Start codon
স্টার্ট কোডন হল রাইবোজোম দ্বারা অনুবাদিত মেসেঞ্জার আরএনএ (এমআরএনএ) প্রতিলিপির প্রথম কোডন। স্টার্ট কোডন সর্বদা ইউক্যারিওটস এবং আর্কিয়ায় মেথিওনাইনের জন্য এবং ব্যাকটেরিয়া, মাইটোকন্ড্রিয়া এবং প্লাস্টিডে একটি এন-ফর্মাইলমেথিওনাইনের (এফমেট) জন্য কোড করে। শুরুর কোডনের আগে প্রায়শই একটি 5 'অনুবাদহীন অঞ্চল (5' ইউটিআর) থাকে। প্রোক্যারিওটগুলিতে এর মধ্যে রাইবোজোম বাঁধাই সাইট অন্তর্ভুক্ত রয়েছে। বিকল্প প্রারম্ভিক কোডনগুলি আদর্শ এ. ইউ. জি কোডন থেকে আলাদা এবং প্রোক্যারিওট (ব্যাকটেরিয়া এবং আর্কিয়া) এবং ইউক্যারিওট উভয় ক্ষেত্রেই পাওয়া যায়। বিকল্প স্টার্ট কোডনগুলি এখনও মেট হিসাবে অনুবাদ করা হয় যখন তারা একটি প্রোটিনের শুরুতে থাকে (এমনকি যদি কোডন অন্যথায় একটি ভিন্ন অ্যামিনো অ্যাসিডকে এনকোড করে)। এর কারণ হল দীক্ষার জন্য একটি পৃথক স্থানান্তর আরএনএ (টিআরএনএ) ব্যবহার করা হয়। ইউক্যারিওট বিকল্প প্রারম্ভিক কোডন (অ-এ. ইউ. জি) ইউক্যারিওটিক জিনোমে খুব বিরল। যাইহোক, কিছু সেলুলার এম. আর. এন. এ-র জন্য প্রাকৃতিকভাবে অ-এ. ইউ. জি স্টার্ট কোডন পাওয়া গেছে। এ. ইউ. জি-তে সম্ভাব্য নয়টি একক-নিউক্লিওটাইড প্রতিস্থাপনের মধ্যে সাতটি ডাইহাইড্রোফোলেট রিডাক্টেজের কোডন স্তন্যপায়ী কোষে ট্রান্সলেশন স্টার্ট সাইট হিসাবে কার্যকরী। ক্যানোনিকাল মেট-টিআরএনএ মেট এবং এইউজি কোডন পথ ছাড়াও, স্তন্যপায়ী কোষগুলি একটি নির্দিষ্ট লিউসিল-টিআরএনএ ব্যবহার করে লিউসিনের সাথে অনুবাদ শুরু করতে পারে যা কোডন সিইউজিকে ডিকোড করে। ক্যান্ডিডা অ্যালবিক্যানরা একটি সিএজি স্টার্ট কোডন ব্যবহার করে। প্রোক্যারিওটস উল্লেখযোগ্যভাবে বিকল্প প্রারম্ভিক কোডন ব্যবহার করে, প্রধানত জিইউজি এবং ইউইউজি। ই. কোলাই 83 শতাংশ এ. ইউ. জি (3542/4284), 14 শতাংশ (612) জি. ইউ. জি, 3 শতাংশ (103) ইউ. ইউ. জি এবং আরও একটি বা দুটি (যেমন, একটি এ. ইউ. ইউ এবং সম্ভবত একটি সি. ইউ. জি) ব্যবহার করে। যে সুপরিচিত কোডিং অঞ্চলগুলিতে এ. ইউ. জি ইনিশিয়েশন কোডন নেই সেগুলি হল ই. কোলাই ল্যাক অপেরনের ল্যাকআই (জি. ইউ. জি) এবং ল্যাকা (ইউ. ইউ. জি)। আরও দুটি সাম্প্রতিক গবেষণায় স্বাধীনভাবে দেখানো হয়েছে যে 17 বা তার বেশি অ-এ. ইউ. জি স্টার্ট কোডন ই. কোলাইতে অনুবাদ শুরু করতে পারে। মাইটোকন্ড্রিয়া মাইটোকন্ড্রিয়াল জিনোমগুলি বিকল্প স্টার্ট কোডনগুলি আরও উল্লেখযোগ্যভাবে ব্যবহার করে (মানুষের মধ্যে এ. ইউ. এ এবং এ. ইউ. জি)। কোডন, পদ্ধতিগত পরিসর এবং উদ্ধৃতি সহ এই ধরনের অনেক উদাহরণ এনসিবিআই-এর অনুবাদ সারণিতে দেওয়া আছে। আপস্ট্রিম স্টার্ট কোডনগুলি এই অর্থে "বিকল্প" স্টার্ট কোডন যে তারা নিয়মিত স্টার্ট কোডনগুলির উজানে এবং তাই বিকল্প স্টার্ট কোডন হিসাবে ব্যবহার করা যেতে পারে। সমস্ত মানব এম. আর. এন. এ-র অর্ধেকেরও বেশি তাদের টীকাযুক্ত অনুবাদ সূচনা শুরুর (টি. আই. এস) কমপক্ষে একটি এ. ইউ. জি কোডন আপস্ট্রিম (ইউ. এ. ইউ. জি) রয়েছে (মানব রেফসেক অনুক্রমের বর্তমান সংস্করণে 58 শতাংশ)। টিআইএস হিসাবে তাদের সম্ভাব্য ব্যবহারের ফলে তথাকথিত আপস্ট্রিম ওপেন রিডিং ফ্রেম (ইউওআরএফ)-এর অনুবাদ হতে পারে। ইউ. ও. আর. এফ অনুবাদের ফলে সাধারণত ছোট পলিপেপটাইড সংশ্লেষণ হয়, যার মধ্যে কয়েকটি কার্যকরী বলে প্রমাণিত হয়েছে, যেমন, এ. এস. এন. এস. ডি1, এম. আই. ই. এফ1, এম. কে. কে. এস এবং এস. এল. সি35এ4। যাইহোক, এটি বিশ্বাস করা হয় যে বেশিরভাগ অনুবাদিত ইউওআরএফগুলি কেবল ডাউনস্ট্রিম অনুবাদে হালকা প্রতিরোধমূলক প্রভাব ফেলে কারণ বেশিরভাগ ইউওআরএফ শুরু হয় ফুটো (অর্থাৎ। অনুবাদ শুরু করবেন না বা সংক্ষিপ্ত ও. আর. এফ-এর অনুবাদের পরে শেষ হওয়া রাইবোজোমগুলি প্রায়শই পুনরায় শুরু করতে সক্ষম হয়)। অ্যাম্বার স্টপ কোডন ইউএজি-তে অনুবাদ শুরু করার জন্য স্ট্যান্ডার্ড জেনেটিক কোড ইঞ্জিনিয়ারড স্টার্ট কোডন ইঞ্জিনিয়ারড ইনিশিয়েটর টিআরএনএ (সিইউএ অ্যান্টিকোডন সহ টিআরএনএএফমেট 2) ব্যবহার করা হয়েছে। এই ধরনের ইঞ্জিনিয়ারড টিআরএনএ-কে ননসেন্স দমনকারী টিআরএনএ বলা হয় কারণ এটি সাধারণত ইউএজি কোডনগুলিতে ঘটে যাওয়া ট্রান্সলেশন স্টপ সিগন্যালকে দমন করে। একটি গবেষণায় দেখা গেছে যে অ্যাম্বার ইনিশিয়েটর টিআরএনএ জিনোমিকভাবে এনকোডেড ইউএজি কোডন থেকে কোনও পরিমাপযোগ্য মাত্রায় অনুবাদ শুরু করে না, শুধুমাত্র শক্তিশালী উজানে শাইন-ডালগার্নো সাইট সহ প্লাজমিড-বাহিত সাংবাদিক। আরও দেখুন আণবিক জীববিজ্ঞানের কেন্দ্রীয় মতবাদ কোডন মেসেঞ্জার আর. এন. এ মিসসেন্স এম. আর. এন. এ স্টপ কোডন ট্রান্সফার আর. এন. এ ট্রান্সলেশন রেফারেন্স বাহ্যিক লিঙ্ক জেনেটিক কোড। আন্দ্রেজ (অঞ্জয়) এলজানোভস্কি এবং জিম অস্টেল, ন্যাশনাল সেন্টার ফর বায়োটেকনোলজি ইনফরমেশন (এনসিবিআই), বেথেসডা, মেরিল্যান্ড, মার্কিন ডিএনএ আণবিক জেনেটিক্স দ্বারা সংকলিত