Зелената костенурка е вписана като застрашена от Международния съюз за опазване на природата. Съгласно Закона за застрашените видове на САЩ, популацията на костенурките в Южната част на САЩ е с размер на растеж от около 150 см. В популацията на костенурките в Южната част на континента се наблюдава нарастване на популацията на вида, с изключение на популациите във Флорида и на тихоокеанското крайбрежие на Мексико. Зелените костенурки продължават да бъдат улавяни за пари от хората, а унищожаването и загубата на местата за гнездене е сериозен проблем.
Хората ги хващат, за да получат печалба. Губят гнездата си. Те имат по-малко места за намиране на храна. Хората обичат да ги държат като домашни любимци.