Palindromic sequence
প্যালিনড্রোমিক সিকোয়েন্স হল ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড ডিএনএ বা আরএনএ অণুর একটি নিউক্লিক অ্যাসিড সিকোয়েন্স যার মাধ্যমে একটি নির্দিষ্ট দিকে পড়া হয় (যেমন। একটি স্ট্র্যান্ডে 5 'থেকে 3') একই দিকের ক্রমের অনুরূপ (যেমন। 5 'থেকে 3') পরিপূরক স্ট্র্যান্ডে। প্যালিনড্রোমের এই সংজ্ঞাটি একে অপরের প্যালিনড্রোমিক পরিপূরক স্ট্র্যান্ডের উপর নির্ভর করে। জেনেটিক্সের প্রেক্ষাপটে প্যালিনড্রোমের অর্থ শব্দ এবং বাক্যের জন্য ব্যবহৃত সংজ্ঞার থেকে কিছুটা আলাদা। যেহেতু একটি দ্বৈত হেলিক্স নিউক্লিওটাইডের দুটি জোড়া সমান্তরাল স্ট্র্যান্ড দ্বারা গঠিত হয় যা বিপরীত দিকে চলে এবং নিউক্লিওটাইডগুলি সর্বদা একইভাবে জোড়া হয় (ডিএনএতে থাইমিন (টি) এর সাথে অ্যাডেনিন (এ) বা আরএনএতে ইউরাসিল (ইউ); গুয়ানিনের (জি) সাথে সাইটোসিন (সি), একটি (একক-স্ট্র্যান্ডেড) নিউক্লিওটাইড ক্রমকে একটি প্যালিনড্রোম বলা হয় যদি এটি তার বিপরীত পরিপূরকের সমান হয়। উদাহরণস্বরূপ, নিউক্লিওটাইড-বাই-নিউক্লিওটাইড পরিপূরক টি. জি. জি. এ. টি. সি. সি. এ সহ ডি. এন. এ ক্রম এ. সি. সি. টি. এ. জি. জি. টি. জি. টি প্যালিন্ড্রোমিক কারণ পরিপূরকে নিউক্লিওটাইডের ক্রমকে বিপরীত করলে মূল ক্রমটি পাওয়া যায়। একটি প্যালিনড্রোমিক নিউক্লিওটাইড ক্রম একটি হেয়ারপিন তৈরি করতে সক্ষম। পুরো হেয়ারপিনটি নিউক্লিক অ্যাসিডের একই (একক) স্ট্র্যান্ডের অংশ হওয়ায় হেয়ারপিনের কান্ডের অংশটি একটি ছদ্ম-দ্বিগুণ আটকে থাকা অংশ। প্যালিনড্রোমিক মোটিফগুলি বেশিরভাগ জিনোম বা জেনেটিক নির্দেশাবলীর সেটে পাওয়া যায়। এগুলি ব্যাকটেরিয়াল ক্রোমোজোম এবং তাদের উপর ছড়িয়ে ছিটিয়ে থাকা তথাকথিত ব্যাকটেরিয়াল ইন্টারস্পার্সড মোজাইক এলিমেন্টস (বিআইএমই)-এ বিশেষভাবে গবেষণা করা হয়েছে। 2008 সালে, একটি জিনোম সিকোয়েন্সিং প্রকল্প আবিষ্কার করে যে মানুষের এক্স এবং ওয়াই ক্রোমোজোমের বড় অংশ প্যালিনড্রোম হিসাবে সাজানো হয়। একটি প্যালিনড্রোমিক কাঠামো ওয়াই ক্রোমোজোমকে মাঝখানে বাঁকিয়ে নিজেকে মেরামত করার অনুমতি দেয় যদি একটি দিক ক্ষতিগ্রস্ত হয়। প্রোটিন তৈরি করে এমন পেপটাইড সিকোয়েন্সগুলিতেও প্যালিন্ড্রোমগুলি প্রায়শই পাওয়া যায় বলে মনে হয়, তবে প্রোটিন কার্যক্রমে তাদের ভূমিকা স্পষ্টভাবে জানা যায় না। এটি প্রস্তাব করা হয়েছে যে পেপটাইডগুলিতে প্যালিনড্রোমের অস্তিত্ব প্রোটিনে কম-জটিলতার অঞ্চলের প্রাদুর্ভাবের সাথে সম্পর্কিত হতে পারে, কারণ প্যালিনড্রোমগুলি প্রায়শই কম-জটিলতার ক্রমের সাথে যুক্ত থাকে। তাদের প্রাদুর্ভাব আলফা হেলিসেস বা প্রোটিন/প্রোটিন কমপ্লেক্স গঠনের জন্য এই ধরনের ক্রমের প্রবণতার সাথেও সম্পর্কিত হতে পারে। উদাহরণস্বরূপ, পলিনড্রোমিক সিকোয়েন্সগুলি আণবিক জীববিজ্ঞানে গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা পালন করে। যেহেতু একটি ডিএনএ সিকোয়েন্স ডাবল স্ট্রেন্ডেড, তাই একটি প্যালিনড্রোম নির্ধারণের জন্য বেস জোড়া পড়া হয় (শুধুমাত্র একটি স্ট্র্যান্ডের বেস নয়)। অনেক সীমাবদ্ধতা এন্ডোনিউক্লিয়াস (সীমাবদ্ধতা এনজাইম) নির্দিষ্ট প্যালিনড্রোমিক ক্রমগুলি সনাক্ত করে এবং সেগুলি কেটে দেয়। সীমাবদ্ধতা এনজাইম ইকোআর1 নিম্নলিখিত প্যালিনড্রোমিক ক্রমকে স্বীকৃতি দেয়ঃ 5 '-জি এ এ টি টি সি-3' 3 '-সি টি টি এ জি-5' উপরের স্ট্র্যান্ডটি 5 '-জিএএটিটিসি-3' পড়ে, যখন নীচের স্ট্র্যান্ডটি 3 '-সিটিটিএএজি-5' পড়ে। যদি ডিএনএ স্ট্র্যান্ডটি উল্টে দেওয়া হয়, তবে ক্রমগুলি ঠিক একই (5 'জিএএটিটিসি-3' এবং 3 '-সিটিটিএএজি-5')। এখানে আরও সীমাবদ্ধ এনজাইম এবং প্যালিনড্রোমিক সিকোয়েন্স রয়েছে যা তারা সনাক্ত করেঃ মিথাইলেশন সাইট প্যালিনড্রোমিক সিকোয়েন্সগুলিতে মিথাইলেশন সাইটও থাকতে পারে। এগুলি হল সেই স্থান যেখানে একটি মিথাইল গ্রুপকে প্যালিনড্রোমিক ক্রমের সাথে সংযুক্ত করা যেতে পারে। মিথাইলেশন প্রতিরোধী জিনকে নিষ্ক্রিয় করে তোলে; এটিকে সন্নিবেশ নিষ্ক্রিয়তা বা সন্নিবেশমূলক মিউটেজেনেসিস বলা হয়। উদাহরণস্বরূপ, টেট্রাসাইক্লিন প্রতিরোধী জিনে পিবিআর 322 মিথাইলেশনে প্লাজমিডকে টেট্রাসাইক্লিন-এর জন্য দায়ী করে তোলে; টেট্রাসাইক্লিন প্রতিরোধী জিনে মিথাইলেশনের পরে যদি প্লাজমিডটি অ্যান্টিবায়োটিক টেট্রাসাইক্লিন-এর সংস্পর্শে আসে তবে এটি বেঁচে থাকে না। টি সেল রিসেপ্টরগুলিতে প্যালিনড্রোমিক নিউক্লিওটাইডস টি সেল রিসেপ্টর (টিসিআর) জিনের বৈচিত্র্য তাদের জার্মলাইন-এনকোডেড ভি, ডি এবং জে বিভাগ থেকে ভি (ডি) জে পুনঃসংযোগের উপর নিউক্লিওটাইড সন্নিবেশ দ্বারা উত্পন্ন হয়। ভি-ডি এবং ডি-জে জংশনে নিউক্লিওটাইড সন্নিবেশ এলোমেলো, তবে এই সন্নিবেশগুলির কিছু ছোট উপসেট ব্যতিক্রমী, এতে এক থেকে তিনটি বেস জোড়া জার্মলাইন ডিএনএর ক্রমকে বিপরীতভাবে পুনরাবৃত্তি করে। এই সংক্ষিপ্ত পরিপূরক প্যালিন্ড্রোমিক ক্রমগুলিকে পি নিউক্লিওটাইড বলা হয়। তথ্যসূত্র ডি. এন. এ প্যালিনড্রোম