The story is a retelling of events from "Assassin's Creed" and the beginning of "Assassin's Creed II", mostly from Desmond's modern perspective; for example it is revealed that Lucy helped the Templars to kidnap Desmond.
הסיפור מספר מחדש את האירועים ב"Assassin's Creed" וההתחלה של "Assassin's Creed II", בעיקר מנקודת המבט המודרנית של דזמונד, לדוגמה לדעתו לוסי עזרה לטמפלרים לחטוף את דזמונד.