Intramembrane protease
ইন্ট্রামেম্ব্রেন প্রোটিজেস (আই. এম. পি), যা ইন্ট্রামেম্ব্রেন-ক্লিভিং প্রোটিজেস (আই-সি. এল. আই. পি) নামেও পরিচিত, হল এমন এনজাইম যা ইন্টিগ্রাল মেমব্রেন প্রোটিনের ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেনগুলিকে বিভক্ত করার বৈশিষ্ট্য রাখে। সমস্ত পরিচিত ইন্ট্রামেম্ব্রেন প্রোটিজেসগুলি একাধিক ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেন সহ অবিচ্ছেদ্য ঝিল্লি প্রোটিন এবং তাদের সক্রিয় সাইটগুলি সেলুলার ঝিল্লির লিপিড দ্বিস্তরের মধ্যে সমাহিত থাকে। নিয়ন্ত্রিত ইন্ট্রামেম্ব্রেন প্রোটিওলাইসিস (আর. আই. পি) নামে পরিচিত কোষ সংকেত প্রক্রিয়ায় প্রোটিওলিটিক ক্লিভেজের জন্য দায়ী ইন্ট্রামেম্ব্রেন প্রোটিজেস। ইন্ট্রামেম্ব্রেন প্রোটিজগুলি বিবর্তনীয়ভাবে ধ্রুপদী দ্রবণীয় প্রোটিজের সাথে সম্পর্কিত নয়, যা অভিসারী বিবর্তনের মাধ্যমে তাদের অনুঘটক স্থানগুলি বিকশিত করেছে। যদিও সম্প্রতি আবিষ্কৃত হয়েছে, ইন্ট্রামেম্ব্রেন প্রোটিজগুলি তাদের প্রধান জৈবিক ক্রিয়াকলাপ এবং মানব রোগের সাথে তাদের প্রাসঙ্গিকতার কারণে উল্লেখযোগ্য গবেষণার আগ্রহের বিষয়। শ্রেণীবিভাগ ইন্ট্রামেম্ব্রেন প্রোটিজগুলির চারটি গ্রুপ রয়েছে, যা তাদের অনুঘটক প্রক্রিয়া দ্বারা আলাদা করা হয়েছেঃ মেটালোপ্রোটিজসঃ সাইট-2 প্রোটিজ (এস2পি) এবং এস2পি-এর মতো প্রোটিজ অ্যাস্পার্টিল প্রোটিজসঃ এই গ্রুপে রয়েছে প্রিসেনিলিন, গামা সিক্রেটেজের সক্রিয় সাবইউনিট এবং সিগন্যাল পেপটাইড পেপটিডেজ (এসপিপি) এবং এসপিপি-এর মতো প্রোটিজ, যা প্রিসেনিলিনের সাথে দূরবর্তীভাবে সম্পর্কিত তবে বিপরীত ঝিল্লি অভিযোজন সেরিন প্রোটিজ রয়েছেঃ রম্বোইড প্রোটিজ গ্লুটামিল প্রোটিজঃ শুধুমাত্র একটি উদাহরণ জানা যায়, আরসিই1। স্ট্রাকচার ইন্ট্রামেম্ব্রেন প্রোটিজেস হল অবিচ্ছেদ্য ঝিল্লি প্রোটিন যা একাধিক ট্রান্সমেম্ব্রেন হেলিস সহ পলিটপিক ট্রান্সমেম্ব্রেন প্রোটিন। তাদের সক্রিয় স্থানগুলি ট্রান্সমেম্ব্রেন হেলিসের মধ্যে অবস্থিত এবং হাইড্রোফোবিক লিপিড দ্বিস্তরের মধ্যে একটি জলীয় পরিবেশ গঠন করে। বেশিরভাগ ইন্ট্রামেম্ব্রেন প্রোটিজগুলি মনোমার হিসাবে কাজ করে বলে মনে করা হয়, প্রিসেনিলিনের উল্লেখযোগ্য ব্যতিক্রম যা শুধুমাত্র গামা-সিক্রেটেজ প্রোটিন কমপ্লেক্সে সক্রিয়। এক্স-রে ক্রিস্টালোগ্রাফি বা ক্রায়ো-ইলেক্ট্রন মাইক্রোস্কোপি দ্বারা ইন্ট্রামেম্ব্রেন প্রোটিজের চারটি গ্রুপের উদাহরণ কাঠামোগতভাবে চিহ্নিত করা হয়েছে। এনজাইম্যাটিক ক্রিয়াকলাপ ইন্ট্রামেম্ব্রেন প্রোটিজের চারটি গ্রুপের মধ্যে তিনটি তাদের স্তরগুলি ট্রান্সমেম্ব্রেন ডোমেনের মধ্যে বিভক্ত করে এবং সিসাইল বন্ডটি ঝিল্লির ভিতরে অবস্থিত। অবশিষ্ট গ্রুপ, আরসিই1 গ্লুটামাইল প্রোটিজেস, সিএএএক্স প্রোটিনের সি-টার্মিনাসকে বিভক্ত করে। ইন্ট্রামেম্ব্রেন প্রোটিয়াসের গতিবিদ্যা সাধারণত দ্রবণীয় প্রোটিয়াসের তুলনায় ধীর হয়। সাবস্ট্রেট নির্দিষ্টতা ভালভাবে বোঝা যায় না এবং এনজাইমগুলির মধ্যে উল্লেখযোগ্যভাবে পরিবর্তিত হয়, বিশেষত গামা-সিক্রেটেজ কমপ্লেক্স তার সাবস্ট্রেট স্বচ্ছতার জন্য পরিচিত। রম্বোইড প্রোটিজ এবং গামা-সিক্রেটেজ উভয়েরই একটি প্রোটিন কমপ্লেক্স গঠনের পরেই অ-সাবস্ট্রেট থেকে সাবস্ট্রেটকে আলাদা করে একটি অস্বাভাবিক সাবস্ট্রেট স্বীকৃতি প্রক্রিয়া রয়েছে বলে জানা গেছে, যা তাদের ধীর এনজাইম গতিবিদ্যার জন্ম দেয়। ডিস্ট্রিবিউশন ইন্ট্রামেম্ব্রেন প্রোটিজেস জীবনের সমস্ত ক্ষেত্রে পাওয়া যায় এবং চারটি গোষ্ঠীই ব্যাপকভাবে বিতরণ করা হয়। ইউক্যারিওটসে, পারক্সিসোম ব্যতীত সমস্ত ঝিল্লি-আবদ্ধ অর্গানেলে কমপক্ষে একটি ইন্ট্রামেম্ব্রেন প্রোটিজ থাকে। যদিও দ্রবণীয় প্রোটিয়াজগুলি প্রাচীনতম এবং সর্বোত্তম বৈশিষ্ট্যযুক্ত এনজাইমগুলির মধ্যে রয়েছে, ইন্ট্রামেম্ব্রেন প্রোটিয়াজগুলি তুলনামূলকভাবে সম্প্রতি আবিষ্কৃত হয়েছে। 1990-এর দশকে ডেনিস সেলকোয়ের মতো আলঝেইমার রোগ নিয়ে গবেষণা করা গবেষকরা অ্যামাইলয়েড প্রিকারসার প্রোটিনের প্রক্রিয়াকরণের জন্য একটি সম্ভাব্য প্রক্রিয়া হিসাবে ইন্ট্রামেম্ব্রেন প্রোটিওলাইসিসের প্রস্তাব করেছিলেন। হাইড্রোফোবিক ঝিল্লির মধ্যে হাইড্রোলাইসিস হওয়ার সম্ভাবনা প্রাথমিকভাবে বিতর্কিত ছিল। 1997 সালে পরীক্ষামূলকভাবে চিহ্নিত প্রথম ইন্ট্রামেম্ব্রেন প্রোটিজ ছিল সাইট-2 প্রোটিজ। তথ্যসূত্র ইসি 3.4 ইন্টিগ্রাল মেমব্রেন প্রোটিন