BioRxiv
BioRxiv (prononciation : « bio-archive ») est une archive de dépôt de  préprints consacrée aux sciences biologiques, cofondée par John Inglis et Richard Sever en novembre 2013. Elle est hébergée par le Cold Spring Harbor Laboratory (CSHL).

En tant que préprints, les documents hébergés sur bioRxiv n'ont pas toujours été revus par des pairs, mais leur nature de publication scientifique a été vérifiée ainsi que l'absence de plagiat. Les lecteurs peuvent commenter les documents archivés. Elle a été inspirée par le service fourni dans les domaines de la physique et des mathématiques par ArXiv, lancé en 1991 par Paul Ginsparg (également membre du conseil de bioRxiv). BioRxiv a reçu en avril 2017 le soutien financier de l'Initiative Chan Zuckerberg.

Histoire 
Avant la mise en place de bioRxiv, les biologistes étaient divisés sur l'opportunité de la mise en place d'une archive de preprints dédiée. Certains craignaient de se voir « doublés » par leurs compétiteurs et de perdre l'antécédence de leur découverte. 

Cependant, certains généticiens avaient déjà pris l'habitude de déposer des manuscrits dans la section « biologie quantitative » de arXiv (lancée en 2003) et n'avaient plus ces préoccupations, puisqu'au contraire ils constataient que les préprints, chronoréférencés, pouvaient appuyer leurs allégations de découverte.

En conséquence de la popularité croissante de bioRxiv, plusieurs revues de biologie ont mis à jour leurs politiques sur des preprints, indiquant qu'ils ne les considèrent plus comme une publication dupliquée comme c'était parfois le cas depuis les années 1960.

L'usage des préprints en biologie est activement promu par le mouvement ASAPBio auprès de tous les maillons de la chaine : institutions, agences de financement et d'évaluation, revues scientifiques, auteurs, etc.

Taux de dépôt 
Selon Jocelyn Kaiser, du magazine Science, dans sa première année, l'archive a « attiré un flux modeste mais croissant de documents », avec 824 préprints.

En février 2016, le taux de dépôt à bioRxiv a augmenté de façon constante à partir de ~60 ~200 par mois, avec un total de 3100 documents reçus. Au 21 avril 2017, plus de  articles avaient été acceptés au total. 

En 2017, le nombre mensuel de dépôts a dépassé 810 en mars et 1000 en juillet. En mars 2018, ce chiffre a frôlé les 1500. En décembre 2019, 2637 preprints ont été déposés dans bioRxiv.

COVID-19 
Début 2020, bioRxiv a joué un rôle important dans la diffusion rapide de la connaissance concernant la pandémie de COVID-19 causée par le coronavirus SARS-CoV-2, en rassemblant sur une même plate-forme dédiée les preprints déposés dans les archives bioRxiv et medRxiv (mais pas ceux d'autres archives telles que ArXiv). Le premier preprint a été déposé dans bioRxiv le , moins de trois semaines après la déclaration officielle des premiers cas par la préfecture de Wuhan, en Chine; le 31 mars, le 1000e preprint concernant la COVID-19 via medRxiv apparaissait sur cette plate-forme.  

Malgré ce rôle important pour diffuser des informations rapidement auprès de spécialistes à même de porter un regard expert sur les contenus, les preprints n'étant pas validés par les pairs, des voix se sont élevées concernant la fiabilité des informations postées de cette façon.

Disciplines scientifiques 
bioRxiv accepte les préprints dans les disciplines suivantes, couvrant toutes les sciences de la vie:

Lien de bioRxiv vers les revues 
Le lien de bioRxiv vers les revues (bioRxiv to Journals, B2J) permet aux auteurs de soumettre leur manuscrit directement à une revue scientifique à partir de bioRxiv. Les revues qui participent actuellement à B2J sont :

Références

Annexes

Bibliographie

Liens externes 
 de bioRxiv
ArXiv
ASAPBio
PeerJ Preprints

Bibliothèque numérique
Archives numériques
BioRxiv ( prononciation \ : « bio-archive » ) est une archive de dépôt de préprints consacrée à les sciences biologiques , cofondée par John Inglis et Richard Sever en novembre Elle est hébergée par le Cold Spring Harbor Laboratory ( CSHL ) . En tant que préprints , les documents hébergés sur bioRxiv n' ont pas toujours été revus par de les pairs , mais leur nature de publication scientifique a été vérifiée ainsi que l' absence de plagiat . Les lecteurs peuvent commenter les documents archivés . Elle a été inspirée par le service fourni dans les domaines de la physique et de les mathématiques par ArXiv , lancé enpar Paul Ginsparg ( également membre de le conseil de bioRxiv ) . BioRxiv a reçu en avrille soutien financier de l' Initiative Chan Zuckerberg . Histoire Avant la mise en place de bioRxiv , les biologistes étaient divisés sur l' opportunité de la mise en place d' une archive de preprints dédiée . Certains craignaient de se voir « doublés » par leurs compétiteurs et de perdre l' antécédence de leur découverte . Cependant , certains généticiens avaient déjà pris l' habitude de déposer de les manuscrits dans la section « biologie quantitative » de arXiv ( lancée enet n' avaient plus ces préoccupations , puisqu' à le contraire ils constataient que les préprints , chronoréférencés , pouvaient appuyer leurs allégations de découverte . En conséquence de la popularité croissante de bioRxiv , plusieurs revues de biologie ont mis à jour leurs politiques sur de les preprints , indiquant qu' ils ne les considèrent plus comme une publication dupliquée comme c' était parfois le cas depuis les années L' usage de les préprints en biologie est activement promu par le mouvement ASAPBio auprès de tous les maillons de la chaine \ : institutions , agences de financement et d' évaluation , revues scientifiques , auteurs , etc. Taux de dépôt Selon Jocelyn Kaiser , de le magazine Science , dans sa première année , l' archive a « attiré un flux modeste mais croissant de documents » , avecpréprints . En février le taux de dépôt à bioRxiv a augmenté de façon constante à partir de ~200 par mois , avec un total dedocuments reçus . Auavril plus de articles avaient été acceptés à le total . En le nombre mensuel de dépôts a dépasséen mars eten juillet . En mars ce chiffre a frôlé les En décembrepreprints ont été déposés dans bioRxiv . COVID-19 Début bioRxiv a joué un rôle important dans la diffusion rapide de la connaissance concernant la pandémie de COVID-19 causée par le coronavirus SARS-CoV-2 , en rassemblant sur une même plate-forme dédiée les preprints déposés dans les archives bioRxiv et medRxiv ( mais pas ceux d' autres archives telles que ArXiv ) . Le premier preprint a été déposé dans bioRxiv le , moins de trois semaines après la déclaration officielle de les premiers cas par la préfecture de Wuhan , en Chine ; lemars , le preprint concernant la COVID-19 via medRxiv apparaissait sur cette plate-forme . Malgré ce rôle important pour diffuser de les informations rapidement auprès de spécialistes à même de porter un regard expert sur les contenus , les preprints n' étant pas validés par les pairs , de les voix se sont élevées concernant la fiabilité de les informations postées de cette façon . Disciplines scientifiques bioRxiv accepte les préprints dans les disciplines suivantes , couvrant toutes les sciences de la vie : Lien de bioRxiv vers les revues Le lien de bioRxiv vers les revues ( bioRxiv to Journals , B2J ) permet à les auteurs de soumettre leur manuscrit directement à une revue scientifique à partir de bioRxiv . Les revues qui participent actuellement à B2J sont \ : Références Annexes Bibliographie Liens externes de bioRxiv ArXiv ASAPBio PeerJ Preprints Bibliothèque numérique Archives numériques