La conversione di Dooku al Lato Oscuro comincia con l'assassinio del Maestro Jedi Sifo-Dyas, suo ex-amico e confidente nell'Ordine ; per far ciò Dooku si accorda con il sindacato Pyke, utilizzando lo pseudonimo di Tyranus, affinché l'organizzazione criminale attaccasse lo Shuttle Jedi 775519 di Sifo-Dyas, il quale era stato inviato su Oba Diah  dal Cancelliere Supremo Finis Valorum  insieme al suo assistente Silman.
Sifo-Dyas muore nell'attacco allo shuttle e il suo corpo è poi dato a Dooku mentre Silman, scampato per miracolo alla morte, è catturato e imprigionato dai Pyke.
A seguito di ciò, quando assume il controllo dei piani di Sifo-Dyas per creare un esercito di cloni per la Repubblica, Dooku approfitta del suo rango di Maestro per accedere al database del Tempio Jedi e cancellare ogni riferimento al pianeta Kamino dagli Archivi Jedi.
E io questo ho fatto. nessuna delle precedenti Però, vedete, la ricerca si fa con le risorse, si fa con la visione, e io devo trovare quell'ambiente che me lo fa fare. Gli scambi commerciali con il Regno Unito, tra il 1816 ed il 1845, furono condizionati dal "privilegio", riconosciuto alla marineria inglese, di una riduzione del 10% del dazio sulle merci trasportate da navi britanniche. Il tempestivo intervento di Mace Windu, Yoda e di molti altri Maestri Jedi a capo del neonato esercito di cloni salva i tre e il conflitto tra le truppe di cloni e di droidi si sviluppa nella battaglia di Geonosis; durante essa Dooku cerca di fuggire portando con sé i piani di un'arma micidiale, la "Morte Nera", ma la sua fuga viene ostacolata dall'intervento di Obi-Wan e Anakin.