C12orf50
ক্রোমোজোম 12 ওপেন রিডিং ফ্রেম 50 (C12orf50) একটি প্রোটিন-এনকোডিং জিন যা মানুষের মধ্যে C12orf50 প্রোটিনের জন্য এনকোড করে। এই জিনের অ্যাক্সেশন আইডি হল NM _ 152589। C12orf50-এর অবস্থান হল 12q21.32। এটি বিপরীত স্ট্র্যান্ডে 88429231 থেকে 88373811 (এনসিবিআই 37, আগস্ট 2010) পর্যন্ত 55.42 কেবি কভার করে। C12orf50-এর কিছু পার্শ্ববর্তী জিন হল RPS4XP15, LOC107984542, এবং C12orf29। আরপিএস4এক্সপি15 উজানে সি12ওআরএফ50 এবং একই স্ট্র্যান্ডে রয়েছে। LOC107984542 এবং C12orf29 উভয়ই নিম্নমুখী। LOC107984542 বিপরীত স্ট্র্যান্ডে এবং C12orf29 একই স্ট্র্যান্ডে রয়েছে। C12orf50-এর ছয়টি আইসোফর্ম রয়েছে। এই পৃষ্ঠাটি আইসোফর্ম এক্স1-এর উপর দৃষ্টি নিবদ্ধ করছে। C12orf50 আইসোফর্ম X1 1711 নিউক্লিওটাইড দীর্ঘ এবং 414 এএ দৈর্ঘ্যের একটি প্রোটিন রয়েছে। ফাংশন অন্টোলজি C12orf50-এর কার্যকারিতা নির্দেশ করে যা হল mRNA এবং প্রোটিন বাঁধাই সক্ষম করা। এটি নিউক্লিয়াস থেকে পলি (এ) + এমআরএনএ রপ্তানির সঙ্গেও জড়িত। আইসোফর্ম C12orf50 জিনের 6টি আইসোফর্ম রয়েছে। জিন অভিব্যক্তি জিনোম দ্বারা নির্দিষ্ট অভিব্যক্তি সহ মানব টিস্যুগুলির একটি বিশ্লেষণে, টিস্যু-নির্দিষ্ট প্রোটিন-কোডিং জিন নির্ধারণের জন্য 27 টি বিভিন্ন টিস্যু প্রতিনিধিত্বকারী 95 জন মানুষের টিস্যু নমুনার উপর আরএনএ-সেকিউ সঞ্চালিত হয়েছিল যাতে দেখা যায় যে টেস্টিস ব্যতীত বেশিরভাগ মানুষের টিস্যুতে সি12ওআরএফ50-এর অভিব্যক্তি খুব কম। C12orf50-এর অভিব্যক্তি টেস্টিসের দিকে সীমাবদ্ধ ছিল। প্রোটিন বৈশিষ্ট্যহীন প্রোটিন ক্রোমোজোম 12 ওপেন রিডিং ফ্রেম 50 হল মানুষের মধ্যে একটি প্রোটিন, যা C12orf50 জিন দ্বারা এনকোড করা হয়। প্রোটিন অ্যাক্সেশন আইডি হল কিউ8এনএ57। প্রোটিনের দৈর্ঘ্য 414এএ। প্রোটিনের আনুমানিক ভর হল 47.2 কেডিএ। প্রোটিনে একটি সিসিসিএইচ-টাইপ জেডএন ফিঙ্গার ডোমেন রয়েছে। প্রোটিনের একটি CCCH-টাইপ Zn ফিঙ্গার ডোমেন রয়েছে যার একটি C-X8-C-X5-C-X3-H মোটিফ রয়েছে। ডোমেইনটি প্রোটিনের শুরুতে শুরু হয় এবং 44তম অ্যামিনো অ্যাসিডে যায়। প্রোটিনের তিনটি বিশৃঙ্খল অঞ্চল রয়েছে, 136তম অ্যামিনো অ্যাসিড থেকে 33 এএ দৈর্ঘ্যের 168তম, 37 এএ দৈর্ঘ্যের 297তম থেকে 333তম এবং 69 এএ দৈর্ঘ্যের 346তম থেকে 414তম। পূর্বাভাসকৃত আণবিক ওজন হল 47.3 কেডিএ এবং পূর্বাভাসকৃত আইসোইলেক্ট্রিক বিন্দু হল 8.79। কাঠামো সি12ওআরএফ50-এর জন্য পূর্বাভাসকৃত তৃতীয় কাঠামোর জিঙ্ক ফিঙ্গার ডোমেনে প্রোটিনের শুরুতে দুটি বিটা-শীট এবং 106-124 এএ থেকে একটি হেলিক্স রয়েছে। এগুলি স্তন্যপায়ী অর্থোলগ জুড়ে সংরক্ষিত রয়েছে। এছাড়াও প্রচুর সংখ্যক কুণ্ডলীযুক্ত অঞ্চল রয়েছে। প্রবর্তক, 3 'ইউটিআর অঞ্চল এবং 5' ইউটিআর খুব ভালভাবে সংরক্ষিত। অ্যামিনো অ্যাসিড 87 থেকে 111 পর্যন্ত হেলিক্সের আগে এবং শুরুতে একটি নেতিবাচক গুচ্ছ (অ্যাসিডিক ডোমেন) রয়েছে। স্থানীয়করণ নিউক্লিয়াসে থাকার একটি 47.8% সম্ভাবনা এবং সাইটোপ্লাজমে থাকার একটি 30.4% সম্ভাবনা রয়েছে। সিগমা-অ্যালড্রিচ দ্বারা ইমিউনোহিস্টোকেমিস্ট্রি এবং ইমিউনোফ্লোরেসেন্স দ্বারা এটি নিশ্চিত করা হয়েছিল যা নিউক্লিয়াস এবং সাইটোপ্লাজম উভয় ক্ষেত্রেই ইতিবাচকতা দেখায়। একটি পারমাণবিক অবস্থান সংকেত এবং অ্যাসিডিক ডোমেন রয়েছে। অর্থোলোগগুলি আরও নিশ্চিত করে যে C12orf50 নিউক্লিয়াস এবং সাইটোপ্লাজমে স্থানীয়কৃত। প্রোটিনের মিথস্ক্রিয়া দুটি প্রোটিন (জিএপিডিএইচএস এবং জিওএলজিএ2) রয়েছে যা সি12ওআরএফ50-এর সাথে মিথস্ক্রিয়া করে। গ্লিসারালডিহাইড-3-ফসফেট ডিহাইড্রোজেনেস, স্পার্মাটোজেনিক (জিএপিডিএইচএস) এনজাইম বিভিন্ন শক্তি উৎপাদনকারী পথের মধ্যে পরিবর্তন নিয়ন্ত্রণে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করতে পারে এবং এটি শুক্রাণুর গতিশীলতা এবং পুরুষ উর্বরতার জন্য প্রয়োজনীয়। অনুবাদ-পরবর্তী পরিবর্তনগুলি সি12ওআরএফ50-এর বিভিন্ন ফসফোরাইলেশন, সি-ম্যানোসাইলেশন এবং ও-গ্লাইকোসাইলেশনের মধ্য দিয়ে যাওয়ার পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছে। ফসফোরিলেশন স্থানগুলি অ্যামিনো অ্যাসিড 262,349 এবং 370-এ রয়েছে। ও-গ্লাইকোসাইলেশন সাইটগুলি হল অ্যামিনো অ্যাসিড 139,238 এবং 374। সি-ম্যানোসাইলেশন সাইটগুলি হল অ্যামিনো অ্যাসিড 13,102,292 এবং 388। বিবর্তন C12orf50-এর বিবর্তনীয় হার ফাইব্রিনোজেন আলফার কাছাকাছি, যা এটিকে তুলনামূলকভাবে দ্রুত করে তোলে। C12orf50-এর জন্য অর্থোলগ স্তন্যপায়ী প্রাণী, সরীসৃপ, পাখি এবং উভচর সিসিলিয়ানদের মধ্যে পাওয়া গেছে। ব্যাঙ, মাছ, অমেরুদণ্ডী প্রাণী বা ছত্রাকের জন্য কোনও অর্থোলগ পাওয়া যায়নি। প্ল্যাটিপাস ব্যতীত স্তন্যপায়ী অর্থোলগগুলি মানুষের সাথে সবচেয়ে বেশি মিল ভাগ করে নিয়েছে। স্তন্যপায়ী প্রাণী থেকে মানুষের বিচ্যুতির পরিসীমা ছিল 6.4-180 মিলিয়ন বছর। সরীসৃপ অর্থোলোগগুলি পরবর্তী অনুরূপ ছিল এবং প্রায় 318 মিলিয়ন বছর আগে বিচ্ছিন্ন হয়েছিল। তারপর পাখিরা সরীসৃপের মতো একই সময়ে মানুষের থেকে বিচ্ছিন্ন হয়ে যায়। উভচর সিসিলিয়ানদের মধ্যে সবচেয়ে কম মিল ছিল এবং তারা প্রায় 351.7 মিলিয়ন বছর আগে বিচ্ছিন্ন হয়েছিল। হোমোলজি অর্থোলগস সি12ওআরএফ50-এর স্তন্যপায়ী প্রাণী, পাখি, সরীসৃপ এবং সিসিলিয়ান উভচরদের মধ্যে অর্থোলগ রয়েছে। উভচর ব্যাঙ, অমেরুদণ্ডী প্রাণী, উদ্ভিদ, ছত্রাক বা খামিরের মধ্যে কোনও অর্থোলগ পাওয়া যায়নি। নীচের সারণিতে কিছু অর্থোলগ দেখানো হয়েছে যা ব্লাস্ট-এ পাওয়া যাবে। প্যারালগ C12orf50-এর দুটি প্যারালগ রয়েছেঃ ZC3H11A এবং ZC3H11B। দস্তা-আঙুলের ক্ষেত্রটি উভয় প্যারালগের মধ্যে বিবেচনা করা হয়। তথ্যসূত্র