Ribosome shunting
রাইবোজোম শান্টিং হল অনুবাদের সূচনার একটি প্রক্রিয়া যেখানে রাইবোজোমগুলি বাইপাস করে, বা 5 'অনুবাদ না করা অঞ্চলের কিছু অংশ শুরু কোডনে পৌঁছানোর জন্য "শান্ট ওভার" করে। যাইহোক, রাইবোসোমাল শান্টিংয়ের একটি সুবিধা হল যে এটি একটি এমআরএনএ অণুর মধ্যে স্বাভাবিকের চেয়ে বেশি তথ্য সংরক্ষণ করার অনুমতি দিয়ে পিছনের দিকে অনুবাদ করতে পারে। কিছু ভাইরাল আরএনএ ভাইরাল জীবনচক্রের নির্দিষ্ট পর্যায়ে বা যখন অনুবাদের সূচনার কারণগুলি দুর্লভ হয় (যেমন। ভাইরাল প্রোটিজেস দ্বারা বিভাজন)। এই প্রক্রিয়াটি ব্যবহার করার জন্য পরিচিত কিছু ভাইরাসের মধ্যে রয়েছে অ্যাডেনোভাইরাস, সেন্ডাই ভাইরাস, হিউম্যান প্যাপিলোমাভাইরাস, ডাক হেপাটাইটিস বি প্যারারেট্রোভাইরাস, রাইস টুংরো ব্যাসিলিফর্ম ভাইরাস এবং ফুলকপি মোজাইক ভাইরাস। এই ভাইরাসগুলিতে রাইবোজোম সরাসরি আপস্ট্রিম ইনিশিয়েশন কমপ্লেক্স থেকে স্টার্ট কোডন (এ. ইউ. জি)-এ স্থানান্তরিত হয় আর. এন. এ গৌণ কাঠামোকে শিথিল করার প্রয়োজন ছাড়াই। ফুলকপি মোজাইক ভাইরাসে রাইবোজোম শান্টিং ফুলকপি মোজাইক ভাইরাসের অনুবাদ (সিএএমভি) 35এস আরএনএ একটি রাইবোজোম শান্ট দ্বারা শুরু হয়। সিএএমভি-র 35এস আরএনএ-তে একটি ~ 600 নিউক্লিওটাইড লিডার সিকোয়েন্স রয়েছে যা স্ট্রেনের উপর নির্ভর করে 7-9টি শর্ট ওপেন রিডিং ফ্রেম (এসওআরএফ) ধারণ করে। এই দীর্ঘ লিডার সিকোয়েন্সের একটি বিস্তৃত জটিল স্টেম-লুপ কাঠামো গঠনের সম্ভাবনা রয়েছে, যা নিম্নলিখিত ওআরএফগুলির প্রকাশের জন্য একটি প্রতিরোধমূলক উপাদান। যাইহোক, সিএএমভি 35এস আরএনএ লিডারের নিচের দিকে ওআরএফ-এর অনুবাদ সাধারণত লক্ষ্য করা গেছে। রাইবোজোম শান্টিং মডেল নির্দেশ করে যে ইনিশিয়েশন ফ্যাক্টরগুলির সহযোগিতায়, রাইবোজোমগুলি ক্যাপ করা 5 '-প্রান্ত থেকে স্ক্যান করা শুরু করে এবং অল্প দূরত্বের জন্য স্ক্যান করে যতক্ষণ না এটি প্রথম এস. ও. আর. এফ-এ আঘাত করে। নেতা দ্বারা গঠিত হেয়ারপিন কাঠামোটি প্রথম দীর্ঘ ও. আর. এফ-কে 5 '-প্রক্সিমাল এস. ও. আর. এফ-এর কাছাকাছি স্থানিক এলাকায় নিয়ে আসে। এস. ও. আর. এফ এ পড়ার পর, 80-এর স্ক্যানিং রাইবোজোম স্টপ কোডনে বিচ্ছিন্ন হয়ে যায়, যা শান্ট টেক-অফ সাইট। 40এস রাইবোসোমাল সাবইউনিটগুলি আর. এন. এ-র সঙ্গে মিলিত হতে থাকে, এবং শক্তিশালী স্টেম-লুপ কাঠামোগত উপাদানকে বাইপাস করে, শান্ট গ্রহণকারী স্থানে অবতরণ করে, স্ক্যানিং পুনরায় শুরু করে এবং প্রথম দীর্ঘ ও. আর. এফ-এ পুনরায় শুরু করে। 5 '-প্রক্সিমাল এস. ও. আর. এফ এ এবং স্টেম-লুপ কাঠামো নিজেই সিএএমভি শান্টিংয়ের জন্য দুটি প্রয়োজনীয় উপাদান। 2-15 কোডন সহ এস. ও. আর. এফ এবং এস. ও. আর. এফ স্টপ কোডন এবং স্টেম কাঠামোর ভিত্তির মধ্যে 5-10 নিউক্লিওটাইড রাইবোজোম শান্টিংয়ের জন্য সর্বোত্তম, যেখানে ন্যূনতম (স্টার্ট-স্টপ) ও. আর. এফ শান্টিংকে উৎসাহিত করে না। রাইস টাংরো ব্যাসিলিফর্ম প্যারারেট্রোভাইরাস রাইবোজোম শান্টিং প্রক্রিয়ায় রাইবোজোম শান্টিং 1993 সালে সিএএমভিতে প্রথম আবিষ্কৃত হয় এবং তারপর 1996 সালে রাইস টাংরো ব্যাসিলিফর্ম ভাইরাসে (আরটিবিভি) রিপোর্ট করা হয়। আর. টি. বি. ভি-তে রাইবোজোম শান্টিংয়ের প্রক্রিয়াটি সিএএমভি-র অনুরূপঃ এর জন্য প্রথম সংক্ষিপ্ত ও. আর. এফ-এর পাশাপাশি নিম্নলিখিত শক্তিশালী গৌণ কাঠামোও প্রয়োজন। সিএএমভি এবং আরটিবিভির মধ্যে সংরক্ষিত শান্ট উপাদানগুলির অদলবদল দক্ষ শান্টিংয়ের জন্য অবতরণ অনুক্রমের নিউক্লিওটাইড গঠনের গুরুত্ব প্রকাশ করে, যা ইঙ্গিত করে যে রাইবোজোম শান্টিংয়ের প্রক্রিয়াটি উদ্ভিদ প্যারারেট্রোভাইরাসগুলিতে বিবর্তনীয়ভাবে সংরক্ষিত। সেন্ডাই ভাইরাস সেন্ডাই ভাইরাস ওয়াই প্রোটিনে রাইবোজোম শান্টিং রাইবোজোম শান্টিং দ্বারা শুরু হয়। সেন্ডাই ভাইরাস পি/সি এমআরএনএ-র 8টি প্রাথমিক অনুবাদ পণ্যের মধ্যে, ফুটো স্ক্যানিং প্রোটিন সি ', পি এবং সি প্রোটিনের অনুবাদের জন্য দায়ী, যেখানে প্রোটিন ওয়াই1 এবং ওয়াই2-এর অভিব্যক্তি একটি রাইবোসোমাল শান্ট বিচ্ছিন্ন স্ক্যানিংয়ের মাধ্যমে শুরু করা হয়। স্ক্যানিং কমপ্লেক্স 5 'ক্যাপ প্রবেশ করে এবং 5' ইউটিআর-এর 50টি নিউক্লিওটাইড স্ক্যান করে, এবং তারপর ওয়াই ইনিশিয়েশন কোডনগুলিতে একটি গ্রহণকারী স্থানে স্থানান্তরিত হয় বা বন্ধ করে দেওয়া হয়। সেন্দাই ভাইরাসের ক্ষেত্রে, কোনও নির্দিষ্ট দাতা সাইট ক্রমের প্রয়োজন হয় না। অ্যাডেনোভাইরাস রাইবোজোম শান্টিং-এ রাইবোজোম শান্ট দেরিতে অ্যাডেনোভাইরাস এমআরএনএ-র প্রকাশের সময় লক্ষ্য করা যায়। দেরিতে অ্যাডেনোভাইরাস এম. আর. এন. এ-তে একটি 5 'ত্রিপক্ষীয় নেতা থাকে, একটি অত্যন্ত সংরক্ষিত 200-নিউক্লিওটাইড এন. টি. আর 25-থেকে 44-নিউক্লিওটাইড অসংরচিত 5' গঠন সহ একটি স্থিতিশীল হেয়ারপিন কাঠামোর একটি জটিল গোষ্ঠী অনুসরণ করে, যা ই. আই. এফ-4এফ (ক্যাপ-বাইন্ডিং প্রোটিন কমপ্লেক্স)-এর প্রয়োজনীয়তা হ্রাস করে অগ্রাধিকার অনুবাদ প্রদান করে, যা সেলুলার প্রোটিন অনুবাদে হস্তক্ষেপ করার জন্য অ্যাডেনোভাইরাস দ্বারা নিষ্ক্রিয় করা হয়। যখন ই. আই. এফ. 4ই প্রচুর পরিমাণে থাকে, তখন সাবইউনিট এম. আর. এন. এ-তে 5 'ক্যাপের সাথে আবদ্ধ হয়, একটি ই. আই. এফ. 4 জটিল গঠন করে যা শান্টিংয়ের দিকে পরিচালিত করে; যাইহোক, যখন হিট শকের দেরিতে অ্যাডেনোভাইরাস সংক্রমণের সময় ই. আই. এফ. 4ই পরিবর্তন বা নিষ্ক্রিয় করা হয়, তখন ত্রিপক্ষীয় নেতা একচেটিয়াভাবে এবং দক্ষতার সাথে শান্টিংয়ের মাধ্যমে সূচনা নির্দেশ করে। যদিও অ্যাডেনোভাইরাসের ত্রিপক্ষীয় নেতা হিসাবে পরিচিত ক্যাপ-ইনিশিয়েশন কমপ্লেক্সকে ব্যাহত করে এটি ছাড়া কোষগুলিকে সংক্রামিত করার জন্য টাইরোসিন কাইনেজের প্রয়োজন হয়। এটি টাইরোসিন ফসফোরিলেশনে রাইবোজোম শান্টিংয়ের মাধ্যমে প্রক্রিয়াটিকে ব্যাহত করে। রাইবোজোমের বাঁধনের জন্য দুটি মূল স্থান রয়েছে। ভাইরাল এমআরএনএ অনুবাদ করতে এবং রাইবোজোম শান্টিং প্রক্রিয়া দ্বারা আবদ্ধ থাকাকালীন অনুবাদটি দমন করতে। অ্যাডেনোভাইরাস লেট এম. আর. এন. এ এবং এইচ. এস. পি. 70 এম. আর. এন. এ-র ক্ষেত্রে, প্রথম সংক্ষিপ্ত ও. আর. এফ-এর স্টপ কোডন শনাক্তকরণের পরিবর্তে, 18এস রাইবোসোমাল আর. এন. এ-র 3 'হেয়ারপিনের পরিপূরক তিনটি সংরক্ষিত ক্রম সহ রাইবোসোম স্ক্যান করার কারণে অনুবাদের বিরতি ঘটে। রাইবোজোম শান্টের প্রক্রিয়াতে স্টার্ট কোডনের উজানে বৃহত্তর সাবইউনিট বাঁধাই জড়িত। পলিমারেজ তারপর প্রোটিন বাইন্ডিং এবং একটি পাওয়ার স্ট্রোক ব্যবহার করে কোডিং এমআরএনএ-তে স্টার্ট কোডনকে বাইপাস করতে সক্ষম হয়। আরও প্রতিলিপির জন্য একটি নতুন বাঁধাই সাইট তৈরি করতে ট্রাইপেটটি মূল স্ট্র্যান্ডে ঢোকানো হয়। তথ্যসূত্র প্রোটিন জৈব সংশ্লেষণ