Iron dependent repressor
আণবিক জীববিজ্ঞানে, লোহা নির্ভর দমনকারী হল ব্যাকটেরিয়া এবং আর্কিয়াল প্রতিলিপি দমনকারীগুলির একটি পরিবার। তাদের এন-টার্মিনাস-এ একটি ডিটিএক্সআর-টাইপ এইচটিএইচ ডোমেন থাকে। এটি ডি. টি. এক্স. আর/এম. এন. টি. আর পরিবারের মেটালোরেগুলেটরগুলিতে উপস্থিত প্রায় 65টি অ্যামিনো অ্যাসিডের একটি ডি. এন. এ-বাইন্ডিং, ডানাযুক্ত হেলিক্স-টার্ন-হেলিক্স (ডব্লিউ. এইচ. টি. এইচ) ক্ষেত্র। আয়রন-নির্দিষ্ট ডিপথেরিয়া টক্সিন দমনকারী কোরিনেব্যাকটেরিয়াম ডিপথেরিয়া ডিটিএক্সআর এবং ম্যাঙ্গানিজ পরিবহন নিয়ন্ত্রক ব্যাসিলাস সাবটিলিস এমএনটিআর-এর নামে এই অঞ্চলের নামকরণ করা হয়েছে। ডিটিএক্সআর এবং আই. ডি. আর-এর মতো আয়রন-প্রতিক্রিয়াশীল মেটালোরেগুলেটর উচ্চ জিসি শাখার গ্রাম-পজিটিভ ব্যাকটেরিয়ায় দেখা যায়, অন্যদিকে এম. এন. টি. আর-এর মতো ম্যাঙ্গানিজ-প্রতিক্রিয়াশীল মেটালোরেগুলেটরগুলি গ্রাম-পজিটিভ এবং গ্রাম-নেগেটিভ ব্যাকটেরিয়ার বিভিন্ন গণ এবং আর্কিয়াতেও বর্ণনা করা হয়। ডিটিএক্সআর/এমএনটিআর-এর মতো মেটালোরেগুলেটরগুলিতে সাধারণত এন-টার্মিনাল অংশে ডিএনএ-বাইন্ডিং ডিটিএক্সআর-টাইপ এইচটিএইচডোমেন থাকে। সি-টার্মিনাল অংশে দুটি ধাতব-বাঁধাই সাইট সহ একটি ডাইমারাইজেশন ডোমেন রয়েছে, যদিও প্রাথমিক ধাতব-বাঁধাই সাইটটি এমএন (II)-নিয়ন্ত্রকগুলিতে কম সংরক্ষিত। ফে (II)-নিয়ন্ত্রিত প্রোটিনগুলিতে সি-টার্মিনাল এক্সটেনশন হিসাবে একটি এসএইচ3-এর মতো ডোমেন থাকে, যা এমএন (II)-নিয়ন্ত্রিত এমএনটিআর-এ অনুপস্থিত। ধাতু-আয়ন নির্ভর নিয়ন্ত্রকরা বেশ কয়েকটি গুরুত্বপূর্ণ মানব রোগজীবাণুগুলির ভাইরাসকে সংগঠিত করে। ডিটিএক্সআর প্রোটিন পরিবেশগত লোহার ঘনত্বের প্রতিক্রিয়ায় ডিপথেরিয়া টক্সিনের অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রণ করে। উপরন্তু, ডিটিএক্সআর এবং আই. ডি. আর আয়রন গ্রহণ নিয়ন্ত্রণ করে। ম্যাঙ্গানিজের হোমিওস্ট্যাসিস, যা একটি প্রয়োজনীয় পুষ্টি, এম. এন. টি. আর দ্বারা নিয়ন্ত্রিত হয়। একটি সাধারণ ডিটিএক্সআর-টাইপ মেটালোরেগুলেটর প্রতি মনোমারে দুটি ডাইভ্যালেন্ট ধাতব প্রভাবককে আবদ্ধ করে, যার উপর অ্যালোস্টেরিক পরিবর্তন ঘটে যা জ্ঞানীয় ডিএনএ অপারেটরদের সাথে মাঝারি বন্ধন ঘটায়। লোহা-আবদ্ধ ডিটিএক্সআর হোমোডিমারগুলি 19 বিপি-র একটি বিঘ্নিত প্যালিনড্রোমের সাথে আবদ্ধ হয়, যা ~ 30 বিপি-র ক্রমকে রক্ষা করে। লোহা-নিয়ন্ত্রিত এবং ম্যাঙ্গানিজ-নিয়ন্ত্রিত দমনকারীগুলির স্ফটিক কাঠামো দেখায় যে ডিএনএ বাঁধাই ডোমেনে তিনটি আলফা-হেলিস এবং এক জোড়া অ্যান্টিপারেলাল বিটা-স্ট্র্যান্ড রয়েছে। হেলিস 2 এবং 3 হেলিক্স-টার্ন-হেলিক্স মোটিফ নিয়ে গঠিত এবং বিটা-স্ট্র্যান্ডগুলিকে উইং বলা হয়। এই ডাব্লুএইচটিএইচ টপোলজি লাইএসআর-টাইপ এইচটিএইচ-এর অনুরূপ। বেশিরভাগ ডিটিএক্সআর-টাইপ মেটালোরেগুলেটর ডিএনএ প্রধান খাঁজটির সাথে ডাইমার হিসাবে আবদ্ধ হয়। বেশ কয়েকটি প্রোটিনে একটি ডিটিএক্সআর-টাইপ এইচটিএইচ ডোমেন রয়েছে বলে জানা যায়। এর মধ্যে রয়েছেঃ কোরিনেব্যাকটেরিয়াম ডিপথেরিয়া ডিটিএক্সআর, একটি ডিপথেরিয়া টক্সিন দমনকারী, যা উচ্চ-আকর্ষণ আয়রন গ্রহণ ব্যবস্থা, অন্যান্য আয়রন-সংবেদনশীল জিন এবং ব্যাকটেরিওফেজ টক্স জিনের অভিব্যক্তি নিয়ন্ত্রণ করে। ধাতব-আবদ্ধ ডিটিএক্সআর টক্স অপারেটরকে আবদ্ধ করে প্রতিলিপি দমন করে; যদি লোহা সীমিত হয়, ডাব্লুএইচটিএইচ-এর গঠনমূলক পরিবর্তনগুলি ডিএনএ-বন্ধনকে ব্যাহত করে এবং ডিপথেরিয়া টক্সিন তৈরি হয়। মাইকোব্যাকটেরিয়াম টিউবারকিউলোসিস আই. ডি. আর, একটি আয়রন-নির্ভর নিয়ন্ত্রক যা এই প্যাথোজেনের জন্য প্রয়োজনীয়। নিয়ন্ত্রক লোহা অর্জনের জন্য জিনগুলিকে দমন করে এবং লোহা সঞ্চয় জিনগুলিকে সক্রিয় করে এবং জারণজনিত চাপ প্রতিক্রিয়াগুলির একটি ইতিবাচক নিয়ন্ত্রক। ব্যাসিলাস সাবটিলিস এমএনটিআর, একটি ম্যাঙ্গানিজ পরিবহন নিয়ন্ত্রক, এমএন2 + কে একটি প্রভাবক হিসাবে আবদ্ধ করে এবং ম্যাঙ্গানিজ আমদানির জন্য পরিবহনকারীদের একটি প্রতিলিপি দমনকারী। ট্রেপোনেমা প্যালিডাম ট্রর, একটি ধাতু-নির্ভর প্রতিলিপি দমনকারী। আর্কিয়োগ্লোবাস ফুলগিডাস এমডিআর1 (ট্রোআর), একটি ধাতু-নির্ভর প্রতিলিপি দমনকারী, যা নেতিবাচকভাবে তার নিজস্ব প্রতিলিপি নিয়ন্ত্রণ করে। তথ্যসূত্র প্রোটিন ক্ষেত্র