Prokaryotic riboflavin biosynthesis protein
প্রোক্যারিওটিক রাইবোফ্লাভিন বায়োসিন্থেসিস প্রোটিন হল ব্যাকটেরিয়ায় পাওয়া একটি দ্বি-কার্যকরী উৎসেচক যা রাইবোফ্লাভিনের ফসফোরিলেশনকে ফ্ল্যাভিন মনোনিউক্লিওটাইড (এফএমএন)-এ অনুঘটক করে এবং এফএমএন-এর অ্যাডেনিলিলেশনকে ফ্ল্যাভিন অ্যাডেনিন ডাইনিউক্লিওটাইড (এফএডি)-এ অনুঘটক করে। এটি একটি সি-টার্মিনাল রাইবোফ্লাভিন কাইনেজ এবং একটি এন-টার্মিনাল এফএমএন-অ্যাডেনিলাইলট্রান্সফেরেজ নিয়ে গঠিত। এই ব্যাকটেরিয়াল প্রোটিন কার্যকরীভাবে ইউক্যারিওটিক জীবের মনোফাংশানাল রাইবোফ্লাভিন কাইনেস এবং এফএমএন-অ্যাডেনিলাইলট্রান্সফেরেসের অনুরূপ, তবে শুধুমাত্র রাইবোফ্লাভিন কাইনেসগুলি কাঠামোগতভাবে সমজাতীয়। কাঠামো প্রোক্যারিওটিক রাইবোফ্লাভিন জৈব সংশ্লেষণ প্রোটিনগুলি প্রোক্যারিওটিক টাইপ-আই এফ. এ. ডি সিন্থেটেস নামেও পরিচিত, যা একটি সি-টার্মিনাল রাইবোফ্লাভিন কিনেজ (আর. এফ. কে) এবং একটি এন-টার্মিনাল এফ. এম. এন-অ্যাডেনিলাইলট্রান্সফেরেজ (এফ. এম. এন. এ. টি) নিয়ে গঠিত। গোলাকার আরএফকে-তে ছয়টি সমান্তরাল β-শীট রয়েছে যা একটি β-ব্যারেল এবং এই কাঠামো সংলগ্ন একটি α-হেলিক্স গঠন করে। ব্যারেল এবং হেলিক্স 7টি স্বাধীন লুপ দ্বারা একসঙ্গে ধরে রাখা হয়। এফ. এম. এন. এ. টি মডিউলে সক্রিয় স্থানের মধ্যে একটি α/β ডাইনুক্লিয়টাইড বাঁধাই ক্ষেত্র থাকে, যা এটি স্তরের সাথে বাঁধতে ব্যবহার করে। সামগ্রিক কাঠামোটি 5টি সমান্তরাল β-শীট দ্বারা একত্রিত করা হয় যা 4টি α-হেলিসের সংলগ্ন, যার মধ্যে 2টি দীর্ঘ এবং 2টি ছোট। একটি সাবডোমেন, যার মধ্যে 2টি ছোট α-হেলিস রয়েছে, সি-টার্মিনাল আরএফকে মডিউলের সাথে সংযুক্ত এলাকাটিকে অন্তর্ভুক্ত করে। রাইবোফ্লাভিন কাইনেসের ক্রিয়া দ্বারা রাইবোফ্লাভিন অনুঘটক হিসাবে সক্রিয় কোফ্যাক্টর এফ. এ. ডি এবং এফ. এম. এন-এ রূপান্তরিত হয়, যা এটিকে এফ. এম. এন এবং এফ. এ. ডি সিন্থেটেসে রূপান্তরিত করে, যা এফ. এম. এন-কে এফ. এ. ডি-তে অ্যাডেনাইলেট করে। আরএফকে মডিউলটি রাইবোফ্লাভিন স্তরকে ফসফোরিলেট করে এবং এটিকে এফএমএন-এ রূপান্তরিত করে, যা পরে মডিউল থেকে মুক্তি পায়। এই বিক্রিয়াটি একটি এম. জি. 2 + আয়ন দ্বারা স্থিতিশীল একটি এ. টি. পি অণুর উপর নির্ভরশীল, যার ফলে শুধুমাত্র একটি ফসফেট গ্রুপ এ. টি. পি এবং রাইবোফ্লাভিনের সাথে বন্ধন ছেড়ে যায়। মুক্তিপ্রাপ্ত এফ. এম. এন তারপর এন-টার্মিনাল এফ. এম. এন. এ. টি মডিউলের সাথে যুক্ত হয় এবং অ্যাডেনাইলেটেড হয়, এ. টি. পি-র অ্যাডেনিলিল গ্রুপ এফ. এম. এন-এ ফসফেট গ্রুপের সাথে সংযুক্ত হয় এবং ডাইফসফেট গ্রুপটি চলে যায়। এ. টি. পি + রাইবোফ্লাভিন এ. ডি. পি + এফ. এম. এন এ. টি. পি + এফ. এম. এন ডাইফসফেট + এফ. এ. ডি ফাইলোজেনেটিক ডোমেইন তুলনা ইউক্যারিওটসের সাধারণত দুটি পৃথক এনজাইম থাকে, যেখানে বেশিরভাগ প্রোক্যারিওটসের একটি একক দ্বি-কার্যকরী প্রোটিন থাকে যা উভয় অনুঘটক বহন করতে পারে, যদিও উভয় ক্ষেত্রেই ব্যতিক্রম ঘটে। ইউক্যারিওটিক মনোফাংশানাল আর. এফ. কে বাইফাংশানাল প্রোক্যারিওটিক আর. এফ. কে মডিউলের অর্থোলোগাস হলেও, মনোফাংশানাল এফ. এম. এন. এ. টি তার প্রোক্যারিওটিক প্রতিরূপের থেকে আলাদা এবং এর পরিবর্তে পি. এ. পি. এস-রিডাক্টেস পরিবারের সাথে সম্পর্কিত। বাইফাংশানাল এনজাইমের ব্যাকটেরিয়াল এফএমএনএটি মডিউলের ইউক্যারিওটিক নিউক্লিওটিডিলট্রান্সফেরেসের সাথে দূরবর্তী মিল রয়েছে এবং তাই এটি এফএডি সিন্থেটেসের অ্যাডেনিলিলেশন প্রতিক্রিয়ায় জড়িত থাকতে পারে। তথ্যসূত্র প্রোটিন পরিবার