Type IV collagen C4 domain
আণবিক জীববিজ্ঞানে, টাইপ IV কোলাজেন সি4 ডোমেন (বা কোলাজেন IV এনসি1 ডোমেন) হল টাইপ IV কোলাজেনের সি-টার্মিনাস-এ উপস্থিত একটি ডুপ্লিকেট ডোমেন। প্রতিটি টাইপ IV কোলাজেনে একটি দীর্ঘ ট্রিপল-হেলিকাল কোলাজেনস ডোমেন থাকে যা যথাক্রমে 25 টি অ্যামিনো অ্যাসিডের একটি সংক্ষিপ্ত 7S ডোমেন এবং এন এবং সি টার্মিনাসের ~ 230 অ্যামিনো অ্যাসিডের একটি গ্লোবুলার অ-কোলাজেনস সি 4 ডোমেন দ্বারা বেষ্টিত। প্রোটোমার সমাবেশে, তিনটি চেইনের সি4 ক্ষেত্র পরস্পরের সঙ্গে মিথস্ক্রিয়া করে, ট্রিপল হেলিক্স গঠনের জন্য চেইন নির্বাচন এবং নিবন্ধনের জন্য একটি সি4 ট্রিমার গঠন করে। নেটওয়ার্ক সমাবেশে, দুটি প্রোটোমারের সি4 ট্রিমার মিথস্ক্রিয়া করে, একটি সি4 হেক্সামার কাঠামো গঠন করে, প্রোটোমার নির্বাচন এবং সংযোগ করতে। কোলাজেন IV সি4 ডোমেনে 12টি সিস্টিন রয়েছে এবং এগুলির সবকটিই ডাইসালফাইড বন্ধনে জড়িত। এটি প্রধানত বিটা-স্ট্র্যান্ড সহ একটি তৃতীয় কাঠামোতে ভাঁজ হয়। কোলাজেন IV সি4 ডোমেনটি দুটি একইভাবে ভাঁজ করা সাবডোমেন নিয়ে গঠিত যা নিম্নলিখিত জোড়াঃ সি1-সি6, সি2-সি5 এবং সি3-সি4-এর সাথে জড়িত 3টি ইন্ট্রাচেইন ডাইসালফাইড বন্ড দ্বারা স্থিতিশীল হয়। প্রতিটি সাবডোমেইন একটি কম্প্যাক্ট ডাইসালফাইড-স্থিতিশীল ত্রিভুজাকার কাঠামোর প্রতিনিধিত্ব করে, যেখান থেকে একটি আঙুলের মতো হেয়ারপিন লুপ একই সংলগ্ন সাবডোমেইনের একটি অসম্পূর্ণভাবে গঠিত ছয়-স্ট্র্যান্ডেড বিটা-শীটে বা একটি সংলগ্ন চেইনে সাবডোমেনগুলিকে শক্তভাবে একত্রিত করে। তথ্যসূত্র প্রোটিন ক্ষেত্র