Semantide
সেম্যান্টাইড (বা সেম্যান্টোফোরেটিক অণু) হল জৈবিক ম্যাক্রোমোলিকুল যা জিনগত তথ্য বা তার প্রতিলিপি বহন করে। তিনটি ভিন্ন বিভাগ বা শব্দার্থকে আলাদা করা হয়ঃ প্রাথমিক, মাধ্যমিক এবং তৃতীয়। প্রাথমিক সেম্যান্টাইড হল জিন, যা ডি. এন. এ নিয়ে গঠিত। সেকেন্ডারি সেম্যান্টাইড হল মেসেঞ্জার আর. এন. এ-র চেইন, যা ডি. এন. এ থেকে প্রতিলিপি করা হয়। টারশিয়ারি সেম্যান্টাইড হল পলিপেপটাইড, যা বার্তাবাহক আর. এন. এ থেকে অনুবাদ করা হয়। ইউক্যারিওটিক জীবের মধ্যে, প্রাথমিক শব্দার্থগুলি পারমাণবিক, মাইটোকন্ড্রিয়াল বা প্লাস্টিড ডিএনএ নিয়ে গঠিত হতে পারে। সমস্ত প্রাথমিক সেম্যান্টাইড শেষ পর্যন্ত টারশিয়ারি সেম্যান্টাইড গঠন করে না। কিছু প্রাথমিক সেম্যান্টাইড এম. আর. এন. এ (নন-কোডিং ডি. এন. এ)-তে প্রতিলিপি করা হয় না এবং কিছু গৌণ সেম্যান্টাইড পলিপেপটাইড (নন-কোডিং আর. এন. এ)-তে রূপান্তরিত হয় না। সেম্যান্টাইডের জটিলতা ব্যাপকভাবে পরিবর্তিত হয়। টারশিয়ারি সেম্যান্টাইডগুলির জন্য, বড় গ্লোবুলার পলিপেপটাইড চেইনগুলি সবচেয়ে জটিল এবং কাঠামোগত প্রোটিনগুলি, পুনরাবৃত্তি সহজ ক্রমগুলির সমন্বয়ে গঠিত, সবচেয়ে কম জটিল। সেম্যান্টাইড শব্দটি এবং সম্পর্কিত শব্দগুলি লিনাস পলিং এবং এমিল জুকারকান্ডল দ্বারা উদ্ভাবিত হয়েছিল। যদিও আধুনিক ফাইলোজেনেটিক্সে ব্যবহৃত প্রধান ধরনের তথ্য হল শব্দার্থবিদ্যা, তবে শব্দটি নিজেই সাধারণত ব্যবহৃত হয় না। সম্পর্কিত পদগুলি আইসোসেম্যান্টিক ডিএনএ বা আরএনএ যা বেস সিকোয়েন্সে পৃথক হয়, তবে অভিন্ন পলিপেপটাইড শৃঙ্খলে অনুবাদ করে আইসোসেম্যান্টিক হিসাবে উল্লেখ করা হয়। এনজাইম (টারশিয়ারি সেম্যান্টাইডস) দ্বারা সংশ্লেষিত এপিসোডিক অণুগুলিকে এপিসোডিক অণু হিসাবে উল্লেখ করা হয়। এপিসেমান্টিক অণুগুলির সেম্যান্টাইডের তুলনায় বৃহত্তর বৈচিত্র্য রয়েছে, যা কেবল তিন ধরনের (ডিএনএ, আরএনএ বা পলিপেপটাইড) নিয়ে গঠিত। সমস্ত পলিপেপটাইড টারশিয়ারি সেম্যান্টাইড নয়। কিছু, প্রধানত ছোট পলিপেপটাইড, এপিসোডিক অণুও হতে পারে। কোনও জীব দ্বারা উত্পাদিত না হওয়া শব্দার্থিক অণুগুলিকে শব্দার্থিক অণু হিসাবে উল্লেখ করা হয়, কারণ এগুলিতে কোনও জিনগত তথ্য থাকে না। অ্যাসেমেন্টিক অণুগুলি অ্যানাবলিক প্রক্রিয়া দ্বারা এপিসোডিক অণুতে পরিবর্তিত হতে পারে। অ্যাসিম্যান্টিক অণুগুলি একটি জিনোমে একীভূত হলে সেম্যান্টিক অণুতেও পরিণত হতে পারে। কিছু ভাইরাস এবং এপিসোডের এই ক্ষমতা রয়েছে। যখন কোনও অণুকে শব্দার্থিক, এপিসোডিক বা অ্যাসেমেন্টিক হিসাবে উল্লেখ করা হয়, তখন এটি শুধুমাত্র একটি নির্দিষ্ট জীবের ক্ষেত্রে প্রযোজ্য। একটি জীবের জন্য একটি শব্দার্থিক অণু অন্য জীবের জন্য তাৎপর্যপূর্ণ হতে পারে। গবেষণা অ্যাপ্লিকেশন সেম্যান্টাইডগুলি জীবের বিবর্তনীয় ইতিহাস অধ্যয়নের জন্য ফাইলোজেনেটিক তথ্য হিসাবে ব্যবহৃত হয়। তুলনামূলক জীববৈচিত্র্য বিশ্লেষণেও প্রাথমিক শব্দার্থবিদ্যা ব্যবহার করা হয়। যাইহোক, যেহেতু বহির্মুখী ডিএনএ কিছু সময়ের জন্য স্থায়ী হতে পারে, তাই এই ধরনের বিশ্লেষণ নিষ্ক্রিয় এবং মৃত জীব থেকে সক্রিয় সনাক্ত করতে পারে না। বিবর্তনীয় ইতিহাস অধ্যয়নের জন্য জৈবিক ম্যাক্রোমোলিকুলগুলি কতটা তথ্যপূর্ণ তা ভিন্ন। একটি অণু যত জটিল হবে, ফাইলোজেনেটিক্সের ক্ষেত্রে তত বেশি তথ্যপূর্ণ হবে। প্রাথমিক এবং মাধ্যমিক শব্দার্থবিজ্ঞানে সর্বাধিক তথ্য থাকে। টারশিয়ারি সেম্যান্টাইডে কিছু তথ্য হারিয়ে যায়, কারণ অনেক অ্যামিনো অ্যাসিড একাধিক কোডন দ্বারা কোড করা হয়। এপিসেমান্টিক অণু (যেমন। ক্যারোটিনয়েড) ফাইলোজেনেটিক্সের জন্যও তথ্যমূলক। যাইহোক, এই অণুগুলির বিতরণ শব্দার্থের উপর ভিত্তি করে ফাইলোজেনিগুলির সাথে নিখুঁতভাবে সম্পর্কযুক্ত নয়। অতএব, স্বাধীন নিশ্চিতকরণ প্রায়শই এখনও প্রয়োজন হয়। একটি সংশ্লেষণ পথে যত বেশি এনজাইম জড়িত থাকে, এই ধরনের পথগুলি আলাদাভাবে বিবর্তিত হওয়ার সম্ভাবনা তত বেশি। অতএব, এপিসোডিক অণুগুলির জন্য, ক্ষুদ্রতম জটিল অ্যাসিমেন্টিক অণু থেকে সংশ্লেষিত অণুগুলি ফাইলোজেনেটিক্সে সবচেয়ে তথ্যপূর্ণ। যাইহোক, বিভিন্ন পথ অনুরূপ বা এমনকি অভিন্ন অণু সংশ্লেষিত করতে পারে। উদাহরণস্বরূপ, প্রাণী, উদ্ভিদ এবং অন্যান্য ইউক্যারিওটগুলিতে ভিটামিন সি সংশ্লেষণের জন্য বিভিন্ন পথ পাওয়া গেছে। অতএব, ফাইলোজেনেটিক সম্পর্ক অধ্যয়নের জন্য নির্দিষ্ট অণু ব্যবহার করা উচিত নয়। যদিও অসীম অণুগুলি জীবের একটি গোষ্ঠীর কিছু পরিমাণগত বা গুণগত বৈশিষ্ট্য নির্দেশ করতে পারে, তবে এগুলি ফাইলোজেনেটিক্সের জন্য অবিশ্বস্ত এবং তথ্যহীন বলে মনে করা হয়। বিভিন্ন শব্দার্থবিদ্যা ব্যবহার করে বিশ্লেষণ পরস্পরবিরোধী ফাইলোজেনি তৈরি করতে পারে। যাইহোক, যদি ফাইলোজেনিগুলি সঙ্গতিপূর্ণ হয়, তবে বিবর্তনীয় সম্পর্কের জন্য আরও সমর্থন রয়েছে। বৃহত্তর ক্রম বিশ্লেষণ করে (যেমন। সম্পূর্ণ মাইটোকন্ড্রিয়াল জিনোম সিকোয়েন্স), ফাইলোজেনি তৈরি করা যেতে পারে, যা আরও সমাধান করা হয় এবং আরও সমর্থন করে। উদাহরণস্বরূপ, গবেষণায় প্রায়শই ব্যবহৃত সেম্যান্টাইডগুলি বেশিরভাগ জীবের কাছে সাধারণ এবং সময়ের সাথে সাথে কেবল ধীরে ধীরে পরিবর্তিত হয়। এই অণুগুলির উদাহরণগুলি হলঃ এটিপিজ সাইটোক্রোম বি সাইটোক্রোম সি অক্সিডেস সাবইউনিট 1 হিট শক প্রোটিন জিন হিস্টোন এইচ 3 রিকএ রিকম্বিনেশন অ্যাক্টিভেটিং জিন 1 রিবোন্যুক্লিয়াস পি আরএনএ রাইবোসোমাল ডিএনএ (যেমন। 28এস আরডিএনএ) রাইবোসোমাল আরএনএ (যেমন। 16S rRNA) তথ্যসূত্র ফাইলোজেনেটিক্স