La temporada 1999-2000 de la Segunda Divisão de Honra va ser la 66a temporada de la competició, i la segona temporada del reconegut desè futbol a Portugal.
La temporada 1999-2000 de la Segunda Divisão de Honra va ser la desena temporada de la competició i la 66a temporada de futbol reconegut de segona divisió a Portugal.