Druggability
ড্রাগাবিলিটি এমন একটি শব্দ যা ড্রাগ আবিষ্কারের সময় একটি জৈবিক লক্ষ্য (যেমন একটি প্রোটিন) বর্ণনা করতে ব্যবহৃত হয় যা একটি ড্রাগের সাথে উচ্চ অনুরাগের সাথে পরিচিত বা আবদ্ধ হওয়ার পূর্বাভাস দেওয়া হয়। উপরন্তু, সংজ্ঞা অনুসারে, একটি ড্রাগযোগ্য লক্ষ্যের সাথে ওষুধের বন্ধন অবশ্যই রোগীর জন্য একটি থেরাপিউটিক সুবিধা সহ লক্ষ্যের কার্যকারিতা পরিবর্তন করতে হবে। ড্রাগযোগ্যতার ধারণাটি প্রায়শই ছোট অণুতে (কম আণবিক ওজনের জৈব পদার্থ) সীমাবদ্ধ থাকে তবে থেরাপিউটিক মনোক্লোনাল অ্যান্টিবডিগুলির মতো জৈবিক চিকিৎসা পণ্যগুলিকে অন্তর্ভুক্ত করার জন্যও প্রসারিত করা হয়েছে। ওষুধ আবিষ্কারের বেশ কয়েকটি পর্যায় রয়েছে যা একটি জৈবিক অনুমান থেকে একটি অনুমোদিত ওষুধের দিকে নিয়ে যায়। লক্ষ্য সনাক্তকরণ সাধারণত আধুনিক ওষুধ আবিষ্কার প্রক্রিয়ার সূচনা বিন্দু। বিভিন্ন পরীক্ষামূলক মানদণ্ডের ভিত্তিতে প্রার্থী লক্ষ্যগুলি নির্বাচন করা যেতে পারে। এই মানদণ্ডগুলির মধ্যে থাকতে পারে রোগ সংযোগ (প্রোটিনের রূপান্তরগুলি একটি রোগের কারণ হিসাবে পরিচিত), যান্ত্রিক যৌক্তিকতা (উদাহরণস্বরূপ, প্রোটিন একটি নিয়ন্ত্রক পথের অংশ যা রোগ প্রক্রিয়ার সাথে জড়িত), বা মডেল জীবের জেনেটিক স্ক্রিন। তবে শুধুমাত্র রোগের প্রাসঙ্গিকতা একটি প্রোটিনের ওষুধের লক্ষ্য হয়ে ওঠার জন্য অপর্যাপ্ত। উপরন্তু, লক্ষ্য অবশ্যই ড্রাগযোগ্য হতে হবে। মাদকদ্রব্যের পূর্বাভাস যদি একটি ওষুধ ইতিমধ্যে একটি লক্ষ্যের জন্য চিহ্নিত করা হয়ে থাকে, তবে সেই লক্ষ্যটি সংজ্ঞা অনুসারে ড্রাগযোগ্য। যদি কোনও পরিচিত ওষুধ কোনও লক্ষ্যের সাথে আবদ্ধ না হয়, তবে বিবর্তনীয় সম্পর্ক, থ্রিডি-স্ট্রাকচারাল বৈশিষ্ট্য বা অন্যান্য বর্ণনার উপর নির্ভরশীল বিভিন্ন পদ্ধতি ব্যবহার করে ড্রাগাবিলিটি বোঝানো বা পূর্বাভাস দেওয়া হয়। অগ্রাধিকার-ভিত্তিক একটি প্রোটিন "ড্রাগযোগ্য" বলে পূর্বাভাস দেওয়া হয় যদি এটি একটি প্রোটিন পরিবারের সদস্য হয় যার জন্য পরিবারের অন্যান্য সদস্যরা ড্রাগ দ্বারা লক্ষ্যবস্তু হিসাবে পরিচিত হয় (অর্থাৎ, অ্যাসোসিয়েশন দ্বারা "অপরাধবোধ")। যদিও এটি ড্রাগযোগ্যতার একটি দরকারী অনুমান, এই সংজ্ঞাটির দুটি প্রধান কারণে সীমাবদ্ধতা রয়েছেঃ (1) এটি শুধুমাত্র ঐতিহাসিকভাবে সফল প্রোটিনগুলিকে তুলে ধরে, একটি নিখুঁত ড্রাগযোগ্য, কিন্তু এখনও ড্রাগবিহীন প্রোটিন পরিবারের সম্ভাবনাকে উপেক্ষা করে; এবং (2) ধরে নেয় যে সমস্ত প্রোটিন পরিবারের সদস্যরা সমানভাবে ড্রাগযোগ্য। কাঠামো-ভিত্তিক এটি পরীক্ষামূলকভাবে নির্ধারিত থ্রিডি কাঠামো বা উচ্চমানের সমতাত্ত্বিক মডেলের উপলব্ধতার উপর নির্ভর করে। ড্রাগযোগ্যতার এই মূল্যায়নের জন্য বেশ কয়েকটি পদ্ধতি রয়েছে তবে সেগুলির সবকটিই তিনটি প্রধান উপাদান নিয়ে গঠিতঃ কাঠামোর উপর গহ্বর বা পকেট সনাক্ত করা পকেটে ভৌত রাসায়নিক এবং জ্যামিতিক বৈশিষ্ট্য গণনা করা এই বৈশিষ্ট্যগুলি কীভাবে পরিচিত ড্রাগযোগ্য লক্ষ্যগুলির একটি প্রশিক্ষণ সেটের সাথে খাপ খায় তা মূল্যায়ন করা, সাধারণত মেশিন লার্নিং অ্যালগরিদম ব্যবহার করে কাঠামো-ভিত্তিক ড্রাগযোগ্যতার কিছু পরামিতি প্রবর্তনের প্রাথমিক কাজটি আবাগিয়ান এবং সহকর্মীদের এবং তারপরে ফেসিক এবং সহকর্মীদের কাছ থেকে এসেছিল, পরেরটি একটি এন. এম. আর-ভিত্তিক টুকরো স্ক্রিন থেকে আঘাতের সাথে নির্দিষ্ট ভৌত রাসায়নিক পরামিতিগুলির পারস্পরিক সম্পর্ক মূল্যায়ন করে। এর পর থেকে বেশ কয়েকটি প্রকাশনা সম্পর্কিত পদ্ধতির প্রতিবেদন প্রকাশ করেছে। কাঠামো-ভিত্তিক ড্রাগযোগ্যতা মূল্যায়নের জন্য বেশ কয়েকটি বাণিজ্যিক সরঞ্জাম এবং ডাটাবেস রয়েছে। চিইএমবিএল-এর ড্রাগইবিলিটি পোর্টালের মাধ্যমে প্রোটিন ডেটা ব্যাঙ্কের (পিডিবি) মধ্যে সমস্ত কাঠামোগত ক্ষেত্রের জন্য প্রাক-গণনাকৃত ড্রাগযোগ্যতা মূল্যায়নের একটি সর্বজনীনভাবে উপলব্ধ ডাটাবেস সরবরাহ করা হয়। কাঠামো-ভিত্তিক ড্রাগাবিলিটি সাধারণত একটি ছোট অণুর জন্য উপযুক্ত বাঁধাই পকেট সনাক্ত করতে ব্যবহৃত হয়; যাইহোক, কিছু গবেষণায় হেলিকাল মিমেটিক্স বাঁধাইয়ের জন্য উপযুক্ত খাঁজগুলির উপলব্ধতার জন্য 3D কাঠামো মূল্যায়ন করা হয়েছে। প্রোটিন-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়ার মাদকযোগ্যতা মোকাবেলায় এটি একটি ক্রমবর্ধমান জনপ্রিয় পদ্ধতি। অন্যান্য বৈশিষ্ট্যের উপর ভিত্তি করে পূর্বাভাসের পাশাপাশি থ্রিডি কাঠামো এবং পারিবারিক অগ্রাধিকার ব্যবহার করে, প্রোটিনের অন্যান্য বৈশিষ্ট্য যেমন অ্যামিনো-অ্যাসিড সিকোয়েন্স (বৈশিষ্ট্য-ভিত্তিক ড্রাগাবিলিটি) থেকে প্রাপ্ত বৈশিষ্ট্যগুলি ব্যবহার করে ড্রাগাবিলিটি অনুমান করা সম্ভব যা ছোট-অণু ভিত্তিক ড্রাগাবিলিটি বা বায়োথেরাপিউটিক-ভিত্তিক ড্রাগাবিলিটি বা লিগ্যান্ড বা যৌগগুলির বৈশিষ্ট্যগুলি মূল্যায়নের জন্য প্রযোজ্য যা প্রোটিনকে আবদ্ধ করে (লিগ্যান্ড-ভিত্তিক ড্রাগাবিলিটি)। প্রশিক্ষণ সেটের গুরুত্ব মাদকযোগ্যতা মূল্যায়নের জন্য সমস্ত পদ্ধতি সেগুলি বিকাশের জন্য ব্যবহৃত প্রশিক্ষণ সেটের উপর অত্যন্ত নির্ভরশীল। এটি উপরে আলোচিত সমস্ত পদ্ধতির একটি গুরুত্বপূর্ণ সতর্কতা তুলে ধরেঃ যা তারা এ পর্যন্ত সাফল্য থেকে শিখেছে। প্রশিক্ষণ সেটগুলি সাধারণত হয় কিউরেটেড ড্রাগ টার্গেটগুলির ডেটাবেস; স্ক্রিন করা টার্গেট ডেটাবেস (চিইএমবিএল, বাইন্ডিংডিবি, পাবচেম ইত্যাদি)। ); অথবা ডেভেলপারদের দ্বারা ড্রাগযোগ্য বলে পরিচিত 3D কাঠামোর ম্যানুয়ালি সংকলিত সেটগুলিতে। প্রশিক্ষণ সেটগুলির উন্নতি ও সম্প্রসারণের সাথে সাথে মাদকাসক্তির সীমানাও প্রসারিত হতে পারে। মানুষের মাত্র 2 শতাংশ প্রোটিন বর্তমানে অনুমোদিত ওষুধের সঙ্গে মিথস্ক্রিয়া করে। উপরন্তু, এটি অনুমান করা হয় যে শুধুমাত্র 10-15% মানব প্রোটিনগুলি রোগ পরিবর্তনকারী এবং শুধুমাত্র 10-15% ড্রাগযোগ্য (উভয়ের মধ্যে কোনও সম্পর্ক নেই), যার অর্থ শুধুমাত্র 1-2.25% রোগ পরিবর্তনকারী প্রোটিনগুলির মধ্যে ড্রাগযোগ্য হওয়ার সম্ভাবনা রয়েছে। তাই নতুন অনাবিষ্কৃত ওষুধের লক্ষ্যমাত্রার সংখ্যা খুব সীমিত বলে মনে হয়। যদি প্রোটিন-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া ছোট অণু দ্বারা ব্যাহত হতে পারে তবে প্রোটিনের একটি সম্ভাব্য অনেক বড় শতাংশকে ড্রাগযোগ্য করা যেতে পারে। তবে এই মিথস্ক্রিয়াগুলির বেশিরভাগই মিথস্ক্রিয়াশীল প্রোটিন অংশীদারদের তুলনামূলকভাবে সমতল পৃষ্ঠের মধ্যে ঘটে এবং ছোট অণুগুলির পক্ষে এই পৃষ্ঠগুলির সাথে উচ্চ সাদৃশ্যের সাথে আবদ্ধ হওয়া খুব কঠিন। তাই প্রোটিনের উপর এই ধরনের বাঁধাই সাইটগুলি সাধারণত অপ্রতিরোধ্য বলে মনে করা হয় তবে এই সাইটগুলিকে লক্ষ্য করে কিছু অগ্রগতি হয়েছে (2009 সালের মধ্যে)। কেমোপ্রোটোমিক্স কৌশলগুলি সম্প্রতি প্রোটিওম জুড়ে সমযোজীভাবে পরিবর্তনযোগ্য সাইটগুলি সনাক্ত করার মাধ্যমে একটি ড্রাগযোগ্য লক্ষ্য হিসাবে বিবেচিত হওয়ার সুযোগকে প্রসারিত করেছে। তথ্যসূত্র আরও পড়া বাহ্যিক লিঙ্ক মাদক আবিষ্কার