More recently, Zuni culture seems related to both the Mogollon and Ancestral Pueblo peoples cultures, who lived in the deserts of New Mexico, Arizona, Utah, and southern Colorado for over two millennia.
המחקר המודרני משייך את תרבות הזוני הן לתרבות מוגויון (Mogollon culture) והן לאנשי הפואבלו הקדומים, ששכנו במדבריות של ניו מקסיקו, אריזונה, יוטה ודרום קולורדו במשך למעלה מ-2,000 שנים.