Indonesian occupation of East Timor
पूर्वी तिमोर पर इंडोनेशियाई कब्जा दिसंबर 1975 में शुरू हुआ और अक्टूबर 1999 तक चला। पूर्वी तिमोर में सदियों के पुर्तगाली औपनिवेशिक शासन के बाद, 1974 में पुर्तगाल में हुए तख्तापलट ने इसके पूर्व उपनिवेशों के उपनिवेशवाद को समाप्त कर दिया, जिससे पूर्वी तिमोर में अस्थिरता पैदा हुई और इसका भविष्य अनिश्चित हो गया। एक छोटे पैमाने के गृहयुद्ध के बाद, स्वतंत्रता समर्थक फ्रेटिलिन ने राजधानी शहर दिली में जीत की घोषणा की और 28 नवंबर 1975 को एक स्वतंत्र पूर्वी तिमोर की घोषणा की। 30 नवंबर 1975 को एपोडेटी, यू. डी. टी., के. ओ. टी. ए. और ट्राबलहिस्टा पार्टी के प्रतिनिधियों द्वारा हस्ताक्षरित "बालिबो घोषणा" के बाद, इंडोनेशियाई सैन्य बलों ने 7 दिसंबर 1975 को पूर्वी तिमोर पर आक्रमण किया और 1979 तक उन्होंने कब्जे के सशस्त्र प्रतिरोध को नष्ट कर दिया था। 17 जुलाई 1976 को, इंडोनेशिया ने औपचारिक रूप से पूर्वी तिमोर को अपने 27वें प्रांत के रूप में शामिल किया और तिमोर प्रांत की घोषणा की। आक्रमण के तुरंत बाद, संयुक्त राष्ट्र महासभा और सुरक्षा परिषद ने पूर्वी तिमोर में इंडोनेशिया की कार्रवाइयों की निंदा करते हुए और क्षेत्र से इसकी तत्काल वापसी का आह्वान करते हुए प्रस्ताव पारित किए। ऑस्ट्रेलिया और इंडोनेशिया दुनिया के एकमात्र ऐसे राष्ट्र थे जिन्होंने पूर्वी तिमोर को इंडोनेशिया के एक प्रांत के रूप में मान्यता दी, और इसके तुरंत बाद उन्होंने तिमोर अंतराल में पाए गए संसाधनों को विभाजित करने के लिए बातचीत शुरू की। संयुक्त राज्य अमेरिका, जापान, कनाडा और मलेशिया सहित अन्य सरकारों ने भी इंडोनेशियाई सरकार का समर्थन किया। हालाँकि, पूर्वी तिमोर के आक्रमण और उसके स्वतंत्रता आंदोलन के दमन ने इंडोनेशिया की प्रतिष्ठा और अंतर्राष्ट्रीय विश्वसनीयता को बहुत नुकसान पहुँचाया। चौबीस वर्षों तक, इंडोनेशियाई सरकार ने पूर्वी तिमोर के लोगों को नियमित और व्यवस्थित यातना, यौन गुलामी, गैर-न्यायिक निष्पादन, नरसंहार और जानबूझकर भुखमरी के अधीन किया। 1991 के सांताक्रूज नरसंहार ने दुनिया भर में आक्रोश पैदा किया, और इस तरह की अन्य हत्याओं की कई खबरें थीं। इंडोनेशियाई शासन का प्रतिरोध मजबूत बना रहा; 1996 में पूर्वी तिमोर के दो पुरुषों, कार्लोस फिलिप ज़िमेनेस बेलो और जोस रामोस-होर्टा को कब्जे को शांतिपूर्ण ढंग से समाप्त करने के उनके चल रहे प्रयासों के लिए नोबेल शांति पुरस्कार से सम्मानित किया गया था। पूर्वी तिमोर के भविष्य को निर्धारित करने के लिए 1999 में हुए मतदान के परिणामस्वरूप स्वतंत्रता के पक्ष में भारी बहुमत मिला और 2002 में पूर्वी तिमोर एक स्वतंत्र राष्ट्र बन गया। पूर्वी तिमोर में स्वागत, सत्य और सुलह आयोग ने अनुमान लगाया कि अकाल और हिंसा से कब्जे के दौरान होने वाली मौतों की संख्या 90,800 और 202,600 के बीच थी, जिसमें 1999 की लगभग 823,386 की आबादी में से 17,600 और 19,600 के बीच हिंसक मौतें या गायब होना शामिल था। सत्य आयोग ने लगभग 70 प्रतिशत हिंसक हत्याओं के लिए इंडोनेशियाई बलों को जिम्मेदार ठहराया। 1999 में स्वतंत्रता के लिए मतदान के बाद, इंडोनेशियाई सेना के साथ काम करने वाले अर्धसैनिक समूहों ने हिंसा की अंतिम लहर चलाई, जिसके दौरान देश का अधिकांश बुनियादी ढांचा नष्ट हो गया था। पूर्वी तिमोर के लिए ऑस्ट्रेलियाई नेतृत्व वाले अंतर्राष्ट्रीय बल ने व्यवस्था बहाल की, और पूर्वी तिमोर से इंडोनेशियाई बलों के प्रस्थान के बाद, पूर्वी तिमोर में संयुक्त राष्ट्र संक्रमणकालीन प्रशासन ने दो साल के लिए इस क्षेत्र को प्रशासित किया, 1999 में किए गए अपराधों की जांच और मुकदमा चलाने के लिए एक गंभीर अपराध इकाई की स्थापना की। इसके सीमित दायरे और इंडोनेशियाई अदालतों द्वारा दी गई छोटी संख्या में सजाओं के कारण कई पर्यवेक्षकों ने पूर्वी तिमोर के लिए एक अंतर्राष्ट्रीय न्यायाधिकरण की मांग की है। ऑक्सफोर्ड विश्वविद्यालय ने पूर्वी तिमोर के कब्जे को नरसंहार बताते हुए एक अकादमिक सर्वसम्मति स्थापित की और येल विश्वविद्यालय इसे अपने नरसंहार अध्ययन कार्यक्रम के हिस्से के रूप में पढ़ाता है। पृष्ठभूमि पुर्तगाली पहली बार 16वीं शताब्दी में तिमोर पहुंचे और 1702 में पूर्वी तिमोर पुर्तगाली औपनिवेशिक प्रशासन के अधीन आ गया। 1860 में डच साम्राज्य के साथ द्वीप के विभाजित होने तक पुर्तगाली शासन कमजोर था। प्रशांत युद्ध के दौरान एक महत्वपूर्ण युद्ध के मैदान, पूर्वी तिमोर पर 20,000 जापानी सैनिकों का कब्जा था। लड़ाई ने ऑस्ट्रेलिया पर जापानी कब्जे को रोकने में मदद की लेकिन इसके परिणामस्वरूप 60,000 पूर्वी तिमोरियों की मौत हो गई। जब इंडोनेशिया ने सुकर्णो के नेतृत्व में द्वितीय विश्व युद्ध के बाद अपनी स्वतंत्रता हासिल की, तो उसने पूर्वी तिमोर पर नियंत्रण का दावा नहीं किया, और सामान्य औपनिवेशिक विरोधी बयानबाजी के अलावा, उसने क्षेत्र पर पुर्तगाली नियंत्रण का विरोध नहीं किया। पुर्तगालियों के खिलाफ पूर्वी तिमोर में 1959 के विद्रोह का इंडोनेशियाई सरकार द्वारा समर्थन नहीं किया गया था। 1962 के संयुक्त राष्ट्र के एक दस्तावेज़ में कहा गया हैः "इंडोनेशिया की सरकार ने घोषणा की है कि वह पुर्तगाल के साथ मैत्रीपूर्ण संबंध रखती है और पुर्तगाली तिमोर पर उसका कोई दावा नहीं है।" 1965 में सुहार्तो के सत्ता संभालने के बाद भी ये आश्वासन जारी रहे। दिसंबर 1974 में एक इंडोनेशियाई अधिकारी ने घोषणा कीः "इंडोनेशिया की कोई क्षेत्रीय महत्वाकांक्षा नहीं है। इस प्रकार इंडोनेशिया के पुर्तगाली तिमोर पर कब्जा करने की इच्छा का कोई सवाल ही नहीं है। 1974 में, लिस्बन में एक तख्तापलट ने तिमोर में अपनी कॉलोनी के साथ पुर्तगाल के संबंधों में महत्वपूर्ण बदलाव किए। यूरोप में सत्ता परिवर्तन ने मोजाम्बिक और अंगोला जैसे उपनिवेशों में स्वतंत्रता के लिए आंदोलनों को प्रोत्साहित किया, और नई पुर्तगाली सरकार ने पूर्वी तिमोर के लिए एक उपनिवेशवाद प्रक्रिया शुरू की। इनमें से पहला राजनीतिक प्रक्रिया की शुरुआत थी। फ्रेटिलिन, यू. डी. टी. और ए. पी. ओ. डी. ई. टी. आई. जब अप्रैल 1974 में पूर्वी तिमोर के राजनीतिक दलों को पहली बार वैध बनाया गया था, तो तीन समूह उत्तर-औपनिवेशिक परिदृश्य में महत्वपूर्ण खिलाड़ियों के रूप में उभरे। यूनिओ डेमोक्रैटिका टिमोरेंस (तिमोरीस डेमोक्रेटिक यूनियन, या यू. डी. टी.) का गठन मई में अमीर जमींदारों के एक समूह द्वारा किया गया था। प्रारंभ में पूर्वी तिमोर को पुर्तगाल के एक संरक्षित राज्य के रूप में संरक्षित करने के लिए समर्पित, सितंबर में यू. डी. टी. ने स्वतंत्रता के लिए अपने समर्थन की घोषणा की। एक सप्ताह बाद, फ्रेंटे रिवोल्यूशनरिया डी तिमोर-लेस्टे इंडिपेंडेंट (एक स्वतंत्र पूर्वी तिमोर के लिए क्रांतिकारी मोर्चा, या फ्रेटिलिन) दिखाई दिया। प्रारंभ में ए. एस. डी. टी. (एसोसिएशन सोशल डेमोक्रैटा टिमोरेंस) के रूप में संगठित, समूह ने "समाजवाद के सार्वभौमिक सिद्धांतों" के साथ-साथ "स्वतंत्रता के अधिकार" का समर्थन किया। हालाँकि, जैसे-जैसे राजनीतिक प्रक्रिया अधिक तनावपूर्ण होती गई, समूह ने अपना नाम बदल दिया और खुद को "लोगों का एकमात्र वैध प्रतिनिधि" घोषित कर दिया। मई के अंत में एक तीसरे पक्ष, एसोसिएशन पॉप्युलर डेमोक्रेटिक टिमोरेंस (तिमोरस पॉप्युलर डेमोक्रेटिक एसोसिएशन, या ए. पी. ओ. डी. ई. टी. आई.) का निर्माण हुआ। इंडोनेशिया के साथ पूर्वी तिमोर के एकीकरण की वकालत करते हुए और मूल रूप से इसका नाम एसोसिएशन इंटीग्रासिआको डी तिमोर इंडोनेशिया (इंडोनेशिया में तिमोर के एकीकरण के लिए संगठन) रखा गया था, ए. पी. ओ. डी. ई. टी. आई. ने चिंता व्यक्त की कि एक स्वतंत्र पूर्वी तिमोर तब आर्थिक रूप से कमजोर और कमजोर होगा। इंडोनेशियाई राष्ट्रवादी और सैन्य कट्टरपंथियों, विशेष रूप से खुफिया एजेंसी कोपकाम्टिब और विशेष संचालन इकाई, कोपासस के नेताओं ने पुर्तगाली तख्तापलट को इंडोनेशिया के साथ पूर्वी तिमोर के एकीकरण के अवसर के रूप में देखा। केंद्र सरकार और सेना को डर था कि वामपंथियों द्वारा शासित पूर्वी तिमोर का उपयोग इंडोनेशिया में प्रतिकूल शक्तियों द्वारा घुसपैठ के लिए एक आधार के रूप में किया जा सकता है, और यह भी कि द्वीपसमूह के भीतर एक स्वतंत्र पूर्वी तिमोर इंडोनेशियाई प्रांतों के भीतर अलगाववादी भावनाओं को प्रेरित कर सकता है। राष्ट्रीय विघटन का डर सुहार्तो के करीबी सैन्य नेताओं पर खेला गया था और 1990 के दशक के अंत तक पूर्वी तिमोर की स्वतंत्रता या यहां तक कि स्वायत्तता की संभावना को स्वीकार करने से इनकार करने के लिए इंडोनेशिया के सबसे मजबूत औचित्य के रूप में बना रहा। सैन्य खुफिया संगठनों ने शुरू में एक गैर-सैन्य विलय रणनीति की मांग की, जिसका उद्देश्य ए. पी. ओ. डी. ई. टी. आई. को अपने एकीकरण वाहन के रूप में उपयोग करना था। जनवरी 1975 में, यू. डी. टी. और फ्रेटिलिन ने पूर्वी तिमोर के लिए स्वतंत्रता प्राप्त करने के लिए समर्पित एक अस्थायी गठबंधन की स्थापना की। उसी समय, ऑस्ट्रेलियाई सरकार ने बताया कि इंडोनेशियाई सेना ने लाम्पुंग में "आक्रमण से पहले" अभ्यास किया था। महीनों से, इंडोनेशियाई विशेष संचालन कमान, कोपासस, ऑपेरासी कोमोडो (ऑपरेशन कोमोडो, छिपकली के नाम पर) के माध्यम से गुप्त रूप से ए. पी. ओ. डी. ई. टी. आई. का समर्थन कर रहा था। पर्यवेक्षकों ने कहा कि फ्रेटिलिन नेताओं के बीच साम्यवाद के आरोपों को प्रसारित करके और यू. डी. टी. गठबंधन में कलह पैदा करके, इंडोनेशियाई सरकार ने पूर्वी तिमोर में अस्थिरता को बढ़ावा दिया और आक्रमण करने का बहाना बनाया। मई तक दोनों समूहों के बीच तनाव के कारण यू. डी. टी. गठबंधन से हट गया। पूर्वी तिमोर के भविष्य पर विवाद के समाधान के लिए बातचीत करने के प्रयास में, पुर्तगाली उपनिवेशवाद आयोग ने जून 1975 में मकाऊ में एक सम्मेलन बुलाया। ए. पी. ओ. डी. ई. टी. आई. की उपस्थिति के विरोध में फ्रेटिलिन ने बैठक का बहिष्कार किया; यू. डी. टी. और ए. पी. ओ. डी. ई. टी. आई. के प्रतिनिधियों ने शिकायत की कि यह उपनिवेशवाद की प्रक्रिया को बाधित करने का एक प्रयास था। अपने 1987 के संस्मरण फ़नूः द अनफिनिश्ड सागा ऑफ़ ईस्ट तिमोर में, फ़्रेटिलिन नेता जोस रामोस-होर्टा ने बैठक में भाग लेने से अपनी पार्टी के इनकार के खिलाफ अपने "जोरदार विरोध" को याद किया। वे लिखते हैं, "यह हमारी सामरिक राजनीतिक गलतियों में से एक थी जिसके लिए मुझे कभी भी एक बुद्धिमान स्पष्टीकरण नहीं मिला।" तख्तापलट, गृहयुद्ध और स्वतंत्रता की घोषणा तनाव 1975 के मध्य में एक उबलते बिंदु पर पहुंच गया जब दोनों स्वतंत्रता दलों से संभावित सत्ता की जब्ती की अफवाहें फैलने लगीं। अगस्त 1975 में, यू. डी. टी. ने राजधानी शहर दिली में तख्तापलट किया, और एक छोटे पैमाने पर गृहयुद्ध छिड़ गया। रामोस-होर्टा लड़ाई को "खूनी" बताता है, और यू. डी. टी. और फ्रेटिलिन दोनों द्वारा की गई हिंसा का विवरण देता है। उन्होंने रेड क्रॉस की अंतर्राष्ट्रीय समिति का हवाला दिया, जिसने युद्ध के बाद मारे गए 1,000 लोगों की गिनती की। लड़ाई ने पुर्तगाली सरकार को पास के अतौरो द्वीप पर मजबूर कर दिया। फ्रेटिलिन ने दो सप्ताह के बाद यू. डी. टी. की सेनाओं को हराया, जिससे पुर्तगाल और इंडोनेशिया को बहुत आश्चर्य हुआ। यू. डी. टी. के नेता इंडोनेशियाई-नियंत्रित पश्चिम तिमोर भाग गए। वहाँ उन्होंने 7 सितंबर को इंडोनेशिया के साथ पूर्वी तिमोर के एकीकरण के लिए एक याचिका पर हस्ताक्षर किए; अधिकांश खातों से संकेत मिलता है कि इस स्थिति के लिए यू. डी. टी. का समर्थन इंडोनेशिया द्वारा मजबूर किया गया था। एक बार जब उन्होंने पूर्वी तिमोर पर नियंत्रण हासिल कर लिया, तो फ्रेटिलिन को पश्चिम से, इंडोनेशियाई सैन्य बलों द्वारा-जिसे तब अंगकतन बर्सेनजाता रिपब्लिक इंडोनेशिया (एबीआरआई) के नाम से जाना जाता था-और यूडीटी सैनिकों के एक छोटे समूह द्वारा हमलों का सामना करना पड़ा। इंडोनेशिया ने 8 अक्टूबर 1975 को सीमावर्ती शहर बटुगाडे पर कब्जा कर लिया; पास के बालिबो और मालियाना को आठ दिन बाद ले लिया गया। बालिबो छापे के दौरान, एक ऑस्ट्रेलियाई टेलीविजन समाचार दल के सदस्य-जिन्हें बाद में "बालिबो फाइव" कहा गया-इंडोनेशियाई सैनिकों द्वारा मारे गए थे। इंडोनेशियाई सैन्य अधिकारियों का कहना है कि मौतें आकस्मिक थीं, और पूर्वी तिमोर के गवाहों का कहना है कि पत्रकारों को जानबूझकर मार दिया गया था। मौतों, और बाद के अभियानों और जांचों ने अंतर्राष्ट्रीय ध्यान आकर्षित किया और पूर्वी तिमोर की स्वतंत्रता के लिए समर्थन जुटाया। नवंबर की शुरुआत में, इंडोनेशिया और पुर्तगाल के विदेश मंत्रियों ने संघर्ष के समाधान पर चर्चा करने के लिए रोम में मुलाकात की। हालाँकि किसी भी तिमोर के नेता को वार्ता में आमंत्रित नहीं किया गया था, लेकिन फ्रेटिलिन ने पुर्तगाल के साथ काम करने की इच्छा व्यक्त करते हुए एक संदेश भेजा। बैठक दोनों पक्षों के इस सहमति के साथ समाप्त हुई कि पुर्तगाल पूर्वी तिमोर में राजनीतिक नेताओं के साथ मुलाकात करेगा, लेकिन बातचीत कभी नहीं हुई। नवंबर के मध्य में, इंडोनेशियाई बलों ने समुद्र से अताबे शहर पर गोलाबारी शुरू की और महीने के अंत तक इस पर कब्जा कर लिया। पुर्तगाल की निष्क्रियता से निराश, फ्रेटिलिन नेताओं का मानना था कि अगर वे एक स्वतंत्र पूर्वी तिमोर की घोषणा करते हैं तो वे इंडोनेशियाई प्रगति को अधिक प्रभावी ढंग से रोक सकते हैं। राष्ट्रीय राजनीतिक आयुक्त मारी अल्कातिरी ने वहाँ और अन्य जगहों की सरकारों से समर्थन जुटाते हुए अफ्रीका का राजनयिक दौरा किया। फ्रेटिलिन के अनुसार, इस प्रयास से चीन जनवादी गणराज्य, सोवियत संघ, मोजाम्बिक, स्वीडन और क्यूबा सहित पँचिश देशों से नए राष्ट्र को मान्यता देने का आश्वासन मिला। क्यूबा के वर्तमान में पूर्वी तिमोर के साथ घनिष्ठ संबंध हैं। 28 नवंबर 1975 को, फ्रेटिलिन ने एकतरफा रूप से पूर्वी तिमोर लोकतांत्रिक गणराज्य के लिए स्वतंत्रता की घोषणा की। इंडोनेशिया ने घोषणा की कि बालिबो और उसके आसपास यू. डी. टी. और ए. पी. ओ. डी. ई. टी. आई. के नेता अगले दिन उस क्षेत्र को पूर्वी तिमोर से स्वतंत्र और आधिकारिक तौर पर इंडोनेशिया का हिस्सा घोषित करके जवाब देंगे। हालाँकि, इस बालिबो घोषणा का मसौदा इंडोनेशियाई खुफिया द्वारा तैयार किया गया था और बाली पर हस्ताक्षर किए गए थे; बाद में इसे कुछ लोगों द्वारा 'बालिबोहोंग घोषणा' के रूप में वर्णित किया गया था, जो 'झूठ' के लिए इंडोनेशियाई शब्द पर एक श्लेष था। पुर्तगाल ने दोनों घोषणाओं को खारिज कर दिया, और इंडोनेशियाई सरकार ने पूर्वी तिमोर के अपने विलय को शुरू करने के लिए सैन्य कार्रवाई को मंजूरी दे दी। 7 दिसंबर 1975 को इंडोनेशियाई सेना ने पूर्वी तिमोर पर आक्रमण किया। ऑपरेशन सेरोजा (ऑपरेशन लोटस) उस राष्ट्र द्वारा किया गया अब तक का सबसे बड़ा सैन्य अभियान था। फ्रेटिलिन के सैन्य संगठन फालिंटिल के सैनिकों ने दिली की सड़कों पर ए. बी. आर. आई. बलों को घेर लिया और बताया कि 400 इंडोनेशियाई पैराट्रूपर मारे गए क्योंकि वे शहर में उतरे थे। अंगकासा पत्रिका 35 इंडोनेशियाई सैनिकों के मारे जाने और फ्रेटिलिन की ओर से 122 सैनिकों के मारे जाने की सूचना देती है। वर्ष के अंत तक, 10,000 सैनिकों ने दिली पर कब्जा कर लिया, और पूरे पूर्वी तिमोर में 20,000 अन्य सैनिकों को तैनात कर दिया गया था। भारी संख्या में, फालिंटिल सैनिक पहाड़ों की ओर भाग गए और गुरिल्ला युद्ध अभियान जारी रखा। इंडोनेशियाई अत्याचार आक्रमण की शुरुआत से, टी. एन. आई. बल तिमोर के नागरिकों के थोक नरसंहार में लगे हुए थे। कब्जे की शुरुआत में, फ्रेटिलिन रेडियो ने निम्नलिखित प्रसारण भेजाः "इंडोनेशियाई सेना अंधाधुंध रूप से मार रही है। महिलाओं और बच्चों को सड़कों पर गोली मारी जा रही है। हम सब मारे जा रहे हैं। यह अंतर्राष्ट्रीय सहायता के लिए एक अपील है। कृपया इस आक्रमण को रोकने के लिए कुछ करें। एक तिमोर के शरणार्थी ने बाद में "महिलाओं और बच्चों और चीनी दुकान मालिकों के बलात्कार [और] निर्मम हत्याओं" के बारे में बताया। उस समय दिली के बिशप, मार्टिन्हो दा कोस्टा लोप्स ने बाद में कहाः "उतरने वाले सैनिकों ने उन सभी को मारना शुरू कर दिया जिन्हें वे पा सकते थे। गलियों में कई शव थे-हम केवल सैनिकों को मारते, मारते, मारते देख सकते थे। एक घटना में, पचास पुरुषों, महिलाओं और बच्चों के एक समूह-जिसमें ऑस्ट्रेलियाई स्वतंत्र रिपोर्टर रोजर ईस्ट भी शामिल थे-को दिली के बाहर एक चट्टान पर खड़ा किया गया और गोली मार दी गई, उनके शव समुद्र में गिर गए। दिली में ऐसे कई नरसंहार हुए, जहाँ दर्शकों को आदेश दिया गया कि वे प्रत्येक व्यक्ति को फांसी दिए जाने पर गौर करें और ज़ोर से गिनती करें। यह अनुमान लगाया गया है कि अकेले दिली में आक्रमण के पहले दो दिनों में कम से कम 2,000 तिमोरियों का नरसंहार किया गया था। फ्रेटिलिन समर्थकों के अलावा, चीनी प्रवासियों को भी फांसी के लिए चुना गया था; अकेले पहले दिन ही पाँच सौ मारे गए थे। सामूहिक हत्याएँ बेरोकटोक जारी रहीं क्योंकि इंडोनेशियाई सेनाएँ पूर्वी तिमोर के फ्रेटिलिन-नियंत्रित पहाड़ी क्षेत्रों में आगे बढ़ीं। एक वरिष्ठ इंडोनेशियाई अधिकारी के लिए एक तिमोर गाइड ने पुर्तगाली तिमोर के लिए पूर्व ऑस्ट्रेलियाई वाणिज्य दूत जेम्स डन को बताया कि लड़ाई के शुरुआती महीनों के दौरान टीएनआई सैनिकों ने "अधिकांश तिमोरियों को मार डाला जिनका वे सामना कर रहे थे।" फरवरी 1976 में दिली के दक्षिण में आइल्यू गाँव पर कब्जा करने और शेष फ्रेटिलिन बलों को बाहर निकालने के बाद, इंडोनेशियाई सैनिकों ने शहर की अधिकांश आबादी को मशीन-बंदूक से मार डाला, कथित तौर पर तीन साल से अधिक उम्र के सभी लोगों को गोली मार दी। जिन छोटे बच्चों को बचा लिया गया था, उन्हें ट्रकों में वापस दिली ले जाया गया। जिस समय आइल्यू इंडोनेशियाई सेना के हाथों गिर गया, उस समय आबादी लगभग 5,000 थी; जब तक सितंबर 1976 में इंडोनेशियाई राहत कार्यकर्ताओं ने गाँव का दौरा किया, तब तक केवल 1,000 बचे थे। जून 1976 में, एक फ्रेटिलिन हमले से बुरी तरह से पीड़ित टी. एन. आई. सैनिकों ने पश्चिम तिमोर सीमा के पास लामाकनान में एक बड़े शरणार्थी शिविर आवास 5-6,000 तिमोरियों के खिलाफ प्रतिशोध लिया। कई घरों में आग लगाने के बाद, इंडोनेशियाई सैनिकों ने लगभग 2,000 पुरुषों, महिलाओं और बच्चों का नरसंहार किया। मार्च 1977 में पूर्व ऑस्ट्रेलियाई वाणिज्य दूत जेम्स डन ने एक रिपोर्ट प्रकाशित की जिसमें आरोपों का विवरण दिया गया था कि दिसंबर 1975 से इंडोनेशियाई बलों ने पूर्वी तिमोर में 50,000 से 100,000 नागरिकों को मार डाला था। यह यू. डी. टी. नेता लोपेज़ दा क्रूज़ द्वारा 13 फरवरी 1976 को दिए गए एक बयान के अनुरूप है कि गृहयुद्ध के पिछले छह महीनों के दौरान 60,000 तिमोरियों को मार दिया गया था, जो आक्रमण के पहले दो महीनों में कम से कम 55,000 लोगों के मारे जाने का सुझाव देता है। इंडोनेशियाई राहत कार्यकर्ताओं का एक प्रतिनिधिमंडल इस आंकड़े से सहमत था। कैथोलिक चर्च द्वारा 1976 के अंत में एक रिपोर्ट में भी मरने वालों की संख्या 60,000 और 100,000 के बीच होने का अनुमान लगाया गया था। इन आंकड़ों की पुष्टि इंडोनेशियाई सरकार के लोगों ने भी की थी। 5 अप्रैल 1977 को सिडनी मॉर्निंग हेराल्ड के साथ एक साक्षात्कार में, इंडोनेशियाई विदेश मंत्री एडम मलिक ने कहा कि मरने वालों की संख्या "50,000 लोग या शायद 80,000" थी। इंडोनेशियाई सरकार ने पूर्वी तिमोर के अपने विलय को उपनिवेश विरोधी एकता के रूप में प्रस्तुत किया। इंडोनेशियाई विदेश मामलों के विभाग की 1977 की एक पुस्तिका, जिसका शीर्षक पूर्वी तिमोर में उपनिवेशवाद का उन्मूलन था, ने "आत्मनिर्णय के पवित्र अधिकार" को श्रद्धांजलि दी और ए. पी. ओ. डी. ई. टी. आई. को पूर्वी तिमोर के बहुमत के सच्चे प्रतिनिधियों के रूप में मान्यता दी। इसने दावा किया कि फ्रेटिलिन की लोकप्रियता "धमकियों, ब्लैकमेल और आतंक की नीति" का परिणाम थी। बाद में, इंडोनेशियाई विदेश मंत्री अली अलातास ने अपने 2006 के संस्मरण द पेबल इन द शूः द डिप्लोमैटिक स्ट्रगल फॉर ईस्ट तिमोर में इस स्थिति को दोहराया। आक्रमण के बाद इंडोनेशिया ने तर्क दिया कि द्वीप का पूर्व और पश्चिम में मूल विभाजन, पुर्तगाली और डच शाही शक्तियों द्वारा लागू "औपनिवेशिक उत्पीड़न का परिणाम" था। इस प्रकार, इंडोनेशियाई सरकार के अनुसार, 27वें प्रांत का इसका विलय द्वीपसमूह के एकीकरण की दिशा में केवल एक और कदम था जो 1940 के दशक में शुरू हुआ था। संयुक्त राष्ट्र की प्रतिक्रिया और अंतर्राष्ट्रीय कानून आक्रमण के अगले दिन, संयुक्त राष्ट्र महासभा की एक समिति ने स्थिति पर बहस करने के लिए बैठक की। इंडोनेशिया के साथ संबद्ध राष्ट्रों-भारत, जापान और मलेशिया सहित-ने रक्तपात के लिए पुर्तगाल और तिमोर के राजनीतिक दलों को दोषी ठहराते हुए एक प्रस्ताव लिखा; इसे अल्जीरिया, क्यूबा, सेनेगल और गुयाना द्वारा तैयार किए गए मसौदे के पक्ष में खारिज कर दिया गया था। इसे 12 दिसंबर को जी. ए. प्रस्ताव 3485 (XXX) के रूप में अपनाया गया था, जिसमें इंडोनेशिया से "बिना किसी देरी के पीछे हटने" का आह्वान किया गया था। दस दिन बाद, संयुक्त राष्ट्र सुरक्षा परिषद ने सर्वसम्मति से प्रस्ताव 384 (1975) को अपनाया, जो तत्काल इंडोनेशियाई वापसी के लिए जी. ए. प्रस्ताव के आह्वान को प्रतिध्वनित करता है। एक साल बाद सुरक्षा परिषद ने प्रस्ताव 389 (1976) में भी यही भावना व्यक्त की और महासभा ने 1976 और 1982 के बीच हर साल पूर्वी तिमोर में आत्मनिर्णय का आह्वान करते हुए प्रस्ताव पारित किए। चीन और संयुक्त राज्य अमेरिका जैसे बड़े देशों की सरकारों ने आगे की कार्रवाई का विरोध किया; कोस्टा रिका, गिनी-बिसाउ और आइसलैंड जैसे छोटे देश एकमात्र ऐसे प्रतिनिधिमण्डल थे जो प्रस्तावों को जोरदार तरीके से लागू करने का आह्वान कर रहे थे। 1982 के प्रस्ताव में संयुक्त राष्ट्र महासचिव से "समस्या के व्यापक समाधान को प्राप्त करने के लिए रास्ते खोजने की दृष्टि से सीधे संबंधित सभी पक्षों के साथ परामर्श शुरू करने" का आह्वान किया गया है। कानूनी विशेषज्ञ रोजर एस. क्लार्क ने नोट किया कि इंडोनेशिया के आक्रमण और कब्जे ने अंतर्राष्ट्रीय कानून के दो महत्वपूर्ण तत्वों का उल्लंघन कियाः आत्मनिर्णय का अधिकार और आक्रामकता पर प्रतिबंध। एकीकरण का आह्वान करने वाली 7 सितंबर 1975 की याचिका और न ही मई 1976 में "पीपुल्स असेंबली" का बाद का प्रस्ताव, संयुक्त राष्ट्र महासभा के प्रस्ताव 1541 (XV) द्वारा आवश्यक "निष्पक्ष रूप से संचालित और सार्वभौमिक वयस्क मताधिकार पर आधारित सूचित और लोकतांत्रिक प्रक्रियाओं" के रूप में योग्य नहीं है, जो आत्मनिर्णय के मानदंडों के लिए दिशानिर्देश स्थापित करता है। याचिकाओं में अन्य अपर्याप्तताएँ भी थीं। पूर्वी तिमोर में इंडोनेशिया के सैन्य बल के उपयोग को संयुक्त राष्ट्र चार्टर के अध्याय I के उल्लंघन के रूप में उद्धृत किया गया है, जिसमें कहा गया हैः "सभी सदस्य अपने अंतर्राष्ट्रीय संबंधों में किसी भी राज्य की क्षेत्रीय अखंडता या राजनीतिक स्वतंत्रता के खिलाफ बल के खतरे या उपयोग से बचेंगे।" कुछ पर्यवेक्षकों ने तर्क दिया है कि पूर्वी तिमोर आक्रमण के समय एक राज्य नहीं था, और इस प्रकार संयुक्त राष्ट्र चार्टर द्वारा संरक्षित नहीं है। यह दावा इंडोनेशियाई राष्ट्रीय क्रांति के दौरान डच द्वारा इंडोनेशिया के खिलाफ किए गए दावों को दर्शाता है। जैसा कि कानूनी विद्वान सुसान मार्क्स बताते हैं, अगर पूर्वी तिमोर को एक पुर्तगाली उपनिवेश माना जाता था, तो हालांकि "एक औपनिवेशिक शक्ति और उसकी अपनी कॉलोनी के बीच सशस्त्र संघर्ष के संदर्भ में [संयुक्त राष्ट्र चार्टर अध्याय I के] इस प्रावधान के लागू होने के बारे में कुछ संदेह हो सकता है, इसमें शायद ही कोई संदेह हो कि यह एक संप्रभु राज्य द्वारा दूसरे राज्य की कॉलोनी के खिलाफ बल प्रयोग करने पर लागू होता है।" इंडोनेशियाई आधिपत्य 17 दिसंबर को, इंडोनेशिया ने पूर्वी तिमोर की अनंतिम सरकार (पी. एस. टी. टी.) का गठन किया, जिसका नेतृत्व ए. पी. ओ. डी. ई. टी. आई. के अर्नाल्डो डॉस रीस अराजो ने अध्यक्ष के रूप में और यू. डी. टी. के लोपेज़ दा क्रूज़ ने किया। अधिकांश स्रोत इस संस्थान को इंडोनेशियाई सेना के निर्माण के रूप में वर्णित करते हैं। पी. एस. टी. टी. की पहली गतिविधियों में से एक "लोकप्रिय सभा" का गठन था जिसमें "तिमोर के जीवन के विभिन्न क्षेत्रों के निर्वाचित प्रतिनिधि और नेता" शामिल थे। स्वयं पी. एस. टी. टी. की तरह, लोकप्रिय सभा को आमतौर पर इंडोनेशियाई सेना द्वारा बनाए गए प्रचार के एक साधन के रूप में चित्रित किया जाता है; हालाँकि अंतर्राष्ट्रीय पत्रकारों को मई 1976 में समूह की बैठक देखने के लिए आमंत्रित किया गया था, लेकिन उनकी आवाजाही को सख्ती से बाधित किया गया था। असेंबली ने इंडोनेशिया में औपचारिक एकीकरण के लिए एक अनुरोध का मसौदा तैयार किया, जिसे जकार्ता ने पूर्वी तिमोर में "आत्मनिर्णय के कार्य" के रूप में वर्णित किया। इंडोनेशिया ने पूर्वी तिमोर को 1980 के दशक के अंत और 1990 के दशक की शुरुआत में कुछ वर्षों को छोड़कर बाकी दुनिया से बंद रखा, यह दावा करते हुए कि पूर्वी तिमोरियों के विशाल बहुमत ने एकीकरण का समर्थन किया। इस स्थिति का इंडोनेशियाई मीडिया द्वारा बारीकी से पालन किया गया था कि इंडोनेशिया के साथ उनके एकीकरण की पूर्वी तिमोरियों की स्वीकृति को अधिकांश इंडोनेशियाई लोगों द्वारा हल्के में लिया गया था और यह एक गैर-मुद्दा था। पूर्वी तिमोर को आचेह और इरियन जया के दमन की रणनीति में अधिकारी दल के लिए एक प्रशिक्षण स्थल के रूप में देखा जाने लगा और यह इंडोनेशिया के सैन्य क्षेत्र के प्रभुत्व को सुनिश्चित करने में महत्वपूर्ण था। प्रतिरोध के खिलाफ इंडोनेशियाई अभियान सुहार्तो के साथ प्रभावशाली इंडोनेशियाई खुफिया नेताओं ने शुरू में परिकल्पना की थी कि आक्रमण, फ्रेटिलिन प्रतिरोध के अधीन और इंडोनेशिया के साथ एकीकरण त्वरित और अपेक्षाकृत दर्द रहित होगा। 1976 तक के आगामी इंडोनेशियाई अभियान पूर्वी तिमोरियों के लिए विनाशकारी थे, इंडोनेशियाई संसाधनों पर एक विशाल नाली, अंतरराष्ट्रीय स्तर पर इंडोनेशिया के लिए गंभीर रूप से हानिकारक थी, और अंततः एक विफलता थी। आक्रमण के शुरुआती महीनों के दौरान तटीय क्षेत्रों के पास टी. एन. आई. द्वारा अनियंत्रित, थोक हत्याओं ने आबादी के एक बड़े हिस्से और शेष फालिंटिल के अधिकांश हिस्से को मध्य क्षेत्रों में धकेल दिया था। यह प्रतिकूल साबित हुआ क्योंकि इसने इंडोनेशियाई सैनिकों को एक ऐसे दुश्मन के खिलाफ लड़ने के लिए छोड़ दिया जो अच्छी तरह से सुसज्जित था और जिसकी कृषि संसाधनों और आबादी तक पहुंच थी। नागरिक आबादी फालिंटिल को इंडोनेशियाई बलों की ज्यादतियों के खिलाफ एक बफर के रूप में देखने आई, जिसके कारण प्रतिरोध के लिए समर्थन बढ़ गया। 1975 से 1977 तक, फ्रेटिलिन ने रैली करने वाले समुदायों के सक्रिय समर्थन के साथ, दुर्गम परिस्थितियों में, तटीय क्षेत्रों से भाग जाने वाली कम से कम 40 प्रतिशत आबादी की रक्षा की। श्वार्ज इस तथ्य का सुझाव देते हैं कि इंडोनेशियाई सेना का शक्ति आधार 1970 के दशक के मध्य में खुफिया गलत गणनाओं से मुश्किल से प्रभावित हुआ और चल रही विफलताएं इंडोनेशियाई मामलों में सेना के प्रभुत्व का एक उपाय था। 1976 के अंत तक, फालिंटिल और इंडोनेशियाई सेना के बीच गतिरोध बना हुआ था। बड़े पैमाने पर प्रतिरोध को दूर करने में असमर्थ और अपने संसाधनों को समाप्त करने में असमर्थ, टी. एन. आई. ने फिर से हथियार बनाना शुरू कर दिया। इंडोनेशियाई नौसेना ने संयुक्त राज्य अमेरिका, ऑस्ट्रेलिया, नीदरलैंड, दक्षिण कोरिया और ताइवान से मिसाइल-फायरिंग गश्ती-नौकाओं के साथ-साथ पश्चिम जर्मनी से पनडुब्बियों का आदेश दिया। फरवरी 1977 में, इंडोनेशिया को एक आधिकारिक अमेरिकी सरकार के विदेशी सैन्य सहायता बिक्री क्रेडिट की सहायता से रॉकवेल इंटरनेशनल कॉर्पोरेशन से तेरह ओ. वी.-10 ब्रोंको विमान भी प्राप्त हुए। ब्रोंको पूर्वी तिमोर आक्रमण के लिए आदर्श था, क्योंकि इसे विशेष रूप से खड़ी भूमि में विद्रोह विरोधी अभियानों के लिए बनाया गया था। फरवरी 1977 की शुरुआत तक, 13 ब्रोंकोस में से कम से कम छह पूर्वी तिमोर में काम कर रहे थे और इंडोनेशियाई सेना को फ्रेटिलिन की स्थिति का पता लगाने में मदद कर रहे थे। ओ. वी.-10 ब्रोंकोस ने फालिंटिल को भारी झटका दिया जब विमान ने उनकी सेना पर पारंपरिक हथियारों और सोवियत द्वारा आपूर्ति किए गए नापलम के साथ हमला किया जिसे 'ओपलम' के रूप में जाना जाता है। नए हथियारों के साथ, नए अभियान शुरू करने के लिए अतिरिक्त 10,000 सैनिकों को भेजा गया जो 'अंतिम समाधान' के रूप में जाना जाने लगा। टी. एन. आई. के रणनीतिकारों ने सितंबर 1977 में फालिंटिल के खिलाफ संघर्ष विराम की रणनीति लागू की। यह पूर्वी तिमोर के मध्य क्षेत्रों को नैपाल्म हमलों, रासायनिक युद्ध और फसलों के विनाश के माध्यम से मानव जीवन को बनाए रखने में असमर्थ बनाकर पूरा किया गया था। यह आबादी को इंडोनेशियाई सेना की हिरासत में आत्मसमर्पण करने के लिए मजबूर करने और फालिंटिल को भोजन और आबादी से वंचित करने के लिए किया जाना था। पूर्वी तिमोर में कैथोलिक अधिकारियों ने इस रणनीति को "घेराबंदी और विनाश" अभियान कहा। 35, 000 एबीआरआई सैनिकों ने फ्रेटिलिन समर्थन के क्षेत्रों को घेर लिया और पुरुषों, महिलाओं और बच्चों को मार डाला। हवाई और नौसैनिक बमबारी के बाद जमीनी सैनिकों ने गाँवों और कृषि बुनियादी ढांचे को नष्ट कर दिया। इस अवधि के दौरान हजारों लोग मारे गए होंगे। 1978 की शुरुआत में, इंडोनेशियाई सीमा के पास अरसाइबाई गांव की पूरी नागरिक आबादी को बमबारी और भूख से मरने के बाद फ्रेटिलिन का समर्थन करने के लिए मार दिया गया था। 'घेराबंदी और विनाश' अभियान की सफलता ने 'अंतिम सफाई अभियान' को जन्म दिया, जिसमें बच्चों और पुरुषों को हाथ पकड़ने और फ्रेटिलिन सदस्यों की तलाश में इंडोनेशियाई इकाइयों के सामने मार्च करने के लिए मजबूर किया गया। जब फ्रेटिलिन के सदस्य पाए जाते थे, तो सदस्य आत्मसमर्पण करने या अपने ही लोगों पर गोली चलाने के लिए मजबूर होते थे। इस अवधि के दौरान, इंडोनेशियाई रासायनिक हथियारों के उपयोग के आरोप सामने आए, क्योंकि ग्रामीणों ने बमबारी हमलों के बाद फसलों पर मैगॉट्स दिखाई देने की सूचना दी। फ्रेटिलिन रेडियो ने दावा किया कि इंडोनेशियाई विमानों ने रासायनिक एजेंट गिराए, और कई पर्यवेक्षकों-जिनमें दिली के बिशप भी शामिल थे-ने ग्रामीण इलाकों में नैपालम गिरते हुए देखने की सूचना दी। पूर्वी तिमोर में संयुक्त राष्ट्र के स्वागत, सत्य और सुलह आयोग ने 8,000 से अधिक गवाहों के साथ साक्षात्कार के साथ-साथ इंडोनेशियाई सैन्य दस्तावेजों और अंतर्राष्ट्रीय स्रोतों से खुफिया जानकारी के आधार पर पुष्टि की कि इंडोनेशियाई लोगों ने "घेराबंदी और विनाश" अभियान के दौरान फ्रेटिलिन नियंत्रित क्षेत्रों में भोजन और पानी की आपूर्ति को जहर देने के लिए रासायनिक हथियारों और नैपाल्म का इस्तेमाल किया। क्रूर होने के बावजूद, 1977-1978 का इंडोनेशियाई 'घेराबंदी और विनाश' अभियान प्रभावी था क्योंकि इसने मुख्य फ्रेटिलिन मिलिशिया की कमर तोड़ दी थी। 31 दिसंबर 1978 को हेलीकॉप्टर में सवार इंडोनेशियाई सैनिकों ने सक्षम तिमोर के राष्ट्रपति और सैन्य कमांडर निकोलाउ लोबेटो की गोली मारकर हत्या कर दी थी। पुनर्वास और जबरन भुखमरी खाद्य फसलों के विनाश के परिणामस्वरूप, कई नागरिकों को पहाड़ियों को छोड़ने और टी. एन. आई. के सामने आत्मसमर्पण करने के लिए मजबूर होना पड़ा। अक्सर, जब जीवित ग्रामीण आत्मसमर्पण करने के लिए निचले इलाकों में आते थे, तो सेना उन्हें मार देती थी। जिन लोगों को टी. एन. आई. सैनिकों द्वारा पूरी तरह से नहीं मारा गया था, उन्हें जाँच के लिए प्राप्त करने वाले केंद्रों में भेजा गया था, जिन्हें स्थानीय टी. एन. आई. ठिकानों के आसपास पहले से तैयार किया गया था। इन पारगमन शिविरों में आत्मसमर्पण करने वाले नागरिकों को पंजीकृत किया गया और उनसे पूछताछ की गई। जिन लोगों पर प्रतिरोध के सदस्य होने का संदेह था, उन्हें मार दिया गया। इन केंद्रों का निर्माण अक्सर फूस की झोपड़ियों से किया जाता था जिनमें शौचालय नहीं होते थे। इसके अतिरिक्त, इंडोनेशियाई सेना ने रेड क्रॉस को मानवीय सहायता वितरित करने से रोक दिया, और बंदियों को कोई चिकित्सा देखभाल प्रदान नहीं की गई। नतीजतन, तिमोर के कई लोग-जो भुखमरी से कमजोर हो गए थे और अपने अपहरणकर्ताओं द्वारा दिए गए छोटे राशन पर जीवित थे-कुपोषण, हैजा, दस्त और तपेदिक से मर गए। 1979 के अंत तक, 300,000 और 370,000 तिमोरियों के बीच इन शिविरों से गुजर चुके थे। तीन महीने के बाद, बंदियों को "रणनीतिक बस्तियों" में फिर से बसाया गया, जहाँ उन्हें कैद कर लिया गया और जबरन भुखमरी का सामना करना पड़ा। शिविरों में रहने वालों को यात्रा करने और कृषि भूमि पर खेती करने से रोक दिया गया और कर्फ्यू लगा दिया गया। संयुक्त राष्ट्र सत्य आयोग की रिपोर्ट ने इंडोनेशियाई सेना द्वारा पूर्वी तिमोर की नागरिक आबादी को खत्म करने के लिए एक हथियार के रूप में जबरन भुखमरी के उपयोग की पुष्टि की, और यह कि बड़ी संख्या में लोगों को "भोजन और उसके स्रोतों तक पहुंच से सकारात्मक रूप से वंचित कर दिया गया था।" रिपोर्ट में उन व्यक्तियों की गवाही का हवाला दिया गया जिन्हें इंडोनेशियाई सैनिकों द्वारा भोजन और फसलों और पशुधन के विस्तृत विनाश से वंचित कर दिया गया था। इसने निष्कर्ष निकाला कि जानबूझकर भुखमरी की इस नीति के परिणामस्वरूप 84,200 से 183,000 तिमोरियों की मौत हुई। एक चर्च कार्यकर्ता ने बताया कि एक जिले में हर महीने पाँच सौ पूर्वी तिमोर के लोग भुखमरी से मरते हैं। वर्ल्ड विजन इंडोनेशिया ने अक्टूबर 1978 में पूर्वी तिमोर का दौरा किया और दावा किया कि 70,000 पूर्वी तिमोरियों को भुखमरी का खतरा है। रेड क्रॉस की अंतर्राष्ट्रीय समिति के एक दूत ने 1979 में बताया कि एक शिविर की 80 प्रतिशत आबादी कुपोषित थी, ऐसी स्थिति में जो "बियाफ्रा जितनी खराब" थी। आई. सी. आर. सी. ने चेतावनी दी कि "दसियों हज़ारों" को भुखमरी का खतरा है। इंडोनेशिया ने घोषणा की कि वह संकट को कम करने के लिए सरकार द्वारा संचालित इंडोनेशियाई रेड क्रॉस के माध्यम से काम कर रहा था, लेकिन एनजीओ एक्शन फॉर वर्ल्ड डेवलपमेंट ने उस संगठन पर दान की गई सहायता आपूर्ति बेचने का आरोप लगाया। पूर्वी तिमोर में महिलाओं के खिलाफ ज्ञात इंडोनेशियाई दुर्व्यवहार कई और अच्छी तरह से प्रलेखित थे, हालांकि कब्जे के दौरान लगाए गए कड़े सैन्य नियंत्रण के कारण, पीड़ितों द्वारा महसूस की गई शर्म के कारण समस्या के वास्तविक दायरे का पता लगाना मुश्किल है। इंडोनेशिया और पूर्वी तिमोर में महिलाओं के खिलाफ हिंसा पर 1995 की एक रिपोर्ट में, एमनेस्टी इंटरनेशनल यू. एस. ए. ने लिखाः "महिलाएं बलात्कार और यौन शोषण के बारे में गैर-सरकारी संगठनों को जानकारी देने में अनिच्छुक हैं, सेना या पुलिस अधिकारियों को उल्लंघन की रिपोर्ट करने की तो बात ही छोड़िए।" यौन दासता को टी. एन. आई. द्वारा संस्थागत रूप से सहन और समर्थित किया गया था और महिलाओं को टी. एन. आई. सैनिकों द्वारा यौन शोषण के लिए बुलाया जा सकता था। विश्वसनीय जांच के अनुसार, टी. एन. आई. ने पूर्वी तिमोर की महिलाओं को नामित करने वाली फाइलें रखी जिन्हें इंडोनेशियाई सैनिकों द्वारा बलात्कार और यौन शोषण के लिए उपलब्ध कराया जाना था। इन सूचियों को सैन्य बटालियनों के बीच पारित किया जा सकता था, जो महिलाओं को बार-बार यौन उत्पीड़न के लिए पूर्वनिर्धारित करती थीं। पूर्वी तिमोर में जबरन विवाह भी टी. एन. आई. नीति का एक घटक था। एमनेस्टी की रिपोर्ट में एक महिला के मामले का हवाला दिया गया है जिसे बाउकाऊ में एक कमांडर के साथ रहने के लिए मजबूर किया गया था, फिर उसकी रिहाई के बाद सैनिकों द्वारा रोजाना परेशान किया जाता था। इस तरह के "विवाह" व्यवसाय के दौरान नियमित रूप से होते थे। इंडोनेशियाई नियंत्रण वाले क्षेत्रों में महिलाओं को भी नसबंदी प्रक्रियाओं को स्वीकार करने के लिए मजबूर किया गया था, और कुछ पर गर्भनिरोधक डिपो प्रोवेरा लेने के लिए दबाव डाला गया था या पूरी तरह से मजबूर किया गया था। गाँव के नेताओं से अक्सर टी. एन. आई. नीति के साथ सहयोग करने का आग्रह किया जाता था, और ग्रामीण इलाकों में टी. एन. आई. के नियंत्रण में गर्भनिरोधक इंजेक्शन देने के लिए जिम्मेदार स्थानीय क्लीनिक स्थापित किए गए थे। एक मामले में विशेष रूप से, हाई-स्कूल की लड़कियों के एक समूह को उनकी जानकारी के बिना गर्भनिरोधक का इंजेक्शन दिया गया था। जन्म नियंत्रण के अन्य रूपों में उन महिलाओं के नवजात बच्चों को मारना शामिल था, जिन पर फ्रेटिलिन से जुड़े होने का संदेह था। इंडोनेशियाई अधिकारियों द्वारा पूछताछ के दौरान महिलाओं को व्यवस्थित यौन गुलामी, जबरन नसबंदी, जबरन विवाह, यातना और गैर-न्यायिक निष्पादन का सामना करने के अलावा बलात्कार और यौन शोषण का भी सामना करना पड़ा। इन महिलाओं में प्रतिरोध सदस्यों की पत्नियां, प्रतिरोध कार्यकर्ता और संदिग्ध फ्रेटिलिन सहयोगी शामिल थे। अक्सर, महिलाओं को निशाना बनाया जाता था और छद्म हिंसा के रूप में यातना दी जाती थी जब पुरुष रिश्तेदार, जिन पर फ्रेटिलिन होने का संदेह था, मौजूद नहीं होते थे। 1999 में शोधकर्ता रेबेका विंटर्स ने पुस्तक बुइबेरः वॉयस ऑफ ईस्ट तिमोरीस विमेन का विमोचन किया, जो कब्जे के शुरुआती दिनों की हिंसा और दुर्व्यवहार की कई व्यक्तिगत कहानियों का वर्णन करती है। एक महिला बताती है कि उससे पूछताछ की जा रही है जबकि उसके कपड़े अधूरे हैं, उसे प्रताड़ित किया जा रहा है, छेड़छाड़ की जा रही है और जान से मारने की धमकी दी जा रही है। एक अन्य ने हाथों और पैरों में जंजीरों से बंधे होने, बार-बार बलात्कार किए जाने और हफ्तों तक पूछताछ किए जाने का वर्णन किया है। एक महिला जिसने फ्रेटिलिन गुरिल्लाओं के लिए भोजन तैयार किया था, उसे गिरफ्तार कर लिया गया, सिगरेट से जला दिया गया, बिजली से प्रताड़ित किया गया और सैनिकों की एक पंक्ति को मूत्र और मल से भरे टैंक में नग्न होकर चलने के लिए मजबूर किया गया। कब्ज़े के दौरान, इंडोनेशियाई सैनिकों के साथ-साथ राज्य और धार्मिक संगठनों द्वारा लगभग 4,000 बच्चों को जबरन उनके परिवारों से हटा दिया गया था। हालाँकि कुछ लोगों के साथ अच्छा व्यवहार किया गया था, लेकिन अन्य लोगों के साथ यौन शोषण सहित विभिन्न प्रकार के दुर्व्यवहार किए गए थे। कुछ को इस्लाम में परिवर्तित कर दिया गया। इन बच्चों का अपहरण करने वाले कई सैनिक अभी भी इंडोनेशियाई सेना में वरिष्ठ पदों पर हैं। ऑपरेशन केमैननः 1981 में इंडोनेशियाई सेना ने ऑपरेशन केमैनन (ऑपरेशन सुरक्षा) शुरू किया, जिसे कुछ लोगों ने "पैरों की बाड़" कार्यक्रम नाम दिया है। इस ऑपरेशन के दौरान, इंडोनेशियाई बलों ने 50,000 से 80,000 तिमोरियों के पुरुषों और लड़कों को पहाड़ों के माध्यम से आगे बढ़ने के लिए टीएनआई सैनिकों को मानव ढाल के रूप में एक फ्रेटिलिन जवाबी हमले को रोकने के लिए भर्ती किया। इसका उद्देश्य गुरिल्लाओं को उस क्षेत्र के मध्य भाग में घुसाना था जहाँ उनका सफाया किया जा सके। "पैरों की बाड़" में भर्ती किए गए कई लोगों की भूख, थकावट से मृत्यु हो गई या गुरिल्लाओं को फिसलने देने के लिए इंडोनेशियाई बलों द्वारा गोली मार दी गई। जैसे ही "बाड़" गाँवों में एकत्र हुई, इंडोनेशियाई बलों ने अज्ञात संख्या में नागरिकों का नरसंहार किया। सितंबर 1981 में इंडोनेशियाई सेना की बटालियन 744 द्वारा लाकलुटा में कम से कम 400 ग्रामीणों का नरसंहार किया गया था। ऑस्ट्रेलियाई सीनेट के सामने गवाही देने वाले एक प्रत्यक्षदर्शी ने कहा कि सैनिकों ने जानबूझकर छोटे बच्चों को एक चट्टान से सिर तोड़कर मार डाला। ऑपरेशन प्रतिरोध को कुचलने में विफल रहा, और कब्जे के प्रति व्यापक आक्रोश पहले से कहीं अधिक मजबूत हो गया। जैसे ही पहाड़ों में फ्रेटिलिन सैनिकों ने अपने छिटपुट हमले जारी रखे, इंडोनेशियाई बलों ने अगले दस वर्षों में उन्हें नष्ट करने के लिए कई अभियान चलाए। इस बीच, शहरों और गाँवों में एक अहिंसक प्रतिरोध आंदोलन आकार लेने लगा। 'ऑपरेशन क्लीन-स्वीप': 1983 लगातार इंडोनेशियाई विद्रोह विरोधी अभियानों की विफलता ने इंडोनेशियाई सैन्य अभिजात वर्ग को मार्च 1983 में एक फ्रेटिलिन-नियंत्रित क्षेत्र में फ्रेटिलिन कमांडर ज़ानाना गुस्माओ के साथ शांति वार्ता शुरू करने के लिए दिली स्थित उप क्षेत्रीय सैन्य रिज़ॉर्ट कमान के कमांडर, कर्नल पुरवांतो को निर्देश देने के लिए प्रेरित किया। जब ज़ानाना ने वार्ता में पुर्तगाल और संयुक्त राष्ट्र का आह्वान करने की मांग की, तो ए. बी. आर. आई. कमांडर बेनी मोर्दानी ने अगस्त 1983 में "ऑपरेशनल क्लीन-स्वीप" नामक एक नए विद्रोह विरोधी हमले की घोषणा करते हुए युद्धविराम तोड़ दिया, "इस बार कोई मूर्खता नहीं है। इस बार हम उन्हें बिना किसी दया के मारने जा रहे हैं। युद्धविराम समझौते के टूटने के बाद इंडोनेशियाई बलों के हाथों नरसंहार, संक्षिप्त निष्पादन और "गायब" होने की एक नई लहर आई। अगस्त 1983 में, क्रेरास गाँव में 200 लोगों को जिंदा जला दिया गया था, और 500 अन्य लोग पास की नदी में मारे गए थे। अगस्त और दिसंबर 1983 के बीच, एमनेस्टी इंटरनेशनल ने अकेले राजधानी शहर में 600 से अधिक लोगों की गिरफ्तारी और "गायब होने" का दस्तावेजीकरण किया। इंडोनेशियाई बलों ने रिश्तेदारों को बताया कि "लापता" लोगों को बाली भेज दिया गया था। एकीकरण का विरोध करने के संदेह में लोगों को अक्सर गिरफ्तार किया जाता था और प्रताड़ित किया जाता था। 1983 में एमनेस्टी इंटरनेशनल ने पूर्वी तिमोर से प्राप्त एक इंडोनेशियाई मैनुअल प्रकाशित किया था जिसमें सैन्य कर्मियों को शारीरिक और मानसिक पीड़ा देने का निर्देश दिया गया था, और सैनिकों को आगाह किया गया था कि "यातना (किसी को बिजली के झटके दिए जाने, निर्वस्त्र किए जाने आदि) दिखाने वाली तस्वीरें लेने से बचें।" अपने 1997 के संस्मरण ईस्ट तिमोर के अनफिनिश्ड स्ट्रगलः इनसाइड द तिमोरिस रेसिस्टेंस में, कॉन्स्टेंसिओ पिंटो ने इंडोनेशियाई सैनिकों द्वारा प्रताड़ित किए जाने का वर्णन किया हैः "प्रत्येक प्रश्न के साथ, मुझे चेहरे पर दो या तीन घूंसे मिलते थे। जब कोई आपको इतना और इतनी जोर से घूंसा मारता है, तो ऐसा लगता है जैसे आपका चेहरा टूट गया है। लोगों ने मेरी पीठ और बगल में अपने हाथों से मारा और फिर मुझे लात मारी। [दूसरी जगह पर] उन्होंने मुझे मनोवैज्ञानिक रूप से प्रताड़ित किया; उन्होंने मुझे नहीं मारा, लेकिन उन्होंने मुझे जान से मारने की कड़ी धमकी दी। उन्होंने मेज पर बंदूक भी रख दी। मिशेल टर्नर की पुस्तक टेलिंग ईस्ट तिमोरः पर्सनल टेस्टिमनीज़ 1942-1992 में, फातिमा नाम की एक महिला ने दिली जेल में यातना को होते हुए देखने का वर्णन किया हैः "वे लोगों को अपने पैर की उंगलियों पर कुर्सी के सामने रखते हुए कुर्सी पर बैठाती हैं। यह पागल है, हाँ। सैनिक भोजन में पेशाब करते हैं और फिर उसे व्यक्ति के खाने के लिए मिलाते हैं। वे बिजली के झटके का उपयोग करते हैं और वे एक बिजली की मशीन का उपयोग करते हैं। "फ्रैटिलिन द्वारा दुर्व्यवहार इंडोनेशियाई सरकार ने 1977 में बताया कि फ्रैटिलिन द्वारा मारे गए लोगों की" बड़ी संख्या "वाली कई सामूहिक कब्रें एलियू और सामे के पास पाई गई थीं। एमनेस्टी इंटरनेशनल ने 1985 में इन रिपोर्टों की पुष्टि की, और कई गैर-न्यायिक हत्याओं के बारे में भी चिंता व्यक्त की, जिनके लिए फ्रेटिलिन ने जिम्मेदारी ली थी। 1997 में ह्यूमन राइट्स वॉच ने फ्रेटिलिन द्वारा किए गए हमलों की एक श्रृंखला की निंदा की, जिसके कारण नौ नागरिकों की मौत हो गई। जनसांख्यिकी और अर्थव्यवस्था पूर्वी तिमोर में पुर्तगाली भाषा पर प्रतिबंध लगा दिया गया था और इंडोनेशियाई को सरकारी, शिक्षा और सार्वजनिक वाणिज्य की भाषा बना दिया गया था और इंडोनेशियाई स्कूल पाठ्यक्रम लागू किया गया था। आधिकारिक इंडोनेशियाई राष्ट्रीय विचारधारा, पंचासिला, पूर्वी तिमोर पर लागू की गई थी और सरकारी नौकरियां पंचासिला प्रशिक्षण में प्रमाणन रखने वालों तक ही सीमित थीं। पूर्वी तिमोर की जीववादी विश्वास प्रणालियाँ इंडोनेशिया के संवैधानिक एकेश्वरवाद के साथ मेल नहीं खाती थीं, जिसके परिणामस्वरूप बड़े पैमाने पर ईसाई धर्म में धर्मांतरण हुआ। पुर्तगाली पादरियों को इंडोनेशियाई पादरियों के साथ बदल दिया गया, और लैटिन और पुर्तगाली जनसमूह को इंडोनेशियाई जनसमूह द्वारा प्रतिस्थापित किया गया। आक्रमण से पहले, केवल 20 प्रतिशत पूर्वी तिमोर के लोग रोमन कैथोलिक थे, और 1980 के दशक तक, 95 प्रतिशत कैथोलिक के रूप में पंजीकृत थे। 90 प्रतिशत से अधिक कैथोलिक आबादी के साथ, पूर्वी तिमोर वर्तमान में दुनिया के सबसे घनी कैथोलिक देशों में से एक है। पूर्वी तिमोर इंडोनेशियाई सरकार के प्रवास कार्यक्रम के लिए एक विशेष केंद्र था, जिसका उद्देश्य इंडोनेशियाई लोगों को घनी आबादी वाले क्षेत्रों से कम आबादी वाले क्षेत्रों में बसाना था। "न्यू ऑर्डर" के तहत मीडिया सेंसरशिप का मतलब था कि पूर्वी तिमोर में संघर्ष की स्थिति प्रवासियों, मुख्य रूप से गरीब जावानी और बाली के गीले-चावल किसानों के लिए अज्ञात थी। आगमन पर, उन्होंने खुद को पूर्वी तिमोर के प्रतिरोध सेनानियों द्वारा हमले के चल रहे खतरे के तहत पाया, और स्थानीय आक्रोश का विषय बन गए, क्योंकि पूर्वी तिमोर से संबंधित भूमि के बड़े हिस्से को इंडोनेशियाई सरकार द्वारा अनिवार्य रूप से प्रवासी निपटान के लिए विनियोजित किया गया था। हालाँकि कई लोगों ने हार मान ली और अपने मूल द्वीप पर लौट आए, लेकिन पूर्वी तिमोर में रहने वाले प्रवासियों ने पूर्वी तिमोर के एकीकरण के "इंडोनेशियाईकरण" में योगदान दिया। 662 प्रवासी परिवार (2,208 लोग) 1993 में पूर्वी तिमोर में बस गए, जबकि 1990 के दशक के मध्य तक अनुमानित 150,000 स्वतंत्र इंडोनेशियाई बसने वाले पूर्वी तिमोर में रहते थे, जिनमें शिक्षा और प्रशासन में नौकरी की पेशकश करने वाले लोग भी शामिल थे। प्रवास ने तिमोरियों के बीच नाराजगी बढ़ा दी, जो अधिक व्यापार प्रेमी प्रवासियों से आगे निकल गए। आक्रमण के बाद, पुर्तगाली वाणिज्यिक हितों पर इंडोनेशियाई लोगों ने कब्जा कर लिया। पश्चिम तिमोर के साथ सीमा खोली गई जिसके परिणामस्वरूप पश्चिम तिमोर के किसानों की आमद हुई और जनवरी 1989 में यह क्षेत्र निजी निवेश के लिए खुला था। शहरों में आर्थिक जीवन को बाद में दक्षिण सुलावेसी से उद्यमी बुगिस, मकासरी और बुटोनी आप्रवासियों के नियंत्रण में लाया गया, जबकि पूर्वी तिमोर के उत्पादों को सेना के अधिकारियों और इंडोनेशियाई व्यापारियों के बीच साझेदारी के तहत निर्यात किया गया। डेनोक, एक सैन्य-नियंत्रित फर्म, ने पूर्वी तिमोर की कुछ सबसे आकर्षक वाणिज्यिक गतिविधियों पर एकाधिकार कर लिया, जिसमें चंदन की लकड़ी का निर्यात, होटल और उपभोक्ता उत्पादों का आयात शामिल था। हालाँकि, समूह का सबसे अधिक लाभदायक व्यवसाय कॉफी के निर्यात पर इसका एकाधिकार था, जो इस क्षेत्र की सबसे मूल्यवान नकदी फसल थी। इंडोनेशियाई उद्यमी गैर-डेनोक/सैन्य उद्यमों पर हावी हो गए, और पुर्तगाली काल से स्थानीय निर्माताओं ने इंडोनेशियाई आयात के लिए रास्ता बनाया। अपनी नीतियों की आलोचना के लिए इंडोनेशियाई सरकार की प्राथमिक प्रतिक्रिया पूर्वी तिमोर के स्वास्थ्य, शिक्षा, संचार, परिवहन और कृषि में विकास के अपने वित्तपोषण को उजागर करना था। हालाँकि, सदियों की पुर्तगाली औपनिवेशिक उपेक्षा के बाद पूर्वी तिमोर गरीब बना रहा और इंडोनेशियाई आलोचक जॉर्ज अदितजोंड्रो बताते हैं कि कब्जे के शुरुआती वर्षों में संघर्ष के कारण चावल और कॉफी उत्पादन और पशुधन की आबादी में तेज गिरावट आई है। अन्य आलोचकों का तर्क है कि सड़क निर्माण जैसे बुनियादी ढांचे के विकास को अक्सर इंडोनेशियाई सैन्य और कॉर्पोरेट हितों को सुविधाजनक बनाने के लिए डिज़ाइन किया गया है। जबकि सेना प्रमुख व्यवसायों को नियंत्रित करती थी, निजी निवेशक, इंडोनेशियाई और अंतर्राष्ट्रीय दोनों, इस क्षेत्र से बचते थे। 1976 के बाद से सुधार के बावजूद, 1993 की इंडोनेशियाई सरकार की एक रिपोर्ट में अनुमान लगाया गया था कि पूर्वी तिमोर के 61 जिलों में से तीन-चौथाई में आधे से अधिक लोग गरीबी में जी रहे थे। 1990 के दशक के बदलते प्रतिरोध और एकीकरण अभियान 1975 के बाद से पूर्वी तिमोर के बुनियादी ढांचे, स्वास्थ्य और शिक्षा सुविधाओं में सुधार के लिए इंडोनेशियाई सरकार द्वारा किए गए प्रमुख निवेश ने इंडोनेशियाई शासन के प्रति पूर्वी तिमोर के प्रतिरोध को समाप्त नहीं किया। हालांकि 1980 के दशक तक फ्रेटिलिन की सेना कुछ सौ सशस्त्र पुरुषों तक गिर गई थी, लेकिन फ्रेटिलिन ने युवा तिमोरियों के साथ अपने संपर्क बढ़ा दिए, विशेष रूप से दिली में, और आत्मनिर्णय की मांग करने वाले एक निहत्थे नागरिक प्रतिरोध ने आकार ले लिया। विरोध आंदोलनों में शामिल कई लोग आक्रमण के समय छोटे बच्चे थे और उन्हें इंडोनेशियाई प्रणाली के तहत शिक्षित किया गया था। वे तिमोर के सांस्कृतिक और राजनीतिक जीवन के दमन और प्रतिस्थापन से नाराज थे, इंडोनेशियाई आर्थिक विकास के प्रति दुविधा में थे, और अपनी पुर्तगाली विरासत पर जोर देते हुए आपस में पुर्तगाली बोलते थे। आत्मनिर्णय के लिए पुर्तगाल से मदद मांगते हुए, वे इंडोनेशिया को एक कब्जा करने वाली ताकत मानते थे। विदेश में, फ्रेटिलिन के सदस्यों-विशेष रूप से पूर्व पत्रकार जोस रामोस-होर्टा (बाद में प्रधानमंत्री और राष्ट्रपति बने)-ने राजनयिक मंचों पर अपने मुद्दे को आगे बढ़ाया। कम सशस्त्र प्रतिरोध ने 1988 में इंडोनेशियाई सरकार को अपनी वाणिज्यिक संभावनाओं में सुधार के लिए पूर्वी तिमोर को खोलने के लिए प्रेरित किया, जिसमें पत्रकारों पर यात्रा प्रतिबंध को हटाना भी शामिल था। नई नीति विदेश मंत्री अली अलातास की ओर से आई थी। अलातास और अन्य राजनयिकों ने सैन्य नेतृत्व के बीच चिंताओं के बावजूद अंतरराष्ट्रीय चिंताओं की प्रतिक्रिया के रूप में नीति के पक्ष में सुहार्तो को प्रभावित किया कि इससे नियंत्रण खो जाएगा। 1989 के अंत में, कट्टरपंथी सैन्य कमांडर ब्रिगेडियर जनरल मुल्यादी को ब्रिगेडियर जनरल रुडोल्फ वारौ द्वारा प्रतिस्थापित किया गया, जिन्होंने एकीकरण-विरोधी लोगों के लिए एक अधिक "प्रेरक" दृष्टिकोण का वादा किया। क्षेत्र के भीतर यात्रा पर प्रतिबंध कम कर दिए गए, राजनीतिक कैदियों के समूहों को रिहा कर दिया गया और पूछताछ में यातना का उपयोग कम हो गया। वारौव ने सैन्य अनुशासन बढ़ाने का प्रयास किया; फरवरी 1990 में एक इंडोनेशियाई सैनिक पर पूर्वी तिमोर में गैरकानूनी आचरण के लिए मुकदमा चलाया गया, जो आक्रमण के बाद पहली ऐसी कार्रवाई थी। उत्पीड़न के कम डर ने प्रतिरोध आंदोलनों को प्रोत्साहित किया; एकीकरण विरोधी विरोध प्रदर्शनों के साथ 1989 में पोप जॉन पॉल द्वितीय सहित पूर्वी तिमोर की हाई-प्रोफाइल यात्राएं हुईं। इसके अतिरिक्त, शीत युद्ध की समाप्ति ने इंडोनेशिया के कब्जे के पश्चिमी समर्थन के अधिकांश औचित्य को हटा दिया। आत्मनिर्णय और मानवाधिकारों पर अंतर्राष्ट्रीय ध्यान में वृद्धि ने इंडोनेशिया पर और दबाव डाला। 1990 के दशक में पूर्वी तिमोर के भीतर बाद की घटनाओं ने पूर्वी तिमोर के अंतर्राष्ट्रीय प्रोफाइल को नाटकीय रूप से बढ़ाने में मदद की, जिसने बदले में प्रतिरोध समूहों की गति को काफी बढ़ा दिया। सांता क्रूज़ नरसंहार 12 नवंबर 1991 को इंडोनेशियाई सैनिकों द्वारा गोली मारे गए स्वतंत्रता समर्थक युवाओं के लिए एक स्मारक समूह के दौरान, 2,500-मजबूत भीड़ के बीच प्रदर्शनकारियों ने स्वतंत्रता समर्थक नारों के साथ फ्रेटिलिन झंडा और बैनर फहराए और जोरदार लेकिन शांतिपूर्ण तरीके से नारे लगाए। इंडोनेशियाई सैनिकों और प्रदर्शनकारियों के बीच एक संक्षिप्त टकराव के बाद, 200 इंडोनेशियाई सैनिकों ने भीड़ पर गोलीबारी की जिसमें कम से कम 250 तिमोरियों की मौत हो गई। कब्रिस्तान में विदेशियों की गवाही की सूचना तुरंत अंतर्राष्ट्रीय समाचार संगठनों को दी गई, और नरसंहार के वीडियो फुटेज को अंतरराष्ट्रीय स्तर पर व्यापक रूप से प्रसारित किया गया, जिससे आक्रोश पैदा हुआ। नरसंहार के जवाब में, दुनिया भर के कार्यकर्ताओं ने पूर्वी तिमोरियों के साथ एकजुटता में संगठित किया, और आत्मनिर्णय के लिए एक नई तात्कालिकता लाई गई। इंडोनेशिया में लोकतंत्र की वकालत करने के लिए 1973 में गठित एक ब्रिटिश संगठन टी. ए. पी. ओ. एल. ने पूर्वी तिमोर के आसपास अपना काम बढ़ाया। संयुक्त राज्य अमेरिका में, ईस्ट तिमोर एक्शन नेटवर्क (अब ईस्ट तिमोर और इंडोनेशिया एक्शन नेटवर्क) की स्थापना की गई थी और जल्द ही देश भर के दस शहरों में इसकी शाखाएँ थीं। पुर्तगाल, ऑस्ट्रेलिया, जापान, जर्मनी, मलेशिया, आयरलैंड और ब्राजील में अन्य एकजुटता समूह दिखाई दिए। नरसंहार का कवरेज इस बात का एक ज्वलंत उदाहरण था कि कैसे इंडोनेशिया में नए मीडिया के विकास ने "न्यू ऑर्डर" के लिए इंडोनेशिया के अंदर और बाहर सूचना प्रवाह को नियंत्रित करना मुश्किल बना दिया था, और यह कि शीत युद्ध 1990 के दशक के बाद, सरकार बढ़ती अंतर्राष्ट्रीय जांच के दायरे में आ रही थी। कई लोकतंत्र समर्थक छात्र समूहों और उनकी पत्रिकाओं ने न केवल पूर्वी तिमोर, बल्कि "नई व्यवस्था" और इंडोनेशिया के व्यापक इतिहास और भविष्य पर भी खुले तौर पर और आलोचनात्मक रूप से चर्चा करना शुरू कर दिया। सेना की तीखी निंदा न केवल अंतर्राष्ट्रीय समुदाय से हुई, बल्कि इंडोनेशियाई अभिजात वर्ग के कुछ हिस्सों से भी हुई। इस नरसंहार ने 1989 में सरकार द्वारा क्षेत्र को खोलने को समाप्त कर दिया और दमन का एक नया दौर शुरू हुआ। वारौव को उनके पद से हटा दिया गया था और तिमोर के प्रतिरोध के प्रति उनके अधिक मिलनसार दृष्टिकोण को उनके वरिष्ठों ने फटकार लगाई थी। संदिग्ध फ्रेटिलिन सहानुभूति रखने वालों को गिरफ्तार कर लिया गया, मानवाधिकारों का हनन बढ़ गया और विदेशी पत्रकारों पर फिर से प्रतिबंध लगा दिया गया। इंडोनेशियाई सैन्य उपस्थिति के तिमोरियों के बीच नफरत बढ़ गई। मेजर जनरल प्रबोवो, कोपासस समूह 3 ने शेष प्रतिरोध को कुचलने के लिए काले हुड पहने मिलिशिया गिरोहों को प्रशिक्षित किया। 20 नवंबर 1992 को, फ्रेटिलिन नेता ज़ानाना गुस्माओ को इंडोनेशियाई सैनिकों द्वारा गिरफ्तार कर लिया गया था। मई 1993 में उन्हें "विद्रोह" के लिए आजीवन कारावास की सजा सुनाई गई थी, लेकिन बाद में उनकी सजा को 20 साल में बदल दिया गया था। प्रतिरोध के सार्वभौमिक रूप से मान्यता प्राप्त नेता की गिरफ्तारी पूर्वी तिमोर में एकीकरण विरोधी आंदोलन के लिए एक बड़ी निराशा थी, लेकिन गुस्माओ ने सिपिनांग जेल के अंदर से आशा के प्रतीक के रूप में काम करना जारी रखा। इस बीच, पूर्वी तिमोरियों द्वारा अहिंसक प्रतिरोध ने खुद को दिखाना जारी रखा। जब राष्ट्रपति बिल क्लिंटन ने 1994 में जकार्ता का दौरा किया, तो उनतीस पूर्वी तिमोर के छात्रों ने इंडोनेशिया के लिए अमेरिकी समर्थन का विरोध करने के लिए अमेरिकी दूतावास पर कब्जा कर लिया। उसी समय, मानवाधिकार पर्यवेक्षकों ने इंडोनेशियाई सैनिकों और पुलिस द्वारा निरंतर उल्लंघन की ओर ध्यान आकर्षित किया। ह्यूमन राइट्स वॉच की 1995 की एक रिपोर्ट में कहा गया है कि "क्षेत्र में दुर्व्यवहार लगातार बढ़ रहे हैं", जिसमें यातना, गुमशुदगी और मौलिक अधिकारों पर सीमाएं शामिल हैं। सितंबर और अक्टूबर 1995 में दंगों की एक श्रृंखला के बाद, एमनेस्टी इंटरनेशनल ने मनमाने ढंग से गिरफ्तारी और यातना के लिए इंडोनेशियाई अधिकारियों की आलोचना की। रिपोर्ट से संकेत मिलता है कि बंदियों को लोहे की छड़ से पीटा गया, लात मारी गई, घाव किए गए और जान से मारने की धमकी दी गई। 1996 में पूर्वी तिमोर को अचानक दुनिया के ध्यान में लाया गया जब बिशप कार्लोस फिलिप ज़िमेनेस बेलो और जोस रामोस-होर्टा को "पूर्वी तिमोर में संघर्ष के न्यायपूर्ण और शांतिपूर्ण समाधान की दिशा में उनके काम के लिए" नोबेल शांति पुरस्कार से सम्मानित किया गया। नोबेल समिति ने अपनी प्रेस विज्ञप्ति में संकेत दिया कि उसे उम्मीद है कि यह पुरस्कार "लोगों के आत्मनिर्णय के अधिकार के आधार पर पूर्वी तिमोर में संघर्ष का राजनयिक समाधान खोजने के प्रयासों को बढ़ावा देगा।" जैसा कि नोबेल विद्वान इरविन अब्राम्स ने नोट कियाः इंडोनेशिया और पुर्तगाल के राजनयिकों ने, इस बीच, 1982 के महासभा के प्रस्ताव द्वारा आवश्यक परामर्श जारी रखा, बैठकों की एक श्रृंखला में, जिसे विदेश मंत्री अली अलातास ने "इंडोनेशियाई जूते में कंकड़" कहा था, की समस्या को हल करने के उद्देश्य से। इंडोनेशिया और पुर्तगाल के बीच इंडोनेशियाई नियंत्रण का अंत नवीनीकृत संयुक्त राष्ट्र-मध्यस्थता प्रयास 1997 की शुरुआत में शुरू हुए। इंडोनेशिया में संक्रमण पूर्वी तिमोर के लिए स्वतंत्रता, या यहां तक कि सीमित क्षेत्रीय स्वायत्तता, सुहार्तो के नए आदेश के तहत कभी भी अनुमति नहीं दी जाने वाली थी। 1990 के दशक में इंडोनेशियाई जनमत के बावजूद कभी-कभी तिमोरियों की स्थिति की अपमानजनक सराहना करते हुए, यह व्यापक रूप से आशंका थी कि एक स्वतंत्र पूर्वी तिमोर इंडोनेशियाई एकता को अस्थिर कर देगा। हालाँकि, 1997 के एशियाई वित्तीय संकट ने इंडोनेशिया में जबरदस्त उथल-पुथल मचाई और मई 1998 में सुहार्तो के इस्तीफे का कारण बना, जिससे उनकी तीस साल की अध्यक्षता समाप्त हो गई। प्रबोवो, तब तक शक्तिशाली इंडोनेशियाई सामरिक रिजर्व की कमान संभाल रहे थे, जॉर्डन में निर्वासन में चले गए और पूर्वी तिमोर में सैन्य अभियानों से दिवालिया इंडोनेशियाई सरकार को एक दिन में दस लाख डॉलर का नुकसान हो रहा था। सापेक्ष राजनीतिक खुलेपन और संक्रमण की बाद की "सुधारवादी" अवधि में पूर्वी तिमोर के साथ इंडोनेशिया के संबंधों के बारे में एक अभूतपूर्व बहस शामिल थी। 1998 के शेष समय के लिए, एक जनमत संग्रह की दिशा में काम करते हुए पूरे दिली में चर्चा मंच हुए। विदेश मंत्री अलाटास ने संभावित स्वतंत्रता के लिए चरणबद्ध स्वायत्तता की योजनाओं को इंडोनेशिया के लिए "सभी दर्द, कोई लाभ नहीं" के रूप में वर्णित किया। 8 जून 1998 को, पदभार ग्रहण करने के तीन सप्ताह बाद, सुहार्तो के उत्तराधिकारी बी. जे. हबीबी ने घोषणा की कि इंडोनेशिया जल्द ही पूर्वी तिमोर को स्वायत्तता के लिए एक विशेष योजना की पेशकश करेगा। 1998 के अंत में, जॉन हॉवर्ड की ऑस्ट्रेलियाई सरकार ने इंडोनेशिया को एक पत्र का मसौदा तैयार किया जिसमें ऑस्ट्रेलियाई नीति में बदलाव की सलाह दी गई और एक दशक के भीतर स्वतंत्रता पर जनमत संग्रह कराने की वकालत की गई। राष्ट्रपति हबीबी ने इस तरह की व्यवस्था को इंडोनेशिया द्वारा "औपनिवेशिक शासन" के रूप में देखा, और उन्होंने इस मुद्दे पर एक त्वरित जनमत संग्रह बुलाने का फैसला किया। इंडोनेशिया और पुर्तगाल ने 5 मई 1999 को घोषणा की कि वे पूर्वी तिमोर के लोगों को स्वायत्तता योजना या स्वतंत्रता के बीच चयन करने की अनुमति देने के लिए एक मतदान आयोजित करने पर सहमत हुए हैं। पूर्वी तिमोर में संयुक्त राष्ट्र मिशन (यूएनएएमईटी) द्वारा प्रशासित होने वाला मतदान शुरू में 8 अगस्त के लिए निर्धारित किया गया था, लेकिन बाद में 30 अगस्त तक के लिए स्थगित कर दिया गया। इंडोनेशिया ने भी सुरक्षा की जिम्मेदारी ली; इस व्यवस्था ने पूर्वी तिमोर में चिंता पैदा कर दी, लेकिन कई पर्यवेक्षकों का मानना है कि इंडोनेशिया ने मतदान के दौरान विदेशी शांति सैनिकों को अनुमति देने से इनकार कर दिया होगा। 1999 जनमत संग्रह जैसे ही स्वायत्तता और स्वतंत्रता का समर्थन करने वाले समूहों ने अभियान शुरू किया, पूर्वी तिमोर के एकीकरण समर्थक अर्धसैनिक समूहों की एक श्रृंखला ने देश भर में हिंसा की धमकी देना शुरू कर दिया-और वास्तव में हिंसा करना शुरू कर दिया। यूएनएएमईटी की ओर से स्वतंत्रता समर्थक पूर्वाग्रह का आरोप लगाते हुए, समूहों को इंडोनेशियाई सैनिकों के साथ काम करते और उनसे प्रशिक्षण प्राप्त करते देखा गया। मई समझौते की घोषणा से पहले, लिकिका में अप्रैल के एक अर्धसैनिक हमले में पूर्वी तिमोर के दर्जनों लोग मारे गए थे। 16 मई 1999 को, इंडोनेशियाई सैनिकों के साथ एक गिरोह ने अटारा गाँव में संदिग्ध स्वतंत्रता कार्यकर्ताओं पर हमला किया; जून में एक अन्य समूह ने मालियाना में एक यूएनएएमईटी कार्यालय पर हमला किया। इंडोनेशियाई अधिकारियों ने पूर्वी तिमोरियों के बीच प्रतिद्वंद्वी गुटों के बीच हिंसा को रोकने में असहाय होने का दावा किया, लेकिन रामोस-होर्टा इस तरह की धारणाओं का उपहास करने में कई अन्य लोगों के साथ शामिल हो गए। फरवरी 1999 में उन्होंने कहाः "[इंडोनेशिया] के पीछे हटने से पहले यह बड़ी तबाही और अस्थिरता पैदा करना चाहता है, जैसा कि उसने हमेशा वादा किया है। हम लगातार तिमोर में इंडोनेशियाई सेना से वर्षों से यह सुन रहे हैं। जैसे ही मिलिशिया नेताओं ने "रक्तपात" की चेतावनी दी, इंडोनेशियाई "घुमक्कड़ राजदूत" फ्रांसिस्को लोप्स दा क्रूज़ ने घोषणा कीः "अगर लोग स्वायत्तता को अस्वीकार करते हैं तो पूर्वी तिमोर में रक्त बहने की संभावना है।" एक अर्धसैनिक बल ने घोषणा की कि स्वतंत्रता के लिए एक वोट के परिणामस्वरूप "आग का सागर" होगा, एक अभिव्यक्ति जो इंडोनेशिया के डच से स्वतंत्रता के युद्ध के दौरान आग के बांडुंग सागर का जिक्र करती है। जैसे-जैसे मतदान की तारीख नजदीक आती गई, स्वतंत्रता विरोधी हिंसा की खबरें लगातार बढ़ती गईं। मतदान का दिन, 30 अगस्त 1999, आम तौर पर शांत और व्यवस्थित था। पंजीकृत मतदाताओं के 98.6% ने मतदान किया और 4 सितंबर को संयुक्त राष्ट्र के महासचिव कोफी अन्नान ने घोषणा की कि 78.5% वोट स्वतंत्रता के लिए डाले गए थे। "न्यू ऑर्डर" के इस आग्रह पर कि पूर्वी तिमोरियों ने एकीकरण का समर्थन किया, इंडोनेशियाई या तो इस बात से हैरान थे या अविश्वास कर रहे थे कि पूर्वी तिमोरियों ने इंडोनेशिया का हिस्सा होने के खिलाफ मतदान किया था। कई लोगों ने मीडिया की खबरों को स्वीकार करते हुए पर्यवेक्षण करने वाले संयुक्त राष्ट्र और ऑस्ट्रेलिया को दोषी ठहराया, जिन्होंने हबीबी पर एक प्रस्ताव के लिए दबाव डाला था। परिणामों के कुछ ही घंटों के भीतर, अर्धसैनिक समूहों ने लोगों पर हमला करना और राजधानी दिली के आसपास आग लगाना शुरू कर दिया था। विदेशी पत्रकार और चुनाव पर्यवेक्षक भाग गए, और पूर्वी तिमोर के हजारों लोग पहाड़ों पर चले गए। इस्लामी गिरोहों ने दिली के कैथोलिक डायोसिस भवन पर हमला किया, जिसमें दो दर्जन लोग मारे गए; अगले दिन, आई. सी. आर. सी. के मुख्यालय पर हमला किया गया और उसे जला दिया गया। बाद में सुआई में लगभग सौ लोग मारे गए और पूर्वी तिमोर के आसपास से इसी तरह के नरसंहार की खबरें आईं। संयुक्त राष्ट्र ने अपने अधिकांश कर्मियों को वापस ले लिया, लेकिन दिली परिसर शरणार्थियों से भर गया था। संयुक्त राष्ट्र के चार कार्यकर्ताओं ने तब तक बाहर निकलने से इनकार कर दिया जब तक कि शरणार्थियों को भी वापस नहीं ले लिया गया, इस बात पर जोर देते हुए कि वे अर्धसैनिक समूहों के हाथों मर जाएंगे। उसी समय, इंडोनेशियाई सैनिकों और अर्धसैनिक गिरोहों ने 200,000 से अधिक लोगों को पश्चिम तिमोर में मजबूर किया, जिन्हें ह्यूमन राइट्स वॉच द्वारा "दयनीय परिस्थितियों" के रूप में वर्णित शिविरों में रखा गया था। जब संयुक्त राष्ट्र का एक प्रतिनिधिमंडल 8 सितंबर को जकार्ता पहुंचा, तो उन्हें इंडोनेशियाई राष्ट्रपति हबीबी ने बताया कि पूर्वी तिमोर में रक्तपात की खबरें "कल्पनाएँ" और "झूठ" थीं। इंडोनेशियाई सेना के जनरल विरांतो ने जोर देकर कहा कि उनके सैनिकों ने स्थिति को नियंत्रण में कर लिया है, और बाद में सैन्य पत्नियों के लिए एक कार्यक्रम में 1975 का हिट गीत "फीलिंग्स" गाकर पूर्वी तिमोर के लिए अपनी भावना व्यक्त की। इंडोनेशियाई वापसी और शांति सेना हिंसा को ऑस्ट्रेलिया, पुर्तगाल और अन्य जगहों पर व्यापक सार्वजनिक गुस्से का सामना करना पड़ा और पुर्तगाल, ऑस्ट्रेलिया, संयुक्त राज्य अमेरिका और अन्य देशों में कार्यकर्ताओं ने अपनी सरकारों पर कार्रवाई करने के लिए दबाव डाला। ऑस्ट्रेलियाई प्रधान मंत्री जॉन हॉवर्ड ने संयुक्त राष्ट्र के महासचिव कोफी अन्नान से परामर्श किया और हिंसा को समाप्त करने के लिए पूर्वी तिमोर में प्रवेश करने के लिए ऑस्ट्रेलियाई नेतृत्व वाले अंतर्राष्ट्रीय शांति रक्षक बल का समर्थन करने के लिए अमेरिकी राष्ट्रपति बिल क्लिंटन की पैरवी की। संयुक्त राज्य अमेरिका ने महत्वपूर्ण रसद और खुफिया संसाधनों और एक "अति-क्षितिज" निवारक उपस्थिति की पेशकश की, लेकिन अभियान के लिए बलों को प्रतिबद्ध नहीं किया। अंत में, 11 सितंबर को, क्लिंटन ने घोषणा कीः मैंने स्पष्ट कर दिया है कि अंतर्राष्ट्रीय समुदाय से भविष्य में आर्थिक सहायता का समर्थन करने की मेरी इच्छा इस बात पर निर्भर करेगी कि इंडोनेशिया आज से स्थिति को कैसे संभालता है। इंडोनेशिया, गंभीर आर्थिक संकट में, झुक गया। राष्ट्रपति बीजे हबीबी ने 12 सितंबर को घोषणा की कि इंडोनेशिया इंडोनेशियाई सैनिकों को वापस ले लेगा और ऑस्ट्रेलिया के नेतृत्व वाले अंतर्राष्ट्रीय शांति सेना को पूर्वी तिमोर में प्रवेश करने की अनुमति देगा। 15 सितंबर 1999 को, संयुक्त राष्ट्र सुरक्षा परिषद ने पूर्वी तिमोर में बिगड़ती स्थिति पर चिंता व्यक्त की और संयुक्त राष्ट्र सुरक्षा परिषद प्रस्ताव 1264 जारी किया जिसमें पूर्वी तिमोर में शांति और सुरक्षा बहाल करने के लिए एक बहुराष्ट्रीय बल का आह्वान किया गया, ताकि वहां संयुक्त राष्ट्र मिशन की रक्षा और समर्थन किया जा सके, और मानवीय सहायता अभियानों को तब तक सुविधाजनक बनाया जा सके जब तक कि संयुक्त राष्ट्र शांति सेना को क्षेत्र में अनुमोदित और तैनात नहीं किया जा सके। पूर्वी तिमोर के लिए अंतर्राष्ट्रीय बल, या इंटरफेट, ऑस्ट्रेलियाई मेजर जनरल पीटर कॉसग्रोव की कमान में, 20 सितंबर को दिली में प्रवेश किया और 31 अक्टूबर तक अंतिम इंडोनेशियाई सैनिकों ने पूर्वी तिमोर छोड़ दिया था। पूर्वी तिमोर में हजारों अंतर्राष्ट्रीय सैनिकों के आगमन के कारण मिलिशिया सीमा पार इंडोनेशिया में भाग गई, जहाँ से मिलिशिया द्वारा इंटरफेट बलों के खिलाफ छिटपुट सीमा पार छापे मारे गए। पूर्वी तिमोर में संयुक्त राष्ट्र संक्रमणकालीन प्रशासन (UNTAET) की स्थापना अक्टूबर के अंत में की गई थी और इस क्षेत्र को दो साल के लिए प्रशासित किया गया था। राष्ट्र का नियंत्रण पूर्वी तिमोर की सरकार को सौंप दिया गया और 20 मई 2002 को स्वतंत्रता की घोषणा की गई। उसी वर्ष 27 सितंबर को पूर्वी तिमोर संयुक्त राष्ट्र में अपने 191वें सदस्य राज्य के रूप में शामिल हुआ। इंटरफेट के सैन्य बलों का बड़ा हिस्सा ऑस्ट्रेलियाई था-अपने चरम पर 5,500 से अधिक सैनिक, एक पैदल सेना ब्रिगेड सहित, बख्तरबंद और विमानन समर्थन के साथ-जबकि अंततः, 22 देशों ने बल में योगदान दिया, जिसकी ऊंचाई पर 11,000 से अधिक सैनिक थे। संयुक्त राज्य अमेरिका ने पूरे संकट के दौरान महत्वपूर्ण रसद और राजनयिक सहायता प्रदान की। उसी समय, क्रूजर यूएसएस मोबाइल बे ने इंटरफेट नौसेना के बेड़े की रक्षा की और 1,000 पुरुषों की एक अमेरिकी समुद्री पैदल सेना बटालियन-साथ ही जैविक कवच और तोपखाने-को भी महत्वपूर्ण सशस्त्र विरोध की स्थिति में एक रणनीतिक रिजर्व प्रदान करने के लिए यूएसएस बेलेउ वुड पर तट पर तैनात किया गया था। अंतर्राष्ट्रीय प्रतिक्रिया इंडोनेशिया ने अपने पूर्वी तिमोर आक्रमण और कब्जे के लिए संयुक्त राज्य अमेरिका और ऑस्ट्रेलिया सहित पश्चिमी देशों के बीच समर्थन की अलग-अलग डिग्री हासिल करने के लिए साम्यवाद के डर का इस्तेमाल किया। पूर्वी तिमोर के स्वतंत्रता आंदोलन के आक्रमण और दमन ने इंडोनेशिया की प्रतिष्ठा और अंतर्राष्ट्रीय विश्वसनीयता को बहुत नुकसान पहुंचाया। विकासशील दुनिया की आलोचना ने 1980 के दशक में गुटनिरपेक्ष आंदोलन की कुर्सी हासिल करने के प्रयासों को कमजोर कर दिया, जिसे सुहार्तो इंडोनेशिया के लिए दृढ़ता से चाहते थे और इंडोनेशिया की निंदा 1990 के दशक तक जारी रही। सितंबर 1974 में, ऑस्ट्रेलियाई प्रधान मंत्री गफ व्हिटलम ने सुहार्तो से मुलाकात की और संकेत दिया कि अगर वह पूर्वी तिमोर पर कब्जा कर लेता है तो वह इंडोनेशिया का समर्थन करेगा। 11 नवंबर 1975 को व्हिटलम सरकार को बर्खास्त कर दिया गया। इसने फ्रेजर की कार्यवाहक सरकार पर प्रतिबंध लगा दिए। 13 दिसंबर के चुनाव के परिणाम ज्ञात होने तक, किसी भी कार्रवाई के लिए दोनों राजनीतिक दलों और गवर्नर-जनरल से अनुमोदन की आवश्यकता होती थी। 4 दिसंबर 1975 को ऑस्ट्रेलिया ने पूर्वी तिमोर की स्वतंत्रता निर्धारित करने के लिए संयुक्त राष्ट्र के प्रस्ताव की असफल मांग की, और ऑस्ट्रेलियाई सरकार ने ऑस्ट्रेलियाई और अन्य विदेशी नागरिकों को दिली से निकाला। जोस रामोस-होर्टा 5 दिसंबर को डार्विन पहुंचे और कहा कि सहायता एजेंसियों ऑस्ट्रेलियाई रेड क्रॉस और ऑस्ट्रेलियाई सोसाइटी फॉर इंटरकंट्री एड तिमोर (एएसआईएटी) को पूर्वी तिमोर से प्रतिबंधित कर दिया गया है। उसी समाचार सम्मेलन में, होर्टा ने कहा कि पूर्वी तिमोर में फ्रेटिलिन सरकार ऑस्ट्रेलिया सहित संयुक्त राष्ट्र की किसी भी सहायता को स्वीकार नहीं करेगी। दिसंबर के चुनाव जीतने के बाद, फ्रेजर सरकार ने यह दृष्टिकोण अपनाया कि दक्षिण पूर्व एशिया के साथ व्यापार और दक्षिण पूर्व एशिया के साथ राजनीतिक संबंधों को जोखिम में डालना बहुत महत्वपूर्ण था, जिसे एक खोए हुए कारण के रूप में देखा गया था। ऑस्ट्रेलिया ने 1976 और 1977 के संयुक्त राष्ट्र महासभा के प्रस्तावों से परहेज किया और 1978 तक पूर्वी तिमोर को आधिकारिक तौर पर इंडोनेशिया के एक प्रांत के रूप में मान्यता देने वाली एकमात्र सरकार बन गई। एक साल बाद, ऑस्ट्रेलिया और इंडोनेशिया ने तिमोर अंतराल में संसाधनों को साझा करने के लिए एक संधि का मसौदा तैयार करना शुरू किया। इस संधि पर दिसंबर 1989 में हस्ताक्षर किए गए थे, जिसमें एक से सात अरब बैरल तेल सुरक्षित होने का अनुमान लगाया गया था। इंडोनेशिया के साथ सामान्य आर्थिक साझेदारी के साथ इस समझौते को अक्सर ऑस्ट्रेलियाई सरकार की स्थिति के लिए एक महत्वपूर्ण कारक के रूप में उद्धृत किया जाता है। हालाँकि, यह देखते हुए कि प्रशांत युद्ध के दौरान जापानियों द्वारा तिमोर पर आक्रमण के बाद ऑस्ट्रेलियाई और जापानी सेनाओं के बीच लड़ाई के दौरान लगभग 60,000 पूर्वी तिमोरियों की मृत्यु हो गई थी, कुछ ऑस्ट्रेलियाई लोगों का मानना था कि उनकी सरकार पर पूर्व पुर्तगाली उपनिवेश का विशेष ऋण था। कब्ज़े से पहले और उसके दौरान ऑस्ट्रेलियाई संसद के एक वरिष्ठ विदेश मामलों के सलाहकार जेम्स डन ने सरकार की स्थिति की निंदा करते हुए बाद में कहाः "1941 में जो महत्वपूर्ण रणनीतिक मूल्य का था, वह 1974 में अप्रासंगिक और अक्षम था।" द्वितीय विश्व युद्ध के कुछ ऑस्ट्रेलियाई दिग्गजों ने इसी तरह के कारणों से कब्जे का विरोध किया। क्रमिक ऑस्ट्रेलियाई सरकारों ने इंडोनेशिया (ऑस्ट्रेलिया के सबसे बड़े पड़ोसी) में अच्छे संबंधों और स्थिरता को ऑस्ट्रेलिया के उत्तर में एक महत्वपूर्ण सुरक्षा बफर प्रदान करने के रूप में देखा, लेकिन पूर्वी तिमोर मुद्दे ने दोनों देशों के बीच सहयोग को जटिल बना दिया। ऑस्ट्रेलिया ने जोस रामोस-होर्टा जैसे पूर्वी तिमोर के स्वतंत्रता अधिवक्ताओं को महत्वपूर्ण अभयारण्य प्रदान किया, जो अपने निर्वासन के दौरान ऑस्ट्रेलिया में स्थित थे। इंडोनेशिया के साथ ऑस्ट्रेलिया का व्यापार 1980 के दशक के दौरान बढ़ा और कीटिंग लेबर सरकार ने 1995 में इंडोनेशिया के साथ एक सुरक्षा समझौते पर हस्ताक्षर किए और जकार्ता के साथ संबंधों को उच्च प्राथमिकता दी। इंडोनेशियाई राष्ट्रपति सुहार्तो के पतन और 1998 में हावर्ड सरकार द्वारा ऑस्ट्रेलियाई नीति में बदलाव ने पूर्वी तिमोर के लिए स्वतंत्रता के सवाल पर जनमत संग्रह के प्रस्ताव को आगे बढ़ाने में मदद की। 1998 के अंत में, प्रधान मंत्री जॉन हॉवर्ड और विदेश मंत्री अलेक्जेंडर डाउनर ने इंडोनेशिया को एक पत्र का मसौदा तैयार किया जिसमें ऑस्ट्रेलियाई नीति में बदलाव का सुझाव दिया गया था, जिसमें सुझाव दिया गया था कि पूर्वी तिमोर को एक दशक के भीतर स्वतंत्रता पर मतदान करने का मौका दिया जाए। इस पत्र ने इंडोनेशियाई राष्ट्रपति बी. जे. हबीबी को परेशान कर दिया, जिन्होंने इसे इंडोनेशिया को एक "औपनिवेशिक शक्ति" के रूप में देखा, और उन्होंने एक त्वरित जनमत संग्रह की घोषणा करने का फैसला किया। 1999 में आयोजित एक संयुक्त राष्ट्र-प्रायोजित जनमत संग्रह ने स्वतंत्रता के लिए भारी अनुमोदन दिखाया, लेकिन उसके बाद हिंसक झड़पें हुईं और स्वतंत्रता विरोधी मिलिशिया द्वारा सुरक्षा संकट को उकसाया गया। ऑस्ट्रेलिया ने तब हिंसा को समाप्त करने के लिए पूर्वी तिमोर के लिए संयुक्त राष्ट्र समर्थित अंतर्राष्ट्रीय बल का नेतृत्व किया और व्यवस्था बहाल की गई। हालांकि हस्तक्षेप अंततः सफल रहा, ऑस्ट्रेलियाई-इंडोनेशियाई संबंधों को ठीक होने में कई साल लगेंगे। ऑस्ट्रेलियाई लेबर पार्टी ने 1999 में अपनी पूर्वी तिमोर नीति को बदल दिया और अपने विदेश मामलों के प्रवक्ता लॉरी ब्रेरेटन के माध्यम से पूर्वी तिमोर की स्वतंत्रता और इंडोनेशियाई उपस्थिति के विरोध के लिए समर्थन की नीति अपनाई। ब्रेरेटन्स की विश्वसनीयता पर सत्तारूढ़ लिबरल-नेशनल कोएलिशन सरकार और उसके विदेश मामलों के मंत्री अलेक्जेंडर डाउनर और प्रधान मंत्री हावर्ड ने हमला किया था। उनके अभियान में तत्कालीन लेबर-बैकबेंचर केविन रुड (जो बाद में 2007 के ऑस्ट्रेलियाई संघीय चुनाव में लेबर पार्टी की जीत का नेतृत्व करेंगे) ने उनकी सहायता की थी। इंडोनेशिया के साथ अपने मजबूत संबंधों के कारण, फिलीपींस शुरू में इस मुद्दे पर ठंडा था। वास्तव में, इसने न केवल 1997 में जोस रामोस-होर्टा के प्रवेश को अस्वीकार कर दिया, जब उन्हें फिलीपींस दिलीमन विश्वविद्यालय में एक व्याख्यान देना था, तब राष्ट्रपति फिदेल वी. रामोस ने उन्हें आप्रवासन काली सूची में भी शामिल कर दिया था। हालाँकि, विभिन्न देशों के व्यापक समर्थन के साथ, फिलीपींस ने अंततः अपनी नीति बदल दी। तिमोर की स्वतंत्रता के बाद, फिलीपींस ने जमीनी सैनिकों के बजाय इंटरफेट में चिकित्सा और रसद कर्मियों का योगदान दिया। 2000 में, संयुक्त राष्ट्र ने एक फिलिपिनो, लेफ्टिनेंट जनरल जैमे डी लॉस सैंटोस को पूर्ण संयुक्त राष्ट्र इंटरफेट की कमान संभालने के लिए नामित किया। समान रोमन कैथोलिक विरासत को साझा करते हुए, फिलीपींस एक स्वाभाविक सहयोगी बन गया और तब से पूर्वी तिमोर के साथ एक अच्छे संबंध बनाए रखा है। इसने जोस रामोस-होर्टा को काली सूची से भी हटा दिया है; वह अक्सर फिलीपींस के विभिन्न विश्वविद्यालयों में व्याख्यान देते हैं, विशेष रूप से फिलीपींस दिलीमन विश्वविद्यालय, फिलीपींस के पॉलिटेक्निक विश्वविद्यालय, डी ला सैले विश्वविद्यालय और एटेनियो डी डेवाओ विश्वविद्यालय में। पुर्तगाल आक्रमण के अगले दिन, पुर्तगाल ने इंडोनेशिया के साथ राजनयिक संबंध तोड़ दिए और आक्रमण की निंदा करने वाले संयुक्त राष्ट्र के प्रस्तावों का समर्थन किया। हालाँकि, 1970 के दशक के अंत और 1980 के दशक की शुरुआत में, पुर्तगाली सरकार इस मुद्दे को आगे बढ़ाने के लिए अनिच्छुक दिखाई दी; अमेरिकी इंडोनेशिया विशेषज्ञ, बेनेडिक्ट एंडरसन का सुझाव है कि यह यूरोपीय समुदाय में इसके आवेदन पर उस समय की अनिश्चितता से उत्पन्न हुआ था। 1980 के दशक के मध्य से पुर्तगाल की आलोचना तेजी से बढ़ी, और सार्वजनिक दबाव के कारण, देश पूर्वी तिमोर के आत्मनिर्णय के लिए अंतर्राष्ट्रीय मंचों में सर्वोच्च प्रोफ़ाइल प्रचारकों में से एक बन गया। 1990 के दशक के दौरान, पुर्तगाल ने इंडोनेशिया के साथ संयुक्त राष्ट्र की मध्यस्थता में भाग लिया। संयुक्त राज्य अमेरिका 1975 में, संयुक्त राज्य अमेरिका वियतनाम से पीछे हटने का काम पूरा कर रहा था। एक कट्टर साम्यवाद विरोधी इंडोनेशिया को संयुक्त राज्य अमेरिका द्वारा एक आवश्यक प्रतिरोध माना जाता था, और पूर्वी तिमोर में एक उपनिवेशवाद प्रक्रिया की तुलना में इंडोनेशियाई सरकार के साथ मैत्रीपूर्ण संबंधों को अधिक महत्वपूर्ण माना जाता था। संयुक्त राज्य अमेरिका भारतीय और प्रशांत महासागरों के बीच अज्ञात पनडुब्बी मार्ग के लिए इंडोनेशिया से गुजरने वाले गहरे जल जलडमरूमध्य तक अपनी पहुंच बनाए रखना चाहता था। आक्रमण से एक दिन पहले, अमेरिकी राष्ट्रपति गेराल्ड आर. फोर्ड और अमेरिकी विदेश मंत्री हेनरी ए. किसिंजर ने इंडोनेशियाई राष्ट्रपति सुहार्तो से मुलाकात की और कथित तौर पर आक्रमण के लिए अपनी मंजूरी दे दी। सुहार्तो के इस कथन के जवाब में, "हम आपकी समझ चाहते हैं कि क्या [पूर्वी तिमोर में] त्वरित या कठोर कार्रवाई करना आवश्यक समझा गया था।" फोर्ड ने जवाब दिया, "हम समझेंगे और इस मुद्दे पर आप पर दबाव नहीं डालेंगे। हम समस्या और आपके इरादों को समझते हैं। किसिंजर इसी तरह सहमत हुए, हालांकि उन्हें डर था कि आक्रमण में U.S.-made हथियारों का उपयोग सार्वजनिक जांच के सामने आ जाएगा, "अमेरिका में प्रतिक्रिया को प्रभावित करने" की उनकी इच्छा के बारे में बात करते हुए ताकि "लोगों के अनधिकृत तरीके से बात करने की संभावना कम हो"। अमेरिका को यह भी उम्मीद थी कि आक्रमण तेज होगा और इसमें लंबा प्रतिरोध शामिल नहीं होगा। किसिंजर ने सुहार्तो से कहा, "यह महत्वपूर्ण है कि आप जो कुछ भी करें वह जल्दी सफल हो जाए।" अमेरिका ने आक्रमण और उसके बाद के कब्जे के दौरान इंडोनेशिया को हथियारों की आपूर्ति की। पूर्वी तिमोर पर आक्रमण के एक सप्ताह बाद, राष्ट्रीय सुरक्षा परिषद ने एक विश्लेषण तैयार किया जिसमें अमेरिका द्वारा आपूर्ति किए गए सैन्य उपकरणों का व्यापक उपयोग पाया गया। हालांकि अमेरिकी सरकार ने कहा कि वे दिसंबर 1975 से जून 1976 तक नए हथियारों की बिक्री में देरी करेंगे, यह निर्धारित करने के लिए कि क्या इंडोनेशिया ने एक द्विपक्षीय समझौते का उल्लंघन किया है जिसमें कहा गया है कि इंडोनेशिया केवल रक्षात्मक उद्देश्यों के लिए U.S.-supplied हथियारों का उपयोग कर सकता है, सैन्य सहायता का प्रवाह जारी रहा, और किसिंजर ने हथियारों की बिक्री में कटौती का सुझाव देने के लिए अपने विदेश विभाग के कर्मचारियों को फटकार लगाई। किसिंजर कांग्रेस सहित अमेरिकी जनता की अपनी नीतियों पर प्रतिक्रियाओं के बारे में चिंतित थे, इस बात पर खेद व्यक्त करते हुए कि "कागज पर सब कुछ मेरे खिलाफ इस्तेमाल किया जाएगा।" 1975 और 1980 के बीच, जब पूर्वी तिमोर में हिंसा अपने चरम पर थी, संयुक्त राज्य अमेरिका ने इंडोनेशियाई सरकार को लगभग 340 मिलियन डॉलर के हथियार प्रदान किए। इंडोनेशिया को अमेरिकी सैन्य सहायता और हथियारों की बिक्री 1974 से बढ़ी और 1999 में बंद होने तक बुश और क्लिंटन के वर्षों तक जारी रही। 1975 और 1995 के बीच इंडोनेशिया को अमेरिकी हथियारों का प्रावधान लगभग 1.1 अरब डॉलर था। क्लिंटन प्रशासन ने पेंटागन के जे. सी. ई. टी. कार्यक्रम के तहत इंडोनेशियाई कोपासस विशेष बलों को शहरी गुरिल्ला युद्ध, निगरानी, प्रति-खुफिया, स्नाइपर रणनीति और 'मनोवैज्ञानिक संचालन' में प्रशिक्षित किया। पूर्वी तिमोर में स्वागत, सत्य और सुलह के लिए संयुक्त राष्ट्र आयोग (सी. ए. वी. आर.) ने अपनी अंतिम रिपोर्ट के "उत्तरदायित्व" अध्याय में कहा कि 1975 और 1999 के बीच पूर्वी तिमोर पर इंडोनेशियाई आक्रमण और कब्जे के लिए अमेरिकी "राजनीतिक और सैन्य समर्थन मौलिक थे"। रिपोर्ट (पृष्ठ 92) में यह भी कहा गया है कि "अमेरिका द्वारा आपूर्ति किए गए हथियार प्रतिरोध को नष्ट करने के अपने बड़े अभियानों में 1977 से सैन्य अभियानों को तेज करने की इंडोनेशिया की क्षमता के लिए महत्वपूर्ण थे, जिसमें संयुक्त राज्य अमेरिका द्वारा आपूर्ति किए गए विमानों ने महत्वपूर्ण भूमिका निभाई थी।" फ्रेटिलिन ने दावा किया है कि पूर्वी तिमोर में इंडोनेशियाई सरकार के प्रयासों के लिए अमेरिकी समर्थन की डिग्री राजनयिक समर्थन और भौतिक सहायता से परे हो सकती है। सिडनी, ऑस्ट्रेलिया से 19 जून 1978 की एक यू. पी. आई. रिपोर्ट में एक फ्रेटिलिन प्रेस विज्ञप्ति का हवाला दिया गया, जिसमें कहा गया थाः "अमेरिकी सैन्य सलाहकारों और भाड़े के सैनिकों ने दो लड़ाइयों में फ्रेटिलिन के खिलाफ इंडोनेशियाई सैनिकों के साथ लड़ाई लड़ी। इस बीच, अमेरिकी पायलट इंडोनेशियाई वायु सेना के लिए ओ. वी.-10 ब्रोंको विमान उड़ा रहे हैं और फ्रीटिलिन नियंत्रण के तहत मुक्त क्षेत्रों के खिलाफ बमबारी कर रहे हैं। संयुक्त राज्य अमेरिका ने इंडोनेशियाई आक्रमण की निंदा करने वाले संयुक्त राष्ट्र के अधिकांश प्रस्तावों से परहेज किया। उस समय संयुक्त राष्ट्र में अमेरिकी राजदूत डैनियल पैट्रिक मोयनिहान ने बाद में अपने संस्मरणों में लिखाः "विदेश विभाग चाहता था कि संयुक्त राष्ट्र जो भी उपाय करे, वह पूरी तरह से अप्रभावी साबित हो। यह कार्य मुझे दिया गया था और मैंने इसे बिना किसी उल्लेखनीय सफलता के आगे बढ़ाया। अन्य देशों ब्रिटेन, कनाडा, जापान और अन्य देशों ने पूर्वी तिमोर के कब्जे के दौरान इंडोनेशिया का समर्थन किया। ब्रिटेन ने पूर्वी तिमोर से संबंधित संयुक्त राष्ट्र महासभा के सभी प्रस्तावों से परहेज किया और पूरे कब्जे के दौरान हथियार बेचे। 1978 में इंडोनेशिया ने आठ बी. ए. ई. हॉक जेट प्रशिक्षक खरीदे, जिनका उपयोग "घेराबंदी और विनाश" अभियान के दौरान किया गया था। ब्रिटेन ने 1990 के दशक में इंडोनेशिया को दर्जनों अतिरिक्त विमान बेचे। कनाडा पूर्वी तिमोर के बारे में महासभा के शुरुआती प्रस्तावों से दूर रहा और तीन का विरोध किया। कनाडाई सरकार नियमित रूप से कब्जे के दौरान इंडोनेशिया को हथियार बेचती थी, और 1990 के दशक में अतिरिक्त हथियारों के पुर्जों के निर्यात में 40 करोड़ डॉलर से अधिक की मंजूरी दी। जापान ने पूर्वी तिमोर के संबंध में महासभा के सभी आठ प्रस्तावों के खिलाफ मतदान किया। भारत सरकार ने भी इंडोनेशिया का समर्थन किया, इस कब्जे की तुलना 1961 में गोवा की अपनी जब्ती से की। कुछ विश्लेषकों ने टिप्पणी की कि इंडोनेशिया की विलंबित कार्रवाई ने पूर्वी तिमोर के शांतिपूर्ण हस्तांतरण को भी रोक दिया, जैसा कि 1962 में फ्रांसीसी ने पांडिचेरी को भारत में स्थानांतरित किया था। दक्षिण पूर्व एशियाई राष्ट्र संघ (ए. एस. ए. एन.) के सदस्य देशों ने पूर्वी तिमोर में आत्मनिर्णय का आह्वान करने वाले महासभा के प्रस्तावों के खिलाफ लगातार मतदान किया। परिणाम मौतों की संख्या मरने वालों की संख्या का सटीक अनुमान लगाना मुश्किल है। संयुक्त राष्ट्र के पूर्वी तिमोर में स्वागत, सत्य और सुलह आयोग (सी. ए. वी. आर.) की 2005 की रिपोर्ट में संघर्ष से संबंधित मौतों की अनुमानित न्यूनतम संख्या 102,800 (+/- 12,000) बताई गई है। इनमें से, रिपोर्ट में कहा गया है कि लगभग 18,600 (+/- 1,000) या तो मारे गए थे या गायब हो गए थे और लगभग 84,000 (+/- 11,000) की भूख या बीमारी से मृत्यु हो गई थी, जो कि शांतिकाल की मृत्यु दर के कारण अपेक्षित थी। ये आंकड़े एक न्यूनतम रूढ़िवादी अनुमान का प्रतिनिधित्व करते हैं जो सी. ए. वी. आर. का कहना है कि इसकी वैज्ञानिक रूप से आधारित प्रमुख खोज है। रिपोर्ट में ऊपरी सीमा नहीं दी गई है। हालांकि, सी. ए. वी. आर. ने अनुमान लगाया कि संघर्ष से संबंधित भूख और बीमारी के कारण होने वाली मौतों की कुल संख्या 183,000 तक हो सकती है। सत्य आयोग ने लगभग 70 प्रतिशत हिंसक हत्याओं के लिए इंडोनेशियाई बलों को जिम्मेदार ठहराया। शोधकर्ता बेन किरनान का कहना है कि "150,000 का आंकड़ा सच्चाई के करीब है", हालांकि 200,000 या उससे अधिक का अनुमान लगाया जा सकता है। रक्षा सूचना केंद्र ने भी कुल 1,50,000 के करीब होने का अनुमान लगाया। पूर्वी तिमोर की जनसंख्या का 1974 का कैथोलिक चर्च अनुमान 688,711 लोगों का था; 1982 में चर्च ने केवल 425,000 लोगों की सूचना दी। इससे कब्जे के दौरान 200,000 लोगों के मारे जाने का अनुमान लगाया गया, जिसकी दुनिया भर में व्यापक रूप से सूचना दी गई थी। एमनेस्टी इंटरनेशनल और ह्यूमन राइट्स वॉच जैसे अन्य स्रोत भी 200,000 से अधिक लोगों के मारे जाने के अनुमान का समर्थन करते हैं। पुर्तगाली और इंडोनेशियाई अधिकारियों और कैथोलिक चर्च से उपलब्ध सांख्यिकीय आंकड़ों के आधार पर विशेषज्ञ गैब्रियल डेफर्ट के अनुसार, दिसंबर 1975 और दिसंबर 1981 के बीच, लगभग 308,000 तिमोरियों ने अपनी जान गंवाई; यह आक्रमण से पहले की आबादी का लगभग 44 प्रतिशत था। इसी तरह, इंडोनेशियाई प्रोफेसर जॉर्ज अदितजोंड्रो, जो पहले जावा में सलातिगा विश्वविद्यालय के थे, ने इंडोनेशियाई सेना के आंकड़ों के अपने अध्ययन से निष्कर्ष निकाला कि वास्तव में कब्जे के शुरुआती वर्षों में 300,000 तिमोरियों को मार दिया गया था। ऑस्ट्रेलियन नेशनल यूनिवर्सिटी के रॉबर्ट क्रिब का तर्क है कि मरने वालों की संख्या को काफी बढ़ा-चढ़ाकर बताया गया था। उनका तर्क है कि 1980 की जनगणना जिसमें 555,350 तिमोरियों की गणना की गई थी, हालांकि "सभी का सबसे विश्वसनीय स्रोत", कुल आबादी के लिए अधिकतम अनुमान के बजाय शायद न्यूनतम था। वे लिखते हैं, "यह याद रखने योग्य है कि सितंबर 1999 की हिंसा के दौरान सैकड़ों हजारों पूर्वी तिमोर के लोग गायब हो गए थे, लेकिन बाद में फिर से दिखाई दिए।" 1980 की जनगणना 1987 की जनगणना के सामने अधिक असंभव हो जाती है जिसमें 657,411 तिमोरियों की गणना की गई थी-इसके लिए प्रति वर्ष 2.5% की विकास दर की आवश्यकता होगी, जो 1970 से 1975 तक पूर्वी तिमोर में बहुत उच्च विकास दर के लगभग समान है, और प्रजनन को हतोत्साहित करने के इंडोनेशियाई प्रयासों सहित क्रूर कब्जे की स्थितियों को देखते हुए इसकी अत्यधिक संभावना नहीं है। अत्याचारों या आघातग्रस्त इंडोनेशियाई सैनिकों के व्यक्तिगत विवरणों की सापेक्ष कमी को ध्यान में रखते हुए, वह आगे कहते हैं कि पूर्वी तिमोर "समाचार रिपोर्टों और अकादमिक विवरणों के आधार पर-एक ऐसे समाज के रूप में प्रतीत नहीं होता है जो बड़े पैमाने पर death.the परिस्थितियों से पीड़ित है जो 1991.indicate के दिली नरसंहार की ओर ले जाती है, एक ऐसा समाज जिसने अपनी शक्ति और आक्रोश को इस तरह से बनाए रखा है जो शायद संभव नहीं होता अगर कंबोडिया के साथ पोल पॉट के तहत व्यवहार किया जाता।" यहां तक कि इंडोनेशियाई सैन्य रणनीति भी आबादी के "दिल और दिमाग" जीतने पर आधारित थी, एक ऐसा तथ्य जो सामूहिक हत्या के आरोपों का समर्थन नहीं करता है। किरनान, 1975 में 700,000 तिमोरियों की आधार आबादी से शुरू करते हुए (1974 की कैथोलिक चर्च जनगणना के आधार पर), 735,000 तिमोरियों की अनुमानित 1980 की आबादी की गणना की (कब्जे के परिणामस्वरूप प्रति वर्ष केवल 1 प्रतिशत की वृद्धि दर मानते हुए)। 1980 की गिनती को स्वीकार करते हुए कि क्रिब कम से कम 10 प्रतिशत (55,000) को बहुत कम मानते हैं, किरनान ने निष्कर्ष निकाला कि युद्ध में 180,000 लोग मारे गए होंगे। क्रिब ने तर्क दिया कि 1974 की जनगणना द्वारा सुझाई गई 3 प्रतिशत की वृद्धि दर बहुत अधिक थी, इस तथ्य का हवाला देते हुए कि चर्च ने पहले 1.8 प्रतिशत की विकास दर का अनुमान लगाया था, जो 1974 के लिए 635,000 के पुर्तगाली जनसंख्या अनुमान के अनुरूप एक आंकड़ा था। हालाँकि क्रिब ने कहा कि पुर्तगाली जनगणना लगभग निश्चित रूप से एक कम आंकी गई थी, लेकिन उनका मानना था कि यह चर्च की जनगणना की तुलना में अधिक सही होने की संभावना है, क्योंकि कुल आबादी के आकार का विस्तार करने के किसी भी चर्च के प्रयास को "समाज में इसकी अपूर्ण पहुंच के प्रकाश में देखा जाना चाहिए" (आधे से भी कम तिमोरियों कैथोलिक थे)। दक्षिण पूर्व एशिया के अन्य देशों के अनुरूप विकास दर को मानते हुए, 1975 के लिए 680,000 का अधिक सटीक आंकड़ा मिलेगा, और 1980 की अनुमानित जनसंख्या 775,000 से थोड़ी अधिक होगी (इंडोनेशियाई कब्जे के परिणामस्वरूप जन्म दर में गिरावट के लिए लेखांकन के बिना)। शेष घाटा लगभग ठीक 200,000 होगा। क्रिब के अनुसार, इंडोनेशियाई नीतियों ने जन्म दर को 50 प्रतिशत या उससे अधिक तक सीमित कर दिया। इस प्रकार, इनमें से लगभग 45,000 मारे जाने के बजाय पैदा नहीं हुए थे; अन्य 55,000 1980 की जनगणना करने वाले इंडोनेशियाई अधिकारियों से तिमोरियों के बचने के परिणामस्वरूप "लापता" थे। विभिन्न कारकों-1974-5 में FRETILIN से बचने के लिए अपने घरों से दसियों हज़ारों लोगों का पलायन; गृह युद्ध में हज़ारों की मौत; कब्जे के दौरान लड़ाकों की मौत; FRETILIN द्वारा हत्याएँ; और प्राकृतिक आपदाएँ-इस समय के दौरान इंडोनेशियाई बलों के कारण होने वाली नागरिक संख्या को और कम कर देती हैं। इन सभी आंकड़ों को ध्यान में रखते हुए, क्रिब ने 100,000 या उससे कम के बहुत कम टोल के लिए तर्क दिया, जिसमें पूर्ण न्यूनतम 60,000 और अस्वाभाविक रूप से मरने वाली नागरिक आबादी का केवल दसवां हिस्सा है। हालांकि, किरनान ने इस बात पर जोर देते हुए जवाब दिया कि कब्जे के दौरान प्रवासी श्रमिकों की आमद और मृत्यु दर संकट की विशिष्ट जनसंख्या वृद्धि दर में वृद्धि 1980 की जनगणना को 1987 के अनुमान के बावजूद वैध के रूप में स्वीकार करने को सही ठहराती है और 1974 की चर्च जनगणना-हालांकि एक "संभावित अधिकतम"-को छूट नहीं दी जा सकती है क्योंकि चर्च की समाज तक पहुंच की कमी के परिणामस्वरूप कम गिनती हो सकती है। उन्होंने निष्कर्ष निकाला कि 1975 से 1980 तक सभी पक्षों द्वारा कम से कम 116,000 लड़ाके और नागरिक मारे गए या "अप्राकृतिक" मौतें हुईं (यदि यह सच है, तो इसका परिणाम यह होगा कि 1975 से 1980 तक पूर्वी तिमोर की लगभग 15 प्रतिशत नागरिक आबादी मारी गई थी)। एफ. हियूर्थ ने अलग से अनुमान लगाया कि इस अवधि के दौरान नागरिक आबादी के 13 प्रतिशत (अनुमानित 730,000 में से 95,000, जब जन्म दर में कमी के लिए जिम्मेदार थे) की मृत्यु हो गई। किरनान का मानना है कि जन्म दर में कमी, या पूर्वी तिमोर की आबादी के 20 प्रतिशत के लिए जिम्मेदार होने पर घाटा संभवतः लगभग 1,45,000 था। संयुक्त राष्ट्र की रिपोर्ट का मध्य-मूल्य 1,46,000 मौतें हैं; राजनीतिक हत्याओं के एक विश्लेषक आर. जे. रुमेल का अनुमान है कि 1,50,000 मौतें हुई हैं। कई पर्यवेक्षकों ने पूर्वी तिमोर में इंडोनेशियाई सैन्य कार्रवाई को नरसंहार का एक उदाहरण बताया है। ऑक्सफोर्ड ने इस घटना को नरसंहार कहते हुए एक अकादमिक सर्वसम्मति बनाई और येल विश्वविद्यालय इसे अपने "नरसंहार अध्ययन" कार्यक्रम के हिस्से के रूप में पढ़ाता है। पूर्वी तिमोर के कब्जे के लिए शब्द के कानूनी अर्थ और प्रयोज्यता के अध्ययन में, कानूनी विद्वान बेन शाऊल ने निष्कर्ष निकाला है कि क्योंकि अंतर्राष्ट्रीय कानून के तहत मान्यता प्राप्त किसी भी समूह को इंडोनेशियाई अधिकारियों द्वारा लक्षित नहीं किया गया था, इसलिए नरसंहार का आरोप लागू नहीं किया जा सकता है। हालाँकि, उन्होंने यह भी नोट कियाः "पूर्वी तिमोर में संघर्ष सबसे सटीक रूप से एक 'राजनीतिक समूह' के खिलाफ नरसंहार के रूप में, या वैकल्पिक रूप से 'सांस्कृतिक नरसंहार' के रूप में योग्य है, फिर भी इनमें से किसी भी अवधारणा को अंतर्राष्ट्रीय कानून में स्पष्ट रूप से मान्यता नहीं दी गई है।" इस कब्जे की तुलना खमेर रूज की हत्याओं, यूगोस्लाव युद्धों और रवांडा के नरसंहार से की गई है। इंडोनेशियाई हताहतों की सटीक संख्या अच्छी तरह से प्रलेखित है। पूर्वी जकार्ता के सिलांगकाप में सशस्त्र बल मुख्यालय में स्थित सेरोजा स्मारक में लगभग 2,300 इंडोनेशियाई सैनिकों और इंडोनेशिया समर्थक मिलिशिया के पूरे नाम उत्कीर्ण किए गए हैं, जो पूरे कब्जे के दौरान कार्रवाई के साथ-साथ बीमारी और दुर्घटनाओं में मारे गए थे। न्यायमूर्ति शाऊल "मानवता के खिलाफ अपराध, युद्ध अपराध और मानवाधिकारों के अन्य घोर उल्लंघन" के लिए जिम्मेदार पक्षों के अभियोजन पर चर्चा करते हैं। कब्जा समाप्त होने के बाद के वर्षों में, इस तरह के अंत के लिए कई कार्यवाही की गई हैं। 1999 में UNTAET को अधिकृत करने वाले संयुक्त राष्ट्र सुरक्षा परिषद के प्रस्ताव में "अंतर्राष्ट्रीय और मानवाधिकार कानून के व्यवस्थित, व्यापक और घोर उल्लंघन" के इतिहास का वर्णन किया गया था और "इस तरह की हिंसा के लिए जिम्मेदार लोगों को न्याय के दायरे में लाने" की मांग की गई थी। इन उद्देश्यों को प्राप्त करने के लिए, UNTAET ने एक गंभीर अपराध इकाई (SCU) की स्थापना की, जिसने ऐसी हिंसा के लिए जिम्मेदार व्यक्तियों की जांच करने और उन पर मुकदमा चलाने का प्रयास किया है। हालांकि, एससीयू की अपेक्षाकृत कम पूरा करने के लिए आलोचना की गई है, संभवतः क्योंकि यह अपर्याप्त रूप से वित्त पोषित है, केवल 1999 में किए गए अपराधों के लिए जनादेश में सीमित है, और अन्य कारणों से। हिंसा के लिए जिम्मेदार लोगों को दंडित करने के लिए इंडोनेशियाई मुकदमों को संयुक्त राष्ट्र आयोग द्वारा "स्पष्ट रूप से अपर्याप्त" बताया गया था। इन प्रक्रियाओं में कमियों के कारण कुछ संगठनों ने पूर्वी तिमोर में हत्याओं के लिए जिम्मेदार व्यक्तियों पर मुकदमा चलाने के लिए एक अंतर्राष्ट्रीय न्यायाधिकरण की मांग की है, जैसा कि यूगोस्लाविया और रवांडा में स्थापित किया गया था। पूर्वी तिमोर के गैर सरकारी संगठन लाओ हमुतुक के 2001 के एक संपादकीय में कहा गया हैः पूर्वी तिमोर में 1975-1999 अवधि के दौरान मानवता के खिलाफ अनगिनत अपराध किए गए थे। हालाँकि एक अंतर्राष्ट्रीय अदालत उन सभी का पीछा नहीं कर सकी, लेकिन यह पुष्टि करती है कि इंडोनेशिया द्वारा पूर्वी तिमोर पर आक्रमण, कब्जा और विनाश एक लंबे समय से चली आ रही, व्यवस्थित, आपराधिक साजिश थी, जिसकी योजना बनाई गई थी और सरकार के उच्चतम स्तर पर आदेश दिया गया था। कई अपराधी पूर्वी तिमोर के निकटतम पड़ोसी में अधिकार और प्रभाव बनाए हुए हैं। पूर्वी तिमोर और इंडोनेशिया दोनों में शांति, न्याय और लोकतंत्र का भविष्य उच्चतम स्तर के अपराधियों को जवाबदेह ठहराने पर निर्भर करता है। 2005 में, इंडोनेशिया-तिमोर लेस्टे कमीशन ऑफ ट्रुथ एंड फ्रेंडशिप की स्थापना कब्जे के तहत अपराधों से संबंधित सच्चाई स्थापित करने और देशों के बीच विभाजन को ठीक करने के लक्ष्य के साथ की गई थी। इसे गैर सरकारी संगठनों से आलोचना मिली है और संयुक्त राष्ट्र द्वारा दंड से मुक्ति की पेशकश के लिए खारिज कर दिया गया था। पूर्वी तिमोर के इंडोनेशियाई राज्यपाल अनंतिम सरकार के अध्यक्षः 17 दिसंबर 1975-17 जुलाई 1976: अर्नाल्डो डॉस रीस अराजो राज्यपालः 1976-1978: अर्नाल्डो डॉस रीस अराजो 1978-1982: गिलहर्मे मारिया गोंसाल्वेस 18 सितंबर 1982-18 सितंबर 1992: मारियो वेगास करास्कालो 18 सितंबर 1992-25 अक्टूबर 1999: जोस अबिलियो ओसोरियो सोरेस कथा साहित्य में चित्रण बालिबो, बालिबो फाइव के बारे में 2009 की ऑस्ट्रेलियाई फिल्म, ऑस्ट्रेलियाई पत्रकारों का एक समूह जिसे पूर्वी तिमोर पर इंडोनेशियाई आक्रमण से ठीक पहले पकड़ लिया गया था और मार दिया गया था। द रिडंडेंसी ऑफ करेज, एक उपन्यास जिसे टिमोथी मो द्वारा बुकर पुरस्कार के लिए चुना गया था, आम तौर पर पूर्वी तिमोर के बारे में माना जाता है। ।