Methyl-CpG-binding domain
আণবিক জীববিজ্ঞানে মিথাইল-সিপিজি-বাইন্ডিং ডোমেন (এমবিডি) ডিএনএর সাথে আবদ্ধ হয় যা এক বা একাধিক প্রতিসমভাবে মিথাইলেটেড সিপিজি ধারণ করে। এম. বি. ডি-র অ-মিথাইলযুক্ত ডি. এন. এ-র প্রতি নগণ্য অ-নির্দিষ্ট আকর্ষণ রয়েছে। ক্রোমোজোমাল প্রোটিন এম. ই. সি. পি. 2-এর সাথে ইন ভিট্রো ফুট-প্রিন্টিং দেখায় যে এম. বি. ডি একটি মিথাইল সি. পি. জি জুটির আশেপাশের 12টি নিউক্লিওটাইড অঞ্চলকে রক্ষা করতে পারে। সিপিজি ডাইনিউক্লিওটাইডগুলিতে ডিএনএ মিথাইলেশন, ইউক্যারিওটগুলিতে সবচেয়ে সাধারণ ডিএনএ পরিবর্তন, ক্রোমাটিন কাঠামোর পরিবর্তন, জিনোমিক ইমপ্রিন্টিং, ট্রান্সপোসন এবং ক্রোমোজোম এক্স নিষ্ক্রিয়তা, পার্থক্য এবং ক্যান্সারের মতো বিভিন্ন ঘটনার সাথে যুক্ত হয়েছে। ডিএনএ মিথাইলেশনের প্রভাবগুলি প্রোটিনের মাধ্যমে মধ্যস্থতা করা হয় যা প্রতিসমভাবে মিথাইলেটেড সিপিজির সাথে আবদ্ধ হয়। এই ধরনের প্রোটিনগুলিতে ~ 70 অবশিষ্টাংশের একটি নির্দিষ্ট ডোমেন থাকে, মিথাইল-সিপিজি-বাইন্ডিং ডোমেন (এমবিডি), যা ক্রোমাটিনের সাথে যুক্ত অতিরিক্ত ডোমেনের সাথে যুক্ত, যেমন ব্রোমোডোমেইন, এটি হুক মোটিফ, সেট ডোমেন বা পিএইচডি ফিঙ্গার। এম. বি. ডি-যুক্ত প্রোটিনগুলি কাঠামোগত প্রোটিন হিসাবে কাজ করে বলে মনে হয়, যা বিভিন্ন হিস্টোন ডিঅ্যাসিটাইলেজ (এইচ. ডি. এ. সি) কমপ্লেক্স এবং ক্রোমাটিন পুনর্নির্মাণের কারণগুলি নিয়োগ করে, যা ক্রোমাটিন সংকোচনের দিকে পরিচালিত করে এবং ফলস্বরূপ, প্রতিলিপিগত দমনের দিকে পরিচালিত করে। এম. ই. সি. পি. 2, এম. বি. ডি. 1, এম. বি. ডি. 2, এম. বি. ডি. 4 এবং বি. এ. জেড. 2-এর এম. বি. ডি ডি. এন. এ-র সঙ্গে এবং এম. ই. সি. পি. 2, এম. বি. ডি. 1 এবং এম. বি. ডি. 2-এর ক্ষেত্রে মিথাইলেটেড সি. পি. জি-র ক্ষেত্রে মধ্যস্থতা করে। মানুষের এম. বি. ডি 3 এবং এস. ই. টি. ডি. বি 1-এ, এম. বি. ডি প্রোটিন-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়ার মধ্যস্থতা করতে দেখা গেছে। এম. বি. ডি ডি. এন. এ ডিমাইথাইলেসেও পাওয়া যায়। এম. বি. ডি একটি আলফা/বিটা স্যান্ডউইচ কাঠামোতে ভাঁজ হয় যা বাঁকানো বিটা শীটের একটি স্তর নিয়ে গঠিত, যা আলফা 1 হেলিক্স দ্বারা গঠিত আরেকটি স্তর এবং সি টার্মিনাসের একটি হেয়ারপিন লুপ দ্বারা সমর্থিত। এই স্তরগুলি উভয়ই অ্যাম্ফিপ্যাথিক, আলফা 1 হেলিক্স এবং বিটা শীট সমান্তরালভাবে পড়ে এবং হাইড্রোফোবিক মুখগুলি একে অপরের বিরুদ্ধে শক্তভাবে প্যাক করা থাকে। বিটা শীট দুটি দীর্ঘ অভ্যন্তরীণ স্ট্র্যান্ড (বিটা 2 এবং বিটা 3) দ্বারা গঠিত যা দুটি ছোট বাইরের স্ট্র্যান্ড (বিটা 1 এবং বিটা 4) দ্বারা স্যান্ডউইচ করা হয়। মিথাইলেটেড ডি. এন. এ-র সাথে আবদ্ধ এম. বি. ডি ডোমেনের কাঠামো সমাধান করা হয়েছে ()। এটি মিথাইলেটেড স্থানগুলিতে প্রধান খাঁজটির হাইড্রেশনকে স্বীকৃতি দেয়। তথ্যসূত্র প্রোটিন ক্ষেত্র