B-box zinc finger
আণবিক জীববিজ্ঞানে বি-বক্স-টাইপ জিঙ্ক ফিঙ্গার ডোমেন হল প্রায় 40টি অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশের একটি ছোট প্রোটিন ডোমেন। বি-বক্স দস্তা আঙ্গুলগুলিকে দুটি গ্রুপে ভাগ করা যেতে পারে, যেখানে টাইপ 1 এবং 2 বি-বক্স ডোমেনগুলি তাদের সর্বসম্মত ক্রম এবং 7-8 দস্তা-বাঁধাই অবশিষ্টাংশের ব্যবধানের ক্ষেত্রে পৃথক হয়। বেশ কয়েকটি প্রোটিনে উভয় ধরনের 1 এবং 2 বি-বক্স থাকে, যা এই দুটি ক্ষেত্রের মধ্যে কিছু মাত্রার সহযোগিতার পরামর্শ দেয়। বিভিন্ন জীবের 1500 টিরও বেশি প্রোটিনে ঘটনা বি-বক্স ডোমেন পাওয়া যায়। এগুলি টিআরআইএম (ত্রিপক্ষীয় মোটিফ) প্রোটিনে পাওয়া যায় যা একটি এন-টার্মিনাল রিং আঙুল (মূলত একটি এ-বক্স নামে পরিচিত), তারপরে 1-2 বি-বক্স ডোমেন এবং একটি কয়েল-কয়েল ডোমেন (রিং, বি-বক্স, কয়েল-কয়েলের জন্য আরবিসিসি নামেও পরিচিত) নিয়ে গঠিত। টিআরআইএম প্রোটিনে একটি টাইপ 2 বি-বক্স ডোমেন থাকে এবং একটি টাইপ 1 বি-বক্সও থাকতে পারে। যে প্রোটিনগুলিতে রিং বা কয়েল-কয়েল ডোমেন থাকে না, সেখানে বি-বক্স ডোমেন প্রাথমিকভাবে টাইপ 2 হয়। অনেক টাইপ 2 বি-বক্স প্রোটিন ইউবিকুইটিনিলেশনের সাথে জড়িত। বি-বক্স জিঙ্ক ফিঙ্গার ডোমেইন ধারণকারী প্রোটিনগুলির মধ্যে রয়েছে ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর, রাইবোনিউক্লিওপ্রোটিন এবং প্রোটো-অনকোপ্রোটিন; উদাহরণস্বরূপ, এমআইডি1, এমআইডি2, টিআরআইএম9, টিএনএল, টিআরআইএম36, টিআরআইএম63, টিআরআইএফআইসি, এনসিএল1 এবং কনস্ট্যান্স-সদৃশ প্রোটিন। মাইক্রোট্যুবুল-সম্পর্কিত ই3 লিগাজ এম. আই. ডি1 (ই. সি)-এ টাইপ 1 বি-বক্স জিঙ্ক ফিঙ্গার ডোমেন রয়েছে। এম. আই. ডি. 1 বিশেষভাবে আলফা-4-কে আবদ্ধ করে, যা ফলস্বরূপ ফসফেটেজ 2এ (পিপি2এসি)-এর অনুঘটক উপ-একক নিয়োগ করে। প্রোটিসোম-মধ্যস্থ অবক্ষয়ের জন্য পিপি2এসি লক্ষ্য করার জন্য এই কমপ্লেক্সটি প্রয়োজন। এমআইডি1 বি-বক্স দুটি দস্তা আয়নকে সমন্বয় করে এবং জেডজেড, পিএইচডি, রিং এবং এফওয়াইভিই দস্তা আঙ্গুলের মতো একটি বিটা/বিটা/আলফা ক্রস-ব্রেস কাঠামো গ্রহণ করে। ডোমেনের প্রোক্যারিওটিক হোমোলোগগুলি বেশ কয়েকটি ব্যাকটেরিয়া বংশ এবং মিথেনোজেনিক আর্কিয়ায় উপস্থিত থাকে এবং প্রায়শই পেপ্টিডেজ ডোমেনের সাথে সংমিশ্রণ দেখায় যেমন রম্বোইড-সদৃশ সেরিন পেপ্টিডেজ এবং জেডএন-নির্ভর মেটালোপেপ্টিডেজ। অন্যান্য সংস্করণগুলিতে সাধারণত ট্রান্সমেম্ব্রেন হেলিস থাকে এবং ডিএনএজে, এফএইচএ, এসএইচ3, ডাব্লুডি40 এবং টেট্রাট্রিকোপেপটাইড পুনরাবৃত্তির মতো ডোমেনে ফিউশনও দেখাতে পারে। এই সংগঠনগুলি একসাথে প্রোটিওলিটিক প্রক্রিয়াকরণ, ভাঁজ বা ঝিল্লি-সম্পর্কিত প্রোটিনের স্থিতিশীলতায় বি-বক্স দস্তা আঙুল ডোমেনের প্রোক্যারিওটিক হোমোলোগের জন্য একটি ভূমিকার পরামর্শ দেয়। ডোমেন স্থাপত্যের বাক্য গঠন উল্লেখযোগ্যভাবে এএন1 দস্তা আঙুল এবং এলআইএম ডোমেনের প্রোক্যারিওটিক হোমোলগে দেখা যায়। তথ্যসূত্র উদ্ভিদ টিএফডিবি-তে সিও-সদৃশ পরিবার, ডিবিবি পরিবারের বাহ্যিক সংযোগঃ উদ্ভিদ প্রতিলিপি ফ্যাক্টর ডাটাবেস আরও দেখুন জিঙ্ক ফিঙ্গার প্রোটিন ডোমেন