SHIFTCOR
শিফটকর (শিফট সংশোধন) একটি বিনামূল্যে উপলব্ধ ওয়েব সার্ভারের পাশাপাশি প্রোটিন কেমিক্যাল শিফট রি-রেফারেন্সিংয়ের জন্য একটি স্বতন্ত্র কম্পিউটার প্রোগ্রাম। জৈব আণবিক এন. এম. আর-এ রাসায়নিক স্থানান্তর রেফারেন্সিং একটি বিশেষভাবে বিস্তৃত সমস্যা, যেখানে বিদ্যমান এন. এম. আর-এর রাসায়নিক স্থানান্তর কাজের 25 শতাংশ পর্যন্ত অনুপযুক্তভাবে উল্লেখ করা হয়। এই রেফারেন্সিং সমস্যাগুলির মধ্যে কয়েকটি 1 থেকে 2.5 পিপিএম (বিশেষত 13 ডিগ্রি সেন্টিগ্রেড এবং 15 ডিগ্রি সেন্টিগ্রেড রাসায়নিক শিফটে) এর মধ্যে নিয়মতান্ত্রিক ত্রুটির কারণ হতে পারে। এই মাত্রার ত্রুটিগুলি প্রোটিনের মধ্যে অ্যাসাইনমেন্টের তুলনা করার বা কাঠামোগতভাবে রাসায়নিক পরিবর্তনগুলি ব্যাখ্যা করার যে কোনও প্রচেষ্টায় ধ্বংসাত্মক ভূমিকা নিতে পারে। কোন প্রোটিনগুলি ভুলভাবে বরাদ্দ করা হয়েছে বা অনুপযুক্তভাবে উল্লেখ করা হয়েছে তা সনাক্ত করা চ্যালেঞ্জিং হতে পারে, যেমন ত্রুটিগুলি খুঁজে পাওয়ার পরে সংশোধন করা যেতে পারে। শিফটকর প্রোগ্রামটি এই রাসায়নিক স্থানান্তর রেফারেন্সিং সমস্যাগুলি সনাক্ত এবং ঠিক করতে সহায়তা করার জন্য ডিজাইন করা হয়েছিল। বিশেষত এটি আগ্রহের প্রোটিন (গুলি)-এর 3ডি কাঠামো (পিডিবি স্থানাঙ্ক ব্যবহার করে) থেকে প্রাপ্ত পূর্বাভাসকৃত রাসায়নিক পরিবর্তনের সাথে পর্যবেক্ষিত রাসায়নিক পরিবর্তনের তুলনা করে পেপটাইড এবং প্রোটিনের 1এইচ, 13সি এবং 15এন মেরুদণ্ডের রাসায়নিক পরিবর্তনের তুলনা, সনাক্তকরণ, সংশোধন এবং পুনরায় উল্লেখ করে। শিফটএক্স প্রোগ্রাম ব্যবহার করে পূর্বাভাসকৃত রাসায়নিক স্থানান্তর গণনা করা হয়। শিফটকর প্রোগ্রামটি মূলত রেফডিবি নামে সঠিকভাবে পুনরায় রেফারেন্স করা প্রোটিন রাসায়নিক স্থানান্তর অ্যাসাইনমেন্টের একটি ডাটাবেস তৈরি করতে ব্যবহৃত হয়েছিল। রিফডিবি হল 2000-এরও বেশি সঠিকভাবে উল্লেখ করা প্রোটিন কেমিক্যাল শিফট অ্যাসাইনমেন্টের একটি ওয়েব-অ্যাক্সেসযোগ্য ডাটাবেস। যদিও মূলত শুধুমাত্র একটি স্বতন্ত্র প্রোগ্রাম হিসাবে উপলব্ধ ছিল, শিফটকর তখন থেকে একটি ওয়েব সার্ভার হিসাবে সাধারণ ব্যবহারের জন্য মুক্তি পেয়েছে। আরও দেখুন কেমিক্যাল শিফট এন. এম. আর প্রোটিন স্ট্রাকচার ডাটাবেস প্রোটিন কেমিক্যাল শিফট রি-রেফারেন্সিং প্রোটিন সেকেন্ডারি স্ট্রাকচার প্রোটিন কেমিক্যাল শিফট প্রেডিকশন কেমিক্যাল শিফট ইনডেক্স প্রোটিন এন. এম. আর রেফারেন্স এক্সটার্নাল লিঙ্ক শিফটএক্স আর. এফ. ডি. বি নিউক্লিয়ার ম্যাগনেটিক রিসোনেন্স সফ্টওয়্যার প্রোটিন পদ্ধতি প্রোটিন স্ট্রাকচার বায়োফিজিক্স কেমিস্ট্রি সফ্টওয়্যার বায়োলজিক্যাল ডেটাবেস