TATA-binding protein
টাটা-বাইন্ডিং প্রোটিন (টিবিপি) একটি সাধারণ ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর যা বিশেষভাবে টাটা বক্স নামে একটি ডিএনএ সিকোয়েন্সের সাথে আবদ্ধ হয়। এই ডিএনএ সিকোয়েন্সটি কিছু ইউক্যারিওটিক জিন প্রোমোটারদের মধ্যে ট্রান্সক্রিপশন স্টার্ট সাইটের উজানে প্রায় 30 টি বেস জোড়া পাওয়া যায়। টি. বি. পি জিন পরিবার টি. বি. পি-সম্পর্কিত কারণগুলির একটি ছোট জিন পরিবারের সদস্য। প্রথম টিবিপি-সম্পর্কিত ফ্যাক্টর (টিআরএফ/টিআরএফ1) ফলের মাছি ড্রোসোফিলায় চিহ্নিত করা হয়েছিল, তবে এটি মাছি বা পোকামাকড়-নির্দিষ্ট বলে মনে হয়। পরবর্তীকালে অনেক মেটাজোয়ানের জিনোমে টিবিপিএল1/টিআরএফ2 পাওয়া যায়, যেখানে মেরুদণ্ডী জিনোমগুলি তৃতীয় মেরুদণ্ডী পরিবারের সদস্য, টিবিপিএল2/টিআরএফ3-কে এনকোড করে। নির্দিষ্ট কোষের প্রকারগুলিতে বা নির্দিষ্ট প্রবর্তকদের উপর টি. বি. পি এই টি. বি. পি-সম্পর্কিত কারণগুলির মধ্যে একটি দ্বারা প্রতিস্থাপিত হতে পারে, যার মধ্যে কয়েকটি টি. বি. পি-র মতো টাটা বাক্সের সাথে যোগাযোগ করে। ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর হিসাবে ভূমিকা টি. বি. পি হল ইউক্যারিওটিক সাধারণ ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর টি. এফ. আই. আই. ডি-এর একটি উপ-ইউনিট। টি. এফ. আই. আই. ডি হল প্রথম প্রোটিন যা আর. এন. এ পলিমারেজ II (আর. এন. এ পোল II)-এর ট্রান্সক্রিপশন প্রি-ইনিশিয়েশন কমপ্লেক্স গঠনের সময় ডি. এন. এ-র সাথে আবদ্ধ হয়। প্রি-ইনিশিয়েশন কমপ্লেক্সের কয়েকটি প্রোটিনের মধ্যে একটি যা ক্রম-নির্দিষ্ট পদ্ধতিতে ডি. এন. এ-কে আবদ্ধ করে, এটি জিনের প্রতিলিপি শুরুর স্থানে আর. এন. এ পলিমারেজ 2-এর অবস্থান নির্ধারণে সহায়তা করে। যাইহোক, এটি অনুমান করা হয় যে শুধুমাত্র 10-20% মানব প্রোমোটারদের টাটা বাক্স রয়েছে-বেশিরভাগ মানব প্রোমোটাররা টাটা-কম হাউসকিপিং জিন প্রোমোটার-তাই টিবিপি সম্ভবত আরএনএ পলিমারেজ II-এর অবস্থানের সাথে জড়িত একমাত্র প্রোটিন নয়। এই প্রবর্তকদের সাথে টি. বি. পি-র বন্ধন হাউসকিপিং জিন নিয়ন্ত্রকদের দ্বারা সহজতর হয়। মজার বিষয় হল, ট্রান্সক্রিপশন টাটা-যুক্ত প্রবর্তকদের উপর টাটা বাক্সের প্রায় 30 বিপি ডাউনস্ট্রিমে একটি সংকীর্ণ অঞ্চলের মধ্যে শুরু হয়, যখন টাটা-কম প্রবর্তকদের ট্রান্সক্রিপশন স্টার্ট সাইটগুলি 200 বিপি অঞ্চলের মধ্যে ছড়িয়ে দেওয়া হয়। জিনের প্রবর্তক অঞ্চলে টাটা বাক্সের সাথে টি. এফ. আই. আই. ডি-এর বন্ধন আর. এন. এ পোল 2-এর প্রতিলিপি শুরু করার জন্য প্রয়োজনীয় অন্যান্য উপাদানগুলির নিয়োগ শুরু করে। অন্যান্য নিয়োগকৃত প্রতিলিপি উপাদানগুলির মধ্যে রয়েছে টি. এফ. আই. আই. এ, টি. এফ. আই. আই. বি এবং টি. এফ. আই. আই. এফ। এই প্রতিলিপি উপাদানগুলির প্রত্যেকটিতে বেশ কয়েকটি প্রোটিন সাবইউনিট রয়েছে। টিবিপি আরএনএ পলিমারেজ I এবং আরএনএ পলিমারেজ III দ্বারা প্রতিলিপির জন্যও গুরুত্বপূর্ণ, এবং তাই তিনটি আরএনএ পলিমারেজ দ্বারা প্রতিলিপির সূচনায় জড়িত। টি. বি. পি ডি. এন. এ-কে 80° দ্বারা বাঁকিয়ে ডি. এন. এ গলনে (ডাবল স্ট্র্যান্ড সেপারেশন) জড়িত থাকে (এটি-সমৃদ্ধ ক্রম যার সাথে এটি সহজে গলতে সহায়তা করে)। টিবিপি একটি অস্বাভাবিক প্রোটিন যে এটি একটি β শীট ব্যবহার করে ছোট খাঁজকে আবদ্ধ করে। টিবিপির আরেকটি স্বতন্ত্র বৈশিষ্ট্য হল প্রোটিনের এন-টার্মিনাস-এ গ্লুটামিনের একটি দীর্ঘ স্ট্রিং। এই অঞ্চলটি সি-টার্মিনাসের ডিএনএ বাঁধাই ক্রিয়াকলাপকে সংশোধন করে এবং ডিএনএ-বাঁধাইয়ের সংশোধন প্রতিলিপি জটিল গঠন এবং প্রতিলিপির সূচনার হারকে প্রভাবিত করে। যে রূপান্তরগুলি সিএজি-র সংখ্যা প্রসারিত করে এই পলিগ্লুটামাইন ট্র্যাক্টের এনকোডিং পুনরাবৃত্তি করে এবং এইভাবে পলিগ্লুটামাইন স্ট্রিংয়ের দৈর্ঘ্য বৃদ্ধি করে, সেগুলি স্পিনোসেরেবেলার অ্যাটাক্সিয়া 17-এর সাথে যুক্ত, যা পলিগ্লুটামাইন রোগ হিসাবে শ্রেণীবদ্ধ একটি নিউরোডিজেনারেটিভ ব্যাধি। ডি. এন. এ-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া যখন টি. বি. পি ডি. এন. এ-র মধ্যে একটি টাটা বাক্সের সাথে আবদ্ধ হয়, তখন এটি বেস জোড়াগুলির মধ্যে অ্যামিনো অ্যাসিড সাইড-চেইন ঢোকিয়ে, হেলিক্সকে আংশিকভাবে শিথিল করে এবং দ্বিগুণভাবে সংযোগ করে ডি. এন. এ-কে বিকৃত করে। প্রোটিন এবং ডি. এন. এ-র মধ্যে প্রচুর পরিমাণে পৃষ্ঠের যোগাযোগের মাধ্যমে বিকৃতি সম্পন্ন হয়। টি. বি. পি ধনাত্মক আধানযুক্ত লাইসিন এবং আর্জিনিন অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশের মাধ্যমে ডি. এন. এ মেরুদণ্ডের ঋণাত্মক আধানযুক্ত ফসফেটের সাথে আবদ্ধ হয়। ডি. এন. এ-তে তীক্ষ্ণ বাঁকটি ছোট খাঁজতে চারটি ভারী ফেনিল্যালানাইন অবশিষ্টাংশের অভিক্ষেপের মাধ্যমে তৈরি হয়। ডিএনএ বাঁকানোর সাথে সাথে, টিবিপির সাথে এর যোগাযোগ বৃদ্ধি পায়, এইভাবে ডিএনএ-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া বাড়ায়। এই মিথস্ক্রিয়ার মাধ্যমে ডি. এন. এ-তে আরোপিত চাপ স্ট্র্যান্ডগুলির গলন বা পৃথকীকরণ শুরু করে। যেহেতু ডি. এন. এ-র এই অঞ্চলটি অ্যাডেনিন এবং থাইমিন অবশিষ্টাংশে সমৃদ্ধ, যা শুধুমাত্র দুটি হাইড্রোজেন বন্ধনের মাধ্যমে বেস-পেয়ার করে, ডি. এন. এ স্ট্র্যান্ডগুলি আরও সহজে পৃথক করা হয়। দুটি স্ট্র্যান্ডের পৃথকীকরণ ঘাঁটিগুলিকে উন্মুক্ত করে এবং আরএনএ পলিমারেজ II-কে জিনের প্রতিলিপি শুরু করার অনুমতি দেয়। টিবিপির সি-টার্মিনাস একটি হেলিকোয়েডাল আকৃতি নিয়ে গঠিত যা (অসম্পূর্ণভাবে) ডিএনএর টি-এ-টি-এ অঞ্চলের পরিপূরক। এই অসম্পূর্ণতা ডি. এন. এ-কে বন্ধনে নিষ্ক্রিয়ভাবে বাঁকানোর অনুমতি দেয়। কোষে টিবিপির ব্যবহার সম্পর্কিত তথ্যের জন্য দেখুনঃ আরএনএ পলিমারেজ I, আরএনএ পলিমারেজ II, এবং আরএনএ পলিমারেজ III। প্রোটিন-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া টাটা-বাইন্ডিং প্রোটিনকে বি. আর. এফ 1, বি. টি. এ. এফ 1, সি-ফস, সি-জুন, ই. ডি. এফ 1, জি. টি. এফ 2 বি (টি. এফ. আই. আই. বি), জি. টি. এফ 2 এ 1 (টি. এফ. আই. আই. এ সাবইউনিট 1), জি. টি. এফ 2 এফ 1 (টি. এফ. আই. আই. এফ সাবইউনিট 1) জি. টি. এফ 2 এইচ 4 (টি. এফ. আই. আই. এইচ সাবইউনিট 4), এম. ডি. এম 2, এম. এস. এক্স 1, এন. এফ. ওয়াই. বি, পি 53, পিএএক্স 6, পি. ও. এল. আর 2 এ, পি. ও. 2 এফ 1, আর. ই. এল, এন. আর 2 বি 1, টি. এ টিএএফ10, টিএএফ11, টিএএফ13 এবং টিএএফ15। জটিল সমাবেশ টাটা বাক্স সহ বা ছাড়া প্রবর্তকদের কাছ থেকে আরএনএ পলিমারেজ I, II এবং III দ্বারা প্রতিলিপি শুরু করার জন্য টাটা-বক্স বাইন্ডিং প্রোটিন (টিবিপি) প্রয়োজন। টাটা-কম প্রবর্তকের উপস্থিতিতে, টিবিপি টিবিপি-সম্পর্কিত কারণগুলির (টিএএফ) সাহায্যে আবদ্ধ হয়। টি. বি. পি সাধারণ ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টর টি. এফ. আই. আই. এ,-বি,-ডি,-ই এবং-এইচ সহ মূল প্রবর্তকের উপর বিশাল মাল্টি-সাবইউনিট প্রি-ইনিশিয়েশন কমপ্লেক্স গঠন করে। বিভিন্ন ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টরের সাথে এর সংযোগের মাধ্যমে, টিবিপি বিভিন্ন আরএনএ পলিমারেজ থেকে ট্রান্সক্রিপশন শুরু করতে পারে। টিবিপি-সদৃশ (টিবিপিএল) প্রোটিন সহ বেশ কয়েকটি সম্পর্কিত টিবিপি রয়েছে। কাঠামো টিবিপির সি-টার্মিনাল কোর (~ 180 অবশিষ্টাংশ) অত্যন্ত সংরক্ষিত এবং এতে দুটি 88-অ্যামিনো অ্যাসিড পুনরাবৃত্তি রয়েছে যা একটি স্যাডল-আকৃতির কাঠামো তৈরি করে যা ডিএনএকে ছড়িয়ে দেয়; এই অঞ্চলটি টাটা বাক্সের সাথে আবদ্ধ হয় এবং প্রতিলিপি উপাদান এবং নিয়ন্ত্রক প্রোটিনের সাথে যোগাযোগ করে। বিপরীতে, এন-টার্মিনাল অঞ্চল দৈর্ঘ্য এবং ক্রম উভয় ক্ষেত্রেই পরিবর্তিত হয়। তথ্যসূত্র বাইরের লিঙ্ক স্পিনোসেরেবেলার অ্যাটাক্সিয়া টাইপ 17 ইন্টারেক্টিভ টিবিপি স্ট্রাকচারের উপর জিনরিভিউ/এনসিবিআই/এনআইএইচ/ইউডাব্লু এন্ট্রি massey.ac.nz প্রোটিন জিন ট্রান্সক্রিপশন ফ্যাক্টরগুলিতে