Yeastract
YEASTRACT (ইস্ট সার্চ ফর ট্রান্সক্রিপশনাল রেগুলেটরস অ্যান্ড কনসেনসাস ট্র্যাকিং) হল 1200 টিরও বেশি গ্রন্থপঞ্জিগত রেফারেন্সের উপর ভিত্তি করে স্যাকারোমাইসেস সেরেভিসিয়ায় ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর (টিএফ) এবং টার্গেট জিনের মধ্যে 48000 টিরও বেশি নিয়ন্ত্রক সমিতির একটি কিউরেটেড সংগ্রহস্থল। এতে শতাধিক বৈশিষ্ট্যযুক্ত টিএফ-এর জন্য প্রায় 300টি নির্দিষ্ট ডিএনএ বাঁধাই সাইটের বিবরণও অন্তর্ভুক্ত রয়েছে। প্রতিটি ইস্ট জিন সম্পর্কে আরও তথ্য স্যাকারোমাইসেস জিনোম ডাটাবেস (এসজিডি) থেকে বের করা হয়েছে। প্রতিটি জিনের জন্য সংশ্লিষ্ট জিন অন্টোলজি (জিও) শর্তাবলী এবং জিও-তে তাদের শ্রেণিবিন্যাস জিও কনসোর্টিয়াম থেকে প্রাপ্ত হয়েছিল। বর্তমানে, YEASTRACT জিও থেকে 7100 টিরও বেশি শর্ত বজায় রাখে। ইস্ট জিনের জন্য প্রবর্তক এবং কোডিং অঞ্চলের নিউক্লিওটাইড সিকোয়েন্স রেগুলেটরি সিকোয়েন্স অ্যানালাইসিস টুলস (আরএসএটি) থেকে প্রাপ্ত হয়েছিল। এসজিডি, জিও কনসোর্টিয়াম, আরএসএ টুলস এবং ইস্ট রেগুলেটরি নেটওয়ার্কের সাম্প্রতিক সাহিত্যের সর্বশেষ তথ্যের সাথে মেলে YEASTRACT-এর সমস্ত তথ্য নিয়মিত আপডেট করা হয়। YEASTRACT-এর মধ্যে রয়েছে ডিসকভারার, সরঞ্জামগুলির একটি সেট যা সহ-নিয়ন্ত্রিত জিনের প্রবর্তক অঞ্চলে অতিরিক্ত প্রতিনিধিত্ব করা জটিল মোটিফগুলি সনাক্ত করতে ব্যবহার করা যেতে পারে। ডিসকভার মুসা অ্যালগরিদমের উপর ভিত্তি করে তৈরি। এই অ্যালগরিদমগুলি জিনের একটি তালিকা ইনপুট হিসাবে নেয় এবং অতিরিক্ত উপস্থাপিত মোটিফগুলি সনাক্ত করে, যা পরে YEASTRACT ডাটাবেসে বর্ণিত ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর বাইন্ডিং সাইটগুলির সাথে তুলনা করা যেতে পারে। টিউটোরিয়ালে যেমন উদাহরণ দেওয়া হয়েছে, বেশ কয়েকটি জৈবিক প্রশ্ন সমাধান করার সময় সংগৃহীত তথ্যের ব্যবহার সক্ষম করার জন্যও সুযোগ-সুবিধা প্রদান করা হয়েছে। YEASTRACT একটি প্রদত্ত জিনের নথিভুক্ত বা সম্ভাব্য প্রতিলিপি নিয়ন্ত্রকদের এবং প্রতিটি প্রতিলিপি ফ্যাক্টরের জন্য নথিভুক্ত বা সম্ভাব্য নিয়ন্ত্রকদের সনাক্তকরণের অনুমতি দেয়। এটি ডিএনএ মোটিফ এবং সাহিত্যে বর্ণিত ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর বাইন্ডিং সাইটগুলির মধ্যে তুলনাও সম্ভব করে তোলে। এই ব্যবস্থাটি পরিচিত প্রতিলিপি উপাদানগুলির সাথে তাদের নিয়ন্ত্রক সংযোগের উপর ভিত্তি করে জিনের একটি তালিকা (উদাহরণস্বরূপ মাইক্রো অ্যারে বিশ্লেষণ দ্বারা প্রকাশিত অনুরূপ অভিব্যক্তি প্রোফাইল সহ জিনের একটি সেট) গোষ্ঠীবদ্ধ করার জন্য একটি দরকারী প্রক্রিয়াও সরবরাহ করে। YEASTRACT সংগৃহীত তথ্য থেকে গুরুত্বপূর্ণ জৈবিক তথ্য অনুসন্ধান এবং পুনরুদ্ধারের জন্য এবং জিন-বাই-জিন বিশ্লেষণ বা বিশ্বব্যাপী পদ্ধতির থেকে উদ্ভূত তথ্য থেকে ইস্টের ট্রান্সক্রিপশন নিয়ন্ত্রণ নেটওয়ার্কগুলির পূর্বাভাস দেওয়ার জন্য প্রশ্নের একটি সেট সরবরাহ করে। আরও দেখুন ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর রেফারেন্স এক্সটার্নাল লিঙ্ক http://www.yeastract.com বায়োলজিক্যাল ডেটাবেস স্যাকারোমাইসিটস জিন এক্সপ্রেশন ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর