Hydrophilicity plot
হাইড্রোফিলিসিটি প্লট হল একটি প্রোটিনের অ্যামিনো অ্যাসিডের হাইড্রোফোবিসিটি বা হাইড্রোফিলিসিটির মাত্রাগত বিশ্লেষণ। এটি একটি প্রোটিনের সম্ভাব্য কাঠামো বা ক্ষেত্রগুলি চিহ্নিত করতে বা সনাক্ত করতে ব্যবহৃত হয়। প্লটটির এক্স-অক্ষে একটি প্রোটিনের অ্যামিনো অ্যাসিড ক্রম রয়েছে এবং এর ওয়াই-অক্ষে হাইড্রোফোবিসিটি এবং হাইড্রোফিলিসিটির মাত্রা রয়েছে। নির্দিষ্ট অ্যামিনো অ্যাসিডের সাথে জলের মতো মেরু দ্রাবকগুলির মিথস্ক্রিয়ার মাত্রা পরিমাপ করার জন্য বেশ কয়েকটি পদ্ধতি রয়েছে। উদাহরণস্বরূপ, কাইট-ডুলিটল স্কেল হাইড্রোফোবিক অ্যামিনো অ্যাসিড নির্দেশ করে, যেখানে হপ-উডস স্কেল হাইড্রোফিলিক অবশিষ্টাংশ পরিমাপ করে। প্লটের আকৃতি বিশ্লেষণ করলে প্রোটিনের আংশিক গঠন সম্পর্কে তথ্য পাওয়া যায়। উদাহরণস্বরূপ, যদি প্রায় 20টি অ্যামিনো অ্যাসিডের একটি প্রসারিত অংশ হাইড্রোফোবিসিটির জন্য ইতিবাচক দেখায়, তবে এই অ্যামিনো অ্যাসিডগুলি লিপিড দ্বিস্তরীয় জুড়ে বিস্তৃত আলফা-হেলিক্সের অংশ হতে পারে, যা হাইড্রোফোবিক ফ্যাটি অ্যাসিড দ্বারা গঠিত। অন্যদিকে, উচ্চ হাইড্রোফিলিসিটি সহ অ্যামিনো অ্যাসিডগুলি ইঙ্গিত দেয় যে এই অবশিষ্টাংশগুলি দ্রাবক বা জলের সংস্পর্শে রয়েছে এবং তাই এগুলি প্রোটিনের বাইরের পৃষ্ঠে থাকার সম্ভাবনা রয়েছে। উপরের টেবিলের তথ্য একটি কম্পিউটার প্রোগ্রাম ব্যবহার করে তৈরি করা হয়েছিল যা একটি প্রোটিনের মধ্যে অংশগুলির গড় হাইড্রোফোবিসিটির মূল্যায়ন করে এবং সাহিত্য থেকে সংগৃহীত তথ্য ব্যবহার করে। তথ্যসূত্র এক্সপেসি প্রোটস্কেল প্রোটিন হাইড্রোফোবিসিটি প্লটস ফ্রম কলোরাডো স্টেট হাইড্রোপ্যাথিসিটি প্লটস ফ্রম দ্য ওয়ার্ল্ড অফ বায়োইনফরম্যাটিক্স প্লটস (গ্রাফিক্স) প্রোটিন কাঠামো