোটিন ভাঁজ করার প্রক্রিয়াটি বোঝা এবং অনুকরণ করা একটি গুরুত্বপূর্ণ চ্যালেঞ্জ হয়ে দাঁড়িয়েছে। প্রোটিন ভাঁজ করার প্রক্রিয়া প্রাথমিক কাঠামো একটি প্রোটিনের প্রাথমিক কাঠামো, তার রৈখিক অ্যামিনো-অ্যাসিড ক্রম, তার স্থানীয় গঠন নির্ধারণ করে। নির্দিষ্ট অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশ এবং পলিপেপটাইড শৃঙ্খলে তাদের অবস্থান নির্ধারণকারী কারণগুলির জন্য প্রোটিনের কোন অংশগুলি ঘনিষ্ঠভাবে ভাঁজ করে এবং তার ত্রিমাত্রিক গঠন গঠন করে। অ্যামিনো অ্যাসিডের গঠন ক্রমের মতো গুরুত্বপূর্ণ নয়। ভাঁজ করার অপরিহার্য সত্যটি অবশ্য রয়ে গেছে যে প্রতিটি প্রোটিনের অ্যামিনো অ্যাসিড সিকোয়েন্সে এমন তথ্য থাকে যা স্থানীয় কাঠামো এবং সেই অবস্থা অর্জনের পথ উভয়ই নির্দিষ্ট করে। এর অর্থ এই নয় যে প্রায় অভিন্ন অ্যামিনো অ্যাসিড সিকোয়েন্স সবসময় একইভাবে ভাঁজ হয়। পরিবেশগত কারণগুলির উপর ভিত্তি করেও গঠনগুলি পৃথক হয়; অনুরূপ প্রোটিনগুলি কোথায় পাওয়া যায় তার উপর ভিত্তি করে আলাদাভাবে ভাঁজ হয়। একটি গৌণ কাঠামো গঠন হল ভাঁজ প্রক্রিয়ার প্রথম ধাপ যা একটি প্রোটিন তার স্থানীয় কাঠামো ধরে নিতে নেয়। গৌণ কাঠামোর বৈশিষ্ট্য হল আলফা হেলিসেস এবং বিটা শীট নামে পরিচিত কাঠামো যা দ্রুত ভাঁজ হয় কারণ তারা আন্তঃআণবিক হাইড্রোজেন বন্ধন দ্বারা স্থিতিশীল হয়, যেমনটি প্রথম লিনাস পলিং দ্বারা চিহ্নিত করা হয়েছিল। আন্তঃআণবিক হাইড্রোজেন বন্ধন গঠন প্রোটিন স্থায়িত্বে আরেকটি গুরুত্বপূর্ণ অবদান প্রদান করে। α-হেলিসগুলি মেরুদণ্ডের হাইড্রোজেন বন্ধন দ্বারা একটি সর্পিল আকৃতি তৈরি করে (ডানদিকে চিত্রটি দেখুন)। β প্লিটেড শীট এমন একটি কাঠামো যা হাইড্রোজেন বন্ধন গঠনের জন্য মেরুদণ্ডের নিজের উপর বাঁক নিয়ে গঠিত হয় (যেমনটি বাম দিকের চিত্রে প্রদর্শিত হয়েছে)। হাইড্রোজেন বন্ধনগুলি পেপটাইড বন্ধনের অ্যামাইড হাইড্রোজেন এবং কার্বনিল অক্সিজেনের মধ্যে থাকে। সমান্তরাল β প্লিটেড শীট এবং সমান্তরাল β প্লিটেড শীট রয়েছে যেখানে সমান্তরাল β শীটে হাইড্রোজেন বন্ডের স্থায়িত্ব আরও শক্তিশালী কারণ এটি সমান্তরাল শীট দ্বারা গঠিত তির্যক হাইড্রোজেন বন্ডের তুলনায় আদর্শ 180 ডিগ্রি কোণের সাথে হাইড্রোজেন বন্ড। তৃতীয় কাঠামো α-হেলিস এবং β-শীটগুলি সাধারণত অ্যাম্ফিপ্যাথিক, যার অর্থ তাদের একটি হাইড্রোফিলিক এবং একটি হাইড্রোফোবিক অংশ রয়েছে। এই ক্ষমতা একটি প্রোটিনের তৃতীয় কাঠামো গঠনে সহায়তা করে যেখানে ভাঁজ ঘটে যাতে হাইড্রোফিলিক দিকগুলি প্রোটিনের চারপাশে জলীয় পরিবেশের মুখোমুখি হয় এবং হাইড্রোফোবিক দিকগুলি প্রোটিনের হাইড্রোফোবিক কোরের মুখোমুখি হয়। পর্যায়ক্রমিকভাবে গৌণ কাঠামো তৃতীয় পর্যায়ের কাঠামো গঠনের পথ তৈরি করে। একবার হাইড্রোফোবিক মিথস্ক্রিয়া দ্বারা প্রোটিনের তৃতীয় কাঠামো গঠিত এবং স্থিতিশীল হয়ে গেলে, দুটি সিস্টিন অবশিষ্টাংশের মধ্যে গঠিত ডাইসালফাইড সেতুর আকারে সমযোজী বন্ধনও থাকতে পারে। এই অ-সমযোজী এবং সমযোজী যোগাযোগগুলি একটি প্রোটিনের স্থানীয় কাঠামোতে একটি নির্দিষ্ট টপোলজিকাল ব্যবস্থা গ্রহণ করে। একটি প্রোটিনের তৃতীয় কাঠামোতে একটি একক পলিপেপটাইড চেইন জড়িত থাকে; তবে, ভাঁজ করা পলিপেপটাইড চেইনের অতিরিক্ত মিথস্ক্রিয়া কোয়াটারনারি কাঠামো গঠনের জন্ম দেয়। কোয়াটারনারি স্ট্রাকচার টারশিয়ারি স্ট্রাকচার কিছু প্রোটিনে কোয়াটারনারি স্ট্রাকচার গঠনের পথ তৈরি করতে পারে, যা সাধারণত ইতিমধ্যেই ভাঁজ হয়ে যাওয়া সাবইউনিটের "অ্যাসেম্বলি" বা "কো-অ্যাসেম্বলি" জড়িত; অন্য কথায়, একাধিক পলিপেপটাইড চেইন একটি সম্পূর্ণ কার্যকরী কোয়াটারনারি প্রোটিন গঠনের জন্য ইন্টারঅ্যাক্ট করতে পারে। প্রোটিন ভাঁজ করার চালিকা শক্তি একটি স্বতঃস্ফূর্ত প্রক্রিয়া যা মূলত হাইড্রোফোবিক মিথস্ক্রিয়া, আন্তঃআণবিক হাইড্রোজেন বন্ধন গঠন, ভ্যান ডার ওয়ালস বল দ্বারা পরিচালিত হয় এবং এটি গঠনমূলক এনট্রপি দ্বারা বিরোধিতা করা হয়। ভাঁজ করার প্রক্রিয়াটি প্রায়শই সহ-অনুবাদমূলকভাবে শুরু হয়, যাতে প্রোটিনের এন-টার্মিনাস ভাঁজ হতে শুরু করে যখন প্রোটিনের সি-টার্মিনাল অংশটি রাইবোজোম দ্বারা সংশ্লেষিত হচ্ছে; তবে, একটি প্রোটিন অণু জৈব সংশ্লেষণের সময় বা পরে স্বতঃস্ফূর্তভাবে ভাঁজ হতে পারে। যদিও এই ম্যাক্রোমোলিকুলগুলিকে "নিজেদের ভাঁজ করা" হিসাবে বিবেচনা করা যেতে পারে, প্রক্রিয়াটি দ্রাবক (জল বা লিপিড দ্বিস্তরীয়), লবণের ঘনত্ব, পিএইচ, তাপমাত্রা, কোফ্যাক্টর এবং আণবিক চ্যাপেরোনগুলির সম্ভাব্য উপস্থিতির উপরও নির্ভর করে। সীমাবদ্ধ বাঁকানো কোণ বা সম্ভাব্য গঠন দ্বারা প্রোটিনের ভাঁজ করার ক্ষমতার সীমাবদ্ধতা থাকবে। প্রোটিন ভাঁজ করার এই অনুমোদিত কোণগুলি রামচন্দ্রন প্লট নামে পরিচিত একটি দ্বি-মাত্রিক প্লট দিয়ে বর্ণনা করা হয়েছে, যা অনুমোদিত ঘূর্ণনের সাই এবং ফাই কোণ দিয়ে চিত্রিত করা হয়েছে। হাইড্রোফোবিক প্রভাব প্রোটিন ভাঁজ একটি স্বতঃস্ফূর্ত প্রতিক্রিয়া হওয়ার জন্য একটি কোষের মধ্যে তাপগতিবিদ্যার অনুকূল হতে হবে। যেহেতু এটি জানা যায় যে প্রোটিন ভাঁজ একটি স্বতঃস্ফূর্ত প্রতিক্রিয়া, তাই এটি অবশ্যই একটি ঋণাত্মক গিবস মুক্ত শক্তি মান ধরে নিতে হবে। প্রোটিন ভাঁজ করার ক্ষেত্রে গিবস মুক্ত শক্তি সরাসরি এনথালপি এবং এনট্রপির সাথে সম্পর্কিত। একটি ঋণাত্মক ব-দ্বীপ জি উদ্ভূত হওয়ার জন্য এবং প্রোটিন ভাঁজ তাপগতিবিদ্যার পক্ষে অনুকূল হওয়ার জন্য, এনথালপি, এনট্রপি বা উভয় পদই অনুকূল হতে হবে। জলের সংস্পর্শে আসা হাইড্রোফোবিক পার্শ্ব-শৃঙ্খলের সংখ্যা হ্রাস করা ভাঁজ প্রক্রিয়াটির পিছনে একটি গুরুত্বপূর্ণ চালিকা শক্তি। হাইড্রোফোবিক প্রভাব হল এমন একটি ঘটনা যেখানে একটি প্রোটিনের হাইড্রোফোবিক চেইন প্রোটিনের মূল অংশে (হাইড্রোফিলিক পরিবেশ থেকে দূরে) ভেঙে যায়। জলীয় পরিবেশে, জলের অণুগুলি হাইড্রোফোবিক অঞ্চল বা প্রোটিনের পার্শ্ব শৃঙ্খলের চারপাশে একত্রিত হয়, যা ক্রমযুক্ত জলের অণুগুলির জলের খোল তৈরি করে। একটি হাইড্রোফোবিক অঞ্চলের চারপাশে জলের অণুগুলির ক্রম একটি সিস্টেমে ক্রম বৃদ্ধি করে এবং তাই এনট্রপিতে নেতিবাচক পরিবর্তন (সিস্টেমে কম এনট্রপি) অবদান রাখে। জলের অণুগুলি এই জলের খাঁচাগুলিতে স্থির থাকে যা হাইড্রোফোবিক পতন বা হাইড্রোফোবিক গোষ্ঠীর অভ্যন্তরীণ ভাঁজকে চালিত করে। হাইড্রোফোবিক পতন জলের খাঁচাগুলি ভেঙে দেওয়ার মাধ্যমে সিস্টেমে এনট্রপির প্রবর্তন করে যা অর্ডার করা জলের অণুগুলিকে মুক্ত করে। গ্লোবুলার ভাঁজ করা প্রোটিনের মূল অংশের মধ্যে মিথস্ক্রিয়া করা প্রচুর হাইড্রোফোবিক গ্রুপগুলি ভাঁজ হওয়ার পরে প্রোটিন স্থিতিশীলতায় উল্লেখযোগ্য পরিমাণে অবদান রাখে, কারণ প্রচুর পরিমাণে সঞ্চিত ভ্যান ডার ওয়ালস শক্তি (বিশেষত লন্ডন বিচ্ছুরণ শক্তি)। তাপগতিবিদ্যায় হাইড্রোফোবিক প্রভাব একটি চালিকা শক্তি হিসাবে তখনই বিদ্যমান যখন একটি বড় হাইড্রোফোবিক অঞ্চল ধারণকারী একটি অ্যাম্ফিফিলিক অণু সহ একটি জলীয় মাধ্যমের উপস্থিতি থাকে। হাইড্রোজেন বন্ধনের শক্তি তাদের পরিবেশের উপর নির্ভর করে; সুতরাং, একটি হাইড্রোফোবিক কেন্দ্রে আবৃত এইচ-বন্ডগুলি জলীয় পরিবেশের সংস্পর্শে আসা এইচ-বন্ডের চেয়ে স্থানীয় অবস্থার স্থিতিশীলতায় বেশি অবদান রাখে। গ্লোবুলার ভাঁজযুক্ত প্রোটিনগুলিতে, হাইড্রোফোবিক অ্যামিনো অ্যাসিডগুলি এলোমেলোভাবে বিতরণ বা একসাথে গুচ্ছবদ্ধ হওয়ার পরিবর্তে প্রাথমিক ক্রম বরাবর ছড়িয়ে ছিটিয়ে থাকে। যাইহোক, যে প্রোটিনগুলি সম্প্রতি ডি নভোতে জন্মগ্রহণ করেছে, যা অভ্যন্তরীণভাবে বিশৃঙ্খল হতে থাকে, প্রাথমিক ক্রম বরাবর হাইড্রোফোবিক অ্যামিনো অ্যাসিড ক্লাস্টারিংয়ের বিপরীত প্যাটার্ন দেখায়। আণবিক চেপারোন হল প্রোটিনের একটি শ্রেণী যা ভিভোতে অন্যান্য প্রোটিনের সঠিক ভাঁজ করতে সহায়তা করে। চ্যাপেরোনগুলি সমস্ত কোষীয় অংশে বিদ্যমান এবং পলিপেপটাইড চেইনের সাথে মিথস্ক্রিয়া করে যাতে প্রোটিনের স্থানীয় ত্রিমাত্রিক গঠন তৈরি হয়; তবে, চ্যাপেরোনগুলি নিজেরাই প্রোটিনের চূড়ান্ত কাঠামোতে অন্তর্ভুক্ত হয় না যেখানে তারা সহায়তা করছে। রাইবোজোম দ্বারা নেসেন্ট পলিপেপটাইড সংশ্লেষিত হওয়ার পরেও চ্যাপেরোনগুলি ভাঁজ করতে সহায়তা করতে পারে। আণবিক চ্যাপেরোনগুলি একটি প্রোটিনের ভাঁজ হওয়ার পথে অন্যথায় অস্থির কাঠামোকে স্থিতিশীল করার জন্য বাঁধাই করে কাজ করে, তবে চ্যাপেরোনগুলিতে প্রোটিনের সঠিক স্থানীয় কাঠামো জানার জন্য প্রয়োজনীয় তথ্য থাকে না যা তারা সহায়তা করছে; বরং, চ্যাপেরোনগুলি ভুল ভাঁজ গঠন প্রতিরোধ করে কাজ করে। এইভাবে, চ্যাপেরোনগুলি প্রকৃত কাঠামোর দিকে ভাঁজ করার পথে জড়িত পৃথক পদক্ষেপের হার প্রকৃতপক্ষে বাড়ায় না; পরিবর্তে, তারা পলিপেপটাইড চেইনের সম্ভাব্য অযাচিত সমষ্টি হ্রাস করে কাজ করে যা অন্যথায় সঠিক মধ্যবর্তী অনুসন্ধানকে ধীর করে দিতে পারে এবং তারা পলিপেপটাইড চেইনের জন্য সঠিক গঠনগুলি ধরে নেওয়ার জন্য আরও কার্যকর পথ সরবরাহ করে। চ্যাপেরোনগুলিকে ভাঁজ অনুঘটক প্রোটিনের সাথে বিভ্রান্ত করা উচিত নয়, যা ভাঁজ পথের ধীর পদক্ষেপের জন্য দায়ী রাসায়নিক প্রতিক্রিয়াগুলিকে অনুঘটক করে। ভাঁজ অনুঘটকের উদাহরণ হল প্রোটিন ডাইসালফাইড আইসোমেরেস এবং পেপটিডাইল-প্রোলাইল আইসোমেরেস যা ডাইসালফাইড বন্ধন গঠন বা পেপটাইড গ্রুপের সিস এবং ট্রান্স স্টেরিওআইসোমারের মধ্যে আন্তঃপরিবর্তনের সাথে জড়িত হতে পারে। ভিভোতে প্রোটিন ভাঁজ করার প্রক্রিয়ায় চ্যাপেরোনগুলি গুরুত্বপূর্ণ বলে দেখানো হয়েছে কারণ তারা প্রোটিনকে তার যথাযথ সারিবদ্ধকরণ এবং গঠনগুলি "জৈবিকভাবে প্রাসঙ্গিক" হওয়ার জন্য যথেষ্ট দক্ষতার সাথে অনুমান করার জন্য প্রয়োজনীয় সহায়তা প্রদান করে। এর মানে হল যে পলিপেপটাইড চেইন তাত্ত্বিকভাবে চ্যাপেরোনগুলির সহায়তা ছাড়াই তার স্থানীয় কাঠামোর মধ্যে ভাঁজ করতে পারে, যেমনটি ভিট্রোতে পরিচালিত প্রোটিন ভাঁজ পরীক্ষা দ্বারা প্রদর্শিত হয়েছে; তবে, এই প্রক্রিয়াটি জৈবিক ব্যবস্থায় অস্তিত্বের জন্য খুব অদক্ষ বা খুব ধীর বলে প্রমাণিত হয়; অতএব, ভিভোতে প্রোটিন ভাঁজ করার জন্য চ্যাপেরোনগুলি প্রয়োজনীয়। স্থানীয় কাঠামো গঠনে সহায়তা করার পাশাপাশি, চ্যাপেরোনগুলি প্রোটিন পরিবহন, অবক্ষয়ের মতো বিভিন্ন ভূমিকায় জড়িত বলে দেখানো হয়েছে এবং এমনকি কিছু বাহ্যিক অবক্ষয়কারী কারণের সংস্পর্শে আসা বিকৃত প্রোটিনগুলিকে তাদের সঠিক স্থানীয় কাঠামোতে পুনরায় ভাঁজ করার সুযোগ দেয়। একটি সম্পূর্ণরূপে বিকৃত প্রোটিনের তৃতীয় এবং গৌণ উভয় কাঠামোরই অভাব থাকে এবং এটি একটি তথাকথিত এলোমেলো কুণ্ডলী হিসাবে বিদ্যমান। কিছু নির্দিষ্ট পরিস্থিতিতে কিছু প্রোটিন পুনরায় ভাঁজ হতে পারে; তবে, অনেক ক্ষেত্রে, বিকৃতি অপরিবর্তনীয়। কোষগুলি কখনও কখনও তাপ শক প্রোটিন (এক ধরনের চ্যাপেরোন) নামে পরিচিত এনজাইমগুলির দ্বারা তাপের বিকৃত প্রভাব থেকে তাদের প্রোটিনগুলিকে রক্ষা করে, যা অন্যান্য প্রোটিনগুলিকে ভাঁজ করতে এবং ভাঁজ রাখতে উভয় ক্ষেত্রেই সহায়তা করে। ব্যাকটেরিয়া থেকে শুরু করে মানুষ পর্যন্ত সমস্ত প্রজাতির মধ্যে হিট শক প্রোটিন পাওয়া গেছে, যা ইঙ্গিত করে যে তারা খুব তাড়াতাড়ি বিবর্তিত হয়েছে এবং তাদের একটি গুরুত্বপূর্ণ কাজ রয়েছে। কিছু প্রোটিন কোষে কখনই ভাঁজ হয় না কেবলমাত্র চ্যাপেরোনগুলির সাহায্যে যা হয় পৃথক প্রোটিনগুলিকে পৃথক করে যাতে তাদের ভাঁজ অন্যান্য প্রোটিনের সাথে মিথস্ক্রিয়া দ্বারা বিঘ্নিত না হয় বা ভুল ভাঁজ করা প্রোটিনগুলিকে প্রসারিত করতে সহায়তা করে, যার ফলে তারা সঠিক স্থানীয় কাঠামোতে পুনরায় ভাঁজ করতে পারে। অদ্রবণীয় নিরাকার সমষ্টিতে বৃষ্টিপাতের ঝুঁকি রোধ করার জন্য এই ফাংশনটি অত্যন্ত গুরুত্বপূর্ণ। প্রোটিন বিকৃতি বা স্থানীয় অবস্থার ব্যাঘাতের সাথে জড়িত বাহ্যিক কারণগুলির মধ্যে রয়েছে তাপমাত্রা, বাহ্যিক ক্ষেত্র (বৈদ্যুতিক, চৌম্বক), আণবিক ভিড় এবং এমনকি স্থানের সীমাবদ্ধতা (অর্থাৎ। কারাবাস), যা প্রোটিনের ভাঁজ করার উপর একটি বড় প্রভাব ফেলতে পারে। দ্রবণের উচ্চ ঘনত্ব, পিএইচ-এর চরম মাত্রা, যান্ত্রিক শক্তি এবং রাসায়নিক ডিনেচুরেন্টের উপস্থিতিও প্রোটিন বিকৃতি ঘটাতে অবদান রাখতে পারে। এই পৃথক কারণগুলিকে একসঙ্গে চাপ হিসাবে শ্রেণীবদ্ধ করা হয়। কোষীয় চাপের সময়ে চ্যাপেরোনগুলি ক্রমবর্ধমান ঘনত্বে বিদ্যমান থাকে এবং উদীয়মান প্রোটিনের পাশাপাশি বিকৃত বা ভুল ভাঁজ করা প্রোটিনের সঠিক ভাঁজ করতে সহায়তা করে। কিছু পরিস্থিতিতে প্রোটিনগুলি তাদের জৈব রাসায়নিক কার্যকরী আকারে ভাঁজ হবে না। কোষগুলি যে পরিসরে বাস করে তার উপরে বা নীচে তাপমাত্রা তাপীয়ভাবে অস্থির প্রোটিনগুলিকে প্রসারিত বা বিকৃত করে (এই কারণেই ফুটন্ত ডিমের সাদা অংশ অস্বচ্ছ হয়ে যায়)। প্রোটিন তাপীয় স্থায়িত্ব ধ্রুবক থেকে অনেক দূরে, তবে উদাহরণস্বরূপ, হাইপারথার্মোফিলিক ব্যাকটেরিয়া পাওয়া গেছে যা 122 ডিগ্রি সেলসিয়াস পর্যন্ত উচ্চ তাপমাত্রায় বৃদ্ধি পায়, যার জন্য অবশ্যই তাদের অত্যাবশ্যক প্রোটিন এবং প্রোটিন সমাবেশগুলির সম্পূর্ণ পরিপূরক সেই তাপমাত্রায় বা তার উপরে স্থিতিশীল হওয়া প্রয়োজন। ব্যাকটেরিয়াম ই. কোলাই হল ব্যাকটেরিওফেজ টি4-এর পোষক, এবং ফেজ এনকোডেড জিপি31 প্রোটিন () কাঠামোগতভাবে এবং কার্যকরীভাবে ই. কোলাই চ্যাপেরোন প্রোটিন গ্রোইএস-এর সমতুল্য বলে মনে হয় এবং সংক্রমণের সময় ব্যাকটেরিওফেজ টি4 ভাইরাস কণার সমাবেশে এর বিকল্প হতে সক্ষম। গ্রোইএস-এর মতো, জিপি31 গ্রোইএল চ্যাপেরোনিনের সাথে একটি স্থিতিশীল জটিল গঠন করে যা ব্যাকটেরিওফেজ টি4 মেজর ক্যাপসিড প্রোটিন জিপি23-এর ভিভোতে ভাঁজ এবং সমাবেশের জন্য একেবারে প্রয়োজনীয়। ভাঁজ পরিবর্তন কিছু প্রোটিনের একাধিক স্থানীয় কাঠামো থাকে এবং কিছু বাহ্যিক কারণের উপর ভিত্তি করে তাদের ভাঁজ পরিবর্তন করে। উদাহরণস্বরূপ, কাইবি প্রোটিন সারা দিন ধরে ভাঁজ হয়ে যায়, যা সায়ানোব্যাকটেরিয়ার জন্য একটি ঘড়ি হিসাবে কাজ করে। এটি অনুমান করা হয়েছে যে প্রায় 0.5-4% পিডিবি (প্রোটিন ডেটা ব্যাংক) প্রোটিনগুলি ভাঁজ হয়ে যায়। প্রোটিনকে ভুলভাবে ভাঁজ করা এবং নিউরোডিজেনারেটিভ রোগ একটি প্রোটিনকে ভুলভাবে ভাঁজ করা বলে মনে করা হয় যদি এটি তার স্বাভাবিক স্থানীয় অবস্থা অর্জন করতে না পারে। এটি অ্যামিনো অ্যাসিড সিকোয়েন্সের মিউটেশন বা বাহ্যিক কারণগুলির দ্বারা স্বাভাবিক ভাঁজ প্রক্রিয়া ব্যাহত হওয়ার কারণে হতে পারে। ভুল ভাঁজ করা প্রোটিনে সাধারণত β-শীট থাকে যা ক্রস-β কাঠামো নামে পরিচিত একটি সুপ্রামোলিকুলার বিন্যাসে সংগঠিত হয়। এই β-শীট সমৃদ্ধ সমাবেশগুলি খুব স্থিতিশীল, খুব অদ্রবণীয় এবং সাধারণত প্রোটোলাইসিস প্রতিরোধী। এই ফাইব্রিলার সমাবেশগুলির কাঠামোগত স্থিতিশীলতা প্রোটিন মনোমারগুলির মধ্যে ব্যাপক মিথস্ক্রিয়া দ্বারা সৃষ্ট হয়, যা তাদের β-স্ট্র্যান্ডগুলির মধ্যে ব্যাকবোন হাইড্রোজেন বন্ধন দ্বারা গঠিত হয়। প্রোটিনের ভুল ভাঁজ অন্যান্য প্রোটিনগুলিকে আরও ভুল ভাঁজ করতে এবং এগ্রিগেট বা অলিগোমারগুলিতে জমা হতে পারে। কোষে একত্রিত প্রোটিনের বর্ধিত মাত্রা অ্যামাইলয়েডের মতো কাঠামো গঠনের দিকে পরিচালিত করে যা অবক্ষয়জনিত ব্যাধি এবং কোষের মৃত্যুর কারণ হতে পারে। অ্যামাইলয়েডগুলি ফাইব্রিলারি কাঠামো যা আন্তঃআণবিক হাইড্রোজেন বন্ধন ধারণ করে যা অত্যন্ত অদ্রবণীয় এবং রূপান্তরিত প্রোটিন সমষ্টি থেকে তৈরি। অতএব, প্রোটিসোম পথটি একত্রীকরণের আগে ভুল ভাঁজ করা প্রোটিনগুলিকে হ্রাস করার জন্য যথেষ্ট কার্যকর নাও হতে পারে। ত্রুটিপূর্ণ প্রোটিনগুলি একে অপরের সাথে মিথস্ক্রিয়া করতে পারে এবং কাঠামোগত সমষ্টি তৈরি করতে পারে এবং আন্তঃআণবিক মিথস্ক্রিয়ার মাধ্যমে বিষাক্ততা অর্জন করতে পারে। ক্রুজফেল্ট-জ্যাকব রোগ, বোভাইন স্পঞ্জিফর্ম এনসেফালোপ্যাথি (পাগল গরুর রোগ), অ্যামাইলয়েড-সম্পর্কিত অসুস্থতা যেমন আলঝেইমার রোগ এবং পারিবারিক অ্যামাইলয়েড কার্ডিওমায়োপ্যাথি বা পলিনিউরোপ্যাথি, পাশাপাশি হান্টিংটন এবং পার্কিনসন রোগের মতো আন্তঃকোষীয় একত্রীকরণ রোগের মতো প্রিওন-সম্পর্কিত অসুস্থতার সাথে একত্রিত প্রোটিনগুলি যুক্ত। এই বয়সের গোড়ার অবক্ষয়জনিত রোগগুলি দ্রবণীয়, এক্সট্রাসেলুলার সমষ্টি এবং/অথবা ক্রস-বিটা অ্যামাইলয়েড ফাইব্রিল সহ আন্তঃকোষীয় অন্তর্ভুক্তিতে ভুলভাবে ভাঁজ করা প্রোটিনগুলির সমষ্টির সাথে যুক্ত। এটি সম্পূর্ণরূপে স্পষ্ট নয় যে এগ্রিগেটগুলি প্রোটিন হোমিওস্ট্যাসিসের ক্ষতির কারণ নাকি নিছক একটি প্রতিফলন, সংশ্লেষণ, ভাঁজ, সমষ্টি এবং প্রোটিন টার্নওভারের মধ্যে ভারসাম্য। সম্প্রতি ইউরোপীয় মেডিসিন এজেন্সি ট্রান্সথাইরেটিন অ্যামাইলয়েড রোগের চিকিৎসার জন্য টাফামিডিস বা ভিন্ডাকেল (টেট্রামেরিক ট্রান্সথাইরেটিন-এর একটি কাইনেটিক স্টেবিলাইজার) ব্যবহারের অনুমোদন দিয়েছে। এর থেকে বোঝা যায় যে অ্যামাইলয়েড ফাইব্রিল গঠনের প্রক্রিয়া (এবং ফাইব্রিলগুলি নয়) মানুষের অ্যামাইলয়েড রোগে পোস্ট-মাইটোটিক টিস্যুর অবক্ষয়ের কারণ হয়। ভাঁজ এবং কার্যকারিতার পরিবর্তে ভুল ভাঁজ এবং অত্যধিক অবক্ষয়ের ফলে অ্যান্টিট্রিপসিন-সম্পর্কিত এমফিসেমা, সিস্টিক ফাইব্রোসিস এবং লাইসোসোমাল স্টোরেজ রোগের মতো বেশ কয়েকটি প্রোটিওপ্যাথি রোগ হয়, যেখানে কার্যকারিতা হ্রাসই এই ব্যাধিটির উৎস। যদিও প্রোটিন প্রতিস্থাপন থেরাপি ঐতিহাসিকভাবে পরবর্তী ব্যাধিগুলি সংশোধন করার জন্য ব্যবহার করা হয়েছে, একটি উদীয়মান পদ্ধতি হল পরিবর্তিত প্রোটিনগুলিকে কার্যকরী করার জন্য ফার্মাসিউটিক্যাল চ্যাপেরোনগুলি ব্যবহার করা। প্রোটিন ভাঁজ অধ্যয়নের জন্য পরীক্ষামূলক কৌশল যদিও প্রোটিন ভাঁজ সম্পর্কে অনুমানগুলি মিউটেশন অধ্যয়নের মাধ্যমে করা যেতে পারে, সাধারণত, প্রোটিন ভাঁজ অধ্যয়নের জন্য পরীক্ষামূলক কৌশলগুলি ধীরে ধীরে প্রোটিনের উন্মোচন বা ভাঁজ এবং স্ট্যান্ডার্ড নন-ক্রিস্টালোগ্রাফিক কৌশল ব্যবহার করে গঠনমূলক পরিবর্তন পর্যবেক্ষণের উপর নির্ভর করে। এক্স-রে স্ফটিকবিদ্যা একটি ভাঁজ করা প্রোটিনের ত্রিমাত্রিক বিন্যাস বোঝার চেষ্টা করার জন্য আরও কার্যকর এবং গুরুত্বপূর্ণ পদ্ধতিগুলির মধ্যে একটি। এক্স-রে ক্রিস্টালোগ্রাফি পরিচালনা করতে সক্ষম হওয়ার জন্য, তদন্তের অধীনে থাকা প্রোটিনটি অবশ্যই একটি স্ফটিক জালের ভিতরে অবস্থিত হতে হবে। স্ফটিক জালের ভিতরে একটি প্রোটিন রাখার জন্য অবশ্যই স্ফটিকীকরণের জন্য উপযুক্ত দ্রাবক থাকতে হবে, দ্রবণে অতিমাত্রায় বিশুদ্ধ প্রোটিন পেতে হবে এবং দ্রবণে স্ফটিকগুলিকে অবক্ষেপিত করতে হবে। একবার একটি প্রোটিন স্ফটিকায়িত হয়ে গেলে, এক্স-রে রশ্মি স্ফটিক জালের মাধ্যমে ঘনীভূত হতে পারে যা মরীচিগুলিকে বিক্ষিপ্ত করবে বা বিভিন্ন দিকে বাইরের দিকে নিক্ষেপ করবে। এই প্রস্থানকারী রশ্মিগুলি প্রোটিনের নির্দিষ্ট ত্রিমাত্রিক বিন্যাসের সাথে সম্পর্কযুক্ত। এক্স-রেগুলি বিশেষভাবে প্রোটিন স্ফটিক জালের মধ্যে পৃথক পরমাণুগুলিকে ঘিরে থাকা ইলেক্ট্রন মেঘের সাথে মিথস্ক্রিয়া করে এবং একটি সুস্পষ্ট বিচ্ছুরণ প্যাটার্ন তৈরি করে। শুধুমাত্র ইলেক্ট্রন ঘনত্বের মেঘগুলিকে এক্স-রে-র বিস্তারের সাথে সম্পর্কিত করে এই প্যাটার্নটি পড়া যেতে পারে এবং জড়িত পর্যায় বা পর্যায় কোণগুলির অনুমানের দিকে পরিচালিত করতে পারে যা এই পদ্ধতিকে জটিল করে তোলে। ফুরিয়ার রূপান্তর নামে পরিচিত একটি গাণিতিক ভিত্তির মাধ্যমে প্রতিষ্ঠিত সম্পর্ক ছাড়া, "পর্যায় সমস্যা" বিচ্ছুরণ নিদর্শনগুলির পূর্বাভাস দেওয়া খুব কঠিন করে তুলবে। একাধিক সমরূপ প্রতিস্থাপনের মতো উদীয়মান পদ্ধতিগুলি এক্স-রেগুলিকে আরও অনুমানযোগ্য পদ্ধতিতে বিচ্ছুরিত করতে ভারী ধাতব আয়নটির উপস্থিতি ব্যবহার করে, জড়িত ভেরিয়েবলের সংখ্যা হ্রাস করে এবং পর্যায় সমস্যার সমাধান করে। ফ্লুরোসেন্স স্পেকট্রোস্কোপি হল প্রোটিনের ভাঁজ অবস্থা অধ্যয়নের জন্য একটি অত্যন্ত সংবেদনশীল পদ্ধতি। তিনটি অ্যামিনো অ্যাসিড, ফেনিল্যালানাইন (ফে), টাইরোসিন (টায়ার) এবং ট্রিপ্টোফান (টিআরপি)-এর অভ্যন্তরীণ ফ্লুরোসেন্স বৈশিষ্ট্য রয়েছে, তবে শুধুমাত্র টায়ার এবং টিআরপি পরীক্ষামূলকভাবে ব্যবহার করা হয় কারণ তাদের কোয়ান্টাম ফলন ভাল ফ্লুরোসেন্স সংকেত দেওয়ার জন্য যথেষ্ট বেশি। টিআরপি এবং টায়ার উভয়ই 280 এনএম তরঙ্গদৈর্ঘ্য দ্বারা উত্তেজিত হয়, যেখানে শুধুমাত্র টিআরপি 295 এনএম তরঙ্গদৈর্ঘ্য দ্বারা উত্তেজিত হয়। তাদের সুগন্ধযুক্ত চরিত্রের কারণে, টিআরপি এবং টায়ারের অবশিষ্টাংশগুলি প্রায়শই প্রোটিনের হাইড্রোফোবিক কেন্দ্রে, দুটি প্রোটিন ডোমেনের মধ্যে ইন্টারফেসে বা অলিগোমেরিক প্রোটিনের সাবইউনিটের মধ্যে ইন্টারফেসে সম্পূর্ণ বা আংশিকভাবে সমাহিত অবস্থায় পাওয়া যায়। এই অপোলার পরিবেশে, তাদের উচ্চ পরিমাণ ফলন রয়েছে এবং তাই উচ্চ ফ্লুরোসেন্স তীব্রতা রয়েছে। প্রোটিনের টারশিয়ারি বা কোয়াটারনারি কাঠামো বিঘ্নিত হলে, এই পার্শ্ব শৃঙ্খলগুলি দ্রাবকের হাইড্রোফিলিক পরিবেশে আরও বেশি উন্মুক্ত হয়ে যায় এবং তাদের কোয়ান্টাম ফলন হ্রাস পায়, যার ফলে কম ফ্লুরোসেন্স তীব্রতা হয়। টিআরপি অবশিষ্টাংশের জন্য, তাদের সর্বাধিক ফ্লুরোসেন্স নির্গমনের তরঙ্গদৈর্ঘ্যও তাদের পরিবেশের উপর নির্ভর করে। ফ্লুরোসেন্স স্পেকট্রোস্কোপি ব্যবহার করা যেতে পারে ফ্লুরোসেন্স নির্গমনের তীব্রতার বৈচিত্র্য বা সর্বাধিক নির্গমনের তরঙ্গদৈর্ঘ্য পরিমাপ করে প্রোটিনের ভারসাম্য উন্মোচনকে একটি ডিনেচুরেন্ট মানের ফাংশন হিসাবে চিহ্নিত করতে। ডিনেচুরেন্ট একটি রাসায়নিক অণু (ইউরিয়া, গুয়ানিডিনিয়াম হাইড্রোক্লোরাইড), তাপমাত্রা, পিএইচ, চাপ ইত্যাদি হতে পারে। বিভিন্ন কিন্তু বিচ্ছিন্ন প্রোটিনের অবস্থার মধ্যে ভারসাম্য, অর্থাৎ। স্থানীয় অবস্থা, মধ্যবর্তী অবস্থা, উন্মুক্ত অবস্থা, ডিনেচুরেন্ট মানের উপর নির্ভর করে; অতএব, তাদের ভারসাম্য মিশ্রণের গ্লোবাল ফ্লুরোসেন্স সংকেতও এই মানের উপর নির্ভর করে। এইভাবে একজন ডিনেচুরেন্ট মানের সাথে বৈশ্বিক প্রোটিন সংকেত সম্পর্কিত একটি প্রোফাইল অর্জন করে। ভারসাম্য উন্মোচন প্রোফাইল একজনকে উন্মোচন মধ্যস্থতাকারী সনাক্ত এবং সনাক্ত করতে সক্ষম করতে পারে। হিউজেস বেদুয়েল এই ধরনের প্রোফাইল থেকে হোমোমেরিক বা হেটেরোমেরিক প্রোটিনের জন্য ট্রিমার এবং সম্ভাব্য টেট্রামার পর্যন্ত উন্মুক্ত ভারসাম্যকে চিহ্নিত করে এমন তাপগতিবিদ্যার পরামিতিগুলি পাওয়ার জন্য সাধারণ সমীকরণগুলি তৈরি করেছেন। প্রোটিন ভাঁজ গতিবিদ্যা পরিমাপ করতে, একটি শেভরন প্লট তৈরি করতে এবং একটি ফাই মান বিশ্লেষণ পেতে ফ্লুরোসেন্স স্পেকট্রোস্কোপি দ্রুত-মিশ্রণকারী যন্ত্রের সাথে একত্রিত করা যেতে পারে। বৃত্তাকার ডাইক্রোইজম হল প্রোটিন ভাঁজ অধ্যয়নের জন্য সবচেয়ে সাধারণ এবং মৌলিক সরঞ্জামগুলির মধ্যে একটি। বৃত্তাকার ডাইক্রোইজম স্পেকট্রোস্কোপি বৃত্তাকার মেরুকৃত আলোর শোষণ পরিমাপ করে। প্রোটিনে, আলফা হেলিসেস এবং বিটা শিটের মতো কাঠামো কাইরাল হয় এবং এইভাবে এই ধরনের আলো শোষণ করে। এই আলোর শোষণ প্রোটিন সমষ্টির ভাঁজ হওয়ার মাত্রার একটি চিহ্নিতকারী হিসাবে কাজ করে। এই কৌশলটি ডিনেচুরেন্ট ঘনত্ব বা তাপমাত্রার একটি ফাংশন হিসাবে এই শোষণের পরিবর্তন পরিমাপ করে প্রোটিনের ভারসাম্য উন্মোচন পরিমাপ করতে ব্যবহৃত হয়েছে। একটি ডিনাচুরেন্ট গলন উদ্ভাসিত হওয়ার মুক্ত শক্তির পাশাপাশি প্রোটিনের এম মান বা ডিনাচুরেন্ট নির্ভরতা পরিমাপ করে। একটি তাপমাত্রা গলন প্রোটিনের বিকৃতি তাপমাত্রা (টিএম) পরিমাপ করে। ফ্লুরোসেন্স স্পেকট্রোস্কোপির ক্ষেত্রে, বৃত্তাকার-ডাইক্রোইজম স্পেকট্রোস্কোপিকে প্রোটিন ভাঁজ গতিবিদ্যা পরিমাপ করতে এবং শেভরন প্লট তৈরি করতে স্টপ ফ্লো-এর মতো দ্রুত-মিশ্রণকারী যন্ত্রের সাথে একত্রিত করা যেতে পারে। প্রোটিনের কম্পনমূলক বৃত্তাকার ডাইক্রোইজম প্রোটিনের জন্য কম্পনমূলক বৃত্তাকার ডাইক্রোইজম (ভি. সি. ডি) কৌশলগুলির আরও সাম্প্রতিক উন্নয়ন, বর্তমানে ফুরিয়ার ট্রান্সফর্ম (এফ. টি) যন্ত্রগুলির সাথে জড়িত, এমনকি খুব বড় প্রোটিন অণুগুলির জন্যও দ্রবণে প্রোটিন গঠন নির্ধারণের জন্য শক্তিশালী উপায় সরবরাহ করে। প্রোটিনের এই ধরনের ভিসিডি অধ্যয়নগুলি প্রোটিন স্ফটিকের জন্য এক্স-রে বিচ্ছুরণ তথ্য, ভারী জলে প্রোটিন সমাধানের জন্য এফটি-আইআর তথ্য (ডি2ও), বা কোয়ান্টাম গণনার সাথে মিলিত হতে পারে। প্রোটিন নিউক্লিয়ার ম্যাগনেটিক রেজোনেন্স স্পেকট্রোস্কোপি প্রোটিন নিউক্লিয়ার ম্যাগনেটিক রেজোনেন্স (এন. এম. আর) ঘনীভূত প্রোটিনের নমুনার মাধ্যমে একটি চুম্বক ক্ষেত্রকে প্ররোচিত করে প্রোটিন কাঠামোগত তথ্য সংগ্রহ করতে সক্ষম। এন. এম. আর-এ, রাসায়নিক পরিবেশের উপর নির্ভর করে, নির্দিষ্ট নিউক্লিয়াস নির্দিষ্ট রেডিও-ফ্রিকোয়েন্সি শোষণ করবে। যেহেতু প্রোটিনের কাঠামোগত পরিবর্তনগুলি এনএস থেকে এমএস পর্যন্ত সময় স্কেলে কাজ করে, তাই এনএসআর বিশেষত পিএস থেকে এস পর্যন্ত সময়কালে মধ্যবর্তী কাঠামো অধ্যয়নের জন্য সজ্জিত। প্রোটিনের কাঠামো এবং নন-ফোল্ডিং প্রোটিন কাঠামোগত পরিবর্তনগুলি অধ্যয়নের জন্য কিছু প্রধান কৌশলের মধ্যে রয়েছে সিওএসওয়াই, টিওসিএসওয়াই, এইচএসকিউসি, সময় শিথিলকরণ (টি1 এবং টি2) এবং এনওই। এন. ও. ই বিশেষভাবে কার্যকর কারণ স্থানিকভাবে প্রক্সিমাল হাইড্রোজেনের মধ্যে চুম্বকায়ন স্থানান্তর পর্যবেক্ষণ করা যেতে পারে। বিভিন্ন এন. এম. আর পরীক্ষায় বিভিন্ন মাত্রার টাইমস্কেল সংবেদনশীলতা থাকে যা বিভিন্ন প্রোটিন কাঠামোগত পরিবর্তনের জন্য উপযুক্ত। এন. ও. ই বন্ধন কম্পন বা পার্শ্ব শৃঙ্খল আবর্তন গ্রহণ করতে পারে, তবে, এন. ও. ই প্রোটিন ভাঁজ তোলার জন্য খুব সংবেদনশীল কারণ এটি বৃহত্তর সময়কালে ঘটে। কারণ প্রোটিন ভাঁজ প্রায় 50 থেকে 3000 s−1 সিপিএমজি শিথিলকরণ বিচ্ছুরণ এবং রাসায়নিক বিনিময় সম্পৃক্ততা স্থানান্তর ভাঁজ করার এনএমআর বিশ্লেষণের জন্য কিছু প্রাথমিক কৌশল হয়ে উঠেছে। উপরন্তু, উভয় কৌশলই প্রোটিন ভাঁজ ল্যান্ডস্কেপে উত্তেজিত মধ্যবর্তী অবস্থা উন্মোচন করতে ব্যবহৃত হয়। এটি করার জন্য, সিপিএমজি শিথিলতা বিচ্ছুরণ ঘূর্ণন প্রতিধ্বনি ঘটনার সুবিধা নেয়। এই কৌশলটি লক্ষ্য নিউক্লিয়াসকে 90টি পালসের পরে এক বা একাধিক 180টি পালসের সংস্পর্শে নিয়ে আসে। নিউক্লিয়াস রিফোকাস হিসাবে, একটি বিস্তৃত বিতরণ নির্দেশ করে যে লক্ষ্য নিউক্লিয়াস একটি মধ্যবর্তী উত্তেজিত অবস্থায় জড়িত। শিথিল বিচ্ছুরণ প্লটগুলি দেখে তথ্যগুলি উত্তেজিত এবং স্থলের মধ্যে তাপগতিবিদ্যা এবং গতিবিদ্যা সম্পর্কে তথ্য সংগ্রহ করে। স্যাচুরেশন ট্রান্সফার ভূগর্ভস্থ অবস্থা থেকে সংকেতের পরিবর্তনকে পরিমাপ করে কারণ উত্তেজিত রাজ্যগুলি বিশৃঙ্খল হয়ে পড়ে। এটি একটি নির্দিষ্ট নিউক্লিয়াসের উত্তেজিত অবস্থাকে পরিপূর্ণ করতে দুর্বল রেডিও ফ্রিকোয়েন্সি বিকিরণ ব্যবহার করে যা তার সম্পৃক্ততাকে স্থল অবস্থায় স্থানান্তরিত করে। এই সংকেতটি স্থল অবস্থার চুম্বকায়ন (এবং সংকেত) হ্রাস করে প্রশস্ত করা হয়। এন. এম. আর-এর প্রধান সীমাবদ্ধতা হল 25 কে. ডি. এ-র চেয়ে বড় এবং এক্স-রে স্ফটিকবিদ্যার মতো বিস্তারিত নয় এমন প্রোটিনের সাথে এর রেজোলিউশন হ্রাস পায়। উপরন্তু, প্রোটিন এন. এম. আর বিশ্লেষণ বেশ কঠিন এবং একই এন. এম. আর বর্ণালী থেকে একাধিক সমাধান প্রস্তাব করতে পারে। প্রোটিন এস. ও. ডি1-এর সঙ্গে জড়িত একটি অ্যামায়োট্রফিক ল্যাটেরাল স্ক্লেরোসিসের ভাঁজ করার উপর দৃষ্টি নিবদ্ধ করা একটি গবেষণায়, উত্তেজিত মধ্যস্থতাকারীদের শিথিলকরণ বিচ্ছুরণ এবং স্যাচুরেশন স্থানান্তরের সাথে অধ্যয়ন করা হয়েছিল। এস. ও. ডি. 1 এর আগে অনেক রোগ সৃষ্টিকারী মিউট্যান্টের সাথে যুক্ত ছিল যা প্রোটিন সমষ্টির সাথে জড়িত বলে মনে করা হত, তবে প্রক্রিয়াটি এখনও অজানা ছিল। রিল্যাক্সেশন ডিসপারশন এবং স্যাচুরেশন ট্রান্সফার পরীক্ষা-নিরীক্ষা ব্যবহার করে অনেক উত্তেজিত মধ্যবর্তী অবস্থা এস. ও. ডি1 মিউট্যান্টগুলিতে ভুল ভাঁজ হওয়া আবিষ্কার করা হয়েছিল। দ্বৈত মেরুকরণ ইন্টারফেরোমেট্রি হল আণবিক স্তরগুলির আলোকীয় বৈশিষ্ট্য পরিমাপের জন্য একটি পৃষ্ঠ-ভিত্তিক কৌশল। যখন প্রোটিন ভাঁজ করার জন্য ব্যবহার করা হয়, তখন এটি প্রোটিনের একটি মনোলেয়ারের সামগ্রিক আকার এবং সাব-অ্যাঙ্গস্ট্রম রেজোলিউশনে রিয়েল টাইমে এর ঘনত্ব নির্ধারণ করে গঠন পরিমাপ করে, যদিও প্রোটিন ভাঁজ করার গতিবিদ্যার রিয়েল-টাইম পরিমাপ এমন প্রক্রিয়াগুলির মধ্যে সীমাবদ্ধ যা ~ 10 হার্জ এর চেয়ে ধীর গতিতে ঘটে। বৃত্তাকার ডাইক্রোইজমের মতো, ভাঁজ করার জন্য উদ্দীপক একটি ডিনেচুরেন্ট বা তাপমাত্রা হতে পারে। উচ্চ সময় রেজোলিউশনের সাথে ভাঁজ করার অধ্যয়ন সাম্প্রতিক বছরগুলিতে দ্রুত, সময়-সমাধান কৌশলগুলির বিকাশের মাধ্যমে প্রোটিন ভাঁজ করার অধ্যয়ন ব্যাপকভাবে উন্নত হয়েছে। পরীক্ষকরা দ্রুত অনাবৃত প্রোটিনের একটি নমুনার ভাঁজকে ট্রিগার করে এবং ফলাফলের গতিশীলতা পর্যবেক্ষণ করে। ব্যবহৃত দ্রুত কৌশলগুলির মধ্যে রয়েছে নিউট্রন বিচ্ছুরণ, দ্রবণগুলির অতিপ্রবাহ মিশ্রণ, আলোক রাসায়নিক পদ্ধতি এবং লেজার তাপমাত্রা লাফ স্পেকট্রোস্কোপি। এই কৌশলগুলির বিকাশে অবদান রাখা অনেক বিজ্ঞানীর মধ্যে রয়েছেন জেরেমি কুক, হাইনরিখ রডার, হ্যারি গ্রে, মার্টিন গ্রুবেল, ব্রায়ান ডায়ার, উইলিয়াম ইটন, শিনা র্যাডফোর্ড, ক্রিস ডবসন, অ্যালান ফার্শ, বেঙ্গট নোল্টিং এবং লার্স কোনরম্যান। প্রোটিয়োলাইসিস প্রোটিয়োলাইসিস নিয়মিতভাবে সমাধান অবস্থার বিস্তৃত পরিসরে প্রকাশিত ভগ্নাংশটি অনুসন্ধান করতে ব্যবহৃত হয় (যেমন। দ্রুত সমান্তরাল প্রোটোলাইসিস (এফ. এ. এস. টি. পি. পি)। একক অণু বল স্পেকট্রোস্কোপি অপটিক্যাল চিমটি এবং এ. এফ. এম-এর মতো একক অণু কৌশলগুলি বিচ্ছিন্ন প্রোটিনের পাশাপাশি চ্যাপেরোনযুক্ত প্রোটিনের প্রোটিন ভাঁজ করার প্রক্রিয়া বোঝার জন্য ব্যবহার করা হয়েছে। অপটিক্যাল চিমটি তাদের সি-এবং এন-টার্মিনি থেকে একক প্রোটিন অণু প্রসারিত করতে এবং পরবর্তী রিফোল্ডিং অধ্যয়নের অনুমতি দেওয়ার জন্য তাদের প্রসারিত করতে ব্যবহৃত হয়েছে। এই কৌশলটি একক-অণু স্তরে ভাঁজ হওয়ার হার পরিমাপ করার অনুমতি দেয়; উদাহরণস্বরূপ, রক্ত জমাট বাঁধার সাথে জড়িত প্রোটিনের ভাঁজ এবং উন্মোচন অধ্যয়নের জন্য সম্প্রতি অপটিক্যাল চিমটি প্রয়োগ করা হয়েছে। ভন উইলব্র্যান্ড ফ্যাক্টর (ভিডব্লিউএফ) হল একটি প্রোটিন যা রক্ত জমাট বাঁধার প্রক্রিয়াতে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। এটি আবিষ্কার করেছে-একক অণু অপটিক্যাল চিমটি পরিমাপ ব্যবহার করে-যে ক্যালসিয়াম-আবদ্ধ ভিডব্লিউএফ রক্তে শিয়ার ফোর্স সেন্সর হিসাবে কাজ করে। শিয়ার বল ভি. ডব্লিউ. এফ-এর এ2 ডোমেনের উদ্ভব ঘটায়, যার ক্যালসিয়ামের উপস্থিতিতে পুনরায় ভাঁজ করার হার নাটকীয়ভাবে বৃদ্ধি পায়। সম্প্রতি, এটিও দেখানো হয়েছে যে সাধারণ এস. আর. সি. এস. এইচ. 3 ডোমেন জোরপূর্বক একাধিক উন্মোচন পথ অ্যাক্সেস করে। বায়োটিন পেইন্টিং বায়োটিন পেইন্টিং (আন) ভাঁজ করা প্রোটিনের শর্ত-নির্দিষ্ট সেলুলার স্ন্যাপশট সক্ষম করে। বায়োটিন 'পেইন্টিং' ভবিষ্যদ্বাণীকৃত অভ্যন্তরীণভাবে বিশৃঙ্খল প্রোটিনের প্রতি পক্ষপাত দেখায়। প্রোটিন ভাঁজ করার গণনামূলক গবেষণায় প্রোটিন স্থিতিশীলতা, গতিবিদ্যা এবং কাঠামোর পূর্বাভাস সম্পর্কিত তিনটি প্রধান দিক অন্তর্ভুক্ত রয়েছে। 2013 সালের একটি পর্যালোচনায় প্রোটিন ভাঁজ করার জন্য উপলব্ধ গণনামূলক পদ্ধতির সংক্ষিপ্তসার দেওয়া হয়েছে। 1969 সালে, সাইরাস লেভিনথাল উল্লেখ করেছিলেন যে, একটি উন্মুক্ত পলিপেপটাইড শৃঙ্খলে খুব বেশি সংখ্যক ডিগ্রি অফ ফ্রিডমের কারণে, অণুটির একটি জ্যোতির্বৈজ্ঞানিক সংখ্যক সম্ভাব্য গঠন রয়েছে। তাঁর একটি গবেষণাপত্রে আনুমানিক 3300 বা 10143 লেখা ছিল। লেভিন্থালের প্যারাডক্স হল একটি চিন্তার পরীক্ষা যা এই পর্যবেক্ষণের উপর ভিত্তি করে যে যদি কোনও প্রোটিনকে সমস্ত সম্ভাব্য গঠনগুলির ক্রমিক নমুনা দ্বারা ভাঁজ করা হয়, তবে এটি করতে একটি জ্যোতির্বৈজ্ঞানিক পরিমাণ সময় লাগবে, এমনকি যদি গঠনগুলি দ্রুত হারে (ন্যানোসেকেন্ড বা পিকোসেকেন্ড স্কেলে) নমুনা করা হয়। এই পর্যবেক্ষণের উপর ভিত্তি করে যে প্রোটিনগুলি এর চেয়ে অনেক দ্রুত ভাঁজ হয়, লেভিনথাল তখন প্রস্তাব করেছিলেন যে একটি এলোমেলো গঠনমূলক অনুসন্ধান ঘটে না এবং তাই প্রোটিনকে অবশ্যই মেটা-স্থিতিশীল মধ্যবর্তী অবস্থার একটি সিরিজের মধ্য দিয়ে ভাঁজ করতে হবে। প্রোটিন ভাঁজ করার শক্তি ল্যান্ডস্কেপ ভাঁজ করার সময় একটি প্রোটিনের বিন্যাস স্থানকে একটি শক্তি ল্যান্ডস্কেপ হিসাবে কল্পনা করা যেতে পারে। জোসেফ ব্রাইঞ্জেলসন এবং পিটার ওলাইনের মতে, প্রোটিনগুলি ন্যূনতম হতাশার নীতি অনুসরণ করে, যার অর্থ প্রাকৃতিকভাবে বিবর্তিত প্রোটিনগুলি তাদের ভাঁজ শক্তি ল্যান্ডস্কেপকে অনুকূল করেছে এবং প্রকৃতি অ্যামিনো অ্যাসিড সিকোয়েন্স বেছে নিয়েছে যাতে প্রোটিনের ভাঁজ অবস্থা যথেষ্ট স্থিতিশীল হয়। উপরন্তু, ভাঁজ রাজ্য অধিগ্রহণ একটি যথেষ্ট দ্রুত প্রক্রিয়া হতে হবে। যদিও প্রকৃতি প্রোটিনে হতাশার মাত্রা হ্রাস করেছে, তবে এর কিছু অংশ এখনও অবধি রয়ে গেছে যা প্রোটিনের শক্তির প্রাকৃতিক দৃশ্যে স্থানীয় মিনিমার উপস্থিতিতে দেখা যায়। বিবর্তনীয়ভাবে নির্বাচিত এই ক্রমগুলির একটি পরিণতি হল যে প্রোটিনগুলি সাধারণত বিশ্বব্যাপী "ফানেলড এনার্জি ল্যান্ডস্কেপ" (জোসে ওনুচিক দ্বারা উদ্ভাবিত একটি শব্দ) রয়েছে বলে মনে করা হয় যা মূলত স্থানীয় রাষ্ট্রের দিকে পরিচালিত হয়। এই "ভাঁজ করা ফানেল" ল্যান্ডস্কেপ প্রোটিনকে একক পদ্ধতিতে সীমাবদ্ধ থাকার পরিবর্তে যে কোনও বড় সংখ্যক পথ এবং মধ্যস্থতার মাধ্যমে স্থানীয় রাজ্যে ভাঁজ করার অনুমতি দেয়। এই তত্ত্বটি মডেল প্রোটিনের গণনামূলক অনুকরণ এবং পরীক্ষামূলক গবেষণা উভয় দ্বারা সমর্থিত এবং এটি প্রোটিন কাঠামোর পূর্বাভাস এবং নকশার পদ্ধতি উন্নত করতে ব্যবহৃত হয়েছে। সমতলকরণ মুক্ত-শক্তি ভূদৃশ্য দ্বারা প্রোটিন ভাঁজ করার বিবরণও তাপগতিবিদ্যার 2য় সূত্রের সাথে সামঞ্জস্যপূর্ণ। ভৌগলিকভাবে, ভৌগলিক প্রাকৃতিক দৃশ্যের পরিবর্তে কেবল ম্যাক্সিমা, স্যাডল পয়েন্ট, মিনিমা এবং ফানেল সহ দৃশ্যমান সম্ভাব্যতা বা মোট শক্তির পৃষ্ঠের পরিপ্রেক্ষিতে ল্যান্ডস্কেপ সম্পর্কে চিন্তা করা সম্ভবত কিছুটা বিভ্রান্তিকর। প্রাসঙ্গিক বর্ণনাটি প্রকৃতপক্ষে একটি উচ্চ-মাত্রিক পর্যায়ের স্থান যেখানে ম্যানিফোল্ডগুলি আরও জটিল টপোলজিকাল রূপ নিতে পারে। অনাবৃত পলিপেপটাইড শৃঙ্খলটি ফানেলের শীর্ষে শুরু হয় যেখানে এটি সর্বাধিক সংখ্যক অনাবৃত বৈচিত্র্য অনুমান করতে পারে এবং তার সর্বোচ্চ শক্তি অবস্থায় থাকে। এই জাতীয় শক্তির প্রাকৃতিক দৃশ্যগুলি ইঙ্গিত দেয় যে প্রচুর সংখ্যক প্রাথমিক সম্ভাবনা রয়েছে, তবে কেবল একটি একক স্থানীয় অবস্থা সম্ভব; তবে, এটি সম্ভাব্য অসংখ্য ভাঁজ পথ প্রকাশ করে না। একই সঠিক প্রোটিনের একটি ভিন্ন অণু সামান্য ভিন্ন ভাঁজ পথ অনুসরণ করতে সক্ষম হতে পারে, বিভিন্ন নিম্ন শক্তির মধ্যবর্তী খুঁজতে পারে, যতক্ষণ না একই স্থানীয় কাঠামো পৌঁছায়। প্রতিটি পথের তাপগতিবিদ্যার অনুকূলতার উপর নির্ভর করে বিভিন্ন পথের ব্যবহারের বিভিন্ন ফ্রিকোয়েন্সি থাকতে পারে। এর মানে হল যে যদি একটি পথ অন্যটির তুলনায় তাপগতিবিদ্যার দিক থেকে বেশি অনুকূল বলে মনে করা হয়, তবে এটি স্থানীয় কাঠামোর সন্ধানে আরও ঘন ঘন ব্যবহার করা হতে পারে। প্রোটিনটি ভাঁজ হতে শুরু করে এবং তার বিভিন্ন গঠন গ্রহণ করে, এটি সর্বদা আগের তুলনায় আরও তাপগতিবিদ্যার অনুকূল কাঠামো চায় এবং এইভাবে শক্তি ফানেলের মাধ্যমে অব্যাহত থাকে। গৌণ কাঠামোর গঠন প্রোটিনের মধ্যে বর্ধিত স্থিতিশীলতার একটি শক্তিশালী ইঙ্গিত, এবং পলিপেপটাইড মেরুদণ্ড দ্বারা ধরে নেওয়া গৌণ কাঠামোর শুধুমাত্র একটি সংমিশ্রণে সর্বনিম্ন শক্তি থাকবে এবং তাই প্রোটিনের স্থানীয় অবস্থায় উপস্থিত থাকবে। পলিপেপটাইড ভাঁজ হতে শুরু করার পরে গঠিত প্রথম কাঠামোগুলির মধ্যে রয়েছে আলফা হেলিসেস এবং বিটা টার্ন, যেখানে আলফা হেলিসেস 100 ন্যানোসেকেন্ডে এবং বিটা টার্ন 1 মাইক্রোসেকেন্ডে তৈরি হতে পারে। এনার্জি ফানেল ল্যান্ডস্কেপে একটি স্যাডল পয়েন্ট রয়েছে যেখানে একটি নির্দিষ্ট প্রোটিনের ট্রানজিশন অবস্থা পাওয়া যায়। এনার্জি ফানেল ডায়াগ্রামে ট্রানজিশন স্টেট হল সেই গঠন যা সেই প্রোটিনের প্রতিটি অণু দ্বারা অনুমান করা আবশ্যক যদি প্রোটিন অবশেষে স্থানীয় কাঠামো গ্রহণ করতে চায়। কোনও প্রোটিন প্রথমে রূপান্তর অবস্থার মধ্য দিয়ে না গিয়ে স্থানীয় কাঠামো গ্রহণ করতে পারে না। রূপান্তর অবস্থাকে অন্য একটি মধ্যস্থতাকারী পদক্ষেপের পরিবর্তে স্থানীয় রাষ্ট্রের একটি বৈকল্পিক বা অকাল রূপ হিসাবে উল্লেখ করা যেতে পারে। রূপান্তর অবস্থার ভাঁজ হার-নির্ধারক হিসাবে দেখানো হয়েছে, এবং যদিও এটি স্থানীয় ভাঁজটির তুলনায় উচ্চতর শক্তি অবস্থায় বিদ্যমান, এটি স্থানীয় কাঠামোর সাথে ব্যাপকভাবে সাদৃশ্যপূর্ণ। রূপান্তর অবস্থার মধ্যে, একটি নিউক্লিয়াস বিদ্যমান যার চারপাশে প্রোটিন ভাঁজ করতে সক্ষম হয়, যা "নিউক্লিয়েশন ঘনীভবন" নামে পরিচিত একটি প্রক্রিয়া দ্বারা গঠিত হয় যেখানে কাঠামোটি নিউক্লিয়াসের উপর ভেঙে পড়তে শুরু করে। প্রোটিন ভাঁজ করার বিভিন্ন দিক অনুকরণের জন্য গণনামূলক প্রোটিন কাঠামোর পূর্বাভাসের জন্য প্রোটিন ভাঁজ করার মডেলিং ডি নভো বা অ্যাব ইনিশিও কৌশল ব্যবহার করা যেতে পারে। আণবিক গতিবিদ্যা (এমডি) সিলিকোতে প্রোটিন ভাঁজ এবং গতিবিদ্যার সিমুলেশনে ব্যবহৃত হয়েছিল। প্রথম ভারসাম্য ভাঁজ সিমুলেশনগুলি অন্তর্নিহিত দ্রাবক মডেল এবং ছাতা নমুনা ব্যবহার করে করা হয়েছিল। গণনামূলক খরচের কারণে, স্পষ্ট জলের সাথে এবি ইনিশিও এমডি ভাঁজ সিমুলেশনগুলি পেপটাইড এবং খুব ছোট প্রোটিনের মধ্যে সীমাবদ্ধ। বৃহত্তর প্রোটিনের এম. ডি সিমুলেশনগুলি পরীক্ষামূলক কাঠামোর গতিশীলতা বা এর উচ্চ-তাপমাত্রার উদ্ভবের মধ্যে সীমাবদ্ধ থাকে। দীর্ঘমেয়াদী ভাঁজ প্রক্রিয়া (প্রায় 1 মিলিসেকেন্ডের বাইরে), যেমন ছোট আকারের প্রোটিন ভাঁজ করা (প্রায় 50 টি অবশিষ্টাংশ) বা বড়, মোটা-দানাদার মডেল ব্যবহার করে অ্যাক্সেস করা যেতে পারে। বেশ কয়েকটি বড় আকারের গণনামূলক প্রকল্প, যেমন Rosetta@home, Folding@home এবং ফোল্ডিট, প্রোটিন ভাঁজকে লক্ষ্য করে। দীর্ঘ অবিচ্ছিন্ন-ট্র্যাজেক্টরি সিমুলেশনগুলি ডি. ই. শ রিসার্চ দ্বারা কাস্টম এএসআইসি এবং আন্তঃসংযোগের চারপাশে ডিজাইন করা এবং নির্মিত একটি বিশাল সমান্তরাল সুপার কম্পিউটার অ্যান্টনের উপর সঞ্চালিত হয়েছে। অ্যান্টন ব্যবহার করে সঞ্চালিত একটি সিমুলেশনের দীর্ঘতম প্রকাশিত ফলাফল হল 355 কেলভিন তাপমাত্রায় এনটিএল9-এর একটি মিলিসেকেন্ডের সিমুলেশন। সিমুলেশনগুলি বর্তমানে ছোট (<150 অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশ) প্রোটিনগুলিকে উন্মোচন করতে এবং পুনরায় ভাঁজ করতে এবং মিউটেশনগুলি ভাঁজ গতিবিদ্যা এবং স্থিতিশীলতাকে কীভাবে প্রভাবিত করে তা ভবিষ্যদ্বাণী করতে সক্ষম। 2020 সালে গবেষকদের একটি দল ডিপমাইন্ড দ্বারা তৈরি একটি কৃত্রিম বুদ্ধিমত্তা (এআই) প্রোগ্রাম আলফাফোল্ড ব্যবহার করে সিএএসপি-তে প্রথম স্থান অর্জন করে। দলটি অন্য যে কোনও দলের তুলনায় অনেক বেশি নির্ভুলতার স্তর অর্জন করেছে। এটি সিএএসপি-র গ্লোবাল ডিস্টেন্স টেস্ট (জিডিটি)-তে প্রায় দুই-তৃতীয়াংশ প্রোটিনের জন্য 90-এর উপরে স্কোর করেছে, একটি পরীক্ষা যা পরিমাপ করে যে একটি গণনামূলক প্রোগ্রামের পূর্বাভাস কাঠামো ল্যাব পরীক্ষা নির্ধারিত কাঠামোর অনুরূপ, 100 একটি সম্পূর্ণ ম্যাচ সহ, জিডিটি গণনার জন্য ব্যবহৃত দূরত্ব কাটঅফের মধ্যে। সিএএসপি-তে আলফাফোল্ডের প্রোটিন কাঠামোর পূর্বাভাসের ফলাফলগুলিকে "রূপান্তরমূলক" এবং "বিস্ময়কর" হিসাবে বর্ণনা করা হয়েছে। কিছু গবেষক উল্লেখ করেছেন যে এর ভবিষ্যদ্বাণীগুলির এক তৃতীয়াংশের জন্য নির্ভুলতা যথেষ্ট বেশি নয় এবং এটি প্রোটিন ভাঁজ করার প্রক্রিয়া বা নিয়মগুলি প্রকাশ করে না যাতে প্রোটিন ভাঁজ করার সমস্যাটি সমাধান করা হয় বলে মনে করা হয়। তা সত্ত্বেও, এটি গণনামূলক জীববিজ্ঞানের একটি উল্লেখযোগ্য অর্জন এবং জীববিজ্ঞানের একটি দশক-পুরানো গ্র্যান্ড চ্যালেঞ্জের দিকে দুর্দান্ত অগ্রগতি হিসাবে বিবেচিত হয়। আরও দেখুন শেভরন প্লট ডিনেচুরেশন মিডপয়েন্ট ডাউনহিল ভাঁজ (রসায়ন) ফাই মান বিশ্লেষণ প্রোটিনের সম্ভাব্য শক্তি প্রোটিন গতিবিদ্যা প্রোটিন ভুল ভাঁজ চক্রাকার পরিবর্ধন প্রোটিন কাঠামো পূর্বাভাস সফ্টওয়্যার প্রোটিওপ্যাথি সময়-সমাধানকৃত ভর বর্ণালী রেফারেন্স বাহ্যিক লিঙ্ক মানব প্রোটিওম ভাঁজ প্রকল্প প্রোটিন কাঠামো