ORF9b
ORF9b (পূর্বে কখনও কখনও ORF13 নামে পরিচিত) একটি জিন যা SARS-CoV এবং SARS-CoV-2 সহ সাবজেনাস সারবেকোভাইরাসের করোনভাইরাসগুলিতে একটি ভাইরাল আনুষঙ্গিক প্রোটিনকে এনকোড করে। এটি একটি ওভারল্যাপিং জিন যার ওপেন রিডিং ফ্রেম সম্পূর্ণরূপে এন জিনের মধ্যে থাকে, যা করোনভাইরাস নিউক্লিওক্যাপসিড প্রোটিনকে এনকোড করে। এনকোডেড প্রোটিনটি সারস-কোভ-এ 97টি অ্যামিনো অ্যাসিড অবশিষ্টাংশ এবং সারস-কোভ-2-এ 98টি, উভয় ক্ষেত্রেই একটি প্রোটিন ডাইমার গঠন করে। নামকরণ বৈজ্ঞানিক সাহিত্যে এই জিনের জন্য ব্যবহৃত নামকরণের মধ্যে অসঙ্গতি রয়েছে। SARS-CoV-এর উপর কিছু কাজে, এটিকে ORF13 হিসাবে উল্লেখ করা হয়েছে। এটি কখনও কখনও ORF9a হিসাবেও উল্লেখ করা হয়েছে, যার ফলে SARS-CoV-তে 76 টি কোডনের একটি ডাউনস্ট্রিম ORF হয়, যা N জিনের সাথেও ওভারল্যাপ করে, ORF9b হিসাবে মনোনীত করা হয়। প্রস্তাবিত নামকরণটি দীর্ঘতর ও. আর. এফ-কে 9বি এবং নিম্নমুখী, ছোট ও. আর. এফ-কে ও. আর. এফ9সি হিসাবে উল্লেখ করে। কাঠামো ও. আর. এফ. 9বি প্রোটিন সারস-সি. ও. ভি-তে 97টি অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশ এবং সারস-সি. ও. ভি-2-এ 98টি। এটি কেন্দ্রে একটি হাইড্রোফোবিক গহ্বর সহ একটি বিটা শীট সমৃদ্ধ হোমোডিমার গঠন করে যা লিপিডগুলিকে আবদ্ধ করে। লিপিড-বাঁধাই গহ্বরটি প্রোটিনকে ঝিল্লিতে নোঙর করার জন্য একটি অস্বাভাবিক প্রক্রিয়া হিসাবে কাজ করতে পারে। SARS-CoV-2 ORF9b প্রোটিনের একটি অংশ কাঠামোগতভাবে টম 70 সহ একটি প্রোটিন কমপ্লেক্সে চিহ্নিত করা হয়েছে যেখানে ORF9b বিচ্ছিন্নভাবে পর্যবেক্ষণ করা বিটা-শীট কাঠামোর পরিবর্তে একটি আলফা হেলিক্স গঠন করে। এই ভাঁজ পরিবর্তন আচরণ বায়োইনফরমেটিক্স ভবিষ্যদ্বাণীর সাথে সামঞ্জস্যপূর্ণ এবং SARS-CoV হোমোলগের ক্ষেত্রেও ঘটতে পারে। এক্সপ্রেশন এবং স্থানীয়করণ ওআরএফ9বি হল এন জিন এনকোডিং করোনভাইরাস নিউক্লিওক্যাপসিড প্রোটিনের ওপেন রিডিং ফ্রেমের মধ্যে সম্পূর্ণরূপে থাকা দুটি ওভারল্যাপিং জিনের মধ্যে একটি, অন্যটি হল ওআরএফ9সি। ও. আর. এফ9বি তার বাইসট্রনিক সাবজেনোমিক আর. এন. এ থেকে রাইবোজোম ফুটো স্ক্যানিং দ্বারা প্রকাশ করা হয়। এর প্রতিবেশী ওআরএফ9সি-র বিপরীতে, এর দৈর্ঘ্য সারবেকোভাইরাসগুলিতে ভালভাবে সংরক্ষিত এবং এটি একটি কার্যকরী প্রোটিন-কোডিং জিন বলে দৃঢ় প্রমাণ রয়েছে। SARS-CoV-তে, প্রোটিনটি এন্ডোপ্লাজমিক রেটিকুলাম (ER) এবং ইন্ট্রাসেলুলার ভেসিকলগুলিতে স্থানীয়করণ করা হয়। এটির পারমাণবিক স্থানীয়করণ ক্রম নেই তবে নিষ্ক্রিয় বিস্তারের মাধ্যমে কোষের নিউক্লিয়াসে প্রবেশ করতে পারে; তবে নিউক্লিয়াস থেকে বেরিয়ে আসার জন্য এটির একটি পারমাণবিক রপ্তানি ক্রম রয়েছে। SARS-CoV-2-এ, এটি মাইটোকন্ড্রিয়াল ঝিল্লির সাথে যুক্ত বলে জানা গেছে। ফাংশন ORF9b প্রোটিনের কার্যকারিতা ভালভাবে চিহ্নিত করা হয় না। ভাইরাল প্রতিলিপির জন্য এটি অপরিহার্য নয়। ভাইরাল প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া ওআরএফ9বি প্রোটিন ওআরএফ6, নন-স্ট্রাকচারাল প্রোটিন 5, নন-স্ট্রাকচারাল প্রোটিন 14 এবং করোনভাইরাস এনভেলপ প্রোটিন সহ অন্যান্য বেশ কয়েকটি ভাইরাল প্রোটিনের সাথে মিথস্ক্রিয়া করে বলে জানা গেছে। এটি পরিপক্ক SARS-CoV ভাইরাসগুলিতে সনাক্ত করা হয়েছে এবং এইভাবে একটি ছোট ভাইরাল কাঠামোগত প্রোটিন হতে পারে। পোষক কোষের প্রভাব পোষকের ইমিউন সিস্টেমের প্রতিক্রিয়া সংশোধন করতে ORF9b প্রোটিন জড়িত থাকতে পারে। SARS-CoV-2 প্রোটিন টম 70 এর সাথে মিথস্ক্রিয়ার মাধ্যমে ইন্টারফেরন প্রতিক্রিয়া দমন করে বলে জানা গেছে, যা বাইরের ঝিল্লি (টিওএম) কমপ্লেক্সের মাইটোকন্ড্রিয়াল ট্রান্সকোজের একটি উপাদান। তথ্যসূত্র করোনাভাইরাস প্রোটিন