En el Máster de Microbiología Clínica participan tres departamentos de la Universidad de Barcelona y uno de la Universidad Autónoma, así como los servicios o unidades de microbiología de los hospitales Clinic, Sant Pau, Bellvitge, Vall d'Hebron, Parc Taulí, Germans Trias i Pujol, el Laboratorio de Referencia de Catalunya, los centros de investigación asociados y también la Sección de Microbiología del Hospital Sant Joan de Deu.