Macro domain
আণবিক জীববিজ্ঞানে, ম্যাক্রো ডোমেন (প্রায়শই ম্যাক্রোডোমেইনও লেখা হয়) বা এ1পিপি ডোমেন হল প্রায় 180টি অ্যামিনো অ্যাসিডের একটি মডিউল যা এডিপি-রাইবোজ, একটি এনএডি মেটাবোলাইট বা সম্পর্কিত লিগ্যান্ডগুলিকে আবদ্ধ করতে পারে। এডিপি-রাইবোজের সাথে বন্ধন হয় সমযোজী বা অ-সমযোজী হতে পারেঃ কিছু ক্ষেত্রে এটি অ-সমযোজীভাবে আবদ্ধ বলে মনে করা হয়, অন্য ক্ষেত্রে (যেমন অ্যাপ্রাট্যাক্সিন) এটি দস্তা আঙুলের মোটিফের মাধ্যমে অ-সমযোজীভাবে এবং প্রোটিনের একটি পৃথক অঞ্চলের মাধ্যমে সমযোজীভাবে আবদ্ধ বলে মনে হয়। ফাংশন ডোমেনটি মূলত ইস্ট ওয়াইবিআর022ডাব্লু প্রোটিনের এডিপি-রাইবোজ 1-ফসফেট (অ্যাপার-1-পি)-প্রসেসিং ক্রিয়াকলাপের (এ1পিপি) সহযোগিতায় বর্ণনা করা হয়েছিল এবং একে এ1পিপি বলা হয়। যাইহোক, ডোমেনটির নামকরণ করা হয়েছে ম্যাক্রো কারণ এটি স্তন্যপায়ী কোর হিস্টোন ম্যাক্রো-এইচ2এ-এর সি-টার্মিনাল ডোমেন। ম্যাক্রো ডোমেইন প্রোটিনগুলি ইউক্যারিওটস, (বেশিরভাগ প্যাথোজেনিক) ব্যাকটেরিয়া, আর্কিয়া এবং এস. এস. আর. এন. এ ভাইরাস, যেমন করোনভাইরাস, রুবেলা এবং হেপাটাইটিস ই ভাইরাসগুলিতে পাওয়া যায়। মেরুদণ্ডী প্রাণীদের ক্ষেত্রে ক্ষেত্রটি দেখা যায় যেমন। হিস্টোন ম্যাক্রোএইচ2এ, পলি-এডিপি-রাইবোজ পলিমারেজ (পিএআরপি) এবং বি অ্যাগ্রেসিভ লিম্ফোমা (বিএএল) প্রোটিনের পূর্বাভাস দিয়েছে। প্রোটিনের এডিপি-রাইবোসাইলেশন একটি গুরুত্বপূর্ণ অনুবাদ-পরবর্তী পরিবর্তন যা ডিএনএ মেরামত, প্রতিলিপি নিয়ন্ত্রণ, ক্রোমাটিন জীববিজ্ঞান, জিনোমিক স্থিতিশীলতা বজায় রাখা, টেলোমিয়ার গতিবিদ্যা, কোষের পার্থক্য এবং বিস্তার, নেক্রোসিস এবং অ্যাপোপটোসিস এবং দীর্ঘমেয়াদী স্মৃতি গঠন সহ বিভিন্ন জৈবিক প্রক্রিয়াতে ঘটে। ম্যাক্রো ডোমেন এডিপি-রাইবোজ নিউক্লিওটাইড এবং কিছু ক্ষেত্রে পলি-এডিপি-রাইবোজকে স্বীকৃতি দেয় এবং এইভাবে এটি একটি উচ্চ-আকর্ষণ এডিপি-রাইবোজ-বাইন্ডিং মডিউল যা অন্যথায় সম্পর্কহীন প্রোটিনে পাওয়া যায়। ডি. এন. এ-র এডিপি-রাইবোসাইলেশন তুলনামূলকভাবে বিরল এবং শুধুমাত্র পিয়েরিসিন, স্ক্যাবিন এবং ডার্টি সহ অল্প সংখ্যক বিষাক্ত পদার্থের জন্য বর্ণনা করা হয়েছে। টক্সিন-অ্যান্টিটক্সিন সিস্টেম ডারটিজির অ্যান্টিটক্সিন ডারজি থেকে ম্যাক্রো ডোমেন, উভয়ই ডার্টি টক্সিন দ্বারা ডিএনএতে যুক্ত এডিপি-রাইবোজ পরিবর্তনকে আবদ্ধ করে এবং সরিয়ে দেয়। মানুষের ম্যাক্রো ডোমেন, macroH2A1.1, একটি NAD মেটাবোলাইট O-অ্যাসিটাইল-ADP-রাইবোজকে আবদ্ধ করে। কাঠামো ম্যাক্রো ডোমেনের থ্রিডি কাঠামোটি একটি মিশ্র বিটা শীটের একটি মিশ্র আলফা/বিটা ভাঁজকে বর্ণনা করে যা লিগ্যান্ড-বাইন্ডিং পকেটের সাথে চারটি হেলিসের মধ্যে স্যান্ডউইচ করা থাকে। বেশ কয়েকটি ম্যাক্রো-মাত্র ডোমেইন এএফ1521-এর কাঠামোর চেয়ে ছোট এবং প্রথম স্ট্র্যান্ড বা সি-টার্মিনাল হেলিক্স 5-এর অভাব রয়েছে। ভালভাবে সংরক্ষিত অবশিষ্টাংশগুলি একটি হাইড্রোফোবিক ফাটল তৈরি করে এবং এএফ1521-এডিপি-রাইবোজ বাঁধাই সাইটের চারপাশে গুচ্ছ গঠন করে। আরও দেখুন এডিপি-রাইবোসিলেশন রেফারেন্স প্রোটিন ডোমেন