KIX domain
বায়োকেমিস্ট্রিতে, কেআইএক্স ডোমেন (কাইনেজ-ইনডিউসিবল ডোমেন (কেআইডি) ইন্টারঅ্যাক্টিং ডোমেন) বা সিআরইবি বাইন্ডিং ডোমেন হল ইউক্যারিওটিক ট্রান্সক্রিপশনাল কো-অ্যাক্টিভেটর সিবিপি এবং পি300-এর একটি প্রোটিন ডোমেন। এটি কো-অ্যাক্টিভেটর এবং নির্দিষ্ট ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টরের মধ্যে হেটেরোডাইমার গঠনের জন্য ডকিং সাইট হিসাবে কাজ করে। কাঠামোগতভাবে, কেআইএক্স ডোমেনটি একটি গোলাকার ডোমেন যা তিনটি α-হেলিস এবং দুটি ছোট 310-হেলিস নিয়ে গঠিত। কেআইএক্স ডোমেনটি মূলত 1996 সালে সিবিপির নির্দিষ্ট এবং ন্যূনতম অঞ্চল হিসাবে আবিষ্কৃত হয়েছিল যা ট্রান্সক্রিপশন সক্রিয় করতে ফসফরিলেটেড সিআরইবি-র সাথে আবদ্ধ এবং মিথস্ক্রিয়া করে। এইভাবে এটিকে প্রথম সি. আর. ই. বি-বাইন্ডিং ডোমেন বলা হয়। যাইহোক, পরে যখন এটি আবিষ্কৃত হয় যে এটি অন্যান্য অনেক প্রোটিনকেও আবদ্ধ করে, তখন আরও সাধারণ নাম কেআইএক্স ডোমেনটি জনপ্রিয় হয়ে ওঠে। কেআইএক্স ডোমেনে দুটি পৃথক বাঁধাই সাইট রয়েছেঃ "সি-মাইব সাইট", যা অনকোপ্রোটিন সি-মাইবের নামে নামকরণ করা হয়েছে এবং "এমএলএল সাইট", প্রোটো-অনকোজিন এমএলএল (মিশ্র বংশগত লিউকেমিয়া, কেএমটি2এ) এর নামে নামকরণ করা হয়েছে। প্যারালগাস কো-অ্যাক্টিভেটর সি. বি. পি (সি. আর. ই. বি. বি. পি) এবং পি300 (ই. পি300)-কে ট্রান্সক্রিপশন সক্রিয় করার জন্য ডি. এন. এ-আবদ্ধ ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টরগুলিতে নিয়োগ করা হয়। কো-অ্যাক্টিভেটররা শুধুমাত্র ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টরগুলির সাথে প্রোটিন-প্রোটিন যোগাযোগের মাধ্যমে পরোক্ষভাবে ডি. এন. এ-তে প্রোমোটার এবং বর্ধকদের সাথে যুক্ত হতে পারে। সিবিপি এবং পি300 দুটি উপায়ে ট্রান্সক্রিপশনকে সমন্বিতভাবে সক্রিয় করেঃ প্রথমত, তাদের অভ্যন্তরীণ হিস্টোন অ্যাসিটাইলট্রান্সফেরেজ ক্রিয়াকলাপের মাধ্যমে ক্রোমাটিনকে পুনর্নির্মাণ ও শিথিল করে এবং দ্বিতীয়ত, আরএনএ পলিমারেজ II-এর মতো বেসাল ট্রান্সক্রিপশন যন্ত্রপাতি নিয়োগ করে। কেআইএক্স ডোমেইন প্রস্তাবিত গ্যাকিক্স ডোমেইন সুপারফ্যামিলির অন্তর্গত। GACKIX সম্পর্কিত প্রোটিনে কাঠামোগত এবং কার্যকরীভাবে অত্যন্ত সমজাতীয় ক্ষেত্র নিয়ে গঠিত। এটি GAL11/ARC105 (MED15) প্রোটিন, উদ্ভিদ প্রোটিন সিবিপি-সদৃশ এবং সিবিপি এবং পি300 থেকে কেআইএক্স ডোমেনের নামে নামকরণ করা হয়েছে। অতিরিক্ত উদাহরণগুলির মধ্যে রয়েছে আরইসিকিউএল5 এবং সম্পর্কিত উদ্ভিদ প্রোটিন। এগুলির সবকটিতেই একটি কেআইএক্স ডোমেন বা কেআইএক্স-সম্পর্কিত ডোমেন রয়েছে যা বিভিন্ন ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টরের ট্রান্সঅ্যাকটিভেশন ডোমেনের সাথে যোগাযোগ করে। একটি কেআইএক্স ডোমেন, একটি কেআইএক্স-সম্পর্কিত ডোমেন এবং একটি গ্যাকিক্স ডোমেনের মধ্যে পার্থক্য একটি চলমান বিতর্কের বিষয় এবং স্পষ্টভাবে সংজ্ঞায়িত নয়। সম্পূর্ণ সিবিপি/পি300 প্রোটিন কেআইএক্স ডোমেন ছাড়াও, সিবিপি এবং পি300-তে আরও অনেক প্রোটিন বাইন্ডিং ডোমেন রয়েছে যা বিভ্রান্ত হওয়া উচিত নয় (সংখ্যাগুলি এএ সংখ্যা): সিএইচ1/টিএজেড1 ডোমেন, সিবিপি [347-433], পি300 [323-423] কেআইএক্স ডোমেন, সিবিপি [587-666], পি300 [566-645] ব্রোমোডোমেইন, সিবিপি [1103-1175], পি300 [1067-1139] সিএইচ2 ডোমেন (), সিবিপি [1191-1317, পি300 [1155-1280]। এইচএটি ডোমেইন, সিবিপি [1323-1700], পি300 [1287-1663] সিএইচ3/জেডজেড ডোমেইন, সিবিপি [1701-1744], পি300 [1664-1707] সিএইচ3/টিএজেড2 ডোমেইন, সিবিপি [1765-1846], পি300 [1728-1809] আইআরএফ-3 বাইন্ডিং (আই-বিআইডি), নিউক্লিয়ার রিসেপ্টর কো-অ্যাক্টিভেটর বাইন্ডিং (এনসিবিডি), বা এসআরসি1 ইন্টারঅ্যাকশন ডোমেইন (এসআইডি;), সিবিপি [2020-2113, পি300 [1992-2098। তিনটি সিএইচ (সিস্টিন/হিস্টিডাইন সমৃদ্ধ) ক্ষেত্রই দস্তা আঙ্গুল। মিথস্ক্রিয়া মানব এবং প্রাণী প্রোটিনঃ খামির প্রোটিনঃ ভাইরাল প্রোটিনঃ রেফারেন্স বাইরের লিঙ্ক KIXBASE, KIX-সুপারফ্যামিলি ডোমেন এবং PDB কাঠামোর একটি ডাটাবেস (HMM প্রশিক্ষণ ডেটাসেট) প্রোটিন ডোমেন জিন অভিব্যক্তি